##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN4_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN4_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN4_R_activity_profile --assembly-region-out CAN4_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN4_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN4_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN4_R
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=283.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,98:0.981:99:1,42:0,54:1,0,69,29
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,13:0,0,5,27
chr1	762211	.	C	CTCTCT	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=126,208;MMQ=57,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:12,1:18,2:0|1:762211_C_CTCTCT:762211:11,19,0,3
chr1	762215	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=126,208;MMQ=57,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:8,1:17,2:0|1:762211_C_CTCTCT:762211:11,19,0,3
chr1	762273	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr1	861395	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr1	871070	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:871070_AG_CC:871070:0,0,1,1
chr1	871073	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=164,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:0,0:0|1:871070_AG_CC:871070:1,1,1,1
chr1	871078	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=164,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:871070_AG_CC:871070:1,1,1,1
chr1	871080	.	TC	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=164,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:871070_AG_CC:871070:1,1,1,1
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,6,6
chr1	878482	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:878482_T_C:878482:0,0,0,1
chr1	878484	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:878482_T_C:878482:0,0,0,1
chr1	878750	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:878750_A_C:878750:2,2,1,1
chr1	878751	.	C	CCCCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:878750_A_C:878750:2,2,1,1
chr1	878753	.	C	CCGCGCCTGAGTTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:878750_A_C:878750:2,2,1,1
chr1	878755	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:1,0:0|1:878750_A_C:878750:2,2,1,1
chr1	879054	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:879054_A_C:879054:1,2,1,0
chr1	879058	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:879054_A_C:879054:1,2,1,0
chr1	881953	.	AGCCCAGGACCGCTCCATGTGCACAGCTG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.346:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	891257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=18447042,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	906388	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,17;MFRL=88,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0,1,1,0
chr1	906395	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=8,13;MFRL=88,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,29;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,1,0
chr1	906886	.	A	AGCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	908823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	914876	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr1	916018	.	G	GATGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	916662	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,6,1
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chr1	949365	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=88,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,2,1
chr1	949925	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	957898	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	970549	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=G;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.711:1:0,1:0,0:0|1:970549_TGG_T:970549:0,0,1,0
chr1	970566	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.404:6:1,0:3,1:0|1:970549_TGG_T:970549:4,0,1,1
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	979748	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=119,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:5,4,3,3
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	980915	.	G	GAGAAATGGTAGAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr1	981750	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=85,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	983311	.	C	CTTGAGTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,2:5,0:0|1:983311_C_CTTGAGTTT:983311:4,4,1,1
chr1	983312	.	C	CTTAAATAATGAGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:983311_C_CTTGAGTTT:983311:4,4,1,1
chr1	985417	.	G	GCAGTACAGACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	986202	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:986202_G_GC:986202:0,1,0,1
chr1	986203	.	T	TGTGATGTCCG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=13,30;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:986202_G_GC:986202:0,1,0,1
chr1	986206	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:986202_G_GC:986202:0,1,0,1
chr1	986208	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:986202_G_GC:986202:0,1,0,1
chr1	986210	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=19,27;MFRL=210,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:986202_G_GC:986202:0,1,0,1
chr1	1025760	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:1025760_A_G:1025760:9,8,1,1
chr1	1025767	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:1025760_A_G:1025760:9,7,1,1
chr1	1025771	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:1025760_A_G:1025760:8,8,1,1
chr1	1025772	.	C	CAGCA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:1025760_A_G:1025760:8,8,1,1
chr1	1115041	.	C	CAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:1115041_C_CAGG:1115041:3,0,0,1
chr1	1115043	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:1115041_C_CAGG:1115041:3,0,0,1
chr1	1115580	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1115580_T_G:1115580:0,2,0,1
chr1	1115581	.	G	GGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1115580_T_G:1115580:0,2,0,1
chr1	1115994	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	1116311	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	1119572	.	G	GGAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1132580	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:1132580_C_T:1132580:2,2,0,1
chr1	1132588	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:1132580_C_T:1132580:2,2,0,1
chr1	1132590	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=21,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:1132580_C_T:1132580:1,2,0,1
chr1	1132593	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:1132580_C_T:1132580:1,2,0,1
chr1	1132595	.	CCCACA	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:1132580_C_T:1132580:1,2,0,1
chr1	1132608	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1132580_C_T:1132580:0,1,0,1
chr1	1132611	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1132580_C_T:1132580:0,1,0,1
chr1	1147436	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=119,1906;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,2:0,0:0|1:1147436_T_A:1147436:4,1,1,1
chr1	1147455	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=115,1906;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:1147436_T_A:1147436:5,2,1,1
chr1	1158534	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AC;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr1	1158562	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,3:1,0,8,1
chr1	1159389	.	C	CGGCGGCATCCGTCTGGCTGTTCGGGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1201743	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=180,116;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	1201745	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=162,89;MMQ=46,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1201745_GC_G:1201745:0,4,0,1
chr1	1201747	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=162,89;MMQ=46,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1201745_GC_G:1201745:0,4,0,1
chr1	1201752	.	ACC	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=185,116;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:1201752_ACC_A:1201752:0,3,0,1
chr1	1201755	.	T	TGGGGTCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=185,116;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1201752_ACC_A:1201752:0,3,0,1
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	1230233	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=127,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:1230233_A_T:1230233:2,5,1,1
chr1	1230235	.	G	GAGTTCCAGCCTTGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:1230233_A_T:1230233:2,5,1,1
chr1	1235541	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:1235541_G_A:1235541:1,2,1,1
chr1	1235543	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:1235541_G_A:1235541:1,2,1,1
chr1	1236162	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=147,164;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:0,13,0,2
chr1	1238511	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1238511_C_CA:1238511:0,2,0,1
chr1	1238513	.	T	TGACTTAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1238511_C_CA:1238511:0,2,0,1
chr1	1238515	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1238511_C_CA:1238511:0,2,0,1
chr1	1238580	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:1238580_C_T:1238580:2,0,1,1
chr1	1238586	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,17;MFRL=155,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:1238580_C_T:1238580:2,0,1,1
chr1	1243929	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1243929_G_T:1243929:0,0,1,0
chr1	1243934	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1243929_G_T:1243929:0,0,1,0
chr1	1247389	.	A	AGGAGAAAACCAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	1257268	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=88,146;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.190:13:4,0:7,2:0|1:1257268_T_TC:1257268:5,6,2,0
chr1	1257271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr1	1257275	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=97,146;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,0:5,1:0|1:1257268_T_TC:1257268:4,6,2,0
chr1	1257277	.	A	AAACCCCCCCCC	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,14;MFRL=97,146;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,0:6,0:0|1:1257268_T_TC:1257268:4,6,2,0
chr1	1257278	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=97,146;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.206:12:4,0:4,0:0|1:1257268_T_TC:1257268:4,6,2,0
chr1	1271574	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1273261	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1273261_C_G:1273261:0,0,1,0
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1273261_C_G:1273261:0,0,1,0
chr1	1275705	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=106,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,1:0,0,7,0
chr1	1277533	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:1277533_T_C:1277533:0,0,1,5
chr1	1277535	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0|1:1277533_T_C:1277533:0,3,1,1
chr1	1288756	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=71,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:1288756_G_A:1288756:1,1,0,1
chr1	1288759	.	G	GGTTCTAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1288756_G_A:1288756:0,1,0,1
chr1	1288762	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1288756_G_A:1288756:0,1,0,1
chr1	1289350	.	CACT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:2,2,0,1
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	1292121	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.185:18:9,1:5,0:0|1:1292121_A_C:1292121:1,14,3,0
chr1	1292123	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.185:18:9,0:6,0:0|1:1292121_A_C:1292121:1,14,3,0
chr1	1292126	.	CACCCAG	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.185:18:9,1:6,1:0|1:1292121_A_C:1292121:1,14,3,0
chr1	1292136	.	CGAGA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.235:14:8,1:3,1:0|1:1292121_A_C:1292121:0,11,3,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	1293795	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,12;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr1	1322594	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,8,4
chr1	1325517	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=139,151;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:4,0:0|1:1325517_C_A:1325517:4,4,2,0
chr1	1325531	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=120,151;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,0:0|1:1325517_C_A:1325517:4,4,2,0
chr1	1326990	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,50;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:0|1:1326990_C_T:1326990:6,17,2,0
chr1	1327003	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=138,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:1326990_C_T:1326990:4,14,2,0
chr1	1372377	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	1375763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=163,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	1375819	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,21;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:1375819_A_C:1375819:0,1,2,0
chr1	1375823	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:0,1:0|1:1375819_A_C:1375819:4,1,2,0
chr1	1375827	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:1375819_A_C:1375819:4,1,2,0
chr1	1375830	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0|1:1375819_A_C:1375819:4,1,2,0
chr1	1375833	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,1:0|1:1375819_A_C:1375819:4,1,2,0
chr1	1375835	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=25,13;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:1375819_A_C:1375819:4,1,2,0
chr1	1386016	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=123,109;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,4:1,6:4,1,8,2
chr1	1387348	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	1387726	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,0:2,5:2,1,5,0
chr1	1387891	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=107,123;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:1,5,3,5
chr1	1387920	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,1,3
chr1	1389695	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,144;MMQ=26,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	1390997	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,160;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	1391304	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=117,93;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,1:0,3:0,4,0,4
chr1	1420637	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=130,148;MMQ=40,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,1,0,1
chr1	1420638	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=130,148;MMQ=40,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,1,0,1
chr1	1420641	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=130,148;MMQ=40,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,1,0,1
chr1	1420644	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,0,0,1
chr1	1420647	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,148;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,0,0,1
chr1	1420651	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1420637_C_CT:1420637:0,0,0,1
chr1	1458236	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=122,125;MMQ=43,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:4,1:6,5,3,1
chr1	1458320	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=183,118;MMQ=37,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:1458320_G_C:1458320:0,2,0,1
chr1	1458324	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=183,118;MMQ=37,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1458320_G_C:1458320:0,2,0,1
chr1	1458333	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=177,118;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1458320_G_C:1458320:0,3,0,1
chr1	1458334	.	G	GCCCCTAGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=177,118;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1458320_G_C:1458320:0,3,0,1
chr1	1458340	.	C	CTCCAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=177,118;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1458320_G_C:1458320:0,3,0,1
chr1	1459060	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,34152;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	1460574	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	1464534	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,88;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,4:6,0:9,0,4,0
chr1	1469528	.	T	TCTTCTGCTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=191,83;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	1560386	.	C	CACCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1564703	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1564703_G_T:1564703:0,0,0,1
chr1	1564712	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1564703_G_T:1564703:0,0,0,1
chr1	1565119	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:3,5,1,1
chr1	1565842	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr1	1573241	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=150,94;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:1573241_T_C:1573241:0,3,0,1
chr1	1573247	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=150,94;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:1573241_T_C:1573241:0,3,0,1
chr1	1573249	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=167,94;MMQ=34,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1573241_T_C:1573241:0,2,0,1
chr1	1573250	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,10;MFRL=139,150;MMQ=27,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1573250_G_T:1573250:0,2,0,1
chr1	1573253	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,11;MFRL=139,150;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1573250_G_T:1573250:0,2,0,1
chr1	1573271	.	GAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=184,150;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1573250_G_T:1573250:0,1,0,1
chr1	1574019	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,150;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:1,8,1,3
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,115;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,7:5,4:2,7,3,8
chr1	1599683	.	T	TTAGTTTTCATTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,129;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=123,131;MMQ=27,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,4:12,0:4,13,4,0
chr1	1603046	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,7:0,0,8,6
chr1	1636274	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	1638909	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,139;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,5,2
chr1	1639703	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1639703_G_T:1639703:0,0,0,1
chr1	1639708	.	C	CTCTGGTCCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1639703_G_T:1639703:0,0,0,1
chr1	1647686	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,22;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,0:4,3:0|1:1647722_G_T:1647722:8,0,2,1
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:4,3:0|1:1647722_G_T:1647722:8,0,2,1
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=31,24;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,0:4,3:0|1:1647722_G_T:1647722:9,0,2,1
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:8,3:4,5:0|1:1647745_G_A:1647745:14,2,9,1
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:13,3:3,7:0|1:1647745_G_A:1647745:15,2,9,1
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.487:31:10,3:5,11:11,5,14,1
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=8;MBQ=27,31;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.418:53:22,7:9,15:17,14,12,10
chr1	1647871	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.467:41:14,11:7,8:6,16,8,11
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.477:25:9,6:4,5:3,10,4,8
chr1	1650920	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,12:0.370:33:3,7:18,4:0|1:1650920_G_A:1650920:1,20,1,11
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:1,5:11,4:0|1:1650920_G_A:1650920:0,12,0,9
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:0,5:11,4:0|1:1650920_G_A:1650920:0,12,0,9
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:0,3:6,3:0|1:1650920_G_A:1650920:0,7,0,6
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:0,2:4,3:0|1:1650920_G_A:1650920:0,5,0,6
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr1	1666338	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1666338_G_A:1666338:0,0,0,1
chr1	1666342	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1666338_G_A:1666338:0,0,0,1
chr1	1666363	.	GAAACT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1666363_GAAACT_G:1666363:0,0,0,1
chr1	1666370	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,96;MMQ=60,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1666363_GAAACT_G:1666363:0,0,0,1
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,15,3
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	1688192	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,15,6
chr1	1691176	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=126,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	1720393	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1737908	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr1	1737926	.	G	GATT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:1737926_G_GATT:1737926:11,5,1,1
chr1	1737927	.	TAGC	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:1737926_G_GATT:1737926:11,6,1,1
chr1	1737933	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:1737926_G_GATT:1737926:10,5,1,1
chr1	1850056	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:1850056_T_TC:1850056:0,0,0,1
chr1	1850059	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1850056_T_TC:1850056:0,0,0,1
chr1	1855415	.	C	CAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1855415_C_CAGGCT:1855415:0,4,0,1
chr1	1855417	.	G	GGCCATGGATACCCATTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1855415_C_CAGGCT:1855415:0,4,0,1
chr1	1855460	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1858534	.	CT	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1858534_CT_TG:1858534:0,0,0,1
chr1	1858537	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1858534_CT_TG:1858534:0,0,0,1
chr1	1887091	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	1895177	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	1897753	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	1898045	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	1898065	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	1900024	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	1900106	.	T	TCTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr1	1903409	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1916862	.	G	GACTCGCGCC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:1916862_G_GACTCGCGCC:1916862:4,5,0,2
chr1	1916864	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:1916862_G_GACTCGCGCC:1916862:4,5,0,2
chr1	1916866	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:4,0:0|1:1916862_G_GACTCGCGCC:1916862:3,5,0,2
chr1	1916890	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,7,11
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,5:3,5:3,0,8,2
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:2075560_T_G:2075560:0,0,4,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:2075560_T_G:2075560:0,0,4,0
chr1	2082427	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=196,157;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2082427_G_T:2082427:0,3,0,1
chr1	2082429	.	T	TACCCTGAATGTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=196,157;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2082427_G_T:2082427:0,3,0,1
chr1	2082432	.	T	TTACCCCTCAGAGCCTCTGTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=196,157;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:2082427_G_T:2082427:0,3,0,1
chr1	2106609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=322,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr1	2118724	.	CT	C,CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26,19;MFRL=154,158,139;MMQ=60,51,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.67,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.270,0.268:8:2,2,0:1,0,0:1,3,0,4
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,5:1,2:2,2,2,5
chr1	2317370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=79,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr1	2330989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,3,10
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	2339894	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,90;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,0,3
chr1	2418350	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:0,0:3,0,1,1
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr1	2422838	.	C	CGCTGGGCAGACTCGTGCTGCTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=80,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr1	2435495	.	CCAT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:2435495_CCAT_C:2435495:3,5,1,1
chr1	2435502	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:4,0:0|1:2435495_CCAT_C:2435495:3,4,1,1
chr1	2441469	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2441469_C_T:2441469:0,3,0,1
chr1	2441477	.	A	AATTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:2441469_C_T:2441469:0,3,0,1
chr1	2442296	.	T	TGACTCCGAGTCAGTCCAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2442296_T_TGACTCCGAGTCAGTCCAAC:2442296:0,2,0,1
chr1	2442299	.	C	CTGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:2442296_T_TGACTCCGAGTCAGTCCAAC:2442296:0,2,0,1
chr1	2444574	.	C	CCCCATGAGGGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	2445386	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:8,2:3,2:9,2,4,0
chr1	2449986	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,0:3,2:8,1,1,1
chr1	2450078	.	A	ACAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr1	2460944	.	CGCG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	2489938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:2,2,0,2
chr1	2491205	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	2494363	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2494363_C_CT:2494363:0,3,0,1
chr1	2494365	.	CC	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2494363_C_CT:2494363:0,3,0,1
chr1	2494369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2494363_C_CT:2494363:0,3,0,1
chr1	2520302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr1	2520500	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	2520527	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	2524205	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	2524457	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	2526169	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1,1,1,0
chr1	2527901	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	2535758	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	2537095	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr1	2537838	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.826:4:0,0:0,1:0,0,0,4
chr1	2538349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	2542653	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	2939299	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=83,38;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:2,2,1,1
chr1	2939453	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,2:9,0:2,7,0,2
chr1	3328002	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:8,4,2,0
chr1	3329091	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:3329091_C_G:3329091:4,1,0,2
chr1	3329096	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=77,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:3329091_C_G:3329091:1,1,0,2
chr1	3329116	.	C	CCAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3329116_C_CCAT:3329116:0,0,0,1
chr1	3329119	.	G	GTCTA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3329116_C_CCAT:3329116:0,0,0,1
chr1	3329121	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3329116_C_CCAT:3329116:0,0,0,1
chr1	3342307	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	3342804	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	3348718	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:3348718_A_C:3348718:0,1,1,0
chr1	3348720	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=20,11;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:3348718_A_C:3348718:0,1,1,0
chr1	3348726	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:3348718_A_C:3348718:0,1,1,0
chr1	3348732	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3348718_A_C:3348718:0,1,1,0
chr1	3348737	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,13;MFRL=84,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:3348718_A_C:3348718:0,1,1,0
chr1	3379748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr1	3380244	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=119,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	3386009	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:3386009_AT_A:3386009:5,6,1,1
chr1	3386011	.	CCTCACGTCGGAGTTCTCCTACCAGCA	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:5,2:0|1:3386009_AT_A:3386009:6,7,1,1
chr1	3386046	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:3,2:0|1:3386009_AT_A:3386009:4,5,1,1
chr1	3389688	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:14,2:10,0:15,10,2,0
chr1	3391394	.	C	CCCACCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:3391394_C_CCCACCA:3391394:0,2,0,1
chr1	3391396	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=178,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3391394_C_CCCACCA:3391394:0,2,0,1
chr1	3391405	.	CCAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	3392613	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=105,139;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.322:26:4,0:14,8:9,9,0,8
chr1	3392720	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:0,0:2,5:0,2,0,5
chr1	3394456	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	3407555	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	3407579	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:3407579_G_A:3407579:0,0,0,1
chr1	3407580	.	T	TTATTTTAATTTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3407579_G_A:3407579:0,0,0,1
chr1	3410531	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=84,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,2,2
chr1	3413868	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:1,2,4,0
chr1	3424339	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:5,8,1,1
chr1	3428322	.	TACCTCCA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3440753	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=80,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,2:3,3:2,1,2,3
chr1	3440824	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,2,3
chr1	3477414	.	GGGCT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3496545	.	G	GAGAATCGCTTGAACCTGGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:3496545_G_GAGAATCGCTTGAACCTGGAA:3496545:3,1,1,1
chr1	3496548	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:3496545_G_GAGAATCGCTTGAACCTGGAA:3496545:3,1,0,1
chr1	3512078	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=250,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3512078_C_CT:3512078:0,1,0,1
chr1	3512079	.	C	CTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=250,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3512078_C_CT:3512078:0,1,0,1
chr1	3518944	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	3519054	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=76,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:5,6,1,2
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,1,2
chr1	3544235	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	3550093	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,3:11,0:7,11,1,2
chr1	3555428	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	3598871	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr1	3598900	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:3598900_G_A:3598900:0,0,6,3
chr1	3598910	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0|1:3598900_G_A:3598900:0,0,6,4
chr1	3638674	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,10,11
chr1	3638834	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	3643744	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:8,0:0|1:3643744_G_A:3643744:12,4,1,1
chr1	3643752	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=117,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:0|1:3643744_G_A:3643744:13,4,1,1
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3644349_A_G:3644349:0,0,0,1
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3644349_A_G:3644349:0,0,0,1
chr1	3644852	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3644852_GC_G:3644852:0,1,0,1
chr1	3644856	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3644852_GC_G:3644852:0,1,0,1
chr1	3644858	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3644852_GC_G:3644852:0,1,0,1
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3646088	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3646088_CC_GG:3646088:0,1,0,1
chr1	3646092	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3646088_CC_GG:3646088:0,1,0,1
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	3680046	.	CTC	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3680046_CTC_AGG:3680046:0,1,0,1
chr1	3680052	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3680046_CTC_AGG:3680046:0,1,0,1
chr1	3680345	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,5:4,1:1,4,4,2
chr1	3692580	.	C	CATCTGTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3699396	.	G	GATCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:3699396_G_GATCT:3699396:1,3,0,1
chr1	3699399	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:3699396_G_GATCT:3699396:1,3,0,1
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,138;MMQ=40,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	3743434	.	G	GGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=138,162;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:3743434_G_GGC:3743434:0,2,0,1
chr1	3743438	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=138,162;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:3743434_G_GGC:3743434:0,2,0,1
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,3:1,0,6,2
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	3746583	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=97,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:3746583_G_T:3746583:1,1,1,2
chr1	3746585	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=185,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1|0:3746583_G_T:3746583:1,2,1,1
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:3746583_G_T:3746583:0,0,2,4
chr1	3747580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:4,0:2,3:5,1,3,1
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,5:1,0,6,5
chr1	3755675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr1	3756120	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3761772	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:6,1,2,1
chr1	3764216	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	3769066	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3769066_T_C:3769066:0,1,0,1
chr1	3769071	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:3769066_T_C:3769066:0,1,0,1
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3782608	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	3784612	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=110,61;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:11,9,0,3
chr1	3786083	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3788968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=126,145;MMQ=54,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr1	3800117	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,2,2
chr1	3800242	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=109,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:7,5:6,2:8,5,5,4
chr1	3807313	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:4,8,0,2
chr1	4772009	.	A	AATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=80,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,3,1
chr1	5927721	.	A	ACGCTGAATGTTGGGATGGGCACGAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,362;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	5927943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	5927977	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=122,79;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:5,2,3,1
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	5935259	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	5937413	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=146,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	5947308	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,2:2,3:5,1,4,1
chr1	5967363	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5967363_C_CT:5967363:0,0,0,1
chr1	5967366	.	G	GTGGGGGCGGCGCAGAGGTCCACGTGCAGTACACGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=288,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5967363_C_CT:5967363:0,1,0,1
chr1	5987696	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	6100670	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:3,12,1,1
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,7,10
chr1	6145379	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.817:9:1,7:0,0:0,1,2,6
chr1	6157297	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:0,1,3,0
chr1	6166370	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:4,6,0,3
chr1	6166796	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,91;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,5:6,1:10,5,6,0
chr1	6169970	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:8,1:5,4:7,6,2,3
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	6181246	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,80;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:12,4:2,0:6,8,4,0
chr1	6181705	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:6181705_C_G:6181705:0,1,0,1
chr1	6181708	.	A	ACTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6181705_C_G:6181705:0,1,0,1
chr1	6181712	.	G	A,GTGTGGGCAGCCTCTGAAGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20,31;MFRL=0,86,114;MMQ=60,60,60;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr1	6181715	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=86,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:6181705_C_G:6181705:0,1,0,1
chr1	6185383	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	6185971	.	C	CAATAAGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6185971_C_CAATAAGATA:6185971:0,0,0,1
chr1	6185972	.	C	CTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6185971_C_CAATAAGATA:6185971:0,0,0,1
chr1	6186758	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,1:5,1:4,11,1,1
chr1	6188268	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=87,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr1	6188296	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=110,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,1,1
chr1	6195432	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=103,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:2,2,2,1
chr1	6196943	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6196951	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6203853	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.586:3:0,0:0,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,0,2,0
chr1	6203857	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,0,2,0
chr1	6204266	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6269280	.	A	AACGTCACACACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	6270513	.	C	CCGGTGGGCTGGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6270513_C_CCGGTGGGCTGGCT:6270513:1,1,0,1
chr1	6270515	.	C	CACGGACTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:6270513_C_CCGGTGGGCTGGCT:6270513:1,1,0,1
chr1	6272137	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	6273330	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=175,126;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:6273330_T_C:6273330:0,4,0,1
chr1	6273332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=175,126;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:6273330_T_C:6273330:0,4,0,1
chr1	6273338	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=175,126;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:6273330_T_C:6273330:0,4,0,1
chr1	6278414	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=106,160;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:7,2:4,3:6,5,3,2
chr1	6304617	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,1:9,0:9,4,1,1
chr1	6314075	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:4,3,2,0
chr1	6355123	.	GCCCTC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6378458	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	6393564	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,102;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,3:10,0:11,7,3,0
chr1	6473312	.	GG	AA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:6473312_GG_AA:6473312:3,8,0,2
chr1	6473315	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:6473312_GG_AA:6473312:3,8,0,2
chr1	6473318	.	G	GCAAGCTGC	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:6,2:0|1:6473312_GG_AA:6473312:4,9,0,2
chr1	6473321	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:6473312_GG_AA:6473312:5,7,0,2
chr1	6473326	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=22,29;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:6473312_GG_AA:6473312:5,7,0,2
chr1	6506096	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6529207	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6529207_T_C:6529207:0,1,0,1
chr1	6529211	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6529207_T_C:6529207:0,1,0,1
chr1	6529212	.	C	CTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=149,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6529207_T_C:6529207:0,1,0,1
chr1	6529799	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=145,148;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	6534520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr1	6534604	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=98,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:4,7,2,0
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	6585877	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:1,4:6,0:4,3,3,1
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	6586152	.	T	TTGTCTTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	6591937	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	6593391	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:8,4:3,0:5,6,2,2
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	6610366	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,1
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,1
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,2
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,2
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	6636461	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:2,1,2,2
chr1	6637056	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:6,5:5,3:7,5,4,4
chr1	6639001	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:3,2:11,0:3,12,1,1
chr1	6648153	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=94,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:8,5,0,2
chr1	6659445	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=82,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:3,5,3,4
chr1	6679848	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=106,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:2,5:7,2:6,3,4,3
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	6692524	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=107,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:2,0:11,6:4,9,0,6
chr1	6694851	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:6694851_G_A:6694851:0,0,0,1
chr1	6694856	.	C	CTTCTTTGGTGTGGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6694851_G_A:6694851:0,0,0,1
chr1	6694858	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6694851_G_A:6694851:0,0,0,1
chr1	6694927	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr1	6697562	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	6700129	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=0,43;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:2,1:0|1:6700129_T_A:6700129:5,3,1,1
chr1	6700131	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=0,43;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:0|1:6700129_T_A:6700129:5,1,1,1
chr1	6704702	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:4,5,3,1
chr1	6705793	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	6727802	.	TTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=95,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,3:5,0:5,4,2,1
chr1	6738521	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=100,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr1	6845657	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=87,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.361:6:1,2:3,0:0|1:6845657_G_GT:6845657:2,2,1,1
chr1	6845659	.	T	TCCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=87,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0|1:6845657_G_GT:6845657:2,2,1,1
chr1	6845661	.	G	GCAGGAGCGTGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=87,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:6845657_G_GT:6845657:2,2,1,1
chr1	6880405	.	G	GGCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6880405_G_GGCTGTC:6880405:0,1,0,1
chr1	6880407	.	C	CCAAATGGTGTGAGTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:1,1:0,0:0|1:6880405_G_GGCTGTC:6880405:0,1,0,1
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr1	7723588	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,1,2
chr1	7723683	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=85,107;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:1,1,0,4
chr1	7796641	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr1	7805921	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=99,41;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,1:2,7,1,1
chr1	7806004	.	C	CAACA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr1	7807897	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	7811215	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	7826681	.	A	ACATTTTCTTTTTGTCAAAAATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=63,187;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr1	7838113	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:5,1,5,0
chr1	7845695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,6:0,2,2,7
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.256:20:7,3:7,2:12,3,3,2
chr1	7861304	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=78.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,31:0.820:37:4,18:2,11:1,5,2,29
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr1	7863051	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=99,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr1	7863293	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	7863651	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,10,6
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr1	7880469	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr1	7887248	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:1,7,3,5
chr1	7890264	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:2,2,0,5
chr1	7890315	.	A	ATCTCTTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7890315_A_ATCTCTTCC:7890315:0,1,0,1
chr1	7890316	.	G	GTGGGATATTCACTGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7890315_A_ATCTCTTCC:7890315:0,1,0,1
chr1	7906870	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:7906870_G_A:7906870:0,3,0,1
chr1	7906872	.	T	TCCTAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:7906870_G_A:7906870:0,3,0,1
chr1	7907805	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	7913029	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,8:7,9:6,5,10,7
chr1	7998277	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,4,2
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	8022800	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=95,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.679:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr1	8029494	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,3:0,0:1,0,1,4
chr1	8029509	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	8037850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=146,98;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:1,10,1,2
chr1	8044868	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	8074242	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=112,72;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:13,3:9,0:0|1:8074242_A_G:8074242:6,17,2,1
chr1	8074247	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=110,72;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:0|1:8074242_A_G:8074242:7,14,2,1
chr1	8378327	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	8384268	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	8384533	.	ACACCCCAAGAGGAGGAAGTGCATTCGTCCCTCCCCACCCCCGCCCCCCAACACCCCGTGCCCGCTTGAGCTGGTGGACTTCGGGGACCTG	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.103:31:7,0:6,2:12,15,2,2
chr1	8384844	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8384844_T_C:8384844:0,1,0,1
chr1	8384846	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8384844_T_C:8384844:0,1,0,1
chr1	8384851	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8384844_T_C:8384844:0,1,0,1
chr1	8384853	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8384844_T_C:8384844:0,1,0,1
chr1	8397774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=157,171;MMQ=53,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr1	8397803	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	8399635	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:5,2,0,2
chr1	8404093	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	8415504	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=16,24;MFRL=82,86;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,1,0,1
chr1	8415508	.	GC	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=82,86;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,1,0,1
chr1	8415513	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,16;MFRL=86,86;MMQ=60,41;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,2,0,1
chr1	8415517	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,16;MFRL=86,86;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,2,0,1
chr1	8415520	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,14;MFRL=86,86;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,2,0,1
chr1	8415523	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,14;MFRL=86,86;MMQ=60,41;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,2,0,1
chr1	8415531	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=86,86;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0|1:8415504_G_T:8415504:1,2,0,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=94,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	8525898	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:8525898_C_A:8525898:0,0,1,0
chr1	8525903	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:8525898_C_A:8525898:1,0,1,0
chr1	8526142	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	8601207	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:12,2,2,0
chr1	8926285	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=210,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	9005996	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.160:17:6,2:9,0:8,7,2,0
chr1	9006101	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	9006104	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	9034598	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=105,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,6,1
chr1	9063602	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	9063646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	9097825	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=110,78;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:2,3,2,1
chr1	9101653	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	9118248	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,90;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.211:36:15,0:13,7:14,15,0,7
chr1	9171238	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	9427508	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr1	9613592	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	9630306	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:7,2,2,0
chr1	9633387	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,1:1,2:4,1,3,0
chr1	9642329	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=56,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:1,3:3,1,8,1
chr1	9648990	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:4,2,2,0
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	9661061	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	9662290	.	A	AGGCTGGTCTTGAACTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,1,1
chr1	9667708	.	CA	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	9670834	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=34;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	9671975	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9671975_A_C:9671975:0,0,0,1
chr1	9671979	.	G	GCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9671975_A_C:9671975:0,0,0,1
chr1	9714008	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=115,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,0:3,3:0|1:9714008_C_A:9714008:4,11,2,1
chr1	9714017	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=115,94;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:9714008_C_A:9714008:3,11,1,1
chr1	9714030	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=115,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:1,3:0,7,0,3
chr1	9714032	.	GAC	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:9714032_GAC_G:9714032:0,9,0,2
chr1	9714035	.	G	GTA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:9714032_GAC_G:9714032:0,9,0,2
chr1	9714066	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	9714258	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=96,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.544:24:6,5:4,8:5,6,6,7
chr1	9776463	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr1	9782081	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,3124346;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:9,10,1,1
chr1	9782386	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=142,97;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,5:3,9:5,4,8,6
chr1	9783244	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:9783244_C_T:9783244:4,7,1,1
chr1	9783252	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:0|1:9783244_C_T:9783244:3,8,1,1
chr1	9784159	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:6,3:4,10,0,4
chr1	9787108	.	C	CAGTTACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:3,2:6,0:7,2,0,2
chr1	9793480	.	G	GCCCATAATGCCTGCTCTTGAAACCTTTTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.268:10:6,2:1,0:5,3,1,1
chr1	9804143	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	9815436	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr1	9816620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,5,4
chr1	9816654	.	A	ACAGCCAGGCCTGAGAACACCAGCGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	9992121	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:9992121_C_A:9992121:0,3,0,1
chr1	9992131	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,0:1,1:0|1:9992121_C_A:9992121:1,3,0,1
chr1	9993058	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	9994941	.	ACT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=115,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:0,3:8,0:0|1:9994941_ACT_A:9994941:0,9,0,3
chr1	9994946	.	CC	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=115,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,3:8,0:0|1:9994941_ACT_A:9994941:0,9,0,3
chr1	9995489	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,150;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:3,1:7,1:8,2,2,0
chr1	9996774	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9996774_CA_TG:9996774:0,0,0,1
chr1	9996778	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:9996774_CA_TG:9996774:0,0,0,1
chr1	10032291	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,6:1,1:1,5,1,6
chr1	10035904	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	10041396	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	10042570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	10057422	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,7:4,1:2,5,2,6
chr1	10161300	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:3,0:1,6:0,5,1,5
chr1	10162951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,486;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	10211351	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=67,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,1:2,1,2,2
chr1	10221432	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:10221432_G_T:10221432:0,0,0,1
chr1	10221437	.	A	ACTGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10221432_G_T:10221432:0,0,0,1
chr1	10231463	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,0,2
chr1	10318543	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:4,3,7,2
chr1	10322054	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:3,4,1,3
chr1	10322140	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10322140_T_G:10322140:0,0,0,1
chr1	10322144	.	TG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10322140_T_G:10322140:0,0,0,1
chr1	10327407	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:6,4,2,1
chr1	10327623	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:7,3:2,1:3,6,1,3
chr1	10342658	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	10352116	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:19,0:10,3:0|1:10352116_T_C:10352116:15,14,2,1
chr1	10352118	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.118:32:16,0:10,3:0|1:10352116_T_C:10352116:15,14,2,1
chr1	10352126	.	G	GTCCGTGGCTACCCTTCAATGTCTTTATATT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.124:31:17,0:10,2:0|1:10352116_T_C:10352116:13,15,2,1
chr1	10352228	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	10352273	.	C	CTCTCTCTCTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	10357003	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=108,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:7,1:8,7,3,0
chr1	10364317	.	TGAGAAGTCAAGATCACATCCAAGTTAGCAAGCAGCACATTAATAATCAGCAACAGCCACCTCAACTACGTTG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.147:19:6,0:4,2:9,8,1,1
chr1	10386436	.	A	AATAGTGTTGCAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	10397049	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr1	10397679	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	10407953	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	10408799	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:21,0:22,3:32,11,3,0
chr1	10408837	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=17,26;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:4,1:2,1:4,10,1,2
chr1	10408850	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=121,123;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.352:17:5,6:5,0:5,6,0,6
chr1	10408887	.	AC	GT	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=129,133;MMQ=57,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0|1:10408887_AC_GT:10408887:0,6,0,2
chr1	10408889	.	A	AATGGC	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=129,133;MMQ=57,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,1:1,0:0|1:10408887_AC_GT:10408887:0,6,0,2
chr1	10408893	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=139,137;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:10408893_A_G:10408893:0,4,0,1
chr1	10408896	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,10;MFRL=139,137;MMQ=52,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:10408893_A_G:10408893:0,4,0,1
chr1	10408899	.	TCATAG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,26;MFRL=138,137;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:10408893_A_G:10408893:0,3,0,1
chr1	10423503	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=150,152;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:0,1:0,5,0,2
chr1	10423509	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=159,139;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr1	10423520	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=159,175;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	10425117	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	10435140	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:1,0:7,2:0|1:10435140_G_A:10435140:2,6,1,1
chr1	10435149	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=119,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:6,1:0|1:10435140_G_A:10435140:2,6,1,1
chr1	10435170	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	10435261	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	10459309	.	T	TGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:10459309_T_TGCA:10459309:0,1,0,1
chr1	10459311	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10459309_T_TGCA:10459309:0,1,0,1
chr1	10471393	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	10477240	.	G	GGCATCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	10477241	.	G	GCTCATGCCTGCAATCCCAGCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr1	10478830	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.559:6:1,0:1,2:2,1,2,1
chr1	10478918	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:13,0:15,3:7,22,0,3
chr1	10490539	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr1	10490550	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:4,3:4,5:7,1,6,2
chr1	10490647	.	G	GTACTTTTCTGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=107,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:3,2:8,0:5,8,1,1
chr1	10502307	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	10511544	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:2,6:1,1,8,1
chr1	10511589	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=203,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:0,5:4,10:3,1,12,4
chr1	10523405	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10523405_C_T:10523405:1,0,1,0
chr1	10523408	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10523405_C_T:10523405:1,0,1,0
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:2,3,5,1
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,2:1,6:3,1,6,2
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	10689942	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,3:0,0,2,9
chr1	10689984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=88,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:2,3:1,2:1,2,0,6
chr1	10720650	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11014238	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,1:3,1:1,13,0,2
chr1	11014278	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=137,119;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr1	11014294	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=198,140;MMQ=42,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	11017022	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,0:3,0,2,1
chr1	11017609	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:11017609_T_C:11017609:1,0,3,0
chr1	11017617	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=103,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:2,1:0,2:0|1:11017609_T_C:11017609:1,1,3,0
chr1	11017634	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=103,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:1,1,4,0
chr1	11018723	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	11018741	.	G	GCCGGCTGAAGTTTGAAGCTCCCACTGATGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,55;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:5,0:4,3,1,1
chr1	11024353	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11073954	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,112;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:21,4:13,0:19,16,4,0
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,174;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr1	11103029	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:6,0:2,10,2,0
chr1	11115093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=129,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr1	11115200	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=136,138;MMQ=40,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,1,0,1
chr1	11115205	.	T	TTTTG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=136,138;MMQ=40,36;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,1,0,1
chr1	11115208	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=136,138;MMQ=40,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,1,0,1
chr1	11115210	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=136,138;MMQ=40,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,1,0,1
chr1	11115215	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=136,138;MMQ=40,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,1,0,1
chr1	11115219	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,36;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11115200_C_T:11115200:0,0,0,1
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,1:1,3:2,0,4,0
chr1	11129839	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11129839_G_A:11129839:0,2,0,1
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11129839_G_A:11129839:0,2,0,1
chr1	11137559	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,131;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr1	11139953	.	T	TAGCAAAAAACAAACAACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11140620	.	AACACAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=158,147;MMQ=60,50;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=AC;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.653:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	11156032	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr1	11181365	.	C	CTCTGATGCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=68,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	11187618	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,11788;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:6,1:1,1:7,0,2,0
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	11193209	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:6,10,1,2
chr1	11193320	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11193320_A_C:11193320:0,1,0,1
chr1	11193321	.	A	ATCCTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11193320_A_C:11193320:0,1,0,1
chr1	11193322	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11193320_A_C:11193320:0,1,0,1
chr1	11227673	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11227673_A_T:11227673:0,0,0,1
chr1	11227678	.	G	GGTAGAATAGGAAATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11227673_A_T:11227673:0,0,0,1
chr1	11259667	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,2:9,0:9,7,1,1
chr1	11269319	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr1	11272888	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,118;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:27,5:14,0:19,22,5,0
chr1	11288832	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:7,8:12,0:0|1:11288832_T_G:11288832:13,7,8,0
chr1	11288840	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:5,8:8,0:0|1:11288832_T_G:11288832:12,4,8,0
chr1	11291478	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=120,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr1	11292669	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=196,138;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr1	11318710	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11318710_G_A:11318710:0,1,0,1
chr1	11318713	.	G	GTGAGGCCTTCCAAGCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11318710_G_A:11318710:0,1,0,1
chr1	11319289	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	11355072	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11355072_T_A:11355072:0,0,0,1
chr1	11355074	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11355072_T_A:11355072:0,0,0,1
chr1	11355077	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11355072_T_A:11355072:0,0,0,1
chr1	11355081	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11355072_T_A:11355072:0,0,0,1
chr1	11355083	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11355072_T_A:11355072:0,0,0,1
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,4,1
chr1	11579982	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11585302	.	T	TCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:11585302_T_TCCA:11585302:1,2,0,1
chr1	11585305	.	A	ACACTCAAGAGTTAACTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:11585302_T_TCCA:11585302:1,2,0,1
chr1	11585354	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:0,1,2,1
chr1	11594400	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=103,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	11594605	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	11595203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr1	11596412	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr1	11710585	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	11733456	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr1	11733499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11733499_C_T:11733499:0,3,0,1
chr1	11733502	.	C	CTGAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:11733499_C_T:11733499:0,4,0,1
chr1	11733505	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=100,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:11733499_C_T:11733499:0,4,0,1
chr1	11735841	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:1,1,1,5
chr1	11737051	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,2:1,1:0,2,1,3
chr1	11737057	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	11737063	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11737063_CT_C:11737063:0,2,0,1
chr1	11737065	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:11737063_CT_C:11737063:0,2,0,1
chr1	11740342	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=170,118;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11740342_G_C:11740342:1,0,1,0
chr1	11740344	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=170,118;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11740342_G_C:11740342:1,0,1,0
chr1	11740358	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr1	11772071	.	CCG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:11772071_CCG_C:11772071:0,2,0,1
chr1	11772075	.	A	AGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11772071_CCG_C:11772071:0,2,0,1
chr1	11772079	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11772071_CCG_C:11772071:0,2,0,1
chr1	11772303	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11772526	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	11805948	.	C	CAACTCAAATCCCATATTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr1	11806303	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,2,3
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:3,11:15,5:13,5,8,8
chr1	11832347	.	AG	GA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=108,100;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:12,10,0,2
chr1	11832400	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=153,103;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:1,0:4,1:0,5,0,1
chr1	11838848	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=94,80;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr1	11839850	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr1	11842491	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	11844189	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=108,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:5,5:12,0:0|1:11844189_A_G:11844189:12,6,4,1
chr1	11844214	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=89,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,15:0.552:27:10,4:2,11:1|0:11844189_A_G:11844189:6,6,8,7
chr1	11844368	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,0,2
chr1	11847525	.	G	GACTCCAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	11848139	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11849231	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	11851003	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	11852300	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,4:5,4:3,3,5,3
chr1	11854457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,7:1,2:4,1,5,4
chr1	11854917	.	AC	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	11854947	.	G	GAGCCAATCAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11854947_G_GAGCCAATCAA:11854947:0,0,0,1
chr1	11854954	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11854947_G_GAGCCAATCAA:11854947:0,0,0,1
chr1	11854955	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11854947_G_GAGCCAATCAA:11854947:0,0,0,1
chr1	11854956	.	G	GCTGCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11854947_G_GAGCCAATCAA:11854947:0,0,0,1
chr1	11860458	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	11861277	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,1:11,2:9,7,2,1
chr1	11879685	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,1:2,1:0,3,1,2
chr1	11882714	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	11888073	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	11888285	.	T	TTGTTTTTGTTTTTATTTTTGTTTTTGGCAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,57;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.188:20:8,3:8,0:4,13,2,1
chr1	11889284	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,4:10,0:9,9,4,0
chr1	11897592	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	11898896	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11898896_T_C:11898896:2,0,0,1
chr1	11898901	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11898896_T_C:11898896:2,0,0,1
chr1	11907329	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,1:1,1:4,5,0,2
chr1	11917620	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.284:15:4,1:7,3:9,2,2,2
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,4:3,1:2,1,4,1
chr1	11983570	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11983570_G_C:11983570:0,0,0,1
chr1	11983571	.	T	TAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11983570_G_C:11983570:0,0,0,1
chr1	11983572	.	T	TAACTGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11983570_G_C:11983570:0,0,0,1
chr1	12014539	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:1,3:18,0:12,8,1,2
chr1	12017164	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:12017164_G_GTA:12017164:1,2,1,1
chr1	12017165	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:12017164_G_GTA:12017164:1,2,1,1
chr1	12017166	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=145,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:12017164_G_GTA:12017164:1,2,1,1
chr1	12017169	.	CCTTCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:12017164_G_GTA:12017164:2,2,1,1
chr1	12017176	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=143,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:12017164_G_GTA:12017164:2,2,1,1
chr1	12027204	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=176,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	12027209	.	A	AGGGACCAAACTCCATCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=176,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	12033113	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=260,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:12033113_A_G:12033113:0,1,0,1
chr1	12033120	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12033113_A_G:12033113:0,0,0,1
chr1	12034741	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=91,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:3,9:12,0:7,9,9,0
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr1	12062221	.	TGCCTTGGGCAGTTAGGACAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=128,0;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	12067044	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	12169775	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:12169775_ACC_A:12169775:0,0,1,1
chr1	12169779	.	C	CAAAGTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:12169775_ACC_A:12169775:0,0,1,1
chr1	12169784	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12169775_ACC_A:12169775:0,0,0,1
chr1	12170084	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=106,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:0|1:12170084_G_A:12170084:12,6,2,1
chr1	12170097	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=104,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:12170084_G_A:12170084:10,11,2,0
chr1	12248856	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:12248856_G_GC:12248856:2,4,1,1
chr1	12248858	.	A	ATTTTCT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:12248856_G_GC:12248856:2,5,1,1
chr1	12248862	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:12248856_G_GC:12248856:2,5,1,1
chr1	12248865	.	CC	GG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=130,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:12248856_G_GC:12248856:2,5,1,1
chr1	12248942	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr1	12249020	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.852:5:0,2:0,0:0,0,0,5
chr1	12249031	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	12251191	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	12251765	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:7,0,3,1
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,14,8
chr1	12254201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr1	12261972	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	12313962	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12313962_G_A:12313962:0,3,0,1
chr1	12313964	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:12313962_G_A:12313962:0,3,0,1
chr1	12313972	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=120,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12313972_T_C:12313972:0,1,0,1
chr1	12313974	.	T	TAGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=120,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12313972_T_C:12313972:0,1,0,1
chr1	12313977	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=120,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12313972_T_C:12313972:0,1,0,1
chr1	12322128	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	12328050	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=154,145;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:12328050_G_A:12328050:0,4,0,1
chr1	12328056	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=154,145;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:12328050_G_A:12328050:0,4,0,1
chr1	12328061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12328061_C_T:12328061:0,4,0,1
chr1	12328063	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12328061_C_T:12328061:0,4,0,1
chr1	12328068	.	GA	CT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	12328075	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=171,145;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12328050_G_A:12328050:0,1,0,1
chr1	12328082	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=171,145;MMQ=60,21;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12328050_G_A:12328050:0,1,0,1
chr1	12335965	.	ACACCTCCTAACACCC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:1,0:2,2:17,2,2,0
chr1	12336436	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:6,5,2,1
chr1	12364815	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=106,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr1	12364847	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:12364847_AAC_A:12364847:0,2,0,1
chr1	12364849	.	C	CAGACAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=189,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	12364850	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:12364847_AAC_A:12364847:0,2,0,1
chr1	12364853	.	G	GTTCCAATTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12364847_AAC_A:12364847:0,1,0,1
chr1	12364855	.	G	GAAGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12364847_AAC_A:12364847:0,1,0,1
chr1	12368589	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,2:14,0:0|1:12368589_G_A:12368589:15,9,2,0
chr1	12368596	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:12368589_G_A:12368589:16,9,2,0
chr1	12368705	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:6,3:2,0:4,8,1,3
chr1	12368725	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=132,100;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:3,10,0,2
chr1	12368750	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=141,102;MMQ=60,50;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:1,5,0,2
chr1	12378406	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:12378406_TG_T:12378406:0,1,0,1
chr1	12378412	.	TGATTCA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,27;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:12378406_TG_T:12378406:0,1,0,1
chr1	12378421	.	GGTGCTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12378406_TG_T:12378406:0,1,0,1
chr1	12379633	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,10:5,3:8,2,7,6
chr1	12393323	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,0:5,3:5,5,2,1
chr1	12416608	.	GAAATAAGCTCCCAGGGAAGGGA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:2,8,1,1
chr1	12418581	.	C	CAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:11,9,2,1
chr1	12418700	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	12639519	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=176,127;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12639519_T_TA:12639519:0,1,0,1
chr1	12639526	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=176,127;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:12639519_T_TA:12639519:0,1,0,1
chr1	12704812	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12704812_TCA_T:12704812:0,1,0,1
chr1	12704818	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12704812_TCA_T:12704812:0,1,0,1
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	12776344	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,9:4,0:2,9,4,5
chr1	12779618	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr1	12781015	.	GA	AG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,2,0,1
chr1	12781019	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,2,0,1
chr1	12781021	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,1,0,1
chr1	12781025	.	TGGGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,1,0,1
chr1	12781033	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,0,0,1
chr1	12781037	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12781015_GA_AG:12781015:0,0,0,1
chr1	12785093	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	12836126	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,1:9,3:6,13,4,0
chr1	12837295	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=121,212;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:10,2:3,1:0|1:12837295_T_C:12837295:10,5,3,0
chr1	12837308	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=24,28;MFRL=109,144;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:11,1:5,3:0|1:12837295_T_C:12837295:10,6,5,0
chr1	12837311	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=30,29;MFRL=103,130;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:11,2:5,4:0|1:12837295_T_C:12837295:12,6,5,1
chr1	12837316	.	GC	TT	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=93,130;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:12,2:6,4:0|1:12837295_T_C:12837295:19,6,5,1
chr1	12837319	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=29,28;MFRL=85,130;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:11,2:12,4:0|1:12837295_T_C:12837295:17,6,5,1
chr1	12837331	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=31,25;MFRL=85,115;MMQ=60,36;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.228:33:11,3:15,4:0|1:12837295_T_C:12837295:18,8,5,2
chr1	12837358	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=110,105;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,2:9,5:0|1:12837358_G_A:12837358:11,6,3,4
chr1	12837371	.	GT	AA	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=25,28;MFRL=101,102;MMQ=52,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,9:0.357:26:8,4:9,3:0|1:12837358_G_A:12837358:10,7,4,5
chr1	12837376	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=101,102;MMQ=50,36;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.384:24:7,6:8,2:0|1:12837358_G_A:12837358:10,5,4,5
chr1	12837471	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=136,118;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:3,2:0,2:0|1:12837471_A_G:12837471:2,1,1,4
chr1	12837475	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=136,118;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0|1:12837471_A_G:12837471:2,1,1,4
chr1	12837564	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=118,96;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:14,2:0|1:12837564_G_T:12837564:12,12,1,1
chr1	12837570	.	GA	AG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,96;MMQ=60,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:14,2:0|1:12837564_G_T:12837564:12,13,1,1
chr1	12837669	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=116,108;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,1:9,1:11,13,1,1
chr1	12837705	.	G	GCC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=113,139;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.287:23:11,0:6,5:0|1:12837705_G_GCC:12837705:5,12,3,3
chr1	12837720	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=118,137;MMQ=60,56;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.328:23:9,0:6,6:0|1:12837705_G_GCC:12837705:2,14,3,4
chr1	12837728	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=122,139;MMQ=60,58;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:8,0:5,6:0|1:12837705_G_GCC:12837705:1,12,2,4
chr1	12837764	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=122,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:1,5,1,4
chr1	12853704	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	12853975	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	12854021	.	GA	TT	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=105,94;MMQ=25,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:0,4:4,3:0|1:12854021_GA_TT:12854021:3,1,4,3
chr1	12854041	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=22,30;MFRL=105,97;MMQ=25,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:0,3:4,3:0|1:12854021_GA_TT:12854021:3,1,3,3
chr1	12854052	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=31,21;MFRL=113,99;MMQ=25,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,2:3,3:0|1:12854021_GA_TT:12854021:2,1,2,4
chr1	12854090	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=152,99;MMQ=25,44;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0|1:12854090_T_A:12854090:1,1,2,3
chr1	12854097	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=113,99;MMQ=25,44;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:0,3:2,2:0|1:12854090_T_A:12854090:2,1,2,3
chr1	12854105	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=26,29;MFRL=103,99;MMQ=31,44;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:0|1:12854090_T_A:12854090:3,3,2,3
chr1	12854614	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=83,62;MMQ=48,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:12854614_T_A:12854614:2,2,0,1
chr1	12854616	.	C	CTTAGAGTTACAGTGCTCTAGAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=83,62;MMQ=48,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:12854614_T_A:12854614:2,2,0,1
chr1	12854938	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,127;MMQ=24,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:2,0:0,4,0,3
chr1	12855962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,134;MMQ=27,24;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,1,4
chr1	12856010	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=105,113;MMQ=27,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:4,1,7,3
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,174;MMQ=26,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=157,137;MMQ=40,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0|1:12907199_T_A:12907199:4,0,3,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=138,137;MMQ=40,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0|1:12907199_T_A:12907199:6,0,4,0
chr1	12907282	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=147,114;MMQ=52,30;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0|1:12907282_G_C:12907282:4,5,3,3
chr1	12907284	.	TG	CC	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=147,114;MMQ=52,30;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0|1:12907282_G_C:12907282:4,5,3,3
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,21;MFRL=116,114;MMQ=54,30;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:6,2:4,1:3,7,1,2
chr1	12907379	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,5:1,6:4,3,6,5
chr1	12907496	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=135,137;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:5,2:2,4:0|1:12907496_T_C:12907496:2,5,2,4
chr1	12907507	.	CT	TC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=158,142;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,1:1,5:0|1:12907496_T_C:12907496:1,4,2,5
chr1	12907533	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=135,142;MMQ=27,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,3:0,3,4,3
chr1	12907762	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=153,125;MMQ=51,37;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:6,3,1,3
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=136,168;MMQ=52,27;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,3:4,3,5,2
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=136,184;MMQ=51,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:2,3:7,1:0|1:12907781_T_C:12907781:6,5,4,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=134,138;MMQ=52,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:3,7:10,3:0|1:12907781_T_C:12907781:8,6,10,0
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=29,25;MFRL=134,138;MMQ=52,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:3,6:10,3:0|1:12907781_T_C:12907781:8,6,10,0
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=119,121;MMQ=52,51;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:2,10:8,3:6,5,10,3
chr1	12907843	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=23,23;MFRL=121,119;MMQ=51,29;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,0:11,2:16,9,2,1
chr1	12908236	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=275616,148;MMQ=27,27;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:6,1:1,2:0,7,0,4
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=0,137904;MMQ=39,28;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	12918819	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=75,124;MMQ=45,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	12918891	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=93,120;MMQ=60,49;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:5,2,2,3
chr1	12919173	.	AG	GA,GG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32,32;MFRL=156,146,189;MMQ=49,40,35;MPOS=22,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.57,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.300,0.350:6:0,1,0:2,1,2:1,1,0,4
chr1	12919186	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,147;MMQ=45,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:1,5,1,2
chr1	12919511	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,131;MMQ=60,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	12920132	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=150,146;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0|1:12920132_A_G:12920132:1,2,0,3
chr1	12920138	.	T	TCA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=150,164;MMQ=40,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:0,1:0|1:12920132_A_G:12920132:1,2,0,3
chr1	12920141	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=165,164;MMQ=50,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:0|1:12920132_A_G:12920132:1,1,0,3
chr1	12920191	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=150,167;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:12920191_T_C:12920191:0,1,0,2
chr1	12920200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=150,167;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:12920191_T_C:12920191:0,1,0,2
chr1	12921127	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=94,32812;MMQ=60,49;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,3:1,6:2,1,5,5
chr1	12921311	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=116,150;MMQ=60,37;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:5,6,2,0
chr1	12921365	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=128,130;MMQ=46,24;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:12921365_A_C:12921365:6,6,0,2
chr1	12921367	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=128,130;MMQ=46,24;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:12921365_A_C:12921365:6,6,0,2
chr1	12921423	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=138,163;MMQ=32,32;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	12921686	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=115,140;MMQ=24,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,2:2,2:3,2,1,3
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=136,113;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:2,0:4,1:1,5,1,2
chr1	12955054	.	GC	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	12979633	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=146,120;MMQ=25,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:12979633_C_CAA:12979633:1,2,1,1
chr1	12979636	.	ACCT	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=140,120;MMQ=25,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:12979633_C_CAA:12979633:1,3,1,1
chr1	12979665	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=140,95;MMQ=28,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0|1:12979665_C_T:12979665:3,3,1,2
chr1	12979671	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=140,95;MMQ=28,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0|1:12979665_C_T:12979665:3,3,1,2
chr1	12979685	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=140,120;MMQ=28,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,0,2
chr1	12979866	.	TGGACTTAGA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=112,106;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=136,93;MMQ=27,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:13182899_A_G:13182899:1,0,0,1
chr1	13182901	.	T	TGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=136,93;MMQ=27,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13182899_A_G:13182899:1,0,0,1
chr1	13182904	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=136,93;MMQ=27,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13182899_A_G:13182899:1,0,0,1
chr1	13183213	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=128,157;MMQ=27,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:7,6,2,0
chr1	13183225	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=137,157;MMQ=27,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:0|1:13183225_T_C:13183225:7,3,2,0
chr1	13183228	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=133,150;MMQ=27,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:5,1:0|1:13183225_T_C:13183225:8,3,3,0
chr1	13183237	.	CT	TC	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=139,144;MMQ=30,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0|1:13183225_T_C:13183225:6,2,4,0
chr1	13183243	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=139,144;MMQ=30,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0|1:13183225_T_C:13183225:6,2,4,0
chr1	13183248	.	TC	AA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=139,144;MMQ=30,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:0|1:13183225_T_C:13183225:6,2,4,0
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=126,99;MMQ=45,36;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:0|1:13183511_T_C:13183511:3,4,1,5
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=125,109;MMQ=51,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:0|1:13183511_T_C:13183511:5,5,1,4
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=125,109;MMQ=51,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,3:5,1:0|1:13183511_T_C:13183511:5,5,1,4
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=131,130;MMQ=51,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:7,7,0,2
chr1	13183704	.	A	AAGGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=157,139;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	13448351	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,23;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	13695974	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,24;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	13718628	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	13802224	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	13802622	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:13802622_T_G:13802622:2,0,0,1
chr1	13802623	.	A	ACCCAAACAAGGGGGAGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:13802622_T_G:13802622:2,0,0,1
chr1	13802628	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:13802622_T_G:13802622:1,0,0,1
chr1	13933855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	14059206	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr1	14068713	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=134,73607100;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:14068713_T_TC:14068713:0,13,1,1
chr1	14068714	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=134,73607100;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,1:0|1:14068713_T_TC:14068713:0,13,1,1
chr1	14107442	.	TTTCTTCTTCCTCCTCTTCATCTTCCTCCTCCTCTTCGTTTTCTTC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.133:21:0,0:4,2:7,12,1,1
chr1	14113091	.	CTACGGCAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=91,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14113091_CTACGGCAA_C:14113091:0,1,0,1
chr1	14113104	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=91,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14113091_CTACGGCAA_C:14113091:0,1,0,1
chr1	15287381	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=59,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	15382667	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,4:4,2:2,2,2,4
chr1	15386862	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,24;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0,2,0,2
chr1	15427982	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	15428351	.	C	CCTGGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15428351_C_CCTGGCA:15428351:0,0,0,1
chr1	15428354	.	CCACT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15428351_C_CCTGGCA:15428351:0,0,0,1
chr1	15428361	.	C	CATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15428351_C_CCTGGCA:15428351:0,0,0,1
chr1	15439083	.	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	15439129	.	C	CCCCGGGCAATCGCTTATCTACCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:15439129_C_CCCCGGGCAATCGCTTATCTACCTT:15439129:0,0,0,1
chr1	15439132	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:15439129_C_CCCCGGGCAATCGCTTATCTACCTT:15439129:0,0,0,1
chr1	15439134	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15439129_C_CCCCGGGCAATCGCTTATCTACCTT:15439129:0,0,0,1
chr1	15495269	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=59,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15495269_T_C:15495269:1,1,0,1
chr1	15495272	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=59,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:15495269_T_C:15495269:1,1,0,1
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	15541839	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=15890784,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	15616220	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15616220_T_G:15616220:0,0,0,1
chr1	15616227	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15616220_T_G:15616220:0,0,0,1
chr1	15627615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	15651007	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=106,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,1:10,0:0|1:15651007_G_A:15651007:9,17,2,0
chr1	15651014	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=109,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:0|1:15651007_G_A:15651007:9,13,2,0
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,7:4,2:3,7,3,6
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,1:1,3:1,4,1,4
chr1	15653563	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=109,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:6,5:3,5:4,5,4,7
chr1	15653595	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:11,0:17,12,1,1
chr1	15653678	.	CTCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	15654737	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.284:8:2,1:1,1:4,2,2,0
chr1	15668319	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=90,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:7,13:7,8:9,5,11,10
chr1	15671483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	15687059	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=109,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:4,6:4,5:4,4,6,6
chr1	15693868	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=156,108;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15693868_C_T:15693868:3,0,1,0
chr1	15693878	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,108;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15693868_C_T:15693868:3,0,1,0
chr1	15694129	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:15694129_C_T:15694129:1,0,0,1
chr1	15694133	.	G	GCAAGAAGAAACGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15694129_C_T:15694129:1,0,0,1
chr1	15723843	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0,0,4,7
chr1	15736792	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:20,0:9,3:8,22,0,3
chr1	15736796	.	G	GGCCCCCCCC	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.194:23:9,3:10,1:0,19,4,0
chr1	15755248	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,7:3,3:0,4,2,8
chr1	15766936	.	G	GGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	15769098	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=213,136;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15769098_A_T:15769098:0,1,0,1
chr1	15769101	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15769098_A_T:15769098:0,0,0,1
chr1	15769102	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15769098_A_T:15769098:0,0,0,1
chr1	15769117	.	G	GGAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15769117_G_GGAA:15769117:0,0,0,1
chr1	15769119	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15769117_G_GGAA:15769117:0,0,0,1
chr1	15769121	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15769117_G_GGAA:15769117:0,0,0,1
chr1	15769876	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	15772933	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	15773178	.	T	TTTCACTAACTATAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=135,143;MMQ=33,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15773178_T_TTTCACTAACTATAAA:15773178:0,1,0,1
chr1	15773181	.	C	CATATTTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=135,143;MMQ=33,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15773178_T_TTTCACTAACTATAAA:15773178:0,1,0,1
chr1	15773195	.	G	GGTTGTTCCTTTCCATGTTTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15773195_G_GGTTGTTCCTTTCCATGTTTA:15773195:0,0,0,1
chr1	15773201	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15773195_G_GGTTGTTCCTTTCCATGTTTA:15773195:0,0,0,1
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	15783381	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,136;MMQ=51,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	15783553	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=125,127;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:5,2,2,0
chr1	15788126	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,157;MMQ=40,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	15789297	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,9,8
chr1	15793994	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr1	15809992	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.383:14:0,3:7,2:2,7,0,5
chr1	15814032	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	15820521	.	C	CTTCCTTTCCTTTGAATGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:15820521_C_CTTCCTTTCCTTTGAATGAGT:15820521:0,1,0,1
chr1	15820526	.	GG	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15820521_C_CTTCCTTTCCTTTGAATGAGT:15820521:0,0,0,1
chr1	15821948	.	C	CTTGATTCAGAAGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=111,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:2,2,0,1
chr1	15831298	.	A	ATTTCCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=219,144189873;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:15831298_A_ATTTCCTCTT:15831298:0,1,1,0
chr1	15831300	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=219,144189873;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15831298_A_ATTTCCTCTT:15831298:0,1,1,0
chr1	15834491	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,0,2
chr1	15834498	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,2,0
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:0,2,2,4
chr1	15850553	.	C	CGGGGGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=107,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGGCG;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,0:0,2:0,1,3,0
chr1	15855806	.	AA	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	15873386	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.359:40:12,10:13,4:12,14,8,6
chr1	15874961	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=86,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr1	15890342	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,161;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	15892723	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15892723_A_AG:15892723:0,0,0,1
chr1	15892725	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15892723_A_AG:15892723:0,0,0,1
chr1	15892726	.	T	TGCTTGGCAAGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15892723_A_AG:15892723:0,0,0,1
chr1	15904404	.	G	GAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15904404_G_GAAGA:15904404:0,1,0,1
chr1	15904406	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15904404_G_GAAGA:15904404:0,1,0,1
chr1	15906754	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:15906754_T_G:15906754:0,4,0,2
chr1	15906757	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:15906754_T_G:15906754:0,4,0,2
chr1	15906759	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,0:0|1:15906754_T_G:15906754:0,4,0,2
chr1	15906763	.	C	CGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=171,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:15906754_T_G:15906754:0,4,0,1
chr1	15909624	.	TGAGTACAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,1,4
chr1	15956769	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	15965025	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=196,182;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=22,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	15970229	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:0,4,0,4
chr1	15987693	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=97,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:13,7,2,0
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,3:0,0,8,0
chr1	16043157	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	16044929	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	16044945	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	16045174	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	16047726	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	16055677	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:15,1:9,3:13,11,1,3
chr1	16064820	.	G	GGCTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:16064820_G_GGCTAA:16064820:0,0,0,1
chr1	16064824	.	AC	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16064820_G_GGCTAA:16064820:0,0,0,1
chr1	16069180	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=154,101625067;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16069180_C_A:16069180:0,1,1,0
chr1	16069186	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=152,101625067;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:16069180_C_A:16069180:0,2,1,0
chr1	16069188	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=152,101625067;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:16069180_C_A:16069180:0,2,1,0
chr1	16069192	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=149,101625067;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16069180_C_A:16069180:0,1,1,0
chr1	16069594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr1	16073560	.	C	CCGGAAACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16073560_C_CCGGAAACAG:16073560:0,1,0,1
chr1	16073563	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16073560_C_CCGGAAACAG:16073560:0,1,0,1
chr1	16091815	.	A	ACCGCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16091815_A_ACCGCC:16091815:1,0,0,1
chr1	16091818	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16091815_A_ACCGCC:16091815:1,0,0,1
chr1	16091819	.	T	TCTTTTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16091815_A_ACCGCC:16091815:1,0,0,1
chr1	16091824	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16091815_A_ACCGCC:16091815:1,0,0,1
chr1	16091827	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,23;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16091815_A_ACCGCC:16091815:1,0,0,1
chr1	16093935	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:16093935_A_C:16093935:1,3,1,0
chr1	16093941	.	T	C,TCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12,28;MFRL=0,130,169;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.333,0.455:2:0,0,1:0,0,0:0,0,1,1
chr1	16093944	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,12;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:16093935_A_C:16093935:0,2,1,0
chr1	16093946	.	CG	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	16093947	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:16093935_A_C:16093935:0,0,1,0
chr1	16094039	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=115,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,1:4,0:2,8,1,1
chr1	16094040	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=98,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:1,9,2,0
chr1	16101452	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr1	16134005	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=128,129;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:1,7,2,0
chr1	16199587	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,1:8,12,1,1
chr1	16202666	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,93;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:9,1,3,0
chr1	16242620	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=90,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,9:2,4:4,4,6,7
chr1	16248728	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:11,0,3,0
chr1	16255360	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:9,4:9,0:7,11,2,2
chr1	16256007	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:2,9:9,8:4,7,9,8
chr1	16259401	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,0:10,8:12,9,8,0
chr1	16260591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=101,129;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:5,2:4,5,0,2
chr1	16262470	.	CA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16262470_CA_TC:16262470:0,0,0,1
chr1	16262476	.	TG	AA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16262470_CA_TC:16262470:0,0,0,1
chr1	16262520	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=0,42;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,0:1,1:0,1,1,1
chr1	16262685	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=102,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:4,5,1,1
chr1	16262731	.	C	CG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:16262731_C_CG:16262731:4,5,1,1
chr1	16262732	.	C	CTAAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:16262731_C_CG:16262731:4,5,1,1
chr1	16263689	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:16,0:7,6:12,11,0,6
chr1	16264264	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=114,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:3,2,2,1
chr1	16265422	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	16266006	.	A	AATAAAAAATTCTTCCTAAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16266006_A_AATAAAAAATTCTTCCTAAAT:16266006:0,0,0,1
chr1	16266007	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16266006_A_AATAAAAAATTCTTCCTAAAT:16266006:0,0,0,1
chr1	16268762	.	C	CTGTCTTGTCTGGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=137,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr1	16271180	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	16273686	.	T	TACCACCATCATCATCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr1	16274769	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr1	16330937	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:3,3:1,5:0,4,0,9
chr1	16330990	.	A	ACT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=150,185;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	16344402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=65,81;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:2,1,1,1
chr1	16345551	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16345551_TA_T:16345551:0,0,1,0
chr1	16345553	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16345551_TA_T:16345551:0,0,1,0
chr1	16351275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=124,81;MMQ=52,45;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,1:7,1,1,1
chr1	16352528	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	16352538	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	16352937	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=162656241,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr1	16356501	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=118,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,0,2
chr1	16356510	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,3,0
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,1:6,2:1,8,1,2
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	16358932	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,9,7
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.492:14:1,3:6,3:0|1:16359051_CA_AG:16359051:1,6,3,4
chr1	16359052	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=83,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,12:0.929:13:0,2:0,10:1|0:16359051_CA_AG:16359051:1,0,3,9
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	16372278	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,1,1
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,1,1
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	16376319	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	16377108	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	16378649	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	16382348	.	G	GTCTCTCACACACACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:1,1,1,1
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:1,1,1,1
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:1,1,1,1
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,6,2
chr1	16383267	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:7,1,4,0
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=120,125;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.827:7:0,5:1,0:0,1,0,6
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,0:0,0,0,7
chr1	16383348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=68,120;MMQ=49,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:1,2,1,4
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr1	16383515	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=143,150;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.339:9:4,2:2,0:1,5,0,3
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	16383794	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,51;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:8,6,1,1
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,39;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0|1:16388556_C_T:16388556:0,0,3,1
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=160,144;MMQ=27,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0|1:16388556_C_T:16388556:0,1,4,1
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	16388890	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	16460910	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	16474983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr1	16525657	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:6,2,4,7
chr1	16525812	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16525812_T_A:16525812:0,0,0,1
chr1	16525813	.	A	AAATGTTTTGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16525812_T_A:16525812:0,0,0,1
chr1	16528205	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=140,212;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,4:1,0:1,1,4,0
chr1	16528218	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,5:0,0:0,0,5,1
chr1	16528843	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	16533022	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,31;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:16533022_C_T:16533022:0,1,0,1
chr1	16533046	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16533022_C_T:16533022:0,1,0,1
chr1	16533048	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16533022_C_T:16533022:0,1,0,1
chr1	16534264	.	A	AAACACAGAACAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,2:3,0:4,3,1,1
chr1	16534410	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163490;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16542366	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:3,0:0,2:3,0,3,0
chr1	16542937	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,5:4,0:5,1,4,1
chr1	16555506	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:14,1:8,2:9,13,1,2
chr1	16555566	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=164,140;MMQ=49,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.477:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	16555567	.	G	GCA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=158,164;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:16555567_G_GCA:16555567:0,3,0,1
chr1	16555569	.	GTA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=158,164;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16555567_G_GCA:16555567:0,3,0,1
chr1	16555575	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,21;MFRL=158,164;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16555567_G_GCA:16555567:0,3,0,1
chr1	16555579	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=158,164;MMQ=50,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:16555567_G_GCA:16555567:0,3,0,1
chr1	16555979	.	GCA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:5,2:7,0:11,2,1,1
chr1	16558697	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	16563044	.	CTCTCCTCAGGGAGCAACAGGTGACACTCT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.180:26:6,0:5,2:16,6,4,0
chr1	16582357	.	A	AAACAGACACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.385:4:0,1:1,0:0|1:16582357_A_AAACAGACACT:16582357:0,3,0,1
chr1	16582361	.	A	ACATCAGATGCACACACACAGACACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,16;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:16582357_A_AAACAGACACT:16582357:0,2,0,1
chr1	16583030	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	16583080	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=94,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,3:6,1,5,2
chr1	16621183	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	16632202	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=236,178;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	16632208	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=236,178;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	16641899	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=71,140;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,9:1,4:0,2,4,9
chr1	16726036	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr1	16727305	.	G	GCTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=85,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr1	16730413	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=109,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:0,1:5,4:4,1,3,2
chr1	16730582	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	16731646	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:16731646_TG_CC:16731646:0,0,1,2
chr1	16731653	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:16731646_TG_CC:16731646:0,0,1,1
chr1	16731661	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16731646_TG_CC:16731646:0,0,0,1
chr1	16736546	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr1	16748122	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:16748122_T_C:16748122:0,2,0,1
chr1	16748125	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=143,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:16748122_T_C:16748122:0,2,0,1
chr1	16748432	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr1	16767359	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:3,5:4,1:2,5,4,2
chr1	16890383	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,191;MMQ=47,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=143,153;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,2:3,1:2,5,1,2
chr1	16893619	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,206;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:8,3,2,0
chr1	16893856	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=152,137;MMQ=40,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,3:6,1:0,13,0,4
chr1	16907283	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=107,110;MMQ=27,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,10:0.137:77:37,5:30,5:35,32,6,4
chr1	16914159	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=119,157;MMQ=31,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:5,1:14,2:14,7,1,2
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,157;MMQ=45,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:7,2:12,6:13,6,4,4
chr1	16914176	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=110,173;MMQ=31,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,1:19,3:21,11,1,3
chr1	16914387	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,64194870;MMQ=60,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:5,2,0,2
chr1	16918486	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,118;MMQ=46,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:1,3:7,4:2,7,4,3
chr1	16918502	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=201,120;MMQ=60,43;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,4:0,7:0,1,4,8
chr1	17250762	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	17250991	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.234:24:11,2:4,3:8,11,1,4
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr1	17256294	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	17256409	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	17257840	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:9,1:9,6:11,8,5,2
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=125,148;MMQ=50,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,2:3,4:6,5,6,0
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=114,100;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:14,8:10,9:14,10,9,8
chr1	17265327	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:1,3:3,1:6,0,4,0
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=134,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr1	17265416	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:3,10,1,2
chr1	17265620	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	17271989	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,111;MMQ=40,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:2,6,2,2
chr1	17272037	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=139,111;MMQ=40,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,0,2
chr1	17272149	.	G	GGTTAGTAGTATATTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,111;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	17272980	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,143;MMQ=55,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:1,3,0,8
chr1	17273493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=155,73;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	17273517	.	G	GATTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,73;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17273517_G_GATTC:17273517:0,2,0,1
chr1	17273519	.	G	GGAGGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,73;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17273517_G_GATTC:17273517:0,2,0,1
chr1	17275436	.	G	GTGCGGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=127,168;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:0|1:17275436_G_GTGCGGT:17275436:1,4,0,2
chr1	17275438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=127,168;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:17275436_G_GTGCGGT:17275436:1,4,0,2
chr1	17292301	.	C	CAACAGCCCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:13,11,1,1
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	17299014	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=174,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,2:1,5:1,1,4,4
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	17313244	.	CCCCAGGGCTCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	17313454	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:2,1,1,2
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	17328731	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:1,3,3,1
chr1	17332357	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17332357_C_T:17332357:0,0,0,1
chr1	17332367	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17332357_C_T:17332357:0,0,0,1
chr1	17332370	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17332357_C_T:17332357:0,0,0,1
chr1	17332376	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17332357_C_T:17332357:0,0,0,1
chr1	17354406	.	GATTCCATCATCACCTCA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr1	17355291	.	A	AATCCCATTTGCAGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,3,13
chr1	17380583	.	C	CTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,2:0,3:3,2,2,3
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr1	17401379	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,1,1
chr1	17401490	.	C	CTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17402116	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.675:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:0,4:2,2:1,1,4,4
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	17405731	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,2,4
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	17409216	.	C	CAAAAACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=221,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,5,1
chr1	17418894	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.630:6:1,1:1,3:0|1:17418883_A_G:17418883:2,0,2,2
chr1	17419024	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:2,0,2,2
chr1	17422302	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.822:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	17431593	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,30;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:17431593_T_G:17431593:0,1,0,1
chr1	17431596	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17431593_T_G:17431593:0,1,0,1
chr1	17431598	.	TA	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17431593_T_G:17431593:0,1,0,1
chr1	17431602	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,21;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:17431593_T_G:17431593:0,1,0,1
chr1	17431618	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	17445715	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,3:1,0:2,1,3,1
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	17551034	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17557039	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr1	17557178	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,2,2
chr1	17563967	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr1	17570466	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr1	17570648	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:9,3:5,0:7,7,2,1
chr1	17570767	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:0,1,0,5
chr1	17592121	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,3,1
chr1	17593144	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	17596961	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:17596961_T_C:17596961:0,3,0,1
chr1	17596972	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,28;MFRL=133,165;MMQ=58,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:17596961_T_C:17596961:0,2,0,1
chr1	17597314	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	17597721	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	17601083	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,4,0
chr1	17657616	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=103,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:4,0,6,3
chr1	17660697	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=26,30;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.566:23:7,9:2,4:10,0,13,0
chr1	17660802	.	A	AT,ATT,ATTT	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=24,21,24,30;MFRL=124,103,116,46;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,19,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.48,6.62,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:24,6,6,6:0.124,0.170,0.159:42:16,4,4,5:6,1,1,1:10,14,11,7
chr1	17660818	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=18;MBQ=26,20;MFRL=122,82;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:26,0:2,2:0|1:17660818_G_A:17660818:17,22,1,1
chr1	17660820	.	TG	CA	.	.	DP=41;ECNT=18;MBQ=26,20;MFRL=122,82;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:29,0:2,2:0|1:17660818_G_A:17660818:17,22,1,1
chr1	17660823	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=18;MBQ=25,18;MFRL=125,82;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:24,0:1,1:0|1:17660818_G_A:17660818:14,21,1,1
chr1	17660825	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=18;MBQ=28,20;MFRL=131,82;MMQ=56,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:23,0:2,2:0|1:17660818_G_A:17660818:5,21,1,1
chr1	17660829	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=18;MBQ=24,28;MFRL=125,170;MMQ=43,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:19,2:3,0:0|1:17660829_A_G:17660829:3,20,0,2
chr1	17660830	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=30,28;MFRL=125,170;MMQ=43,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:20,2:2,0:0|1:17660829_A_G:17660829:3,20,0,2
chr1	17660831	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=30,29;MFRL=131,82;MMQ=48,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:19,1:1,1:2,20,1,2
chr1	17660832	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=31,25;MFRL=128,170;MMQ=42,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:19,1:2,0:0|1:17660829_A_G:17660829:2,20,0,2
chr1	17660851	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=18;MBQ=31,25;MFRL=132,95;MMQ=40,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:12,1:0,1:0,12,0,2
chr1	17660879	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=18;MBQ=30,29;MFRL=162,153;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:17660879_C_G:17660879:0,2,0,2
chr1	17660882	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=31,26;MFRL=162,153;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:17660879_C_G:17660879:0,2,0,2
chr1	17660885	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=29,29;MFRL=162,132;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:17660879_C_G:17660879:0,2,0,1
chr1	17660900	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=25,28;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:17660900_C_T:17660900:0,3,0,1
chr1	17660904	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=30,30;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:17660900_C_T:17660900:0,3,0,1
chr1	17660908	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=31,22;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:17660900_C_T:17660900:0,3,0,1
chr1	17660912	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=18;MBQ=28,26;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:17660900_C_T:17660900:0,3,0,1
chr1	17662541	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	17662662	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=79,131;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.373:11:3,1:4,2:4,3,3,1
chr1	17662751	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=99,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,3:1,8:2,1,4,7
chr1	17672642	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:2,4:0,4:0,2,3,5
chr1	17685706	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,0:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685708	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685710	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685713	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,19;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685718	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685724	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:17685706_A_C:17685706:0,0,3,0
chr1	17685729	.	CGACTGCCATCAGT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=120,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:0,1:0|1:17685706_A_C:17685706:0,1,3,0
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	17708457	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=140,189;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:9,4,3,0
chr1	17708527	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=106,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:13,0:11,14,1,2
chr1	17708664	.	C	CTAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17708664_C_CTAGCCA:17708664:0,2,0,1
chr1	17708667	.	GG	GTG,TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,15,25;MFRL=155,110,122;MMQ=60,60,60;MPOS=5,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,0,0:0,1,0,2
chr1	17708668	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17708668_G_C:17708668:0,1,0,1
chr1	17708671	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17708668_G_C:17708668:0,2,0,1
chr1	17708672	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17708664_C_CTAGCCA:17708664:0,3,0,1
chr1	17715189	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,14,8
chr1	17720391	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,2:0,0,4,2
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,1,5
chr1	17720634	.	C	CCCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr1	17721956	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=190,145;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	17721977	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=123,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:0|1:17721977_A_G:17721977:8,3,2,0
chr1	17721979	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:0|1:17721977_A_G:17721977:9,3,2,0
chr1	17723476	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	17723739	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	17725358	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	17739646	.	G	GGTCTGTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:11,2:6,0:7,11,0,2
chr1	17748680	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,7:3,7:7,1,10,5
chr1	17752000	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr1	17764627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr1	17764824	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	17930070	.	A	AAGCTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:17930070_A_AAGCTG:17930070:3,1,1,1
chr1	17930072	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:17930070_A_AAGCTG:17930070:3,1,1,1
chr1	17930075	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:17930070_A_AAGCTG:17930070:3,1,1,1
chr1	17930076	.	G	GTGGCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=83,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:0|1:17930070_A_AAGCTG:17930070:3,1,1,1
chr1	17945005	.	GT	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17948519	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17948519_G_T:17948519:0,1,0,1
chr1	17948523	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17948519_G_T:17948519:0,0,0,1
chr1	17948525	.	GGGC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17948519_G_T:17948519:0,0,0,1
chr1	17948530	.	GT	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:17948519_G_T:17948519:0,0,0,1
chr1	17965194	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:2,2,0,4
chr1	17981323	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17991052	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr1	18023877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,1:1,1:6,2,1,1
chr1	18152315	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=144,441;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr1	18153095	.	G	GACAGTTTTTCCAGGGTGGCCTATCATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	18153107	.	T	TAACTTGCCTGATTAAAGCCTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,29;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	18153114	.	G	GCCTATCATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	18554356	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=114,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	18618485	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18618485_A_T:18618485:0,0,0,1
chr1	18618490	.	C	CACTGTGCTAGGTTAATTTTTGAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18618485_A_T:18618485:0,0,0,1
chr1	18661484	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	18703523	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr1	18703544	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	18703952	.	GCTTA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:18703952_GCTTA_G:18703952:4,4,1,1
chr1	18703959	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:18703952_GCTTA_G:18703952:4,3,1,1
chr1	18704829	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=104,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,3:1,2,1,4
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	18704881	.	T	TCCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	19027368	.	TACTTTCACTTACAAAGGCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:19027368_TACTTTCACTTACAAAGGCTC_T:19027368:0,3,0,1
chr1	19027394	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	19027395	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,0:1,1:0|1:19027368_TACTTTCACTTACAAAGGCTC_T:19027368:0,2,0,1
chr1	19029546	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr1	19166716	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:19166716_GG_CT:19166716:2,0,0,1
chr1	19166720	.	G	GCATTTCTTATATCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:19166716_GG_CT:19166716:2,0,0,1
chr1	19181542	.	G	GGATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19181542_G_GGATGT:19181542:0,1,0,1
chr1	19181545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19181542_G_GGATGT:19181542:0,1,0,1
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	19202009	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	19203864	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19203864_C_T:19203864:1,0,1,0
chr1	19203871	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:19203864_C_T:19203864:1,0,1,0
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,3:0,0,7,2
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	19209726	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:19209726_T_G:19209726:2,4,1,1
chr1	19209728	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:19209726_T_G:19209726:2,4,1,1
chr1	19209730	.	A	ACAGTCACGGCGAGTCTTGTGAGG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:19209726_T_G:19209726:2,4,1,1
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	19216560	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	19223586	.	ATCCAAAATCCGAAATGT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=124,108;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,0:8,2:2,12,1,1
chr1	19238596	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr1	19282725	.	CCCG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	19401405	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,6:1,6:1,4,6,7
chr1	19408273	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=94,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,9:7,1:3,8,3,7
chr1	19415378	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,0:12,4:7,14,1,3
chr1	19415445	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:3,8,2,0
chr1	19420687	.	C	CCAAAAGATTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chr1	19433023	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	19440107	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	19442111	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:19442111_G_C:19442111:2,8,1,1
chr1	19442119	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:19442111_G_C:19442111:2,8,1,1
chr1	19442122	.	GC	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:19442111_G_C:19442111:2,8,1,1
chr1	19447988	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:19447988_C_CTG:19447988:0,4,0,1
chr1	19447991	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:19447988_C_CTG:19447988:0,4,0,1
chr1	19447992	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:19447988_C_CTG:19447988:0,4,0,1
chr1	19454142	.	G	GTTTCCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=119,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:19454142_G_GTTTCCTC:19454142:2,1,0,1
chr1	19454145	.	T	TCCCAAATTGCTACAAGAACTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=119,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:19454142_G_GTTTCCTC:19454142:2,1,0,1
chr1	19465780	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=120,115;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	19465781	.	A	ATAATTCAGTACAGTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=115,126;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	19465784	.	A	T,AT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,23,22;MFRL=87,115,126;MMQ=60,40,40;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.09,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.223,0.254:5:1,1,1:2,0,0:0,3,0,2
chr1	19468227	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:0|1:19468227_GCA_G:19468227:3,5,1,1
chr1	19468230	.	T	TCTGTCTCTCTCTCTCTGTCTC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=116,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:6,0:0|1:19468227_GCA_G:19468227:3,6,1,1
chr1	19468232	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=116,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:7,0:0|1:19468227_GCA_G:19468227:3,6,1,1
chr1	19476307	.	G	C,A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,20,28;MFRL=120,117,119;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,2,2:0.087,0.080:31:15,0,0:2,1,2:9,18,0,4
chr1	19483209	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	19486817	.	A	ATTGTTATACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	19487656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=13,26;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.827:7:0,5:0,1:0,1,0,6
chr1	19487678	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	19488258	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,65;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:3,4,2,0
chr1	19490379	.	AC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19490379_AC_CA:19490379:1,2,0,1
chr1	19490382	.	A	AAAATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19490379_AC_CA:19490379:1,2,0,1
chr1	19491877	.	T	TTTAACAGAGAGGTTCTCATTGGCTGTTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.528:11:2,2:1,0:0,3,4,4
chr1	19496070	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,2:4,1:1,10,0,3
chr1	19496126	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	19499517	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:3,0:7,2:0|1:19499517_A_T:19499517:4,6,1,1
chr1	19499522	.	C	CTGTTGG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:19499517_A_T:19499517:3,6,1,1
chr1	19499548	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr1	19504301	.	T	TGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	19510394	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=73,116;MMQ=60,60;MPOS=34;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:5,3,0,3
chr1	19513632	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr1	19518659	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	19519898	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	19549372	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19549372_C_CT:19549372:0,2,0,1
chr1	19549373	.	A	ACTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19549372_C_CT:19549372:0,2,0,1
chr1	19549864	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=38,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr1	19557490	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=12,27;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:19557490_T_TAAA:19557490:0,1,0,1
chr1	19557492	.	G	GTGTAGATGTCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19557490_T_TAAA:19557490:0,1,0,1
chr1	19557495	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19557490_T_TAAA:19557490:0,1,0,1
chr1	19559217	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=97,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:13,0:6,3:10,11,0,3
chr1	19561833	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=139,137;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:19561833_G_A:19561833:0,1,0,1
chr1	19561836	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=139,137;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19561833_G_A:19561833:0,1,0,1
chr1	19561838	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=139,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19561833_G_A:19561833:0,1,0,1
chr1	19570020	.	GCCAAAAGCCCAGAGTTGCTGTCTATGCAGATCTGTGTTCCGGTGAAGCCTTTAACTCAGTCAAGATAAAAT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=70,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.304:6:0,1:1,0:3,1,2,0
chr1	19571524	.	CCTG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:6,0:0|1:19571524_CCTG_C:19571524:14,10,1,1
chr1	19571529	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:6,0:0|1:19571524_CCTG_C:19571524:13,10,1,1
chr1	19581423	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19581423_AGG_A:19581423:0,1,0,1
chr1	19581428	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:19581423_AGG_A:19581423:0,2,0,1
chr1	19581433	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19581423_AGG_A:19581423:0,1,0,1
chr1	19581437	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,23;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19581423_AGG_A:19581423:0,1,0,1
chr1	19581440	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,21;MFRL=192,97;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19581423_AGG_A:19581423:0,1,0,1
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=108,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr1	19584523	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	19595137	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=149,108;MMQ=40,56;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,2,2
chr1	19595174	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=75,149;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,2,3
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=72,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.499:36:10,9:8,9:18,0,15,3
chr1	19597482	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=112,123;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,0:4,4:1,10,1,3
chr1	19609254	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,100;MMQ=60,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,8:6,6:8,4,8,6
chr1	19611241	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=113,119;MMQ=60,46;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:3,2:3,8:1,5,3,7
chr1	19612366	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=77,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,0:8,4:5,6,2,2
chr1	19612961	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19612961_GT_G:19612961:0,3,0,1
chr1	19612963	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:19612961_GT_G:19612961:0,3,0,1
chr1	19653095	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,435;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,1:9,1:4,8,0,2
chr1	19653890	.	T	TTGTCTGTGGGTGGGAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	19671769	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:19671769_A_T:19671769:0,1,0,1
chr1	19671772	.	T	TAGCGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:0,1:0|1:19671769_A_T:19671769:0,1,0,1
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr1	20027475	.	A	ATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20027475_A_ATC:20027475:0,0,0,1
chr1	20027479	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20027475_A_ATC:20027475:0,0,0,1
chr1	20067504	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20067524	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20305027	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20411234	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	20411332	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,4:5,3:2,3,5,2
chr1	20445969	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,0:20,2:16,16,1,1
chr1	20446071	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.256:16:3,2:7,0:0|1:20446071_A_C:20446071:2,10,4,0
chr1	20446075	.	AG	CC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=86,90;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.294:11:3,1:3,0:0|1:20446071_A_C:20446071:2,6,3,0
chr1	20446106	.	C	CCTTAGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=63,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	20465998	.	C	CTGTGCGAGAGCAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20466709	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	20474907	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	20490725	.	G	GCGCTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20490725_G_GCGCTGTT:20490725:0,0,0,1
chr1	20490728	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20490725_G_GCGCTGTT:20490725:0,0,0,1
chr1	20501442	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	20501533	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:4,3,3,2
chr1	20501705	.	C	CTTTAACCAGAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr1	20519931	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:1,3,0,2
chr1	20521880	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=356,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20521880_G_A:20521880:1,1,0,1
chr1	20521883	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=356,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20521880_G_A:20521880:1,1,0,1
chr1	20521886	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=356,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:20521880_G_A:20521880:1,1,0,1
chr1	20639518	.	T	TCTTACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	20644149	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr1	20657458	.	G	GGAGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:20657458_G_GGAGAA:20657458:1,0,1,1
chr1	20657462	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:20657458_G_GGAGAA:20657458:1,0,1,1
chr1	20659501	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20659501_TC_T:20659501:0,0,0,1
chr1	20659505	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20659501_TC_T:20659501:0,0,0,1
chr1	20664387	.	T	TGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,0:0|1:20664387_T_TGGG:20664387:0,1,0,1
chr1	20664390	.	G	GAATGAATGCGGGGAGGAACCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:20664387_T_TGGG:20664387:0,1,0,1
chr1	20678701	.	GCTCCACTCAGCAGCAGGGCCT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,2:3,0:1,7,1,1
chr1	20827978	.	T	TAGTGATCTTACTGTCTTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20827978_T_TAGTGATCTTACTGTCTTCTTC:20827978:0,0,0,1
chr1	20827981	.	AC	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20827978_T_TAGTGATCTTACTGTCTTCTTC:20827978:0,0,0,1
chr1	20829808	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	20829848	.	C	CTTCCACCCTTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	20880309	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	20915589	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr1	20944889	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	20960443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,2:1,2:1,3,3,2
chr1	20978886	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,5:4,1:4,2,2,4
chr1	20982631	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=90,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:4,5,2,3
chr1	20991200	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,6:9,0:15,1,6,0
chr1	20998548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:5,4,1,1
chr1	21011497	.	GA	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:5,5,1,1
chr1	21024901	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr1	21044219	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21076129	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,159;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,2:12,0:14,0,2,0
chr1	21076459	.	G	GCTGTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21083664	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:8,2,2,0
chr1	21091861	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:3,1,7,0
chr1	21102502	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.413:8:0,0:1,3:1,4,0,3
chr1	21154110	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,0:6,2:4,4,2,0
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	21180250	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	21188703	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=130,100;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.464:9:1,0:3,4:4,1,3,1
chr1	21188871	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	21188912	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=166,184;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	21188922	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=166,184;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:21188922_T_A:21188922:0,2,0,1
chr1	21188926	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=166,184;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:21188922_T_A:21188922:0,2,0,1
chr1	21191151	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,0:12,3:12,13,1,2
chr1	21307743	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,1,2
chr1	21324196	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0|1:21324196_A_AC:21324196:1,5,1,1
chr1	21324200	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,2:4,0:0|1:21324196_A_AC:21324196:1,6,1,1
chr1	21324202	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,1:4,0:0|1:21324196_A_AC:21324196:1,5,1,1
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	21329213	.	CGGGTTTGAGGTTGTGAATTCATTGTCTGAG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:7,0:0|1:21329213_CGGGTTTGAGGTTGTGAATTCATTGTCTGAG_C:21329213:18,10,1,1
chr1	21329266	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,2:7,0:0|1:21329213_CGGGTTTGAGGTTGTGAATTCATTGTCTGAG_C:21329213:10,12,1,1
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	21494634	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.572:40:13,13:4,10:0|1:21494634_C_T:21494634:5,12,7,16
chr1	21494639	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=114,51;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:24,1:9,1:0|1:21494634_C_T:21494634:10,24,1,1
chr1	21494644	.	CC	TG	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=115,51;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:23,0:8,1:0|1:21494634_C_T:21494634:10,22,1,1
chr1	21560193	.	C	CCCAAAGTGCTGGGATTACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=198988024,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=107,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,3:4,2:3,1,3,2
chr1	21599468	.	A	AGGGTGTATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	21605914	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:4,8,0,2
chr1	21616643	.	T	TGCCAGGGCTCTATCCCCTGCCCTCTCCTGACTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=77,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.326:8:4,0:1,2:3,3,1,1
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,4,3
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,2:3,1:1,4,2,2
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:0,2,4,1
chr1	21801301	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,2,6
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21805820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr1	21807550	.	G	GGGCCGGGGCAGCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21887322	.	T	TGAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21887322_T_TGAGG:21887322:0,0,0,1
chr1	21887324	.	T	TCCCAGAAGCCCCAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21887322_T_TGAGG:21887322:0,0,0,1
chr1	21896893	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:21896893_A_C:21896893:2,1,1,1
chr1	21896897	.	A	AGTGAGCCGAAATCATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=156,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:21896893_A_C:21896893:1,1,1,1
chr1	21896917	.	C	CATGTGCTTCTTACCTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,34;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21896917_C_CATGTGCTTCTTACCTAT:21896917:0,1,0,1
chr1	21896921	.	GC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21896917_C_CATGTGCTTCTTACCTAT:21896917:0,1,0,1
chr1	21902950	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=174,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	21930216	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	21930321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=78,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:3,2,2,0
chr1	21930462	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=140,137;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:1,2,0,1
chr1	21930468	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=140,137;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:1,2,0,1
chr1	21930471	.	ATGGTGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=142,137;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:1,3,0,1
chr1	21930480	.	G	GTC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=142,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:1,3,0,1
chr1	21930481	.	G	GATA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	21930482	.	G	GCACAC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=142,137;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:1,3,0,1
chr1	21930489	.	AG	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=160,137;MMQ=60,40;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:21930462_GCA_G:21930462:0,2,0,1
chr1	21932530	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	21938375	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,3,2
chr1	21940609	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	21944352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:0,3:2,0:1,1,2,1
chr1	21946635	.	T	TCATTTGGAGACACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:21946635_T_TCATTTGGAGACACTG:21946635:0,1,0,1
chr1	21946639	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:21946635_T_TCATTTGGAGACACTG:21946635:0,1,0,1
chr1	21978198	.	C	CAACAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22013561	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	22013771	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	22032379	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,65;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:0,17,0,2
chr1	22033385	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr1	22082967	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=102,155;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.582:9:0,1:2,3:3,1,4,1
chr1	22148789	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22148789_G_A:22148789:0,0,0,1
chr1	22148790	.	GTCCC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22148789_G_A:22148789:0,0,0,1
chr1	22148799	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22148789_G_A:22148789:0,0,0,1
chr1	22148803	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22148789_G_A:22148789:0,0,0,1
chr1	22154987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	22155853	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr1	22156512	.	C	CTCACCGGCTTCACGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	22158373	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	22159766	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:5,2:4,0:6,3,3,0
chr1	22162211	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=153,148;MMQ=47,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22162211_T_G:22162211:0,2,0,1
chr1	22162221	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=153,148;MMQ=47,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22162211_T_G:22162211:0,2,0,1
chr1	22162230	.	AC	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=153,148;MMQ=47,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22162211_T_G:22162211:0,2,0,1
chr1	22170828	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	22174035	.	G	GCAACAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:22174035_G_GCAACAGT:22174035:0,2,0,1
chr1	22174037	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:22174035_G_GCAACAGT:22174035:0,2,0,1
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	22176449	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,171;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:22176449_G_A:22176449:2,0,1,0
chr1	22176453	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,171;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:22176449_G_A:22176449:2,0,1,0
chr1	22176500	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,3:2,0:1,3,1,2
chr1	22176831	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=91,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:0,1,1,2
chr1	22181266	.	CA	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:22181266_CA_AC:22181266:1,2,0,1
chr1	22181271	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:22181266_CA_AC:22181266:1,3,0,1
chr1	22181272	.	A	ATGGCTTGAACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:22181266_CA_AC:22181266:1,3,0,1
chr1	22181723	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	22181824	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	22183711	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=12368876,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22191530	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr1	22199245	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:2,5,3,3
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	22200882	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:6,3,3,1
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	22207906	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:8,5,3,0
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	22212016	.	T	TTGTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	22212030	.	CATA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22212030_CATA_C:22212030:0,0,0,1
chr1	22212036	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22212030_CATA_C:22212030:0,0,0,1
chr1	22213624	.	G	GGGCGGGGCAGGAGTGGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGCGGGGCAGGAGTGGAA;STR;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr1	22214214	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr1	22214229	.	C	CAGCTCTCTTGCCTCTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=63,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	22214538	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,2,0
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr1	22217108	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr1	22222846	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22222846_C_CCT:22222846:0,1,0,1
chr1	22222848	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22222846_C_CCT:22222846:0,1,0,1
chr1	22222852	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22222846_C_CCT:22222846:0,0,0,1
chr1	22222853	.	G	GTGTATCTTTTGTCTTACTCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22222846_C_CCT:22222846:0,0,0,1
chr1	22303465	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:1,6:2,1:2,1,6,2
chr1	22304831	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=113,160;MMQ=52,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:14,5,2,0
chr1	22304839	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=121,91;MMQ=54,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:11,0:14,7,2,1
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,5,2
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:22310139_T_G:22310139:0,0,5,2
chr1	22310380	.	G	GAGCAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=113,105;MMQ=49,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	22310411	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	22310725	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,6,4
chr1	22313017	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=110,128;MMQ=55,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,4:10,4:4,13,4,4
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	22315806	.	C	CTACTACATAGAGGAGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=217,189;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	22333595	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=128,182;MMQ=60,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,119;MMQ=40,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:0,1,6,10
chr1	22338977	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	22447040	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,11;MFRL=160,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:22447040_T_G:22447040:1,1,0,1
chr1	22447050	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=160,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:22447040_T_G:22447040:1,1,0,1
chr1	22447056	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=160,254;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:22447040_T_G:22447040:1,1,0,1
chr1	22469473	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:22469473_T_G:22469473:0,0,0,1
chr1	22469497	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:22469473_T_G:22469473:0,0,0,1
chr1	22832695	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,0:4,2:3,3,0,2
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	22843815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=80,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	22895945	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22895945_C_CT:22895945:0,0,0,1
chr1	22895947	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22895945_C_CT:22895945:0,0,0,1
chr1	22895951	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22895945_C_CT:22895945:0,0,0,1
chr1	22913183	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22913183_C_A:22913183:0,1,0,1
chr1	22913184	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22913183_C_A:22913183:0,1,0,1
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	23107811	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	23191332	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:23191332_T_A:23191332:0,1,1,0
chr1	23191334	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:23191332_T_A:23191332:0,1,1,0
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,0,4
chr1	23233346	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,1,2
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	23289783	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23289783_G_C:23289783:0,1,0,1
chr1	23289791	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23289783_G_C:23289783:0,1,0,1
chr1	23289796	.	C	CCT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23289783_G_C:23289783:0,0,0,1
chr1	23289799	.	AA	CG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23289783_G_C:23289783:0,0,0,1
chr1	23289803	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23289783_G_C:23289783:0,0,0,1
chr1	23357199	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr1	23385515	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,4:8,0:11,5,0,4
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	23415629	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23415629_C_T:23415629:0,0,0,1
chr1	23415634	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23415629_C_T:23415629:0,0,0,1
chr1	23415641	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23415629_C_T:23415629:0,0,0,1
chr1	23637670	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,7:2,3:4,1,9,1
chr1	23688933	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr1	23689739	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	23708086	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23708086_C_A:23708086:0,1,0,1
chr1	23708090	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23708086_C_A:23708086:0,1,0,1
chr1	23708093	.	G	GGTTTATAGCATGTGTTGATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23708086_C_A:23708086:0,1,0,1
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:3,2:4,4,2,3
chr1	23743960	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	23745727	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23745727_G_GCC:23745727:0,1,0,1
chr1	23745732	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23745727_G_GCC:23745727:0,1,0,1
chr1	23758427	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr1	23782752	.	C	CAAAAACAAGATCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	23836364	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr1	23885498	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=71,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.506:14:3,3:3,4:0|1:23885498_T_C:23885498:4,3,1,6
chr1	23885499	.	G	GTCGTACAAGCCTTTGCCTACAAAAGTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:5,2:7,0:1|0:23885498_T_C:23885498:4,8,1,1
chr1	23956164	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23956164_T_A:23956164:0,1,0,1
chr1	23956166	.	AT	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:23956164_T_A:23956164:0,1,0,1
chr1	24022437	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,8:4,3:3,8,4,7
chr1	24082286	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.410:13:1,3:5,2:5,3,4,1
chr1	24082593	.	GGTGTAGGACTGC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=64,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr1	24082608	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:24082608_G_A:24082608:0,2,0,1
chr1	24082613	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24082608_G_A:24082608:0,2,0,1
chr1	24083494	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,3:3,2:2,1,2,3
chr1	24083510	.	AGCCC	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=133,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:24083510_AGCCC_A:24083510:4,3,1,1
chr1	24083518	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:24083510_AGCCC_A:24083510:5,3,1,1
chr1	24106264	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	24112956	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=181,156;MMQ=60,42;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24112956_C_G:24112956:0,4,0,1
chr1	24112960	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,16;MFRL=181,156;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:24112956_C_G:24112956:0,4,0,1
chr1	24112968	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,14;MFRL=159,156;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:24112956_C_G:24112956:0,2,0,1
chr1	24112973	.	GGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0,4,0,1
chr1	24112974	.	G	GCTATGGGAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,30;MFRL=191,110;MMQ=51,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	24112976	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,15;MFRL=138,156;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0|1:24112956_C_G:24112956:0,3,0,1
chr1	24112978	.	C	T,G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,26,15;MFRL=138,207,156;MMQ=60,60,42;MPOS=-2147483648,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:0,1,0:0,3,0,2
chr1	24119127	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,2:0,1:4,2,3,0
chr1	24129126	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	24130962	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,0:8,2:5,5,0,2
chr1	24130967	.	G	GTTGAGTGAGGCCACACGCATGGGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:3,7,1,1
chr1	24140875	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=145,143;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,2,0,1
chr1	24140883	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=172,143;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,1,0,1
chr1	24140890	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=165,143;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,2,0,1
chr1	24140894	.	TT	AC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=165,143;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,2,0,1
chr1	24140899	.	TG	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=165,143;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,2,0,1
chr1	24140901	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=165,143;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,2,0,1
chr1	24140907	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=157,143;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24140875_G_T:24140875:0,1,0,1
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,6:0,0:0,0,5,2
chr1	24151996	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	24172332	.	CC	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,0:7,7,1,1
chr1	24180806	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,70906381;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	24180916	.	C	CTTATATTCA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:6,0:8,2:0|1:24180916_C_CTTATATTCA:24180916:7,10,0,2
chr1	24180919	.	G	GACACAGCGTGACC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:24180916_C_CTTATATTCA:24180916:7,10,0,2
chr1	24192200	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	24200969	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,1,0
chr1	24200983	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,1,0
chr1	24201919	.	TT	CC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,6:0,3:1,2,5,5
chr1	24287877	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	24288184	.	A	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,133;MMQ=55,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.306:47:18,7:15,7:14,19,7,7
chr1	24288528	.	TTAAAC	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=143,129;MMQ=50,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:7,13:14,8:11,10,11,11
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=134,131;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.959:46:0,21:1,24:1,0,23,22
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,9:0,0,11,14
chr1	24294450	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,18,17;MFRL=152,123,161;MMQ=60,56,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.15,7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.272,0.457:8:0,0,0:0,1,0:0,2,0,6
chr1	24298212	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr1	24402822	.	G	GTTGATCTTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	24408575	.	CAGGATCTTG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,2:2,0:0|1:24408575_CAGGATCTTG_C:24408575:2,1,1,1
chr1	24408587	.	AC	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=59,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:24408575_CAGGATCTTG_C:24408575:2,2,1,1
chr1	24408593	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=117,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24408575_CAGGATCTTG_C:24408575:3,2,1,1
chr1	24410928	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=79,0;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,1:16,0:12,12,0,2
chr1	24411157	.	A	AAAATACTGAGACTGGGTAATTTATAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=216,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	24416132	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:5,9,1,1
chr1	24417376	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,289;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr1	24417504	.	C	CAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=99,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr1	24432443	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24432443_G_GC:24432443:2,3,1,1
chr1	24432445	.	G	GGCAGCCACCGTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:24432443_G_GC:24432443:2,3,1,1
chr1	24432449	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=118,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:24432443_G_GC:24432443:2,2,1,1
chr1	24432578	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	24447801	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr1	24463858	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24463858_T_G:24463858:0,1,0,1
chr1	24463860	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24463858_T_G:24463858:0,1,0,1
chr1	24484396	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24484396_G_A:24484396:0,0,0,1
chr1	24484404	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:24484396_G_A:24484396:0,0,1,1
chr1	24484441	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr1	24485941	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:5,3:2,2:5,2,3,2
chr1	24495836	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	24664540	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:2,3,0,2
chr1	24664635	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24664635_T_TC:24664635:0,1,0,1
chr1	24664640	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24664635_T_TC:24664635:0,1,0,1
chr1	24664646	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24664635_T_TC:24664635:0,1,0,1
chr1	24664648	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24664635_T_TC:24664635:0,1,0,1
chr1	24664651	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24664635_T_TC:24664635:0,1,0,1
chr1	24676563	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,5:9,0:12,9,5,0
chr1	24768778	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	24775967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,5:0,0,9,5
chr1	24779873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	24784386	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24784386_G_C:24784386:0,1,0,1
chr1	24784389	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24784386_G_C:24784386:0,1,0,1
chr1	24784391	.	A	ATCTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24784386_G_C:24784386:0,1,0,1
chr1	24857795	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:10,8,0,2
chr1	24859595	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=113,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:2,7,0,2
chr1	24927561	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr1	24981439	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:1,4,3,1
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	24995757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:4,0:10,3:9,5,3,0
chr1	24996626	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,128;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:16,7:14,0:16,14,7,0
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	25166359	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:9,0:2,1:0|1:25166359_A_G:25166359:4,7,1,1
chr1	25166367	.	C	CCTTCTCTGCCTGTCCGTCTGTCTGTCTGTCTCTCCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:2,2:0|1:25166359_A_G:25166359:6,6,1,1
chr1	25229084	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr1	25254293	.	AGGGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,25;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	25555570	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,0:8,4:7,13,0,4
chr1	25599017	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,118;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	25599114	.	CT	GC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=27,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:25599114_CT_GC:25599114:6,4,1,1
chr1	25599117	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=139,53;MMQ=27,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,1:5,0:0|1:25599114_CT_GC:25599114:6,3,1,1
chr1	25599122	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=27,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:3,0:0|1:25599114_CT_GC:25599114:5,3,1,1
chr1	25599124	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,18;MFRL=132,53;MMQ=27,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,1:3,0:0|1:25599114_CT_GC:25599114:4,2,1,1
chr1	25599237	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=133,101;MMQ=40,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	25599242	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,27;MFRL=139,84;MMQ=33,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0,3,0,1
chr1	25611035	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=114.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,25:0,12:0,0,24,14
chr1	25617045	.	AGAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=93,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GAAT;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:1,2:4,1,3,0
chr1	25666906	.	CGGGCTTGAAGCAAGTAAATGGAAGTACTTATTTAATTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAAGTGACCTGAAAAAAATGTCTGGATTTCTAGA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.102:31:1,2:1,0:20,7,1,3
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:25678238_T_A:25678238:0,0,0,4
chr1	25678246	.	A	AGATATATTAAAACAAATAAAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:25678238_T_A:25678238:0,2,0,1
chr1	25697120	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,147;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	25735415	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25735415_G_GC:25735415:0,0,0,1
chr1	25735416	.	T	TTAGACGAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25735415_G_GC:25735415:0,0,0,1
chr1	25735419	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25735415_G_GC:25735415:0,0,0,1
chr1	25780889	.	A	ATG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.887:5:0,3:0,2:0|1:25780889_A_ATG:25780889:0,0,1,4
chr1	25780893	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0|1:25780889_A_ATG:25780889:0,0,5,7
chr1	25783066	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr1	25824853	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:25824853_A_C:25824853:0,3,1,0
chr1	25824855	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=82,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25824853_A_C:25824853:0,3,1,0
chr1	25883781	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:3,1,0,1
chr1	25889632	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:6,5:5,5:6,5,3,7
chr1	25889672	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr1	26012961	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:1,5,2,0
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	26110065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	26138136	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr1	26138419	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr1	26138451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	26139137	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,7,8
chr1	26152758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,7,2
chr1	26190451	.	CGA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	26227608	.	CAAAAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,15;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr1	26301196	.	TAGGGTGGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,920;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:1,0:1,1:1,3,1,0
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:6,1,8,3
chr1	26310677	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:26310677_A_T:26310677:0,0,0,2
chr1	26310679	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:26310677_A_T:26310677:0,0,0,2
chr1	26310684	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:26310677_A_T:26310677:0,0,0,2
chr1	26310689	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:26310677_A_T:26310677:1,0,0,2
chr1	26310693	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26310677_A_T:26310677:1,0,0,1
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr1	26316159	.	T	TGGCTAATGGATGCCCCTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	26317383	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	26349109	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,3:3,6:1,2,4,5
chr1	26356006	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26356006_G_A:26356006:1,0,0,1
chr1	26356011	.	A	ATCATCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:26356006_G_A:26356006:1,0,0,1
chr1	26357667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr1	26369297	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	26380450	.	C	CTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26380450_C_CTTTT:26380450:0,0,0,1
chr1	26380451	.	C	CTCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26380450_C_CTTTT:26380450:0,0,0,1
chr1	26380454	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26380450_C_CTTTT:26380450:0,0,0,1
chr1	26384013	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:2,1,3,0
chr1	26385003	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:3,4,2,2
chr1	26385150	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr1	26387625	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:2,1,3,0
chr1	26488947	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,2:7,2:4,4,4,0
chr1	26504036	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:4,0:1,3:4,1,3,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=58,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,1,5
chr1	26513815	.	C	CAGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:26513815_C_CAGG:26513815:1,1,0,1
chr1	26513818	.	G	GGCGACTTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=143,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:26513815_C_CAGG:26513815:1,1,0,1
chr1	26513841	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	26513862	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=194,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26513862_G_A:26513862:1,0,0,1
chr1	26513865	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:26513862_G_A:26513862:0,0,0,1
chr1	26517267	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,1,3
chr1	26517773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:4,1,3,1
chr1	26517794	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chr1	26517896	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=87,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26517896_T_C:26517896:1,2,0,1
chr1	26517921	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:26517896_T_C:26517896:1,3,0,1
chr1	26520455	.	C	CAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr1	26524520	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=106,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:1,5,1,2
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr1	26526348	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	26527783	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=57,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	26529121	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	26570562	.	CTA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	26601385	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr1	26601570	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr1	26603291	.	CCTT	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr1	26603324	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26603324_CCA_C:26603324:0,3,0,1
chr1	26603327	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26603324_CCA_C:26603324:0,3,0,1
chr1	26603331	.	C	CTCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:26603324_CCA_C:26603324:0,3,0,1
chr1	26603708	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:13,2:18,3:16,16,2,3
chr1	26603883	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	26607726	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr1	26612042	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr1	26612297	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:3,2:10,4:8,6,5,1
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	26646611	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.677:7:1,1:1,3:2,0,3,2
chr1	26650550	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	26655208	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88185315;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	26658170	.	C	CTGGGAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	26663362	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	26665873	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,6:1,1:3,2,4,3
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,160;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	26669787	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,1:2,2:2,2,2,2
chr1	26689659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,4,10
chr1	26799941	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:1,3,6,2
chr1	26872355	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	26881565	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=521,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	26883672	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26883672_A_G:26883672:0,0,0,1
chr1	26883673	.	T	TTGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26883672_A_G:26883672:0,0,0,1
chr1	26883676	.	T	TGAGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26883672_A_G:26883672:0,0,0,1
chr1	26883679	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26883672_A_G:26883672:0,0,0,1
chr1	26888158	.	AGT	CTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.380:3:1,0:0,1:0|1:26888158_AGT_CTC:26888158:1,1,0,1
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chr1	26888167	.	TCG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:26888158_AGT_CTC:26888158:0,2,0,1
chr1	26888172	.	G	GTGAATATATATTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26888158_AGT_CTC:26888158:0,2,0,1
chr1	27087961	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:12,2:5,0:8,9,1,1
chr1	27102088	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,122;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,2:1,0:3,2,2,0
chr1	27105731	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr1	27176958	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,2:0,0:2,3,2,0
chr1	27179426	.	A	AACTCACTGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=122,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	27210721	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:4,5,2,0
chr1	27220869	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,2,3
chr1	27224187	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,141;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,3:1,1:3,3,0,4
chr1	27237769	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	27268151	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,121;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:2,1:3,0:2,3,0,1
chr1	27271803	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,113;MMQ=50,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	27277139	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=87,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:27277139_A_C:27277139:1,3,2,0
chr1	27277146	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=103,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:27277139_A_C:27277139:2,3,2,0
chr1	27277148	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,19;MFRL=103,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,1:0|1:27277139_A_C:27277139:2,3,2,0
chr1	27278466	.	GG	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=141,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:27278466_GG_CT:27278466:2,1,1,1
chr1	27278471	.	AC	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:27278466_GG_CT:27278466:2,1,1,1
chr1	27278592	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:27278592_G_A:27278592:0,0,0,1
chr1	27278593	.	G	GCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:27278592_G_A:27278592:0,0,0,1
chr1	27332637	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:4,3,1,4
chr1	27426796	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr1	27434381	.	GGGCTCCGTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=93,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr1	27440612	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:9,3,1,1
chr1	27608627	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	27609960	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27609960_G_T:27609960:0,1,0,1
chr1	27609961	.	AGCAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27609960_G_T:27609960:0,1,0,1
chr1	27614442	.	C	CCTTTAAAGGCCACTGTGCTACCCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	27627855	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:4,7,1,1
chr1	27631676	.	C	CTCCCCTCAGTGCAAACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=96,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	27648733	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,3:4,3:5,0,6,1
chr1	27658708	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,1,0,1
chr1	27658710	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,1,0,1
chr1	27658715	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,0,0,1
chr1	27658720	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,0,0,1
chr1	27658722	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,0,0,1
chr1	27658723	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27658708_C_T:27658708:0,0,0,1
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	27659975	.	A	AAGTTCAAGACCAAAGTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=102,114;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	27659981	.	C	CAAGATCAAGACACTGCCAGATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27660568	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:1,2,3,7
chr1	27674211	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,133;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr1	27678123	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:27678123_AT_A:27678123:0,1,0,1
chr1	27678126	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27678123_AT_A:27678123:0,1,0,1
chr1	27678129	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27678123_AT_A:27678123:0,1,0,1
chr1	27680357	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:27680357_C_T:27680357:7,14,1,1
chr1	27680367	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,9:0.454:20:5,0:6,9:1|0:27680357_C_T:27680357:5,6,0,9
chr1	27682126	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=79,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:2,1,6,1
chr1	27682481	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:2,4,3,3
chr1	27684456	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27684456_T_TC:27684456:0,0,0,1
chr1	27684458	.	T	TGTGAGCTCTGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27684456_T_TC:27684456:0,0,0,1
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	27687366	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.762:6:1,2:0,3:1,0,2,3
chr1	27688383	.	T	TATTCCTCTGTTTCCTGTTGCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr1	27688391	.	A	ATCTTCCTTGCCTGAGTCATCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	27690125	.	T	TGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=64,216529986;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27690125_T_TGCCCC:27690125:0,1,1,0
chr1	27690129	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=64,216529986;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27690125_T_TGCCCC:27690125:0,1,1,0
chr1	27690132	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=64,216529986;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27690125_T_TGCCCC:27690125:0,1,1,0
chr1	27690359	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=117,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr1	27690949	.	G	GGCAGGTCCTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27691343	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:27691343_C_T:27691343:7,8,1,1
chr1	27691352	.	T	TGCTGGAGGTG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:0|1:27691343_C_T:27691343:9,11,1,1
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	27700808	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr1	27876099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	27877093	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr1	27942064	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:4,6,0,2
chr1	27942418	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:0|1:27942418_C_T:27942418:0,3,0,3
chr1	27942426	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:27942418_C_T:27942418:0,4,0,1
chr1	27942428	.	C	CTTCTCCTCCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,1:3,0:1|0:27942418_C_T:27942418:0,4,0,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,1,5
chr1	28086924	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:28086924_A_AT:28086924:4,0,0,1
chr1	28086925	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:28086924_A_AT:28086924:4,0,0,1
chr1	28086927	.	A	ACCTTTCCTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:28086924_A_AT:28086924:4,0,0,1
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	28116220	.	G	GTTCTATTTGTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:28116220_G_GTTCTATTTGTTT:28116220:0,1,0,1
chr1	28116225	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28116220_G_GTTCTATTTGTTT:28116220:0,1,0,1
chr1	28116227	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28116220_G_GTTCTATTTGTTT:28116220:0,1,0,1
chr1	28165330	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=98,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:4,12,1,1
chr1	28165341	.	T	TTGGAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:4,9,1,1
chr1	28169906	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=137,140;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:28169906_G_A:28169906:0,7,0,2
chr1	28169913	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=142,123;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,0:0,2:0,6,0,2
chr1	28169917	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=137,140;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:28169906_G_A:28169906:0,7,0,2
chr1	28169938	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=156,128;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	28176970	.	TGGAGAAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.513:2:0,1:1,0:0|1:28176970_TGGAGAAG_T:28176970:0,1,0,1
chr1	28176980	.	TGGGA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28176970_TGGAGAAG_T:28176970:0,0,0,1
chr1	28199253	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	28206207	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=76,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,3:7,0:6,9,3,0
chr1	28209542	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=151,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr1	28211976	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28211976_GG_TT:28211976:1,0,0,1
chr1	28211978	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28211976_GG_TT:28211976:1,0,0,1
chr1	28211979	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28211976_GG_TT:28211976:1,0,0,1
chr1	28223532	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,0:9,4:7,9,2,2
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr1	28268744	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:8,3,3,0
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0|1:28268833_C_CG:28268833:0,0,10,8
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0|1:28268833_C_CG:28268833:0,0,10,8
chr1	28268961	.	C	CTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	28271643	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	28271986	.	T	G,TCATTCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31,28;MFRL=119,0,101;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,1:2,1,0:2,2,1,1
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,6,12
chr1	28290258	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:0,6,0,2
chr1	28290272	.	G	GAGGGCTTCTATTGTATATCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0,4,0,1
chr1	28293444	.	C	CGTGAGTCTGGGT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:1,2:5,0:4,2,1,1
chr1	28323718	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	28537265	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	28607392	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28607392_TCC_T:28607392:0,0,0,1
chr1	28607395	.	C	CAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:28607392_TCC_T:28607392:0,0,0,1
chr1	28792843	.	TCTCTTGTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:4,0,1,0
chr1	28818321	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=136,141;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:6,0:5,13:0|1:28818321_G_T:28818321:2,9,0,13
chr1	28818326	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=136,141;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:6,0:4,13:0|1:28818321_G_T:28818321:2,9,0,13
chr1	28858465	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=102,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:4,3,0,2
chr1	29010137	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,126;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:14,2:3,0:7,10,2,0
chr1	29016715	.	GT	G,GGTTGTTGTTGTTAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32,31;MFRL=3454057,0,129;MMQ=60,60,60;MPOS=16,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.35,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.529,0.261:5:0,1,1:1,2,0:1,0,2,2
chr1	29016717	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=1727093,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:1,1,2,1
chr1	29016723	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	29016729	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	29064755	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,1:14,2:24,4,3,0
chr1	29342090	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.790:11:0,0:2,9:2,0,9,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	29362361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:5,0:7,5,2,1
chr1	29385486	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	29485852	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,3,2
chr1	29522416	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:29522416_C_T:29522416:1,0,1,0
chr1	29522434	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:29522416_C_T:29522416:3,1,1,0
chr1	29522721	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=78,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,1:6,2:6,1,1,2
chr1	29533483	.	C	CACGCCTGGCCCCTATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29533483_C_CACGCCTGGCCCCTATG:29533483:0,0,0,1
chr1	29533486	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29533483_C_CACGCCTGGCCCCTATG:29533483:0,0,0,1
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	29602108	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.393:18:5,0:6,6:6,5,7,0
chr1	29602227	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=114,98270645;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:11,5,1,1
chr1	29602320	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr1	29602363	.	T	TGAGATGGTGTCTCACTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:29602363_T_TGAGATGGTGTCTCACTG:29602363:0,0,0,1
chr1	29602365	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29602363_T_TGAGATGGTGTCTCACTG:29602363:0,0,0,1
chr1	29605718	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29605718_TG_GT:29605718:0,0,0,1
chr1	29605721	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29605718_TG_GT:29605718:0,0,0,1
chr1	29616335	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=65,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:29616335_T_C:29616335:1,2,0,1
chr1	29616339	.	C	CTCTCATTCCTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=65,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:29616335_T_C:29616335:1,2,0,1
chr1	29630554	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:3,8,1,3
chr1	29630570	.	C	CGAAAGCTGTCTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr1	29631393	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=88,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr1	29631416	.	AGGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:29631416_AGGGG_A:29631416:0,2,0,1
chr1	29631421	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29631416_AGGGG_A:29631416:0,0,0,1
chr1	29631782	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=285,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	29633757	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	29633778	.	T	TCTCTTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:29633778_T_TCTCTTTC:29633778:0,0,0,1
chr1	29633779	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:29633778_T_TCTCTTTC:29633778:0,0,0,1
chr1	29637136	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	29637366	.	TCTGC	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=147,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:4,1:1,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,5,0,1
chr1	29637376	.	CTGCTG	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=157,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,5,0,1
chr1	29637383	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,3,0,1
chr1	29637385	.	CGCTTGATT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,3,0,1
chr1	29637396	.	TGAATG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,3,0,1
chr1	29637403	.	CTCCCCACCG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=175,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:29637366_TCTGC_T:29637366:0,2,0,1
chr1	29651670	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,2:6,0:5,8,5,0
chr1	29652068	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=112,63393507;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	31188089	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,14:0,5:0,0,9,10
chr1	31206637	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	31206806	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	31208042	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,3,3
chr1	31349689	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=126,79;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:2,4,0,3
chr1	31413972	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:5,2,1,3
chr1	31426714	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:4,4,0,2
chr1	31438751	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31438751_C_T:31438751:0,0,1,0
chr1	31438754	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31438751_C_T:31438751:1,0,1,0
chr1	31441214	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=128,0;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:6,2,0,2
chr1	31453084	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	31478638	.	AAGAGAGAGAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=AG;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.517:6:0,1:0,2:3,0,2,1
chr1	31656894	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31656894_G_C:31656894:0,1,0,1
chr1	31656903	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31656894_G_C:31656894:0,1,0,1
chr1	31656909	.	G	GAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31656894_G_C:31656894:0,1,0,1
chr1	31740706	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr1	31744383	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=237,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31744383_A_C:31744383:0,1,0,1
chr1	31744385	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=237,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:31744383_A_C:31744383:0,1,0,1
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	31764946	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=155,123;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:31764946_A_G:31764946:0,4,0,1
chr1	31764948	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=155,123;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:31764946_A_G:31764946:0,4,0,1
chr1	31821815	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=110,119;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:12,10,0,2
chr1	31837011	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=103,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,4:0.081:60:29,4:25,0:30,26,4,0
chr1	31838888	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31838888_A_C:31838888:0,1,0,1
chr1	31838889	.	T	TAAGTTAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31838888_A_C:31838888:0,1,0,1
chr1	31842225	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:10,3:5,0:11,4,2,1
chr1	31882582	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr1	31882726	.	TT	GG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:6,0:6,0:0|1:31882726_TT_GG:31882726:7,6,0,2
chr1	31882734	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=107,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,0:2,0:0|1:31882726_TT_GG:31882726:4,5,0,2
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr1	31899416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=179,31;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:31899416_G_A:31899416:1,0,1,1
chr1	31899419	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=179,31;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:31899416_G_A:31899416:1,0,1,1
chr1	31899421	.	C	CTGAGATTCTCCTCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=179,31;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:31899416_G_A:31899416:1,0,1,1
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:2,4:0,4:2,0,5,3
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,3,2
chr1	32051313	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr1	32051411	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,3:4,0:9,2,2,1
chr1	32052375	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:32052375_T_TC:32052375:1,3,2,0
chr1	32052380	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:32052375_T_TC:32052375:1,3,2,0
chr1	32052386	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=121,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:32052375_T_TC:32052375:1,3,2,0
chr1	32052394	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:32052375_T_TC:32052375:0,3,1,0
chr1	32052396	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:32052375_T_TC:32052375:0,3,1,0
chr1	32098340	.	T	TGCAGTGGTGTAATCACAGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	32110408	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,41;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:9,2,1,1
chr1	32124648	.	A	AAACTGAAAATTAGGACTGGAAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	32127953	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,9,12
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	32133737	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	32134440	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:2,2:6,1:1,7,2,1
chr1	32136168	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,6:0,10:0,0,12,10
chr1	32141014	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:32141014_G_A:32141014:0,4,0,1
chr1	32141019	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=157,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:32141014_G_A:32141014:0,4,0,1
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr1	32149248	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=110,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,1:3,0:0|1:32149248_G_A:32149248:2,2,1,1
chr1	32149252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,18;MFRL=101,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,1:4,0:0|1:32149248_G_A:32149248:3,2,1,1
chr1	32150346	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	32151219	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=183,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32151219_C_CCA:32151219:3,1,0,1
chr1	32151222	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=183,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:32151219_C_CCA:32151219:3,1,0,1
chr1	32151633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:6,4,2,0
chr1	32156246	.	C	CTGAGTGCACCATCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	32156940	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	32156951	.	T	TCTCATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	32158488	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32158488_G_A:32158488:0,0,0,1
chr1	32158491	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32158488_G_A:32158488:0,0,0,1
chr1	32158494	.	CCCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32158488_G_A:32158488:0,0,0,1
chr1	32193699	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr1	32196647	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	32197091	.	T	TAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32197091_T_TAGA:32197091:0,0,0,1
chr1	32197093	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32197091_T_TAGA:32197091:0,0,0,1
chr1	32197095	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32197091_T_TAGA:32197091:0,0,0,1
chr1	32198697	.	G	GCCCTCTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=82,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.323:7:3,0:2,2:0|1:32198697_G_GCCCTCTT:32198697:3,2,1,1
chr1	32198699	.	G	GCTGTCTTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=82,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:32198697_G_GCCCTCTT:32198697:3,2,1,1
chr1	32198700	.	A	AACTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=82,39;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:32198697_G_GCCCTCTT:32198697:3,2,1,1
chr1	32201251	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:9,2:6,1:9,7,3,0
chr1	32202302	.	G	GAAGGAAGGAAAGAAAGAAAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:32202302_G_GAAGGAAGGAAAGAAAGAAAGA:32202302:4,4,1,1
chr1	32202303	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,1:4,0:0|1:32202302_G_GAAGGAAGGAAAGAAAGAAAGA:32202302:4,4,1,1
chr1	32203163	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,1:5,4:2,4,3,2
chr1	32203362	.	G	GGTCAGGTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32203362_G_GGTCAGGTCTTC:32203362:0,0,0,1
chr1	32203364	.	A	ACACAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32203362_G_GGTCAGGTCTTC:32203362:0,0,0,1
chr1	32205279	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:32205279_A_G:32205279:1,3,0,1
chr1	32205282	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:32205279_A_G:32205279:1,3,0,1
chr1	32205285	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:32205279_A_G:32205279:1,2,0,1
chr1	32205295	.	A	AGGTTGCAGTGAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	32221727	.	TGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GTG;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr1	32221913	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr1	32259707	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:3,0:0|1:32259707_T_A:32259707:5,0,2,0
chr1	32259719	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,14;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,0:0|1:32259707_T_A:32259707:5,3,2,0
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	32281005	.	T	TCTGTCCTTCTCTCACCCTCTCTCTCTGTCTCTCCCTCTCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	32377504	.	AGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.308:14:6,0:4,4:0,10,0,4
chr1	32381416	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:19,1,2,0
chr1	32504190	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:5,1,1,1
chr1	32541401	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:2,1:1,1:0|1:32541401_A_C:32541401:2,3,3,0
chr1	32541405	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=102,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.362:9:3,1:2,0:0|1:32541401_A_C:32541401:3,3,3,0
chr1	32541409	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=82,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,0:1,1:0|1:32541401_A_C:32541401:3,4,3,0
chr1	32620313	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:32620313_A_T:32620313:8,8,1,1
chr1	32620323	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:32620313_A_T:32620313:6,9,1,1
chr1	32620324	.	TGAG	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=133,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:4,0:0|1:32620313_A_T:32620313:5,8,1,1
chr1	32620329	.	T	TTTA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:32620313_A_T:32620313:2,7,1,1
chr1	32636242	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,175;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,3:3,0:5,0,3,0
chr1	32655671	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.186:23:8,1:11,2:7,12,2,2
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,0:0,2:1,0,0,3
chr1	32658756	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	32671341	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,4:3,0:7,1,4,0
chr1	32672409	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:0,0:11,2:2,9,1,1
chr1	32672725	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=119,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:9,11,1,1
chr1	32677283	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32677283_T_G:32677283:0,0,1,0
chr1	32677285	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32677283_T_G:32677283:0,0,1,0
chr1	32677292	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32677283_T_G:32677283:0,0,1,0
chr1	32677295	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32677283_T_G:32677283:0,0,1,0
chr1	32678436	.	G	GATAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:32678436_G_GATAA:32678436:1,3,1,1
chr1	32678439	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:32678436_G_GATAA:32678436:1,3,1,1
chr1	32678441	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:32678436_G_GATAA:32678436:1,3,1,1
chr1	32678443	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:32678436_G_GATAA:32678436:1,3,1,1
chr1	32680621	.	G	GTGTGCTTGTTGTCGAAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	32682970	.	AAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	32682984	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=184,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32682984_A_ATT:32682984:0,2,0,1
chr1	32682987	.	C	CTGTGACTTCATCTGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=184,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32682984_A_ATT:32682984:0,2,0,1
chr1	32692178	.	T	TCTTCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=161,122;MMQ=49,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32692178_T_TCTTCG:32692178:0,1,0,1
chr1	32692181	.	T	TCCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=161,122;MMQ=49,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32692178_T_TCTTCG:32692178:0,1,0,1
chr1	32694387	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:4,9,0,2
chr1	32694418	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=120,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:32694418_G_T:32694418:2,5,1,1
chr1	32694430	.	C	CTATATCTGG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=112,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:2,4,0,2
chr1	32694441	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=118,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:32694418_G_T:32694418:0,3,1,1
chr1	32694509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	32714069	.	A	AACCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,32;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr1	32768380	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:32768380_G_C:32768380:0,0,0,1
chr1	32768382	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32768380_G_C:32768380:0,1,0,1
chr1	32768383	.	C	CAGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32768380_G_C:32768380:0,1,0,1
chr1	32768388	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32768380_G_C:32768380:0,1,0,1
chr1	32768392	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=175,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32768380_G_C:32768380:0,1,0,1
chr1	32793369	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32793369_G_GC:32793369:0,0,0,1
chr1	32793372	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32793369_G_GC:32793369:0,0,0,1
chr1	32793374	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32793369_G_GC:32793369:0,0,0,1
chr1	32793377	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32793369_G_GC:32793369:0,0,0,1
chr1	32794843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794845	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794847	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794851	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794853	.	C	CTT,T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32,28;MFRL=0,145,155;MMQ=60,60,60;MPOS=8,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr1	32794855	.	C	CTTTCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794856	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,25;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32794859	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:32794843_T_C:32794843:0,1,0,1
chr1	32797875	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=36556612,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	32846775	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,0:14,2:12,12,0,2
chr1	32936405	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=100,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr1	33059256	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=101,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:9,6,0,2
chr1	33059379	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:33059379_CCT_C:33059379:0,3,0,1
chr1	33059384	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33059379_CCT_C:33059379:0,3,0,1
chr1	33060917	.	G	GTTTACTCTTCTTTACTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	33087437	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,3:3,1:6,2,3,1
chr1	33087565	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:2,0:0,1:0|1:33087565_G_A:33087565:2,0,0,1
chr1	33087567	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:0,1:0|1:33087565_G_A:33087565:2,0,0,1
chr1	33087574	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:33087565_G_A:33087565:1,0,0,1
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr1	33117092	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,2:2,5:0,4,0,7
chr1	33117137	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	33117674	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,1:13,3:1,24,0,4
chr1	33117739	.	C	CAAATAATGGTGTAGTCATAGCAGTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	33133918	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=120,114;MMQ=50,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:20,4:19,0:21,20,4,0
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:7,1,3,6
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:1,6,2,7
chr1	33135223	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:21,0:9,3:4,26,0,3
chr1	33135234	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=137,127;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:18,0:9,2:1,26,0,2
chr1	33135256	.	C	CCA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=151,126;MMQ=52,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:9,1:2,1:0|1:33135256_C_CCA:33135256:0,11,0,2
chr1	33135257	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=151,126;MMQ=52,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,1:2,1:0|1:33135256_C_CCA:33135256:0,11,0,2
chr1	33135262	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=162,126;MMQ=46,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:2,1:0|1:33135256_C_CCA:33135256:0,10,0,2
chr1	33138361	.	TTTC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:2,3:2,2:0|1:33138361_TTTC_T:33138361:3,3,2,5
chr1	33138366	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0|1:33138361_TTTC_T:33138361:3,2,2,5
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr1	33145352	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:33145352_CAA_C:33145352:0,4,0,1
chr1	33145355	.	C	CCCCTATTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:33145352_CAA_C:33145352:0,4,0,1
chr1	33145365	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,281;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33145365_G_GT:33145365:0,0,0,1
chr1	33145367	.	T	TCAGGCGAGATAAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,281;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33145365_G_GT:33145365:0,0,0,1
chr1	33146113	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=88,122;MMQ=46,54;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.261:35:15,6:11,3:19,7,8,1
chr1	33149698	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AG;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0,3,1,1
chr1	33235651	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=228,75;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	33236550	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33236550_T_TG:33236550:0,0,1,0
chr1	33236554	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33236550_T_TG:33236550:0,0,1,0
chr1	33237086	.	GG	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,18;MFRL=76,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:33237086_GG_TC:33237086:0,2,0,1
chr1	33237088	.	C	CCATCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=76,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:33237086_GG_TC:33237086:0,2,0,1
chr1	33237358	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,3:2,0:2,3,3,1
chr1	33237885	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:1,1:0|1:33237885_A_C:33237885:1,7,2,0
chr1	33237889	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,1:0|1:33237885_A_C:33237885:2,7,2,0
chr1	33237892	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,0:0|1:33237885_A_C:33237885:2,7,2,0
chr1	33237897	.	CAGTTA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:3,2:0|1:33237885_A_C:33237885:3,9,2,0
chr1	33252074	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr1	33252743	.	GTTA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33252743_GTTA_G:33252743:0,3,0,1
chr1	33252750	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:33252743_GTTA_G:33252743:0,3,0,1
chr1	33252752	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:33252743_GTTA_G:33252743:0,3,0,1
chr1	33252754	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33252743_GTTA_G:33252743:0,2,0,1
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:2,6,3,6
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	33295728	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr1	33329746	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	33333504	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	33402334	.	GAAAA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,2:1,0:4,3,1,1
chr1	33411282	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33411282_G_T:33411282:0,1,0,1
chr1	33411286	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33411282_G_T:33411282:0,1,0,1
chr1	33411288	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33411282_G_T:33411282:0,1,0,1
chr1	33411290	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33411282_G_T:33411282:0,1,0,1
chr1	33411292	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:33411282_G_T:33411282:0,1,0,1
chr1	33476353	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=110,79;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,3:1,0:5,2,2,1
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,79;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:10,5:3,0:0|1:33476385_C_G:33476385:9,6,3,2
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,79;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:11,5:4,0:0|1:33476385_C_G:33476385:9,6,3,2
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=110,87;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:9,4:4,0:0|1:33476385_C_G:33476385:8,6,2,2
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=110,95;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:5,0:8,7,2,1
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=110,102;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:8,3:10,3:14,4,5,1
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.224:29:11,4:12,2:16,7,4,2
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.256:32:10,4:14,3:15,9,4,4
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.219:25:8,1:10,4:11,9,1,4
chr1	33547768	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	33741787	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:33741787_G_A:33741787:0,1,0,2
chr1	33741807	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:33741787_G_A:33741787:0,1,0,1
chr1	33741895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr1	33795572	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	33795590	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr1	33797158	.	G	GTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	33799658	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,2:0,0:1,0,2,1
chr1	33799900	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr1	33836768	.	AGGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,0:0|1:33836768_AGGAG_A:33836768:0,0,0,1
chr1	33836773	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33836768_AGGAG_A:33836768:0,0,0,1
chr1	33954220	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	33985618	.	CCGACTA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	33998830	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:33998830_C_CAG:33998830:0,5,1,1
chr1	33998832	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:33998830_C_CAG:33998830:0,5,1,1
chr1	33999552	.	T	TAGGAGTTGGGCCATGTGAAAATGGTCAAAGGACAGAC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	33999585	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33999585_A_AG:33999585:0,1,0,1
chr1	33999591	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,19;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:33999585_A_AG:33999585:0,1,0,1
chr1	33999594	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33999585_A_AG:33999585:0,1,0,1
chr1	33999596	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33999585_A_AG:33999585:0,1,0,1
chr1	33999599	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33999599_C_A:33999599:0,1,0,1
chr1	33999605	.	CT	AA	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33999599_C_A:33999599:0,0,0,1
chr1	33999608	.	T	TCTTAACTAATTCCA	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33999599_C_A:33999599:0,0,0,1
chr1	34003223	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:34003223_G_A:34003223:0,4,0,1
chr1	34003227	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:34003223_G_A:34003223:0,4,0,1
chr1	34006124	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr1	34008297	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	34008458	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=112,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:34008458_G_T:34008458:4,0,0,1
chr1	34008460	.	GC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=112,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:34008458_G_T:34008458:4,0,0,1
chr1	34015879	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:7,2:3,5,1,1
chr1	34035224	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34035224_GA_G:34035224:0,0,0,1
chr1	34035232	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34035224_GA_G:34035224:0,0,0,1
chr1	34037283	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr1	34038214	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	34042979	.	C	CATGGTGGCGGATGACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	34049221	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr1	34052845	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34052845_T_C:34052845:0,1,0,1
chr1	34052847	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34052845_T_C:34052845:0,1,0,1
chr1	34052850	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34052845_T_C:34052845:0,1,0,1
chr1	34052851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34052845_T_C:34052845:0,1,0,1
chr1	34052854	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34052845_T_C:34052845:0,1,0,1
chr1	34066568	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,1:4,1:1,5,0,2
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0|1:34071434_C_T:34071434:0,0,8,2
chr1	34071444	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:34071434_C_T:34071434:7,3,2,0
chr1	34112469	.	TA	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	34117889	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	34118112	.	T	TAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	34128656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=121,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:34128656_G_A:34128656:1,3,0,1
chr1	34128658	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=121,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:34128656_G_A:34128656:1,3,0,1
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	34192315	.	TTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.709:1:0,1:0,0:0|1:34192315_TTTC_T:34192315:0,0,0,1
chr1	34192320	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34192315_TTTC_T:34192315:0,0,0,1
chr1	34208986	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	34238366	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34238366_A_G:34238366:1,0,0,1
chr1	34238368	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34238366_A_G:34238366:1,0,0,1
chr1	34257966	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:1,0:2,0:1,2,2,0
chr1	34270498	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,2:0,1:0,0,2,3
chr1	34270593	.	T	TTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	34285995	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	34286189	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	34330340	.	T	TCCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=52,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:34330340_T_TCCC:34330340:2,2,0,1
chr1	34330345	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=52,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:34330340_T_TCCC:34330340:2,2,0,1
chr1	34330407	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34330407_T_TGC:34330407:0,1,0,1
chr1	34330409	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34330407_T_TGC:34330407:0,1,0,1
chr1	34330412	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34330407_T_TGC:34330407:0,1,0,1
chr1	34643555	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=51,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:34643555_G_A:34643555:2,6,1,1
chr1	34643563	.	CCCAAG	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=51,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:5,0:0|1:34643555_G_A:34643555:2,6,1,1
chr1	34643571	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=51,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:34643555_G_A:34643555:2,5,1,1
chr1	34643787	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34643787_GC_TT:34643787:0,0,0,1
chr1	34643792	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34643787_GC_TT:34643787:0,0,0,1
chr1	34643795	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34643787_GC_TT:34643787:0,0,0,1
chr1	34663187	.	A	AGGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:34663187_A_AGGC:34663187:0,3,1,1
chr1	34663189	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,1:1,0:0|1:34663187_A_AGGC:34663187:0,3,1,1
chr1	34663191	.	T	TTGTGTAAAGAAGAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34663187_A_AGGC:34663187:0,3,0,1
chr1	34663198	.	C	CATACAGCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=132,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	34678039	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,12523145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	35135315	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:2,7,2,5
chr1	35223945	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:35223945_A_G:35223945:7,3,0,2
chr1	35223947	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:35223945_A_G:35223945:7,3,0,2
chr1	35227339	.	G	GTGCTCACTGAGTAGTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr1	35227844	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:10,5,3,0
chr1	35228475	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=116,385;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:4,0:2,6,2,0
chr1	35228485	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=122,385;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:3,0:0|1:35228485_A_C:35228485:3,8,2,0
chr1	35228490	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:5,0:4,0:1,8,3,0
chr1	35228493	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=127,385;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:3,0:0|1:35228485_A_C:35228485:2,8,2,0
chr1	35228496	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=24,13;MFRL=127,385;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:3,0:0|1:35228485_A_C:35228485:2,8,2,0
chr1	35251545	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:0,1,7,3
chr1	35252033	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35252033_G_C:35252033:0,2,0,1
chr1	35252037	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:35252033_G_C:35252033:0,2,0,1
chr1	35252043	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:35252033_G_C:35252033:0,2,0,1
chr1	35259716	.	GGCAGACCTCCCTGCAGGCTTGTTGCTGGGCGAACGAGAAGGATGCCATGCTGACACACTGACGTGCTCTGTCTCCTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=145,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.580:4:0,1:0,0:1,0,3,0
chr1	35259961	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:2,4,3,1
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,3:0,0:3,0,0,3
chr1	35321628	.	C	CTTGGCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	35334312	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	35370320	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=121,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:35370320_G_T:35370320:0,1,0,1
chr1	35370323	.	GT	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35370320_G_T:35370320:0,0,0,1
chr1	35452878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:2,0:3,4:2,3,2,2
chr1	35453185	.	G	GC	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.236:32:11,7:14,0:13,12,6,1
chr1	35476239	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	35486072	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:0,1,1,2
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:10,4:7,5:7,10,3,8
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:2,7,0,5
chr1	35653690	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr1	35655064	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35655064_C_T:35655064:0,1,0,1
chr1	35655066	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35655064_C_T:35655064:0,1,0,1
chr1	35655068	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35655064_C_T:35655064:0,1,0,1
chr1	35655071	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,28;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35655064_C_T:35655064:0,1,0,1
chr1	35790921	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,169;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:6,5,0,3
chr1	35857913	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=129,114;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:2,9,2,0
chr1	35857919	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=129,114;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:2,9,2,0
chr1	35859139	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=117,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	35873853	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35873853_A_C:35873853:0,0,0,1
chr1	35873856	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35873853_A_C:35873853:0,0,0,1
chr1	35873858	.	T	TTGTTGTAGAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35873853_A_C:35873853:0,0,0,1
chr1	35873861	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35873853_A_C:35873853:0,0,0,1
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr1	35944866	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:35944866_G_A:35944866:0,0,0,1
chr1	35944867	.	G	GAGAACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:35944866_G_A:35944866:0,0,0,1
chr1	35944868	.	T	TTTAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35944866_G_A:35944866:0,0,0,1
chr1	36029565	.	TCCTGTGTTTGGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36029565_TCCTGTGTTTGGGG_T:36029565:0,2,0,1
chr1	36029582	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36029565_TCCTGTGTTTGGGG_T:36029565:0,1,0,1
chr1	36029585	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36029565_TCCTGTGTTTGGGG_T:36029565:0,1,0,1
chr1	36060065	.	CT	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:3,3,3,0
chr1	36075055	.	A	AGAAAACTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36075055_A_AGAAAACTCTC:36075055:1,0,0,1
chr1	36075062	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36075055_A_AGAAAACTCTC:36075055:1,0,0,1
chr1	36202585	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:8,7:4,6:6,6,7,6
chr1	36203659	.	TTTC	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=118,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0|1:36203659_TTTC_T:36203659:0,4,0,2
chr1	36203688	.	C	CGAGACAGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:36203659_TTTC_T:36203659:0,3,0,1
chr1	36203690	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=101,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:36203659_TTTC_T:36203659:0,3,0,1
chr1	36203695	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=51,94;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:36203659_TTTC_T:36203659:0,2,0,1
chr1	36205211	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=283,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36205211_G_GA:36205211:0,1,0,1
chr1	36205212	.	T	TCTCAGAGGCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=283,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36205211_G_GA:36205211:0,1,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	36235381	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=237,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=164,119;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	36282423	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=119,158;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.367:8:1,0:3,1:5,0,3,0
chr1	36282427	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=119,213;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.248:9:3,0:4,1:6,1,2,0
chr1	36288604	.	A	AGTAGATATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=145,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	36292388	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:2,4:8,1:8,3,2,3
chr1	36316418	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=69,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.803:15:0,5:3,3:1,2,5,7
chr1	36316571	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=98,158;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,3:6,1:5,5,1,3
chr1	36358937	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36358937_G_T:36358937:0,1,0,1
chr1	36358940	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,24;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:36358937_G_T:36358937:0,1,0,1
chr1	36358942	.	GGGAGCACAT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36358937_G_T:36358937:0,1,0,1
chr1	36448130	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	36509124	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=104,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:10,0:9,4:7,12,2,2
chr1	36520535	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:7,15,1,2
chr1	36552612	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr1	36556742	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=139,148;MMQ=60,56;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	36556751	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=150,147;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:36556751_C_CA:36556751:6,0,2,0
chr1	36556759	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=138,147;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:1,2:9,0:0|1:36556751_C_CA:36556751:9,1,2,0
chr1	36556770	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=118,158;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:0,3:9,0:9,1,3,0
chr1	36556978	.	GGG	AAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr1	36558696	.	A	ACACTGGCTGCGTGACT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=137,30;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:36558696_A_ACACTGGCTGCGTGACT:36558696:6,3,1,1
chr1	36558702	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=137,30;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:36558696_A_ACACTGGCTGCGTGACT:36558696:7,4,1,1
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:4,1,1,1
chr1	36563371	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	36603831	.	T	TTTTTTTGAAATGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:36603831_T_TTTTTTTGAAATGGAG:36603831:0,0,0,1
chr1	36603833	.	C	CTCACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36603831_T_TTTTTTTGAAATGGAG:36603831:0,0,0,1
chr1	36603836	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36603831_T_TTTTTTTGAAATGGAG:36603831:0,0,0,1
chr1	36605616	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	36636672	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36636672_G_C:36636672:0,1,0,1
chr1	36636675	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36636672_G_C:36636672:0,1,0,1
chr1	36637262	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	36637285	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:36637285_G_A:36637285:0,2,0,1
chr1	36637292	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36637285_G_A:36637285:0,1,0,1
chr1	36637296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:36637285_G_A:36637285:0,1,0,1
chr1	36643258	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36643258_G_A:36643258:0,4,0,1
chr1	36643260	.	GG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36643258_G_A:36643258:0,4,0,1
chr1	36644963	.	T	TCGTGTACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:3,7,1,1
chr1	36645720	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:36645720_T_C:36645720:4,0,0,1
chr1	36645722	.	TA	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:36645720_T_C:36645720:4,0,0,1
chr1	36748383	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr1	36752433	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,7:1,3:1,2,7,4
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	36769310	.	A	AAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=198,374;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36769310_A_AAATC:36769310:1,0,1,0
chr1	36769313	.	G	GTACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=198,374;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:36769310_A_AAATC:36769310:1,0,1,0
chr1	36769659	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:4,2:3,9,0,2
chr1	36773074	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr1	36773828	.	T	TCACAGAGTCGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,22;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.386:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=98,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,3:3,6:4,0,7,2
chr1	36785333	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=100,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:36785333_GA_G:36785333:3,9,1,1
chr1	36785337	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=107,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:36785333_GA_G:36785333:3,8,1,1
chr1	36785635	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,412;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:1,2:3,0:0|1:36785635_T_TC:36785635:2,3,2,0
chr1	36785637	.	C	CTGGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,0;MFRL=144,412;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:1,0:4,0:0|1:36785635_T_TC:36785635:2,3,2,0
chr1	36809962	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36809962_A_C:36809962:0,0,0,1
chr1	36809963	.	C	CCTCCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36809962_A_C:36809962:0,0,0,1
chr1	36814473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	36884530	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:4,2:8,2:10,7,4,0
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	36893893	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,228;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr1	36909701	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	36921371	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:3,5:1,2:4,0,7,1
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=83,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,3:5,3:3,4,4,3
chr1	36937679	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr1	36938100	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,0,2
chr1	36938325	.	C	CACCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,0:1,1:0|1:36938325_C_CACCA:36938325:0,2,0,1
chr1	36938330	.	T	TTGTCTCTCAGTAAAACTGACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36938325_C_CACCA:36938325:0,2,0,1
chr1	37267510	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr1	37267623	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:3,4,0,2
chr1	37270513	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	37271912	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr1	37271917	.	A	AAGGAGGGGGACACAGCCC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,1:2,0:0|1:37271917_A_AAGGAGGGGGACACAGCCC:37271917:1,2,0,1
chr1	37271918	.	T	TAAAACCAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,1:2,0:0|1:37271917_A_AAGGAGGGGGACACAGCCC:37271917:1,2,0,1
chr1	37271920	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:37271917_A_AAGGAGGGGGACACAGCCC:37271917:1,2,0,1
chr1	37315954	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,1:2,2:5,4,1,2
chr1	37324683	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,1:3,1:4,2,2,1
chr1	37325655	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,2
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,1
chr1	37946040	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=102,125;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:5,6,0,2
chr1	37959287	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,0:5,4:10,2,3,1
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,15:0,7:0,0,6,16
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,6,12
chr1	37959839	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:37959839_A_G:37959839:0,3,0,1
chr1	37959843	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37959839_A_G:37959839:0,3,0,1
chr1	37959854	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	37974975	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:7,2:7,2:11,4,4,0
chr1	38006328	.	C	CCGCCCCACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38022452	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	38030696	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	38032579	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:16,2:10,1:11,15,1,2
chr1	38032682	.	T	TGAAAAACTGTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,3,9
chr1	38052867	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,144;MMQ=40,50;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,3:1,4:1,0,7,1
chr1	38053161	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:38053161_C_A:38053161:0,1,0,1
chr1	38053162	.	A	ATATGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38053161_C_A:38053161:0,1,0,1
chr1	38053166	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38053161_C_A:38053161:0,1,0,1
chr1	38078689	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38078689_G_T:38078689:0,0,0,1
chr1	38078691	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38078689_G_T:38078689:0,0,0,1
chr1	38149193	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:38149193_C_T:38149193:0,0,0,1
chr1	38149202	.	G	GGGGAAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38149193_C_T:38149193:1,0,0,1
chr1	38155265	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr1	38158496	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,0:5,2:2,10,1,1
chr1	38161694	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr1	38164724	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:38164724_C_G:38164724:0,0,1,6
chr1	38164730	.	G	GTGGCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,0:2,1:0|1:38164724_C_G:38164724:0,3,0,1
chr1	38164734	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38164724_C_G:38164724:0,3,0,1
chr1	38166022	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	38169046	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr1	38169113	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=128,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	38185583	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:4,9,1,2
chr1	38185814	.	GC	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	38188697	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr1	38188740	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr1	38188768	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=198,795;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	38201101	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38201101_C_A:38201101:1,1,0,1
chr1	38201103	.	TCACGGCA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38201101_C_A:38201101:1,1,0,1
chr1	38201121	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38201121_T_A:38201121:0,0,0,1
chr1	38201123	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38201121_T_A:38201121:0,0,0,1
chr1	38265771	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	38323312	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,1:3,13,2,0
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:3,6:0,3:1,2,8,1
chr1	38328154	.	GAC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38332057	.	T	TTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=181,156;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=TC;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.647:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	38341209	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=167,0;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38341209_G_A:38341209:1,0,0,1
chr1	38341218	.	GC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=155,0;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:2,1:1,0:0|1:38341209_G_A:38341209:3,0,0,1
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	38351397	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:8,5,1,1
chr1	38351584	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:38351584_G_A:38351584:0,3,0,2
chr1	38351590	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:38351584_G_A:38351584:0,3,0,1
chr1	38425724	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	38425895	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:1,1:1,2,2,2
chr1	38444333	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr1	38445304	.	A	AGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:38445304_A_AGCAG:38445304:0,4,0,1
chr1	38445307	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:38445304_A_AGCAG:38445304:0,4,0,1
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chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,4:0,5:1,0,6,3
chr1	38485104	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:4,1:1,0:2,4,0,2
chr1	38485120	.	T	TAAGGAAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,4:0,0:2,1,2,2
chr1	39325197	.	CCCG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCG;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:4,4,0,2
chr1	39340607	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:3,4,3,3
chr1	39341945	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=136,58;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,0:6,2:0|1:39341945_C_T:39341945:2,8,1,1
chr1	39341957	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:39341945_C_T:39341945:0,4,0,1
chr1	39341961	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:39341945_C_T:39341945:0,4,0,1
chr1	39341971	.	AG	GA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39341945_C_T:39341945:0,3,0,1
chr1	39342011	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39342011_C_T:39342011:0,1,0,1
chr1	39342013	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39342011_C_T:39342011:0,1,0,1
chr1	39342045	.	A	ATTCTGC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr1	39352431	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39352428_T_C:39352428:0,0,0,1
chr1	39352436	.	C	CAATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39352428_T_C:39352428:0,0,0,1
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:2,1:4,1,2,0
chr1	39466626	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.441:21:4,6:6,3:6,6,3,6
chr1	39466786	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr1	39494686	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494688	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494694	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494698	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494702	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494705	.	CCT	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39494711	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39494686_C_T:39494686:0,0,0,1
chr1	39715650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	39749125	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:8,2,1,1
chr1	39763242	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	39766041	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=82,171;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr1	39789809	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=99,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	39790434	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:39790434_C_T:39790434:7,10,1,1
chr1	39790442	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:39790434_C_T:39790434:6,10,1,1
chr1	39790444	.	AC	CA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:8,2:0|1:39790434_C_T:39790434:6,10,1,1
chr1	39801815	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:4,2,3,1
chr1	39806419	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:5,4,1,1
chr1	39806717	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39806717_T_A:39806717:0,0,0,1
chr1	39806719	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39806717_T_A:39806717:0,0,0,1
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	39815143	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:2,4,2,4
chr1	39815359	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=139,170;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	39815366	.	GTTATCTT	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39815366_GTTATCTT_G:39815366:0,4,0,1
chr1	39815376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39815366_GTTATCTT_G:39815366:0,4,0,1
chr1	39815387	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,32;MFRL=154,177;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0|1:39815387_T_C:39815387:0,1,0,1
chr1	39815390	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=154,177;MMQ=60,30;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39815387_T_C:39815387:0,1,0,1
chr1	39815392	.	TC	CA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=154,177;MMQ=60,30;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39815387_T_C:39815387:0,1,0,1
chr1	39815396	.	C	CCAGGTTCAAG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=154,177;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39815387_T_C:39815387:0,1,0,1
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:9,3:5,6:10,5,6,3
chr1	39823488	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:7,2:2,1:4,5,2,1
chr1	39824588	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,1206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr1	39824718	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	39854119	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=113,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:11,3:3,0:3,11,3,0
chr1	39854160	.	GG	AA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=81,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:7,6,0,2
chr1	39877152	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=68,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr1	39880319	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=92,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,7:3,3:3,4,4,6
chr1	39881006	.	ATT	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:13,2:8,0:9,16,0,2
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:0,7,0,6
chr1	39881094	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=185,222;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:39881094_A_G:39881094:0,4,0,1
chr1	39881108	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=185,222;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:39881094_A_G:39881094:0,2,0,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,6:6,3:4,4,3,6
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=179,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.745:14:2,4:1,7:3,0,8,3
chr1	39893339	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,30;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39893339_GA_G:39893339:0,1,0,1
chr1	39893344	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39893339_GA_G:39893339:0,1,0,1
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	39905109	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=106,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:17,0:9,7:13,13,0,7
chr1	39907057	.	C	CTGTTTGTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:39907057_C_CTGTTTGTTTTT:39907057:0,3,0,1
chr1	39907058	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=165,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:39907057_C_CTGTTTGTTTTT:39907057:0,3,0,1
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:3,3,3,4
chr1	39913583	.	A	AATGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,22;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr1	39913617	.	G	GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCCACGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	39920510	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=82,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:39920510_G_GT:39920510:1,1,1,1
chr1	39920516	.	GG	TT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=82,51;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.507:4:1,0:1,2:0|1:39920510_G_GT:39920510:1,1,1,1
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr1	39929240	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:6,2,2,5
chr1	39951417	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=110,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,1,1
chr1	39951485	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:39951485_A_AG:39951485:0,0,0,1
chr1	39951486	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:39951485_A_AG:39951485:0,0,0,1
chr1	39951490	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39951485_A_AG:39951485:0,0,0,1
chr1	39951493	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39951485_A_AG:39951485:0,0,0,1
chr1	39988831	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=120,120;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	40027305	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,7:3,0:4,4,7,0
chr1	40028109	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:40028109_T_A:40028109:1,3,0,1
chr1	40028111	.	GGTTAGCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:40028109_T_A:40028109:1,3,0,1
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,0,2
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:2,2:1,4:3,0,4,3
chr1	40038249	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,1:1,0:0|1:40038249_GC_G:40038249:2,5,1,1
chr1	40038254	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:6,2:1,0:0|1:40038249_GC_G:40038249:2,5,1,1
chr1	40038296	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=173,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40038296_C_G:40038296:0,1,0,1
chr1	40038298	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=173,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40038296_C_G:40038296:0,1,0,1
chr1	40038299	.	C	CTTGACA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=173,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40038296_C_G:40038296:0,1,0,1
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	40092928	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40092928_C_T:40092928:0,0,0,1
chr1	40092933	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40092928_C_T:40092928:0,0,0,1
chr1	40092941	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40092928_C_T:40092928:0,0,0,1
chr1	40092948	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40092928_C_T:40092928:0,0,0,1
chr1	40092951	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40092928_C_T:40092928:0,0,0,1
chr1	40096053	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	40098426	.	G	GTGGGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:40098426_G_GTGGGTT:40098426:1,3,0,1
chr1	40098428	.	A	AACCCAAAGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:40098426_G_GTGGGTT:40098426:1,3,0,1
chr1	40149870	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	40150370	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	40207169	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	40209403	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40209403_C_T:40209403:0,0,1,0
chr1	40209408	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40209403_C_T:40209403:0,0,1,0
chr1	40214815	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:40214815_CA_TT:40214815:0,3,0,1
chr1	40214820	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:40214815_CA_TT:40214815:0,3,0,1
chr1	40228152	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:7,8,1,1
chr1	40228268	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=77,138;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:7,9,2,0
chr1	40235624	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	40349245	.	G	GTGATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	40432475	.	GC	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:6,2,1,1
chr1	40530312	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:0,0:0|1:40530312_A_G:40530312:0,2,0,1
chr1	40530316	.	AC	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40530312_A_G:40530312:0,0,0,1
chr1	40533266	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,3,10
chr1	40533287	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,55;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,1,9
chr1	40533289	.	C	CTCAAGTGATA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=146,53;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:40533289_C_CTCAAGTGATA:40533289:0,8,1,1
chr1	40533291	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=165,53;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:40533289_C_CTCAAGTGATA:40533289:0,9,1,1
chr1	40533315	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,1,5
chr1	40533320	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,2:0|1:40533315_T_G:40533315:0,0,1,6
chr1	40535609	.	TTTCA	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:7,1:1,19,0,2
chr1	40535610	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=140,118;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:5,2:0|1:40535610_T_C:40535610:3,18,0,2
chr1	40535615	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:7,1:0,20,0,2
chr1	40535616	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=141,118;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:5,2:0|1:40535610_T_C:40535610:0,19,0,2
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr1	40539832	.	C	CTGCCTCAGCCTCCTG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:40539832_C_CTGCCTCAGCCTCCTG:40539832:2,4,1,1
chr1	40539834	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:40539832_C_CTGCCTCAGCCTCCTG:40539832:2,4,1,1
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr1	40546064	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:8,2:6,1:7,8,0,3
chr1	40555166	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:1,3:9,0:4,6,2,1
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,3,1
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	40559555	.	CAA	C,CA,CAAAAAA	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=25,18,17,32;MFRL=112,105,101,74;MMQ=51,60,60,60;MPOS=6,7,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,19,20,25;RU=A;STR;TLOD=7.25,4.89,14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,10,6,9:0.307,0.242,0.376:27:0,3,0,0:1,1,1,1:1,1,4,21
chr1	40559596	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,4:0.045:108:58,4:46,0:39,65,0,4
chr1	40654976	.	C	CTACCAAGTCCTAGTTTCTGTTTTACCTATTGTAATCCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,94;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.454:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr1	40701378	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr1	40705958	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,5:6,0:8,3,5,0
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	40768973	.	T	TCCTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40768973_T_TCCTTG:40768973:0,1,0,1
chr1	40768978	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40768973_T_TCCTTG:40768973:0,1,0,1
chr1	40770568	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40770568_C_T:40770568:0,1,0,1
chr1	40770576	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40770568_C_T:40770568:0,1,0,1
chr1	40775789	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:2,1,1,1
chr1	40775801	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,2:1,1,1,1
chr1	40776525	.	A	ATTCACTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=1778,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:0,2,0,5
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr1	40781152	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	40781359	.	GG	AA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:40781359_GG_AA:40781359:3,6,1,1
chr1	40781363	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:40781359_GG_AA:40781359:2,6,1,1
chr1	40840296	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=110,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.677:19:2,6:1,6:4,2,10,3
chr1	40878798	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=82,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,2:1,0:3,5,0,2
chr1	40879808	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr1	40882035	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:1,4,0,2
chr1	40947617	.	T	TGCTGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40947617_T_TGCTGG:40947617:0,1,0,1
chr1	40947619	.	A	AAAACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40947617_T_TGCTGG:40947617:0,1,0,1
chr1	40947624	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40947624_G_GAT:40947624:0,0,0,1
chr1	40947625	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40947624_G_GAT:40947624:0,0,0,1
chr1	40947626	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40947624_G_GAT:40947624:0,0,0,1
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	40981251	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=150,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:4,5,1,2
chr1	40981938	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=111,68;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,2:0.049:59:30,0:21,2:27,30,1,1
chr1	40981941	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.096:51:29,0:17,5:19,27,4,1
chr1	40981945	.	G	GCT	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=122,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.083:48:27,0:16,4:0|1:40981945_G_GCT:40981945:18,26,3,1
chr1	40981947	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:40,6:0.147:46:25,1:14,5:1|0:40981945_G_GCT:40981945:17,23,3,3
chr1	40981949	.	ATG	A	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.084:47:26,0:15,4:0|1:40981945_G_GCT:40981945:17,26,3,1
chr1	40981955	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=31,23;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.101:39:20,0:11,2:0|1:40981945_G_GCT:40981945:13,22,3,1
chr1	41012910	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,115;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:11,9,0,4
chr1	41013159	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=61,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,3,0
chr1	41095033	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=102,523;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:5,5,0,3
chr1	41098894	.	A	ATGGTTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	41204569	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,14:0,1:0,0,7,8
chr1	41232595	.	A	ATC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:41232595_A_ATC:41232595:2,3,1,1
chr1	41232596	.	A	AACATCTCTGGTCATG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=106,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:2,0:3,2:0|1:41232595_A_ATC:41232595:2,3,1,1
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	41285769	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	41298825	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	41304294	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	41450407	.	TAATGAGTGTTTTATTTCAGGATTGCAGTTGTGCCATGGTATAGGTATTTTTCACTTAACGTA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=91,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:0,0:1,2:24,7,1,1
chr1	41454328	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=148,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:2,1,2,3
chr1	41454437	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:41454437_G_A:41454437:0,2,0,1
chr1	41454440	.	AAA	TCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:41454437_G_A:41454437:0,2,0,1
chr1	41456808	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:41456808_CTTT_C:41456808:2,0,1,0
chr1	41456823	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:0,0:0|1:41456808_CTTT_C:41456808:2,0,1,0
chr1	41456995	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41456995_A_G:41456995:0,1,0,1
chr1	41456997	.	C	CGCTGTGTCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41456995_A_G:41456995:0,1,0,1
chr1	41461513	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	41466795	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.222:11:6,2:3,0:0|1:41466795_T_A:41466795:3,6,1,1
chr1	41466796	.	A	AATCCATCCAAACTCCATGACAGCCACT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.222:11:6,1:3,0:0|1:41466795_T_A:41466795:3,6,1,1
chr1	41466803	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	41474400	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	41494222	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	41494453	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,76;MMQ=60,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41494453_C_A:41494453:0,0,0,1
chr1	41494456	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,76;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41494453_C_A:41494453:0,0,0,1
chr1	41494459	.	T	TCAGGAGGCTGAGGCAGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,76;MMQ=60,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41494453_C_A:41494453:0,0,0,1
chr1	41503113	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=98,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:5,7,1,1
chr1	41540789	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=142,159;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:2,1,1,0
chr1	41540816	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=143,100;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:11,1,2,0
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:4,2:4,6:0|1:41540853_A_T:41540853:5,4,4,4
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:4,2:6,8:0|1:41540853_A_T:41540853:6,4,4,6
chr1	41540947	.	TGGATGGGGCAGAGATG	T	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=106,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:14,0:13,2:13,18,1,1
chr1	41540984	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:9,2:10,13,1,1
chr1	41848024	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41848024_C_T:41848024:0,0,1,0
chr1	41848037	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41848024_C_T:41848024:0,0,1,0
chr1	41848060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41848024_C_T:41848024:0,0,1,0
chr1	41848296	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	41976043	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,6:1,0:3,0,6,0
chr1	41978566	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr1	42046238	.	AC	GT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:42046238_AC_GT:42046238:5,4,1,1
chr1	42046241	.	G	GTTTCTTTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:42046238_AC_GT:42046238:4,5,1,1
chr1	42046242	.	G	GCTCTGTA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,1:0|1:42046238_AC_GT:42046238:4,5,1,1
chr1	42046812	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,4:0,0,8,8
chr1	42046882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=86,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:3,4,0,2
chr1	42048929	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,1,0
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	42645532	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:1,7,0,2
chr1	42656959	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,4:9,0:15,5,4,0
chr1	42664923	.	GACAATTGAATATAAGGGTACTTCTTAAGCAACTCTGCAAAAAT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=147,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.343:4:3,0:0,1:0|1:42664923_GACAATTGAATATAAGGGTACTTCTTAAGCAACTCTGCAAAAAT_G:42664923:0,3,0,1
chr1	42664951	.	G	GTCGCACCATCGTAAGTCAGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:42664923_GACAATTGAATATAAGGGTACTTCTTAAGCAACTCTGCAAAAAT_G:42664923:0,0,0,1
chr1	42664954	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:42664923_GACAATTGAATATAAGGGTACTTCTTAAGCAACTCTGCAAAAAT_G:42664923:0,0,0,1
chr1	42664957	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:42664923_GACAATTGAATATAAGGGTACTTCTTAAGCAACTCTGCAAAAAT_G:42664923:0,0,0,1
chr1	42846786	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	42901082	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	42901156	.	A	ATCACTATCAAGTCCTCTCACAGGCTCACAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	42925688	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,354;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43002199	.	AAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.290:13:2,1:3,3:6,3,1,3
chr1	43002347	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	43002358	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr1	43166767	.	C	CAATTCTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:43166767_C_CAATTCTGT:43166767:0,3,0,1
chr1	43166771	.	T	TCCCGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43166767_C_CAATTCTGT:43166767:0,3,0,1
chr1	43201534	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,4,2
chr1	43212431	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,2:0,13:0,0,8,7
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,1:0,0,2,6
chr1	43216056	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43216056_GGC_G:43216056:1,1,0,1
chr1	43216059	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:43216056_GGC_G:43216056:1,1,0,1
chr1	43216069	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43216056_GGC_G:43216056:0,0,0,1
chr1	43223649	.	A	ACATGCCCTTGGAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=169,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	43225033	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:43225033_T_G:43225033:0,4,1,1
chr1	43225036	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=151,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:43225033_T_G:43225033:0,4,1,1
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	43259467	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	43263687	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:2,2:0,0:4,0,2,0
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43395458	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:3,5,1,1
chr1	43611005	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:4,5:1,3:3,2,3,5
chr1	43613773	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0|1:43613773_G_A:43613773:0,1,0,2
chr1	43613786	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,23;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:43613773_G_A:43613773:0,1,0,2
chr1	43632815	.	TT	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:2,3:2,1,2,1
chr1	43632998	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:43632998_C_G:43632998:0,1,0,1
chr1	43632999	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43632998_C_G:43632998:0,1,0,1
chr1	43633004	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:43633004_T_TCC:43633004:0,0,0,1
chr1	43633007	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43633004_T_TCC:43633004:0,0,0,1
chr1	43633009	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43633004_T_TCC:43633004:0,0,0,1
chr1	43634593	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,0:4,3:6,1,0,3
chr1	43637050	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=699,99;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:43637050_C_T:43637050:1,0,0,1
chr1	43637058	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,99;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43637050_C_T:43637050:0,0,0,1
chr1	43637078	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=0,99;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43637078_A_C:43637078:1,0,0,1
chr1	43637079	.	C	CAGCGAGAGATGAGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=0,99;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43637078_A_C:43637078:1,0,0,1
chr1	43637081	.	A	ATGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=0,99;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43637078_A_C:43637078:1,0,0,1
chr1	43637082	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=0,99;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43637078_A_C:43637078:1,0,0,1
chr1	43637932	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:3,1,2,1
chr1	43638175	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:43638175_T_TCC:43638175:0,1,0,1
chr1	43638176	.	A	AGGGGGCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43638175_T_TCC:43638175:0,1,0,1
chr1	43638334	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	43638410	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:3,3:7,0,2,2
chr1	43651040	.	GA	AC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=82,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:3,7,0,2
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,5,13
chr1	43652563	.	A	ATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:43652563_A_ATTT:43652563:1,3,1,1
chr1	43652564	.	G	GATCATTCTGGTAGGGTCCGTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:43652563_A_ATTT:43652563:1,3,1,1
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr1	43664324	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:43664324_A_AG:43664324:1,3,0,1
chr1	43664326	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:43664324_A_AG:43664324:1,3,0,1
chr1	43664330	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:43664324_A_AG:43664324:0,4,0,1
chr1	43664332	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:43664324_A_AG:43664324:0,4,0,1
chr1	43672498	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:8,5,1,1
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr1	43687907	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,39;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:14,0:11,14,1,1
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	43700116	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:4,3,0,2
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	43739747	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43739760	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:6,4:3,3:4,6,4,3
chr1	43771090	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr1	43774815	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=154,106;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:43774815_T_A:43774815:0,4,1,0
chr1	43774818	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,14;MFRL=154,106;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:43774815_T_A:43774815:0,4,1,0
chr1	43774836	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=122,106;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:43774815_T_A:43774815:0,4,1,0
chr1	43774843	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=122,106;MMQ=60,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:43774815_T_A:43774815:0,4,1,0
chr1	43774851	.	C	CTTACCAGTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=106,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43777833	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43777833_C_T:43777833:0,2,0,1
chr1	43777836	.	C	CAGTGGCCTCTTTCAGCCCAGCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43777833_C_T:43777833:0,2,0,1
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	43777863	.	G	GTATCTCCTTATCCTTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43777863_G_GTATCTCCTTATCCTTC:43777863:0,1,0,1
chr1	43777864	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43777863_G_GTATCTCCTTATCCTTC:43777863:0,1,0,1
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,2:2,1:2,1,3,1
chr1	43785121	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,29;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:5,5,1,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:2,2,3,2
chr1	43827799	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	43829918	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43829918_G_GCC:43829918:1,0,0,1
chr1	43829922	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43829918_G_GCC:43829918:1,0,0,1
chr1	43829926	.	GGATAAAGGCAGGATC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:43829918_G_GCC:43829918:1,0,0,1
chr1	43852186	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=92,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:2,1:4,1,3,0
chr1	43870054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=133,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:4,2:0,0:0|1:43870054_G_A:43870054:2,2,1,1
chr1	43870056	.	T	TAGCAATGTTGAACTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=133,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:3,1:0,0:0|1:43870054_G_A:43870054:2,2,1,1
chr1	43890538	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,9:1,0:1,1,5,4
chr1	43892526	.	T	TCCCACCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43892526_T_TCCCACCC:43892526:0,3,0,1
chr1	43892531	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:43892526_T_TCCCACCC:43892526:0,4,0,1
chr1	43892532	.	C	CATCAAGTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:43892526_T_TCCCACCC:43892526:0,4,0,1
chr1	43892838	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,91;MMQ=60,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:12,8,2,1
chr1	43895501	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	43895812	.	ACCCAGAGGCCCACCCAGACCCTCTTGAGTCTTGGTT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	43897496	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:1,2:3,2:2,2,3,2
chr1	43903242	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=74,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:2,1:0,4:0,2,1,5
chr1	43904316	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	43904844	.	C	CAGGGATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43904844_C_CAGGGATG:43904844:0,1,0,1
chr1	43904845	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:0,1:1,0:0|1:43904844_C_CAGGGATG:43904844:0,1,0,1
chr1	43907056	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:10,2:6,12,1,1
chr1	43907069	.	G	GCTAATTATAAAATGTCA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:4,2:4,9,1,1
chr1	43907100	.	A	AGAGACGATGACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,1:0,6:2,1,6,1
chr1	43913276	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43913276_A_T:43913276:1,0,0,1
chr1	43913284	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43913276_A_T:43913276:1,1,0,1
chr1	43913286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:43913276_A_T:43913276:1,1,0,1
chr1	43913428	.	TGCAGTAGGGAGACCAATGTTTTCTTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.401:18:10,4:1,3:4,7,3,4
chr1	43918152	.	G	GGCATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	43919198	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:1,10,0,2
chr1	44035300	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=100,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:44035300_G_T:44035300:3,3,1,1
chr1	44035302	.	C	CATATGTGCCACATTTT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=100,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:44035300_G_T:44035300:3,3,1,1
chr1	44035304	.	T	TTAATC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=100,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,1:0|1:44035300_G_T:44035300:3,3,1,1
chr1	44035327	.	C	CCCCCCAGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr1	44054536	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:44054536_C_G:44054536:2,5,1,1
chr1	44054539	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:44054536_C_G:44054536:2,6,1,1
chr1	44054541	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:44054536_C_G:44054536:2,6,1,1
chr1	44067857	.	G	GCTTTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:44067857_G_GCTTTTTC:44067857:0,1,0,1
chr1	44067859	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44067857_G_GCTTTTTC:44067857:0,1,0,1
chr1	44070691	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,1:3,2:1,4,1,2
chr1	44078381	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:13,2:3,4:9,7,5,1
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:5,11:6,1:8,3,7,5
chr1	44078427	.	T	TTGATGGAG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:9,0:9,10,0,3
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=89,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,0:0,4:2,0,2,2
chr1	44083507	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,2:3,4:5,4,3,3
chr1	44085766	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=85,141;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:9,3:10,0:10,10,3,0
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=87,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr1	44086310	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	44158016	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,37;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	44202125	.	G	GAAAATAAAAGCATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=166,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44202125_G_GAAAATAAAAGCATTT:44202125:0,2,0,1
chr1	44202128	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=166,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44202125_G_GAAAATAAAAGCATTT:44202125:0,2,0,1
chr1	44303786	.	C	CAAAAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,24;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:0,0,1,0
chr1	44303807	.	T	TAAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,15;MFRL=123,188;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:1,0,1,0
chr1	44303814	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=123,188;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:1,0,1,0
chr1	44303818	.	AGCTCC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=123,188;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:1,0,1,0
chr1	44303826	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,15;MFRL=123,188;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:1,0,1,0
chr1	44303828	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,15;MFRL=123,188;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:44303786_C_CAAAAAAAA:44303786:1,0,1,0
chr1	44360190	.	CCG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44360190_CCG_C:44360190:0,1,0,1
chr1	44360193	.	A	AAACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44360190_CCG_C:44360190:0,1,0,1
chr1	44363962	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	44395882	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=98,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:44395882_A_AAT:44395882:1,0,1,1
chr1	44395884	.	T	TCCTAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=98,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:44395882_A_AAT:44395882:1,0,1,1
chr1	44395888	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=98,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:1,1:0,0:0|1:44395882_A_AAT:44395882:1,0,1,1
chr1	44423033	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr1	44423922	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=51,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:3,4,1,3
chr1	44426054	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=94,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:1,2,1,4
chr1	44426984	.	G	GGCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr1	44433444	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44433444_T_TTC:44433444:0,0,0,1
chr1	44433448	.	G	GGGCTTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44433444_T_TTC:44433444:0,0,0,1
chr1	44441694	.	GG	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,0,1
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	44466606	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,5:8,4:6,6,3,6
chr1	44474372	.	CT	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=46,133;MMQ=48,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44474372_CT_TG:44474372:1,1,0,1
chr1	44474377	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=46,133;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44474372_CT_TG:44474372:1,1,0,1
chr1	44475586	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:5,2,2,3
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=132,1216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr1	44595047	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr1	44596368	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,0:0|1:44596368_A_C:44596368:4,3,2,0
chr1	44596370	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:44596368_A_C:44596368:4,3,2,0
chr1	44596491	.	CGG	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	44596500	.	ACT	CTT,A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,30,28;MFRL=132,144,152;MMQ=60,60,24;MPOS=4,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.256:5:3,1,0:0,0,1:0,3,0,2
chr1	44596518	.	G	GTCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.349:21:5,5:8,2:8,6,0,7
chr1	44685664	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	44750514	.	A	ACCCATACATATATTGTGTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr1	44878224	.	A	AACAATGCATGGAAATAGTGAGATTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=100,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr1	45097895	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.229:33:17,7:8,0:0|1:45097895_G_A:45097895:16,10,5,2
chr1	45097905	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=116,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:16,6:9,0:0|1:45097895_G_A:45097895:17,8,5,2
chr1	45102035	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:45102035_G_A:45102035:2,1,1,1
chr1	45102040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:45102035_G_A:45102035:2,1,1,1
chr1	45111181	.	GA	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=89,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:45111181_GA_TG:45111181:2,2,1,1
chr1	45111184	.	C	CATTGTCCAGTCTAGGCTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=89,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:45111181_GA_TG:45111181:2,2,1,1
chr1	45111259	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr1	45116527	.	AC	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45116527_AC_TG:45116527:0,0,0,1
chr1	45116530	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:45116527_AC_TG:45116527:0,0,0,1
chr1	45120135	.	C	CACGAAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,820;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	45155641	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=182,137;MMQ=50,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45155641_C_T:45155641:0,2,0,1
chr1	45155656	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=182,137;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45155641_C_T:45155641:0,2,0,1
chr1	45155658	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=211,145;MMQ=40,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	45155661	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,24;MFRL=182,137;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45155641_C_T:45155641:0,2,0,1
chr1	45155662	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=174,153;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	45155664	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=182,137;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:45155641_C_T:45155641:0,2,0,1
chr1	45155666	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=211,137;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45155641_C_T:45155641:0,1,0,1
chr1	45190959	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:3,8,5,0
chr1	45205598	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,5:3,3:8,3,6,2
chr1	45216216	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:3,3,0,2
chr1	45218806	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.195:17:4,3:10,0:7,7,1,2
chr1	45225973	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:4,5,2,0
chr1	45226169	.	C	CAGGAACAACTGAGGTCCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr1	45266832	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,1,2
chr1	45268356	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr1	45270464	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:4,0:1,2:1,4,2,1
chr1	45271097	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:2,5,2,3
chr1	45291908	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	45294156	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,2,2
chr1	45297753	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr1	45307506	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chr1	45340282	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:2,0:3,3:4,1,2,1
chr1	45341439	.	ACCTCTCCCACTCCCCCTCCCCACGGTCTCCCTCTC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,4:3,0:2,1,2,2
chr1	45407411	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=210,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45407411_AG_A:45407411:0,1,0,1
chr1	45407414	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=210,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:45407411_AG_A:45407411:0,1,0,1
chr1	45443894	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	45444038	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,3,2
chr1	45470392	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=123,74;MMQ=60,33;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:5,3,1,2
chr1	45471362	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	45472823	.	T	TTTAGTAGAGACG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	45474008	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:5,6,1,2
chr1	45474750	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=63,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:0|1:45474750_A_T:45474750:1,1,3,1
chr1	45474755	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=63,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:45474750_A_T:45474750:1,1,3,1
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	45476061	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:45476061_C_A:45476061:0,0,1,0
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45476061_C_A:45476061:0,0,1,0
chr1	45479772	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=86,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.686:27:4,12:4,5:0,8,6,13
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,8:0,0,1,11
chr1	45484984	.	C	CCACCACGCCCAGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr1	45502026	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=66,151;MMQ=56,53;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:0,1:1,0:0,2,0,3
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	45796985	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	45797310	.	C	CGACAGGCTCCCTGAGGCTAAGAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,604;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	45797489	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45797489_G_A:45797489:0,2,0,1
chr1	45797492	.	G	GCATTCCAGTGAGTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45797489_G_A:45797489:0,2,0,1
chr1	45797494	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45797489_G_A:45797489:0,2,0,1
chr1	45798435	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=110,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	45798449	.	C	CACCGTAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:1,0:0|1:45798449_C_CACCGTAA:45798449:1,1,0,1
chr1	45798451	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:45798449_C_CACCGTAA:45798449:1,1,0,1
chr1	45798454	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=103,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45798449_C_CACCGTAA:45798449:1,1,0,1
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	45798652	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45798652_A_C:45798652:0,0,0,1
chr1	45798657	.	G	GCCAAACTCCGTCCCCCCACCTCCCCGCGCACATAATAACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=119,173;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.663:2:0,0:0,1:0|1:45798652_A_C:45798652:1,0,0,1
chr1	45800135	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:45800135_G_A:45800135:8,6,1,1
chr1	45800140	.	C	CTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:45800135_G_A:45800135:8,6,1,1
chr1	45800156	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,2:2,7:3,2,5,4
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,7,17
chr1	45805731	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45805731_A_C:45805731:0,1,0,1
chr1	45805735	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:45805731_A_C:45805731:0,1,0,1
chr1	45805740	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45805731_A_C:45805731:0,0,0,1
chr1	45810865	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr1	45923195	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	45923447	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:1,9,0,2
chr1	45965307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:0,3:0,3,1,4
chr1	45965340	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=177,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr1	45973928	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:1,4:3,7:2,2,7,5
chr1	45981258	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=141,167;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:5,0,4,0
chr1	45981512	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=76,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,1,2
chr1	46065998	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,14,5
chr1	46073489	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=154,156;MMQ=60,46;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,1:2,2:1,6,0,3
chr1	46074049	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46074049_T_TCA:46074049:0,1,0,1
chr1	46074050	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46074049_T_TCA:46074049:0,1,0,1
chr1	46079004	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=116,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	46079010	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=53,172;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:46079010_TGG_T:46079010:0,2,0,1
chr1	46079016	.	GAT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=53,172;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:46079010_TGG_T:46079010:0,2,0,1
chr1	46079020	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46079010_TGG_T:46079010:0,1,0,1
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,3,4
chr1	46082137	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=166,153;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr1	46082153	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=164,160;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	46082155	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=166,156;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:46082155_G_A:46082155:0,4,0,1
chr1	46082157	.	AA	TG,CG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,25,28;MFRL=171,160,111;MMQ=60,60,40;MPOS=2,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.248,0.248:5:2,1,0:1,0,1:0,3,0,2
chr1	46082158	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=178,156;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:0|1:46082155_G_A:46082155:0,2,0,1
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	46083706	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:4,5,5,4
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	46086329	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,2,0
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	46088174	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46088174_T_TA:46088174:1,0,0,1
chr1	46088176	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46088174_T_TA:46088174:1,0,0,1
chr1	46089149	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46089149_G_A:46089149:0,1,0,1
chr1	46089150	.	A	AAATGTAAAGGTTAAGCACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46089149_G_A:46089149:0,1,0,1
chr1	46099183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=111,804;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:0,0:6,2:3,3,2,0
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,4:7,5:3,7,3,6
chr1	46124683	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,2:12,0:5,13,1,1
chr1	46207055	.	C	CACTATCTTGCAGAGGCAGAAAGGCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46207055_C_CACTATCTTGCAGAGGCAGAAAGGCAT:46207055:0,1,0,1
chr1	46207059	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46207055_C_CACTATCTTGCAGAGGCAGAAAGGCAT:46207055:0,1,0,1
chr1	46295070	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=93,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,148;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	46463570	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	46468616	.	T	TTGC	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.294:9:3,0:3,2:0|1:46468616_T_TTGC:46468616:2,5,1,1
chr1	46468617	.	A	AAG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:46468616_T_TTGC:46468616:2,4,1,1
chr1	46468619	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:46468616_T_TTGC:46468616:2,4,1,1
chr1	46468622	.	G	GTGTGCTGTGGGACAGAGCCTGGGGTCCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=117,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:46468616_T_TTGC:46468616:1,2,1,1
chr1	46468660	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46487552	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0|1:46487552_G_A:46487552:2,0,2,1
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0|1:46487552_G_A:46487552:0,0,5,1
chr1	46491348	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=103,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:46491348_G_A:46491348:4,4,1,1
chr1	46491352	.	G	GACTCCAGCAGCTGTGTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=103,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:6,2:0|1:46491348_G_A:46491348:4,4,1,1
chr1	46495296	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	46498375	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr1	46500613	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,80;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,1,4
chr1	46500645	.	C	CCAAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr1	46521517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,4,4
chr1	46521559	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr1	46527808	.	C	CATCCAGTACTTAGGGCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46532600	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=142,881;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:6,6,3,0
chr1	46650118	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr1	46656019	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=158,170;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:46656019_AG_A:46656019:3,0,1,0
chr1	46656023	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,170;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:46656019_AG_A:46656019:3,0,1,0
chr1	46658293	.	A	AGGG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=236,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=G;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:0|1:46658293_A_AGGG:46658293:0,2,1,1
chr1	46658297	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=236,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:46658293_A_AGGG:46658293:0,2,1,1
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46658328_A_G:46658328:0,0,0,1
chr1	46658343	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46658328_A_G:46658328:0,0,0,1
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=107,99665903;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr1	46659210	.	CG	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=100,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	46660113	.	G	GGCTGGTCTCGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	46660295	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:5,7,4,3
chr1	46662839	.	A	ATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46662839_A_ATC:46662839:0,0,0,1
chr1	46662840	.	G	GCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46662839_A_ATC:46662839:0,0,0,1
chr1	46685861	.	AG	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:46685861_AG_CT:46685861:2,3,1,1
chr1	46685864	.	A	AAGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:46685861_AG_CT:46685861:2,3,1,1
chr1	46715860	.	C	CCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:46715860_C_CCATT:46715860:0,0,0,1
chr1	46715864	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46715860_C_CCATT:46715860:0,0,0,1
chr1	46739001	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	46739988	.	T	TGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGCCTAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=120,138;MMQ=58,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0,2,0,2
chr1	46739990	.	A	AACAGGGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=131,109;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:1,1:0,0:0|1:46739990_A_AACAGGGTCTC:46739990:0,1,0,1
chr1	46739993	.	C	CTATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=131,109;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46739990_A_AACAGGGTCTC:46739990:0,1,0,1
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:2,2,5,2
chr1	46826550	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	46827561	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46827561_G_A:46827561:0,0,0,1
chr1	46827565	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46827561_G_A:46827561:0,0,0,1
chr1	46877874	.	CC	GG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=170,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:46877874_CC_GG:46877874:1,4,1,1
chr1	46877876	.	C	CTTGACTGAACTGGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=170,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:46877874_CC_GG:46877874:1,4,1,1
chr1	46877881	.	C	CAGCTCCGCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=170,224;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	46976618	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=67,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAG;STR;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.970:31:1,9:0,20:0,1,17,13
chr1	47015023	.	G	GTC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=96,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,2,0,1
chr1	47015024	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,3,0,1
chr1	47015029	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,3,0,1
chr1	47015033	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,3,0,1
chr1	47015037	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,3,0,1
chr1	47015039	.	C	CAGTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,0:1,1:0|1:47015023_G_GTC:47015023:0,2,0,1
chr1	47024529	.	C	CTTGACTACATGGTGACATTCAGACTTCATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	47028536	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:47028536_G_A:47028536:1,2,0,1
chr1	47028540	.	GGG	CCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47028536_G_A:47028536:1,2,0,1
chr1	47028546	.	ATGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:47028536_G_A:47028536:1,3,0,1
chr1	47028555	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=203,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:47028536_G_A:47028536:0,3,0,1
chr1	47037938	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,124;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47037938_A_G:47037938:0,1,0,1
chr1	47037940	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=182,124;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47037938_A_G:47037938:0,1,0,1
chr1	47040780	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47040780_T_C:47040780:0,1,0,1
chr1	47040782	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47040780_T_C:47040780:0,1,0,1
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	47123804	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=101,79;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:21,0:25,4:16,30,0,4
chr1	47123812	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=106,99;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.137:41:18,0:18,5:15,21,0,5
chr1	47138945	.	A	AAGCCAATAAACTCCATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	47155218	.	GCACTGTGGTCACAGGGAGTTAAGCCAGAGATAAAAAGCACCTGTTTCAAATTCT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.123:23:4,1:4,0:14,7,1,1
chr1	47276728	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	47276884	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=97,149;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,10:2,3:2,2,2,11
chr1	47279496	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	47279558	.	CCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=131,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCT;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	47280859	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:3,0,2,1
chr1	47282632	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47282632_G_GCA:47282632:1,0,1,0
chr1	47282634	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47282632_G_GCA:47282632:1,0,1,0
chr1	47282915	.	T	TGCATGTGTGTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=79,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47282915_T_TGCATGTGTGTCA:47282915:1,0,0,1
chr1	47282919	.	T	TATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=79,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47282915_T_TGCATGTGTGTCA:47282915:1,0,0,1
chr1	47284572	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,667;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	47395726	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:4,1,3,0
chr1	47399884	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,11;MFRL=152,155;MMQ=57,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0,3,1,0
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	47400628	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47489708	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:2,2,0,1
chr1	47495592	.	TCAGCTTGTGTCTATAAGAGGGGACAGGTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:5,3:7,0:16,7,1,2
chr1	47495822	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr1	47496983	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47504289	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:47504289_C_T:47504289:3,0,1,0
chr1	47504298	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:47504289_C_T:47504289:3,0,1,0
chr1	47515596	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	47515625	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	47533292	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:5,2:14,0:12,7,1,1
chr1	47548035	.	A	ATTGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=151,159;MMQ=27,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47548035_A_ATTGTT:47548035:1,1,0,1
chr1	47548036	.	A	AGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=151,159;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47548035_A_ATTGTT:47548035:1,1,0,1
chr1	47571902	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=20,27;MFRL=97,152;MMQ=27,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.898:17:0,10:1,6:0|1:47571902_C_T:47571902:1,0,4,12
chr1	47571905	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=20,28;MFRL=97,152;MMQ=27,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,9:1,5:0|1:47571902_C_T:47571902:1,0,4,12
chr1	47571943	.	CTTT	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,9:0,5:0,0,2,13
chr1	47571996	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:47571996_T_C:47571996:0,0,1,3
chr1	47572013	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,21565;MMQ=60,30;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47571996_T_C:47571996:0,0,1,0
chr1	47572022	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,51;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47581122	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	47581139	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:3,0:3,3:7,1,3,0
chr1	47582242	.	ATTTCGT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr1	47582292	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,11,16
chr1	47583415	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	47603280	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,71;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,1:10,1:5,8,1,1
chr1	47607762	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	47607785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	47609407	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr1	47610436	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,37;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr1	47610574	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,130;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,9:0,0:2,1,2,7
chr1	47614185	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	47689768	.	C	CAACAATAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:47689768_C_CAACAATAT:47689768:1,4,1,1
chr1	47689770	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:47689768_C_CAACAATAT:47689768:1,4,1,1
chr1	47689771	.	C	CAATGAAATAAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:47689768_C_CAACAATAT:47689768:1,4,1,1
chr1	47726087	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,10:6,1:8,7,5,6
chr1	47735278	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=176,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,3,1
chr1	47737729	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,5:0,3:1,0,7,1
chr1	47765490	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	47767828	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	47768002	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:11,0:8,4:4,15,0,4
chr1	47770466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=350,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	47770806	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	47904370	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,136;MMQ=52,54;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:6,3,1,1
chr1	47905782	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	48688376	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=65,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,2:0,5:1,1,5,2
chr1	48690480	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:4,1:0|1:48690480_T_A:48690480:2,3,0,1
chr1	48690483	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:1,0:4,1:0|1:48690480_T_A:48690480:2,3,0,1
chr1	48690484	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:1,0:4,1:0|1:48690480_T_A:48690480:2,3,0,1
chr1	48690488	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=85,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:2,6,0,2
chr1	48694622	.	G	GATCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48694622_G_GATCT:48694622:0,1,0,1
chr1	48694625	.	A	ATGAATCTGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=104,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48694622_G_GATCT:48694622:0,1,0,1
chr1	48696362	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=99,52;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr1	48697794	.	C	CAAGCAGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr1	48764419	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,10:6,1:7,2,5,6
chr1	48821318	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=74,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:4,4:2,3:3,3,5,2
chr1	48999965	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,112;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:2,8,0,2
chr1	49000066	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	49052916	.	C	CAAAAACTCTGCTTGCTTCTGTCATTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	49511233	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,7:1,0:2,0,7,0
chr1	50574969	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50574969_C_CTT:50574969:0,1,0,1
chr1	50574973	.	GCT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:50574969_C_CTT:50574969:0,1,0,1
chr1	50574985	.	TTCCTAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=205,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	50575675	.	CTGTG	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=TG;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:4,1:4,6,2,1
chr1	50659504	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=123,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:11,3:11,8,3,0
chr1	50661411	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr1	51049418	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=139,102;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:6,4:1,16,0,4
chr1	51210284	.	CAATTTTTACATATCATTTAATCAATGGCATAACTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=142,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.348:4:0,0:0,1:3,0,1,0
chr1	51210401	.	GGA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=128,129;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:1,0:3,6,2,0
chr1	51210406	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=128,129;MMQ=60,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:3,6,2,0
chr1	51584404	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,166;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:20,2:7,1:16,11,3,0
chr1	51753812	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,5:0,1:0,1,5,2
chr1	51760222	.	G	GCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51760222_G_GCAA:51760222:0,1,0,1
chr1	51760225	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51760222_G_GCAA:51760222:0,1,0,1
chr1	51760227	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51760222_G_GCAA:51760222:0,1,0,1
chr1	51767459	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51767459_TG_T:51767459:0,0,0,1
chr1	51767469	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51767459_TG_T:51767459:0,1,0,1
chr1	51767474	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51767459_TG_T:51767459:0,1,0,1
chr1	51768225	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=131,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:7,4:13,0:5,16,2,2
chr1	51775082	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=188,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	51777074	.	C	CTGACCCTTGGATTCCGACCATTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	51831752	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=112,123;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:51831752_T_A:51831752:0,4,0,1
chr1	51831770	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:51831770_A_G:51831770:0,3,0,1
chr1	51831774	.	T	TCTTGCCCAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=131,123;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:51831752_T_A:51831752:0,3,0,1
chr1	51831775	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:51831770_A_G:51831770:0,3,0,1
chr1	51831777	.	CCACCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:51831770_A_G:51831770:0,3,0,1
chr1	51831784	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=200,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51831770_A_G:51831770:0,1,0,1
chr1	51868155	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:19,0:24,2:0|1:51868155_C_T:51868155:21,23,1,1
chr1	51868160	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:19,0:24,2:0|1:51868155_C_T:51868155:22,23,1,1
chr1	51869276	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51869276_C_A:51869276:0,1,0,1
chr1	51869281	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51869276_C_A:51869276:0,1,0,1
chr1	51912828	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51912828_A_C:51912828:0,2,0,1
chr1	51912832	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51912828_A_C:51912828:0,2,0,1
chr1	51912833	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51912828_A_C:51912828:0,2,0,1
chr1	51926768	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,0:10,4:13,6,1,3
chr1	51929309	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=194,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr1	52179818	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:2,2:5,1:2,6,0,3
chr1	52237925	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:0,5,1,2
chr1	52242432	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:0,0:0,1:0,3,1,0
chr1	52252335	.	TTT	CCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	52252345	.	C	CTGGAGTGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=116,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	52256634	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,0:5,3:7,9,2,1
chr1	52257716	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:6,0:1,2:3,4,0,2
chr1	52266242	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=102,125;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:1,5:5,3:3,3,6,2
chr1	52272413	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,6:6,3:6,5,8,1
chr1	52275138	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr1	52285512	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:7,5,1,1
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,12:0,11:0,0,6,17
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=101,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.755:14:1,4:2,6:0,3,3,8
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	52442854	.	C	CAAAGCACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52442854_C_CAAAGCACA:52442854:1,1,0,1
chr1	52442856	.	A	AGTCCAGAGATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52442854_C_CAAAGCACA:52442854:1,1,0,1
chr1	52498841	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=132,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,4:2,8:3,2,9,3
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,7,2
chr1	52518262	.	C	CTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=42,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	52518284	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=50,42;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:52518284_A_T:52518284:0,1,1,1
chr1	52518289	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=50,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:52518284_A_T:52518284:0,1,1,1
chr1	52729359	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	52740092	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:9,3,2,0
chr1	52740341	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=108,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52740341_G_C:52740341:0,1,0,1
chr1	52740342	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=108,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52740341_G_C:52740341:0,1,0,1
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr1	52822818	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=168,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr1	52822851	.	CAAGTCCAACAAAGGCAGGAGCCCAAACTAAGTAATTCTTCAGCTTCTACTA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=191,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.571:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	52824328	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	52825953	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825953_G_A:52825953:0,0,0,1
chr1	52825955	.	CC	AG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825953_G_A:52825953:0,0,0,1
chr1	52825959	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825953_G_A:52825953:0,0,0,1
chr1	52825962	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825953_G_A:52825953:0,0,0,1
chr1	52825964	.	AAGACAG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825953_G_A:52825953:0,0,0,1
chr1	52828369	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:0,1:4,0:2,2,1,0
chr1	52830236	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:6,5,0,2
chr1	52839052	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	52851704	.	A	ACAAGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	52854961	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,4:3,7:3,2,8,4
chr1	52897009	.	CCTGCTGAGGTGGGCCAAGCTTAGGTTGGGATCCTGGCTGAGA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.120:26:13,2:5,0:13,9,1,3
chr1	52902548	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,1:2,1:6,5,1,1
chr1	52911553	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:8,0:0|1:52911553_A_G:52911553:12,11,2,0
chr1	52911558	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.165:27:14,4:9,0:0|1:52911553_A_G:52911553:12,11,2,2
chr1	52912157	.	A	ATGTTTTGCCATGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chr1	52926946	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	52937651	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:6,6,2,0
chr1	52937691	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:0|1:52937691_T_TTG:52937691:6,6,1,1
chr1	52937693	.	A	ATAGATACCCAAGCACAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0|1:52937691_T_TTG:52937691:6,6,1,1
chr1	52947433	.	C	CTA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,0:3,2:7,1,1,1
chr1	52947610	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,348;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,3:14,0:9,12,0,3
chr1	52959245	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.254:18:6,1:5,3:12,2,3,1
chr1	52991430	.	TCTTCTGTCTCATGTCTTTCAACAGTAAACTGGGTCCCTTTTCTG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.108:27:7,2:8,0:9,16,1,1
chr1	53072454	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr1	53222053	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	53245472	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	53267474	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,137;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.255:6:2,1:2,0:4,1,1,0
chr1	53267885	.	C	CTGAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:3,8,0,2
chr1	53351598	.	T	TC	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=125,92;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:25,0:11,3:14,22,0,3
chr1	53351640	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:9,4:3,0:0|1:53351640_A_T:53351640:1,11,0,4
chr1	53351643	.	CG	TC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:8,1:3,0:0|1:53351640_A_T:53351640:1,11,0,3
chr1	53370461	.	T	TAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	53393125	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:53393125_T_C:53393125:1,4,1,1
chr1	53393127	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:53393125_T_C:53393125:1,4,1,1
chr1	53407406	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,153;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.293:12:2,2:6,1:7,2,3,0
chr1	53504540	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=98,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,4:1,0:0|1:53504540_A_G:53504540:5,0,4,0
chr1	53504546	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=107,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:0|1:53504540_A_G:53504540:6,0,4,0
chr1	53516411	.	GAGATATAT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=299,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGATATAT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	53527921	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=130,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:3,4,0,2
chr1	53540401	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	53544432	.	C	CATCTTAGGAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	53546605	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:53546605_C_CTA:53546605:1,1,0,1
chr1	53546606	.	G	GTTCCTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:53546605_C_CTA:53546605:1,1,0,1
chr1	53546608	.	G	GAGATATCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:53546605_C_CTA:53546605:1,1,0,1
chr1	53547788	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,2:7,8,1,3
chr1	53554608	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:3,1,1,0
chr1	53555621	.	A	AGCTGCCTGAGGCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=166,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr1	53556207	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	53559310	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	53600149	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=92,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:53600149_A_T:53600149:0,3,0,1
chr1	53600153	.	T	TCTATA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=92,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:53600149_A_T:53600149:0,3,0,1
chr1	53600211	.	A	AGGCCTCAAAGCGGTCCAAATCTCCAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53676181	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53676181_G_A:53676181:0,0,0,1
chr1	53676185	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53676181_G_A:53676181:0,0,0,1
chr1	53676187	.	A	ATATTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53676181_G_A:53676181:0,0,0,1
chr1	53684086	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr1	53684523	.	G	GGAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:0|1:53684523_G_GGAA:53684523:10,3,1,1
chr1	53684525	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0|1:53684523_G_GGAA:53684523:0,0,11,4
chr1	53723188	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:53723188_AG_A:53723188:0,1,0,1
chr1	53723194	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53723188_AG_A:53723188:0,1,0,1
chr1	53726340	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	53726345	.	G	GTAAAACTGTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	53727979	.	A	AAGCTTGAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53732411	.	C	CGATTATGGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53930447	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=61,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:53930447_C_T:53930447:1,1,0,1
chr1	53930449	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=9,31;MFRL=61,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:53930447_C_T:53930447:1,1,0,1
chr1	53930551	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0|1:53930551_G_A:53930551:2,0,1,1
chr1	53930569	.	CTGGAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:53930551_G_A:53930551:0,4,0,1
chr1	53930575	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:53930551_G_A:53930551:0,4,0,1
chr1	53972205	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	53980276	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	54238235	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=150,172;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54238235_A_G:54238235:0,1,0,1
chr1	54238237	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=150,172;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54238235_A_G:54238235:0,1,0,1
chr1	54238248	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:54238235_A_G:54238235:0,0,0,2
chr1	54238257	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=172,150;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:54238235_A_G:54238235:0,1,0,1
chr1	54238261	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:54238235_A_G:54238235:0,0,0,2
chr1	54269524	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:1,3:12,0:11,2,3,0
chr1	54272249	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54272249_A_AC:54272249:0,1,0,1
chr1	54272251	.	G	GCCAAACACATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54272249_A_AC:54272249:0,1,0,1
chr1	54344282	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	54359870	.	CTGGCTTTGCCGAGATGGGGCTGCCCCAGCCAGGGCTGTGGCTGAAGAGGCTCTGGGTGCTCTTGGAGG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=143,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.304:6:0,0:0,1:2,2,2,0
chr1	54370306	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,20:0,4:0,0,15,9
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chr1	54372044	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:54372038_TTTGC_T:54372038:0,1,0,1
chr1	54375570	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	54395673	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.492:8:3,3:0,1:4,0,4,0
chr1	54395818	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,2:8,0:0|1:54395818_C_T:54395818:6,16,1,1
chr1	54395830	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:11,2:5,0:0|1:54395818_C_T:54395818:5,13,1,1
chr1	54395831	.	T	TGCCTC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,1:5,0:0|1:54395818_C_T:54395818:4,12,1,1
chr1	54427772	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:13,2:3,0:8,9,2,0
chr1	54433378	.	C	CCTTCAATTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:54433378_C_CCTTCAATTTT:54433378:3,0,0,1
chr1	54433383	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:54433378_C_CCTTCAATTTT:54433378:3,0,0,1
chr1	54483171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:54483171_G_A:54483171:2,2,0,1
chr1	54483193	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54483171_G_A:54483171:0,2,0,1
chr1	54514223	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	54518582	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,2:4,0:6,0,2,0
chr1	54562150	.	G	GGGACTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	54605171	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,4:0,0,6,6
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr1	54610099	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	54610171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:2,1,1,1
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	54653476	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=155,167;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,0:1,0:0|1:54653476_C_T:54653476:2,3,0,1
chr1	54653499	.	CA	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=176,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:54653476_C_T:54653476:0,2,0,1
chr1	54653519	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	54666313	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	54681920	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=98,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:9,2:1,3:6,4,4,1
chr1	54686374	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=109,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,2:3,5:2,5,3,5
chr1	54692859	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	54694391	.	TGGG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:1,0:7,3,1,1
chr1	54704462	.	C	CCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr1	54706733	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	54707955	.	G	GTGAGCTACTGTCCCTGGGTGTAGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr1	54871566	.	ACCGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGC;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CGC;STR;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.917:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	55014099	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr1	55051601	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=92,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:4,3,1,1
chr1	55058160	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=62,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr1	55063126	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55063126_T_C:55063126:0,1,0,1
chr1	55063127	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55063126_T_C:55063126:0,1,0,1
chr1	55063130	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55063126_T_C:55063126:0,1,0,1
chr1	55063133	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55063126_T_C:55063126:0,1,0,1
chr1	55069986	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55070649	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr1	55080612	.	G	GGTGTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=GT;STR;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.773:7:0,4:1,2:0|1:55080612_G_GGTGTGT:55080612:0,1,1,5
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0|1:55080612_G_GGTGTGT:55080612:0,0,1,6
chr1	55081773	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=78,65;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:9,0:11,8,2,1
chr1	55085499	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,0:2,5:3,1,4,1
chr1	55089065	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,66;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:0|1:55089065_C_T:55089065:2,4,1,1
chr1	55089078	.	C	CTCTTGCTCCTGCTCCTGCCATGTGACATGCCTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,66;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:0|1:55089065_C_T:55089065:2,4,1,1
chr1	55096437	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=103,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:11,0:8,4:15,4,2,2
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=212,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,5,2
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	55134487	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=93,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:1,2,3,0
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	55138673	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,104;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	55139912	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	55168272	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=131,91;MMQ=60,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:1,4,5,0
chr1	55168300	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=95,91;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,6:5,0:0|1:55168300_G_A:55168300:2,5,5,1
chr1	55168307	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=109,91;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,5:6,0:0|1:55168300_G_A:55168300:3,5,5,1
chr1	55168509	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55168509_A_C:55168509:0,1,0,1
chr1	55168510	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55168509_A_C:55168509:0,1,0,1
chr1	55168513	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55168509_A_C:55168509:0,1,0,1
chr1	55224933	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55224933_C_T:55224933:0,0,0,1
chr1	55224939	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55224933_C_T:55224933:0,0,0,1
chr1	55224941	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55224933_C_T:55224933:0,0,0,1
chr1	55224942	.	A	ATTATTATAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55224933_C_T:55224933:0,0,0,1
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	55319008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	55319902	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:3,3,2,4
chr1	55319935	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr1	55446814	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55446814_T_A:55446814:0,2,1,1
chr1	55446816	.	C	CAGTCTGGAAGGCTGATGTTAGAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:55446814_T_A:55446814:0,2,1,1
chr1	55457663	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55457663_C_A:55457663:0,3,0,1
chr1	55457667	.	C	CCTCAAGTAGGACCCAGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:55457663_C_A:55457663:0,3,0,1
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	55473011	.	G	GAATGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	55473789	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55473853	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	55474325	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	55474356	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55474356_A_C:55474356:0,1,0,1
chr1	55474359	.	A	ATTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55474356_A_C:55474356:0,1,0,1
chr1	55474361	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55474356_A_C:55474356:0,1,0,1
chr1	55474363	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55474356_A_C:55474356:0,1,0,1
chr1	55505552	.	A	ACTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CTG;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:0,0:4,1:2,2,1,1
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	55518316	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=98,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,3:5,2:6,3,3,3
chr1	55518467	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,2:2,4:2,3,2,4
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=98,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:6,2,5,2
chr1	55524197	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:8,4,2,3
chr1	55527291	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55527291_TG_T:55527291:1,3,0,1
chr1	55527294	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=135,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55527291_TG_T:55527291:1,2,0,1
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	55534760	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	55537966	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:1,1,8,1
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr1	55538462	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:6,4,2,4
chr1	55551718	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=101,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:7,4:5,3:8,4,5,3
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.580:14:2,3:2,5:5,1,7,1
chr1	55565508	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=106,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:6,10,1,2
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=109,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:1,3:2,0,4,0
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,4:1,0:1,1,3,1
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	55620181	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:3,5,0,3
chr1	55638075	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,1:3,6:5,5,6,1
chr1	57157940	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,158;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:57157940_G_A:57157940:3,0,1,0
chr1	57157943	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=0,158;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:57157940_G_A:57157940:3,0,1,0
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr1	57189193	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	57189256	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chr1	57204444	.	T	TCCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57204444_T_TCCCTGC:57204444:0,0,0,1
chr1	57204451	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57204444_T_TCCCTGC:57204444:0,0,0,1
chr1	57206375	.	GTTTTCTTTCGACTTGGTTTTCTTTATTTTAAATCTATCC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.179:16:7,0:3,2:6,8,1,1
chr1	57221696	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=161,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57221696_AG_CC:57221696:0,3,0,1
chr1	57221698	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57221698_G_T:57221698:0,3,0,1
chr1	57221701	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57221698_G_T:57221698:0,3,0,1
chr1	57221702	.	A	AAAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=161,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:57221696_AG_CC:57221696:0,3,0,1
chr1	57221707	.	GCCTCA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:57221698_G_T:57221698:0,3,0,1
chr1	57221714	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57221698_G_T:57221698:0,1,0,1
chr1	57254764	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=113,269;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:10,3:10,15,3,0
chr1	57395020	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	57422484	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=87,45;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,1:5,0:0|1:57422484_C_T:57422484:5,5,1,1
chr1	57422494	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=96,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:57422484_C_T:57422484:7,5,1,1
chr1	57431689	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	57476485	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.347:7:4,1:1,1:3,2,0,2
chr1	57481172	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57481172_A_T:57481172:0,0,0,1
chr1	57481173	.	G	GAAATGGGCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57481172_A_T:57481172:0,0,0,1
chr1	57499312	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57499312_GT_G:57499312:0,1,0,1
chr1	57499320	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57499312_GT_G:57499312:0,0,0,1
chr1	57537327	.	G	GATAAGCAGTGTGAACAAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	57602272	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:5,0:1,4:3,4,0,4
chr1	58939502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	58971980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	58993085	.	A	AGGTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58993085_A_AGGTC:58993085:0,1,0,1
chr1	58993086	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58993085_A_AGGTC:58993085:0,1,0,1
chr1	58993088	.	A	ATTGCTAAGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58993085_A_AGGTC:58993085:0,1,0,1
chr1	58993091	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58993085_A_AGGTC:58993085:0,1,0,1
chr1	58993093	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58993085_A_AGGTC:58993085:0,1,0,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	59005025	.	A	AATAAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:59005025_A_AATAAGT:59005025:0,1,0,1
chr1	59005026	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=201,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:59005025_A_AATAAGT:59005025:0,1,0,1
chr1	59042434	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	59127193	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:0,4,3,4
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=109.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,14:0,14:0,0,18,13
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.559:12:3,4:2,3:3,2,0,7
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	59160735	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:59160735_A_G:59160735:0,0,4,0
chr1	59160742	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0|1:59160735_A_G:59160735:1,0,3,0
chr1	59160885	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	59160901	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=125,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0|1:59160901_G_A:59160901:0,5,1,1
chr1	59160909	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=129,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:59160901_G_A:59160901:0,4,0,1
chr1	59160982	.	ATACT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	59249901	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.203:24:7,4:10,0:6,13,4,1
chr1	59844332	.	CTTTTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	59844366	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:2,1:3,0:0|1:59844366_G_A:59844366:5,1,1,1
chr1	59844369	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:2,2:4,0:0|1:59844366_G_A:59844366:5,2,1,1
chr1	59978003	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr1	60019853	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:3,0:4,6:2,6,2,4
chr1	60107061	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	60139805	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,79;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.139:48:16,6:26,0:11,31,4,2
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr1	60280749	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	60309330	.	G	GATGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60309330_G_GATGCT:60309330:0,1,0,1
chr1	60309332	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60309330_G_GATGCT:60309330:0,1,0,1
chr1	60324224	.	G	C,GATCACAAGTTCCTAA	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=30,32,33;MFRL=136,92,93;MMQ=60,60,60;MPOS=7,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:1,1,1:0,4,0,2
chr1	60324230	.	T	TGGCGAA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=136,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	60324234	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:60324234_G_GA:60324234:0,3,0,1
chr1	60324237	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:60324234_G_GA:60324234:0,3,0,1
chr1	60324240	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:60324234_G_GA:60324234:0,3,0,1
chr1	60324243	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	60324246	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60324234_G_GA:60324234:0,1,0,1
chr1	60324249	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:60324234_G_GA:60324234:0,1,0,1
chr1	60370746	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr1	60490990	.	TATTTGAAGTTAAAGCTTCACCATATC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,2:2,0,1,1
chr1	60503627	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	60506862	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:5,4:1,7,0,4
chr1	60506883	.	A	AGAGATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:1,3,0,1
chr1	61331228	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61331228_CA_C:61331228:0,1,0,1
chr1	61331231	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:61331228_CA_C:61331228:0,1,0,1
chr1	61548326	.	ATT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=T;STR;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:7,8:2,8:7,2,16,0
chr1	61548344	.	TTC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TC;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:6,4:9,1,5,3
chr1	61848837	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,118;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.482:10:3,3:2,0:5,0,5,0
chr1	61872215	.	GCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=11,32;MFRL=138,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=C;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:1,5,2,5
chr1	62232173	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=122,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr1	62232196	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=78,105702800;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr1	62240967	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:7,0:5,12,5,0
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr1	62365217	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	62365428	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=129,73;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.428:38:6,11:13,5:14,8,6,10
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=105,98;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.335:31:3,6:16,4:13,8,4,6
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr1	62393439	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:6,1,2,1
chr1	62417951	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:2,0,11,0
chr1	62417952	.	A	AGAGAGAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.770:13:1,6:2,4:3,0,10,0
chr1	62456014	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,3:0,4:3,2,3,4
chr1	62456048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,2,3
chr1	62456132	.	A	AGGATACTATAGTGTAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:62456132_A_AGGATACTATAGTGTAC:62456132:0,1,0,1
chr1	62456134	.	A	ACTTAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:62456132_A_AGGATACTATAGTGTAC:62456132:0,1,0,1
chr1	62545085	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	62672647	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,0:6,2:9,7,0,2
chr1	62673225	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr1	62676095	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=148,131;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr1	62676224	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=122,347;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.274:31:9,8:13,0:18,5,0,8
chr1	62676247	.	GAACT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=347,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:11,5:5,5:6,11,7,3
chr1	62676284	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:8,5:12,5:11,9,5,5
chr1	62677048	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62677048_G_T:62677048:0,0,0,1
chr1	62677050	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62677048_G_T:62677048:0,0,0,1
chr1	62704078	.	A	AAAAGACAATTCTCAAAAGAAGAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=122,85;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.294:5:1,0:3,1:0|1:62704078_A_AAAAGACAATTCTCAAAAGAAGAG:62704078:2,2,0,1
chr1	62704082	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=122,85;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.302:5:0,0:3,1:0|1:62704078_A_AAAAGACAATTCTCAAAAGAAGAG:62704078:2,2,0,1
chr1	62704100	.	T	TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	62704134	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	62713434	.	C	CAAAAAGAAAAAAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62713434_C_CAAAAAGAAAAAAAG:62713434:0,0,0,1
chr1	62713437	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62713434_C_CAAAAAGAAAAAAAG:62713434:0,0,0,1
chr1	62713439	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62713434_C_CAAAAAGAAAAAAAG:62713434:0,0,0,1
chr1	62713441	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:62713434_C_CAAAAAGAAAAAAAG:62713434:0,0,0,1
chr1	62729066	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	62729077	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62729077_G_C:62729077:0,0,0,1
chr1	62729080	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62729077_G_C:62729077:0,0,0,1
chr1	62729083	.	CCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62729077_G_C:62729077:0,0,0,1
chr1	62738904	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:2,3,1,6
chr1	62739187	.	G	GAAATGACTCCCTGTCTCAGGCCCCTATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr1	62941908	.	A	AGTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	62960081	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=113,116;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:5,6,0,2
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:62973795_A_G:62973795:0,0,0,4
chr1	62973803	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1|0:62973795_A_G:62973795:0,4,0,2
chr1	62976293	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:62976293_C_T:62976293:11,5,1,1
chr1	62976296	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:62976293_C_T:62976293:11,5,1,1
chr1	62976423	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62976423_G_A:62976423:0,1,0,1
chr1	62976434	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:62976423_G_A:62976423:0,1,0,1
chr1	62979038	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	62994908	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	63001394	.	C	CATTGTTTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	63008302	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=98,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:9,2:0|1:63008302_C_T:63008302:13,8,1,1
chr1	63008311	.	A	ATGG	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:63008302_C_T:63008302:9,7,1,1
chr1	63008314	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:63008302_C_T:63008302:9,9,1,1
chr1	63008315	.	T	TG	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=119,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:4,2:0|1:63008302_C_T:63008302:9,9,1,1
chr1	63008317	.	A	AAAGAAGTGTCTCTACC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=120,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:63008302_C_T:63008302:8,9,1,1
chr1	63008451	.	A	AATCCTTGGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63008451_A_AATCCTTGGAAAC:63008451:0,4,0,1
chr1	63008457	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63008451_A_AATCCTTGGAAAC:63008451:0,4,0,1
chr1	63024909	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	63024961	.	C	CCACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63024961_C_CCACT:63024961:0,0,0,1
chr1	63024962	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63024961_C_CCACT:63024961:0,0,0,1
chr1	63024965	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:63024961_C_CCACT:63024961:0,0,0,1
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	63114167	.	C	CTAATCTTACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:3,6,1,1
chr1	63153866	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr1	63282547	.	A	AATTATCATATGGTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr1	63294926	.	T	TGCTGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:63294926_T_TGCTGGCA:63294926:0,1,0,1
chr1	63294929	.	A	AGACAGCTGTCAGCATCTTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:63294926_T_TGCTGGCA:63294926:0,1,0,1
chr1	63790450	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,6:6,0:8,2,6,0
chr1	63862375	.	T	TATTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	63920515	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:0,4:2,1:3,0,4,1
chr1	63955759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:5,5,1,2
chr1	64017575	.	TTCTG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	64095579	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr1	64095786	.	C	CCTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:2,11,0,2
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	64515687	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	64680446	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	64680654	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:7,9:1,0:3,5,4,5
chr1	64680682	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,0,7
chr1	64698411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	64709891	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,1,3
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr1	65098490	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:65098490_T_A:65098490:1,2,0,1
chr1	65098498	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:65098490_T_A:65098490:1,1,0,1
chr1	65098499	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:65098490_T_A:65098490:0,1,0,1
chr1	65099716	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:5,0:9,0:7,12,5,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr1	65120583	.	A	AAGCACAGAGCTGTGTAGAGTCTCAGCGAAGTGCTCGCTGGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,184;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	65129323	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:2,0,0,1
chr1	65138883	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:10,0:5,14,0,3
chr1	65139175	.	T	TGTATAGTTTGAGTTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:0,0:4,2:0|1:65139175_T_TGTATAGTTTGAGTTG:65139175:1,3,1,1
chr1	65139176	.	C	CTGCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:0,0:4,1:0|1:65139175_T_TGTATAGTTTGAGTTG:65139175:1,3,1,1
chr1	65139178	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:65139175_T_TGTATAGTTTGAGTTG:65139175:1,3,0,1
chr1	65143740	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	65147865	.	T	TTCCTCTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:65147865_T_TTCCTCTTA:65147865:0,1,0,1
chr1	65147867	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:65147865_T_TTCCTCTTA:65147865:0,1,0,1
chr1	65247089	.	TG	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:65247089_TG_GA:65247089:3,3,1,1
chr1	65247092	.	T	TGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:4,0:0|1:65247089_TG_GA:65247089:6,3,1,1
chr1	65247094	.	GCT	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,2:8,0:0|1:65247089_TG_GA:65247089:6,3,1,1
chr1	65247104	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:6,3:4,3,3,0
chr1	65305419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:5,5,2,0
chr1	65312368	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:1,8,3,5
chr1	65325970	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=104,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,1,5
chr1	65339273	.	C	CAAGAAAATGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65339273_C_CAAGAAAATGAT:65339273:0,0,0,1
chr1	65339277	.	CC	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:65339273_C_CAAGAAAATGAT:65339273:0,0,0,1
chr1	65656305	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr1	65845083	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=151,60;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:65845083_A_T:65845083:8,4,1,1
chr1	65845088	.	T	TGAAAGGTTGTCCCTCACAGAGGATTCCAAAACTCTGGTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=156,60;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:65845083_A_T:65845083:8,5,1,1
chr1	65871820	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=111,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	66037984	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,2:2,0:0,5,2,0
chr1	66037985	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:3,0:1,2:2,2,0,3
chr1	66038227	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66038227_TA_CC:66038227:0,1,0,1
chr1	66038232	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:66038227_TA_CC:66038227:0,1,0,1
chr1	66038233	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66038227_TA_CC:66038227:0,0,0,1
chr1	66062325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	66085525	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	66085574	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,6,5
chr1	66088701	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	66102239	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr1	66102257	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	66732529	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,4,6
chr1	66829344	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	67000103	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr1	67000137	.	G	GTATTTGTATATTTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	67098664	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	67109410	.	T	TTGTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TG;STR;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr1	67136610	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr1	67139051	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,62;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:67139051_T_A:67139051:3,7,1,1
chr1	67139060	.	A	ACTGTGTGAAGTAGAGATGGAAAGAGGGCTGGGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=123,62;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:67139051_T_A:67139051:2,6,1,1
chr1	67142675	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr1	67145322	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	67154730	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	67155862	.	TCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr1	67160981	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr1	67194911	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr1	67205185	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=102,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:4,10,1,1
chr1	67205201	.	G	GAGACCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:67205201_G_GAGACCA:67205201:2,12,1,1
chr1	67205203	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:8,0:0|1:67205201_G_GAGACCA:67205201:2,12,1,1
chr1	67205284	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=214,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67205284_A_T:67205284:0,1,0,1
chr1	67205285	.	G	GGGATTTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=214,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67205284_A_T:67205284:0,1,0,1
chr1	67205289	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=214,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67205284_A_T:67205284:0,1,0,1
chr1	67207219	.	CTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	67242087	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:4,2,5,2
chr1	67287989	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr1	67313352	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr1	67356861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:9,0:2,3:5,6,2,1
chr1	67359195	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	67411902	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,63;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,4:8,0:12,12,0,4
chr1	67424637	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:7,11,2,0
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,5:2,1:0,2,2,4
chr1	67474880	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:0,4,3,4
chr1	67474940	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67474940_A_T:67474940:0,2,1,0
chr1	67474942	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:67474940_A_T:67474940:0,2,1,0
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	67487393	.	CAGACACAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67487393_CAGACACAG_C:67487393:0,1,0,1
chr1	67487394	.	A	AAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:67487393_CAGACACAG_C:67487393:0,0,0,1
chr1	67487396	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:67487393_CAGACACAG_C:67487393:0,0,0,1
chr1	67487399	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:67487393_CAGACACAG_C:67487393:0,0,0,1
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	67515500	.	TACAGTCATTTTAATACCCCAAGAAAAAGTCTTCCTACAAAACAAAAAATTTTAAAATACACACATGACTTTATTCCC	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=105,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,9:0.084:65:12,0:29,7:0|1:67515500_TACAGTCATTTTAATACCCCAAGAAAAAGTCTTCCTACAAAACAAAAAATTTTAAAATACACACATGACTTTATTCCC_T:67515500:17,39,4,5
chr1	67515517	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=112,101;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:35,6:0.161:41:13,0:21,6:1|0:67515500_TACAGTCATTTTAATACCCCAAGAAAAAGTCTTCCTACAAAACAAAAAATTTTAAAATACACACATGACTTTATTCCC_T:67515500:13,22,0,6
chr1	67516191	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.481:17:5,3:3,5:3,6,1,7
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,5,3
chr1	67561056	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:2,3,3,6
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	67591660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:67591660_G_A:67591660:0,0,1,2
chr1	67591683	.	T	TATGCACCCATGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:67591660_G_A:67591660:1,1,0,1
chr1	67648430	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=113,170;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr1	67666401	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr1	67672765	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	67702516	.	A	ATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=117,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	67702591	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	67724891	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67724891_T_TAA:67724891:0,1,0,1
chr1	67724892	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67724891_T_TAA:67724891:0,1,0,1
chr1	67724900	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:67724891_T_TAA:67724891:0,1,0,1
chr1	67786024	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,2:6,2:13,4,3,1
chr1	67792467	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:67792467_G_T:67792467:2,2,0,1
chr1	67792469	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:67792467_G_T:67792467:2,2,0,1
chr1	67792470	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:67792467_G_T:67792467:2,2,0,1
chr1	67792477	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:67792467_G_T:67792467:2,2,0,1
chr1	67878789	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.323:16:3,4:8,1:10,1,5,0
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,13,6
chr1	67891755	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:4,1:8,2:10,2,3,0
chr1	67891772	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:7,0:13,1:19,6,2,0
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	68171293	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr1	68611684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=122,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:7,3:3,0:7,3,1,2
chr1	68698002	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=115,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:8,0:7,1:1,15,4,0
chr1	68914440	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=189,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	68915483	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=185,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0|1:68943436_G_A:68943436:3,0,3,1
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0|1:68943436_G_A:68943436:2,0,3,1
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,2:5,4:2,9,3,3
chr1	68943730	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:68943730_A_T:68943730:0,2,0,1
chr1	68943732	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68943730_A_T:68943730:0,2,0,1
chr1	68943739	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68943730_A_T:68943730:0,2,0,1
chr1	68947318	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,51;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	68948640	.	CAAAAACAATAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68948640_CAAAAACAATAG_C:68948640:0,1,0,1
chr1	68948654	.	AAGTT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:68948640_CAAAAACAATAG_C:68948640:0,1,0,1
chr1	68948670	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=377,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68948670_C_G:68948670:1,0,0,1
chr1	68948672	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=377,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:68948670_C_G:68948670:1,0,0,1
chr1	68949826	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:68949826_A_AG:68949826:0,3,0,1
chr1	68949827	.	A	ATTTTATAC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:68949826_A_AG:68949826:0,3,0,1
chr1	68949851	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68949851_A_G:68949851:0,2,0,1
chr1	68949859	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68949851_A_G:68949851:0,2,0,1
chr1	68949863	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68949851_A_G:68949851:0,1,0,1
chr1	68949867	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,31;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68949851_A_G:68949851:0,1,0,1
chr1	68952564	.	A	AACAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,0;MFRL=111,138;MMQ=60,50;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=AC;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,0:2,0,4,0
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	70225923	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:3,4,1,3
chr1	70226125	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	70446244	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=9,31;MFRL=204,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	70452092	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	70655035	.	G	GAATTATAAATTAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	70715518	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=157,173;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:70715518_T_C:70715518:2,0,1,0
chr1	70715523	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=157,173;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:70715518_T_C:70715518:2,0,1,0
chr1	70740441	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:7,3:10,4,2,1
chr1	70742532	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=42,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.386:10:3,0:3,3:4,2,3,1
chr1	70742581	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70742581_T_G:70742581:0,0,0,1
chr1	70742585	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70742581_T_G:70742581:0,0,0,1
chr1	70771819	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr1	70820004	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:5,3,0,2
chr1	70833376	.	TGGCCTGAAGCAAGTGAAGAATCACAAAAGAAGTGAAAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,123;MMQ=42,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	70877278	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:70877278_C_G:70877278:6,8,1,1
chr1	70877285	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:70877278_C_G:70877278:5,5,1,1
chr1	70877287	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:70877278_C_G:70877278:5,5,1,1
chr1	70877291	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:70877278_C_G:70877278:4,5,1,1
chr1	70881670	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:8,8:6,2:10,4,7,3
chr1	70904271	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	70904523	.	T	TTGTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=TG;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	70904567	.	GCATGGGGGGTCACTAT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	71418768	.	A	AGATTTTATCAAAGGACTGCATCCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,1,1
chr1	71532642	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr1	71537749	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=125,120;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,6:1,0:0|1:71537749_G_A:71537749:1,0,6,0
chr1	71537754	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=125,120;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.781:7:0,6:1,0:0|1:71537749_G_A:71537749:1,0,6,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	72400770	.	G	GCTACAGAACGAAAACACACATACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:72400770_G_GCTACAGAACGAAAACACACATACA:72400770:2,2,0,1
chr1	72400772	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=128,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:72400770_G_GCTACAGAACGAAAACACACATACA:72400770:2,2,0,1
chr1	72748121	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=112,35187145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:3,0:5,8,2,0
chr1	74610254	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr1	74621361	.	TTTATTTCTTCACCTTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:4,2:7,0:9,8,1,1
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	74649439	.	T	TCAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	74665265	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=161,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	74671519	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr1	74671575	.	T	TCTTCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=1227,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	74701950	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	74819650	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	74901739	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.627:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr1	74937749	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	74941210	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,4,3
chr1	74941243	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=72,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:5,4,4,0
chr1	74945794	.	CAAGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=10,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGAG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	75038088	.	T	TTGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75038088_T_TTGG:75038088:1,0,0,1
chr1	75038091	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75038088_T_TTGG:75038088:1,0,0,1
chr1	75038093	.	C	CTTATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75038088_T_TTGG:75038088:1,0,0,1
chr1	75038095	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75038088_T_TTGG:75038088:1,0,0,1
chr1	75072264	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	75078362	.	CT	TC	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:6,0:2,2:0|1:75078362_CT_TC:75078362:5,3,0,2
chr1	75078370	.	C	CCTA	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:75078362_CT_TC:75078362:4,3,0,2
chr1	75078372	.	GG	AA	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:75078362_CT_TC:75078362:4,3,0,2
chr1	75078379	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:75078362_CT_TC:75078362:5,3,0,2
chr1	75078381	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:1,2:0|1:75078362_CT_TC:75078362:5,5,0,2
chr1	75078383	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:75078362_CT_TC:75078362:5,4,0,2
chr1	75086665	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	75097564	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=118,163;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:6,5,0,2
chr1	75108648	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	75112573	.	G	GACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,211;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	75172680	.	TAACATGAAAAACAGCAATTCTACAGTTAAAGATTACTGTAAAATAGTGTTAAATTGTGGTAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:2,0:3,2,0,2
chr1	75172756	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,25,24,26;MFRL=115,153,122,99;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,5,2;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.59,7.61,4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,4,3:0.176,0.295,0.235:13:2,1,1,2:1,1,3,1:4,0,7,2
chr1	75190501	.	G	GGCCTCAGGCGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=78,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr1	75190512	.	C	CACTGTCACCACCAACAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0,3,1,1
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	75602214	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	75614380	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.848:22:2,9:1,9:3,0,9,10
chr1	75679569	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.664:5:0,2:1,1:1,1,2,1
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	75684529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	75685678	.	T	TGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=138,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr1	76190439	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,4,2
chr1	76190569	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0,0,5,14
chr1	76194054	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,6:0,0,3,10
chr1	76199345	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr1	76205643	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,13,5
chr1	76216330	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.951:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr1	76257074	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=97,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.394:13:4,1:4,4:2,6,1,4
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	76276353	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=244,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,6:1,2:1,0,7,1
chr1	76333163	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,7,2
chr1	76343955	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:15,0:14,4:11,18,0,4
chr1	76378359	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=84,3265181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	76378360	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,0:0,6:0,0,6,1
chr1	76378362	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,7,1
chr1	76878156	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	77558057	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	77588131	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=63,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	77620332	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr1	77627282	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=85,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:4,2,4,0
chr1	77752544	.	TAATTA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AATTA;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.565:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	77752894	.	A	ACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	77759380	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	77763542	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr1	77763663	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=169,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr1	77949123	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0|1:77949123_G_A:77949123:0,0,0,5
chr1	77949129	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0|1:77949123_G_A:77949123:0,0,0,4
chr1	77952095	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=202,148;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77952095_AG_CT:77952095:0,1,0,1
chr1	77952098	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=202,148;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:77952095_AG_CT:77952095:0,1,0,1
chr1	77952108	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,14;MFRL=202,148;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:77952095_AG_CT:77952095:0,1,0,1
chr1	77952114	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=190,148;MMQ=56,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:77952095_AG_CT:77952095:0,2,0,1
chr1	77952116	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=190,148;MMQ=56,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:77952095_AG_CT:77952095:0,2,0,1
chr1	78024284	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr1	78034141	.	CTTTCGTCATCCTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTGGTTTGGTAATTAAAATGAATTAAGTGTAAGTAATACTGATACAGAATAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.222:13:3,2:4,1:4,6,0,3
chr1	78044455	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=132,35;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:0|1:78044455_T_C:78044455:9,4,1,1
chr1	78044456	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=132,35;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:78044455_T_C:78044455:9,4,1,1
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	78179032	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=192,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr1	78184427	.	AA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=173,167;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:78184427_AA_TG:78184427:0,4,0,1
chr1	78184435	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=173,167;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:78184427_AA_TG:78184427:0,4,0,1
chr1	78184440	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=173,167;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:78184427_AA_TG:78184427:0,4,0,1
chr1	78184444	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	78184448	.	C	A,T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,23,30;MFRL=175,127,167;MMQ=60,60,40;MPOS=7,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,0:0,0,1:0,2,0,2
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr1	78332171	.	TGTAGGAGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAGGAGGG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	78381903	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	78381910	.	A	AACCAGGATTCAAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr1	78401661	.	G	GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.118:25:9,1:12,0:10,12,2,1
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr1	78435701	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.321:19:4,1:5,4:4,9,2,4
chr1	78471060	.	T	TC,TTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31,28;MFRL=0,124,142;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.55,8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.454,0.442:7:0,2,3:0,2,0:0,0,1,6
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	78585086	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:1,2:4,5:4,1,3,4
chr1	78601404	.	G	GGCTATCAAAAATAATATTAAAAAATTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:3,4,1,1
chr1	79002421	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79002424	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79002429	.	A	ATTTACAGGT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79002435	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79002437	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79002441	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79002421_G_C:79002421:0,0,0,1
chr1	79093776	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:2,6:3,4,3,7
chr1	79094081	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:2,5:1,1:2,1,2,4
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr1	79102726	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=115,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr1	79106899	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	79107533	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=68,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:1,0:6,2:3,5,0,2
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:9,7:10,2:10,9,4,5
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:2,4:4,5:0,7,2,7
chr1	79356809	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:14,0:0|1:79356809_G_A:79356809:14,7,1,1
chr1	79356815	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,2:14,0:0|1:79356809_G_A:79356809:13,7,1,1
chr1	79357445	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:79357445_A_ATTT:79357445:0,0,0,1
chr1	79357446	.	A	ATTTACCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:79357445_A_ATTT:79357445:0,0,0,1
chr1	79383300	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=87,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.702:11:3,4:0,4:1,2,6,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr1	79383733	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:2,0:2,6,0,2
chr1	79385807	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=151,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	79403450	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:2,1,5,1
chr1	79403751	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	79411888	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	79411918	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=71,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	79411951	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=92,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,2:0,4:4,2,6,0
chr1	82402364	.	TAATC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	82434966	.	C	CTTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=102,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.192:13:9,2:2,0:0|1:82434966_C_CTTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTT:82434966:4,7,0,2
chr1	82434968	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=102,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,1:2,0:0|1:82434966_C_CTTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTT:82434966:4,7,0,2
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,5,1,1
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,4,1,1
chr1	82450462	.	GT	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82450462_GT_AG:82450462:0,1,0,1
chr1	82450465	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82450462_GT_AG:82450462:0,1,0,1
chr1	82456113	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,185;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:9,0:12,10,3,0
chr1	84371986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,154;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,3:7,0:9,1,3,0
chr1	84640834	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr1	84765340	.	G	GTA,GTATA,GTATATA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,31,31,31;MFRL=112,109,135,132;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=13.78,25.53,7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,7,13,4:0.247,0.474,0.165:27:1,2,2,3:2,4,11,0:1,2,6,18
chr1	84768861	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	84874242	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	84880445	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:3,7,2,1
chr1	84944989	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:5,5:2,6:4,3,5,6
chr1	84945025	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:9,3:16,0:15,10,3,0
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=82,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	84956161	.	CT	C,CTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=122,128,128;MMQ=60,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.77,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,4,3:0.103,0.137:27:4,3,0:14,1,3:5,15,1,6
chr1	84967676	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.409:15:3,3:5,2:2,7,2,4
chr1	84982051	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:17,6:9,0:9,17,6,0
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	85031492	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:6,7:8,5:11,3,10,2
chr1	85040024	.	CAGCAGCGCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:6,2:0,10,1,2
chr1	85113360	.	G	GAAAACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85113360_G_GAAAACA:85113360:0,1,0,1
chr1	85113361	.	G	GACTAATATACCCCATAATCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85113360_G_GAAAACA:85113360:0,1,0,1
chr1	85124242	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85124242_G_A:85124242:0,2,0,1
chr1	85124243	.	A	AATTAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85124242_G_A:85124242:0,2,0,1
chr1	85124245	.	G	GTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:85124242_G_A:85124242:0,2,0,1
chr1	85128262	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	85135667	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135667_G_C:85135667:0,0,0,1
chr1	85135670	.	T	TTTTGTGTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135667_G_C:85135667:0,0,0,1
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,1:7,6:3,7,2,5
chr1	85392324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:4,3,2,4
chr1	85406752	.	A	ATAATATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85406752_A_ATAATATCT:85406752:0,1,0,1
chr1	85406754	.	A	AATATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85406752_A_ATAATATCT:85406752:0,1,0,1
chr1	85406756	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85406752_A_ATAATATCT:85406752:0,1,0,1
chr1	85422061	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,1:1,7:1,0,7,1
chr1	85462582	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.293:11:6,1:0,1:3,5,1,2
chr1	85462652	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr1	85462665	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	85484963	.	G	GAGTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=28795947,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	85491761	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=106,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,1:1,4:2,2,1,4
chr1	85510854	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,15538;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	85538655	.	A	G,AAAG	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,34,19;MFRL=112,89,67;MMQ=60,60,39;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.29,3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,2:0.222,0.190:25:7,1,1:13,2,0:6,14,2,3
chr1	85538754	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,3:20,0:9,28,0,3
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.526:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr1	85560306	.	T	TGTTTTGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85561634	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:8,8,3,0
chr1	85563440	.	A	AGTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=149,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	85563444	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=82,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	85575925	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85589923	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:3,8,0,2
chr1	85592165	.	TATTTGTCTTTTTAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	85595644	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,4:9,0:10,12,4,0
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr1	85598706	.	G	GTAAAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=98,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	85624864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr1	85630295	.	A	ATTTTTTAAAAATTCACTTTGAGTTAGTCAAGGAAGTTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,62;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.325:8:3,2:2,0:4,2,1,1
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr1	85648905	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	85725353	.	GCCGGAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGGAAA;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr1	85787333	.	A	AAACAAGAGTTAGTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85816215	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr1	86048820	.	G	GTCTGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86048820_G_GTCTGCA:86048820:0,0,0,1
chr1	86048822	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86048820_G_GTCTGCA:86048820:0,0,0,1
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,6:2,6:3,2,3,9
chr1	86173298	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr1	86203216	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=119,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:2,4,7,2
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	86227353	.	C	CTGATATGAAACACTGAGTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=157,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	86227362	.	CA	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86227362_CA_GT:86227362:0,1,0,1
chr1	86227365	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86227362_CA_GT:86227362:0,1,0,1
chr1	86227369	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=163,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86227362_CA_GT:86227362:0,1,0,1
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	86283600	.	A	AGAAAAGCAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,287;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	86361646	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,6:7,0:2,6,0,6
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	86372839	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.493:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr1	86375619	.	C	CTTTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr1	86377028	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:2,3,4,3
chr1	86435850	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:0,3:3,9:3,0,10,2
chr1	86435957	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=112,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.415:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr1	86435996	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86435996_G_T:86435996:1,2,0,1
chr1	86436001	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:86435996_G_T:86435996:1,2,0,1
chr1	86436002	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:86435996_G_T:86435996:1,2,0,1
chr1	86436006	.	A	ACTGCAAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86435996_G_T:86435996:1,2,0,1
chr1	86437150	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=100,58039225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr1	86453237	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,5:1,3:1,3,3,6
chr1	86482922	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=10619286,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr1	86487981	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:2,7:4,4:2,4,3,8
chr1	86487992	.	A	AACAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:3,4:2,4,0,9
chr1	86512433	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,7:5,5:12,1,11,2
chr1	86524698	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,57;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,0:1,7:3,0,7,0
chr1	86524868	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=113,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:8,0:13,11:3,18,0,11
chr1	86524903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.351:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	86554813	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=99.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,26:0.963:27:0,11:1,8:0|1:86554813_G_GA:86554813:1,0,19,7
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=114.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,32:0.971:33:0,19:1,13:0|1:86554813_G_GA:86554813:1,0,22,10
chr1	86554954	.	A	ATGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,3:9,0:10,8,0,3
chr1	86591255	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:10,5:5,0:2,13,4,1
chr1	86621992	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	86821034	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,93;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,0:9,3:15,10,0,3
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	86891005	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=100.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,19:0,0,20,15
chr1	86891179	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:1,8,3,6
chr1	86894273	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,2,2
chr1	86894279	.	A	AAAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,25;MFRL=88,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:86894279_A_AAAG:86894279:2,1,0,1
chr1	86894280	.	T	TAATCCTCAGAAAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=88,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:86894279_A_AAAG:86894279:2,1,0,1
chr1	86894328	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=141,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86894328_C_G:86894328:0,1,0,1
chr1	86894332	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86894328_C_G:86894328:0,2,0,1
chr1	86894333	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,23;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86894328_C_G:86894328:0,2,0,1
chr1	86896541	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=114,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:8,7:7,6:7,8,6,7
chr1	86896706	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr1	86897970	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:86897970_T_A:86897970:3,0,2,0
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:86897970_T_A:86897970:0,0,5,0
chr1	86900140	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	86900491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,2:2,1:0,4,0,4
chr1	86909589	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=158,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:86909589_T_A:86909589:5,6,1,1
chr1	86909597	.	T	TTCTGTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=158,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:86909589_T_A:86909589:6,6,1,1
chr1	86909599	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:86909589_T_A:86909589:5,6,1,1
chr1	86909600	.	T	TGCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:86909589_T_A:86909589:5,6,1,1
chr1	86909703	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=88,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	86913265	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,3:1,2:5,3,3,2
chr1	86920904	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=142,95;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,2:2,2:3,3,2,2
chr1	86920929	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:5,5,2,0
chr1	86934891	.	T	TAGATGAATGAATGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	86959173	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=98,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,2:2,5:2,3,4,3
chr1	86964185	.	AAGAAAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	86964344	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,2:0,0:3,3,1,1
chr1	86964534	.	C	CCCCGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	87025819	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	87031588	.	A	AATCAGCAGGTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=132,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	87038240	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:1,1,4,0
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:3,2,4,0
chr1	87170493	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	87188309	.	CTTACTCCTT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=117,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:20,0:20,2:23,24,0,2
chr1	87200729	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	87208953	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,2:5,8:2,3,5,5
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.661:15:2,4:2,5:3,2,8,2
chr1	89287617	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:9,3,0,2
chr1	89298628	.	T	TATCAATCATGTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	89408797	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:5,7:1,3:1,6,4,6
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	89448539	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=132,202;MMQ=60,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:89448539_C_G:89448539:10,10,2,0
chr1	89448556	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=139,202;MMQ=60,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:89448539_C_G:89448539:11,7,2,0
chr1	89449178	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,2:7,0:0|1:89449178_G_A:89449178:11,11,1,1
chr1	89449189	.	T	TAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:5,0:0|1:89449178_G_A:89449178:10,13,1,1
chr1	89449380	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=120,165;MMQ=52,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.121:39:16,0:18,4:0|1:89449380_C_T:89449380:24,11,4,0
chr1	89449390	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=122,104;MMQ=60,45;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,13:0.318:42:10,6:18,7:1|0:89449380_C_T:89449380:20,9,9,4
chr1	89449399	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,104;MMQ=60,45;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,13:0.304:44:13,6:17,7:1|0:89449380_C_T:89449380:20,11,8,5
chr1	89449483	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,125;MMQ=52,35;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.092:63:28,1:27,4:22,36,4,1
chr1	89475230	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,141;MMQ=52,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	89478854	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,3:5,3:6,5,4,2
chr1	89520574	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,0:2,4:1,3,2,2
chr1	89525812	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.678:13:0,3:3,5:0|1:89525812_C_G:89525812:3,1,7,2
chr1	89525820	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:0,3:6,5:0|1:89525812_C_G:89525812:4,2,6,2
chr1	89525966	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=113,128;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:7,7:1,4:5,3,4,7
chr1	89574026	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=103,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	89583544	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	89587727	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,4,0
chr1	89618214	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89618214_T_C:89618214:0,0,0,1
chr1	89618216	.	T	TCAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89618214_T_C:89618214:0,0,0,1
chr1	89618368	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:89618368_C_T:89618368:4,1,1,1
chr1	89618374	.	G	GTTGGTGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:89618368_C_T:89618368:5,1,1,1
chr1	89618472	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,1,2
chr1	89652846	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:1,0:5,2:0,6,0,3
chr1	89662772	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:1,1,5,0
chr1	89732259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:1,10,1,1
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr1	89847153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	89847359	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:89847359_C_A:89847359:3,0,1,0
chr1	89847372	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:89847359_C_A:89847359:0,0,4,1
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	89851106	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89851106_T_A:89851106:0,0,0,1
chr1	89851108	.	T	TGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89851106_T_A:89851106:0,0,0,1
chr1	89851111	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89851106_T_A:89851106:0,0,0,1
chr1	90049148	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	90058242	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	90179549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=113,1185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:90179549_C_T:90179549:0,2,1,0
chr1	90179552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=138,1185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:90179549_C_T:90179549:0,1,1,0
chr1	90179757	.	GC	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:3,0:0,1:0|1:90179757_GC_CA:90179757:1,2,0,1
chr1	90179761	.	T	TCCCCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:90179757_GC_CA:90179757:1,2,0,1
chr1	90399464	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:90399464_G_T:90399464:0,0,0,1
chr1	90399466	.	A	AACTTGGCTGTTTTGATAACTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:90399464_G_T:90399464:0,0,0,1
chr1	90400186	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=83,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:90400186_T_G:90400186:3,4,1,1
chr1	90400188	.	TG	AC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=83,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:90400186_T_G:90400186:3,4,1,1
chr1	90400192	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=95,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,2:0|1:90400186_T_G:90400186:4,4,1,1
chr1	90478684	.	GCAAAAACTGATCCTAA	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=95,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:13,2:17,0:22,22,2,0
chr1	90478783	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=99,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:14,1:14,5:0|1:90478783_G_A:90478783:12,18,0,6
chr1	90478790	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=101,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:12,1:16,0:0|1:90478783_G_A:90478783:8,20,0,6
chr1	91382286	.	GTGGCTTAAAAAAAAAGAATTTCAAATTTACATCCAATTCAAAC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.140:20:2,2:2,0:12,6,1,1
chr1	91383589	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,1:2,7:2,1,5,3
chr1	91403130	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:10,8,1,1
chr1	91406636	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.155:21:8,3:10,0:9,9,1,2
chr1	91726900	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=94,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,0:9,7:8,7,0,7
chr1	91728053	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,11,11
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	91742231	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:4,9,1,1
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	91818110	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:5,9,0,2
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr1	91845798	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=93,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:9,0:6,4:4,11,0,4
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,3,16
chr1	91978775	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=106,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:15,4:24,0:22,18,4,0
chr1	91978963	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	92195601	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,1,4
chr1	92200533	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	92224347	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,8:5,4:2,6,2,10
chr1	92326950	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=133,96;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:2,2:13,0:12,3,1,1
chr1	92327126	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,4:4,11:5,3,4,11
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.609:26:2,6:8,10:3,7,9,7
chr1	92446961	.	T	TTGTA	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TGTA;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:6,1:2,2:2,7,1,2
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr1	92447020	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.329:10:5,3:2,0:0|1:92447020_T_TA:92447020:2,5,0,3
chr1	92447021	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.329:10:5,2:2,0:0|1:92447020_T_TA:92447020:2,5,0,3
chr1	92447024	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:92447020_T_TA:92447020:2,5,0,2
chr1	92459613	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,0:5,3:5,1,2,1
chr1	92467730	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:1,2,2,5
chr1	92469881	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	92470580	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	92498159	.	AA	TT	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,5,1,1
chr1	92498162	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,5,1,1
chr1	92498165	.	CAT	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=155,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,5,1,1
chr1	92498170	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=158,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,4,1,1
chr1	92498176	.	AC	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,3,0,1
chr1	92498179	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=160,56;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:92498159_AA_TT:92498159:0,3,0,1
chr1	92637073	.	CTTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr1	92643158	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:92643158_A_G:92643158:0,0,0,1
chr1	92643167	.	ACCTAAACCTGTATTT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=237,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:0,1:0|1:92643158_A_G:92643158:0,3,0,1
chr1	92706349	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=145,132;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	92709689	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=203,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr1	92710513	.	T	TACTTTTATTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	92712302	.	T	TAGGGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:92712302_T_TAGGGAG:92712302:0,3,0,1
chr1	92712303	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:92712302_T_TAGGGAG:92712302:0,3,0,1
chr1	92713586	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:92713586_G_GC:92713586:0,1,0,1
chr1	92713594	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:92713586_G_GC:92713586:0,1,0,1
chr1	92735414	.	A	ATGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:92735414_A_ATGT:92735414:1,1,0,1
chr1	92735419	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:92735414_A_ATGT:92735414:1,1,0,1
chr1	92752114	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,1,1
chr1	92763091	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:0,1:8,2:3,8,0,3
chr1	92944314	.	CAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,6;RU=AG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:2,0:0,2:1,2,1,1
chr1	93159522	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:93159522_ATT_A:93159522:0,1,0,2
chr1	93159526	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:93159522_ATT_A:93159522:0,1,0,2
chr1	93159527	.	A	ATAGGCTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:93159522_ATT_A:93159522:0,1,0,2
chr1	93159821	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:4,0:10,3:9,9,3,0
chr1	93160002	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	93167854	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,7,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:0|1:93426866_T_C:93426866:5,0,2,0
chr1	93426874	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:93426866_T_C:93426866:5,0,2,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	93580692	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93580692_A_AC:93580692:0,1,0,1
chr1	93580696	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93580692_A_AC:93580692:0,1,0,1
chr1	93580700	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=172,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93580692_A_AC:93580692:0,1,0,1
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,10,5
chr1	93583818	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr1	93620199	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=167,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:93620199_T_TG:93620199:2,0,1,1
chr1	93620200	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=167,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:93620199_T_TG:93620199:2,0,1,1
chr1	93620201	.	A	AGTCTGGACTTGATGCTGTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=167,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:93620199_T_TG:93620199:2,0,1,1
chr1	93620393	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	93621823	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr1	93657672	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,2:2,4:3,6,2,4
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,0,11
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr1	93676555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:93676555_C_T:93676555:0,3,0,1
chr1	93676559	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,1:0|1:93676555_C_T:93676555:0,3,0,1
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	93683259	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=115,53;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:10,3:16,0:15,11,3,0
chr1	93691855	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32,33;MFRL=88,138,180;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.98,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,2:0.127,0.114:24:4,1,2:6,2,0:14,5,5,0
chr1	93691873	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=86,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.187:48:10,1:19,0:14,25,8,1
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,3,18
chr1	93722013	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:21,0:15,3:24,12,2,1
chr1	93989787	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=101,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,7:2,0:3,3,7,0
chr1	93995378	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	94041748	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94041748_C_T:94041748:0,1,0,1
chr1	94041757	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94041748_C_T:94041748:0,1,0,1
chr1	94041764	.	ACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,22;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94041748_C_T:94041748:0,1,0,1
chr1	94041770	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94041748_C_T:94041748:0,1,0,1
chr1	94041779	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	94140083	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94140083_G_A:94140083:3,0,1,0
chr1	94140085	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=158,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:94140083_G_A:94140083:3,0,1,0
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=102.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,17:0,0,14,17
chr1	94335194	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,3:2,0:5,1,3,0
chr1	94473377	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=112,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:94473377_GA_G:94473377:0,1,0,1
chr1	94473381	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=112,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94473377_GA_G:94473377:0,1,0,1
chr1	94476555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	94487082	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=177,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,6:0,5,2,9
chr1	94487544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr1	94502214	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=117,79;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,3:11,0:15,3,2,1
chr1	94502220	.	CA	GG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,79;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:94502220_CA_GG:94502220:15,5,1,1
chr1	94502223	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,79;MMQ=60,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:11,0:0|1:94502220_CA_GG:94502220:15,5,1,1
chr1	94505762	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	94505776	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94505776_TA_T:94505776:0,0,0,1
chr1	94505780	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:94505776_TA_T:94505776:0,0,0,1
chr1	94508492	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:94508492_T_A:94508492:0,1,0,1
chr1	94508495	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,29;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:94508492_T_A:94508492:0,1,0,1
chr1	94508497	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:94508492_T_A:94508492:0,1,0,1
chr1	94508505	.	AG	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:94508492_T_A:94508492:0,0,0,1
chr1	94522248	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=114,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:11,0:3,4:7,7,0,4
chr1	94543328	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=130,167;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:5,6,0,3
chr1	94544222	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:4,0:0|1:94544222_AAC_A:94544222:3,4,1,1
chr1	94544226	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=129,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:94544222_AAC_A:94544222:3,4,1,1
chr1	94544229	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:94544222_AAC_A:94544222:3,3,1,1
chr1	94544230	.	AACGT	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:94544222_AAC_A:94544222:3,3,1,1
chr1	94544276	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	94544326	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	94544805	.	TCA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CA;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:3,3:9,0,3,1
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	94649896	.	C	CTATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=184,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:2,0:0|1:94649896_C_CTATTT:94649896:0,3,0,1
chr1	94649900	.	ATGCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=184,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:94649896_C_CTATTT:94649896:0,3,0,1
chr1	94667423	.	T	TTTGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	94668046	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	94670784	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:2,4,1,4
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	94944134	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=114,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:27,0:8,2:0|1:94944134_T_C:94944134:24,11,0,2
chr1	94944141	.	T	TAA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=124,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:21,0:7,1:0|1:94944134_T_C:94944134:16,15,0,2
chr1	94964139	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.910:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	95293005	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,6:1,2:3,0,5,3
chr1	95310790	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=41,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:2,2,3,3
chr1	95333068	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	95357751	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	95358096	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr1	95363495	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:8,4,2,1
chr1	95367669	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr1	95614215	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:3,0,5,0
chr1	95615888	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	95712050	.	TGAGACTCA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,4:2,2:5,3,4,2
chr1	97189091	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,4:7,2:7,10,3,3
chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,23;MFRL=30831584,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	97278804	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,0:4,10:7,1,9,1
chr1	97544771	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	97547831	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	97839062	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=111,12644523;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr1	97981242	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	98039556	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr1	98157395	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:0,3,0,3
chr1	98186497	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.300:27:7,2:11,6:11,8,2,6
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,3,9
chr1	99156826	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99156828	.	T	TCG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99156829	.	T	TGGGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,29;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99156832	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99156834	.	T	TGACTC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99156837	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=185,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99156826_C_CAT:99156826:0,1,0,1
chr1	99157075	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=120,8612;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.192:14:4,0:8,2:7,5,1,1
chr1	99164246	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	99418857	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,0:4,3:10,4,3,0
chr1	99418941	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:99418941_G_A:99418941:0,0,0,1
chr1	99418943	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99418941_G_A:99418941:0,0,0,1
chr1	99418947	.	G	GTTAAACT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99418941_G_A:99418941:0,0,0,1
chr1	99418949	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99418941_G_A:99418941:0,0,0,1
chr1	99418952	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99418941_G_A:99418941:0,0,0,1
chr1	99422383	.	G	GACTGTTGCTATATAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99422383_G_GACTGTTGCTATATAAA:99422383:0,0,0,1
chr1	99422386	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99422383_G_GACTGTTGCTATATAAA:99422383:0,0,0,1
chr1	99753721	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,0:5,3:3,4,0,3
chr1	99767269	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:5,2,1,2
chr1	99767545	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99767545_T_A:99767545:0,1,0,1
chr1	99767547	.	T	TATAGTAGTAATAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99767545_T_A:99767545:0,1,0,1
chr1	99771842	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=67,415;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:3,4,2,0
chr1	99772258	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,0,2
chr1	99772530	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=209,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,0:0,2:0,1,1,2
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:5,8:4,4:8,1,8,5
chr1	100154960	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,122;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,0:5,6:3,6,0,6
chr1	100176574	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100176574_A_C:100176574:0,1,0,1
chr1	100176576	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100176574_A_C:100176574:0,1,0,1
chr1	100176578	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100176574_A_C:100176574:0,1,0,1
chr1	100176581	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100176574_A_C:100176574:0,1,0,1
chr1	100176584	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100176574_A_C:100176574:0,0,0,1
chr1	100206292	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=109,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:4,1:5,1,3,0
chr1	100206299	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:1,2:9,0:9,1,2,0
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	100330212	.	A	ACACACAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.241:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	100341080	.	A	AGTT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100341080_A_AGTT:100341080:0,2,0,1
chr1	100341081	.	A	AATATTAAG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100341080_A_AGTT:100341080:0,2,0,1
chr1	100341084	.	T	TATGTCCAAATCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100341080_A_AGTT:100341080:0,2,0,1
chr1	100341095	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=119,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100341095_T_TCC:100341095:0,1,0,1
chr1	100341096	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=119,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100341095_T_TCC:100341095:0,1,0,1
chr1	100341100	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=119,204;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100341095_T_TCC:100341095:0,1,0,1
chr1	100341101	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,30;MFRL=119,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100341095_T_TCC:100341095:0,1,0,1
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	100343416	.	A	ATGTTAATATCATAGGCCTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=101,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	100346235	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,3:10,1:12,7,3,1
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,3:6,2:6,1,3,2
chr1	100358103	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=92,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,3:2,1,4,4
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	100361986	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	100366446	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0|1:100376448_G_A:100376448:1,3,1,4
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=81,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:100376448_G_A:100376448:0,1,1,4
chr1	100381109	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	100472640	.	G	GTATAGCAGGAGGTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,0:4,2:3,5,0,2
chr1	100535303	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr1	100542702	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	100572358	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=146,128;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:2,1:14,1:17,0,2,0
chr1	100572366	.	TG	CA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=140,128;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:2,1:16,1:21,0,2,0
chr1	100572385	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=131,120;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:7,3:20,1:26,1,4,0
chr1	100572396	.	TG	CA	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=124,111;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:9,2:25,0:29,14,2,0
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr1	100602325	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	100614419	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	100672248	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:100672248_A_C:100672248:0,1,0,1
chr1	100672249	.	A	AGAGAGAGTTTTCTGTGTTTTTCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:100672248_A_C:100672248:0,1,0,1
chr1	100701031	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:18,0:10,4:12,16,0,4
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	100731819	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:100731819_C_CA:100731819:0,0,2,0
chr1	100731820	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:100731819_C_CA:100731819:0,0,2,0
chr1	100732044	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.215:12:4,0:6,2:0|1:100732044_C_T:100732044:6,4,1,1
chr1	100732048	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:100732044_C_T:100732044:5,3,1,1
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr1	100741107	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:6,1,1,1
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr1	100819483	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	100960461	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=124,99;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:11,0:0,3:5,6,0,3
chr1	100961717	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	101007055	.	CGTAT	C,TGTAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,28;MFRL=0,110,165;MMQ=60,60,60;MPOS=7,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.222,0.665:6:0,0,2:0,1,2:0,0,2,4
chr1	101194692	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,3:3,0:4,2,1,2
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	101377845	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,3:0,1,2,1
chr1	101387320	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:6,2:9,3:7,8,2,3
chr1	101706145	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,2:2,3:0|1:101706145_A_C:101706145:1,6,5,0
chr1	101706149	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=100,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:4,1:3,2:0|1:101706145_A_C:101706145:1,6,5,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	102462446	.	GTCAGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:102462446_GTCAGT_G:102462446:0,1,0,2
chr1	102462459	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,23;MFRL=151,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:102462446_GTCAGT_G:102462446:0,1,0,2
chr1	103356072	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.223:18:5,4:9,0:2,12,1,3
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	103444273	.	TGGAGGGCCA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=88,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGAGGGCCA;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:5,0:5,5,1,1
chr1	103444679	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	103444776	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	103449598	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	103455104	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:5,0:14,2:0|1:103455104_G_A:103455104:5,14,1,1
chr1	103455129	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=121,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:0|1:103455104_G_A:103455104:5,10,1,1
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	103470314	.	TGGCAGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:103470314_TGGCAGGG_T:103470314:0,1,0,1
chr1	103470323	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103470314_TGGCAGGG_T:103470314:0,1,0,1
chr1	103470325	.	ATATATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,21;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103470314_TGGCAGGG_T:103470314:0,1,0,1
chr1	103471456	.	CCAT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CAT;STR;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.913:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	103471734	.	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27,28,24;MFRL=92,143,89,118;MMQ=60,53,40,40;MPOS=26,10,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=AAAT;STR;TLOD=6.90,5.69,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,1:0.274,0.385,0.231:6:1,2,1,0:0,0,1,1:1,0,4,1
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	103484376	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,0:8,4:12,9,4,0
chr1	103487388	.	TT	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,153;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,0:1,2:1,8,0,2
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=19,21;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,1:0,2:0,1,1,2
chr1	103491924	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103491924_T_TAA:103491924:0,1,0,1
chr1	103491928	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103491924_T_TAA:103491924:0,1,0,1
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	103540324	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=59,59;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	104094474	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:104094474_T_A:104094474:0,4,0,1
chr1	104094479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:104094474_T_A:104094474:0,4,0,1
chr1	104094507	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	104115610	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=137,152;MMQ=60,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,14:2,0:3,1,14,0
chr1	104116565	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,214;MMQ=60,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.670:16:3,3:2,8:4,1,1,10
chr1	104116797	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr1	104166496	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,139;MMQ=27,26;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr1	104203052	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=186,106;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	107600983	.	TCC	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:107600983_TCC_T:107600983:9,13,0,2
chr1	107600987	.	CA	TT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:107600983_TCC_T:107600983:9,13,0,2
chr1	107600991	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,0:14,2:0|1:107600983_TCC_T:107600983:8,15,0,2
chr1	108023196	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=95,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,0:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,3,0
chr1	108023198	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:3,0:0|1:108023196_G_C:108023196:0,7,3,0
chr1	108023202	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,0:0|1:108023196_G_C:108023196:0,7,3,0
chr1	108023206	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=102,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,2:3,0:0|1:108023196_G_C:108023196:0,7,3,0
chr1	108023210	.	CTACCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=109,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:3,0:0|1:108023196_G_C:108023196:0,8,3,0
chr1	108115871	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	108160260	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.941:12:0,5:0,3:0,0,1,11
chr1	108291559	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108291559_T_G:108291559:1,1,0,1
chr1	108291564	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:108291559_T_G:108291559:2,1,0,1
chr1	108307636	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0|1:108307636_G_C:108307636:5,1,4,1
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:108307636_G_C:108307636:0,0,10,3
chr1	108307848	.	C	CAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	108319947	.	A	AACCCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr1	108507541	.	GGCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	108700299	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,99;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	108724552	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,2:6,3:7,6,4,1
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	108766424	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	108994925	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=95,102;MMQ=49,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,0:4,3:6,7,1,2
chr1	108994952	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=95,111;MMQ=50,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:4,6,0,2
chr1	108994980	.	TGG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=148,95;MMQ=25,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108994980_TGG_ACA:108994980:0,2,0,1
chr1	108994985	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=148,95;MMQ=25,51;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108994980_TGG_ACA:108994980:0,2,0,1
chr1	108994987	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=148,95;MMQ=25,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108994980_TGG_ACA:108994980:0,2,0,1
chr1	109010260	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,63;MMQ=43,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.083:45:21,2:21,1:23,19,2,1
chr1	109103244	.	G	GTTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr1	109172097	.	GTTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	109187392	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=129,125;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109187392_T_C:109187392:0,1,0,1
chr1	109187398	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=129,125;MMQ=52,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109187392_T_C:109187392:0,1,0,1
chr1	109187405	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=129,125;MMQ=52,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109187392_T_C:109187392:0,1,0,1
chr1	109193081	.	G	GATCCGATTATCTCATTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	109238724	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:16,0:19,3:20,15,3,0
chr1	109239294	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:10,4,2,0
chr1	109242672	.	A	AAGACTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109242672_A_AAGACTT:109242672:0,3,0,1
chr1	109242673	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109242672_A_AAGACTT:109242672:0,3,0,1
chr1	109242692	.	T	TAGAAAGCGTAGTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	109260692	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109260692_T_C:109260692:0,1,0,1
chr1	109260696	.	G	GGGGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109260692_T_C:109260692:0,1,0,1
chr1	109261494	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:7,9,2,1
chr1	109270402	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	109270436	.	G	GCCCACCTACATTTCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,1,1
chr1	109273610	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=111,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=100,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:3,3:9,5:3,9,0,8
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:5,5:2,3:1,6,1,8
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	109336373	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109336373_TG_AA:109336373:0,1,0,1
chr1	109336377	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109336373_TG_AA:109336373:0,1,0,1
chr1	109337572	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	109350196	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:0|1:109350196_C_T:109350196:7,7,1,1
chr1	109350203	.	T	TTTG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:4,2:0|1:109350196_C_T:109350196:6,8,1,1
chr1	109363140	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:6,2,2,0
chr1	109377157	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27,27;MFRL=0,129,145;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.21,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.250,0.581:3:0,1,1:0,0,1:0,0,0,3
chr1	109377178	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr1	109461176	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109461176_G_A:109461176:0,0,1,0
chr1	109461179	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109461176_G_A:109461176:0,0,1,0
chr1	109465255	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr1	109465264	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:109465264_G_T:109465264:0,4,0,1
chr1	109465266	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:109465264_G_T:109465264:0,3,0,1
chr1	109482182	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=177,142;MMQ=40,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	109482210	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=152,143;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	109484111	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:5,0:5,5:0|1:109484111_C_T:109484111:3,7,0,6
chr1	109484121	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:4,0:3,6:0|1:109484111_C_T:109484111:3,5,0,6
chr1	109484125	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:8,0:1,11,1,1
chr1	109484132	.	C	CAAAAATGATCAATAAATACTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=113,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:1,11,1,1
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=161,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.373:30:9,7:10,4:3,16,7,4
chr1	109493134	.	G	GTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTA;STR;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr1	109524584	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	109553467	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=152,152;MMQ=50,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	109553474	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=147,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:109553474_G_A:109553474:4,0,1,0
chr1	109553477	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=147,155;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:109553474_G_A:109553474:4,0,1,0
chr1	109553483	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,27;MFRL=144,155;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109553474_G_A:109553474:3,0,1,0
chr1	109553486	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,34;MFRL=144,155;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109553474_G_A:109553474:3,0,1,0
chr1	109553492	.	CT	TA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109553492_CT_TA:109553492:3,0,1,0
chr1	109553499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109553492_CT_TA:109553492:3,0,1,0
chr1	109553507	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:109553492_CT_TA:109553492:3,0,1,0
chr1	109707369	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:109707369_G_A:109707369:0,1,0,1
chr1	109707372	.	A	AACATATACTCATGCACACACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:109707369_G_A:109707369:0,1,0,1
chr1	109716401	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=77,40;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:5,7,1,1
chr1	109731860	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,5,6
chr1	109737063	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,8:0,1:0,0,6,4
chr1	109737090	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr1	109737307	.	C	CACTAATCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109740310	.	AGT	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:8,2:1,0:3,6,0,2
chr1	109740312	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:5,1:0,0:0,5,0,1
chr1	109740342	.	TAAGA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr1	109740348	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,21;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=-1073741827;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	109740355	.	G	GTGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	109766619	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=173,146;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:0|1:109766619_C_T:109766619:2,7,0,3
chr1	109766625	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,146;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:3,3:0|1:109766619_C_T:109766619:1,7,0,3
chr1	109773705	.	ATTT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=67,107;MMQ=54,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.678:7:2,3:0,1:0|1:109773705_ATTT_A:109773705:0,2,0,5
chr1	109773710	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=67,107;MMQ=54,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.678:7:1,4:0,1:0|1:109773705_ATTT_A:109773705:0,2,0,5
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	109780437	.	GC	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.136:45:19,0:20,4:23,16,1,5
chr1	109804309	.	C	CCATTCCTCAGGACTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:109804309_C_CCATTCCTCAGGACTCA:109804309:0,0,0,1
chr1	109804313	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109804309_C_CCATTCCTCAGGACTCA:109804309:0,0,0,1
chr1	109805653	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109811510	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:5,6,2,1
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:1,4,1,4
chr1	109815074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=82,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	109816761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr1	109839063	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,27;MFRL=107,119;MMQ=50,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:0,1:0|1:109839063_ATT_A:109839063:1,1,0,1
chr1	109839082	.	GTG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=107,119;MMQ=50,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:109839063_ATT_A:109839063:1,1,0,1
chr1	109839091	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=107,119;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109839063_ATT_A:109839063:0,1,0,1
chr1	109839329	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=158,154;MMQ=57,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:109839329_G_A:109839329:5,1,2,0
chr1	109839331	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=158,154;MMQ=57,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:109839329_G_A:109839329:5,1,2,0
chr1	109839356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=102,154;MMQ=60,41;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:4,4,2,0
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,7,12
chr1	109839954	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	109840918	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	109856842	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	109857278	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr1	109865810	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:109865810_A_T:109865810:0,0,0,1
chr1	109865813	.	C	CTTGGCTTTAAAGTTTTTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:109865810_A_T:109865810:0,0,0,1
chr1	109870083	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:6,3,4,0
chr1	109910013	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr1	109954678	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	109968885	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.238:17:4,0:6,1:3,10,4,0
chr1	109969041	.	C	CAGTAGAAAAGTCATGTAATCAACCTAAGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	110019381	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	110019665	.	G	GCCAGGAGCCAGCAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=99,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:110019665_G_GCCAGGAGCCAGCAGCC:110019665:0,1,0,1
chr1	110019667	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=99,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:110019665_G_GCCAGGAGCCAGCAGCC:110019665:0,1,0,1
chr1	110020440	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:11,4,1,1
chr1	110029678	.	A	ATCTTTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr1	110030945	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	110035159	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,5:1,8:1,0,10,4
chr1	110035318	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	110036998	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	110037192	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=117,51;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:15,0:7,2:0|1:110037192_G_C:110037192:6,16,1,1
chr1	110037196	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=117,51;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:110037192_G_C:110037192:6,16,1,1
chr1	110037202	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=136,82;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,1:5,1:3,12,0,2
chr1	110037224	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,18;MFRL=138,127;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,0:0,10,0,2
chr1	110037257	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=164,163;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	110037838	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr1	110050708	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110050708_C_T:110050708:0,0,0,1
chr1	110050716	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110050708_C_T:110050708:0,0,0,1
chr1	110050717	.	T	TTCTTTCACTGCTTCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110050708_C_T:110050708:0,0,0,1
chr1	110051085	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=100,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,2:8,1:9,4,1,2
chr1	110086009	.	G	GTGAGAGGTGACCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:110086009_G_GTGAGAGGTGACCA:110086009:2,1,0,1
chr1	110086011	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:110086009_G_GTGAGAGGTGACCA:110086009:2,1,0,1
chr1	110086019	.	TG	GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:110086009_G_GTGAGAGGTGACCA:110086009:3,1,0,1
chr1	110086949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr1	110141413	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:110141413_A_G:110141413:2,0,1,0
chr1	110141418	.	TGTTTTC	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:110141413_A_G:110141413:2,0,1,0
chr1	110141421	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	110141425	.	ATGCTTTTAC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:110141413_A_G:110141413:2,0,1,0
chr1	110141436	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:110141413_A_G:110141413:3,0,1,0
chr1	110141438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:110141413_A_G:110141413:3,0,1,0
chr1	110141440	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:110141413_A_G:110141413:3,0,1,0
chr1	110141662	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:110141662_A_C:110141662:0,4,0,1
chr1	110141665	.	GGAAGGAAT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:110141662_A_C:110141662:0,4,0,1
chr1	110141677	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:110141662_A_C:110141662:0,4,0,1
chr1	110141679	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:110141662_A_C:110141662:0,4,0,1
chr1	110152633	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=61,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,1,0
chr1	110153198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	110155524	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:3,4,2,2
chr1	110170574	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:3,1:4,1:2,7,0,2
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	110200360	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:4,4:8,4,1,8
chr1	110200388	.	TG	GA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:10,2:11,14,0,2
chr1	110200542	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr1	110201809	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,3,6
chr1	110201812	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,3,6
chr1	110207541	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=212,71;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	110255008	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:110255008_G_A:110255008:2,0,0,1
chr1	110255013	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:0,1:2,0:0|1:110255008_G_A:110255008:2,1,0,1
chr1	110281941	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	110294577	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr1	110295890	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=94,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	110295916	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,27;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	110299550	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	110299831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=213,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110299831_G_A:110299831:0,1,0,1
chr1	110299833	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=213,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110299831_G_A:110299831:0,1,0,1
chr1	110300750	.	CCG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110300750_CCG_C:110300750:0,1,0,1
chr1	110300758	.	C	CCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110300750_CCG_C:110300750:0,1,0,1
chr1	110301766	.	AGTGTGTGT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=103,166;MMQ=48,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=GT;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.447:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr1	110302546	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=46259482,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110302546_AG_A:110302546:1,0,0,1
chr1	110302550	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=46259482,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110302546_AG_A:110302546:1,0,0,1
chr1	110467881	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=21,20;MFRL=134,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:110467881_A_T:110467881:0,4,1,1
chr1	110467885	.	T	TGCTTCAATCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:110467881_A_T:110467881:0,3,1,1
chr1	110467934	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110467934_TG_T:110467934:0,1,0,1
chr1	110467938	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110467934_TG_T:110467934:0,1,0,1
chr1	110467939	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110467934_TG_T:110467934:0,1,0,1
chr1	110564392	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	110564396	.	CTTG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=99,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr1	110564400	.	A	ACAT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	110564408	.	C	CCTGT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110564408_C_CCTGT:110564408:0,0,0,1
chr1	110564412	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110564408_C_CCTGT:110564408:0,0,0,1
chr1	110564413	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110564408_C_CCTGT:110564408:0,0,0,1
chr1	110564418	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110564408_C_CCTGT:110564408:0,0,0,1
chr1	110581780	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:6,3:2,5:5,3,6,3
chr1	110587376	.	AT	CC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	110590198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:5,5,1,3
chr1	110655292	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:2,4,1,4
chr1	110655541	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	110716511	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	110716540	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110716540_G_A:110716540:4,0,1,0
chr1	110716542	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:110716540_G_A:110716540:4,0,1,0
chr1	110717649	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:110717649_CT_C:110717649:0,1,0,1
chr1	110717652	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110717649_CT_C:110717649:0,1,0,1
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	110766563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:2,4,0,2
chr1	110768873	.	T	TACCTACCTGTTCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	110923822	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr1	110924235	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,14:0,0,14,5
chr1	110932006	.	G	GGAACTTGGAAACACTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	111059825	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,0:4,3:4,1,3,0
chr1	111136649	.	G	GCCCCACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=132,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:111136649_G_GCCCCACC:111136649:0,3,0,1
chr1	111136653	.	C	CCACCCCAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=132,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:111136649_G_GCCCCACC:111136649:0,3,0,1
chr1	111136656	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=132,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:111136649_G_GCCCCACC:111136649:0,3,0,1
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	111661413	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=85,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:15,5:0,6:9,6,8,3
chr1	111661528	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:3,6:4,4:4,4,4,6
chr1	111663411	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111663411_C_CTT:111663411:0,1,0,1
chr1	111663412	.	A	ACAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111663411_C_CTT:111663411:0,1,0,1
chr1	111726026	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr1	111737183	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr1	111737398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr1	111739851	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:111739851_GA_G:111739851:0,3,1,1
chr1	111739856	.	C	CCAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:111739851_GA_G:111739851:0,4,1,1
chr1	111739858	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:111739851_GA_G:111739851:0,4,1,1
chr1	111739862	.	C	CAGATCGCCTGAGGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=136,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:111739851_GA_G:111739851:0,4,0,1
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=86,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:3,4:0,1:1,2,1,4
chr1	111773568	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:3,2:1,2:0,5,1,3
chr1	111773830	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:7,5,5,2
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	111778468	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	111783856	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=206,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111783856_C_T:111783856:1,0,1,0
chr1	111783860	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:111783856_C_T:111783856:2,0,1,0
chr1	111783869	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:111783856_C_T:111783856:2,0,1,0
chr1	111783942	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:2,1:2,3,1,2
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	111889346	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=118,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:10,4,1,1
chr1	111891225	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:9,2,0,2
chr1	111892905	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	111958048	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111958048_C_T:111958048:0,0,0,1
chr1	111958067	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:111958048_C_T:111958048:0,0,0,1
chr1	111968990	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	111969294	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=77,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr1	111969307	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	111969320	.	G	GCGGGGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	111969719	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:6,3,2,2
chr1	111990265	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	111991845	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=70706706,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr1	111992095	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=69,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,5:2,1:2,1,5,1
chr1	111998895	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,2:0,0:0|1:111998895_CT_C:111998895:0,3,1,1
chr1	111998897	.	ATTT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=168,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:111998895_CT_C:111998895:0,3,1,1
chr1	111999383	.	TTTCAGAAGTTTCTAGGAAGAATGAAGTTACTTGTTGTGTGCATTTTTTTAA	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.071:52:19,5:16,2:10,32,6,4
chr1	112026198	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	112028561	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.745:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr1	112029345	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112029345_G_C:112029345:1,2,0,1
chr1	112029346	.	C	CATACTGTCTGTGGAGTTAGAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=171,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:112029345_G_C:112029345:1,2,0,1
chr1	112031706	.	A	ACCT,AAGACAATTGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23,24;MFRL=0,118,118;MMQ=60,60,60;MPOS=2,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.76,3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.405,0.401:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr1	112031708	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:112031708_A_T:112031708:0,1,0,1
chr1	112031709	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,19;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1|0:112031708_A_T:112031708:0,1,0,1
chr1	112032205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=165,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:3,2:0,3:2,1,4,1
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	112234068	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=84,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:2,3:8,3:4,7,1,5
chr1	112240038	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr1	112269630	.	G	GGGAAGGAATCCTGCCTCTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=122,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,1,1
chr1	112298829	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	112302208	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr1	112303165	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,0:13,2:0|1:112303165_A_C:112303165:11,8,0,2
chr1	112303171	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=154,146;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:0|1:112303165_A_C:112303165:11,10,0,2
chr1	112303405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:3,4,2,0
chr1	112309480	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:112309480_AA_TT:112309480:0,0,0,1
chr1	112309484	.	CCA	TTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112309480_AA_TT:112309480:0,0,0,1
chr1	112309493	.	T	TTTTGAATGTCTTTTGAGGCTGTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=1185,98;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112309480_AA_TT:112309480:0,1,0,1
chr1	112318835	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=80,44;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:7,16,0,2
chr1	112319795	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=65,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:14,4:8,0:12,10,3,1
chr1	112997122	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=102,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:19,6:9,0:15,13,3,3
chr1	112998711	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=83,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:11,0:14,12,0,3
chr1	112999276	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:6,2,4,0
chr1	112999646	.	G	GGGCAGCCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:112999646_G_GGGCAGCCCTTC:112999646:2,1,0,1
chr1	112999648	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:112999646_G_GGGCAGCCCTTC:112999646:2,1,0,1
chr1	113059104	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	113068577	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr1	113140583	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=130,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,4:3,1:2,2,3,3
chr1	113159371	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,1:7,2:10,1,3,0
chr1	113162494	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:7,4,8,3
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,21;MFRL=665,161;MMQ=55,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.643:6:0,0:1,2:2,0,2,2
chr1	113231827	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:2,5,1,3
chr1	113238119	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0|1:113238119_C_A:113238119:4,4,1,1
chr1	113238122	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:113238119_C_A:113238119:4,5,1,1
chr1	113240563	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=129,131;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,0:7,2,2,0
chr1	113241445	.	CCG	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:113241445_CCG_C:113241445:2,8,1,1
chr1	113241450	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:113241445_CCG_C:113241445:2,8,1,1
chr1	113241453	.	C	CTTTGTCT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:113241445_CCG_C:113241445:2,7,1,1
chr1	113241477	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=166,271;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:113241477_T_TC:113241477:0,3,0,1
chr1	113241478	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=166,271;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:113241477_T_TC:113241477:0,3,0,1
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=88,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:1,2,2,2
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	113245640	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:14,7,1,2
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	113254056	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113254056_A_T:113254056:0,1,0,1
chr1	113254065	.	T	TGAGTGGGTGACCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:113254056_A_T:113254056:0,2,0,1
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	113255288	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr1	113256165	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=117,121;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:5,0:14,3:8,11,0,4
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr1	114092111	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr1	114133164	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:6,5,0,3
chr1	114165672	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=261,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,2,0,1
chr1	114165674	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=261,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,2,0,1
chr1	114165680	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,1,0,1
chr1	114165681	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,1,0,1
chr1	114165685	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,1,0,1
chr1	114165687	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,1,0,1
chr1	114165689	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=257,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:114165672_G_A:114165672:0,1,0,1
chr1	114186501	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=128,37;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:114186501_G_A:114186501:0,2,1,1
chr1	114186504	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=128,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:114186501_G_A:114186501:0,2,1,1
chr1	114186506	.	TAG	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=170,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:114186501_G_A:114186501:0,1,1,1
chr1	114186512	.	G	GACCAGTGTATACTCAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,18;MFRL=170,37;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.608:3:1,0:0,1:0|1:114186501_G_A:114186501:0,1,1,1
chr1	114192042	.	T	TGAGACAGAGTCTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:3,1:1,3,1,2
chr1	114240882	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr1	114242250	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=114,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:2,5,1,1
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	114301335	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:4,6:12,10:8,8,5,11
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,2:1,0:4,1,3,0
chr1	114372332	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114372332_TA_T:114372332:0,1,0,1
chr1	114372348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114372332_TA_T:114372332:0,1,0,1
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,3:0,3,3,5
chr1	114394798	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:114394798_T_A:114394798:0,2,0,1
chr1	114394801	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:114394798_T_A:114394798:0,2,0,1
chr1	114397767	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114397767_AG_A:114397767:0,1,0,1
chr1	114397769	.	TGGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114397767_AG_A:114397767:0,1,0,1
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr1	114443035	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:1,7,1,5
chr1	114445167	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	114445559	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114445559_A_ACC:114445559:0,1,0,1
chr1	114445561	.	C	CCTTAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114445559_A_ACC:114445559:0,1,0,1
chr1	114445567	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114445559_A_ACC:114445559:0,0,0,1
chr1	114445570	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114445559_A_ACC:114445559:0,0,0,1
chr1	114504860	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	114505000	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=93,133;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,1:1,5:3,4,2,4
chr1	114508693	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	114522285	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:1,1,1,3
chr1	114523137	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,0:5,5:9,4,0,5
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	114680540	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr1	114940364	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=82,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:7,10,0,2
chr1	114943911	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=142,158;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:114943911_G_T:114943911:3,0,1,0
chr1	114943914	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=142,158;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:114943911_G_T:114943911:3,0,1,0
chr1	114943918	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=149,158;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:114943911_G_T:114943911:4,0,1,0
chr1	114943926	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=149,145;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	114952712	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=77,186;MMQ=49,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:114952712_C_G:114952712:2,0,1,0
chr1	114952718	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=77,186;MMQ=49,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:114952712_C_G:114952712:2,0,1,0
chr1	114976285	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,1:9,2:10,2,4,0
chr1	115006203	.	CT	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:4,2:1,7,1,1
chr1	115006236	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	115110959	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	115119280	.	AATTTTAATTTCC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:3,2:3,3,1,1
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	115144035	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr1	115144879	.	C	CTTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115144879_C_CTTCAG:115144879:0,1,0,1
chr1	115144885	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115144879_C_CTTCAG:115144879:0,1,0,1
chr1	115165801	.	GCTAACT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115165801_GCTAACT_G:115165801:0,0,0,1
chr1	115165809	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115165801_GCTAACT_G:115165801:0,0,0,1
chr1	115165813	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:115165801_GCTAACT_G:115165801:0,0,0,1
chr1	115238016	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.866:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr1	115252414	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=137,177;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:115252414_TG_CA:115252414:0,2,0,1
chr1	115252420	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=137,177;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:115252414_TG_CA:115252414:0,2,0,1
chr1	115252425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=137,177;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:115252414_TG_CA:115252414:0,2,0,1
chr1	115252442	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=159,177;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115252414_TG_CA:115252414:0,1,0,1
chr1	115258623	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=86,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:9,2,2,0
chr1	115261464	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	115273323	.	TT	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,15,4
chr1	115428800	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:6,1,1,2
chr1	115456723	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,98;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,0:7,2:1,8,0,2
chr1	115466252	.	A	AAAGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	115537317	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:9,9,2,0
chr1	115537600	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.247:17:3,0:7,1:3,10,0,4
chr1	115576175	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=102,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:7,1:3,5,0,3
chr1	115601428	.	CTGGTGAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	115601606	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=129,108;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:0|1:115601606_A_T:115601606:5,6,0,3
chr1	115601614	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=129,108;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:6,1:0|1:115601606_A_T:115601606:5,6,0,3
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=108,123;MMQ=59,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,10:0.732:13:0,4:1,4:1|0:115601606_A_T:115601606:0,3,4,6
chr1	116202312	.	G	GCCAAATAGGCATC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:5,2:2,0:0|1:116202312_G_GCCAAATAGGCATC:116202312:5,3,1,1
chr1	116202314	.	T	TCCTGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.222:12:8,1:1,0:0|1:116202312_G_GCCAAATAGGCATC:116202312:7,3,1,1
chr1	116206362	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=106,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:2,1:7,9:4,5,8,3
chr1	116206615	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,0:9,3:8,8,2,1
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	116243877	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=133,89;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:3,3:5,5:2,6,4,4
chr1	116243889	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:4,9,0,2
chr1	116260597	.	G	GTTTCTCTTCTACTTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:116260597_G_GTTTCTCTTCTACTTAC:116260597:1,0,0,1
chr1	116260601	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:116260597_G_GTTTCTCTTCTACTTAC:116260597:1,0,0,1
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=89,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:3,1,2,1
chr1	116383356	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=167,162;MMQ=51,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:116383356_CAG_C:116383356:0,2,0,1
chr1	116383360	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=167,162;MMQ=51,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:116383356_CAG_C:116383356:0,2,0,1
chr1	116383361	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=16,33;MFRL=167,162;MMQ=51,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:116383356_CAG_C:116383356:0,2,0,1
chr1	116383364	.	A	ATTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=178,141;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,1:0,2,0,2
chr1	116383369	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:116383356_CAG_C:116383356:0,3,0,1
chr1	116384386	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,70;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:4,1,2,1
chr1	116385171	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	116573942	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr1	116577747	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	116577919	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.599:18:1,5:6,6:2,5,3,8
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.580:10:1,1:2,5:4,0,5,1
chr1	116655381	.	GACACATAAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,1,2
chr1	116670774	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:4,5:1,2:6,0,5,2
chr1	116676035	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	116933115	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:1,2:1,2,0,2
chr1	116940601	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:6,0:6,5,1,2
chr1	117078864	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:117078864_T_A:117078864:1,0,0,1
chr1	117078866	.	T	TTCTCGCTCCTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,28;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:117078864_T_A:117078864:1,0,0,1
chr1	117120150	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=182,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:1,2:0,2:0,1,2,2
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=172,16775956;MMQ=52,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:5,2,1,2
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=116,119;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:7,4,2,2
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=153,119;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	117146504	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=126,106;MMQ=52,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:2,7,1,1
chr1	117146545	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=126,91;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr1	117146563	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,91;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0|1:117146563_G_A:117146563:0,2,1,1
chr1	117146571	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=148,91;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0|1:117146563_G_A:117146563:0,2,1,1
chr1	117149135	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=124,122;MMQ=58,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:11,2:2,1:6,7,0,3
chr1	117150600	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=106,104;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:8,1:5,2:6,9,2,1
chr1	117150617	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=108,125;MMQ=58,59;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:6,6,1,1
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=148,134;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:2,3:0|1:117150928_C_T:117150928:2,4,0,4
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,134;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:117150928_C_T:117150928:2,4,0,4
chr1	117156418	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=122,109;MMQ=52,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,1:11,3:13,4,3,1
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=120,124;MMQ=58,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,5:14,2:10,10,2,5
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=120,137;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:8,4:12,1:7,13,1,4
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=133,99;MMQ=54,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:2,6,0,3
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=126,109;MMQ=57,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,0,2
chr1	117158898	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=163,118;MMQ=37,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:117158898_C_T:117158898:1,6,2,0
chr1	117158909	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=156,101;MMQ=31,24;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0|1:117158898_C_T:117158898:2,5,2,1
chr1	117158934	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=112,115;MMQ=25,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,3:2,0:0|1:117158898_C_T:117158898:3,1,3,1
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=113,129;MMQ=25,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:3,3,3,2
chr1	117159024	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=119,105;MMQ=33,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,3:1,1:2,2,1,3
chr1	117516885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,4:4,3:3,5,4,3
chr1	117556477	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr1	117559726	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	117568599	.	C	CCTCACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	117603188	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr1	117605130	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.402:14:4,2:2,1:0,8,2,4
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	117622217	.	G	GGAGCACACATAGACACC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=139,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.378:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	117622286	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,0:0,0,2,4
chr1	117624641	.	G	GAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117624641_G_GAAAA:117624641:0,1,0,1
chr1	117624644	.	A	AGGTCATGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:117624641_G_GAAAA:117624641:0,1,0,1
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	117631595	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=123,92;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:6,8,1,2
chr1	117640156	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117640156_C_A:117640156:0,0,0,1
chr1	117640158	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:117640156_C_A:117640156:0,0,0,1
chr1	117644058	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,2,2
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr1	117660728	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:3,2:7,5,1,1
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr1	117690495	.	A	AAATCAATGAATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117690495_A_AAATCAATGAATC:117690495:0,1,0,1
chr1	117690499	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:117690495_A_AAATCAATGAATC:117690495:0,1,0,1
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	118166436	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:7,2,1,2
chr1	118167498	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,3:5,0:7,1,3,0
chr1	118168234	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:4,2,3,3
chr1	118168804	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,1,2
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.513:19:7,6:2,3:2,7,4,6
chr1	118170528	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,114;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr1	118171000	.	CATTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr1	118171011	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:1,4:0,2,0,4
chr1	118491215	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	118530537	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=85,70;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:3,6,1,2
chr1	118617274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr1	118617311	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118617311_G_GAA:118617311:0,0,0,1
chr1	118617313	.	T	TTTTAAGCAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118617311_G_GAA:118617311:0,0,0,1
chr1	118617316	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118617311_G_GAA:118617311:0,0,0,1
chr1	118617318	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118617311_G_GAA:118617311:0,0,0,1
chr1	118623681	.	TACACAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=104,79;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AC;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.574:7:0,1:0,3:1,2,2,2
chr1	118628736	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:118628736_G_GTT:118628736:2,1,1,1
chr1	118628737	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:118628736_G_GTT:118628736:2,1,1,1
chr1	118628740	.	T	TGTTGCCTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:118628736_G_GTT:118628736:2,1,1,1
chr1	118628742	.	A	ATTCAACTCAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:118628736_G_GTT:118628736:2,1,1,1
chr1	118635936	.	T	TGCCATTAAATCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr1	118644430	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr1	119428118	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=95,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:7,7,1,2
chr1	119433649	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=165,808;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:119433649_C_CT:119433649:0,1,1,0
chr1	119433651	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=165,808;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:119433649_C_CT:119433649:0,1,1,0
chr1	119433654	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=165,808;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:0,0:0,1:0|1:119433649_C_CT:119433649:0,1,1,0
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr1	119467243	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr1	119929429	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,3:4,4,4,3
chr1	119934919	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr1	119958101	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=50,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:5,6,2,0
chr1	120168763	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120168763_G_C:120168763:0,1,0,1
chr1	120168768	.	A	AGTCAACACCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:120168763_G_C:120168763:0,0,0,1
chr1	120279911	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.327:9:3,0:2,0:1,5,0,3
chr1	120283180	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:120283180_A_AG:120283180:1,2,0,1
chr1	120283181	.	T	TAGAATGGATTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:120283180_A_AG:120283180:1,3,0,1
chr1	120283184	.	G	GTGGAATGGAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:120283180_A_AG:120283180:1,3,0,1
chr1	120285451	.	G	GAAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:120285451_G_GAAT:120285451:4,0,1,1
chr1	120285452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=154,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:0|1:120285451_G_GAAT:120285451:4,0,1,1
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,7:1,2:0,1,5,4
chr1	120296043	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:2,1:5,1:0|1:120296043_CA_C:120296043:1,6,0,2
chr1	120296051	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:2,1:5,1:0|1:120296043_CA_C:120296043:1,6,0,2
chr1	120296053	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:2,1:5,1:0|1:120296043_CA_C:120296043:1,6,0,2
chr1	120311509	.	GC	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=128,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:120311509_GC_CA:120311509:2,4,1,1
chr1	120311513	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=128,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:120311509_GC_CA:120311509:2,4,1,1
chr1	120311515	.	A	ACTGGTTTTACACATATCTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:120311509_GC_CA:120311509:1,4,1,1
chr1	120336876	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:1,3,1,3
chr1	120341274	.	C	CTACGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	120341279	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	120379977	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=102,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,3:11,0:4,11,0,3
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,3,14
chr1	120437765	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	120458191	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120458191_G_T:120458191:2,2,0,1
chr1	120458194	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120458191_G_T:120458191:2,2,0,1
chr1	120458196	.	G	GAGTAGTCTGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120458191_G_T:120458191:2,2,0,1
chr1	120458203	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:120458203_C_T:120458203:2,2,0,1
chr1	120458206	.	A	AACATAAAGCTGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=153,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:120458203_C_T:120458203:1,2,0,1
chr1	120458364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	120458633	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120458633_C_A:120458633:0,1,0,1
chr1	120458635	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120458633_C_A:120458633:0,1,0,1
chr1	120458638	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120458633_C_A:120458633:0,1,0,1
chr1	120458640	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120458633_C_A:120458633:0,1,0,1
chr1	120459031	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:1,2,2,0
chr1	120459074	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	120510920	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120510944	.	A	ACTCCACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,129;MMQ=27,29;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:9,0,2,0
chr1	143767778	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=87,124;MMQ=51,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,1:12,5:12,10,1,5
chr1	143767943	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=191,125;MMQ=24,23;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:3,4:1,5:2,2,4,6
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:3,2:10,2:10,3,3,1
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,2:8,6:9,4,6,2
chr1	144014051	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:4,4:4,8,3,5
chr1	144014068	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:1,7,2,5
chr1	144618000	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=124,141;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:144618000_G_A:144618000:4,3,2,0
chr1	144618009	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=123,145;MMQ=45,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:144618000_G_A:144618000:5,1,3,0
chr1	144618070	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=113,115;MMQ=32,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:5,2:10,4:12,3,4,2
chr1	144618354	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,121;MMQ=21,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr1	144619957	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=221,101;MMQ=43,20;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	144816724	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,147;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr1	144828454	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=103,108;MMQ=55,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,0:6,3:6,2,1,2
chr1	144828484	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=134,124;MMQ=45,32;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:144828484_G_A:144828484:10,2,0,2
chr1	144828497	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=135,124;MMQ=40,32;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:144828484_G_A:144828484:9,2,0,2
chr1	144828748	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=136,111;MMQ=40,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,0:5,3:8,7,2,1
chr1	144828764	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=136,118;MMQ=52,22;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,0:4,4:3,10,2,2
chr1	144828784	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=146,111;MMQ=52,22;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,1:5,2:1,12,1,2
chr1	144852390	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=126,79;MMQ=52,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,3,2
chr1	144852450	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=126,92;MMQ=49,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr1	144852476	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=126,92;MMQ=40,33;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.346:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	144852525	.	A	AGTGGAAGGGACCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=176,149;MMQ=45,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=123,142;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:5,3,3,0
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:5,2:0|1:144854087_A_G:144854087:6,2,2,1
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:2,1:6,2:0|1:144854087_A_G:144854087:7,2,3,1
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=171,156;MMQ=30,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:0|1:144854491_T_G:144854491:5,1,3,0
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=171,156;MMQ=30,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:0|1:144854491_T_G:144854491:5,1,3,0
chr1	144854597	.	TC	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:0,3:2,4,2,5
chr1	144855812	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=118,140;MMQ=52,40;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:1,8,0,3
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,158;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:5,5:8,4:3,10,2,8
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,141;MMQ=58,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=129,122;MMQ=46,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,2,2
chr1	144864162	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=121,114;MMQ=43,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.129:33:11,0:15,3:13,16,1,3
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:1,7,2,5
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=156,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:0,5,1,2
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=98,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0|1:144871889_A_C:144871889:1,4,1,7
chr1	144871925	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:144871889_A_C:144871889:0,4,0,1
chr1	144871928	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:144871889_A_C:144871889:0,4,0,1
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:8,5,2,1
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chr1	144873935	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,2:17,0:0|1:144873933_G_A:144873933:13,15,1,1
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:8,1:8,5:8,10,1,5
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=131,141;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:1,10,1,3
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,2,1
chr1	144874760	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=120,138;MMQ=60,56;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:5,4:2,1:4,4,5,1
chr1	144876124	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=104,164;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876124_G_A:144876124:0,1,0,1
chr1	144876127	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=104,164;MMQ=40,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:144876124_G_A:144876124:0,1,0,1
chr1	144880832	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.265:21:10,2:6,3:6,10,4,1
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:5,1,7,1
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:2,1,1,4
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=105,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:2,2,3,5
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=149,181;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:3,6:2,2:5,0,9,0
chr1	144892368	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:5,3,0,3
chr1	144903183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr1	144909956	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,15:0.265:58:25,6:18,8:20,23,6,9
chr1	144912153	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,22:0,10:0,0,19,13
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:144916486_T_G:144916486:2,0,3,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:144916486_T_G:144916486:3,0,3,0
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,128;MMQ=40,33;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,8:0.180:48:10,5:29,3:19,21,3,5
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=128,131;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.535:54:5,14:20,14:15,10,14,15
chr1	144919008	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=146,155;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=208,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:1,2,0,3
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=68.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,7:0,8:0,0,6,11
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:8,10:7,4:12,3,13,2
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.407:35:11,11:9,3:13,8,9,5
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,2,5
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=100.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,18:0,0,8,23
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,3:7,5:2,13,2,6
chr1	145016035	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:9,1:11,2:5,16,0,3
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,1:8,5:9,1,5,1
chr1	145021150	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,5:0.105:55:18,1:30,4:22,28,0,5
chr1	145021183	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=110,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:14,1:18,3:12,20,0,4
chr1	145039562	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,1:2,5:4,5,5,1
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=144,12198907;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:13,1,1,1
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,5:8,4:10,3,8,1
chr1	145074975	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:17,7:13,4:22,9,8,3
chr1	145075668	.	C	CAGACCCCAGAATGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=127,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,0:6,1,1,1
chr1	145075683	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:5,2,2,0
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:7,2,5,1
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:10,3:4,2:13,1,5,0
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:145112284_CCG_C:145112284:7,0,2,0
chr1	145112287	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:145112284_CCG_C:145112284:7,0,2,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:8,3,2,1
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr1	145115810	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.453:38:9,9:11,8:0|1:145115810_A_G:145115810:10,11,9,8
chr1	145115815	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,7:0.185:41:16,3:17,4:0|1:145115810_A_G:145115810:19,15,2,5
chr1	145115820	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.244:39:14,4:15,5:0|1:145115810_A_G:145115810:16,14,6,3
chr1	145273302	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,126;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,12:0.196:64:23,7:29,5:34,18,9,3
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=115,120;MMQ=51,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.313:49:9,8:25,7:10,24,4,11
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,124;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:3,1:7,2:1,9,1,3
chr1	145281473	.	T	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,125;MMQ=52,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,7:0.121:64:33,3:24,4:29,28,3,4
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=163,144;MMQ=40,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:9,8:5,2:2,12,2,8
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,146;MMQ=57,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,1:14,2:1,29,0,3
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,3:10,2:14,4,4,1
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=116,149;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.313:46:12,5:20,8:22,10,11,3
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=121,150;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.156:49:16,5:23,2:31,11,4,3
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=120,150;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,18:0.274:67:20,12:29,6:29,20,10,8
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=121,140;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,13:0.186:73:28,9:32,4:31,29,10,3
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=77;ECNT=7;MBQ=24,34;MFRL=121,167;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,5:0.076:77:35,2:35,3:0|1:145290401_T_G:145290401:39,33,4,1
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=121,167;MMQ=52,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,5:0.076:77:32,2:35,3:0|1:145290401_T_G:145290401:37,35,4,1
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=113,168;MMQ=52,47;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,6:0.107:63:20,3:36,3:24,33,1,5
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,164;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,1:18,2:11,21,1,2
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,136;MMQ=49,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	145298416	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	145414937	.	G	GACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145414937_G_GACC:145414937:0,1,0,1
chr1	145414938	.	T	TGGGACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145414937_G_GACC:145414937:0,1,0,1
chr1	145439713	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:4,7,0,2
chr1	145456732	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:1,1:1,3:0,7,0,4
chr1	145457689	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:145457689_G_GA:145457689:0,1,0,1
chr1	145457691	.	TT	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145457689_G_GA:145457689:0,1,0,1
chr1	145457695	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,26;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:145457689_G_GA:145457689:0,1,0,1
chr1	145457699	.	A	ACCATTCTTGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:145457689_G_GA:145457689:0,1,0,1
chr1	145457702	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145457689_G_GA:145457689:0,0,0,1
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	145477233	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:145477233_GC_G:145477233:0,1,0,1
chr1	145477237	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145477233_GC_G:145477233:0,1,0,1
chr1	145518176	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:10,3:12,10,1,2
chr1	145522865	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=109,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:2,0:4,3:4,4,0,3
chr1	145522877	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=107,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:2,3,0,3
chr1	145522886	.	C	CACTGCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=97,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	145522913	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:145522913_G_C:145522913:0,2,0,1
chr1	145522914	.	C	CTCCACCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:145522913_G_C:145522913:0,2,0,1
chr1	145527683	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=104,277;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:8,8,0,3
chr1	145528131	.	T	TGTCTGCTAGGCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:145528131_T_TGTCTGCTAGGCG:145528131:4,0,0,1
chr1	145528134	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:145528131_T_TGTCTGCTAGGCG:145528131:4,0,0,1
chr1	145534793	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,31;MFRL=178,173;MMQ=40,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	145536202	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:145536202_G_A:145536202:0,2,0,1
chr1	145536203	.	A	ATAGTCATTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:145536202_G_A:145536202:0,3,0,1
chr1	145536206	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:145536202_G_A:145536202:0,4,0,1
chr1	145539155	.	T	TAAGAGGAAGGTTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr1	145539501	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,1426;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr1	145555653	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr1	145560226	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,92;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:9,7,1,2
chr1	145561594	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr1	145578497	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	145581663	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,145;MMQ=43,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	145585706	.	T	TTCCGGGGTCCCTCCTTCCAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	145586786	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:145586786_G_A:145586786:6,5,1,1
chr1	145586789	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:145586786_G_A:145586786:6,5,1,1
chr1	145587907	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=186,209;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:145587907_C_A:145587907:0,3,0,1
chr1	145587917	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=186,209;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:145587907_C_A:145587907:0,3,0,1
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr1	145589314	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr1	145594832	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	145609394	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:145609394_T_TA:145609394:0,1,0,1
chr1	145609395	.	T	TTAATC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145609394_T_TA:145609394:0,1,0,1
chr1	145609398	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145609394_T_TA:145609394:0,0,0,1
chr1	145609400	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145609394_T_TA:145609394:0,0,0,1
chr1	145609402	.	T	TGCCTTTAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145609394_T_TA:145609394:0,0,0,1
chr1	145682189	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:145682189_C_T:145682189:0,1,0,1
chr1	145682193	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:145682189_C_T:145682189:0,1,0,1
chr1	145684780	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	145816707	.	CGGAGAAGATCACCTGTA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=131,176;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:145816707_CGGAGAAGATCACCTGTA_C:145816707:4,0,0,1
chr1	145816727	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=131,176;MMQ=27,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:145816707_CGGAGAAGATCACCTGTA_C:145816707:4,0,0,1
chr1	146466146	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	146633933	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=121,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	146643555	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,0:8,6:8,10,4,2
chr1	146656292	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	146696652	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=137,89;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:146696652_G_A:146696652:1,3,0,1
chr1	146696655	.	T	TGAACTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=137,89;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:146696652_G_A:146696652:1,3,0,1
chr1	146696706	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	146696708	.	T	TTATTG,TCGAATGCCACGGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26,29;MFRL=0,135,88;MMQ=60,60,60;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.454,0.333:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr1	146737540	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr1	146740569	.	G	GAGAGTTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146740569_G_GAGAGTTTGTT:146740569:0,1,0,1
chr1	146740570	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146740569_G_GAGAGTTTGTT:146740569:0,1,0,1
chr1	146740575	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146740569_G_GAGAGTTTGTT:146740569:0,1,0,1
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	146748008	.	CAGCCA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	146751837	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=92,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:6,4:10,0:10,6,5,0
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	146758240	.	A	AGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146758240_A_AGGC:146758240:0,1,0,1
chr1	146758243	.	A	AGCTTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:146758240_A_AGGC:146758240:0,1,0,1
chr1	146759428	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=157,187;MMQ=57,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr1	146765218	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:146765218_C_T:146765218:0,0,1,0
chr1	146765222	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146765218_C_T:146765218:1,0,1,0
chr1	146765456	.	T	TATTAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:146765456_T_TATTAA:146765456:0,4,1,1
chr1	146765457	.	G	GTGGGATCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=171,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:146765456_T_TATTAA:146765456:0,4,1,1
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	146766299	.	T	TTAATTTGTGTTTTTCTAACTGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	147085066	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	147086504	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=81,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	147090674	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:5,3,2,0
chr1	147092252	.	T	TCTAAAGTGGCCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=229,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	147092881	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	147096481	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	147096505	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:147096505_CGG_C:147096505:1,3,0,1
chr1	147096511	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:147096505_CGG_C:147096505:1,3,0,1
chr1	147096514	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:147096505_CGG_C:147096505:1,3,0,1
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	147119273	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr1	147120251	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=221,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:147120251_AG_A:147120251:0,1,0,1
chr1	147120254	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=221,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:147120251_AG_A:147120251:0,1,0,1
chr1	147126329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:147126329_C_T:147126329:6,2,1,1
chr1	147126337	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:147126329_C_T:147126329:8,2,1,1
chr1	147126341	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=116,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,1:0|1:147126329_C_T:147126329:8,2,1,1
chr1	147131091	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,3:15,0:13,14,0,3
chr1	147131150	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:8,3:2,12,1,2
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=106,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,8:4,0:1,6,4,4
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	147231371	.	C	CAGCTCTAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=119,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	147231400	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=119,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147231400_A_G:147231400:0,1,0,1
chr1	147231407	.	AA	GC,ACAGACAGACAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28,26;MFRL=0,119,184;MMQ=60,60,60;MPOS=3,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr1	147231409	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=119,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147231400_A_G:147231400:0,1,0,1
chr1	147408864	.	C	CTGTTTGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=119,797103;MMQ=45,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:147408864_C_CTGTTTGG:147408864:1,4,2,0
chr1	147408866	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=119,797103;MMQ=45,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:147408864_C_CTGTTTGG:147408864:1,4,2,0
chr1	147416227	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,139;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,1:6,4:7,5,2,3
chr1	148009601	.	G	GAGAGAGAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:9,2:11,0:0|1:148009601_G_GAGAGAGAA:148009601:5,17,0,2
chr1	148009605	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,2:10,0:0|1:148009601_G_GAGAGAGAA:148009601:5,17,0,2
chr1	148009607	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:9,0:0|1:148009601_G_GAGAGAGAA:148009601:5,15,0,2
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,85;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,3,0
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,129;MMQ=43,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	148756363	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148756363_A_G:148756363:0,0,1,0
chr1	148756384	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148756363_A_G:148756363:0,0,1,0
chr1	148756397	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148756363_A_G:148756363:0,0,1,0
chr1	149459518	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=103,132;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,1:5,3:5,6,2,2
chr1	149876540	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=89,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,2,0
chr1	149879380	.	A	ATATCCACT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:149879380_A_ATATCCACT:149879380:5,3,1,1
chr1	149879382	.	G	GGAGATTCCACAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,0:0|1:149879380_A_ATATCCACT:149879380:5,3,1,1
chr1	149881136	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=73,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr1	149881170	.	A	ATTTTGCTAATGCAGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:1,1,0,1
chr1	149885437	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=208,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149885437_T_G:149885437:0,1,0,1
chr1	149885439	.	T	TGACCTCCCCTGCTGACC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=208,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149885437_T_G:149885437:0,1,0,1
chr1	149885441	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=208,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149885437_T_G:149885437:0,1,0,1
chr1	149885443	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:149885437_T_G:149885437:0,1,0,2
chr1	149885445	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:149885437_T_G:149885437:0,1,0,2
chr1	149895540	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:4,2:3,0:6,3,2,0
chr1	149897630	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	149901274	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=235,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:149901274_CTA_C:149901274:0,2,0,1
chr1	149901277	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=235,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:149901274_CTA_C:149901274:0,2,0,1
chr1	149901283	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=275,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149901274_CTA_C:149901274:0,1,0,1
chr1	149905279	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:1,5,2,5
chr1	149908452	.	CC	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=83,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	150040779	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:12,4:8,0:7,13,4,0
chr1	150048380	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:8,10,0,2
chr1	150082732	.	A	ACCACACACACACACCACACACAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=137,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:9,2:6,0:3,12,0,2
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	150199063	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=97,66;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:0,2:13,0:0|1:150199063_T_C:150199063:1,12,1,1
chr1	150199069	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=97,66;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:0,2:11,0:0|1:150199063_T_C:150199063:1,11,1,1
chr1	150199070	.	T	TCCTCCTC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=97,66;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:0,2:10,0:0|1:150199063_T_C:150199063:1,10,1,1
chr1	150199071	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=97,66;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:0,1:10,0:0|1:150199063_T_C:150199063:1,10,1,1
chr1	150201514	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:5,4,2,0
chr1	150202869	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,149;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:6,1,3,0
chr1	150203082	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150234090	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150248312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=149,132;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0|1:150248312_A_G:150248312:0,5,0,2
chr1	150248318	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=158,143;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:150248312_A_G:150248312:0,4,0,1
chr1	150248320	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=158,143;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:150248312_A_G:150248312:0,4,0,1
chr1	150256724	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,159;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr1	150257166	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:150257166_A_AC:150257166:0,3,0,1
chr1	150257168	.	G	GCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:150257166_A_AC:150257166:0,3,0,1
chr1	150258824	.	CA	TT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=123,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:9,1,1,1
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:7,1,4,2
chr1	150259400	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr1	150315719	.	AAAAAAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,4:1,1:4,0,4,2
chr1	150316989	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,120;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:12,0:14,9,4,0
chr1	150429669	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150429683	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150432802	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,1,3
chr1	150432870	.	GGTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GTT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	150445688	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=111,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:7,3:11,0:6,12,1,2
chr1	150445819	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.480:19:2,4:7,5:7,3,7,2
chr1	150463218	.	AGGAGGAGAATGATTCTGGGATGGTTTCTGAGGCTCTTTTCAGGGGCCTTGGGCATGCTCCATTTGGATGAGGAAGCT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.358:12:2,1:2,4:0,6,4,2
chr1	150463294	.	C	CCTCAAATTAGAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	150465015	.	TG	CA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=126,130;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:6,2:3,14,0,2
chr1	150465025	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=131,122;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,0:5,2:1,13,0,2
chr1	150469151	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:150469151_A_G:150469151:0,3,0,1
chr1	150469155	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:150469151_A_G:150469151:0,3,0,1
chr1	150469156	.	T	TGGAGGGAGCCGAGGGAGCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:150469151_A_G:150469151:0,3,0,1
chr1	150469480	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150469480_C_A:150469480:0,0,0,1
chr1	150469482	.	GGCAC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150469480_C_A:150469480:0,0,0,1
chr1	150470172	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:150470172_G_T:150470172:2,0,0,1
chr1	150470173	.	G	GACATTTACTAAAATTACTGTTTGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:150470172_G_T:150470172:2,0,0,1
chr1	150471183	.	T	TTCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150471183_T_TTCTC:150471183:0,1,0,1
chr1	150471191	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150471183_T_TTCTC:150471183:0,1,0,1
chr1	150471192	.	C	CTTTCTTTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150471183_T_TTCTC:150471183:0,1,0,1
chr1	150471195	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150471183_T_TTCTC:150471183:0,1,0,1
chr1	150471848	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=159,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	150476941	.	C	CCCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:150476941_C_CCCAA:150476941:1,2,0,1
chr1	150476942	.	T	TGGCTGTACCTC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:150476941_C_CCCAA:150476941:1,2,0,1
chr1	150476946	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:150476941_C_CCCAA:150476941:1,1,0,1
chr1	150476948	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:150476948_G_C:150476948:1,2,0,1
chr1	150476950	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=93,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:150476948_G_C:150476948:1,1,0,1
chr1	150477061	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:2,2:3,0:4,1,2,1
chr1	150482738	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr1	150484395	.	ACC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	150524705	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,1,0
chr1	150525554	.	CGG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.241:6:4,0:1,0:1,4,1,0
chr1	150526135	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:1,0:3,2:2,3,1,1
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	150530155	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:150530155_C_CA:150530155:0,1,1,1
chr1	150530156	.	C	CGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:150530155_C_CA:150530155:0,1,1,1
chr1	150530160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=98,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:150530155_C_CA:150530155:0,1,1,1
chr1	150531468	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr1	150531970	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	150621258	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=115,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	150634472	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	150636134	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=118,96;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:4,0:5,3:5,5,1,2
chr1	150727394	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr1	150771703	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,2,13
chr1	150779306	.	A	AGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr1	150790552	.	A	AACTTACAATTGGATTTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150799112	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=86,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.424:38:7,8:14,8:16,6,11,5
chr1	150804403	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr1	150807176	.	G	GGATCACGAGGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=157,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	150807181	.	A	ATATTGCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150807181_A_ATATTGCAG:150807181:0,1,0,1
chr1	150807187	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150807181_A_ATATTGCAG:150807181:0,1,0,1
chr1	150849071	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.771:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	150921773	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,0:2,5:2,3,0,5
chr1	150922009	.	A	AATATAATTGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=209,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150922009_A_AATATAATTGAG:150922009:1,0,0,1
chr1	150922014	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=209,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150922009_A_AATATAATTGAG:150922009:1,0,0,1
chr1	150934670	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=26,18;MFRL=127,92;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:15,0:8,1:0|1:150934670_A_G:150934670:4,20,1,1
chr1	150934675	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=127,93;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:150934675_T_C:150934675:3,20,1,1
chr1	150934676	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=127,92;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:9,2:0|1:150934670_A_G:150934670:4,20,1,1
chr1	150934677	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=127,93;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:150934675_T_C:150934675:3,20,1,1
chr1	150934683	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=130,93;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:7,2:0|1:150934675_T_C:150934675:0,20,1,1
chr1	150934684	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=130,93;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:7,1:0|1:150934675_T_C:150934675:0,20,1,1
chr1	150934714	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=142,122;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:150934714_A_G:150934714:0,5,0,2
chr1	150934720	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=140,126;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:150934714_A_G:150934714:0,4,0,1
chr1	150935668	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:0|1:150935668_A_C:150935668:1,4,1,1
chr1	150935670	.	A	ATGCTAAAAGATCTCTGAGTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0|1:150935668_A_C:150935668:1,4,1,1
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chr1	150940689	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,801;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150960888	.	TTATGTAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0|1:150960888_TTATGTAA_T:150960888:0,2,0,1
chr1	150960899	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150960888_TTATGTAA_T:150960888:0,2,0,1
chr1	150970195	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:2,3,1,1
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:0,1:5,1:5,0,1,2
chr1	150981270	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150990306	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:6,3:13,0:7,14,0,3
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr1	151009984	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	151011543	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr1	151015868	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=93,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,3:2,6:1,1,5,4
chr1	151015962	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	151018388	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0|1:151018388_T_C:151018388:0,3,0,1
chr1	151018393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151018388_T_C:151018388:0,3,0,1
chr1	151018397	.	CCCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151018388_T_C:151018388:0,3,0,1
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,3,1
chr1	151028146	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:15,8,1,1
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,5:0,18:0,0,8,15
chr1	151062957	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,2:2,1:4,4,2,1
chr1	151070252	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	151107790	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:151107790_GGT_G:151107790:0,2,0,1
chr1	151107796	.	G	GAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151107790_GGT_G:151107790:0,2,0,1
chr1	151107798	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151107790_GGT_G:151107790:0,2,0,1
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=81,134578706;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:2,1:1,0:2,1,2,0
chr1	151115180	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:151115180_G_A:151115180:0,3,0,1
chr1	151115183	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:151115180_G_A:151115180:0,3,0,1
chr1	151115186	.	CG	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:151115180_G_A:151115180:0,3,0,1
chr1	151131091	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:4,0,4,0
chr1	151134561	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,1:12,2:6,12,1,2
chr1	151134579	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:3,2:4,3:0,8,1,4
chr1	151139083	.	T	TTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:151139083_T_TTTCA:151139083:0,3,0,1
chr1	151139088	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:151139083_T_TTTCA:151139083:0,4,0,1
chr1	151140915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	151142917	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=96,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	151143166	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	151149186	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=158,178;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,4:6,0:7,4,4,0
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,1,11
chr1	151199741	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr1	151208935	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151208935_G_A:151208935:1,0,1,0
chr1	151208937	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151208935_G_A:151208935:1,0,1,0
chr1	151208941	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151208935_G_A:151208935:1,0,1,0
chr1	151208944	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151208935_G_A:151208935:1,0,1,0
chr1	151208947	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151208935_G_A:151208935:1,0,1,0
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	151212399	.	C	CCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	151252784	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151252784_G_C:151252784:0,2,0,1
chr1	151252790	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151252784_G_C:151252784:0,2,0,1
chr1	151254664	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151254664_C_CCA:151254664:0,1,0,1
chr1	151254666	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151254664_C_CCA:151254664:0,1,0,1
chr1	151262298	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:3,3,2,1
chr1	151276211	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=180,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151276211_A_T:151276211:0,1,0,1
chr1	151276212	.	T	TTTACCGCCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151276211_A_T:151276211:0,1,0,1
chr1	151288974	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,111;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,0,4
chr1	151316279	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:0|1:151316279_G_C:151316279:7,13,0,2
chr1	151316284	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:151316279_G_C:151316279:7,13,0,2
chr1	151317179	.	T	TGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=143,168;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:151317179_T_TGC:151317179:0,4,2,0
chr1	151317183	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:1,1:0|1:151317179_T_TGC:151317179:0,5,2,0
chr1	151317186	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:151317179_T_TGC:151317179:0,3,2,0
chr1	151317190	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:151317179_T_TGC:151317179:0,3,1,0
chr1	151336934	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=89,79;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:0,0:3,0,1,1
chr1	151337767	.	GA	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:151337767_GA_AT:151337767:1,3,0,1
chr1	151337771	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:151337767_GA_AT:151337767:0,3,0,1
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,14,8
chr1	151374025	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr1	151380727	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=100,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,0,2
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:0,1,2,2
chr1	151384052	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:1,1:3,1,2,1
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151384711_A_G:151384711:1,0,1,0
chr1	151384719	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:151384711_A_G:151384711:1,0,1,0
chr1	151384733	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,3,2
chr1	151491532	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	151496607	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	151505088	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:2,1:0|1:151505088_C_T:151505088:2,1,0,1
chr1	151505093	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=80,116;MMQ=57,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151505088_C_T:151505088:1,1,0,1
chr1	151505101	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=80,116;MMQ=57,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:151505088_C_T:151505088:1,1,0,1
chr1	151505107	.	T	TCGTTAATCCAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:151505088_C_T:151505088:1,2,0,1
chr1	151508061	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	151534719	.	G	GCCCAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151534719_G_GCCCAAT:151534719:0,1,0,1
chr1	151534725	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151534719_G_GCCCAAT:151534719:0,1,0,1
chr1	151535020	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TC;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr1	151535042	.	CTCA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:3,2,0,3
chr1	151538595	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,16;MFRL=142,67;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.273:8:4,0:2,0:4,2,1,1
chr1	151538801	.	T	TGTGCCTATCTTCTGTCTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:151552301_TG_T:151552301:0,0,1,5
chr1	151552311	.	T	TGATGGTTTTGTTACATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.315:4:2,1:1,0:0|1:151552301_TG_T:151552301:0,3,0,1
chr1	151553569	.	GGGACAGAGCTCTGTAGAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151553569_GGGACAGAGCTCTGTAGAA_G:151553569:0,3,0,1
chr1	151553577	.	G	GGAAAGAAAGGAATCCAGGATGATTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:151553569_GGGACAGAGCTCTGTAGAA_G:151553569:0,1,0,1
chr1	151665911	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:4,4,0,2
chr1	151666826	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.310:13:4,4:5,0:9,0,3,1
chr1	151679031	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151679031_A_G:151679031:0,0,0,1
chr1	151679032	.	A	AGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151679031_A_G:151679031:0,0,0,1
chr1	151679800	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=92,24727721;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:7,10,1,1
chr1	151679900	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	151681635	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	151686983	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	151688548	.	C	CTCTTGATGAAGAGAAACATATAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	151701345	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr1	151732700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,2,2
chr1	151735718	.	C	CACTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=103,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr1	151742573	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:0,2:2,0,2,1
chr1	151748015	.	G	A,GGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20,20;MFRL=121,89,67;MMQ=60,60,60;MPOS=12,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.02,3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.267:8:3,2,2:1,0,0:1,3,2,2
chr1	151748017	.	C	CAAGCGATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=103,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:4,1:1,0:2,4,1,1
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	151751090	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=100,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	151751092	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=100,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	151753859	.	ATGTGAATGTTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	151773971	.	G	GATGGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151773971_G_GATGGGA:151773971:0,1,0,1
chr1	151773973	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151773971_G_GATGGGA:151773971:0,1,0,1
chr1	151774255	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	151789647	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr1	151789826	.	T	TTTCAGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151789826_T_TTTCAGTG:151789826:0,0,0,1
chr1	151789829	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:151789826_T_TTTCAGTG:151789826:0,1,0,1
chr1	151789831	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,24;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:151789826_T_TTTCAGTG:151789826:0,1,0,1
chr1	151789847	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,1476781;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	151811226	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151861926	.	C	CCGCCTCCTTTCTAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,110;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:151861926_C_CCGCCTCCTTTCTAAA:151861926:0,2,0,1
chr1	151861928	.	G	GCAGCGACCTCTGTTCTTCAGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=160,110;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:151861926_C_CCGCCTCCTTTCTAAA:151861926:0,2,0,1
chr1	152058049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr1	152058755	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=115,118;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,4:5,0:5,7,4,0
chr1	152058773	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=115,118;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:6,7,4,0
chr1	152085000	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152085000_T_C:152085000:1,1,0,1
chr1	152085007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152085000_T_C:152085000:1,1,0,1
chr1	152085313	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:7,4:4,7,2,2
chr1	152085505	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	152130383	.	A	ATCACAATCCTCCTGGATGAGATCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=186,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	152130410	.	C	CCATTGAATATTAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	152185704	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:7,2:10,8,1,1
chr1	152185762	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,74;MMQ=60,50;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,1,1
chr1	152185768	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,74;MMQ=60,50;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,1,1
chr1	152185774	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,1
chr1	152185780	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,1
chr1	152187787	.	G	GACTGACGGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,160;MMQ=24,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	152192687	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=454,110;MMQ=60,54;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,4,3
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	152275601	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:152275601_CTG_C:152275601:3,0,0,1
chr1	152275604	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:152275601_CTG_C:152275601:3,0,0,1
chr1	152276616	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=101,0;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:8,2:5,7,0,3
chr1	152278698	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=149,140;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,0,1
chr1	152278735	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=138,139;MMQ=40,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	152280366	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,3789;MMQ=27,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:3,3,3,0
chr1	152280616	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,87;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:9,9,0,2
chr1	152286885	.	T	TGCTAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,2:10,0:10,7,0,2
chr1	152327761	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,94;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:4,2:0|1:152327761_C_G:152327761:10,5,1,1
chr1	152327777	.	GT	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,94;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:4,2:0|1:152327761_C_G:152327761:9,9,1,1
chr1	152382119	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,0:2,3:3,1,1,2
chr1	152383046	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr1	152383276	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,2,1
chr1	152384498	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	152637150	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	152648847	.	GGGACTGAATGGCCAAGAACCTGCTAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.342:7:5,0:0,2:1,4,1,1
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=58.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,4:0,10:0,0,6,9
chr1	152691943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	152692948	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0|1:152692948_T_A:152692948:1,5,2,2
chr1	152692952	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:4,1:2,2:0|1:152692948_T_A:152692948:1,5,2,2
chr1	152732174	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,7:3,2:1,4,2,7
chr1	152732683	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=99,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:6,2:12,0:0|1:152732683_C_T:152732683:8,10,1,1
chr1	152732706	.	CAGCAGCT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:152732683_C_T:152732683:5,9,1,1
chr1	152732717	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,57;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:152732683_C_T:152732683:5,7,1,1
chr1	152733301	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,8:0,0,12,6
chr1	152734390	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:7,3:3,8:6,4,7,4
chr1	152749008	.	C	CCAGCTCTGGGGGCTGCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,77;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGCTCTGGGGGCTGCTG;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,0:1,0,1,2
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	152760543	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=179,108;MMQ=40,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:1,2,4,4
chr1	152760546	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=26,31;MFRL=116,179;MMQ=51,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr1	152760557	.	CGG	C	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=20,32;MFRL=116,179;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:152760557_CGG_C:152760557:4,5,0,2
chr1	152760561	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=20,29;MFRL=120,179;MMQ=52,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:152760557_CGG_C:152760557:4,6,0,2
chr1	152760566	.	CC	TT	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=116,179;MMQ=52,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:4,2:0|1:152760557_CGG_C:152760557:3,6,0,2
chr1	152760628	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	152760642	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:152760642_C_T:152760642:0,0,2,2
chr1	152760644	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,34;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:152760642_C_T:152760642:0,0,2,2
chr1	152760647	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:152760642_C_T:152760642:0,0,2,2
chr1	152760651	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,34;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:152760642_C_T:152760642:0,0,2,2
chr1	152770672	.	G	GAATTTGAAAGAAAAATATTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,103;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	152777574	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=83,107;MMQ=27,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:2,4:11,1:4,9,3,2
chr1	152777908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=102,139;MMQ=46,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,3:4,5:6,0,7,1
chr1	152815979	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:10,1,2,1
chr1	152815990	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=102,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:10,4,1,1
chr1	152884061	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=73,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:5,4,2,0
chr1	152945149	.	C	CGGTACAAAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	152957832	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=90,138;MMQ=39,51;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,4:0,8:1,1,1,13
chr1	152975941	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,6:0,12:0,0,15,3
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,22,10
chr1	153004848	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.969:29:0,12:0,17:0|1:153004848_T_C:153004848:0,0,15,14
chr1	153004853	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.969:29:0,12:0,16:0|1:153004848_T_C:153004848:0,0,15,14
chr1	153066262	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=174,110;MMQ=56,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr1	153122301	.	G	GACAATAGATGCACATGATGGAGCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	153177641	.	TTGTTTTACAGCACTAAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr1	153191387	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=19,12;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:153191387_A_C:153191387:2,2,1,0
chr1	153191396	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:153191387_A_C:153191387:2,1,1,0
chr1	153191402	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=13,12;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:153191387_A_C:153191387:2,0,1,0
chr1	153191408	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:153191387_A_C:153191387:1,1,1,0
chr1	153191417	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=19,33;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:153191387_A_C:153191387:1,1,1,0
chr1	153191565	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr1	153233488	.	C	CGGCGGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGCGGT;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.439:7:2,2:2,1:0|1:153233488_C_CGGCGGT:153233488:1,3,0,3
chr1	153233510	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.623:6:1,2:1,2:1|0:153233488_C_CGGCGGT:153233488:0,2,1,3
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	153279730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr1	153317705	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	153333198	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=126,2675;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,3:10,0:8,8,0,3
chr1	153347127	.	C	CCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:153347127_C_CCTTT:153347127:0,2,0,1
chr1	153347130	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:153347127_C_CCTTT:153347127:0,2,0,1
chr1	153347133	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153347127_C_CCTTT:153347127:0,1,0,1
chr1	153362788	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,30;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr1	153362852	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=102,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,0:4,2:2,8,4,0
chr1	153362858	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=101,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,0:4,0:1,8,4,0
chr1	153520789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:0,0:0|1:153520789_A_G:153520789:3,0,1,0
chr1	153520797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:153520789_A_G:153520789:3,1,1,0
chr1	153535848	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=105,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.181:32:6,2:8,2:13,13,3,3
chr1	153536361	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	153580639	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	153588208	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:3,0,4,0
chr1	153600648	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=119,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.345:21:5,6:9,0:4,10,1,6
chr1	153600891	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:12,6,0,2
chr1	153603214	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=123,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,2,0
chr1	153604020	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=135,43;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,0:5,2:5,6,2,0
chr1	153604029	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,1:3,7:5,2,6,2
chr1	153615783	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=121,128;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,0:12,3:10,7,3,0
chr1	153635608	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:7,6,1,1
chr1	153636472	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:5,1,2,1
chr1	153640628	.	T	TAAATTGTTTTTCCCCGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	153642182	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=110,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	153642184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	153642186	.	GA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	153642187	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr1	153642197	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:4,1:0,0:5,0,1,0
chr1	153642372	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:1,6,1,5
chr1	153653614	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	153656352	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,23024846;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	153657529	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:2,8,0,2
chr1	153659843	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:3,1,0,2
chr1	153660500	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=89,55;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:2,7,4,0
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.772:16:3,3:0,4:2,1,7,6
chr1	153662063	.	G	GAAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153662063_G_GAAC:153662063:0,0,0,1
chr1	153662065	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153662063_G_GAAC:153662063:0,0,0,1
chr1	153662068	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153662063_G_GAAC:153662063:0,0,0,1
chr1	153662323	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr1	153727311	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153727311_G_GCC:153727311:0,0,0,1
chr1	153727312	.	A	AGGTAGATCAGGTACG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153727311_G_GCC:153727311:0,0,0,1
chr1	153730290	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153730294	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153730296	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153730301	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153730308	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153730312	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153730290_C_CCA:153730290:0,0,0,1
chr1	153732975	.	A	AGCAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	153746134	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,3:7,6:7,6,5,4
chr1	153746475	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=101,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.317:26:5,1:12,6:11,7,2,6
chr1	153784350	.	A	ATTGGGGGCAGATTTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=162,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	153785983	.	T	TTCCTCCTGTCATCATTCCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	153792014	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:153792014_A_G:153792014:3,0,1,0
chr1	153792015	.	T	TTGGCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:153792014_A_G:153792014:3,0,1,0
chr1	153792297	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,142;MMQ=60,52;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:153792297_G_A:153792297:0,2,0,1
chr1	153792299	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=179,142;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:153792297_G_A:153792297:0,2,0,1
chr1	153792302	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=179,142;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:153792297_G_A:153792297:0,2,0,1
chr1	153800786	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,373;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153903160	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	153903593	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=64,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153903593_G_A:153903593:0,2,0,1
chr1	153903595	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=64,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153903593_G_A:153903593:0,2,0,1
chr1	153903597	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=64,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153903593_G_A:153903593:0,2,0,1
chr1	153903599	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=64,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153903593_G_A:153903593:0,2,0,1
chr1	153903613	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153903613_A_AG:153903613:0,1,0,1
chr1	153903614	.	T	TGAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153903613_A_AG:153903613:0,1,0,1
chr1	153906075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:153906075_G_A:153906075:0,3,0,1
chr1	153906082	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:153906075_G_A:153906075:0,3,0,1
chr1	153906397	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr1	153911501	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=110,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:7,7,2,0
chr1	153912677	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr1	153913770	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=123,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:4,3:6,4:4,6,5,3
chr1	153913777	.	G	GTGACGTGGTCAGATCTGC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,2:6,0:7,8,1,1
chr1	153913916	.	CCT	GAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=74,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:153913916_CCT_GAG:153913916:1,3,0,1
chr1	153913921	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:153913916_CCT_GAG:153913916:1,2,0,1
chr1	153913928	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=79,159;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:153913916_CCT_GAG:153913916:1,1,0,1
chr1	153913949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=43855403,105;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	153923773	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,0:16,3:8,23,1,2
chr1	153925426	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=248,162;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153925426_G_A:153925426:0,1,0,1
chr1	153925434	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=248,162;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153925426_G_A:153925426:0,1,0,1
chr1	153925868	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:1,2:0,5,0,2
chr1	153926687	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr1	153927633	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,2,0
chr1	153954674	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=89,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:2,5,1,2
chr1	153954954	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:6,16,0,2
chr1	153955340	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=115,129;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:19,0:8,2:13,14,0,2
chr1	153963808	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr1	153965368	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=109,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.215:35:13,4:15,3:12,16,4,3
chr1	153967668	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	154042957	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154042958	.	AGT	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154042964	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154042968	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154042971	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154042976	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154042957_A_T:154042957:0,1,0,1
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	154072713	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=184,128;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:0|1:154072713_C_G:154072713:0,3,0,2
chr1	154072716	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=184,128;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:2,0:0|1:154072713_C_G:154072713:0,3,0,2
chr1	154072718	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=158,103;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:154072713_C_G:154072713:0,4,0,1
chr1	154072719	.	AGTTTAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=158,123;MMQ=60,54;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	154131618	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:154131618_GT_G:154131618:0,2,0,1
chr1	154131621	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154131618_GT_G:154131618:0,2,0,1
chr1	154131628	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154131618_GT_G:154131618:0,2,0,1
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=74,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0,2,1,7
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.185:37:16,3:12,3:0|1:154144673_GA_G:154144673:13,18,4,2
chr1	154144681	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,18:0.423:43:13,9:12,9:1|0:154144673_GA_G:154144673:12,13,7,11
chr1	154144919	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:6,1:11,2:4,13,1,2
chr1	154144950	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=150,126;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:0|1:154144950_C_T:154144950:0,12,0,2
chr1	154144954	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=150,126;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:154144950_C_T:154144950:0,10,0,2
chr1	154145006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr1	154145011	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,26;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:154145011_G_A:154145011:0,4,0,1
chr1	154145014	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,24;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:154145011_G_A:154145011:0,2,0,1
chr1	154145017	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,31;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154145011_G_A:154145011:0,1,0,1
chr1	154145022	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=29,22;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154145011_G_A:154145011:0,1,0,1
chr1	154145026	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,24;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154145011_G_A:154145011:0,1,0,1
chr1	154145532	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:6,2,7,3
chr1	154145708	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=170,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0|1:154145708_C_G:154145708:0,3,1,1
chr1	154145713	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=179,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:154145708_C_G:154145708:0,3,0,1
chr1	154145715	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=179,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:154145708_C_G:154145708:0,3,0,1
chr1	154145721	.	GTGTCGTCAGCTCCACTCCAA	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:0,0:1,1:0|1:154145721_GTGTCGTCAGCTCCACTCCAA_G:154145721:2,2,0,1
chr1	154145743	.	GGTCTCAGAACTGTA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:154145721_GTGTCGTCAGCTCCACTCCAA_G:154145721:2,2,0,1
chr1	154178227	.	CCA	TTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=171,175;MMQ=58,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	154186475	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=107,81;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:0|1:154186475_T_C:154186475:4,9,1,1
chr1	154186481	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=107,81;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:154186475_T_C:154186475:4,7,1,1
chr1	154186484	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=112,81;MMQ=60,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:154186475_T_C:154186475:3,7,1,1
chr1	154186489	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=112,81;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:154186475_T_C:154186475:3,7,1,1
chr1	154186491	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=112,81;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:154186475_T_C:154186475:3,7,1,1
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	154207158	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,0:3,2:8,2,1,1
chr1	154207642	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,1:7,1:8,7,1,1
chr1	154207669	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:11,6:12,0:11,13,6,0
chr1	154207834	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,3:4,0:0,8,0,3
chr1	154209169	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr1	154209490	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=94,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:5,1,3,2
chr1	154227292	.	GT	G,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=119,149,157;MMQ=60,60,60;MPOS=20,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.47,6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.272,0.364:8:2,1,0:1,1,3:3,0,5,0
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr1	154235648	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:154235648_C_T:154235648:7,15,0,2
chr1	154235652	.	GTTT	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=128,36;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:8,0:14,2:1|0:154235648_C_T:154235648:5,17,2,0
chr1	154245142	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	154293778	.	A	ATGGTGGCTCACACCCGTAATCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	154303664	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:154303664_C_CTT:154303664:0,2,0,1
chr1	154303666	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:154303664_C_CTT:154303664:0,2,0,1
chr1	154303705	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	154305190	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr1	154306732	.	A	ACTCTTACCCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:1,2:8,0:2,7,1,1
chr1	154319105	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:16,2:4,1:9,11,1,2
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	154321084	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	154321663	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	154401972	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr1	154402889	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	154402974	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,0:1,2:3,2,2,0
chr1	154407419	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	154407713	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	154422277	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	154427146	.	TATTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=123,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,2,0
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	154479446	.	T	TCTACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:154479446_T_TCTACC:154479446:1,2,0,1
chr1	154479448	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:154479446_T_TCTACC:154479446:1,2,0,1
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:154479657_C_CAT:154479657:0,0,4,0
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0|1:154479657_C_CAT:154479657:1,0,4,0
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	154494043	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154494043_T_A:154494043:0,1,0,1
chr1	154494045	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:154494043_T_A:154494043:0,1,0,1
chr1	154517217	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	154519800	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	154524973	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,7:7,1:7,8,3,5
chr1	154525393	.	GAAAGGATTAGGCACAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,0,1
chr1	154527348	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=50,203;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:1,0:1,2:1,3,0,2
chr1	154528256	.	TCAGGATCCCTTTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=87,133;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:2,1,1,0
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:10,3:4,2:9,5,3,2
chr1	154562004	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.473:2:1,1:0,0:0|1:154562004_T_TG:154562004:0,1,0,1
chr1	154562006	.	T	TGTCGGAGGTTCTCTTGAGCACAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154562004_T_TG:154562004:0,1,0,1
chr1	154575040	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	154842330	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:4,2:6,0:8,3,2,0
chr1	154901523	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=117,481;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,2,0
chr1	154901584	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=103,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:3,3,0,2
chr1	154909235	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:1,2,0,2
chr1	154919379	.	G	GGGTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	154926100	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,14;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,0:0,2,3,0
chr1	154926102	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=112,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:1,0:0|1:154926102_A_C:154926102:0,3,3,0
chr1	154926110	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,0:0|1:154926102_A_C:154926102:0,4,3,0
chr1	154926115	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,0:0|1:154926102_A_C:154926102:0,4,3,0
chr1	154926122	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=23,19;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,0:2,5,2,0
chr1	154932035	.	C	CTGTCTTCCTTCCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	154936531	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:7,3:6,0:7,6,2,1
chr1	154936782	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	154936807	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=131,169;MMQ=54,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0|1:154936807_T_G:154936807:1,1,0,2
chr1	154936808	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=131,169;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr1	154936813	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,23;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:154936807_T_G:154936807:1,2,0,1
chr1	154936815	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=131,145;MMQ=54,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154936807_T_G:154936807:1,1,0,1
chr1	154940690	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=104,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:5,3,5,0
chr1	154951296	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=177,227;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154951296_CCT_C:154951296:0,2,0,1
chr1	154951299	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=177,227;MMQ=40,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:154951296_CCT_C:154951296:0,2,0,1
chr1	155001929	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=89,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:1,1,0,4
chr1	155003589	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,473;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,4:7,0:6,4,0,4
chr1	155003792	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	155003987	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:0,0,1,0
chr1	155003989	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:0,0,1,0
chr1	155003991	.	T	TTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:0,0,1,0
chr1	155003995	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:1,0,1,0
chr1	155004000	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,34;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:1,0,1,0
chr1	155004005	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,33;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:155003987_A_C:155003987:1,0,1,0
chr1	155005642	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:5,8,1,1
chr1	155005833	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155005833_C_CT:155005833:2,1,0,1
chr1	155005835	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155005833_C_CT:155005833:2,1,0,1
chr1	155005838	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155005833_C_CT:155005833:2,1,0,1
chr1	155006091	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,3:5,2:7,3,3,2
chr1	155006450	.	CC	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	155012979	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,0:10,2:4,9,1,1
chr1	155014426	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	155026532	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155026532_AGG_A:155026532:2,2,0,1
chr1	155026536	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155026532_AGG_A:155026532:2,2,0,1
chr1	155026537	.	A	AAAAGTTAAAATTATAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155026532_AGG_A:155026532:2,2,0,1
chr1	155026538	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155026532_AGG_A:155026532:2,2,0,1
chr1	155026942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr1	155026968	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=89,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,1:4,3,1,2
chr1	155028802	.	CCCCTGAAGCTCTGACCACCGTGGCTTCTGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,1,0
chr1	155029009	.	TATGCACTGA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155029009_TATGCACTGA_T:155029009:0,1,0,1
chr1	155029021	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155029009_TATGCACTGA_T:155029009:0,0,0,1
chr1	155029024	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155029009_TATGCACTGA_T:155029009:0,0,0,1
chr1	155029026	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155029009_TATGCACTGA_T:155029009:0,0,0,1
chr1	155030948	.	T	TAACTCATGGGGCCCCAGTGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155030948_T_TAACTCATGGGGCCCCAGTGGG:155030948:0,1,0,1
chr1	155030950	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155030948_T_TAACTCATGGGGCCCCAGTGGG:155030948:0,1,0,1
chr1	155030952	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155030948_T_TAACTCATGGGGCCCCAGTGGG:155030948:0,1,0,1
chr1	155041398	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:155041398_C_T:155041398:2,2,1,1
chr1	155041401	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:155041398_C_T:155041398:2,2,1,1
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr1	155058579	.	T	TGGC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,2:3,1:0|1:155058579_T_TGGC:155058579:1,5,4,0
chr1	155058584	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:2,1:0|1:155058579_T_TGGC:155058579:1,5,4,0
chr1	155058588	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:2,1:0|1:155058579_T_TGGC:155058579:1,6,4,0
chr1	155058590	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,3:2,1:0|1:155058579_T_TGGC:155058579:1,6,4,0
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	155108737	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,14;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:155108737_T_TG:155108737:1,1,2,0
chr1	155108738	.	T	TGGCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:155108737_T_TG:155108737:1,1,2,0
chr1	155108742	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=19,31;MFRL=180,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:155108737_T_TG:155108737:1,1,1,0
chr1	155108748	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0,1,2,0
chr1	155149824	.	G	GTAATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155149824_G_GTAATA:155149824:0,4,0,1
chr1	155149825	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155149824_G_GTAATA:155149824:0,4,0,1
chr1	155151127	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155161047	.	C	CCAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.458:3:1,1:1,0:0|1:155161047_C_CCAAG:155161047:0,2,0,1
chr1	155161049	.	AGGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.458:3:1,1:1,0:0|1:155161047_C_CCAAG:155161047:0,2,0,1
chr1	155161794	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	155182470	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,85;MMQ=55,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:3,1:4,2,2,1
chr1	155184523	.	A	ATCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155184523_A_ATCC:155184523:0,0,0,1
chr1	155184524	.	A	AATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,172;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155184523_A_ATCC:155184523:0,0,0,1
chr1	155186510	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,0,1
chr1	155186867	.	A	AATATTATCACAGCAACAGTTGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=177,148;MMQ=27,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155186867_A_AATATTATCACAGCAACAGTTGAC:155186867:0,1,0,1
chr1	155186870	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=177,148;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155186867_A_AATATTATCACAGCAACAGTTGAC:155186867:0,1,0,1
chr1	155194531	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=142,130;MMQ=52,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:1,2:3,1,2,0
chr1	155194563	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:7,0:4,8,2,0
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	155205719	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155205719_GGC_G:155205719:0,0,0,1
chr1	155205723	.	G	GAGAAACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155205719_GGC_G:155205719:0,0,0,1
chr1	155209938	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155209938_G_A:155209938:0,0,0,1
chr1	155209940	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155209938_G_A:155209938:0,0,0,1
chr1	155220924	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:6,2,1,1
chr1	155223408	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,43;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:8,0:5,3:6,8,2,1
chr1	155223413	.	C	CCTCCGGCCCTGTCCAGAGTCGGGGCAGGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=108,43;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:7,10,1,1
chr1	155231495	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,84;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:6,0:12,3:8,12,0,3
chr1	155234151	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,23511240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:4,12,1,1
chr1	155234315	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:7,0:7,9,3,0
chr1	155238222	.	A	AGTGAATTATTGTTAGTATCTGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	155238623	.	G	GAGGAGAATCCCCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155256912	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=258,835;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155256912_G_A:155256912:1,0,1,0
chr1	155256915	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=258,835;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155256912_G_A:155256912:1,0,1,0
chr1	155265004	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,2:6,1:4,5,2,1
chr1	155265154	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155265154_C_T:155265154:0,1,0,1
chr1	155265157	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155265154_C_T:155265154:0,1,0,1
chr1	155265160	.	CC	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155265154_C_T:155265154:0,1,0,1
chr1	155265164	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155265154_C_T:155265154:0,1,0,1
chr1	155282164	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=133,72;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:9,9,1,2
chr1	155282240	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=215,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155282240_G_GAA:155282240:0,2,0,1
chr1	155282241	.	T	TACG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=215,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:155282240_G_GAA:155282240:0,2,0,1
chr1	155282247	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=215,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:155282240_G_GAA:155282240:0,2,0,1
chr1	155282250	.	GA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=264,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:155282240_G_GAA:155282240:0,1,0,1
chr1	155291032	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.389:22:4,0:8,0:3,10,9,0
chr1	155291037	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,8;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:4,0:12,1:0|1:155291037_T_G:155291037:6,11,3,0
chr1	155291040	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:4,0:9,0:0|1:155291037_T_G:155291037:7,11,3,0
chr1	155292758	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=159,169;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:155292758_G_C:155292758:0,4,1,0
chr1	155292762	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=159,169;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:155292758_G_C:155292758:0,4,1,0
chr1	155292770	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=147,169;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:155292758_G_C:155292758:0,3,1,0
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr1	155298066	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	155324282	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:7,0:3,3:5,6,1,2
chr1	155327611	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155327611_A_G:155327611:0,1,0,1
chr1	155327615	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155327611_A_G:155327611:0,1,0,1
chr1	155330265	.	CC	TG,AG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,30,27;MFRL=149,95,102;MMQ=47,60,40;MPOS=2,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:4,0,0:0,1,1:0,4,0,2
chr1	155330273	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=146,102;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:155330273_T_C:155330273:0,3,0,1
chr1	155330277	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=146,102;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:155330273_T_C:155330273:0,3,0,1
chr1	155330295	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,30;MFRL=196,134;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:155330295_TG_CA:155330295:0,1,0,1
chr1	155330298	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=196,134;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155330295_TG_CA:155330295:0,1,0,1
chr1	155385782	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	155630784	.	T	TTCTGCCTCCTACAGACTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155649194	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=117,107;MMQ=52,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:0|1:155649194_G_A:155649194:12,7,1,1
chr1	155649201	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,107;MMQ=52,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,2:5,0:0|1:155649194_G_A:155649194:12,8,1,1
chr1	155686739	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.177:16:2,1:8,1:9,5,2,0
chr1	155720303	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,53;MMQ=39,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	155720621	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	155721633	.	C	CGGCTGGAAGTGCAATAGCAAGAATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,85;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	155724371	.	GT	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,136;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr1	155726651	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	155732244	.	A	ACT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,23;MFRL=102,154;MMQ=44,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	155732246	.	CCAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=124,109;MMQ=44,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	155732252	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=94,109;MMQ=27,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	155734913	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=100,127;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,0:3,6:3,5,0,6
chr1	155746340	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.885:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr1	155747371	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,105;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,5:8,0:11,1,5,0
chr1	155747598	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	155753953	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:155753953_G_GT:155753953:0,2,0,1
chr1	155753954	.	A	AAGCAGATTGGAATTACAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155753953_G_GT:155753953:0,2,0,1
chr1	155755239	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	155792336	.	A	AACTCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155792336_A_AACTCAT:155792336:0,0,0,1
chr1	155792340	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155792336_A_AACTCAT:155792336:0,0,0,1
chr1	155822971	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	155837988	.	T	TTTTTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=113,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:6,3,1,1
chr1	155838616	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,1,1
chr1	155838618	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,1,1
chr1	155838623	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,1,1
chr1	155838625	.	GAGAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,1,1
chr1	155838632	.	TATCTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,1,1
chr1	155838641	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,2,0,1
chr1	155838646	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,30;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,1,0,1
chr1	155838652	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=20,25;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155838616_A_G:155838616:0,1,0,1
chr1	155870413	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155870413_T_C:155870413:0,3,0,1
chr1	155870416	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:155870413_T_C:155870413:0,0,0,4
chr1	155870419	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155870413_T_C:155870413:0,2,0,1
chr1	155870421	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155870413_T_C:155870413:0,2,0,1
chr1	155874283	.	G	GATGTAATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=100,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	155880159	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	155880391	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:1,1,2,3
chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr1	155887332	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=79,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:8,0:13,2:13,10,0,2
chr1	155896387	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,177;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr1	155896955	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:2,0:8,6:0|1:155896955_G_C:155896955:3,8,0,6
chr1	155896957	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:3,0:8,6:0|1:155896955_G_C:155896955:3,8,0,6
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=215,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	155903357	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:5,1:1,4:1,5,3,2
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	155917902	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	155917904	.	T	TCG,TGGGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,26,31;MFRL=137,123,116;MMQ=60,60,60;MPOS=4,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,0,0:1,1,1:0,4,0,2
chr1	155917911	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	155924684	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:10,3:10,9,0,3
chr1	155924830	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,6
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,4
chr1	155934683	.	CAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=182,124;MMQ=56,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr1	155934697	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=175,186;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	155934701	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=186,124;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:155934701_G_T:155934701:4,0,1,0
chr1	155934707	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=185,124;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:155934701_G_T:155934701:3,0,1,0
chr1	155939153	.	A	ATGCTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	155981489	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=29818,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	155981750	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=118,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:155981750_G_GA:155981750:0,2,0,1
chr1	155981751	.	G	GCTGTTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=118,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:155981750_G_GA:155981750:0,2,0,1
chr1	155981762	.	C	CAAATGTAAAAGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155981762_C_CAAATGTAAAAGAA:155981762:0,0,0,1
chr1	155981764	.	A	AGAAATTAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155981762_C_CAAATGTAAAAGAA:155981762:0,0,0,1
chr1	155989866	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:8,4:13,0:9,13,3,1
chr1	156021079	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=111,87;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:9,1:2,4:4,7,4,2
chr1	156021170	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	156024845	.	AAGCGGCAGAGGGGGC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	156100625	.	TACCTAG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156100625_TACCTAG_T:156100625:0,1,0,1
chr1	156100634	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156100625_TACCTAG_T:156100625:0,1,0,1
chr1	156108482	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.453:15:2,0:5,0:7,1,0,7
chr1	156126455	.	T	TCATTCTCTATCCAAAGCTCAGAAACTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=77,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.484:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	156131050	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr1	156142729	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,66183440;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,0:0,2:3,4,2,0
chr1	156146421	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:156146421_T_C:156146421:2,3,1,1
chr1	156146423	.	G	GCCCAAGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:156146421_T_C:156146421:2,3,1,1
chr1	156146430	.	AG	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=150,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:156146421_T_C:156146421:1,4,1,1
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	156206121	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:2,4:0,9:1,1,7,6
chr1	156214069	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:156214069_C_G:156214069:2,3,1,1
chr1	156214070	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:3,2:2,0:0|1:156214069_C_G:156214069:2,3,1,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	156222788	.	G	GTAATTCCAGCTACTCTAGAGGCTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=119,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	156222821	.	A	AAACTTTGTGATGATATGTAGGAGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	156229026	.	C	CAGGGCTGTCCCAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156230206	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:0,4:5,2:3,2,4,2
chr1	156237963	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:1,0:7,2:0|1:156237963_A_C:156237963:2,6,1,1
chr1	156237967	.	C	CTCCATAGTTTTGCCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:156237963_A_C:156237963:2,6,1,1
chr1	156247665	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.610:13:2,0:2,8:4,1,5,3
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	156256341	.	C	CCATGCACTGCCCACAGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156261491	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156268509	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,0:6,3:8,2,2,1
chr1	156268785	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=134,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:156268785_C_T:156268785:1,1,0,1
chr1	156268797	.	T	TGCATTTGTGGGTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156268785_C_T:156268785:0,0,0,1
chr1	156269113	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=91,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr1	156269422	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156269422_T_C:156269422:0,0,0,1
chr1	156269427	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156269422_T_C:156269422:0,0,0,1
chr1	156269430	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156269422_T_C:156269422:0,0,0,1
chr1	156269434	.	TTCA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156269422_T_C:156269422:0,0,0,1
chr1	156269440	.	A	ATTG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156269422_T_C:156269422:0,0,0,1
chr1	156279050	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=138,94;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.487:3:0,0:1,1:0|1:156279050_G_C:156279050:1,1,0,1
chr1	156279055	.	C	CTTTCCCAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=134,94;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156279050_G_C:156279050:0,1,0,1
chr1	156279057	.	G	GCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=134,94;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156279050_G_C:156279050:0,1,0,1
chr1	156279058	.	A	ACCTCACTATGGCTGTTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=134,94;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156279050_G_C:156279050:0,1,0,1
chr1	156280296	.	GATAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATAA;STR;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,3,2
chr1	156287403	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	156339114	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,104;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,4:10,0:8,9,4,0
chr1	156374240	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,8:0,0:1,0,8,0
chr1	156396744	.	T	TCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:156396744_T_TCG:156396744:0,2,0,1
chr1	156396749	.	CTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:156396744_T_TCG:156396744:0,2,0,1
chr1	156396764	.	T	TATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156396764_T_TATA:156396764:0,0,0,1
chr1	156396766	.	T	TTTTTTTACCCCTCAACATTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156396764_T_TATA:156396764:0,0,0,1
chr1	156437987	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,5:6,0:8,4,5,0
chr1	156438013	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:11,5,2,1
chr1	156444989	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	156497862	.	A	AAGTTTGAAGTAAATGC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:0|1:156497862_A_AAGTTTGAAGTAAATGC:156497862:2,8,1,1
chr1	156497864	.	A	AAGTTCCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:156497862_A_AAGTTTGAAGTAAATGC:156497862:2,8,1,1
chr1	156502971	.	A	ACACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=53,114;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:156502971_A_ACACC:156502971:0,2,0,1
chr1	156502975	.	G	GACGAACACACACGTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=53,114;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:156502971_A_ACACC:156502971:0,2,0,1
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	156517944	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,1:7,1:1,6,2,0
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	156526387	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	156526407	.	G	GTCCTCACA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:6,5,1,1
chr1	156526444	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr1	156530868	.	C	CATCCTCCACACTTGCTACCTGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	156530887	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156530887_G_C:156530887:0,1,0,1
chr1	156530888	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156530887_G_C:156530887:0,1,0,1
chr1	156530891	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156530887_G_C:156530887:0,1,0,1
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,5:0,0,8,6
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,1,0
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,3,1
chr1	156536251	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,14,12
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	156536419	.	C	CCTCTCATTCTGGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr1	156551752	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:156551752_CT_GG:156551752:2,2,1,0
chr1	156551755	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:156551752_CT_GG:156551752:2,2,1,0
chr1	156556321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,10:0,8:0,0,9,9
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	156563770	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:9,4,0,3
chr1	156563775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=102,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:7,6,2,1
chr1	156563813	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr1	156563852	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,2,4
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,22:0,16:0,0,18,21
chr1	156566111	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr1	156616891	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,1:2,1:4,4,1,1
chr1	156617001	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=57,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:156617001_G_GCA:156617001:1,1,0,1
chr1	156617004	.	G	GAATAAGCAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=57,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:156617001_G_GCA:156617001:1,1,0,1
chr1	156617006	.	G	GCCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=57,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:156617001_G_GCA:156617001:1,1,0,1
chr1	156621457	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156621457_G_T:156621457:0,0,0,1
chr1	156621463	.	GCCC	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156621457_G_T:156621457:0,0,0,1
chr1	156621469	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156621457_G_T:156621457:0,0,0,1
chr1	156621528	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156626201	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156626201_G_A:156626201:0,1,0,1
chr1	156626225	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=53,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:156626201_G_A:156626201:0,2,0,1
chr1	156628104	.	GG	AT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.326:7:3,0:2,2:0|1:156628104_GG_AT:156628104:0,5,1,1
chr1	156628109	.	G	GTAATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=122,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:156628104_GG_AT:156628104:0,4,0,1
chr1	156628111	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:156628104_GG_AT:156628104:0,3,0,1
chr1	156628943	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:156628943_CA_AG:156628943:0,4,1,0
chr1	156628950	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:156628943_CA_AG:156628943:0,3,1,0
chr1	156628983	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156628986	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,30;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:156628986_A_C:156628986:0,1,0,1
chr1	156628988	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:156628986_A_C:156628986:0,1,0,1
chr1	156628993	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156628986_A_C:156628986:0,0,0,1
chr1	156628994	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156628986_A_C:156628986:0,0,0,1
chr1	156639904	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	156639917	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	156639932	.	CCTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	156640156	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr1	156640195	.	TCG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=113,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:3,1:0,0:0|1:156640195_TCG_T:156640195:0,3,0,1
chr1	156640200	.	C	CCCATACT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=113,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:3,1:0,0:0|1:156640195_TCG_T:156640195:0,3,0,1
chr1	156640657	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:0,2:2,0:0|1:156640657_AG_CC:156640657:0,2,2,0
chr1	156640662	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:156640657_AG_CC:156640657:0,2,2,0
chr1	156640666	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,34;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:156640657_AG_CC:156640657:1,2,1,0
chr1	156640672	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:156640657_AG_CC:156640657:1,1,1,0
chr1	156640678	.	GGG	CCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:156640657_AG_CC:156640657:1,2,1,0
chr1	156641351	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:2,1,0,1
chr1	156642284	.	CATGG	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:0|1:156642284_CATGG_C:156642284:4,5,1,1
chr1	156642290	.	T	TTCC	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:156642284_CATGG_C:156642284:4,5,1,1
chr1	156642291	.	CTGG	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,1:7,0:0|1:156642284_CATGG_C:156642284:4,5,1,1
chr1	156642537	.	AT	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156642537_AT_TG:156642537:0,2,0,1
chr1	156642542	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156642537_AT_TG:156642537:0,0,0,1
chr1	156670475	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156701740	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=84,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr1	156703380	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156703380_G_A:156703380:0,1,0,1
chr1	156703384	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156703380_G_A:156703380:0,1,0,1
chr1	156703385	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156703380_G_A:156703380:0,1,0,1
chr1	156706559	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	156708166	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:5,1:10,2:6,9,2,1
chr1	156708229	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=139,81;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr1	156708244	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156760887	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,3:8,3:7,8,4,2
chr1	156779647	.	G	GCTGAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	156779649	.	G	GTTCAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0|1:156779649_G_GTTCAAT:156779649:0,2,0,1
chr1	156779651	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0|1:156779649_G_GTTCAAT:156779649:0,2,0,1
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,8,4
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,8,4
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,4:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,7,3
chr1	156810756	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:1,2:2,1:1,3,1,2
chr1	156814152	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,523;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156814152_G_A:156814152:0,1,1,0
chr1	156814155	.	G	GTAACGCAGAACAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,523;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156814152_G_A:156814152:0,1,1,0
chr1	156814645	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr1	156818813	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr1	156818988	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,62606;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr1	156838001	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156846082	.	A	ACAGCTTGGTTCTTCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156874568	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,0:4,2:0|1:156874568_T_C:156874568:6,6,0,3
chr1	156874576	.	C	CCCAACCCAAAGTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:4,2:0|1:156874568_T_C:156874568:6,6,0,2
chr1	156874578	.	T	TGGGATTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:156874568_T_C:156874568:5,5,0,2
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,1,0
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,1,0
chr1	156875247	.	T	TCAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156876547	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=97,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr1	156877457	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr1	156877583	.	GCTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156877583_GCTAA_G:156877583:0,3,0,1
chr1	156877588	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=153,196;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156877583_GCTAA_G:156877583:0,3,0,1
chr1	156877623	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156877623_G_GAA:156877623:0,1,0,1
chr1	156877624	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156877623_G_GAA:156877623:0,1,0,1
chr1	156882576	.	TTT	AGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=99,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:4,0,0,1
chr1	156883151	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=96,125;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	156884399	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156894752	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:3,7,0,2
chr1	156899294	.	GT	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=52,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	156899610	.	TGC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	156899612	.	C	CCTTGCTCTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	156901787	.	GG	TA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:6,0:0|1:156901787_GG_TA:156901787:9,8,1,1
chr1	156901789	.	A	ATCCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:0|1:156901787_GG_TA:156901787:9,8,1,1
chr1	156901855	.	AGGCTACCCGGGCCCTGTCCTGCCTGAGGGTGTTTACCCCGACTCTATGGAGCAGAGCTGGTCCTCCCATCTTTG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=178,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.294:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	156901882	.	G	GCGCAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156907359	.	G	GACCACCCACGCCAACCTGCGGCCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	156909750	.	A	AGGAAGAGCCTTCGGGAAGGTGGAGGGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156910030	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=122,107;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:156910030_C_A:156910030:6,4,2,0
chr1	156910040	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,107;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:0|1:156910030_C_A:156910030:6,6,2,0
chr1	156911659	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:0,0,0,1
chr1	156911662	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:0,0,0,1
chr1	156911669	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,14;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:0,0,0,1
chr1	156911672	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,16;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:0,0,0,1
chr1	156911681	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:1,0,0,1
chr1	156911684	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:156911659_C_A:156911659:1,0,0,1
chr1	156911718	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,22;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	156914240	.	C	CCATT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CATT;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.310:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	156914324	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156914324_A_C:156914324:0,0,0,1
chr1	156914325	.	T	TGAGCAGGAACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156914324_A_C:156914324:0,0,0,1
chr1	156914327	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156914324_A_C:156914324:0,0,0,1
chr1	156915946	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:156915946_CT_C:156915946:0,0,0,1
chr1	156915949	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156915946_CT_C:156915946:0,0,0,1
chr1	156917708	.	G	GAACCTGATGCCCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.419:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr1	156949188	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=179,176;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156949194	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=179,176;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156950306	.	G	GGTTCCACCTGCCCCCCAGATGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr1	157013982	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:157013982_C_A:157013982:1,0,1,0
chr1	157013987	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=19,14;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:1,1,1,0
chr1	157013992	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:157013982_C_A:157013982:1,2,1,0
chr1	157013997	.	AC	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,11;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:157013982_C_A:157013982:2,2,1,0
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	157067838	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:157067838_A_T:157067838:0,4,0,1
chr1	157067839	.	G	GGGTTTCGGCAATTCTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:157067838_A_T:157067838:0,4,0,1
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,2:0,0,3,6
chr1	157488454	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=155,70;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,3:7,0:6,5,2,1
chr1	157488473	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=115,70;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:4,2:9,0:6,7,2,1
chr1	157490710	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	157491161	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:157491161_T_G:157491161:0,3,0,1
chr1	157491162	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:157491161_T_G:157491161:0,3,0,1
chr1	157491165	.	A	ATATTCCATGCTTATGGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:157491161_T_G:157491161:0,3,0,1
chr1	157491168	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:157491161_T_G:157491161:0,3,0,1
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr1	157513005	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:157513005_C_T:157513005:0,0,0,1
chr1	157513022	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:157513005_C_T:157513005:0,0,0,1
chr1	157545401	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,119;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:4,7,0,3
chr1	157545603	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,549;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:157545603_G_C:157545603:0,2,1,0
chr1	157545608	.	CC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=155,549;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:157545603_G_C:157545603:0,2,1,0
chr1	157550235	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157550235_A_AAT:157550235:0,0,0,1
chr1	157550237	.	T	TGTTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157550235_A_AAT:157550235:0,0,0,1
chr1	157550239	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157550235_A_AAT:157550235:0,0,0,1
chr1	157557955	.	T	TGTGAAATATACTTGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	157559278	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,1:0|1:157559278_T_C:157559278:0,2,0,1
chr1	157559281	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=233,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157559278_T_C:157559278:0,1,0,1
chr1	157559282	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=233,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157559278_T_C:157559278:0,1,0,1
chr1	157559290	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=233,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157559278_T_C:157559278:0,1,0,1
chr1	157559292	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=233,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157559278_T_C:157559278:0,1,0,1
chr1	157567794	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,0:10,2:10,13,1,1
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,3:4,1,5,1
chr1	157653041	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=108,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.144:46:19,0:21,6:14,26,0,6
chr1	157665456	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	157665474	.	T	TCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157665474_T_TCAGAA:157665474:0,1,0,1
chr1	157665476	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157665474_T_TCAGAA:157665474:0,1,0,1
chr1	157665825	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:5,5,0,2
chr1	157668390	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr1	157668427	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=87,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:2,1:0,4:0,2,2,4
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr1	157738465	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:157738465_CCA_C:157738465:1,2,0,1
chr1	157738468	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:157738465_CCA_C:157738465:1,2,0,1
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,6:0,4:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,4,8
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,4:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,4,8
chr1	157767519	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=62,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr1	157771795	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:157771795_G_A:157771795:2,3,1,1
chr1	157771811	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:157771795_G_A:157771795:4,0,0,1
chr1	157772075	.	C	CACCTTACTTTATGCAAGAGGCATGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	157802896	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	157803269	.	T	TAGGGCTGACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	157805884	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	157811432	.	AAGCCTAAACCAACAGGTGCAGAGATACTCACCAAGGATCAAGGAGAATAGCAG	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=111,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.089:33:6,0:6,2:19,12,0,2
chr1	158054380	.	GCCAGCTCCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	158057959	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:158057959_G_A:158057959:0,2,0,1
chr1	158057979	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:158057959_G_A:158057959:0,2,0,1
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr1	158058209	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,0:12,3:16,10,3,0
chr1	158059185	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,82;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr1	158150970	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=39,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	158226879	.	T	TCATTTGCATGGTAGTTTCACTGCTCCACAAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=153,63;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr1	158226894	.	GTGGACCTC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:158226894_GTGGACCTC_G:158226894:0,3,0,1
chr1	158226904	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:158226894_GTGGACCTC_G:158226894:0,3,0,1
chr1	158226907	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:158226894_GTGGACCTC_G:158226894:0,3,0,1
chr1	158226911	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:158226894_GTGGACCTC_G:158226894:0,3,0,1
chr1	158263122	.	CCAGTTTCTTATTTCACATTCCATTTTTCACTCTCTTAGCTTTTCTCTATTGACTACTCCACCTTATCCT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,304;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.109:26:3,2:7,0:7,17,0,2
chr1	158298679	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.287:9:2,1:5,1:5,2,2,0
chr1	158325281	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	158325428	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158325428_A_C:158325428:0,0,0,1
chr1	158325432	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158325428_A_C:158325428:0,0,0,1
chr1	158325435	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158325428_A_C:158325428:0,0,0,1
chr1	158325437	.	T	TCCATACTACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158325428_A_C:158325428:0,0,0,1
chr1	158325641	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,79;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:158325641_G_A:158325641:4,7,1,1
chr1	158325644	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=124,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:158325641_G_A:158325641:4,7,1,1
chr1	158389630	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=113,124;MMQ=49,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,1:5,6:5,2,5,2
chr1	158390501	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,6:8,4:10,4,6,4
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=23,34;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:2,6,1,3
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	158436381	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:158436381_C_CT:158436381:0,3,0,1
chr1	158436382	.	A	ACTTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,24;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:158436381_C_CT:158436381:0,3,0,1
chr1	158436385	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:158436381_C_CT:158436381:0,2,0,1
chr1	158436390	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:158436381_C_CT:158436381:0,2,0,1
chr1	158450382	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=104,147;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr1	158450604	.	A	AAATGATCCTCCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:2,5,1,1
chr1	158517142	.	C	T,CAAAGT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24,30;MFRL=151,102,81;MMQ=60,60,60;MPOS=28,1;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.36,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,1:0.586,0.203:8:1,2,1:0,3,0:1,0,1,6
chr1	158517353	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:1,3,3,1
chr1	158517384	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=114,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:3,2,0,2
chr1	158532641	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:158532641_AG_A:158532641:1,1,0,1
chr1	158532643	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:158532641_AG_A:158532641:1,1,0,1
chr1	158549569	.	T	TCTTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=134,52;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:158549569_T_TCTTC:158549569:5,0,1,1
chr1	158549572	.	G	GATGGATAGCACATAACAAAGTTTAGATCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,52;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:158549569_T_TCTTC:158549569:5,0,1,1
chr1	158576214	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:7,3,1,1
chr1	158582573	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=79,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,2,1
chr1	158583697	.	A	AATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:158583697_A_AATC:158583697:0,4,0,1
chr1	158583706	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:158583697_A_AATC:158583697:0,4,0,1
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:0,1,1,4
chr1	158584103	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:0,0:0,2,0,3
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,6,6
chr1	158596881	.	C	CATTTCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=842,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	158606387	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=26053,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	158607935	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:1,3,3,1
chr1	158607937	.	TTG	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:158607937_TTG_T:158607937:3,3,1,1
chr1	158607940	.	A	ATC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:158607937_TTG_T:158607937:3,4,1,1
chr1	158607946	.	TC	GT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,1:0|1:158607937_TTG_T:158607937:3,5,1,1
chr1	158612807	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=475,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:158612807_C_CCA:158612807:0,2,0,1
chr1	158612809	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=475,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:158612807_C_CCA:158612807:0,2,0,1
chr1	158612814	.	T	TACTTAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	158622533	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:158622533_A_AG:158622533:0,1,0,1
chr1	158622539	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:158622533_A_AG:158622533:0,1,0,1
chr1	158623225	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr1	158637865	.	GAAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.584:3:0,1:0,1:0,1,1,1
chr1	158639601	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	158641301	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158641301_T_C:158641301:0,0,0,1
chr1	158641304	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158641301_T_C:158641301:0,0,0,1
chr1	158641306	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158641301_T_C:158641301:0,0,0,1
chr1	158641308	.	A	AGTCCTTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:158641301_T_C:158641301:0,0,0,1
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	158647669	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,2:1,2,1,3
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	158656281	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,8:0,18:0,0,18,9
chr1	158656312	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=107,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:6,0:12,2:11,9,0,2
chr1	158656347	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27,20;MFRL=0,101,119;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,13;RU=AG;STR;TLOD=5.87,7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.393,0.529:5:0,0,0:0,1,2:0,0,0,5
chr1	158669494	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:14,0:10,17,0,2
chr1	158724541	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	158735892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0,0,6,3
chr1	158813264	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr1	158815298	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=167,148;MMQ=56,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	158815342	.	TTTTAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=158,141;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:3,0:4,0,2,0
chr1	158817579	.	T	TTAATCTTCTTTTGCAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr1	158908205	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:0|1:158908205_C_T:158908205:4,2,1,1
chr1	158908211	.	C	CACTTTTATCTCTTCATGTTACTTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:158908205_C_T:158908205:5,2,1,1
chr1	158913486	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0|1:158913525_A_G:158913525:0,0,8,2
chr1	158913532	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0|1:158913525_A_G:158913525:0,0,7,2
chr1	158986225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	158986477	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=171.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,18:0,34:0,0,26,27
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,424;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	159002377	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,17:0,0,18,18
chr1	159002389	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,15,15
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	159162606	.	C	CGCAGTCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	159163314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:3,2,4,3
chr1	159169463	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	159169641	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,6:0,0,11,8
chr1	159170797	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr1	159175494	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr1	159176204	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=93,539;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:4,4:16,0:9,11,0,4
chr1	159277743	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:159277743_T_A:159277743:2,2,0,1
chr1	159277747	.	A	AGAGTCTTTCCCACTGC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=103,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:159277743_T_A:159277743:2,2,0,1
chr1	159277766	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159277766_C_G:159277766:0,1,0,1
chr1	159277769	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159277766_C_G:159277766:0,1,0,1
chr1	159277770	.	A	ATTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=117,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159277766_C_G:159277766:0,1,0,1
chr1	159284523	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:159284523_G_T:159284523:0,1,0,1
chr1	159284527	.	G	GCCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:159284523_G_T:159284523:0,1,0,1
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	159410340	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	159684186	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,3:4,0:1,7,2,1
chr1	159770524	.	A	AATAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0|1:159770524_A_AATAC:159770524:0,2,0,1
chr1	159770525	.	G	GCAATTTAGTCTGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:159770524_A_AATAC:159770524:0,2,0,1
chr1	159770530	.	AC	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:159770524_A_AATAC:159770524:0,2,0,1
chr1	159772369	.	G	GCTCTGATTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159772369_G_GCTCTGATTA:159772369:0,0,0,1
chr1	159772372	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159772369_G_GCTCTGATTA:159772369:0,0,0,1
chr1	159772374	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159772369_G_GCTCTGATTA:159772369:0,0,0,1
chr1	159772376	.	GC	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159772369_G_GCTCTGATTA:159772369:0,0,0,1
chr1	159778699	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	159779234	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr1	159783221	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr1	159784170	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr1	159803167	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159803167_T_TA:159803167:0,1,0,1
chr1	159803168	.	C	CAGCGGCATGATCTCGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:159803167_T_TA:159803167:0,1,0,1
chr1	159803248	.	AGA	TTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159803248_AGA_TTC:159803248:0,0,0,1
chr1	159803252	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159803248_AGA_TTC:159803248:0,0,0,1
chr1	159803255	.	C	CACT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159803248_AGA_TTC:159803248:0,0,0,1
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	159825083	.	C	CCAGCGTCTTTCACAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	159827475	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	159827504	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	159842684	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:159842684_C_A:159842684:2,0,2,0
chr1	159842691	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=115,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1|0:159842684_C_A:159842684:2,0,2,0
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	159857661	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=107,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:2,1:7,1:3,6,2,0
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:8,6:3,4:6,5,6,5
chr1	159897388	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	159897681	.	TAA	T,TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,21,28;MFRL=0,142,123;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.34,10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.331,0.572:6:0,1,3:0,0,1:0,0,0,6
chr1	159900051	.	G	GTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	159901777	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159901777_C_T:159901777:0,1,0,1
chr1	159901787	.	T	TCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159901777_C_T:159901777:0,1,0,1
chr1	159901788	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159901777_C_T:159901777:0,1,0,1
chr1	159901792	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159901777_C_T:159901777:0,1,0,1
chr1	159902520	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr1	159902521	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:159902521_C_CA:159902521:1,1,0,1
chr1	159902524	.	G	GAAATACT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:159902521_C_CA:159902521:1,1,0,1
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,1,0
chr1	159906517	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=103,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:4,2,5,0
chr1	159912839	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:3,2:0|1:159912839_A_T:159912839:12,9,1,1
chr1	159912847	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,0:4,2:0|1:159912839_A_T:159912839:11,10,1,1
chr1	159912853	.	C	CATAT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:4,2:0|1:159912839_A_T:159912839:9,9,1,1
chr1	159912854	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:4,2:0|1:159912839_A_T:159912839:9,9,1,1
chr1	159921703	.	G	GTGAGTGGCATTGTTTTCTTTCACTTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	159922098	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:4,8,2,0
chr1	160000799	.	CC	GG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:160000799_CC_GG:160000799:2,1,0,1
chr1	160000803	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:160000799_CC_GG:160000799:2,1,0,1
chr1	160062707	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=118,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	160068268	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160068268_G_A:160068268:0,1,0,1
chr1	160068286	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160068268_G_A:160068268:0,1,0,1
chr1	160090828	.	G	GTGGGCGAAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:160090828_G_GTGGGCGAAGC:160090828:1,1,0,1
chr1	160090833	.	CC	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:160090828_G_GTGGGCGAAGC:160090828:2,1,0,1
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	160093927	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	160098370	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	160098535	.	A	ACCGAAGATCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=131,111;MMQ=51,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	160098705	.	G	GATCGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:160098705_G_GATCGTT:160098705:3,1,1,1
chr1	160098707	.	G	GTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=114,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:1,1:3,0:0|1:160098705_G_GATCGTT:160098705:3,1,1,1
chr1	160099227	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=201,194;MMQ=49,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160099227_GA_TC:160099227:0,1,0,1
chr1	160099233	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,28;MFRL=201,194;MMQ=49,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160099227_GA_TC:160099227:0,1,0,1
chr1	160099235	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=201,194;MMQ=49,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:160099227_GA_TC:160099227:0,1,0,1
chr1	160099236	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160099227_GA_TC:160099227:0,0,0,1
chr1	160099246	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160099246_G_GT:160099246:0,0,0,1
chr1	160099248	.	A	ACCGTGGCCATTGT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160099246_G_GT:160099246:0,0,0,1
chr1	160100410	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:160100410_T_A:160100410:0,3,0,1
chr1	160100412	.	C	CCTTTGTTTTTTATGCCATTGACTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:160100410_T_A:160100410:0,3,0,1
chr1	160104480	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	160106863	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=48,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	160121746	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=82,136;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	160124875	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=106,178;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr1	160124891	.	T	TTGG,TGG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,24,24;MFRL=159,114,147;MMQ=60,60,60;MPOS=31,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,1,1:1,3,2,0
chr1	160124892	.	A	C,G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,31,17;MFRL=159,114,147;MMQ=60,60,60;MPOS=29,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,1,0:1,3,2,0
chr1	160124897	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,1:1,3,2,0
chr1	160124904	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,1:0,3,3,0
chr1	160124906	.	CACT	TGCT,C,CCTGACT	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=31,19,12,29;MFRL=127,178,114,194;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,15,1;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,1,1,1:0.182,0.182,0.182:7:1,0,0,1:3,0,0,0:1,3,2,1
chr1	160124911	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:0,1:3,0:2,2,0,1
chr1	160125897	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=79,52;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:2,3,0,3
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=60,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,1,3
chr1	160143594	.	G	GGGATGGTTATCTTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr1	160147517	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,2:0|1:160147517_A_G:160147517:1,1,0,4
chr1	160147521	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:160147517_A_G:160147517:1,1,0,4
chr1	160156243	.	A	AGCTCCTGGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=96,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160156243_A_AGCTCCTGGGCCC:160156243:0,1,0,1
chr1	160156246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=96,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160156243_A_AGCTCCTGGGCCC:160156243:0,1,0,1
chr1	160160921	.	G	GGAAGAGCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160163509	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	160163724	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.375:4:2,0:0,1:0|1:160163724_C_T:160163724:0,3,0,1
chr1	160163731	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.380:4:2,0:1,1:0|1:160163724_C_T:160163724:0,3,0,1
chr1	160168633	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160168633_G_GTC:160168633:0,1,0,1
chr1	160168634	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160168633_G_GTC:160168633:0,1,0,1
chr1	160168639	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160168633_G_GTC:160168633:0,1,0,1
chr1	160168641	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160168633_G_GTC:160168633:0,1,0,1
chr1	160168643	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160168633_G_GTC:160168633:0,1,0,1
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	160188564	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	160201149	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.184:20:6,3:9,0:9,8,3,0
chr1	160251792	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	160259994	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:0|1:160259994_C_T:160259994:10,10,1,1
chr1	160260005	.	AC	TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:160259994_C_T:160259994:8,11,1,1
chr1	160260011	.	G	GCCCATTGA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,1:0|1:160259994_C_T:160259994:7,10,1,1
chr1	160260233	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,3:1,1:0,1,3,1
chr1	160263036	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=118,82;MMQ=60,60;MPOS=-1073741811;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:5,6,1,1
chr1	160263124	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:4,2,1,2
chr1	160263308	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=156,102;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:1,3,0,1
chr1	160263310	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=156,102;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:1,3,0,1
chr1	160263314	.	ACA	TTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=163,102;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:0,4,0,1
chr1	160263323	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=163,102;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:0,4,0,1
chr1	160263326	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=163,102;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:0,4,0,1
chr1	160263330	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=163,102;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:160263308_A_T:160263308:0,4,0,1
chr1	160265515	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:7,2,4,4
chr1	160268834	.	G	GA,T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,18,10;MFRL=115,182,90;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.41,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.453,0.250:4:1,0,0:0,0,0:1,0,0,3
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	160303416	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr1	160303576	.	C	CCATTTTGTTTTTGGTGGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=81,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:2,2,2,1
chr1	160313690	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	160319550	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:160319550_T_A:160319550:0,0,0,1
chr1	160319557	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160319550_T_A:160319550:0,0,0,1
chr1	160341637	.	ACTCCTACTGTCCCAATTTTCTCC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=132,179;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.254:10:2,2:2,0:0|1:160341637_ACTCCTACTGTCCCAATTTTCTCC_A:160341637:3,5,0,2
chr1	160341678	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=132,179;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:3,0:2,0:0|1:160341637_ACTCCTACTGTCCCAATTTTCTCC_A:160341637:4,4,0,2
chr1	160342162	.	C	CTTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTAT;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,4:1,1:2,0,3,3
chr1	160394126	.	TCCCAC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=88,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,0:0|1:160394126_TCCCAC_T:160394126:0,2,0,1
chr1	160394136	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160394126_TCCCAC_T:160394126:0,1,0,1
chr1	160394173	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	160461235	.	CTGTGAAAAATA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160461235_CTGTGAAAAATA_C:160461235:0,1,0,1
chr1	160461251	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:160461235_CTGTGAAAAATA_C:160461235:0,1,0,1
chr1	160519849	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,4,0,1
chr1	160519852	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,4,0,1
chr1	160519857	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,3,0,1
chr1	160519861	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,3,0,1
chr1	160519867	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,2,0,1
chr1	160519870	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:160519849_A_T:160519849:0,2,0,1
chr1	160523225	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,4:11,0:10,8,3,1
chr1	160582248	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr1	160593841	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,6,14
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,32;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr1	160766180	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:160766180_T_TAG:160766180:0,3,0,1
chr1	160766182	.	T	TATACATTCATCTAAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,10;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:160766180_T_TAG:160766180:0,3,0,1
chr1	160766187	.	T	TTCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:160766180_T_TAG:160766180:0,2,0,1
chr1	160766188	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:160766180_T_TAG:160766180:0,2,0,1
chr1	160784109	.	A	ATCATACCCATCGCGAGGGCTCCGACCCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=80,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	160788046	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=116,65;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.112:25:10,0:12,2:0|1:160788046_C_T:160788046:11,12,1,1
chr1	160788063	.	G	GTATTCTGGGCTCTGATCATAACTTGTTCTGTGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,65;MMQ=60,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.129:22:11,0:8,2:0|1:160788046_C_T:160788046:7,13,1,1
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	160797684	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=87,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,6:9,9:5,9,3,13
chr1	160808897	.	CA	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160808897_CA_TT:160808897:0,0,0,1
chr1	160808900	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160808897_CA_TT:160808897:0,0,0,1
chr1	160808902	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160808897_CA_TT:160808897:0,0,0,1
chr1	160811241	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	160849030	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=125,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,3,2
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:3,3:5,6:0|1:160849060_G_A:160849060:3,6,4,6
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.535:26:6,4:6,10:0|1:160849060_G_A:160849060:6,6,4,10
chr1	160849291	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160849291_G_C:160849291:0,1,0,1
chr1	160849293	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160849291_G_C:160849291:0,1,0,1
chr1	160849295	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160849291_G_C:160849291:0,1,0,1
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	160850854	.	GACCCATTAAAAAATGACTCCTGCCCAACCTCTAACACTTGCTTCTCTGTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=145,116;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=105,127;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.434:12:4,0:2,5:0|1:160920809_A_G:160920809:4,3,3,2
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0|1:160920809_A_G:160920809:0,0,9,6
chr1	160968609	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,2:6,1:5,5,2,1
chr1	160968836	.	A	AGCTTCAAACCACATGCATCCATG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,2:4,0:6,4,1,1
chr1	160969110	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr1	160969930	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=96,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:3,5,2,2
chr1	160970968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=196,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr1	160971015	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	160971155	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:3,5,2,2
chr1	160990875	.	TC	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=65,109;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:0|1:160990875_TC_CA:160990875:1,3,1,5
chr1	160990878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=65,109;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:4,2:0,3:0|1:160990875_TC_CA:160990875:1,3,1,5
chr1	160990906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	161010762	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=89,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	161011355	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=127,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	161012590	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.499:38:15,11:4,8:12,7,9,10
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,18:0,0,9,23
chr1	161018704	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:10,4:4,17,0,4
chr1	161019040	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr1	161019489	.	G	GTCAGAGGCTGGACTTGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr1	161022444	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=125,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:7,6,4,1
chr1	161023060	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:3,2,2,0
chr1	161026371	.	G	GCACTAAGTAGCTGTGAGTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	161042740	.	G	GATCTCTCAGGTACTCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	161046347	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:161046347_A_G:161046347:0,2,0,1
chr1	161046350	.	C	CGGCTAATTTTTGTATTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:161046347_A_G:161046347:0,2,0,1
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	161069626	.	A	ATGGTTAGGTTTGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr1	161090109	.	T	TCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=236,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:161090109_T_TCCTGG:161090109:1,0,0,1
chr1	161090112	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,23;MFRL=236,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:161090109_T_TCCTGG:161090109:1,0,0,1
chr1	161092154	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=99,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,0:12,3:10,10,0,3
chr1	161092394	.	A	AGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:6,3,3,0
chr1	161132268	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:9,2:0|1:161132268_C_T:161132268:0,11,0,2
chr1	161132277	.	CTGG	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:161132268_C_T:161132268:0,10,0,2
chr1	161132315	.	TAAAGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161132315_TAAAGG_T:161132315:0,0,0,1
chr1	161132323	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161132315_TAAAGG_T:161132315:0,0,0,1
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	161138854	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=104,43;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,2,0
chr1	161140666	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:4,0,1,2
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	161143920	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=111,166;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161143920_G_A:161143920:0,1,0,1
chr1	161143925	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=111,166;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161143920_G_A:161143920:0,1,0,1
chr1	161143931	.	C	CGCG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,25;MFRL=166,111;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:161143931_C_CGCG:161143931:0,1,0,1
chr1	161143932	.	TTAC	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=166,111;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:161143931_C_CGCG:161143931:0,1,0,1
chr1	161143933	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:161143920_G_A:161143920:0,0,0,1
chr1	161143936	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=111,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161143920_G_A:161143920:0,1,0,1
chr1	161145098	.	A	ACACCTTGTGAGATCTTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161145098_A_ACACCTTGTGAGATCTTTG:161145098:0,0,0,1
chr1	161145104	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161145098_A_ACACCTTGTGAGATCTTTG:161145098:0,0,0,1
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	161163638	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:161163638_G_A:161163638:1,3,0,1
chr1	161163639	.	TGGGGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:161163638_G_A:161163638:1,3,0,1
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:5,1,1,1
chr1	161182207	.	G	GGCTACCAAGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:161182207_G_GGCTACCAAGTT:161182207:0,1,0,1
chr1	161182213	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:161182207_G_GGCTACCAAGTT:161182207:0,1,0,1
chr1	161184090	.	T	TGTTTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161188649	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,2:5,0:5,2,2,0
chr1	161188760	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=151,126;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,0:6,4:5,7,0,4
chr1	161188843	.	T	TCTCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	161192316	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=100,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:1,1,0,8
chr1	161192383	.	G	GATTCGGTTTGCCAGTATTTTACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	161192881	.	ACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=132,129;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	161201350	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=146,156;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:4,5:0,1:0|1:161201350_G_T:161201350:0,4,0,6
chr1	161201352	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=146,156;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:4,5:0,1:0|1:161201350_G_T:161201350:0,4,0,6
chr1	161202827	.	GAAGCCTGCTCA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,0,1
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	161284113	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161284113_C_T:161284113:0,0,1,0
chr1	161284118	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:161284113_C_T:161284113:0,0,1,0
chr1	161284297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr1	161293492	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=24,24;MFRL=152,152;MMQ=47,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.415:8:4,1:1,1:0,5,0,3
chr1	161293508	.	CG	TA	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=146,153;MMQ=45,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:161293508_CG_TA:161293508:0,6,0,2
chr1	161293516	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=140,153;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:161293508_CG_TA:161293508:0,5,0,2
chr1	161293542	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=21,25;MFRL=162,125;MMQ=54,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:161293542_A_AAG:161293542:0,4,0,1
chr1	161293546	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=171,125;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:161293542_A_AAG:161293542:0,3,0,1
chr1	161293547	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=149,116;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	161293549	.	GA	AA,TG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,24,26;MFRL=173,125,116;MMQ=60,40,40;MPOS=6,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr1	161293554	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=23,27;MFRL=145,125;MMQ=50,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161293542_A_AAG:161293542:0,2,0,1
chr1	161298279	.	TATCTACAGGTAAGGAAGGATTCTGGAGCCAGAGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=122,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.470:7:2,0:1,3:0,4,0,3
chr1	161335035	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161335035_T_G:161335035:0,0,0,1
chr1	161335036	.	A	ATGAACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:161335035_T_G:161335035:0,0,0,1
chr1	161335270	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,87;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chr1	161475179	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,125237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	161488022	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=149,105;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161488022_A_C:161488022:0,1,0,1
chr1	161488026	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=149,105;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:161488022_A_C:161488022:0,1,0,1
chr1	161488027	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=149,105;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:161488022_A_C:161488022:0,1,0,1
chr1	161495796	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=104,54;MMQ=52,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:9,12,0,3
chr1	161495885	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=132,153;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:5,1,1,1
chr1	161495916	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=120,114;MMQ=52,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.133:21:10,1:8,1:14,5,1,1
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,103;MMQ=59,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0|1:161559327_A_G:161559327:0,0,11,6
chr1	161559334	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=101,82122;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:0|1:161559327_A_G:161559327:10,3,0,3
chr1	161561225	.	G	GTTGGGATCCGA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=99,40917;MMQ=51,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:161561225_G_GTTGGGATCCGA:161561225:2,5,0,2
chr1	161561227	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=99,40917;MMQ=51,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:161561225_G_GTTGGGATCCGA:161561225:2,5,0,2
chr1	161561231	.	A	AAAATTTCT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=121,40917;MMQ=39,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:161561225_G_GTTGGGATCCGA:161561225:1,5,0,2
chr1	161561236	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	161600109	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,104;MMQ=27,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.743:33:6,9:2,16:5,3,17,8
chr1	161600287	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	161600832	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,10,4
chr1	161676904	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	161676970	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:5,2,4,1
chr1	161680258	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=91,72;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,4:7,1:6,3,2,3
chr1	161681319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	161693199	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,5:1,3:0,2,5,4
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:9,2:6,6:5,10,2,6
chr1	161722779	.	C	CAA,CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34,32;MFRL=0,124,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.25,6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.378,0.511:5:0,2,1:0,0,1:0,0,4,1
chr1	161723138	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	161771781	.	GCTGCTTCCC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=93,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:1,0:3,0,1,0
chr1	161771846	.	G	GGTTAC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr1	161789392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,1360;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,0,3
chr1	161823011	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	161829973	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=92,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.245:19:6,1:6,3:10,5,3,1
chr1	161832894	.	TCTTAGAATTCAGACATAGC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	161928409	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:161928409_C_T:161928409:1,1,0,1
chr1	161928419	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=96,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161928409_C_T:161928409:0,1,0,1
chr1	161928426	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=96,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161928409_C_T:161928409:0,1,0,1
chr1	161928432	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:161928409_C_T:161928409:0,2,0,1
chr1	161928434	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:161928409_C_T:161928409:0,2,0,1
chr1	161953638	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=87,64;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:16,0:13,3:12,18,0,3
chr1	161970064	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	161992995	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=103,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr1	162257329	.	T	TGTTGGTTTCACTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr1	162313735	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,13:1,4:0,1,11,6
chr1	162335424	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	162337134	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=3065161,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	162337205	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	162345276	.	C	CCGTCCAGTTTTCTGCCTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:0,0:0|1:162345276_C_CCGTCCAGTTTTCTGCCTG:162345276:0,2,0,1
chr1	162345278	.	A	AATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,24;MFRL=151,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:162345276_C_CCGTCCAGTTTTCTGCCTG:162345276:0,2,0,1
chr1	162345282	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=167,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162345276_C_CCGTCCAGTTTTCTGCCTG:162345276:0,1,0,1
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	162353420	.	AC	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:162353420_AC_CA:162353420:0,0,0,1
chr1	162353430	.	T	TGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=80,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:162353420_AC_CA:162353420:0,1,0,1
chr1	162353432	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=80,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:162353420_AC_CA:162353420:0,1,0,1
chr1	162353435	.	AAT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=80,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:162353420_AC_CA:162353420:0,1,0,1
chr1	162367071	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:1,3,4,3
chr1	162381868	.	ACAGC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162381868_ACAGC_A:162381868:0,0,0,1
chr1	162381873	.	TCTGA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162381868_ACAGC_A:162381868:0,0,0,1
chr1	162381881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162381868_ACAGC_A:162381868:0,0,0,1
chr1	162470961	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	162549134	.	T	TACAAAGGAGTTCTTCACCAAGCACAAGTAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=134,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	162560384	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:162560384_A_C:162560384:0,3,0,2
chr1	162560385	.	T	TGTTTCTCTCTGTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:162560384_A_C:162560384:0,3,0,2
chr1	162567715	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	162740327	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,14:0,1:0,0,9,6
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	162748605	.	C	CTGAATGTGCCATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=96,100;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:9,4:3,5:6,6,3,6
chr1	162767741	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=112,148;MMQ=57,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:1,7,0,5
chr1	162773984	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:2,8:1,5:3,1,12,1
chr1	162782267	.	C	CTAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=199,166;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162782267_C_CTAA:162782267:0,1,0,1
chr1	162782269	.	A	ATAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=199,166;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162782267_C_CTAA:162782267:0,1,0,1
chr1	162782271	.	CCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=199,166;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162782267_C_CTAA:162782267:0,1,0,1
chr1	162782276	.	GAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=199,166;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:162782267_C_CTAA:162782267:0,1,0,1
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	162824746	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=120,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:2,6,1,1
chr1	163038684	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr1	163038711	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr1	163039375	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163039375_A_G:163039375:0,0,0,1
chr1	163039377	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163039375_A_G:163039375:0,0,0,1
chr1	163039378	.	T	TCAGGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163039375_A_G:163039375:0,0,0,1
chr1	163117351	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	163131801	.	C	CATCTGTTGTCCCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=90,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:163131801_C_CATCTGTTGTCCCT:163131801:2,3,1,1
chr1	163131803	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:4,0:0|1:163131801_C_CATCTGTTGTCCCT:163131801:2,5,1,1
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	163297381	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.445:41:12,10:9,8:8,15,6,12
chr1	163298548	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=155,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr1	163298767	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	163310255	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,27;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:163310255_A_AG:163310255:1,3,0,1
chr1	163310256	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,29;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:163310255_A_AG:163310255:1,3,0,1
chr1	163310258	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:163310255_A_AG:163310255:1,3,0,1
chr1	163310259	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=21,23;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:163310255_A_AG:163310255:1,3,0,1
chr1	163310269	.	G	GGTCT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.760:2:0,2:0,0:0|1:163310269_G_GGTCT:163310269:0,0,1,1
chr1	163310271	.	A	ATATATCTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:163310269_G_GGTCT:163310269:0,0,1,1
chr1	163310272	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:163310269_G_GGTCT:163310269:0,0,1,1
chr1	163313539	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=95,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,28:0.491:57:20,11:9,17:13,16,13,15
chr1	163313562	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.101:47:17,0:24,4:22,21,4,0
chr1	163317811	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	164529246	.	G	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,9:0.133:73:38,0:25,9:32,32,0,9
chr1	164529337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:0,16,0,3
chr1	164761988	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	164776752	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=5071340,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	165218634	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=161,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:3,4:3,1:1,5,4,2
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,35546044;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	165376064	.	GGAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=71091961,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	165378729	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:165378729_TAC_T:165378729:0,0,6,0
chr1	165378733	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,5:0|1:165378729_TAC_T:165378729:0,0,7,0
chr1	165378735	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0|1:165378729_TAC_T:165378729:0,0,7,0
chr1	165378990	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:165378990_A_T:165378990:0,1,0,1
chr1	165378996	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:165378990_A_T:165378990:0,1,0,1
chr1	165389129	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	165514237	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:165514237_G_A:165514237:0,2,0,1
chr1	165514245	.	AGTTGGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:165514237_G_A:165514237:0,1,0,1
chr1	165601495	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:165601495_C_T:165601495:7,7,1,1
chr1	165601497	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,1:0|1:165601495_C_T:165601495:7,7,1,1
chr1	165621322	.	TATTATC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,4,12
chr1	165630698	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr1	165630770	.	GAAAAAAATATTGCCAAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	165636742	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=150,98;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:165636742_C_T:165636742:0,1,0,1
chr1	165636744	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=150,98;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:165636742_C_T:165636742:0,1,0,1
chr1	165636748	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=150,98;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:165636742_C_T:165636742:0,1,0,1
chr1	165648886	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0|1:165648886_G_A:165648886:0,0,0,3
chr1	165648894	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:165648886_G_A:165648886:0,0,0,2
chr1	165721489	.	ATTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.525:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	165723433	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr1	165859645	.	G	GCAGTAATAGTGCAGTTGGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	166826708	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	166826773	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:4,1,3,1
chr1	166831404	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr1	166833199	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr1	166905893	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:16,3:17,0:17,16,3,0
chr1	166974420	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,4:2,6:2,8,3,7
chr1	167038459	.	C	CATCCCAGGCCCTGCAACTGCGTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	167059651	.	C	CTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	167088473	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	167088706	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	167095547	.	C	CCCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=49,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:2,2,0,1
chr1	167095881	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,6:3,1:2,2,4,3
chr1	167095948	.	CC	TT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=75,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:4,2:3,7,1,1
chr1	167096092	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167096092_C_CG:167096092:0,2,0,1
chr1	167096093	.	A	AGAAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167096092_C_CG:167096092:0,2,0,1
chr1	167096095	.	T	TTCGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167096092_C_CG:167096092:0,2,0,1
chr1	167096108	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	167096123	.	C	CCTCAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	167097739	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,1:5,6:0,5,1,6
chr1	167097876	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=185,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:167097876_ACC_A:167097876:0,1,0,1
chr1	167097882	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=185,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:167097876_ACC_A:167097876:0,1,0,1
chr1	167353225	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,0:2,11,1,1
chr1	167353258	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	167381637	.	A	ATAGGTGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167381637_A_ATAGGTGG:167381637:0,0,0,1
chr1	167381640	.	A	ATATTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167381637_A_ATAGGTGG:167381637:0,0,0,1
chr1	167381642	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167381637_A_ATAGGTGG:167381637:0,0,0,1
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=123.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,27:0,15:0,0,23,19
chr1	167385324	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=99,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.751:8:1,1:0,1:2,0,0,6
chr1	167400898	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:7,5,2,1
chr1	167403212	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:0,1,4,1
chr1	167408670	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:1,4,1,4
chr1	167487547	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	167517139	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167517139_C_CA:167517139:0,0,1,0
chr1	167517144	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167517139_C_CA:167517139:0,0,1,0
chr1	167517147	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167517139_C_CA:167517139:0,0,1,0
chr1	167599583	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	167654705	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,2:9,0:5,7,1,1
chr1	167734793	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:7,1,4,3
chr1	167757148	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=110,91;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:14,0:10,3:11,14,0,4
chr1	167778843	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr1	167780018	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=102,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,3:7,0:4,6,2,1
chr1	167787265	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:0,0:4,2:5,0,2,0
chr1	167792356	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,2:3,2:1,5,3,2
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	167806647	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	167806652	.	G	GGGATAATGTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:167806652_G_GGGATAATGTC:167806652:0,3,0,1
chr1	167806654	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:167806652_G_GGGATAATGTC:167806652:0,3,0,1
chr1	167815167	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	167825321	.	A	AGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:167825321_A_AGAT:167825321:0,0,1,0
chr1	167825322	.	C	CTTGTTGGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:167825321_A_AGAT:167825321:0,0,1,0
chr1	167829137	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr1	167829224	.	T	TATATAATAAATTTCTACTTGCAGCCAAACTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,32;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.660:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	167839578	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,8:1,5:1,0,6,7
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=85,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr1	167863008	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr1	167863224	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:2,9,1,1
chr1	167889145	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.158:24:9,0:11,3:18,3,3,0
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=91,115;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.504:28:2,9:11,5:7,7,8,6
chr1	167893778	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.256:23:9,1:8,5:8,9,2,4
chr1	167905411	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	167962695	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:8,2:0|1:167962695_C_T:167962695:7,3,1,1
chr1	167962707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=100,100;MMQ=49,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:167962695_C_T:167962695:1,4,1,1
chr1	167962710	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=100,92;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:167962710_G_A:167962710:1,4,1,1
chr1	167962714	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=115,92;MMQ=55,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:167962710_G_A:167962710:0,4,1,1
chr1	167962741	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=148,92;MMQ=55,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:167962710_G_A:167962710:0,4,0,1
chr1	167962758	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=166,130;MMQ=55,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167962758_TG_CA:167962758:0,2,0,1
chr1	167962761	.	GTG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=166,130;MMQ=55,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167962758_TG_CA:167962758:0,2,0,1
chr1	167974063	.	G	GCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167974063_G_GCCTTT:167974063:0,1,0,1
chr1	167974064	.	A	AAGTAGTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167974063_G_GCCTTT:167974063:0,1,0,1
chr1	167984932	.	CCTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTT;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:0,3:9,1:8,1,4,0
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	168056724	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	168148480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:168148480_G_A:168148480:0,3,0,1
chr1	168148482	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:168148480_G_A:168148480:0,3,0,1
chr1	168153340	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:3,3:4,0:2,6,1,2
chr1	168161538	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=186,113;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168161538_C_G:168161538:0,1,0,1
chr1	168161541	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=186,113;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:168161538_C_G:168161538:0,1,0,1
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:4,2:6,1:8,2,2,1
chr1	168201009	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:5,1:9,3:10,4,2,2
chr1	168262527	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=33,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.677:20:3,8:3,3:5,1,6,8
chr1	168262580	.	GATCA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	168266838	.	TC	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=100,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:8,0:7,5,1,1
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	168278067	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:6,11,1,1
chr1	168281989	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	168344882	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,156;MMQ=57,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	168510450	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,127;MMQ=33,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168510450_GT_G:168510450:0,1,0,1
chr1	168510453	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=143,127;MMQ=33,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168510450_GT_G:168510450:0,1,0,1
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	168513243	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=136,128;MMQ=21,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,1,7
chr1	168513294	.	G	GTCTTTCCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=147,154;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	168513320	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=136,99;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,1:2,7:2,2,4,4
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,4:4,1:2,2,5,0
chr1	169099398	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:169099398_C_T:169099398:0,4,0,1
chr1	169099400	.	GT	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=198,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169099398_C_T:169099398:0,4,0,1
chr1	169099420	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=198,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:169099420_T_TA:169099420:0,4,0,1
chr1	169099421	.	T	TCTCTGACATTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=198,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:169099420_T_TA:169099420:0,4,0,1
chr1	169204451	.	TAAAACAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:169204451_TAAAACAA_T:169204451:0,1,0,1
chr1	169204459	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169204451_TAAAACAA_T:169204451:0,1,0,1
chr1	169204464	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,34;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169204451_TAAAACAA_T:169204451:0,1,0,1
chr1	169207018	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169207018_G_A:169207018:0,1,0,1
chr1	169207019	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169207018_G_A:169207018:0,1,0,1
chr1	169207021	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169207018_G_A:169207018:0,1,0,1
chr1	169256501	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:4,1,3,0
chr1	169272299	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,4:2,7:3,0,11,0
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.591:15:3,3:3,6:4,2,5,4
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	169345982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,143;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr1	169364479	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=94,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,4:3,0:1,3,0,4
chr1	169391154	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=44,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	169394264	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:169394264_A_T:169394264:0,1,0,1
chr1	169394266	.	G	GCAATATATACCTCTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:169394264_A_T:169394264:0,1,0,1
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	169437517	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169437517_A_ATG:169437517:1,2,0,1
chr1	169437518	.	A	AGTCAGAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169437517_A_ATG:169437517:1,2,0,1
chr1	169483798	.	TT	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,13,7
chr1	169509867	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=116,632;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr1	169509900	.	TT	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=65,81;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr1	169510001	.	T	TTTCCCTTTTGCAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	169510233	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,14:0,24:0,0,17,21
chr1	169512069	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=117,184;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:7,7,2,0
chr1	169528384	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,3,1
chr1	169551830	.	T	TGTTTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=115,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:2,3,0,1
chr1	169551834	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=119,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr1	169551855	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	169564097	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169564097_A_T:169564097:0,1,0,1
chr1	169564098	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169564097_A_T:169564097:0,1,0,1
chr1	169564101	.	C	CTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:169564097_A_T:169564097:0,1,0,1
chr1	169564130	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	169566132	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	169566372	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:169566372_AG_A:169566372:5,8,1,1
chr1	169566375	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:169566372_AG_A:169566372:5,8,1,1
chr1	169580954	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=208,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	169581530	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:10,6,1,1
chr1	169582887	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=121,84;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,0:10,3:7,7,1,2
chr1	169582899	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=114,84;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:9,3:6,5,1,2
chr1	169588354	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr1	169665551	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:5,3,1,2
chr1	169672343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	169679472	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=201,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	169679553	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:8,12:10,5:12,6,13,4
chr1	169679716	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr1	169695110	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:4,1:4,4:3,5,2,3
chr1	169695957	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=132,124;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr1	169695984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	169696568	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:6,3,2,0
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	169701057	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:2,4,2,0
chr1	169701748	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:9,4,3,0
chr1	169702145	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=185,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169702145_G_A:169702145:0,1,0,1
chr1	169702147	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=185,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169702145_G_A:169702145:0,1,0,1
chr1	169702154	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=185,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169702145_G_A:169702145:0,1,0,1
chr1	169702159	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=185,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169702145_G_A:169702145:0,1,0,1
chr1	169702705	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=57,100;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:1,1,2,1
chr1	169763059	.	A	AAGATTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr1	169773160	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr1	169796765	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=159,121;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169796765_T_C:169796765:3,0,1,0
chr1	169796774	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=159,121;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169796765_T_C:169796765:3,0,1,0
chr1	169796778	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=159,121;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169796778_C_CA:169796778:3,0,1,0
chr1	169796782	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=159,121;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169796778_C_CA:169796778:3,0,1,0
chr1	169812765	.	ATTC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	169838187	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:5,0:11,3:0|1:169838187_T_G:169838187:6,10,0,3
chr1	169838192	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:3,0:10,3:0|1:169838187_T_G:169838187:6,9,0,3
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,11:0,1:0,0,4,8
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.748:10:0,7:2,1:2,0,8,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	169985594	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:10,3,2,0
chr1	170004722	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:0,4,0,6
chr1	170135608	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=15808604,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr1	170501385	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,7,10
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	170513992	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=114,178;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,0:12,3:0|1:170513992_T_G:170513992:7,17,0,3
chr1	170514000	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=113,178;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:9,0:11,3:0|1:170513992_T_G:170513992:7,16,0,3
chr1	170521650	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	170689059	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=55,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:170689059_G_T:170689059:1,1,0,1
chr1	170689063	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=55,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:170689059_G_T:170689059:1,1,0,1
chr1	170699535	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170699535_T_A:170699535:0,2,0,1
chr1	170699537	.	AGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170699535_T_A:170699535:0,2,0,1
chr1	170699545	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170699535_T_A:170699535:0,2,0,1
chr1	170699547	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170699535_T_A:170699535:0,2,0,1
chr1	170699549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,21;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170699535_T_A:170699535:0,2,0,1
chr1	170699575	.	G	GGGAAAAATGTTATTTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	170914769	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:170914769_A_G:170914769:0,3,0,1
chr1	170914771	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:170914769_A_G:170914769:0,3,0,1
chr1	170914777	.	G	GTTTTCAATTTTAGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:170914769_A_G:170914769:0,2,0,1
chr1	170928833	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	170967526	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr1	170967574	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170967574_G_A:170967574:0,0,0,1
chr1	170967593	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:170967574_G_A:170967574:0,1,0,1
chr1	171031424	.	AGTGCCAGGCCAGACAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr1	171077372	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=80,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:3,4,1,3
chr1	171120948	.	ATGTTTAACTGCTTGATG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171120948_ATGTTTAACTGCTTGATG_A:171120948:1,0,1,0
chr1	171120971	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171120948_ATGTTTAACTGCTTGATG_A:171120948:1,0,1,0
chr1	171120977	.	TTA	GAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:171120948_ATGTTTAACTGCTTGATG_A:171120948:1,0,1,0
chr1	171121503	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	171174816	.	G	GGCGGTGGGTGCTGGATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	171247903	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:8,5,2,0
chr1	171306560	.	A	AAAAGAGGCAAAAGCAGAGGAGAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:171306560_A_AAAAGAGGCAAAAGCAGAGGAGAAC:171306560:1,0,0,1
chr1	171306566	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:171306560_A_AAAAGAGGCAAAAGCAGAGGAGAAC:171306560:1,0,0,1
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr1	171494202	.	C	CTCACCAGGCAGATTCTTAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=186,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	171496868	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,5:4,6:4,3,10,1
chr1	171496997	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=110,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:20,5:14,0:14,20,4,1
chr1	171506644	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,142;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.407:33:7,7:9,6:7,13,6,7
chr1	171530239	.	A	AACCGTGTTTAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:0|1:171530239_A_AACCGTGTTTAG:171530239:4,6,1,1
chr1	171530241	.	A	ATGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:171530239_A_AACCGTGTTTAG:171530239:4,6,1,1
chr1	171536024	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171536024_C_CAT:171536024:0,1,0,1
chr1	171536028	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171536024_C_CAT:171536024:0,1,0,1
chr1	171536031	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171536024_C_CAT:171536024:0,1,0,1
chr1	171548617	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	171556268	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	171751236	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0|1:171751236_T_C:171751236:0,0,3,7
chr1	171751241	.	A	AATGCATGCTCTCTGGTTTCCTTGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:171751236_T_C:171751236:2,6,1,1
chr1	171755146	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=113,122;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:3,6,4,0
chr1	171755170	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:2,1,3,3
chr1	171761421	.	G	GACTAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	171763522	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=82,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:4,0:2,2:3,3,1,2
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=99,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,3:4,2:4,1,2,3
chr1	171765591	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,1,3
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	172002498	.	TCCAAAAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,15;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	172277845	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:0,3:2,0:3,0,3,1
chr1	172356524	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=124,90;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:0|1:172356524_G_A:172356524:10,13,1,1
chr1	172356526	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=124,90;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:172356524_G_A:172356524:10,13,1,1
chr1	172356534	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=124,90;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:7,2:0|1:172356524_G_A:172356524:8,13,1,1
chr1	172356536	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=133,90;MMQ=60,38;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,0:5,3:6,12,1,2
chr1	172356557	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=145,124;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:7,1:2,2:1,8,0,3
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=124,157;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.557:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	172410967	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr1	172425529	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	172425663	.	C	CTGAAAAGTAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172425663_C_CTGAAAAGTAGAG:172425663:0,1,0,1
chr1	172425665	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=123,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172425663_C_CTGAAAAGTAGAG:172425663:0,1,0,1
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	172431435	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,8,6
chr1	172437753	.	C	CATGTCCAGCTAATTTTTTGTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	172539941	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,0:9,4:2,11,0,4
chr1	172557924	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:22,0:7,2:0|1:172557924_A_C:172557924:16,15,1,1
chr1	172557928	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:23,0:6,2:0|1:172557924_A_C:172557924:16,17,1,1
chr1	172571326	.	TCCTAAAAGTAATCAGTATCCAAGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=143,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,1:2,0:1,5,1,1
chr1	172577864	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,6:1,2:6,2,6,3
chr1	173157541	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:2,1:2,2:4,0,4,0
chr1	173454569	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,1:7,2:9,8,1,2
chr1	173475964	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=105,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,1:1,4:4,1,2,4
chr1	173490407	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=104,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr1	173490616	.	CTATATA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=TA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.778:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	173499102	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,72;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:5,0:11,3:5,11,1,2
chr1	173569231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=157,84;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,3:4,0:2,2,3,0
chr1	173594022	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr1	173638898	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=126,47;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr1	173721141	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:173721141_CCA_C:173721141:0,3,0,1
chr1	173721144	.	A	T,AGACG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,27,27;MFRL=113,177,141;MMQ=60,60,40;MPOS=4,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,0:1,0,1:0,2,0,2
chr1	173721145	.	GGC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:173721141_CCA_C:173721141:0,3,0,1
chr1	173721148	.	AGGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=132,141;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	173721152	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	173744838	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,1627;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,0:7,4:10,5,2,2
chr1	173795803	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33,33;MFRL=126,155,158;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=5.88,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.354,0.237:9:3,3,1:0,0,1:3,1,5,0
chr1	173797626	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:173797626_T_TG:173797626:0,2,0,1
chr1	173797634	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:173797626_T_TG:173797626:0,2,0,1
chr1	173808681	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:1,9,1,2
chr1	173819421	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.868:6:0,1:0,2:0,0,3,3
chr1	173840285	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:173840285_A_C:173840285:0,0,0,1
chr1	173840288	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173840285_A_C:173840285:0,0,0,1
chr1	173840292	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173840285_A_C:173840285:0,0,0,1
chr1	173840297	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173840285_A_C:173840285:0,0,0,1
chr1	173840300	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173840285_A_C:173840285:0,0,0,1
chr1	173842630	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:5,3,4,3
chr1	173855208	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,7:5,1:6,4,6,2
chr1	173878885	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr1	173912742	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=180,110;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:173912742_GTT_G:173912742:1,3,0,1
chr1	173912745	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=180,110;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:173912742_GTT_G:173912742:1,3,0,1
chr1	173912747	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=180,110;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:173912742_GTT_G:173912742:1,3,0,1
chr1	173947746	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr1	173952101	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:173952101_T_C:173952101:0,2,0,1
chr1	173952108	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:173952101_T_C:173952101:0,2,0,1
chr1	173962153	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,0:2,3:1,4,1,2
chr1	173962164	.	A	ACACAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	174274347	.	G	GTGGGGCGGGGTTATGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	174517006	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	174781128	.	GT	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174781128_GT_TA:174781128:0,1,0,1
chr1	174781135	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174781128_GT_TA:174781128:0,1,0,1
chr1	174781137	.	G	GGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174781128_GT_TA:174781128:0,1,0,1
chr1	174945171	.	CTGTATGACTGTGA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTATGACTGTGA;STR;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.672:13:0,4:3,5:2,2,5,4
chr1	174947885	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=135,264;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:8,2:2,0:8,2,3,0
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr1	174983765	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr1	174984068	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=104,142;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:174984068_TC_T:174984068:0,3,0,1
chr1	174984073	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=104,142;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:174984068_TC_T:174984068:0,3,0,1
chr1	174987790	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174987790_T_TTA:174987790:0,1,0,1
chr1	174987793	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:174987790_T_TTA:174987790:0,1,0,1
chr1	174987796	.	CACT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:174987790_T_TTA:174987790:0,1,0,1
chr1	175053098	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:175053098_T_C:175053098:1,0,0,2
chr1	175053101	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:175053098_T_C:175053098:1,0,0,2
chr1	175063144	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:7,5,3,0
chr1	175086169	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,6:10,0:11,7,6,0
chr1	175087677	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=100,145;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,1,1
chr1	175087683	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=112,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr1	175087729	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=85,74;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,3:2,8:3,3,5,6
chr1	175092707	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=100,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:5,3,5,3
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	175129947	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.725:2:0,1:0,1:0|1:175129947_TTC_T:175129947:0,0,1,1
chr1	175129955	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.725:2:0,0:0,1:0|1:175129947_TTC_T:175129947:0,0,1,1
chr1	175292694	.	A	ATCACACACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	175293513	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=110,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:4,3,1,1
chr1	175299439	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	175332965	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,0:4,6:0|1:175332965_T_C:175332965:2,8,0,6
chr1	175332971	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,0:4,6:0|1:175332965_T_C:175332965:2,6,0,6
chr1	175355128	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	175355152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	175355438	.	C	CAAGTTTGCCTTGAACATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=103,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	175372451	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:175372451_A_T:175372451:2,4,1,1
chr1	175372452	.	G	GACA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:175372451_A_T:175372451:2,4,1,1
chr1	175372456	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:175372451_A_T:175372451:2,4,1,1
chr1	175375683	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,5,6
chr1	175375746	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=93,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,0:1,3:2,2,0,3
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	175996673	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	176050441	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=111,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:4,0:0,1:0|1:176050441_A_AG:176050441:2,2,0,1
chr1	176050448	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=127,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:176050441_A_AG:176050441:1,2,0,1
chr1	176050451	.	A	AGAAAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:176050441_A_AG:176050441:1,3,0,1
chr1	176050454	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:176050441_A_AG:176050441:1,3,0,1
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:1,0,10,0
chr1	176661359	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=168,108;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:3,5,0,4
chr1	176668788	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176668788_C_A:176668788:0,0,0,1
chr1	176668790	.	C	CACAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176668788_C_A:176668788:0,0,0,1
chr1	176668795	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:176668788_C_A:176668788:0,0,0,1
chr1	176671969	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	176680949	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=126,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:8,2,0,2
chr1	176740324	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,0:2,4:4,6,0,4
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	176905586	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	176913215	.	ATTT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=140,99;MMQ=50,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	176992553	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:6,2:6,1:3,9,0,3
chr1	176999917	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=89,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,5,1
chr1	177133693	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr1	177198998	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:2,5:2,6:0,4,4,7
chr1	177199296	.	C	CTGCAGTACATATGGTAGGTGCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,42;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr1	177225022	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=91,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:4,5,2,1
chr1	177247959	.	C	CAAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	177249915	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177249915_G_A:177249915:1,2,0,1
chr1	177249917	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177249915_G_A:177249915:1,2,0,1
chr1	177249919	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:177249915_G_A:177249915:1,2,0,1
chr1	177250057	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:177250057_T_A:177250057:1,3,0,1
chr1	177250061	.	GC	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:177250057_T_A:177250057:1,3,0,1
chr1	177250065	.	G	GCACTCTTGCAGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=135,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:177250057_T_A:177250057:1,3,0,1
chr1	177250637	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177250637_A_G:177250637:0,0,0,1
chr1	177250638	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177250637_A_G:177250637:0,0,0,1
chr1	177250639	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177250637_A_G:177250637:0,0,0,1
chr1	177899000	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.288:15:7,4:4,0:6,5,1,3
chr1	177902370	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr1	177902801	.	AT	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:177902801_AT_TA:177902801:0,2,0,1
chr1	177902809	.	TGAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:177902801_AT_TA:177902801:0,2,0,1
chr1	177902813	.	A	AGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=119,195;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:177902801_AT_TA:177902801:0,1,0,1
chr1	177906657	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=299,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,1,4
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	177917122	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	177923440	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	177930096	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=89,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,1,3
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,1,2
chr1	177937146	.	T	TGCTCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCCGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:177937146_T_TGCTCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCCGTG:177937146:0,3,0,1
chr1	177937151	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:177937146_T_TGCTCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCCGTG:177937146:0,3,0,1
chr1	178426005	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=70,88;MMQ=44,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:3,0:0,2:1,3,1,1
chr1	178426039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=106,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178426039_G_T:178426039:0,1,0,1
chr1	178426041	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=18,32;MFRL=106,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:178426039_G_T:178426039:0,1,0,1
chr1	178426044	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=106,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:178426039_G_T:178426039:0,1,0,1
chr1	178426046	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178426039_G_T:178426039:0,0,0,1
chr1	178442373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:178442373_G_A:178442373:0,4,0,1
chr1	178442376	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:178442373_G_A:178442373:0,4,0,1
chr1	178442414	.	C	CTGAGAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	178490899	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	178490901	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	178490905	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:178490905_C_A:178490905:0,4,0,1
chr1	178490906	.	C	CACTTTGGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:178490905_C_A:178490905:0,4,0,1
chr1	178492490	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=113,72136095;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr1	178492555	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178492555_GT_G:178492555:0,0,0,1
chr1	178492561	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178492555_GT_G:178492555:0,0,0,1
chr1	178492563	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178492555_GT_G:178492555:0,0,0,1
chr1	178492565	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178492555_GT_G:178492555:0,0,0,1
chr1	178746031	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,5:1,4:0,1,3,6
chr1	178820511	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178820511_A_G:178820511:0,1,0,1
chr1	178820513	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178820511_A_G:178820511:0,1,0,1
chr1	178834456	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=124,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:2,0:2,2,3,0
chr1	178854162	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	178858711	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	178871423	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=69,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:178871423_A_G:178871423:0,2,0,2
chr1	178871424	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=69,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:178871423_A_G:178871423:0,2,0,2
chr1	178871427	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=69,169;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:178871423_A_G:178871423:0,2,0,2
chr1	179012947	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,4:9,1:8,4,4,1
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=61,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.560:32:9,5:4,11:9,5,12,6
chr1	179063412	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179063412_T_G:179063412:0,1,0,1
chr1	179063418	.	GAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179063412_T_G:179063412:0,1,0,1
chr1	179066907	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	179084080	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,4:6,5:8,3,1,8
chr1	179086419	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr1	179086748	.	G	GAACTTTGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,3:4,1:6,4,1,3
chr1	179089475	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	179089491	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	179100348	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=141,143;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179100348_A_G:179100348:2,0,1,0
chr1	179100351	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=141,143;MMQ=50,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179100348_A_G:179100348:2,0,1,0
chr1	179100357	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=141,143;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179100348_A_G:179100348:2,0,1,0
chr1	179100370	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=147,132;MMQ=50,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179100370_TG_CA:179100370:2,0,1,0
chr1	179100374	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=147,132;MMQ=50,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179100370_TG_CA:179100370:2,0,1,0
chr1	179198284	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179198284_G_A:179198284:0,0,0,1
chr1	179198285	.	A	ATAGGCTCCATTGTGTGTTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179198284_G_A:179198284:0,0,0,1
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	179316687	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:7,5,7,1
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,2:10,0:10,4,2,0
chr1	179354304	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.520:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr1	179401564	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=119,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,6:0,1:0,1,0,7
chr1	179401577	.	G	GAGAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,1:0,1:0,7,0,2
chr1	179452194	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr1	179502827	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=86,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,6:0,5:1,0,8,4
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=107,113;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.925:23:1,10:0,11:1,0,14,8
chr1	179504130	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,1,22
chr1	179520506	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:1,3,4,5
chr1	179623528	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=67,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	179659827	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:6,4,1,2
chr1	179660016	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr1	179660142	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179660142_CA_C:179660142:0,0,0,1
chr1	179660145	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179660142_CA_C:179660142:0,0,0,1
chr1	179815559	.	C	CTCCTTATCTCTCCCCTGGACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	179816027	.	G	GTTGATAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	179821874	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,0:3,5:0,8,0,5
chr1	179821928	.	TA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179821928_TA_CC:179821928:0,0,0,1
chr1	179821933	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179821928_TA_CC:179821928:0,0,0,1
chr1	179873275	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179873275_T_C:179873275:0,0,0,1
chr1	179873279	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179873275_T_C:179873275:0,0,0,1
chr1	179876900	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=57,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:3,8:1,5:3,1,10,3
chr1	179877129	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=91,156;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	179975762	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:3,13,0,3
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	180006063	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=114,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:6,5,1,1
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	180031502	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	180062539	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,0:10,2:0|1:180062539_G_A:180062539:6,5,1,1
chr1	180062546	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:0,0:8,2:0|1:180062539_G_A:180062539:6,5,1,1
chr1	180062550	.	A	AATCCACT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,0:9,2:0|1:180062539_G_A:180062539:5,4,1,1
chr1	180062551	.	G	GAAGAC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:0,0:9,2:0|1:180062539_G_A:180062539:5,4,1,1
chr1	180063348	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=138,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:5,1:10,2:0|1:180063348_A_T:180063348:13,3,1,2
chr1	180063350	.	GAAGACAACC	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:6,1:10,2:0|1:180063348_A_T:180063348:19,4,1,2
chr1	180063361	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,1:12,2:0|1:180063348_A_T:180063348:19,4,1,2
chr1	180063363	.	ATG	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,1:12,2:0|1:180063348_A_T:180063348:20,4,1,2
chr1	180063366	.	CTGAAGCTTCAGA	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:11,1:13,2:0|1:180063348_A_T:180063348:20,5,1,2
chr1	180064828	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:7,7:5,2:4,8,3,6
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	180144585	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.511:2:1,0:0,0:0|1:180144585_A_C:180144585:0,1,0,1
chr1	180144586	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=121,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.511:2:1,0:0,0:0|1:180144585_A_C:180144585:0,1,0,1
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:180155376_C_G:180155376:0,0,0,5
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:180155376_C_G:180155376:0,0,0,5
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	180165563	.	T	TCCGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=126,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr1	180166231	.	G	GGTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180166231_G_GGTCA:180166231:0,1,0,1
chr1	180166232	.	ACCCC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180166231_G_GGTCA:180166231:0,1,0,1
chr1	180166248	.	T	TATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	180217656	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180217656_G_A:180217656:0,0,0,1
chr1	180217659	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180217656_G_A:180217656:0,0,0,1
chr1	180217664	.	CAGCAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180217656_G_A:180217656:0,0,0,1
chr1	180241183	.	TC	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	180757007	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:2,3:3,1:3,2,1,4
chr1	180772518	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	180849494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:180849494_T_C:180849494:0,0,0,2
chr1	180849501	.	TAAAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180849494_T_C:180849494:0,0,0,1
chr1	180849508	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180849494_T_C:180849494:0,0,0,1
chr1	180887125	.	GTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=102,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180887125_GTA_G:180887125:0,1,0,1
chr1	180887129	.	G	GCCAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=102,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180887125_GTA_G:180887125:0,1,0,1
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	180897569	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=114,160;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:2,3,1,1
chr1	180897707	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.756:2:0,0:0,2:0|1:180897707_C_T:180897707:0,0,1,1
chr1	180897715	.	T	TTTGAGTGTGTGAATGTGTGTGTTAAGATGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=142,70;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,1:0|1:180897707_C_T:180897707:0,1,1,1
chr1	180897717	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=142,70;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:180897707_C_T:180897707:0,1,0,1
chr1	180953853	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr1	180953866	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr1	180991665	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	181022884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:181022884_C_T:181022884:0,1,0,1
chr1	181022900	.	CCAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:181022884_C_T:181022884:0,1,0,1
chr1	181022905	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:181022884_C_T:181022884:0,1,0,1
chr1	181480708	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,2,0,1
chr1	181480711	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,2,0,1
chr1	181480713	.	GG	TT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:181480713_GG_TT:181480713:0,1,0,1
chr1	181480715	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,24;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,1,0,1
chr1	181480716	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:181480713_GG_TT:181480713:0,1,0,1
chr1	181480717	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,29;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,1,0,1
chr1	181480720	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,0,0,1
chr1	181480722	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:181480708_G_T:181480708:0,0,0,1
chr1	181685354	.	A	ATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	181690886	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr1	181700354	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=73,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,2:7,1:11,6,2,1
chr1	181708485	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	181721265	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=86,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,4:2,0:1,2,3,2
chr1	181721418	.	A	AAACAAAGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,24;MFRL=121,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	181727875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=85,66;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,1:0,2:3,1,2,1
chr1	181731840	.	G	GTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181731840_G_GTTGT:181731840:0,1,0,1
chr1	181731842	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181731840_G_GTTGT:181731840:0,1,0,1
chr1	181740560	.	A	AAAAGAGCAAGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181740560_A_AAAAGAGCAAGT:181740560:0,1,0,1
chr1	181740562	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181740560_A_AAAAGAGCAAGT:181740560:0,1,0,1
chr1	181740566	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181740560_A_AAAAGAGCAAGT:181740560:0,1,0,1
chr1	181740570	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:181740560_A_AAAAGAGCAAGT:181740560:0,1,0,1
chr1	181745213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,0:4,2:12,3,1,1
chr1	181752769	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,7:0,8:0,0,5,11
chr1	181762907	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:1,5,0,3
chr1	181764124	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=109,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:0,0:2,1,0,2
chr1	181767549	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	181767551	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	181767558	.	G	GCCCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	181767559	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	181767563	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	181767565	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=164,96;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:181767549_C_CCT:181767549:0,1,0,1
chr1	182026114	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:182026114_G_A:182026114:3,1,0,1
chr1	182026126	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:182026114_G_A:182026114:4,0,0,1
chr1	182026538	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,6:1,2:3,0,6,2
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:0,4,3,6
chr1	182356521	.	TAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:182356521_TAAA_T:182356521:0,1,0,1
chr1	182356525	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:182356521_TAAA_T:182356521:0,1,0,1
chr1	182356527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:182356521_TAAA_T:182356521:0,1,0,1
chr1	182427383	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	182457342	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,2:4,0:6,1,2,0
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	182500070	.	A	ACACGTGCTG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=119,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	182500073	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:182500073_C_CG:182500073:0,2,0,1
chr1	182500074	.	A	ATGGT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,22;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0|1:182500073_C_CG:182500073:0,2,0,1
chr1	182500082	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:182500082_C_A:182500082:0,1,0,1
chr1	182500084	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:182500082_C_A:182500082:0,1,0,1
chr1	182500086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:182500082_C_A:182500082:0,1,0,1
chr1	182500089	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:182500082_C_A:182500082:0,1,0,1
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=141,61114389;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	182522552	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr1	182525281	.	G	GCCATATCTGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:182525281_G_GCCATATCTGGGCT:182525281:0,1,0,1
chr1	182525283	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:182525281_G_GCCATATCTGGGCT:182525281:0,1,0,1
chr1	182525284	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:182525281_G_GCCATATCTGGGCT:182525281:0,1,0,1
chr1	182550350	.	TTGTTCATACCTTAGTCGTCCACTTGTCAAAACTTTTGGAA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:2,2:8,0:11,7,1,1
chr1	182571537	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:13,4:20,0:20,13,4,0
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	182635936	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,1,1
chr1	182775471	.	GC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.538:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	182787916	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:1,2:3,2,1,1
chr1	182811904	.	T	TGGCCGGGAGCGGTGGCTGATGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	182844132	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=131,52;MMQ=60,34;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:6,0:0,8,0,2
chr1	182850483	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,8:4,1:2,3,5,4
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	182872217	.	G	GAAGCATAGCTATTTTGGAAAGAAATGAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:7,3,0,2
chr1	182908794	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	183079853	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	183084607	.	AC	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	183085696	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=133,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr1	183095185	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	183095234	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:4,5:1,2:3,3,3,5
chr1	183095477	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,1,3
chr1	183097795	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,2:6,3:7,1,3,2
chr1	183099701	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	183101444	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=125,81;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:183101444_A_C:183101444:1,0,1,1
chr1	183101451	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,81;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:183101444_A_C:183101444:1,0,2,1
chr1	183101471	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:183101444_A_C:183101444:1,0,3,1
chr1	183101686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	183103965	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=76,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,0:2,3:2,5,2,1
chr1	183104013	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	183105534	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,5:3,4:6,1,5,4
chr1	183106739	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:1,1,3,0
chr1	183177218	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:1,2,2,4
chr1	183194665	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	183194929	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:183194929_G_T:183194929:0,1,0,1
chr1	183194931	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:183194929_G_T:183194929:0,1,0,1
chr1	183194935	.	C	CTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:183194929_G_T:183194929:0,1,0,1
chr1	183203443	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:6,1,2,1
chr1	183205511	.	GAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCTCAAAGTCCTCTTTTTATTACCGCCCCCTCCCCACCCCCAACACCAGATTGGAGA	G	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=121,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,4:0.038:80:2,0:11,3:19,57,2,2
chr1	183205523	.	CAA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=139,167;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.706:11:0,1:0,7:0,3,8,0
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:2,3,0,3
chr1	183259442	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:183259442_G_GCC:183259442:0,1,0,1
chr1	183259445	.	A	AGTATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:183259442_G_GCC:183259442:0,1,0,1
chr1	183273891	.	TGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr1	183481964	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=68,128;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,1:9,0:0|1:183481964_C_T:183481964:3,18,2,0
chr1	183481966	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=62,128;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:10,0:9,0:0|1:183481964_C_T:183481964:3,20,2,0
chr1	183481968	.	CT	AA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=68,128;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:11,0:11,0:0|1:183481964_C_T:183481964:4,21,2,0
chr1	183482136	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:183482136_GC_G:183482136:0,1,0,1
chr1	183482138	.	TTTAAATA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:183482136_GC_G:183482136:0,1,0,1
chr1	183496658	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,3:7,1:8,0,3,1
chr1	183503007	.	G	GCTACATCGATGAAATGCCTAAGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,305;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr1	183511400	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=128,255;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.206:22:7,0:10,4:0|1:183511400_C_T:183511400:7,11,4,0
chr1	183511407	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,0;MFRL=156,255;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:7,0:12,0:0|1:183511400_C_T:183511400:10,9,4,0
chr1	183519004	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:15,2:15,14,0,2
chr1	183534977	.	TGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:183534977_TGGG_T:183534977:0,1,0,1
chr1	183534983	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=96,193;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0|1:183534977_TGGG_T:183534977:1,1,0,1
chr1	183592701	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	183617954	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	183913540	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	183914468	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	183938538	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=94,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:1,2:8,0:4,6,1,1
chr1	183938560	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=119,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,0:8,2:6,7,1,1
chr1	183944281	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:1,3,0,2
chr1	184023585	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,2:10,0:0|1:184023585_A_G:184023585:5,17,0,2
chr1	184023586	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:9,0:0|1:184023585_A_G:184023585:5,17,0,2
chr1	184041469	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=119,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=83,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:5,2,3,4
chr1	184559788	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	184560030	.	G	GGGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=202,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184560030_G_GGGCC:184560030:0,1,0,1
chr1	184560033	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=202,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184560030_G_GGGCC:184560030:0,1,0,1
chr1	184560034	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=202,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184560030_G_GGGCC:184560030:0,1,0,1
chr1	184560040	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=202,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184560030_G_GGGCC:184560030:0,1,0,1
chr1	184567463	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	184588814	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184588814_A_C:184588814:0,1,0,1
chr1	184588815	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184588814_A_C:184588814:0,1,0,1
chr1	184588818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:184588814_A_C:184588814:0,1,0,1
chr1	184675814	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:2,3,3,1
chr1	184677464	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr1	184677496	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:1,3,0,6
chr1	184677521	.	C	CCCAGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	184679719	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr1	184679756	.	A	ACCAGTGCATCCCTCACC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	184681081	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	184681110	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=198,165;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	184681797	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184681797_A_G:184681797:0,2,0,1
chr1	184681799	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184681797_A_G:184681797:0,2,0,1
chr1	184681801	.	A	ACTTAGGTATTTAATCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184681797_A_G:184681797:0,2,0,1
chr1	184686857	.	A	AACATCATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	184688237	.	C	CGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:3,0,1,1
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	184706212	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=98.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,10:0,22:0,0,12,21
chr1	184718750	.	GAAAA	G,GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=16,26,19;MFRL=143,143,165;MMQ=60,60,60;MPOS=25,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.24,7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,6:0.187,0.470:12:1,1,2:0,0,1:1,3,2,6
chr1	184764229	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	184777154	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=66,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr1	184787988	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:3,0:0|1:184787988_G_A:184787988:1,3,0,1
chr1	184787996	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=190,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:184787988_G_A:184787988:0,2,0,1
chr1	184853739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	184853890	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=85,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:3,2,1,2
chr1	185060944	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=148,100;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:185060944_C_A:185060944:0,2,0,1
chr1	185060950	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,20;MFRL=148,100;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:0,0:0|1:185060944_C_A:185060944:0,2,0,1
chr1	185060967	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=150,163;MMQ=48,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:185060967_G_A:185060967:0,2,0,1
chr1	185060968	.	A	ATTTATCCTATAAGTGTACATG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=150,163;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:185060967_G_A:185060967:0,2,0,1
chr1	185106810	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,4:5,0:4,9,4,0
chr1	185109401	.	TAAAG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:185109401_TAAAG_T:185109401:0,0,0,1
chr1	185109408	.	T	TTCAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=253,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:185109401_TAAAG_T:185109401:0,1,0,1
chr1	185109411	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=253,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185109401_TAAAG_T:185109401:0,1,0,1
chr1	185109416	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=253,119;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185109401_TAAAG_T:185109401:0,1,0,1
chr1	185114753	.	G	GAAC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,1:1,1:0|1:185114753_G_GAAC:185114753:0,5,1,1
chr1	185114754	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:185114753_G_GAAC:185114753:0,5,1,1
chr1	185114760	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:185114753_G_GAAC:185114753:0,4,1,1
chr1	185114762	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:1,0:0|1:185114753_G_GAAC:185114753:0,5,1,1
chr1	185240441	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=112,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:11,3:15,0:17,14,2,1
chr1	185833565	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr1	185897871	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=27,27;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897874	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897875	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897878	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897882	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=23,33;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897884	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=21,32;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897888	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,1,0,1
chr1	185897895	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,0,0,1
chr1	185897896	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:185897871_AG_A:185897871:0,0,0,1
chr1	185950160	.	TTTGGAAAGATCCAGTCAGAGACAACAGTAACAGTGACCGGAC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.228:17:6,1:2,2:6,8,1,2
chr1	185969145	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=120,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	185992192	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:7,6,1,1
chr1	186007890	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	186022032	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	186023165	.	T	TATGTGTAAGTGAGATCATGCCATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	186031832	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=176,160;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186031832_C_T:186031832:0,1,0,1
chr1	186031834	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=176,160;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186031832_C_T:186031832:0,1,0,1
chr1	186031839	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=176,160;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186031832_C_T:186031832:0,1,0,1
chr1	186039006	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	186045752	.	C	CTTTATACGATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	186055371	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	186057181	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	186064538	.	C	CAAGATCTGTACATTGTTCTCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr1	186081918	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	186086160	.	C	CAGCTAGTTTAACATGGTA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:9,5,1,1
chr1	186086578	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	186113566	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	186113852	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	186115062	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,3,0
chr1	186141301	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr1	186151493	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	186156991	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	186158605	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	186277088	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr1	186277526	.	G	GGTCAAACTGTGTCCTTCAAGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:4,0:0,2:1,3,1,1
chr1	186278051	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,0:8,5:6,12,2,3
chr1	186279058	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:1,7,0,4
chr1	186286782	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	186300790	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	186301538	.	T	TACAAAGCATGAGGTGTCATTCCTAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	186304167	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=98,701;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,0,2
chr1	186304298	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,2,2
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr1	186313293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=1962561,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	186313312	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=3925002,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186313312_AT_A:186313312:0,1,0,1
chr1	186313317	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=3925002,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:186313312_AT_A:186313312:0,1,0,1
chr1	186313319	.	CT	GC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186313312_AT_A:186313312:0,0,0,1
chr1	186313423	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,126;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr1	186314729	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:1,3:3,3,2,1
chr1	186319282	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	186326757	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:2,3,1,2
chr1	186327871	.	G	GAACTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186327871_G_GAACTT:186327871:0,0,0,1
chr1	186327873	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186327871_G_GAACTT:186327871:0,0,0,1
chr1	186329869	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr1	186330700	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	186342629	.	TC	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	186344137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=102,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:8,3:3,0:4,8,1,2
chr1	186355318	.	C	CGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr1	186360814	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,1:4,5:6,3,3,3
chr1	186363211	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	186367459	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=104,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr1	186367619	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	186368089	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,973;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:8,8,0,2
chr1	186370598	.	T	TTCTG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTG;STR;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.948:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr1	186370630	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=122,105;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.222:7:4,0:2,1:0,6,0,1
chr1	186413594	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr1	186863385	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	186908385	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:2,2,0,2
chr1	186908450	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186908450_A_C:186908450:0,1,0,1
chr1	186908452	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,14;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:186908450_A_C:186908450:0,1,0,1
chr1	186908456	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186908450_A_C:186908450:0,1,0,1
chr1	186908458	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186908450_A_C:186908450:0,1,0,1
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	186925194	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	186957477	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,122;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:7,4,2,0
chr1	190195469	.	A	AAGAATGTGTATTCCGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	192128532	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:192128532_C_CT:192128532:0,1,0,1
chr1	192128534	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:192128532_C_CT:192128532:0,1,0,1
chr1	192128537	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:192128532_C_CT:192128532:0,1,0,1
chr1	192128540	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,21;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:192128532_C_CT:192128532:0,1,0,1
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	192546028	.	A	AGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	192780088	.	GCT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=41.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:5,7:12,7:10,7,8,6
chr1	192780337	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=105,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,0,4
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	193094375	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,3,6
chr1	193121669	.	T	TAAGTCCTTCCCTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr1	193121678	.	T	TTTTCTTTCTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=TTTC;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:193121678_T_TTTTCTTTCTTTC:193121678:0,0,0,1
chr1	193121686	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:193121678_T_TTTTCTTTCTTTC:193121678:0,0,0,1
chr1	193150099	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=72,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr1	196254970	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	196274428	.	T	TACTTAGGAGATGTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	196309523	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=278,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,5:1,2:0,2,3,4
chr1	196311417	.	T	TGTATTTCCCACTGGGTATTCTTTAGCATGTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	196311422	.	A	ACAGGACAGAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	196392172	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,2:8,2:7,5,3,1
chr1	196461411	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,4:9,0:7,15,4,0
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr1	196642072	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=96,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,1:4,1,4,0
chr1	196642233	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:3,4,1,3
chr1	196642969	.	C	CT,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32,25;MFRL=127,121,153;MMQ=60,60,60;MPOS=9,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.28,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.247,0.246:9:2,0,0:3,2,1:3,2,2,2
chr1	196646633	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,0,2
chr1	196711265	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:196711265_G_T:196711265:0,2,0,1
chr1	196711268	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:196711265_G_T:196711265:0,2,0,1
chr1	196711279	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:196711279_C_T:196711279:0,0,0,1
chr1	196711281	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:196711279_C_T:196711279:0,0,0,1
chr1	196749194	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	196757250	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,164;MMQ=40,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:1,2:2,0:0|1:196757250_C_G:196757250:3,0,1,1
chr1	196757258	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,132;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1|0:196757250_C_G:196757250:3,1,2,0
chr1	196796184	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr1	196801190	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	196881825	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=109,131;MMQ=35,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:7,1,1,1
chr1	196883678	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,112;MMQ=52,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:6,7,2,1
chr1	196973903	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=1052,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:196973903_C_T:196973903:1,0,0,1
chr1	196973904	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=1052,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:196973903_C_T:196973903:1,0,0,1
chr1	197008597	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,1,2
chr1	197009889	.	A	ATAATCTGACC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:0|1:197009889_A_ATAATCTGACC:197009889:1,13,0,2
chr1	197009891	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:7,2:6,0:0|1:197009889_A_ATAATCTGACC:197009889:1,13,0,2
chr1	197009895	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:197009889_A_ATAATCTGACC:197009889:0,12,0,2
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	197029742	.	T	TCCCAATGAC,TGCGACATCTTCAAATGTTTTTCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30,31;MFRL=167,94,148;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.284,0.280:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr1	197030087	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:3,3,0,4
chr1	197030201	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	197030237	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	197063352	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr1	197074362	.	T	TTATCCTAGATTGCAGGATGATTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,0:0,1:0|1:197074362_T_TTATCCTAGATTGCAGGATGATTGA:197074362:0,0,0,1
chr1	197074366	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197074362_T_TTATCCTAGATTGCAGGATGATTGA:197074362:0,0,0,1
chr1	197091808	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	197094202	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr1	197101303	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	197101483	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,87;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,0:16,3:11,17,1,2
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,15,4
chr1	197141404	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:197141404_T_A:197141404:4,13,1,1
chr1	197141406	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:197141404_T_A:197141404:4,13,1,1
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.456:31:9,7:8,7:8,9,9,5
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr1	197396917	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=67,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,3:0,0:0,2,1,2
chr1	197411422	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=156,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,3:6,0:1,9,1,2
chr1	197447037	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	197480927	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:4,7:3,3:4,3,4,6
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	197576334	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0|1:197576334_A_ATT:197576334:0,3,0,1
chr1	197576336	.	C	CCTTCTAAAATAAAGGCTAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0|1:197576334_A_ATT:197576334:0,3,0,1
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,17:0,0,18,8
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	197886570	.	TTTTTCTTTCTTTGTGTTCAAAACTA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.098:29:12,2:8,0:13,14,1,1
chr1	197887121	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	198231863	.	T	TGAAGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=183,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:198231863_T_TGAAGCC:198231863:0,1,0,1
chr1	198231865	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:198231863_T_TGAAGCC:198231863:0,1,0,1
chr1	198288546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=131,1806;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:7,0:1,2:4,5,0,2
chr1	198697438	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:0,3:4,1:3,1,4,0
chr1	198698420	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=158,124;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:198698420_A_G:198698420:0,3,0,2
chr1	198698422	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	198698425	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=158,124;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:198698420_A_G:198698420:0,3,0,2
chr1	198698430	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=162,109;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:198698430_G_T:198698430:0,3,0,1
chr1	198698433	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=162,109;MMQ=60,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:198698430_G_T:198698430:0,3,0,1
chr1	198704313	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,134;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:19,7:17,0:21,15,7,0
chr1	198711170	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,2:4,0:2,10,0,3
chr1	198717218	.	G	GTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.371:13:3,2:4,3:6,2,4,1
chr1	198828210	.	GG	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:198828210_GG_AT:198828210:2,4,1,1
chr1	198828214	.	GA	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:198828210_GG_AT:198828210:2,5,1,1
chr1	200014762	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,1,0,2
chr1	200014766	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,1,0,2
chr1	200080463	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr1	200080516	.	T	TGGAATGGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	200090120	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,1:0,4:0,4,0,5
chr1	200143064	.	CTTTTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,154,147;MMQ=60,60,60;MPOS=8,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.92,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.385,0.495:5:0,1,0:0,1,3:0,0,5,0
chr1	200182637	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:200182637_G_T:200182637:0,0,1,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:200182637_G_T:200182637:0,0,2,0
chr1	200182664	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:200182637_G_T:200182637:0,0,2,0
chr1	200182703	.	GGAGGACGCCGGAGAGGAGGCCGGA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.813:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	200183398	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,52;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0,0,9,6
chr1	200183435	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,84;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,0:5,3:9,6,2,1
chr1	200183460	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,9,5
chr1	200311868	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=68,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:1,1,3,5
chr1	200311910	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,2:1,1:0,2,1,2
chr1	200377491	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:10,3:3,1:9,4,4,0
chr1	200378731	.	TGCCGCCGCC	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=GCC;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,2:3,0:2,11,1,1
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=177,142;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:0|1:200523514_A_G:200523514:6,0,2,0
chr1	200523518	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1|0:200523514_A_G:200523514:5,0,2,0
chr1	200534440	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:200534440_T_TAA:200534440:0,1,0,1
chr1	200534446	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:200534440_T_TAA:200534440:0,1,0,1
chr1	200538962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr1	200549563	.	T	TTAAATGTAAAAATAAATATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.314:4:1,0:2,1:0|1:200549563_T_TTAAATGTAAAAATAAATATA:200549563:0,3,0,1
chr1	200549568	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:200549563_T_TTAAATGTAAAAATAAATATA:200549563:0,3,0,1
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	200555203	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:2,4:2,12:2,2,11,5
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	200571192	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:200571192_A_T:200571192:0,1,0,1
chr1	200571197	.	C	CACAAATAATAGTTAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200571192_A_T:200571192:0,0,0,1
chr1	200575794	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chr1	200583380	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,666;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	200594005	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=110,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,2:5,1:7,5,3,0
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	200801546	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=160,144;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	200801550	.	CT	AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:200801550_CT_AC:200801550:0,4,0,1
chr1	200801552	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=160,144;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:200801552_A_G:200801552:0,3,0,1
chr1	200801555	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=160,139;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:200801550_CT_AC:200801550:0,3,0,1
chr1	200801559	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=237,142;MMQ=60,38;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	200801561	.	AGTGG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=160,139;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:200801550_CT_AC:200801550:0,3,0,1
chr1	200801563	.	TGG	CAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=237,144;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:200801552_A_G:200801552:0,2,0,1
chr1	200802059	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=144,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:200802059_C_G:200802059:0,2,0,1
chr1	200802061	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=144,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:200802059_C_G:200802059:0,2,0,1
chr1	200816521	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	200818004	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=80,1438;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:4,4,3,0
chr1	200819104	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,57318009;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	200822560	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:10,3:12,0:14,9,2,1
chr1	200877850	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:2,5:0,12:1,1,11,7
chr1	200960307	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:200960307_G_A:200960307:0,2,1,3
chr1	200960312	.	G	GACACCTTTATCTTGGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:200960307_G_A:200960307:1,3,0,1
chr1	200967490	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:5,4:1,1:5,1,5,0
chr1	200967729	.	CCAGCGTTAGGGCGAGGGGCAAATTGGGGAGCAGATGTGCCAG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:200967729_CCAGCGTTAGGGCGAGGGGCAAATTGGGGAGCAGATGTGCCAG_C:200967729:1,3,0,1
chr1	200967773	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:200967729_CCAGCGTTAGGGCGAGGGGCAAATTGGGGAGCAGATGTGCCAG_C:200967729:0,1,0,1
chr1	200967777	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,25;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:200967729_CCAGCGTTAGGGCGAGGGGCAAATTGGGGAGCAGATGTGCCAG_C:200967729:0,1,0,1
chr1	200967779	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:200967729_CCAGCGTTAGGGCGAGGGGCAAATTGGGGAGCAGATGTGCCAG_C:200967729:0,1,0,1
chr1	201013669	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=151,195;MMQ=44,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:201013669_C_T:201013669:0,2,0,1
chr1	201013677	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=151,195;MMQ=44,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:201013669_C_T:201013669:0,2,0,1
chr1	201013680	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=151,195;MMQ=44,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:201013669_C_T:201013669:0,2,0,1
chr1	201016296	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr1	201017756	.	G	GAGAAAAGTAGCATGAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	201017832	.	G	GGGGATAGAAAACGGCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201017832_G_GGGGATAGAAAACGGCACA:201017832:0,1,0,1
chr1	201017835	.	C	CTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201017832_G_GGGGATAGAAAACGGCACA:201017832:0,1,0,1
chr1	201019614	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,8377992;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr1	201019725	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:201019725_C_G:201019725:0,1,0,1
chr1	201019726	.	T	TTTCACAGAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=148,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:201019725_C_G:201019725:0,1,0,1
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:6,8:3,3:5,5,6,5
chr1	201021662	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=102,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,11;RU=G;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:5,0:0|1:201021662_T_TGGGGGG:201021662:12,1,0,4
chr1	201021668	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,19;MFRL=93,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:5,1:0|1:201021662_T_TGGGGGG:201021662:13,2,0,4
chr1	201021671	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=93,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:8,0:7,0:0|1:201021662_T_TGGGGGG:201021662:13,2,0,4
chr1	201022738	.	G	GCCACTAGGGACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201022738_G_GCCACTAGGGACA:201022738:0,3,0,1
chr1	201022741	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:201022738_G_GCCACTAGGGACA:201022738:0,3,0,1
chr1	201022743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:201022738_G_GCCACTAGGGACA:201022738:0,3,0,1
chr1	201023717	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:7,3:9,9,2,1
chr1	201030647	.	AGAGTCAGGCT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=332,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	201031663	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201031663_G_A:201031663:0,0,0,1
chr1	201031679	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:201031663_G_A:201031663:0,0,0,1
chr1	201031730	.	G	GCAGACACATATTCACAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201036172	.	T	TATAAGCAGCAGAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	201038687	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=94,137;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:5,2:3,1:7,1,1,3
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,1,5
chr1	201047075	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:1,3,3,5
chr1	201047111	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:1,2,2,5
chr1	201052310	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=89,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,2:0|1:201052310_A_T:201052310:2,0,2,0
chr1	201052312	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=89,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:201052310_A_T:201052310:2,0,2,0
chr1	201052342	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:3,3,4,0
chr1	201052474	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr1	201056899	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=54,70;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,0:1,4:2,0,2,2
chr1	201058692	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201062936	.	CTGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	201063030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:5,3,0,2
chr1	201063084	.	G	GCCATGAAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,1,1
chr1	201081220	.	C	CTCTTCCTTCTCCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	201116076	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201116076_T_TC:201116076:0,1,0,1
chr1	201116077	.	A	AATGCCAGGGTATGCTCACAGTGGCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201116076_T_TC:201116076:0,1,0,1
chr1	201122816	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	201173104	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	201174149	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201174149_G_GC:201174149:1,0,1,0
chr1	201174157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:201174149_G_GC:201174149:2,0,1,0
chr1	201174194	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:5,1,1,1
chr1	201185858	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	201185874	.	T	TAAGAAGGCGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=94,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr1	201191993	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=103,57;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:3,3,0,2
chr1	201195062	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,0:4,4:4,4,2,2
chr1	201195245	.	C	CCATCTATGTGCCAGTCATCTGCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr1	201293512	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	201294244	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:201294244_G_C:201294244:1,3,0,1
chr1	201294246	.	G	GGCTTACACCCTCAACTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:201294244_G_C:201294244:1,3,0,1
chr1	201328890	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201328890_T_TA:201328890:0,2,0,1
chr1	201328891	.	G	GCATCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201328890_T_TA:201328890:0,2,0,1
chr1	201328917	.	G	GGATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201328917_G_GGATA:201328917:0,1,0,1
chr1	201328919	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:201328917_G_GGATA:201328917:0,1,0,1
chr1	201332437	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:13,0:19,3:24,8,0,3
chr1	201334880	.	CCTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201334880_CCTT_C:201334880:0,1,0,1
chr1	201334887	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201334880_CCTT_C:201334880:0,1,0,1
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr1	201336077	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:201336077_T_TC:201336077:0,2,0,1
chr1	201336081	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:201336077_T_TC:201336077:0,2,0,1
chr1	201336984	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr1	201337010	.	T	TGGCCCTGTGCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	201339066	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr1	201341341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	201353827	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	201386271	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	201453967	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:5,0:3,3:1,7,0,4
chr1	201454385	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:3,1,3,4
chr1	201457914	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr1	201687451	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	201687922	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:1,0:0|1:201687922_T_A:201687922:0,2,0,1
chr1	201687924	.	G	GCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201687922_T_A:201687922:0,2,0,1
chr1	201687925	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=129,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201687922_T_A:201687922:0,2,0,1
chr1	201754528	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,2:7,3:2,6,0,5
chr1	201757748	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:3,2,1,2
chr1	201758998	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,169;MMQ=36,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr1	201828209	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=165,163;MMQ=60,36;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201828209_G_A:201828209:0,2,0,1
chr1	201828212	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=165,163;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201828209_G_A:201828209:0,2,0,1
chr1	201828216	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=165,163;MMQ=60,36;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:201828209_G_A:201828209:0,2,0,1
chr1	201828221	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=165,163;MMQ=60,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201828209_G_A:201828209:0,2,0,1
chr1	201832513	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,144;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:5,4,2,0
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,12:0,0,13,5
chr1	201840539	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=163,150;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	201840545	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=163,150;MMQ=40,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:201840545_C_T:201840545:0,3,0,1
chr1	201840552	.	TC	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=163,150;MMQ=40,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:201840545_C_T:201840545:0,3,0,1
chr1	201843997	.	AGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:1,1:1,9,1,2
chr1	201844109	.	TTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:201844109_TTGC_T:201844109:0,4,0,1
chr1	201844116	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:201844109_TTGC_T:201844109:0,4,0,1
chr1	201844123	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:201844109_TTGC_T:201844109:0,4,0,1
chr1	201845092	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.316:13:7,0:2,3:5,4,2,2
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr1	201868326	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201868326_C_A:201868326:0,0,1,0
chr1	201868333	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201868326_C_A:201868326:0,0,1,0
chr1	201926403	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:10,4:8,7:12,7,7,4
chr1	201934578	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:3,4:2,4:3,2,5,3
chr1	201938600	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,0:13,4:14,11,4,0
chr1	201938657	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=131,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:0|1:201938657_T_C:201938657:4,13,0,3
chr1	201938662	.	G	GCATAGCAAGCCAGTCTGTCATATGTTATACCAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=132,99;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,0:8,3:0|1:201938657_T_C:201938657:3,14,0,3
chr1	201969082	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,6:3,3:3,5,6,3
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=81,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:1,2:4,3,2,1
chr1	201980492	.	A	AATCAAAGAGGGATATACTAATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.668:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201983242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	202092415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	202097700	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	202103496	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:202103496_A_G:202103496:4,0,1,0
chr1	202103500	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:202103496_A_G:202103496:4,0,1,0
chr1	202107422	.	AACACACAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=AC;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:0,0:2,0,2,0
chr1	202122783	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	202123019	.	C	CTCCATCTATTGAATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:202123019_C_CTCCATCTATTGAATG:202123019:0,4,0,1
chr1	202123021	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:202123019_C_CTCCATCTATTGAATG:202123019:0,4,0,1
chr1	202123023	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=114,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:202123019_C_CTCCATCTATTGAATG:202123019:0,4,0,1
chr1	202123055	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	202127467	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:202127467_A_C:202127467:0,0,0,1
chr1	202127469	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202127467_A_C:202127467:0,0,0,1
chr1	202127511	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202127511_A_G:202127511:0,0,0,1
chr1	202127513	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202127511_A_G:202127511:0,0,0,1
chr1	202127526	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202127511_A_G:202127511:0,0,0,1
chr1	202130028	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202130028_A_AT:202130028:0,0,0,1
chr1	202130033	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202130028_A_AT:202130028:0,0,0,1
chr1	202163621	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	202163815	.	G	GTGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=157,123;MMQ=46,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:202163815_G_GTGTT:202163815:1,2,0,1
chr1	202163817	.	G	GTTGTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=157,123;MMQ=46,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:202163815_G_GTGTT:202163815:1,2,0,1
chr1	202173087	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:2,2:4,0:2,5,1,1
chr1	202183292	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=108,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,2,0
chr1	202183308	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,18;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:2,0:0|1:202183308_C_G:202183308:2,2,0,1
chr1	202183312	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,22;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:202183308_C_G:202183308:2,2,0,1
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	202194508	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,0,2
chr1	202194715	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:202194715_A_AT:202194715:0,0,0,1
chr1	202194716	.	G	GGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:202194715_A_AT:202194715:0,0,0,1
chr1	202194722	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202194715_A_AT:202194715:0,0,0,1
chr1	202197161	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:8,1:2,2:4,6,0,3
chr1	202205123	.	TGAGTCATTAGAGGGCTGGTCTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,3507;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,1,2
chr1	202287066	.	GATCTCTCCTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:202287066_GATCTCTCCTAC_G:202287066:1,1,1,0
chr1	202287079	.	GGCCCC	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:0,0:0|1:202287066_GATCTCTCCTAC_G:202287066:2,1,1,1
chr1	202287086	.	TCAAGCCCTG	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:202287066_GATCTCTCCTAC_G:202287066:3,1,1,1
chr1	202287100	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:202287066_GATCTCTCCTAC_G:202287066:2,1,1,1
chr1	202287102	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.438:5:2,2:1,0:0|1:202287066_GATCTCTCCTAC_G:202287066:2,1,1,1
chr1	202301174	.	GTA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202301174_GTA_G:202301174:0,0,0,1
chr1	202301178	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202301174_GTA_G:202301174:0,0,0,1
chr1	202318316	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr1	202410006	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202410006_C_T:202410006:0,0,0,1
chr1	202410009	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202410006_C_T:202410006:0,0,0,1
chr1	202457784	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,122;MMQ=46,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,7:1,3:4,5,2,8
chr1	202536848	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,3,1
chr1	202544295	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:3,1:0,0:0|1:202544295_TC_T:202544295:1,2,0,1
chr1	202544301	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,1:1,0:0|1:202544295_TC_T:202544295:1,3,0,1
chr1	202549780	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=105,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	202549788	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	202566120	.	C	CCCCAGGACTGTCACCTCCTCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:1,4,1,1
chr1	202566137	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:202566137_T_TG:202566137:0,3,0,1
chr1	202566140	.	C	CGTACCTCCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:202566137_T_TG:202566137:0,3,0,1
chr1	202570918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	202703053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	202710025	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202710025_G_GCT:202710025:0,0,0,1
chr1	202710027	.	A	ACATCTAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202710025_G_GCT:202710025:0,0,0,1
chr1	202715244	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr1	202718028	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr1	202718202	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr1	202718238	.	A	AATAAGGCCTAGGGCCTAGGCTAGGAATTTTATGAGTCTGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=103,67;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:4,2:5,0:7,2,1,1
chr1	202722277	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	202732000	.	T	TGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	202861875	.	TA	T,CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26,30;MFRL=192,210,127;MMQ=60,60,60;MPOS=15,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr1	202861877	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=210,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	202861879	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,10:0,3:0,0,6,7
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=56,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:1,1,1,7
chr1	202920127	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:5,9,2,1
chr1	202936082	.	G	GCAAGTTACTTGACGCTTCCGAGCCCTGTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	202936351	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:202936351_T_TA:202936351:2,5,1,1
chr1	202936354	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:202936351_T_TA:202936351:2,5,1,1
chr1	202978032	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	202987770	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	202987796	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	202990110	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.689:4:0,0:0,3:0,1,0,3
chr1	203014577	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr1	203014877	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=11609,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:203014877_G_A:203014877:1,1,1,0
chr1	203014897	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=22980,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:203014877_G_A:203014877:0,1,1,1
chr1	203015344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=123,90;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,7:2,0:3,1,5,2
chr1	203022921	.	C	CTATGATGTATTCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203022921_C_CTATGATGTATTCAA:203022921:1,0,0,1
chr1	203022924	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203022921_C_CTATGATGTATTCAA:203022921:1,0,0,1
chr1	203025209	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr1	203028468	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:203028468_TG_T:203028468:0,3,0,1
chr1	203028470	.	CTGTGA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:203028468_TG_T:203028468:0,3,0,1
chr1	203028478	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:203028468_TG_T:203028468:0,3,0,1
chr1	203028482	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:203028468_TG_T:203028468:0,3,0,1
chr1	203028483	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:203028468_TG_T:203028468:0,3,0,1
chr1	203029017	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=103,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:4,1:3,4,0,2
chr1	203029043	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:203029043_G_GAT:203029043:0,3,0,1
chr1	203029046	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:203029043_G_GAT:203029043:0,3,0,1
chr1	203029049	.	G	GGAGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:203029043_G_GAT:203029043:0,3,0,1
chr1	203030685	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	203037696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=135,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:6,2,2,0
chr1	203040740	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	203040922	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=111,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,4:0,4:0,1,4,4
chr1	203045583	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr1	203053017	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,156;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,7:1,0:3,2,7,0
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=98,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,3:3,0:4,5,1,2
chr1	203134508	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:7,1,1,1
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	203148633	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,8:0,0,8,7
chr1	203149724	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=100,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,0:1,3:5,2,0,3
chr1	203149775	.	AT	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203149775_AT_CA:203149775:1,0,0,1
chr1	203149782	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203149775_AT_CA:203149775:1,0,0,1
chr1	203149784	.	G	GCGGAAAATGTGAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203149775_AT_CA:203149775:1,0,0,1
chr1	203155882	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203155882_G_C:203155882:0,0,0,1
chr1	203155888	.	G	GCTGTGCCTCTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203155882_G_C:203155882:0,0,0,1
chr1	203316804	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,438;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,4:1,0:2,5,0,4
chr1	203317162	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,5,12
chr1	203670128	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	203671125	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,1:6,1:6,1,2,0
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	203683359	.	CA	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:203683359_CA_GT:203683359:1,1,0,1
chr1	203683363	.	TG	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:203683359_CA_GT:203683359:1,1,0,1
chr1	203691728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,2,0
chr1	203691891	.	A	AGGACTAAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203691891_A_AGGACTAAGCT:203691891:0,1,0,1
chr1	203691894	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203691891_A_AGGACTAAGCT:203691891:0,1,0,1
chr1	203693164	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:203693164_TC_T:203693164:0,1,1,0
chr1	203693166	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:203693164_TC_T:203693164:0,1,1,0
chr1	203709034	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	203740615	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,1,2
chr1	203741368	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	203803048	.	A	ACCCAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:203803048_A_ACCCAC:203803048:0,4,0,1
chr1	203803051	.	C	CATAAGCATTTAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:203803048_A_ACCCAC:203803048:0,4,0,1
chr1	203803053	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:203803048_A_ACCCAC:203803048:0,4,0,1
chr1	203809349	.	AT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	203816214	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	203819177	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=104,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:1,4,2,6
chr1	203819864	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=53,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:203819864_A_AT:203819864:1,1,0,1
chr1	203819868	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=106,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:203819864_A_AT:203819864:1,2,0,1
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	204082323	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	204085583	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:2,2:1,4:2,1,2,4
chr1	204091564	.	T	TCCTCCATCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204091564_T_TCCTCCATCA:204091564:0,0,0,1
chr1	204091567	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204091564_T_TCCTCCATCA:204091564:0,0,0,1
chr1	204094963	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	204115823	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:4,3,0,3
chr1	204115934	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	204116741	.	GCCTCTGCCTGTTGCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	204118823	.	C	CTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:204118823_C_CTTA:204118823:0,0,1,1
chr1	204118825	.	C	CTCCCTTCGCTGACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:204118823_C_CTTA:204118823:0,0,1,1
chr1	204125086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204125086_G_A:204125086:0,0,0,1
chr1	204125088	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204125086_G_A:204125086:0,0,0,1
chr1	204125459	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	204125741	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	204125745	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,12;MFRL=54,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:0,0:0,0:1,1,1,0
chr1	204125937	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	204129671	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	204129907	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	204131060	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=114,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr1	204131106	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,0:6,2:5,4,2,0
chr1	204135371	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=91,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:12,10,1,2
chr1	204159787	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204159787_G_C:204159787:0,0,1,0
chr1	204159789	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204159787_G_C:204159787:0,0,1,0
chr1	204168462	.	A	ATTTAGTACCATTCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	204199660	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=118,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:10,2:0|1:204199660_C_A:204199660:10,12,1,1
chr1	204199667	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:0|1:204199660_C_A:204199660:10,14,1,1
chr1	204210997	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	204218149	.	G	GACACCCTCCTGCCTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	204219821	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	204234196	.	G	GGTGT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=65,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=GT;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:1,1:1,1:1,2,2,1
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:204234222_T_C:204234222:0,0,2,4
chr1	204234225	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:204234222_T_C:204234222:0,0,2,4
chr1	204394723	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:2,4,2,0
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	204412458	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=243,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,11,16
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,13:0,12:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,11,16
chr1	204418882	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204418882_C_T:204418882:0,0,1,0
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204418882_C_T:204418882:0,0,1,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr1	204425203	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:204425203_G_A:204425203:0,3,0,1
chr1	204425208	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:204425203_G_A:204425203:0,3,0,1
chr1	204429756	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:3,5,2,4
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	204433105	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	204438643	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,10,11
chr1	204494756	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.364:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr1	204495595	.	GT	G,TT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=17,14,25;MFRL=143,164,0;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.07,8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,5:0.223,0.173:21:4,1,2:1,0,3:3,9,3,6
chr1	204589436	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr1	204589497	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:204589497_A_G:204589497:0,0,0,1
chr1	204589515	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204589497_A_G:204589497:0,0,0,1
chr1	204589521	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:204589497_A_G:204589497:0,0,0,1
chr1	204921245	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=523,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:204921245_GT_G:204921245:2,2,0,1
chr1	204921248	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=523,73;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:204921245_GT_G:204921245:2,2,0,1
chr1	204921258	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	204942419	.	C	CTATCAACCTTCCCTCCTTCAGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	204943767	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=98,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:6,3,1,1
chr1	204943992	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	204945839	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=71,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.171:17:12,3:2,0:6,8,1,2
chr1	204953327	.	G	GCTCACCATGAAGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=94266679,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	204955119	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:4,0,1,1
chr1	204971897	.	G	GGCCTTAACTGGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr1	204982068	.	T	TGAAAAGGTGGAAAGACATACATAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	205027410	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr1	205027844	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,132;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr1	205028176	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr1	205028883	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	205028904	.	G	GAAGGGGAAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=196,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	205033890	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:205033890_C_CT:205033890:1,0,0,1
chr1	205033891	.	A	AGGAGAGAGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:205033890_C_CT:205033890:1,0,0,1
chr1	205033893	.	G	GAAGCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:205033890_C_CT:205033890:1,0,0,1
chr1	205033897	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:205033890_C_CT:205033890:1,0,0,1
chr1	205033905	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:205033905_G_C:205033905:0,0,1,0
chr1	205033910	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:205033905_G_C:205033905:0,0,1,0
chr1	205034852	.	A	ATGGCCTGCTGCACTGGTCAGGGCCGGTGGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGCCTGCTGCACTGGTCAGGGCCGGTGGTC;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.661:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr1	205035102	.	C	CAGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	205042446	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:205042446_CA_C:205042446:0,2,0,1
chr1	205042449	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:205042446_CA_C:205042446:0,2,0,1
chr1	205052939	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr1	205066406	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,5:4,0:8,2,5,0
chr1	205068939	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	205116921	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr1	205117346	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr1	205117367	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:205117367_A_G:205117367:3,0,0,1
chr1	205117370	.	A	AATGGAACAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:205117367_A_G:205117367:3,0,0,1
chr1	205133129	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:205133129_G_GA:205133129:0,7,1,1
chr1	205133130	.	C	CAGGGTGAAGTTTTATTAGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:205133129_G_GA:205133129:0,7,1,1
chr1	205157007	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205157007_G_GTT:205157007:0,1,0,1
chr1	205157009	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=208,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205157007_G_GTT:205157007:0,1,0,1
chr1	205272487	.	G	GAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205272487_G_GAGA:205272487:1,0,1,0
chr1	205272488	.	T	TGGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205272487_G_GAGA:205272487:1,0,1,0
chr1	205272722	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,1:0,1,3,2
chr1	205273100	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:3,2,1,1
chr1	205275507	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:205275507_C_CAA:205275507:0,1,0,2
chr1	205275508	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:205275507_C_CAA:205275507:0,1,0,2
chr1	205308328	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:5,2,2,0
chr1	205308335	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:3,2,3,1
chr1	205308566	.	G	GAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=87,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	205308821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:2,2,0,1
chr1	205353439	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,0:8,3:13,5,0,3
chr1	205385498	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	205417586	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=103,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:1,2,1,3
chr1	205495392	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	205495892	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=115,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,2,0
chr1	205495976	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,6:0,2:0,1,1,7
chr1	205500450	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:2,4,1,2
chr1	205568213	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=108,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:2,3:7,1,6,2
chr1	205568216	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:5,6:3,2:6,2,7,1
chr1	205568390	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,4,10
chr1	205568438	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	205589028	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:5,10,1,2
chr1	205632132	.	GCTGGTGC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=132,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205632132_GCTGGTGC_G:205632132:0,1,0,1
chr1	205632140	.	AGCCGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=132,116;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:205632132_GCTGGTGC_G:205632132:0,1,0,1
chr1	205687341	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=149,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	205688681	.	ATTTTC	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,58;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTC;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:8,0:18,2:9,18,1,1
chr1	205719191	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.626:12:0,4:4,0:1,3,0,8
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	205739678	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr1	205769059	.	TAA	GTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	205801872	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,60;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,2:4,1:6,7,1,2
chr1	205811903	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	205813000	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:205813000_T_C:205813000:0,2,0,1
chr1	205813004	.	G	GAAAGTATTCCCTGTCTAATCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	205813005	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:205813000_T_C:205813000:0,2,0,1
chr1	205813278	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:7,4:4,0:6,7,4,0
chr1	205814057	.	AAGACGTTATT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	205884052	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:7,9,2,1
chr1	205884082	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:2,2:7,0:0|1:205884082_G_A:205884082:6,4,0,2
chr1	205884084	.	A	ATTTCACCTCCTCACCACTTACTCCT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:7,0:0|1:205884082_G_A:205884082:7,5,0,2
chr1	205884086	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=110,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,1:7,0:0|1:205884082_G_A:205884082:7,4,0,2
chr1	205884337	.	G	GGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0|1:205884337_G_GGT:205884337:1,2,1,1
chr1	205884339	.	A	AGTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:205884337_G_GGT:205884337:1,2,1,1
chr1	205884600	.	TGCAACCAAGAGGTGACCCTAGGAACCCCTGGCCAG	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=150,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.236:11:2,0:2,2:0|1:205884600_TGCAACCAAGAGGTGACCCTAGGAACCCCTGGCCAG_T:205884600:2,7,0,2
chr1	205884638	.	CA	AT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=153,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:205884600_TGCAACCAAGAGGTGACCCTAGGAACCCCTGGCCAG_T:205884600:2,5,0,2
chr1	205884642	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=153,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:205884600_TGCAACCAAGAGGTGACCCTAGGAACCCCTGGCCAG_T:205884600:2,5,0,2
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:1,0,2,1
chr1	205892386	.	G	GCTCCCACCACTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,0;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,0:2,1,1,0
chr1	205892411	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=75,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:205892411_T_C:205892411:2,1,2,2
chr1	205892415	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=75,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:205892411_T_C:205892411:2,1,2,2
chr1	205893699	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	205896523	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=343,331;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:205896523_G_A:205896523:1,1,1,0
chr1	205896525	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=343,331;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:205896523_G_A:205896523:1,1,1,0
chr1	205896527	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=343,331;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:205896523_G_A:205896523:1,1,1,0
chr1	205896533	.	GAGCTGGCCTGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=545,331;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:205896523_G_A:205896523:1,0,1,0
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	205901883	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,93;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:8,8,2,0
chr1	205902018	.	G	GGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205902018_G_GGGC:205902018:1,0,0,1
chr1	205902019	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205902018_G_GGGC:205902018:1,0,0,1
chr1	205902021	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205902018_G_GGGC:205902018:1,0,0,1
chr1	205904886	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,2:3,2:4,5,2,2
chr1	206145435	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=147,126;MMQ=24,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.315:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr1	206224412	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:1,3:9,5:1,9,3,5
chr1	206225011	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,3:3,5:4,1,6,2
chr1	206225376	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr1	206239659	.	C	CACATGTTTTTTCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	206243442	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,0:7,3:6,6,2,1
chr1	206566904	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=105,94;MMQ=60,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:3,3:6,8:7,3,6,5
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=148,126;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.308:8:3,2:1,0:1,5,0,2
chr1	206574800	.	C	CTCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=212,183;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,126;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	206603535	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.932:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	206610449	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	206619589	.	C	CCAGTGTGTGCTAGTGAATCCCTCCCCTCCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:3,5,1,1
chr1	206619698	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,2,2
chr1	206628456	.	T	TCTTTGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	206648419	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=37,31;MFRL=145,145;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.360:6:4,1:1,0:0|1:206648419_C_CA:206648419:0,5,0,1
chr1	206648421	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=145,145;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.360:6:1,1:1,0:0|1:206648419_C_CA:206648419:0,5,0,1
chr1	206648422	.	C	CTTCAATATATTGATTTTCTTATTTTTGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,145;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:206648419_C_CA:206648419:0,2,0,1
chr1	206661336	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=95,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:5,0:15,2:9,11,0,2
chr1	206661369	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:206661369_C_T:206661369:1,16,1,1
chr1	206661381	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=127,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,0:8,1:0|1:206661369_C_T:206661369:1,12,1,1
chr1	206664209	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chr1	206665896	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	206666734	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	206765254	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=92,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	206765275	.	AGC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206765275_AGC_A:206765275:0,0,0,1
chr1	206765278	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206765275_AGC_A:206765275:0,0,0,1
chr1	206773250	.	C	CAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206773250_C_CAAG:206773250:0,0,0,1
chr1	206773253	.	G	GGCAGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206773250_C_CAAG:206773250:0,0,0,1
chr1	206773256	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206773250_C_CAAG:206773250:0,0,0,1
chr1	206773258	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:206773250_C_CAAG:206773250:0,0,0,1
chr1	206775885	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:206775885_A_T:206775885:1,0,0,1
chr1	206775890	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:206775885_A_T:206775885:1,0,0,1
chr1	206775892	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:206775885_A_T:206775885:1,0,0,1
chr1	206775894	.	T	TTTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:206775885_A_T:206775885:1,0,0,1
chr1	206775897	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=76,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:206775885_A_T:206775885:1,0,0,1
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,1:0,0,6,0
chr1	206781704	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,0:12,2:0|1:206781704_A_G:206781704:10,11,1,1
chr1	206781710	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=116,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:206781704_A_G:206781704:7,10,1,1
chr1	206781712	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:206781704_A_G:206781704:6,12,1,1
chr1	206781713	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=121,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:206781704_A_G:206781704:6,12,1,1
chr1	206781715	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:9,2:0|1:206781704_A_G:206781704:6,11,1,1
chr1	206781718	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:206781704_A_G:206781704:5,10,1,1
chr1	206781721	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:206781704_A_G:206781704:3,10,1,1
chr1	206810436	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:206810436_A_T:206810436:0,2,0,1
chr1	206810437	.	G	GCATTTCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:206810436_A_T:206810436:0,2,0,1
chr1	206902204	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	206902479	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:2,5,1,1
chr1	206902483	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:2,5,1,1
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=89,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,2:9,5:10,8,3,4
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:3,2,4,0
chr1	207009910	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	207013441	.	C	CTGATTTTTCTCAAGATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:207013441_C_CTGATTTTTCTCAAGATT:207013441:0,2,0,1
chr1	207013446	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:207013441_C_CTGATTTTTCTCAAGATT:207013441:0,2,0,1
chr1	207105221	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:207105221_C_CA:207105221:0,2,0,1
chr1	207105222	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:207105221_C_CA:207105221:0,2,0,1
chr1	207106285	.	GGCTCTGGGGTGTTCTCCGAGTGGGGAGCCTTGAATCCTTCCTTACCTGCCGGAATCCACAGATGCTCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:0,5:3,0:4,4,1,4
chr1	207109167	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,5:6,2:4,8,4,3
chr1	207110936	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=99,77;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,5:1,5:1,2,5,5
chr1	207110954	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=71,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:7,1:5,6,1,1
chr1	207113755	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	207143587	.	T	TATACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:6,7:6,4:7,5,4,7
chr1	207244676	.	CTTCATTATCCCTATA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:207244676_CTTCATTATCCCTATA_C:207244676:0,3,0,1
chr1	207244681	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:207244676_CTTCATTATCCCTATA_C:207244676:0,1,0,1
chr1	207262945	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=104,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.198:43:14,0:21,8:10,25,0,8
chr1	207269960	.	G	GACTGATCCTACTAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	207286550	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	207288897	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,2,5
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr1	207304863	.	GTTC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	207304900	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr1	207314608	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=111,120;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	207533053	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr1	207627783	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.411:3:0,1:2,0:0|1:207627783_T_G:207627783:2,0,0,1
chr1	207627785	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:207627783_T_G:207627783:2,0,0,1
chr1	207641840	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=109,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,0:6,6:5,1,5,1
chr1	207642055	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,2,0
chr1	207642295	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	207646898	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=102,163;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:2,1:3,6:2,4,3,4
chr1	207653444	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=565,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	207658944	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	207659001	.	G	GCATCATTAGTTTACTTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=199,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	207679229	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,1:1,4:5,0,5,0
chr1	207726000	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,152;MMQ=25,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,2,3
chr1	207737458	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207737458_CG_C:207737458:0,0,0,1
chr1	207737461	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:207737458_CG_C:207737458:0,0,0,1
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.862:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	207739127	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=134,109;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:5,2:1,1:5,1,3,0
chr1	207739177	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=126,139;MMQ=52,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:6,7,1,1
chr1	207751403	.	A	AATATGCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=143,163;MMQ=27,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:207751403_A_AATATGCCC:207751403:1,1,0,1
chr1	207751405	.	T	TAGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=143,163;MMQ=27,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:207751403_A_AATATGCCC:207751403:1,1,0,1
chr1	207757936	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	207758232	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=87,115;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,4:7,1:2,7,1,4
chr1	207784968	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	207871105	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=103,0;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:16,0:6,2:14,8,1,1
chr1	207872657	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,1:7,5:2,8,1,5
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,10,5
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,10,5
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0|1:207881485_TA_T:207881485:0,0,10,5
chr1	207941182	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=105,117;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,0:6,3:0|1:207941182_C_T:207941182:5,9,0,3
chr1	207941191	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0|1:207941182_C_T:207941182:0,0,3,11
chr1	207943760	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:10,3:6,14,2,1
chr1	207975379	.	T	TTAAAACGAGATTAAATTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	207990797	.	G	GGTAGTAATGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,1:0,0:1,3,1,1
chr1	207992564	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	208062260	.	TCTG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:208062260_TCTG_T:208062260:0,0,0,1
chr1	208062265	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:208062260_TCTG_T:208062260:0,0,0,1
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,2:2,3:0,4,4,2
chr1	208063100	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.925:9:0,2:0,4:0,0,6,3
chr1	208072582	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,72;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:0|1:208072582_C_T:208072582:4,11,1,1
chr1	208072592	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,72;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:0|1:208072582_C_T:208072582:4,10,1,1
chr1	208072603	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=121,72;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:7,2:0|1:208072582_C_T:208072582:4,8,1,1
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	208212397	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	208213182	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208213182_C_CTTT:208213182:0,1,0,1
chr1	208213185	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208213182_C_CTTT:208213182:0,1,0,1
chr1	208213284	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=106,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	208224411	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,38;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:7,5,1,1
chr1	208224667	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.200:38:8,7:23,0:25,6,7,0
chr1	208252681	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=72,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr1	208255885	.	A	ACGCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,1:1,0:0|1:208255885_A_ACGCC:208255885:0,2,0,1
chr1	208255887	.	G	GTAATCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208255885_A_ACGCC:208255885:0,2,0,1
chr1	208255889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208255885_A_ACGCC:208255885:0,2,0,1
chr1	208255892	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208255885_A_ACGCC:208255885:0,2,0,1
chr1	208270178	.	ACAGGCGATACCCGCAGATAGATCAGGAGCATCACTCACTAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.328:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr1	208315604	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	209605636	.	TAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=18,30;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AGC;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:1,3:0,4,1,2
chr1	209779805	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,1:1,3:2,1,1,3
chr1	209782252	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	209785329	.	C	CATTGTTTTCAGCCTATCCCATAAGCTCCTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=100,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.326:8:4,2:0,0:3,3,1,1
chr1	209786078	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=63,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,2,1
chr1	209789805	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:3,2:9,3,1,1
chr1	209791929	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:3,3,3,1
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr1	209797198	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:0,1,3,2
chr1	209797253	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,2,2
chr1	209799205	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,4:7,5:4,7,4,5
chr1	209799253	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr1	209799288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr1	209801529	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,17;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,0:0|1:209801529_T_A:209801529:2,3,1,1
chr1	209801531	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:209801529_T_A:209801529:2,3,1,1
chr1	209801532	.	C	CCAA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:209801529_T_A:209801529:2,3,1,1
chr1	209801569	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	209801577	.	GT	AC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:209801577_GT_AC:209801577:0,3,0,1
chr1	209801581	.	A	ATTAAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,23;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:209801577_GT_AC:209801577:0,3,0,1
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	209806568	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209806568_C_T:209806568:0,1,0,1
chr1	209806576	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209806568_C_T:209806568:0,1,0,1
chr1	209806578	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209806568_C_T:209806568:0,1,0,1
chr1	209806582	.	T	TAGGACCTTCCACATCTCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209806568_C_T:209806568:0,1,0,1
chr1	209807782	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=113,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:5,4:10,1:5,10,4,1
chr1	209807815	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,2,3
chr1	209811375	.	C	CCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:209811375_C_CCAA:209811375:0,0,0,1
chr1	209811379	.	C	CTAGTTAGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:209811375_C_CCAA:209811375:0,0,0,1
chr1	209811806	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,5,1
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=94,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:5,2:7,6,1,3
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr1	209849408	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=94,9371823;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:8,7,0,2
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,16,5
chr1	209880422	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,2:0|1:209880422_C_CA:209880422:4,3,1,1
chr1	209880424	.	C	CAGGAACTCAGAGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,0:4,2:0|1:209880422_C_CA:209880422:4,4,1,1
chr1	209880427	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:209880422_C_CA:209880422:4,4,1,1
chr1	209905988	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,156;MMQ=47,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:209905988_G_C:209905988:0,4,0,2
chr1	209905991	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=157,156;MMQ=47,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,0:0|1:209905988_G_C:209905988:0,4,0,2
chr1	209936224	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,1:4,5:2,7,0,6
chr1	209936248	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,1:2,0:0|1:209936248_AT_A:209936248:0,2,0,1
chr1	209936250	.	CCATT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:209936248_AT_A:209936248:0,2,0,1
chr1	209936258	.	C	CTGGTA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:209936248_AT_A:209936248:0,2,0,1
chr1	209937020	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=169,114;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209937020_A_T:209937020:0,1,0,1
chr1	209937027	.	T	TCTCCATGTTGGTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=169,114;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209937020_A_T:209937020:0,1,0,1
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr1	209954013	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:209954013_C_G:209954013:0,1,0,1
chr1	209954014	.	A	AGCGCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:209954013_C_G:209954013:0,1,0,1
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,17,5
chr1	209974751	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	210001543	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:210008367_C_G:210008367:0,0,3,2
chr1	210008374	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:210008367_C_G:210008367:0,0,3,2
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr1	210267893	.	TGAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr1	210334081	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr1	210414879	.	CTT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=96,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.217:26:6,3:5,2:9,12,5,0
chr1	210560907	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:6,0:10,4:5,12,2,2
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	210761462	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	210856604	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	210857044	.	C	CAGAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=42,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:210857044_C_CAGAA:210857044:1,3,0,1
chr1	210857049	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=42,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:210857044_C_CAGAA:210857044:1,3,0,1
chr1	210857059	.	C	CTCTCCCTGTCTCTGTCTGTCTCCCGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=161,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.594:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	210857175	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	210948939	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=95,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.623:11:0,1:4,5:2,2,5,2
chr1	210971085	.	G	GAGGATAAAACCCATTTTTCTTATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr1	211093375	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211093375_G_A:211093375:0,0,0,1
chr1	211093376	.	G	GTATATCATCTTTAAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211093375_G_A:211093375:0,0,0,1
chr1	211093378	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211093375_G_A:211093375:0,0,0,1
chr1	211093381	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211093375_G_A:211093375:0,0,0,1
chr1	211192596	.	G	GCAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	211263968	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=53,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr1	211280724	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr1	211444464	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	211447435	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	211452529	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=61,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.838:7:0,4:0,2:0,1,4,2
chr1	211526757	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=79,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	211749107	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr1	211842702	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,0:0,1:0|1:211842702_T_C:211842702:0,0,0,1
chr1	211842706	.	A	AGTTTTTCCACATAATCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211842702_T_C:211842702:0,0,0,1
chr1	211847109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	212115456	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	212142027	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=128,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:5,2:3,0:0|1:212142027_G_T:212142027:7,3,1,1
chr1	212142037	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:212142027_G_T:212142027:7,2,1,1
chr1	212142054	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.795:8:1,3:0,3:1,0,2,5
chr1	212150124	.	C	CACTATCCTGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	212208848	.	CCCCG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:212208848_CCCCG_C:212208848:0,2,0,1
chr1	212208853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:212208848_CCCCG_C:212208848:0,2,0,1
chr1	212208855	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:212208848_CCCCG_C:212208848:0,2,0,1
chr1	212208861	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:212208848_CCCCG_C:212208848:0,2,0,1
chr1	212208862	.	TGCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:212208848_CCCCG_C:212208848:0,2,0,1
chr1	212209367	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	212217944	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.588:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,2:0,0,6,4
chr1	212220700	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,3:11,0:8,9,2,1
chr1	212220847	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr1	212238252	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:6,1,4,0
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	212538768	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:212538768_A_T:212538768:1,2,0,1
chr1	212538771	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,0:0|1:212538768_A_T:212538768:1,2,0,1
chr1	212538795	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:212538795_TG_CA:212538795:0,4,0,1
chr1	212538800	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,19;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:212538795_TG_CA:212538795:0,4,0,1
chr1	212558679	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,3:6,1,1,4
chr1	212616080	.	C	CATTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=82,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=ATTTT;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr1	212617829	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:1,2:3,1:0|1:212617829_C_G:212617829:1,3,2,2
chr1	212617843	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=188,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,1:2,0:0|1:212617829_C_G:212617829:0,6,1,1
chr1	212799070	.	C	CAGAGG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:1,2:2,0:0|1:212799070_C_CAGAGG:212799070:3,0,1,1
chr1	212799072	.	G	GGCCCCACACACCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:212799070_C_CAGAGG:212799070:3,0,1,1
chr1	212799076	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:212799070_C_CAGAGG:212799070:3,0,1,1
chr1	212799078	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=142,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:212799070_C_CAGAGG:212799070:3,0,1,1
chr1	212799949	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:5,5,3,4
chr1	212860267	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=101,74;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,4:8,0:7,5,3,1
chr1	212870410	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,1:6,3:1,6,0,4
chr1	212957827	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,1,2
chr1	212960866	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,7:5,3:8,2,6,4
chr1	212969842	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,32,20;MFRL=155,135,115;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.65,8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,6:0.273,0.479:13:1,1,1:2,2,3:2,1,5,5
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	213009178	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:1,0:1,1:1,2,1,0
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	213046236	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	213061362	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:2,1,2,2
chr1	213062032	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	213062640	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,0,2
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	213068404	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=154,115;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,5:4,3:0,6,2,6
chr1	213068436	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:1,4,0,3
chr1	213068542	.	C	CTGAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,2:4,2,3,2
chr1	213068595	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=90,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:6,6:3,4:6,4,5,5
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=51,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:2,2,3,3
chr1	213140599	.	T	TCCCTCCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	213147443	.	A	AATGTCTTGTTGGCTCTTCACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=107,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	213170732	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	213180441	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=127,0;MMQ=48,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.725:9:1,4:1,2:2,0,0,7
chr1	213181458	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=149,162;MMQ=52,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.361:4:1,1:2,0:0|1:213181458_A_G:213181458:3,0,1,0
chr1	213181477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=149,162;MMQ=52,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.357:4:1,1:2,0:0|1:213181458_A_G:213181458:3,0,1,0
chr1	213224719	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	213349902	.	AA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:213349902_AA_TG:213349902:0,0,0,1
chr1	213349908	.	T	TTCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:213349902_AA_TG:213349902:0,0,0,1
chr1	213403947	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=73,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	213405414	.	GGCAACTGAGGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACTGAGGAT;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.813:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	213405594	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=120,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,0:11,3:10,15,1,2
chr1	213415128	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=150,8;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:213415128_A_AT:213415128:0,3,2,0
chr1	213415129	.	G	GAGGAGAAAGGCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,8;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:213415128_A_AT:213415128:0,3,2,0
chr1	214492104	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,20073830;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	214498118	.	T	TAAAGGAATTCTGCCTGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	214501068	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:214501068_G_A:214501068:7,11,1,1
chr1	214501070	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:8,0:0|1:214501068_G_A:214501068:7,11,1,1
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:5,2,3,1
chr1	214560293	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:1,3,3,3
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:1,1,2,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.758:19:1,6:3,8:2,2,11,4
chr1	214568388	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=97,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:1,2,1,3
chr1	214816550	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,40;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	214818414	.	A	ACTCTAAGGGCTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	214820099	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr1	214820186	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=207,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:214820186_A_G:214820186:1,1,0,1
chr1	214820189	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=207,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:214820186_A_G:214820186:1,1,0,1
chr1	214821949	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	214825289	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=90,567;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	215179369	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:215179369_C_CA:215179369:1,2,1,1
chr1	215179372	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:215179369_C_CA:215179369:1,2,1,1
chr1	215298114	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:10,0:5,3:3,12,0,3
chr1	215342573	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=59,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,6,3
chr1	215345287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr1	215368293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr1	215368492	.	T	TGTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:215368492_T_TGTAGCC:215368492:0,1,0,1
chr1	215368494	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:215368492_T_TGTAGCC:215368492:0,1,0,1
chr1	215368498	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215368492_T_TGTAGCC:215368492:0,0,0,1
chr1	215751168	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=184,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:215751168_G_A:215751168:1,0,0,1
chr1	215751191	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=184,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:215751168_G_A:215751168:1,0,0,1
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,2:0,5:0,3,3,4
chr1	215775514	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:6,11,0,3
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	215791566	.	T	TTATTAGAGACAGGGTCTCACTCTGTCAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	215821080	.	G	GGCACGGAACAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=107,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:215821080_G_GGCACGGAACAC:215821080:0,3,0,1
chr1	215821082	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=107,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:215821080_G_GGCACGGAACAC:215821080:0,3,0,1
chr1	215847889	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:3,2,0,2
chr1	215848078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr1	215853653	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:5,3,2,0
chr1	215853748	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr1	215914646	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	215916730	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	215931922	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=471518,35294497;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,1:2,1,1,1
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	215960125	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:5,5,1,2
chr1	215960153	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr1	216051287	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	216062420	.	A	ACAATATCCATTATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.475:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	216062449	.	C	CCAAGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	216073505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	216074291	.	G	GATCAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	216166263	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr1	216166437	.	CGCCTTCGGGTATGTCCTCGTCAGTTAGGGCCTCACTGGCCTCACTCACTGTGCACCCACCACCTGTGCAA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:6,2:6,0:10,15,1,1
chr1	216222073	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=179,200;MMQ=47,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.302:7:1,0:2,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,6,0,1
chr1	216222074	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,3,0,1
chr1	216222077	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,3,0,1
chr1	216222079	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,28;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,3,0,1
chr1	216222081	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,1,0,1
chr1	216222082	.	AGAGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,25;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,1,0,1
chr1	216222088	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,1,0,1
chr1	216222090	.	A	AGTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:216222073_C_A:216222073:0,1,0,1
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	216390694	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr1	216390925	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=144,155;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr1	216390939	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	216420568	.	C	CTGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=48,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	216495191	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr1	216495248	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:6,4,0,2
chr1	216495400	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	216498834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:3,3,0,4
chr1	216595196	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:216595196_T_C:216595196:1,2,0,1
chr1	216595204	.	GT	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:216595196_T_C:216595196:1,2,0,1
chr1	216595207	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:216595196_T_C:216595196:1,2,0,1
chr1	216824521	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,2:2,1:0,2,0,4
chr1	216850907	.	A	AACAATTTACTCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=138,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	216850934	.	AGGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	217793921	.	T	TTTCATCATTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	217804635	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.779:19:1,9:2,6:2,2,12,3
chr1	217856787	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	217947890	.	G	GGCTCCCCATGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=243,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:217947890_G_GGCTCCCCATGCC:217947890:0,1,0,1
chr1	217947893	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=243,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:217947890_G_GGCTCCCCATGCC:217947890:0,1,0,1
chr1	218036237	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr1	218458715	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:3,15:3,9:4,2,16,8
chr1	218458745	.	AGCCGTAGCGTC	A	.	.	DP=47;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:15,1:17,0:0|1:218458745_AGCCGTAGCGTC_A:218458745:23,22,1,1
chr1	218458752	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=106,78;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:16,4:18,0:17,17,3,1
chr1	218458759	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=104,63;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:20,2:16,0:0|1:218458745_AGCCGTAGCGTC_A:218458745:18,23,1,1
chr1	218458761	.	CT	AA	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:22,2:17,0:0|1:218458745_AGCCGTAGCGTC_A:218458745:18,23,1,1
chr1	218578726	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:218578726_AC_TG:218578726:0,0,0,1
chr1	218578732	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218578726_AC_TG:218578726:0,0,0,1
chr1	218578735	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218578726_AC_TG:218578726:0,0,0,1
chr1	218683417	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=93,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.456:5:2,1:0,1:1,2,2,0
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=203,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,2:0,0,11,4
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,12,8
chr1	220101066	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220101066_GT_G:220101066:0,0,1,0
chr1	220101068	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220101066_GT_G:220101066:0,0,1,0
chr1	220101193	.	GA	TT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=162,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:220101193_GA_TT:220101193:1,4,1,1
chr1	220101197	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:220101193_GA_TT:220101193:1,3,1,1
chr1	220101199	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:220101193_GA_TT:220101193:1,3,1,1
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	220145584	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,292;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	220146527	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr1	220151808	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	220154246	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	220154659	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,8,3
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	220160845	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	220170285	.	A	AAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,387;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220170285_A_AAAC:220170285:0,0,1,0
chr1	220170288	.	C	CATCTCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,387;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220170285_A_AAAC:220170285:0,0,1,0
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,5:0,0,1,7
chr1	220180521	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=237,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	220203918	.	G	GTCTTTCTTGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:0|1:220203918_G_GTCTTTCTTGTC:220203918:0,1,0,1
chr1	220203924	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.516:2:1,1:0,0:0|1:220203918_G_GTCTTTCTTGTC:220203918:0,1,0,1
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,8,12
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	220231180	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.452:53:11,11:18,12:21,8,17,7
chr1	220231343	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=179,177;MMQ=52,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,3,0,1
chr1	220231348	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=172,177;MMQ=46,41;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,2,0,1
chr1	220232140	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=139,134;MMQ=45,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220232140_G_A:220232140:3,0,1,0
chr1	220232141	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=139,134;MMQ=45,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220232140_G_A:220232140:3,0,1,0
chr1	220232148	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=123,134;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:220232140_G_A:220232140:3,1,1,0
chr1	220232152	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=123,134;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:220232140_G_A:220232140:3,1,1,0
chr1	220232161	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=126,115;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.356:7:3,2:2,0:0|1:220232140_G_A:220232140:4,1,2,0
chr1	220233197	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr1	220291487	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:5,5,5,3
chr1	220298693	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:220298693_T_C:220298693:2,2,1,1
chr1	220298695	.	TG	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=106,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,0:3,2:0|1:220298693_T_C:220298693:2,3,1,1
chr1	220300191	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:3,10,0,3
chr1	220310332	.	T	TAAATTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=177,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	220325137	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=127,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:2,6,0,2
chr1	220326741	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:11,0:10,5:7,14,0,6
chr1	220332859	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,27;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220332859_C_T:220332859:0,1,0,1
chr1	220332861	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220332859_C_T:220332859:0,1,0,1
chr1	220332863	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220332859_C_T:220332859:0,1,0,1
chr1	220344453	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:2,4:1,4,3,4
chr1	220355521	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=109,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	220357301	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	220368527	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	220375753	.	TGGATAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	220379361	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.255:14:4,0:4,3:2,9,1,2
chr1	220383900	.	CAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	220386119	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr1	220406054	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	220406291	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	220771685	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=130,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:12,4:9,0:11,10,2,2
chr1	220771728	.	AATATATATATATTAT	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:5,2:7,0:3,12,0,2
chr1	220771740	.	TTA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:4,1:5,2:1,9,0,3
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	220773135	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.814:9:1,3:0,4:0,1,2,6
chr1	220792057	.	A	AACT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=143,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:3,0:0,2:0|1:220792057_A_AACT:220792057:0,3,1,1
chr1	220792063	.	TAG	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,1:0|1:220792057_A_AACT:220792057:1,3,1,1
chr1	220792069	.	T	TCTTTGTTCTGCAGTGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=143,68;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:220792057_A_AACT:220792057:1,2,0,1
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr1	220831276	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=156,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr1	220970152	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:3,11,0,2
chr1	220978455	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=90,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:9,11,2,0
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,6:5,4:2,6,2,8
chr1	221055426	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=148,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	221912808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:2,3,2,3
chr1	222700416	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,5:0,3,2,4
chr1	222700430	.	C	CTCTGGGATAGACGTGTCCAAGCAAAATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	222700435	.	A	AAACTCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=127,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	222705270	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=240,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	222705530	.	G	GGCTCTAATTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	222713474	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=130,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:3,3,2,0
chr1	222713503	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,0:5,6:2,5,3,3
chr1	222713670	.	C	CTTGCTTACCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:222713670_C_CTTGCTTACCT:222713670:0,1,0,1
chr1	222713672	.	A	ATTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:222713670_C_CTTGCTTACCT:222713670:0,1,0,1
chr1	222715549	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222715549_G_C:222715549:0,0,0,1
chr1	222715552	.	T	TAAAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222715549_G_C:222715549:0,0,0,1
chr1	222715554	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222715549_G_C:222715549:0,0,0,1
chr1	222715555	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222715549_G_C:222715549:0,0,0,1
chr1	222715557	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222715549_G_C:222715549:0,0,0,1
chr1	222716972	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,2:1,2:0,4,2,2
chr1	222717138	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr1	222717628	.	CG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	222721288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:2,3,2,2
chr1	222721299	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=122,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,4:7,2:4,6,6,0
chr1	222737549	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:222737549_C_A:222737549:0,2,0,1
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:222737549_C_A:222737549:0,0,0,2
chr1	222751009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,3:2,0:2,2,1,2
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	222803375	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:2,3:4,3,1,2
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,14:0,18:0,0,11,22
chr1	222824013	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,122;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.167:34:13,5:16,0:9,20,0,5
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	222832010	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:5,1,2,1
chr1	222835312	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	222838277	.	AT	GG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	222838713	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:5,0:8,9,0,2
chr1	222846856	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=140,138;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	222846868	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr1	222867721	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,0:0,1:0|1:222867721_T_A:222867721:0,0,0,1
chr1	222867728	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:222867721_T_A:222867721:0,0,0,1
chr1	223116327	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:7,2,0,3
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,18:0,6:0,0,17,7
chr1	223178111	.	C	CAGATCTGCTCACTTAGTGCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	223442079	.	T	TGCCCAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.671:1:0,0:0,1:0|1:223442079_T_TGCCCAGCCA:223442079:0,0,0,1
chr1	223442080	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:223442079_T_TGCCCAGCCA:223442079:0,0,0,1
chr1	223442083	.	C	CCTCTGTCTAAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:223442079_T_TGCCCAGCCA:223442079:0,0,0,1
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,2:4,6:3,2,4,4
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	223717379	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	223805881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:3,0,5,0
chr1	223807239	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=113,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:6,4,2,1
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:6,5,2,2
chr1	223853321	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:5,2:2,3,0,2
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	223934720	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	223934760	.	ACCGG	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=128,37;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:4,0:5,5,1,1
chr1	223934811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,2:6,0:6,4,1,1
chr1	223947227	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	223957646	.	G	GCTGACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:3,2,1,1
chr1	223983524	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0|1:223983524_AG_A:223983524:2,1,1,1
chr1	223983527	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0|1:223983524_AG_A:223983524:2,1,1,1
chr1	223983530	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:0,0:0|1:223983524_AG_A:223983524:2,1,1,1
chr1	223986057	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,63;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:8,5,1,1
chr1	223991105	.	C	CTTGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:223991105_C_CTTGA:223991105:4,2,1,1
chr1	223991107	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:223991105_C_CTTGA:223991105:4,2,1,1
chr1	223991804	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:223991804_C_G:223991804:4,0,1,0
chr1	223991806	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:223991804_C_G:223991804:4,0,1,0
chr1	223991808	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=170,141;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:223991808_A_G:223991808:3,0,1,0
chr1	223991812	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=170,141;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:223991808_A_G:223991808:3,0,1,0
chr1	223991813	.	C	CTTAAA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=170,141;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:223991808_A_G:223991808:3,0,1,0
chr1	223991814	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:223991804_C_G:223991804:3,0,1,0
chr1	223991820	.	C	T,A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27,29;MFRL=170,141,143;MMQ=60,40,60;MPOS=31,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:1,0,2,0
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0,0,0,10
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr1	224321754	.	TTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	224321839	.	A	ACTCTTTTTGCTCAAATTATGTTTGTGAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,1,1
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	224345378	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:4,6,1,2
chr1	224363674	.	C	CT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.667:19:4,6:2,4:0|1:224363674_C_CT:224363674:3,3,8,5
chr1	224363683	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,13:0.666:19:3,9:2,4:0|1:224363674_C_CT:224363674:3,3,8,5
chr1	224363746	.	G	GCACT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=155,164;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:224363746_G_GCACT:224363746:0,3,0,1
chr1	224363758	.	TT	CC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=155,164;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:224363746_G_GCACT:224363746:0,3,0,1
chr1	224363765	.	CC	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=156,164;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:224363746_G_GCACT:224363746:0,4,0,1
chr1	224363768	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=156,164;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:224363746_G_GCACT:224363746:0,3,0,1
chr1	224377724	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr1	224424353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	224444643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr1	224444747	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=107,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:5,0:17,2:0|1:224444747_C_T:224444747:7,19,1,1
chr1	224444750	.	T	TTGTGTG	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=104,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:7,0:18,2:0|1:224444747_C_T:224444747:7,18,1,1
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	224468955	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	224468986	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	224473925	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=169,163;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:224473925_T_TC:224473925:0,3,0,1
chr1	224473931	.	T	TAGAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,163;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:224473925_T_TC:224473925:0,3,0,1
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	224495852	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,12,13
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=66.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	224544746	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=96,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr1	224566891	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:224566891_T_A:224566891:0,1,0,1
chr1	224566892	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:224566891_T_A:224566891:0,1,0,1
chr1	224872504	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:6,7,3,0
chr1	224926997	.	CTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=70,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=25,15;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:0,1:1,1,1,0
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	225268524	.	C	CCTAGCAGACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225268524_C_CCTAGCAGACTA:225268524:0,1,0,1
chr1	225268528	.	G	GTAGAAATTGACAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225268524_C_CCTAGCAGACTA:225268524:0,1,0,1
chr1	225270409	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,6,5
chr1	225311340	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=173,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225311340_A_G:225311340:3,1,0,1
chr1	225311343	.	T	TTCTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=173,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225311340_A_G:225311340:3,1,0,1
chr1	225311346	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=182,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:225311340_A_G:225311340:1,1,0,1
chr1	225328430	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	225332137	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,1,1
chr1	225334715	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	225373081	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:4,7,2,0
chr1	225394737	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:5,2,1,1
chr1	225460860	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=131,125;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:225460860_T_C:225460860:0,3,0,1
chr1	225460862	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=131,125;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:225460860_T_C:225460860:0,3,0,1
chr1	225460870	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=147,125;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:225460860_T_C:225460860:0,2,0,1
chr1	225460872	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=147,125;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:225460860_T_C:225460860:0,2,0,1
chr1	225463884	.	A	AGTAGACACGGGGTTTCACGTGTTAGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	225506262	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=63,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:4,0,4,0
chr1	225506427	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	225511905	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,1:1,3:3,0,5,0
chr1	225512402	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	225525299	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	225528340	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:3,2,1,3
chr1	225546172	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	225546449	.	C	CCTATCGTGGGACAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,170;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	225552624	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:1,6,0,5
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	225586176	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	225592171	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,0:14,2:7,13,0,2
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	225610054	.	A	AATTGCCTCATGATTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225610054_A_AATTGCCTCATGATTTT:225610054:0,1,0,1
chr1	225610058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225610054_A_AATTGCCTCATGATTTT:225610054:0,1,0,1
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	226016381	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	226016619	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226016619_G_A:226016619:0,3,0,1
chr1	226016636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226016619_G_A:226016619:0,3,0,1
chr1	226016643	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226016619_G_A:226016619:0,3,0,1
chr1	226016648	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,15;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:226016648_G_T:226016648:0,3,0,1
chr1	226016651	.	G	GCCGGTTC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:226016648_G_T:226016648:0,3,0,1
chr1	226016653	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=21,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:226016648_G_T:226016648:0,1,0,1
chr1	226016656	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:226016648_G_T:226016648:0,0,0,1
chr1	226019540	.	C	CAGTCAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:2,3,1,1
chr1	226026455	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:6,4,1,1
chr1	226036309	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	226043499	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=94,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.654:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	226044766	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	226050609	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=79,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr1	226054914	.	G	GAGAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	226076700	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226108396	.	C	CCCTCCAGTAGGCCCCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	226109045	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=89,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,11:0,9:0,0,6,14
chr1	226173131	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=117,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:14,0:15,3:14,15,3,0
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,17:0,0,4,24
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,13,6
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	226334607	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226334610	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226334623	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226353521	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:10,5:5,1:12,3,6,0
chr1	226453432	.	T	TCGCCCAGGTTGGAG,TCACCCAGGCTGGAGTGCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30,27;MFRL=182,161,143;MMQ=60,40,50;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.250,0.375:5:1,0,2:1,1,0:0,2,0,3
chr1	226485327	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	226550924	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226553726	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,93;MMQ=60,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:12,0:8,13,2,1
chr1	226553843	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:226553843_A_C:226553843:0,1,0,1
chr1	226553845	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:226553843_A_C:226553843:0,1,0,1
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	226564814	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:8,0:6,2:0|1:226564814_C_T:226564814:7,8,1,1
chr1	226564822	.	A	ATAAAGGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:7,2:0|1:226564814_C_T:226564814:7,8,1,1
chr1	226567860	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=209,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	226567868	.	G	GTTCTCTCTCTCTGCTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=209,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	226567915	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226573387	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=95,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr1	226576548	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=94,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr1	226590145	.	C	CCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	226923264	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:3,4:8,2:5,6,2,4
chr1	226923771	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=82,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr1	227071364	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr1	227071377	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:7,2,2,1
chr1	227075939	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	227081622	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:2,2:4,0,4,1
chr1	227081850	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr1	227149171	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.405:5:3,0:0,2:0|1:227149171_C_T:227149171:3,0,1,1
chr1	227149173	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.403:5:3,0:0,2:0|1:227149171_C_T:227149171:3,0,1,1
chr1	227169859	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:227169859_G_A:227169859:0,1,0,2
chr1	227169861	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:227169859_G_A:227169859:0,0,0,3
chr1	227170507	.	C	CTCTCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	227170543	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	227170741	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	227171737	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:227171737_G_T:227171737:0,0,2,0
chr1	227171739	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:227171737_G_T:227171737:0,0,2,0
chr1	227172290	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=55,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:0,5:1,1,4,3
chr1	227172695	.	G	GAGACACCAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=246,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	227182754	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	227182769	.	C	CAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,5,2
chr1	227192865	.	CT	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,25;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227192868	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227192870	.	G	GGGA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227192873	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227192875	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=18,28;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227192878	.	T	TTTCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=11,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:227192865_CT_AA:227192865:1,0,0,1
chr1	227204557	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr1	227210888	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	227213831	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:10,9,1,2
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	227219314	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	227239562	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	227257573	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:7,12,0,2
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,9,8
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,4:0,0,9,3
chr1	227921584	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	227935444	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:2,4:3,4:2,3,3,5
chr1	227954832	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,0:5,5:0,9,0,5
chr1	228109626	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228284991	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr1	228295919	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.516:25:4,8:6,4:5,7,9,4
chr1	228333652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr1	228333852	.	CCG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228333852_CCG_C:228333852:0,1,0,1
chr1	228333855	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228333852_CCG_C:228333852:0,1,0,1
chr1	228352269	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228352269_G_A:228352269:1,0,0,1
chr1	228352272	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228352269_G_A:228352269:1,0,0,1
chr1	228352276	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228352269_G_A:228352269:1,0,0,1
chr1	228352279	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:228352269_G_A:228352269:1,0,0,1
chr1	228362579	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=133,143;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	228362594	.	T	TAAAGCAGCGGTCAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr1	228391768	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,140;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:7,5,0,2
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	228434583	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0|1:228434583_C_T:228434583:0,1,0,1
chr1	228434602	.	AA	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228434583_C_T:228434583:0,0,0,1
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=251,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,4:0,3:1,0,5,3
chr1	228438032	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:228438032_A_T:228438032:0,1,0,1
chr1	228438033	.	C	CCCTCCCTCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:228438032_A_T:228438032:0,1,0,1
chr1	228438036	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228438032_A_T:228438032:0,0,0,1
chr1	228438038	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228438032_A_T:228438032:0,0,0,1
chr1	228438040	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228438032_A_T:228438032:0,0,0,1
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=151,172;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	228463817	.	T	TTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228463817_T_TTGG:228463817:0,1,0,1
chr1	228463821	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228463817_T_TTGG:228463817:0,1,0,1
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	228466750	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	228466862	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:2,4,5,3
chr1	228471379	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	228471466	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,4:1,0:1,0,2,3
chr1	228475919	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=80,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,2:7,1:6,13,2,1
chr1	228479758	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:1,2:5,1:5,2,1,2
chr1	228480282	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,8,14
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	228494357	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228494382	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	228505262	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0|1:228505262_T_C:228505262:0,1,1,1
chr1	228505263	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:228505262_T_C:228505262:0,1,1,1
chr1	228505264	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=120,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:228505262_T_C:228505262:0,1,1,1
chr1	228505668	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,5:0,0,14,5
chr1	228505699	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr1	228509523	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:228509523_A_AG:228509523:0,2,1,1
chr1	228509525	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:228509523_A_AG:228509523:0,2,1,1
chr1	228509528	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:228509523_A_AG:228509523:0,2,1,1
chr1	228522602	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228522602_G_A:228522602:0,0,0,1
chr1	228522607	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:228522602_G_A:228522602:0,2,0,1
chr1	228523447	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	228524861	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	228525008	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:3,2,0,2
chr1	228526768	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228526768_A_T:228526768:0,0,0,1
chr1	228526773	.	C	CAGAGAAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228526768_A_T:228526768:0,0,0,1
chr1	228527844	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr1	228528609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=18,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:228528609_C_T:228528609:0,2,1,1
chr1	228528614	.	C	CAGACACCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:228528609_C_T:228528609:0,2,1,1
chr1	228528618	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:228528609_C_T:228528609:0,2,0,1
chr1	228528620	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:228528609_C_T:228528609:0,2,0,1
chr1	228528622	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:228528609_C_T:228528609:0,2,0,1
chr1	228552632	.	A	AACCACAGATTGTTGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,1:0|1:228552632_A_AACCACAGATTGTTGAC:228552632:3,0,1,1
chr1	228552636	.	T	TTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:228552632_A_AACCACAGATTGTTGAC:228552632:4,0,0,1
chr1	228552638	.	A	ATCATATTCTCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=116,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:228552632_A_AACCACAGATTGTTGAC:228552632:4,0,0,1
chr1	228554047	.	G	GTGTTAGGAAGTATGTCAAGAAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228555739	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228555739_A_T:228555739:0,1,0,1
chr1	228555745	.	T	TCCCCAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228555739_A_T:228555739:0,0,0,1
chr1	228557832	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.709:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	228559956	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228559956_C_T:228559956:0,0,1,0
chr1	228559965	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:228559956_C_T:228559956:1,0,1,0
chr1	228565089	.	CTGCACAG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	228582643	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,2:3,1:3,3,1,2
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	228602552	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr1	228612638	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,3:7,1:7,9,3,1
chr1	228646263	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,5:8,5:3,9,3,7
chr1	228646356	.	C	CGT,CGTGT,CGTGTGTGTGT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32,30,32;MFRL=184,123,118,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,7,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,15,16,19;RU=GT;STR;TLOD=7.14,3.02,6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,3,7:0.195,0.223,0.447:15:0,3,1,3:2,0,2,1:2,0,13,0
chr1	228646548	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=106,49;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:16,0:13,2:16,14,1,1
chr1	228646666	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228646666_G_A:228646666:0,0,0,1
chr1	228646671	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228646666_G_A:228646666:0,0,0,1
chr1	228646677	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228646666_G_A:228646666:0,0,0,1
chr1	228647697	.	ATT	A,AT	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=24,24,24;MFRL=151,147,134;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.98,44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,7,20:0.216,0.691:29:2,5,15:0,2,5:0,2,8,19
chr1	228647722	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:19,2:4,0:0|1:228647722_C_T:228647722:1,23,1,1
chr1	228647724	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:20,2:4,0:0|1:228647722_C_T:228647722:1,23,1,1
chr1	228647759	.	T	TCATGA	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=28,28;MFRL=163,149;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.257:10:7,2:1,0:0,8,0,2
chr1	228647813	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228647813_CC_TT:228647813:0,0,0,1
chr1	228647817	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228647813_CC_TT:228647813:0,0,0,1
chr1	228647819	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228647813_CC_TT:228647813:0,0,0,1
chr1	228647822	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228647813_CC_TT:228647813:0,0,0,1
chr1	228647831	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228647813_CC_TT:228647813:0,0,0,1
chr1	228676608	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228676608_G_A:228676608:1,0,0,1
chr1	228676615	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:228676608_G_A:228676608:1,0,0,1
chr1	228681489	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=105,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,1:1,2:4,1,3,0
chr1	228681558	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:228681558_G_C:228681558:3,12,1,1
chr1	228681562	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:228681558_G_C:228681558:3,12,1,1
chr1	228681565	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,2:7,0:0|1:228681558_G_C:228681558:3,12,1,1
chr1	228681722	.	T	TGCAGCCCCCAAAACACG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228879327	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:6,3:0|1:228879327_T_C:228879327:7,5,0,3
chr1	228879329	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:6,3:0|1:228879327_T_C:228879327:7,5,0,3
chr1	229385645	.	T	TCCAACC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:229385645_T_TCCAACC:229385645:0,3,0,1
chr1	229385647	.	T	TACTC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:229385645_T_TCCAACC:229385645:0,3,0,1
chr1	229385673	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=20,31;MFRL=157,181;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:229385673_C_T:229385673:0,1,0,1
chr1	229385682	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=157,181;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:229385673_C_T:229385673:0,1,0,1
chr1	229385687	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=157,181;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:229385673_C_T:229385673:0,1,0,1
chr1	229385692	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=157,181;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:229385673_C_T:229385673:0,1,0,1
chr1	229385699	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=29,28;MFRL=181,157;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:229385699_C_T:229385699:0,1,0,1
chr1	229385703	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=181,157;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:229385699_C_T:229385699:0,1,0,1
chr1	229385706	.	T	TGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=181,157;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:229385699_C_T:229385699:0,1,0,1
chr1	229385960	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	229386130	.	T	TGGTGGTTGCCGTGGAATATGTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr1	229387331	.	G	GCATATCACT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=179,134;MMQ=42,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	229387338	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=164,193;MMQ=43,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:229387338_G_A:229387338:0,1,0,1
chr1	229387340	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=164,193;MMQ=43,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:229387338_G_A:229387338:0,1,0,1
chr1	229387345	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=164,193;MMQ=43,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:229387338_G_A:229387338:0,1,0,1
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr1	229422376	.	T	TTTTTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,1,1
chr1	229422380	.	T	TGTATGAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,1,1
chr1	229567261	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=109,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,2:6,0:8,4,1,2
chr1	229568154	.	CCGT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:229568154_CCGT_C:229568154:1,2,0,1
chr1	229568162	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229568154_CCGT_C:229568154:0,2,0,1
chr1	229568508	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr1	229568673	.	G	GCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:229568673_G_GCTTC:229568673:0,0,1,1
chr1	229568675	.	A	ATCTTCGCGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:229568673_G_GCTTC:229568673:0,0,1,1
chr1	229580593	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,130;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr1	229596260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	229599225	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	229600336	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=73,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr1	229613419	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:5,9,1,1
chr1	229623131	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:229623131_G_C:229623131:1,0,1,0
chr1	229623137	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=122,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:2,1:0|1:229623131_G_C:229623131:1,1,1,0
chr1	229631193	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=115,301;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr1	229631734	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=64,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:0,3:2,3:1,1,3,3
chr1	229635083	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	229637881	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	229644089	.	A	AATAGCCCCTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	229662901	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:229662901_C_CA:229662901:2,0,1,0
chr1	229662916	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,13;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:229662901_C_CA:229662901:2,0,1,0
chr1	229662922	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:229662901_C_CA:229662901:3,0,1,0
chr1	229662929	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:229662901_C_CA:229662901:4,0,1,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.889:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	229738154	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.141:26:8,0:14,3:0|1:229738154_G_A:229738154:11,12,0,3
chr1	229738160	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:8,0:13,1:0|1:229738154_G_A:229738154:9,13,0,3
chr1	229750036	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr1	229772094	.	G	GCACAAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=40,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229772094_G_GCACAAGCCA:229772094:2,0,0,1
chr1	229772097	.	C	CTGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=40,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229772094_G_GCACAAGCCA:229772094:2,0,0,1
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	230372061	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,5,1
chr1	230372166	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,1:7,1:6,10,1,1
chr1	230372228	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	230372243	.	TGAGGCGTGAACAAGCCAGAAATCAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=-126;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.297:8:3,1:0,2:2,3,1,2
chr1	230386118	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=97,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr1	230398241	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	230398445	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	230493059	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,1,1
chr1	230493138	.	GCATTT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:230493138_GCATTT_G:230493138:0,0,0,1
chr1	230493148	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:230493138_GCATTT_G:230493138:0,0,0,1
chr1	230778243	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:3,1,3,1
chr1	230798864	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.238:18:8,1:6,3:13,1,4,0
chr1	230820780	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	230829176	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:230829176_AG_GA:230829176:0,0,1,1
chr1	230829179	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:230829176_AG_GA:230829176:0,0,1,1
chr1	230846592	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	230891224	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	230907924	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230907924_G_A:230907924:0,1,0,1
chr1	230907926	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230907924_G_A:230907924:0,1,0,1
chr1	230925836	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,4:4,11:4,7,6,9
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=116,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,2:2,3:0,3,0,6
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,125;MMQ=21,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:7,3:0,3:1,6,2,4
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.534:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,2,4
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	231075058	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=138,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231075058_T_G:231075058:1,0,1,0
chr1	231075068	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=138,217;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231075058_T_G:231075058:1,0,1,0
chr1	231094016	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,87;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:2,0:7,5:5,5,0,5
chr1	231094050	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	231124055	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:7,0,5,2
chr1	231155894	.	GTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=18,18;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:231155894_GTAA_G:231155894:0,3,0,1
chr1	231155900	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:231155894_GTAA_G:231155894:0,3,0,1
chr1	231155901	.	A	ACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,23;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:231155894_GTAA_G:231155894:0,3,0,1
chr1	231155903	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:231155894_GTAA_G:231155894:0,3,0,1
chr1	231298775	.	G	GTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=69,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr1	231298805	.	CG	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:231298805_CG_AC:231298805:0,0,0,1
chr1	231298809	.	C	CCTGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231298805_CG_AC:231298805:0,0,0,1
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	231386612	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	231472245	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:5,0:5,3:7,3,1,2
chr1	231483591	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=166,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr1	231502230	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr1	231697030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	232002392	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr1	232098847	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=792,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0|1:232098847_C_T:232098847:1,1,6,1
chr1	232098859	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.694:11:3,2:0,5:0|1:232098847_C_T:232098847:2,1,7,1
chr1	232098999	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	232172374	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	232172502	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:12,3:7,14,0,3
chr1	232534957	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=120,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,4:3,0:1,3,1,3
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	232539183	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=96,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,1:2,2,1,1
chr1	232564407	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	232568041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	232577434	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=81,130;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr1	232597919	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	232598061	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:232598061_C_T:232598061:0,0,0,1
chr1	232598063	.	CAGAGGCAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:232598061_C_T:232598061:0,0,0,1
chr1	232598075	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:232598061_C_T:232598061:0,0,0,1
chr1	232650097	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	232650744	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,152;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:2,3,3,0
chr1	232650750	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.852:4:0,1:0,1:0,0,1,3
chr1	233091296	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=122,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:233091296_A_T:233091296:0,1,1,0
chr1	233091301	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=83,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:233091296_A_T:233091296:0,3,1,0
chr1	233137225	.	CATAA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=ATAA;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.729:1:0,0:0,1:0|1:233137225_CATAA_C:233137225:0,0,1,0
chr1	233137267	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,12:0.418:29:8,2:9,9:1|0:233137225_CATAA_C:233137225:5,12,5,7
chr1	233161115	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:1,4,1,2
chr1	233161244	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	233362930	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	233397752	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	233397816	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=118,83;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr1	233398670	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	233398713	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=5071,122;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,7:1,2:1,0,7,2
chr1	233398918	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,0,0,4
chr1	233398927	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,0,0,4
chr1	233398931	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:233398918_AG_A:233398918:0,0,0,3
chr1	233464514	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr1	233464552	.	C	CAGTCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:0|1:233464552_C_CAGTCT:233464552:2,1,1,1
chr1	233464554	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,1:3,0:0|1:233464552_C_CAGTCT:233464552:2,1,1,1
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:0,2:6,1:4,2,3,0
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:2,3,3,1
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=93,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.472:21:6,2:5,8:3,8,3,7
chr1	233489734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:5,2:2,5,0,3
chr1	233490536	.	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:0,0:3,2:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:4,0,3,0
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:5,1,3,0
chr1	233511913	.	TAGAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	233749944	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr1	233750117	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:233750117_A_C:233750117:1,2,0,1
chr1	233750122	.	T	TTTGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=18,30;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:233750117_A_C:233750117:1,1,0,1
chr1	233750124	.	C	CAATTCGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:233750117_A_C:233750117:1,1,0,1
chr1	233767123	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233767123_C_CT:233767123:0,1,0,1
chr1	233767129	.	TG	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233767123_C_CT:233767123:0,1,0,1
chr1	233767132	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233767123_C_CT:233767123:0,1,0,1
chr1	233802245	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	234040742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	234041574	.	G	GCCCGCTGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	234367445	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=115,35;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,2:2,0:0|1:234367445_T_TC:234367445:4,6,1,1
chr1	234367447	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=115,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,2:2,0:0|1:234367445_T_TC:234367445:4,6,1,1
chr1	234367450	.	A	AGCGGCG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=115,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:2,0:0|1:234367445_T_TC:234367445:4,6,1,1
chr1	234367549	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	234444774	.	ACTTGCTATAGG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:3,1,1,0
chr1	234452470	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,0:0,2:2,6,0,2
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	234519452	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.805:7:0,2:1,4:0,1,5,1
chr1	234527575	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	234541622	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	234556630	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr1	234556646	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	234561590	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr1	234569233	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,0,2
chr1	234569244	.	C	CCTCCCTTCCCTACACAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:1,0:2,1:3,1,0,1
chr1	234569248	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=117,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:3,1,0,1
chr1	234594947	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr1	234603490	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,0:1,1:0|1:234603490_TAA_T:234603490:0,1,0,1
chr1	234603493	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:234603490_TAA_T:234603490:0,1,0,1
chr1	234613975	.	ACC	TGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234613975_ACC_TGG:234613975:0,1,0,1
chr1	234613980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234613975_ACC_TGG:234613975:0,1,0,1
chr1	234744889	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	234745022	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=206,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr1	235275430	.	G	GA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,0:11,2:10,12,0,3
chr1	235285740	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,2:5,6:1,4,1,7
chr1	235294936	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,398;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr1	235301399	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:13,4,2,0
chr1	235301496	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=104,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:2,3:4,2:5,2,2,3
chr1	235316185	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	235324047	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=6,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:5,2,1,2
chr1	235357303	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	235383188	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,17:0,7:0,0,10,14
chr1	235392546	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,12,7
chr1	235394510	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	235394541	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	235394583	.	C	CGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:235394583_C_CGT:235394583:0,3,0,2
chr1	235394585	.	T	TTTTAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,1:0|1:235394583_C_CGT:235394583:0,3,0,2
chr1	235403595	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,13,2
chr1	235403865	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235403865_T_TC:235403865:0,1,0,1
chr1	235403866	.	A	AACTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:235403865_T_TC:235403865:0,1,0,1
chr1	235506625	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,126;MMQ=50,41;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	235506782	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=170,194;MMQ=48,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	235506844	.	TG	CG,CA	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=24,31,30;MFRL=115,96,82;MMQ=60,48,58;MPOS=10,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.72,13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.136,0.227:19:4,2,1:8,0,2:12,1,4,2
chr1	235506853	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=107,85;MMQ=60,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:0|1:235506853_G_A:235506853:15,4,1,1
chr1	235506857	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=107,85;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,1:13,0:0|1:235506853_G_A:235506853:17,6,1,1
chr1	235506861	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=107,86;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:8,5:12,0:15,6,3,2
chr1	235506865	.	C	CAAAGAA	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=103,86;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:15,9,1,1
chr1	235506918	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=35,26;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.954:41:1,22:0,18:1,0,11,29
chr1	235507466	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:1,2:6,3:7,1,0,5
chr1	235543510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.350:8:3,2:2,0:0|1:235543510_G_A:235543510:0,5,1,2
chr1	235543513	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:235543510_G_A:235543510:0,4,0,2
chr1	235577778	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,0:4,3:6,1,3,0
chr1	235582749	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:2,2:5,0:7,1,2,0
chr1	235590559	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	235599077	.	AGACAG	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=139,49;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:5,3,1,1
chr1	235599085	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=132,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:2,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:6,3,1,1
chr1	235599086	.	AGTTATTAGATCTT	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=108,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:2,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:9,4,1,1
chr1	235599103	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=108,49;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:7,4,1,1
chr1	235599106	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=108,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:7,4,1,1
chr1	235599110	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=28,20;MFRL=105,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:7,3,1,1
chr1	235599113	.	TA	CC	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=111,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,2:5,0:0|1:235599077_AGACAG_A:235599077:9,3,1,1
chr1	235616309	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	235747005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	235747154	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	235891504	.	C	CTATGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235891504_C_CTATGTG:235891504:0,0,0,1
chr1	235891509	.	GAG	TTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235891504_C_CTATGTG:235891504:0,0,0,1
chr1	235891514	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235891504_C_CTATGTG:235891504:0,0,0,1
chr1	235893019	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	235945196	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:5,1,1,1
chr1	235955434	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:235955434_A_C:235955434:0,2,0,1
chr1	235955436	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:235955434_A_C:235955434:0,2,0,1
chr1	235973777	.	G	GCCCTGTCTAGTCAGGTTTCTGCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,33;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:235973777_G_GCCCTGTCTAGTCAGGTTTCTGCA:235973777:6,3,1,1
chr1	235973780	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=104,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:0|1:235973777_G_GCCCTGTCTAGTCAGGTTTCTGCA:235973777:6,3,1,1
chr1	235973781	.	T	TAAATG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=103,33;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:235973777_G_GCCCTGTCTAGTCAGGTTTCTGCA:235973777:5,3,1,1
chr1	236143311	.	C	CAGCAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:236143311_C_CAGCAAA:236143311:0,3,0,1
chr1	236143314	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:236143311_C_CAGCAAA:236143311:0,3,0,1
chr1	236143316	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:236143311_C_CAGCAAA:236143311:0,3,0,1
chr1	236148889	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236201609	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr1	236201651	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:236201651_A_T:236201651:0,0,0,1
chr1	236201653	.	AC	CG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236201651_A_T:236201651:0,0,0,1
chr1	236205493	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:236205493_T_TAG:236205493:0,3,0,1
chr1	236205494	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:236205493_T_TAG:236205493:0,3,0,1
chr1	236208688	.	AT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	236209024	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	236209036	.	A	ATGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,24;MFRL=128,143;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.386:4:1,1:0,0:0|1:236209036_A_ATGAG:236209036:0,3,0,1
chr1	236209038	.	A	AGCCACTGGCGTGTTCTGAGCGGGGGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=138,143;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:236209036_A_ATGAG:236209036:0,2,0,1
chr1	236343339	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:17,0:9,6:14,12,0,6
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr1	236381917	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,4,9
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0|1:236381987_A_G:236381987:0,0,0,5
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:236381987_A_G:236381987:0,0,0,5
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr1	236388346	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:7,2,3,4
chr1	236399506	.	CG	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=98,46;MMQ=42,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:236399506_CG_TA:236399506:1,1,0,2
chr1	236399516	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=112,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:236399506_CG_TA:236399506:1,2,0,2
chr1	236399750	.	G	GCTGCTTTACAGATTAAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236399794	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	236413147	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	236413282	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	236415444	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	236590675	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=356,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:0,2:3,1,1,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=87,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:2,2:3,1:3,2,3,0
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:0|1:236702447_T_G:236702447:1,9,0,3
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,1:4,1:0|1:236702447_T_G:236702447:1,9,0,3
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr1	236703982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,1:0,4:2,1,2,3
chr1	236704888	.	A	AACAGGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,3:2,2:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:4,0,5,1
chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=157,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:5,0,5,1
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=93,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.501:12:1,3:5,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:4,2,5,1
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	236706371	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	236707036	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236707036_A_T:236707036:0,0,0,1
chr1	236707045	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236707036_A_T:236707036:0,0,0,1
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,5:1,2:4,4,3,4
chr1	236708316	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:7,6:2,2:7,2,6,2
chr1	236711323	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:7,5:6,3:9,4,3,5
chr1	236714311	.	TC	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,17;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,0:0,4,2,0
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	236718938	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:2,4,1,4
chr1	236719291	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:236719291_T_G:236719291:0,3,0,1
chr1	236719295	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:236719291_T_G:236719291:0,3,0,1
chr1	236720694	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr1	236721731	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr1	236722492	.	A	AGAAAATCTCCAAGAAGCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	236722535	.	AC	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	236724504	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=96,123;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:1,0:9,5:5,5,4,2
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,5:5,5:1,6,1,9
chr1	236732198	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=140,146;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:236732198_C_A:236732198:1,0,1,0
chr1	236732210	.	ACT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=165,146;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:236732198_C_A:236732198:3,0,1,0
chr1	236732211	.	CT	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,19;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,0:2,0,1,0
chr1	236732520	.	GGATGC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236737513	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:5,6,2,0
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=84,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:1,1,5,0
chr1	236745968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,135;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr1	236746587	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:236746587_G_A:236746587:0,0,0,1
chr1	236746595	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:236746587_G_A:236746587:0,1,0,1
chr1	236748505	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,4:2,3:1,2,2,5
chr1	236749817	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	236755427	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,3:3,5:1,4,1,7
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=99,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,12:0.542:22:4,7:5,5:0|1:236755814_G_A:236755814:7,3,7,5
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:7,10:5,6:0|1:236755814_G_A:236755814:7,5,8,8
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:0,2,1,1
chr1	236761349	.	C	CAGACCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=51,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:236767176_C_G:236767176:1,0,3,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:236767176_C_G:236767176:1,0,3,0
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	236883538	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=133,201;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	236891154	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236902560	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,0,11
chr1	236906192	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=72,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	236906328	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr1	236915014	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=199,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:236915014_G_T:236915014:0,4,0,1
chr1	236915017	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=221,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:236915014_G_T:236915014:0,3,0,1
chr1	236917149	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917149_A_C:236917149:0,0,1,0
chr1	236917150	.	C	CGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917149_A_C:236917149:0,0,1,0
chr1	236917151	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917149_A_C:236917149:0,0,1,0
chr1	236917155	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917149_A_C:236917149:0,0,1,0
chr1	236917161	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236917149_A_C:236917149:0,0,1,0
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236966877	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,1:9,2:9,6,2,1
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	236979922	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:236979922_G_GC:236979922:0,1,0,1
chr1	236979923	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:236979922_G_GC:236979922:0,1,0,1
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,5,4
chr1	237054719	.	T	TAAAGGGACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237054719_T_TAAAGGGACA:237054719:0,0,0,1
chr1	237054720	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237054719_T_TAAAGGGACA:237054719:0,0,0,1
chr1	237054722	.	A	ATATGATATTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237054719_T_TAAAGGGACA:237054719:0,0,0,1
chr1	237057699	.	T	TGTCCTCAGCCCCTCGGCG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr1	237433940	.	A	AATCTTGTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	237519165	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	237532738	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=48,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr1	237608853	.	GATAC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,1:3,0:0|1:237608853_GATAC_G:237608853:0,7,1,1
chr1	237608859	.	TCA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:237608853_GATAC_G:237608853:0,7,1,1
chr1	237620124	.	TC	CT,CC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34,32;MFRL=148,157,105;MMQ=60,40,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:3,0,0:0,2,1:0,3,0,3
chr1	237620131	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=148,146;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:0,3,0,3
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,5:3,7:0,3,5,7
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	237753074	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	237753364	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	237753390	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	237755188	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr1	237755203	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	237765470	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	237777674	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=131,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:237777674_C_A:237777674:1,4,1,1
chr1	237777677	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=131,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:237777674_C_A:237777674:1,4,1,1
chr1	237777680	.	TCGGC	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=131,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:237777674_C_A:237777674:1,4,1,1
chr1	237777686	.	TCAGC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=68,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:237777674_C_A:237777674:0,3,1,1
chr1	237777695	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=68,40;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:237777674_C_A:237777674:0,3,1,1
chr1	237780725	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,0:6,9:7,4,0,9
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	237796837	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr1	237797082	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	237797096	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237797096_C_T:237797096:0,0,1,0
chr1	237797103	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237797096_C_T:237797096:0,0,1,0
chr1	237798342	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:237798342_G_A:237798342:0,0,0,1
chr1	237798349	.	T	TGCTTACACACTAATATAGTATTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237798342_G_A:237798342:0,0,0,1
chr1	237813126	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	237814783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr1	237817514	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr1	237823256	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,2,2
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr1	237837438	.	CAGCCAAAGAGAA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:4,0:10,8,1,1
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	237862436	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237863531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=94,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,0:8,5:8,11,1,4
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	237870550	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:237870550_C_G:237870550:1,1,0,1
chr1	237870557	.	A	AAAAAACT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:237870550_C_G:237870550:1,1,0,1
chr1	237870564	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237870550_C_G:237870550:0,1,0,1
chr1	237872390	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237872390_C_T:237872390:1,0,0,1
chr1	237872392	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:237872390_C_T:237872390:1,0,0,1
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	237881770	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	237893705	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237893705_CAG_C:237893705:0,1,0,1
chr1	237893708	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237893705_CAG_C:237893705:0,1,0,1
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	237936974	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=-1073741815;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,4,1,1
chr1	237936976	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,1:1,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,4,1,1
chr1	237936977	.	TAGCACTGAACTC	T	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=-1073741817;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,1:1,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,4,1,1
chr1	237936994	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=173,75;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,0:0,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,2,1,1
chr1	237936996	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,2,0,1
chr1	237936998	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,2,0,1
chr1	237937000	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:237936974_C_A:237936974:0,2,0,1
chr1	237944981	.	T	TTCAAACGTGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.488:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	237955674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=141,179;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:237955674_T_C:237955674:0,1,0,2
chr1	237955676	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=141,179;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:237955674_T_C:237955674:0,1,0,2
chr1	237955683	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=71,169;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.424:3:0,0:2,1:0|1:237955674_T_C:237955674:0,2,0,1
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:5,3:1,0:3,3,2,1
chr1	237996000	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237996000_T_TCC:237996000:0,1,0,1
chr1	237996002	.	T	TACATTCTTTGCCTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237996000_T_TCC:237996000:0,1,0,1
chr1	237996006	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237996000_T_TCC:237996000:0,1,0,1
chr1	238045893	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:238045893_A_AAT:238045893:0,0,0,1
chr1	238045896	.	G	GTCAATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:238045893_A_AAT:238045893:0,0,0,1
chr1	238049121	.	G	GGGATATTTGGCTTGAGTATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr1	238050184	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	238050900	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	238050932	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	238051714	.	C	CCGAGATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0|1:238051714_C_CCGAGATG:238051714:2,1,1,1
chr1	238051717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:238051714_C_CCGAGATG:238051714:2,1,1,1
chr1	238053828	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:4,5,2,0
chr1	240072412	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,145;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,0:4,2:4,6,0,2
chr1	240072688	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,0:9,6:9,6,0,6
chr1	240072721	.	G	GAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=138,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=A;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:1,1:0,3,3,6
chr1	240073615	.	ATGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	240073884	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.818:10:1,5:0,2:1,1,7,1
chr1	240074554	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.628:20:4,8:3,3:1,7,7,5
chr1	240074847	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,1:0,2,1,3
chr1	240075424	.	ATC	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=95,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.327:16:7,4:4,1:4,7,3,2
chr1	240075973	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr1	240076608	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:3,3,2,1
chr1	240255963	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	240256427	.	C	CTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	240256778	.	A	AGCTGATCAAAGATAGGCTGAACAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.656:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	240370629	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=167,94924972;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr1	240492296	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,413;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	240637571	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	240656824	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	240964061	.	A	AACGTTGAGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	240966326	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:240966326_A_AAG:240966326:1,3,0,1
chr1	240966329	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=180,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:240966326_A_AAG:240966326:0,3,0,1
chr1	240977964	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	240979662	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,0:13,2:9,9,0,2
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=81,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	241663902	.	T	TGAGAGAGAGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=121,123;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,24;RU=GA;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr1	241667605	.	AT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:241667605_AT_TG:241667605:0,2,0,1
chr1	241667610	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:241667605_AT_TG:241667605:0,1,0,1
chr1	241667613	.	GTGAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:241667605_AT_TG:241667605:0,1,0,1
chr1	241669240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr1	241712279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=129,155;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:241712279_G_A:241712279:0,3,0,1
chr1	241712289	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=129,155;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:241712279_G_A:241712279:0,3,0,1
chr1	241712296	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=123,155;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:241712279_G_A:241712279:0,2,0,1
chr1	241712305	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=116,155;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:241712279_G_A:241712279:0,3,0,1
chr1	241712310	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=116,155;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241712279_G_A:241712279:0,3,0,1
chr1	241725720	.	A	ACTCAGCTGGAGATCTGAGAACAGGCAGAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=118,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	241767930	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	241797458	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,94;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:6,0:7,9,0,2
chr1	241797935	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,142;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:5,6,2,0
chr1	241834472	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0|1:241834472_A_T:241834472:3,5,1,1
chr1	241834476	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:241834472_A_T:241834472:2,5,1,1
chr1	241834477	.	A	ACTAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:241834472_A_T:241834472:2,5,1,1
chr1	241834479	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:241834472_A_T:241834472:2,5,1,1
chr1	241838057	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0|1:241838057_C_T:241838057:0,0,13,10
chr1	241838065	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,8:0|1:241838057_C_T:241838057:0,0,6,11
chr1	241846994	.	ACTTTAAAAGGTAAGAGTATCATACAGTTAATTTAATTCTTTTAATAATTATAGTCTTTTGCAAGTAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.159:18:9,2:6,0:1,15,1,1
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	241886790	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr1	241904819	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,0:0,2:2,1,1,1
chr1	241907691	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:1,1,3,1
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr1	241913076	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,4:2,3:5,3,5,2
chr1	241938513	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	241943271	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,5,2
chr1	241943445	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241943445_GA_G:241943445:0,1,0,1
chr1	241943447	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241943445_GA_G:241943445:0,1,0,1
chr1	241943453	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=186,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:241943445_GA_G:241943445:0,2,0,1
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.585:10:1,4:3,2:0|1:241951106_A_G:241951106:3,1,5,1
chr1	241951107	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.413:10:4,1:2,3:1|0:241951106_A_G:241951106:5,1,3,1
chr1	241958401	.	C	CTTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,0:0|1:241958401_C_CTTGT:241958401:2,0,3,0
chr1	241958409	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0|1:241958401_C_CTTGT:241958401:3,0,3,0
chr1	242024835	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:242024835_A_AG:242024835:0,4,1,1
chr1	242024836	.	C	CCTGGGTAAATCTCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:242024835_A_AG:242024835:0,4,1,1
chr1	242035438	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,109;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,8:4,3:4,6,5,6
chr1	242042454	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=125,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,2:2,3:0,2,3,2
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	242045275	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr1	242048514	.	G	GTAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TAAA;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	242048886	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=235,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:242048886_T_C:242048886:0,1,0,1
chr1	242048890	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=235,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:242048886_T_C:242048886:0,1,0,1
chr1	242162352	.	C	CCTTTAAAATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	242264171	.	G	GTATGATTTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242264171_G_GTATGATTTGT:242264171:0,0,0,1
chr1	242264173	.	C	CATTCTTTTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242264171_G_GTATGATTTGT:242264171:0,0,0,1
chr1	242264176	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242264171_G_GTATGATTTGT:242264171:0,0,0,1
chr1	242287684	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	242383242	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	242511435	.	G	GTCAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=111,74;MMQ=30,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:3,0:4,2,1,1
chr1	242511519	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=141,155;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	243289784	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=99,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,5:7,3:4,6,2,6
chr1	243289890	.	G	GACAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,120;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:243289890_G_GACAA:243289890:0,3,0,1
chr1	243289892	.	T	TTTAGAGGGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=180,120;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:243289890_G_GACAA:243289890:0,3,0,1
chr1	243327519	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,147;MMQ=33,41;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.456:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	243329465	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=173,102;MMQ=57,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr1	243335940	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	243362331	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	243384921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	243419429	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr1	243471462	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=111,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,0:4,5:0,7,2,3
chr1	243504266	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	243507551	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.109:43:27,0:12,4:25,14,1,3
chr1	243579112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=98,82;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:7,4:2,2:5,5,1,5
chr1	243579165	.	T	TCCAGCCCGGGCAACAGTGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	243652490	.	AC	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=68,409;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:243652490_AC_GA:243652490:1,2,1,0
chr1	243652493	.	G	GGTCGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=68,409;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:243652490_AC_GA:243652490:1,2,1,0
chr1	243663195	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	243736190	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	244219663	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:16,4:15,0:15,17,4,0
chr1	244219952	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:244219952_C_A:244219952:0,2,0,1
chr1	244219953	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:244219952_C_A:244219952:0,2,0,1
chr1	244219956	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:244219952_C_A:244219952:0,2,0,1
chr1	244219962	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=77,129;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:244219952_C_A:244219952:0,2,0,1
chr1	244528087	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=96,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	244574529	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,89;MMQ=60,32;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:1,2:7,0:8,0,2,0
chr1	244587195	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:4,1,5,1
chr1	244587432	.	A	AAGATCTAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=210,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:244587432_A_AAGATCTAAG:244587432:0,2,0,1
chr1	244587436	.	A	AGGGCCGGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=210,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:244587432_A_AAGATCTAAG:244587432:0,2,0,1
chr1	244587437	.	A	ACAGTGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:244587432_A_AAGATCTAAG:244587432:0,1,0,1
chr1	244587742	.	A	AGTGTTGGCAAAGATGTGGAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=147,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr1	244595962	.	CTT	C,CTTTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,26,24;MFRL=146,129,154;MMQ=50,50,40;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,19,23;RU=T;STR;TLOD=4.98,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.230,0.483:8:0,0,3:0,1,0:0,2,0,6
chr1	244595996	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=151,137;MMQ=40,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr1	244624635	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	244624826	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=141,96;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=115,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	244627107	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	244640907	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=121,329;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,0:10,6:9,13,6,0
chr1	244715610	.	C	CCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=157,299;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr1	244803205	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=103,64,137;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.17,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.336:6:1,2,0:1,0,2:2,0,4,0
chr1	244849976	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,1:13,2:10,10,0,3
chr1	245005373	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.341:51:17,4:16,13:20,14,6,11
chr1	245005492	.	T	TG	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.471:51:14,12:11,12:10,17,16,8
chr1	245008377	.	TTTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTG;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr1	245009796	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,159;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,1:2,2:4,0,3,0
chr1	245018456	.	TAGCA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.372:26:2,4:13,5:10,7,8,1
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:245133539_A_G:245133539:0,0,0,1
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:245133539_A_G:245133539:0,0,0,1
chr1	245180639	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,1:2,2:4,7,1,2
chr1	245583054	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:0|1:245583054_GA_G:245583054:3,11,1,1
chr1	245583062	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:245583054_GA_G:245583054:3,11,1,1
chr1	245766084	.	A	AATGTAGC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=166,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:0|1:245766084_A_AATGTAGC:245766084:0,1,0,1
chr1	245766087	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:245766084_A_AATGTAGC:245766084:0,2,0,1
chr1	245766088	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:245766084_A_AATGTAGC:245766084:0,2,0,1
chr1	245766091	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:245766084_A_AATGTAGC:245766084:0,2,0,1
chr1	245766093	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:245766084_A_AATGTAGC:245766084:0,2,0,1
chr1	245766117	.	ACG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245766117_ACG_A:245766117:0,2,0,1
chr1	245766120	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245766117_ACG_A:245766117:0,2,0,1
chr1	245850478	.	C	CACTTCTATTACCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,0:2,1:2,2,0,1
chr1	245850498	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=112892880,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr1	245861571	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	245862097	.	C	CACAATTCATTGCTCCACTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	245912840	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr1	246021875	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=72,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	246022071	.	CG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:0,2:0|1:246027024_A_G:246027024:4,0,3,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0|1:246027024_A_G:246027024:4,0,3,0
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,7,0
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:0,1:0,2,0,2
chr1	246498866	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.477:17:3,4:6,4:6,3,5,3
chr1	246707858	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=102,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,2:7,6:7,4,4,5
chr1	246711816	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	246714587	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr1	246714631	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:246714631_TG_AA:246714631:0,0,1,4
chr1	246714636	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:246714631_TG_AA:246714631:0,0,1,3
chr1	246714644	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=129,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:246714644_T_A:246714644:0,2,0,1
chr1	246714646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=129,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:246714644_T_A:246714644:0,2,0,1
chr1	246720798	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,10,14
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	246727672	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=109,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,7:5,2,7,4
chr1	246755307	.	C	CGGGTTCAAGCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=99,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:246755307_C_CGGGTTCAAGCG:246755307:0,1,0,1
chr1	246755310	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=99,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:246755307_C_CGGGTTCAAGCG:246755307:0,1,0,1
chr1	246811110	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:6,2,1,1
chr1	246811113	.	ACG	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:6,2,1,1
chr1	246811120	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:6,4,1,1
chr1	246811122	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:6,4,1,1
chr1	246811124	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:6,4,1,1
chr1	246811130	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=132,51;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:246811110_A_AAC:246811110:5,4,1,1
chr1	246899460	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	246903654	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr1	246907521	.	ATGTGTGAAAGTCACCATG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:246907521_ATGTGTGAAAGTCACCATG_A:246907521:0,1,0,1
chr1	246907544	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:246907521_ATGTGTGAAAGTCACCATG_A:246907521:0,1,0,1
chr1	246921711	.	T	TAGTTTTGATTTGTATTTCTCTGATAGCCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	246939610	.	A	ATATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATT;STR;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr1	246939856	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	246939943	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:1,4,1,1
chr1	246940442	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	246942107	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:1,2:5,5:3,3,5,4
chr1	246943725	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,0:4,3:4,6,0,3
chr1	247004392	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	247006051	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=77,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:5,5:4,6:3,6,5,7
chr1	247007042	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,24,25;MFRL=42,183,148;MMQ=60,60,60;MPOS=12,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=6.44,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.313,0.295:10:2,0,1:2,3,2:4,0,6,0
chr1	247007043	.	AA	TT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=150,42;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.458:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr1	247007320	.	T	TACCCAATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247007320_T_TACCCAATG:247007320:0,0,0,1
chr1	247007323	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247007320_T_TACCCAATG:247007320:0,0,0,1
chr1	247013203	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,150;MMQ=27,21;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	247021138	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	247025547	.	CAGAG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:6,2:0,0:0|1:247025547_CAGAG_C:247025547:0,6,0,2
chr1	247025552	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,2:0,0:0|1:247025547_CAGAG_C:247025547:0,6,0,2
chr1	247027387	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,171;MMQ=50,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr1	247031211	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	247039256	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	247055111	.	CAA	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=108,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:247055111_CAA_C:247055111:10,14,1,1
chr1	247055115	.	A	ATCT	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=108,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:0|1:247055111_CAA_C:247055111:10,13,1,1
chr1	247055127	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,22;MFRL=129,63;MMQ=47,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:0|1:247055127_T_A:247055127:9,9,0,2
chr1	247055129	.	TA	AG	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=129,63;MMQ=47,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,1:9,1:0|1:247055127_T_A:247055127:9,9,0,2
chr1	247061466	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:2,0,2,1
chr1	247062726	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:6,3:7,1:6,7,3,1
chr1	247062758	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:12,10,0,3
chr1	247062857	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247062860	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247062863	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247062867	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247062868	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247062870	.	A	ATTTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=176,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:247062857_A_T:247062857:0,1,0,1
chr1	247067153	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,140;MMQ=50,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.271:13:8,3:2,0:10,0,3,0
chr1	247068785	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=161,147;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.484:31:7,2:9,13:16,0,15,0
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:1,2,1,5
chr1	247151553	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:247151553_C_T:247151553:0,2,1,1
chr1	247151554	.	AAAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:247151553_C_T:247151553:0,2,1,1
chr1	247151561	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:247151553_C_T:247151553:0,2,1,1
chr1	247151564	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:247151553_C_T:247151553:0,2,1,1
chr1	247162607	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr1	247163293	.	A	ACTCTTTCTCCTCACTTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,52;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,1,1
chr1	247201687	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:247201687_A_C:247201687:0,2,0,1
chr1	247201694	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:247201687_A_C:247201687:0,1,0,1
chr1	247201696	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:247201687_A_C:247201687:0,1,0,1
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr1	247264337	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=205,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:247264337_C_G:247264337:1,2,1,1
chr1	247264339	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=188,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:247264337_C_G:247264337:2,2,1,1
chr1	247264342	.	CA	AG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:1,0:0|1:247264337_C_G:247264337:2,3,1,1
chr1	247267269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=113,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,1,1
chr1	247419274	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	247471828	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr1	247473569	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	247492473	.	C	CATCACATGCATGGCCCAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr1	247588873	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	247588938	.	T	TCCCACCCCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247588938_T_TCCCACCCCCA:247588938:0,0,0,1
chr1	247588943	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247588938_T_TCCCACCCCCA:247588938:0,0,0,1
chr1	247597656	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.807:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr1	247608167	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:1,2,1,5
chr1	247614523	.	G	GAAGTGACTGAACATTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:247614523_G_GAAGTGACTGAACATTT:247614523:1,2,0,1
chr1	247614527	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:247614523_G_GAAGTGACTGAACATTT:247614523:1,2,0,1
chr1	247614531	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:247614523_G_GAAGTGACTGAACATTT:247614523:1,2,0,1
chr1	247614617	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,21;MFRL=80,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,0:3,4,1,1
chr1	247614652	.	C	CCCCCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=166,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:247614652_C_CCCCCA:247614652:4,1,1,1
chr1	247614654	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,1:0|1:247614652_C_CCCCCA:247614652:4,1,1,1
chr1	247615252	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	247655072	.	CCTCA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:2,2:5,0:4,7,1,1
chr1	247694809	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr1	247695612	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	247726822	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	247729206	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=89,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:1,1:3,3,3,1
chr1	247729391	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	247769062	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=101,133;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.576:33:5,9:8,10:7,7,6,13
chr1	247835593	.	G	GCGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	247835779	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=112,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,2:4,0:2,2,0,2
chr1	247836126	.	C	CTTTTGTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:247836126_C_CTTTTGTTT:247836126:2,1,0,1
chr1	247836132	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:247836126_C_CTTTTGTTT:247836126:2,1,0,1
chr1	247836134	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=204,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:247836126_C_CTTTTGTTT:247836126:1,1,0,1
chr1	247875314	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=67,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:1,1,2,1
chr1	247875970	.	GCAT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,1,0
chr1	247921717	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr1	248004614	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr1	248005208	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248005208_G_A:248005208:0,0,0,1
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248005208_G_A:248005208:0,0,0,1
chr1	248039523	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=116,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,4:9,0:7,11,4,0
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	248059456	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,106;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:11,3:2,4:7,6,5,2
chr1	248059703	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:248059703_T_A:248059703:0,0,6,5
chr1	248059712	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:248059703_T_A:248059703:0,0,3,6
chr1	248084434	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	248097379	.	G	GCCTTAAACAATGTCCGGGAAAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr1	248097681	.	T	TCTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	248098058	.	A	AATAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248113095	.	G	GTTATCTTGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248113095_G_GTTATCTTGTC:248113095:0,0,0,1
chr1	248113098	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248113095_G_GTTATCTTGTC:248113095:0,0,0,1
chr1	248113101	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248113095_G_GTTATCTTGTC:248113095:0,0,0,1
chr1	248128986	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=141,426;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:1,0:2,1:0|1:248128986_T_A:248128986:2,1,1,0
chr1	248128988	.	T	TATACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=141,426;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:248128986_T_A:248128986:2,1,1,0
chr1	248129021	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=127,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:4,2,0,2
chr1	248129337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:1,2,1,3
chr1	248129658	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:248129658_T_G:248129658:1,4,1,1
chr1	248129665	.	CT	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:248129658_T_G:248129658:1,3,1,1
chr1	248201468	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248201468_A_G:248201468:0,0,1,0
chr1	248201470	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248201468_A_G:248201468:0,0,1,0
chr1	248201474	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=135,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:248201468_A_G:248201468:1,0,1,0
chr1	248201478	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=135,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:248201468_A_G:248201468:1,0,1,0
chr1	248224383	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,35416;MMQ=60,43;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,2,0
chr1	248224569	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=110,87;MMQ=44,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:7,3:4,5:6,6,4,4
chr1	248224595	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=115,89;MMQ=57,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:5,4,1,5
chr1	248309410	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=97,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:2,0:0|1:248309410_T_TC:248309410:1,4,1,1
chr1	248309413	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=97,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0|1:248309410_T_TC:248309410:1,4,1,1
chr1	248309449	.	C	CTTTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248309449_C_CTTTGGGT:248309449:0,1,0,1
chr1	248309451	.	T	TACACC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248309449_C_CTTTGGGT:248309449:0,1,0,1
chr1	248309453	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:248309449_C_CTTTGGGT:248309449:0,1,0,1
chr1	248309455	.	G	GTGGTGTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:248309449_C_CTTTGGGT:248309449:0,0,0,1
chr1	248343672	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,1:11,2:11,6,1,2
chr1	248366702	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr1	248436805	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr1	248436809	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=103,107;MMQ=24,24;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.666:13:1,6:3,3:0|1:248436809_G_A:248436809:3,1,5,4
chr1	248436811	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=103,107;MMQ=24,24;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:1,6:3,2:0|1:248436809_G_A:248436809:3,1,5,4
chr1	248437138	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,109;MMQ=40,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr1	248458875	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,110;MMQ=49,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	248487768	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=183,116;MMQ=53,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.923:23:1,10:0,12:0,1,12,10
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:1,2,4,2
chr1	248525100	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=146,94;MMQ=50,37;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,3:7,0:9,4,2,1
chr1	248525135	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=99,113;MMQ=50,37;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:10,3:8,2:0|1:248525135_G_A:248525135:11,8,3,2
chr1	248525138	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=99,113;MMQ=50,37;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:11,3:8,2:0|1:248525135_G_A:248525135:11,8,3,2
chr1	248525602	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=105,127036;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:0|1:248525602_C_T:248525602:5,5,3,0
chr1	248525607	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=105,127036;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:0|1:248525602_C_T:248525602:5,4,3,0
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,9,6
chr1	248525990	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248570185	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=116,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:3,2,3,0
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	248616782	.	GAT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248616782_GAT_G:248616782:0,0,0,1
chr1	248616785	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:248616782_GAT_G:248616782:0,0,0,1
chr1	248637416	.	GC	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=112,118;MMQ=27,39;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,0:3,2:9,1,1,1
chr1	248637543	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=127,125;MMQ=27,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:4,2,2,1
chr1	248637706	.	C	CATTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=150,132;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:248637706_C_CATTT:248637706:0,3,0,1
chr1	248637709	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=150,132;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:248637706_C_CATTT:248637706:0,3,0,1
chr1	248651867	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,120;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr1	248685909	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:248685909_G_T:248685909:0,1,0,1
chr1	248685912	.	T	TTCCAACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:248685909_G_T:248685909:0,1,0,1
chr1	248722883	.	A	G,C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31,32;MFRL=203,178,120;MMQ=27,50,27;MPOS=26,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.62,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:0,2,1:1,0,0:0,1,0,3
chr1	248722884	.	T	TGTGTGTTGTAGGGGGCACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=195,120;MMQ=50,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:248722884_T_TGTGTGTTGTAGGGGGCACG:248722884:0,3,0,1
chr1	248722888	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=203,178;MMQ=27,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1|0:248722884_T_TGTGTGTTGTAGGGGGCACG:248722884:0,1,0,2
chr1	248756543	.	TGC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:5,2:4,0:0|1:248756543_TGC_T:248756543:8,3,1,1
chr1	248756546	.	T	TATTATACAAAAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:6,2:5,0:0|1:248756543_TGC_T:248756543:8,3,1,1
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=69,141;MMQ=52,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:1,3:2,1:1,2,1,3
chr1	248802116	.	G	GAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	248845097	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	249106087	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=185046893,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:249106087_C_T:249106087:1,0,1,0
chr1	249106091	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=185046893,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:249106087_C_T:249106087:1,0,1,0
chr1	249106099	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=182,185046893;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:249106099_C_T:249106099:1,0,1,0
chr1	249106109	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=182,185046893;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:249106099_C_T:249106099:1,0,1,0
chr1	249212444	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:249212444_T_C:249212444:0,1,1,1
chr1	249212446	.	A	ACTGCAACAGCTGCCAACCTTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:249212444_T_C:249212444:0,1,1,1
chr1	249212451	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=205,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:249212444_T_C:249212444:1,1,0,1
chr1	249213684	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:11,2,2,0
chr1	249214082	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:1,4,0,3
chr1	249214133	.	G	GCGGA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	249214225	.	AC	GG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:249214225_AC_GG:249214225:0,0,0,1
chr1	249214227	.	CACCA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:249214225_AC_GG:249214225:0,0,0,1
chr1	249214233	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:249214225_AC_GG:249214225:0,0,0,1
chr1	249214237	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:249214225_AC_GG:249214225:0,0,0,1
chr1	249214242	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:249214225_AC_GG:249214225:0,0,0,1
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	229860	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,0:5,2,5,0
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.797:13:1,6:0,4:0,2,3,8
chr2	247614	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=129,135;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr2	253032	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:0|1:253032_TG_T:253032:2,4,1,2
chr2	253037	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,2:5,0:0|1:253032_TG_T:253032:2,4,1,2
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	269352	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:3,3,0,3
chr2	271998	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:1,0:0,2:1,0,1,2
chr2	272186	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=95,42;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:11,2:10,0:0|1:272186_T_TG:272186:12,12,1,1
chr2	272187	.	T	TCTGTC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=95,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:13,2:10,0:0|1:272186_T_TG:272186:12,12,1,1
chr2	272203	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,14:0.567:24:6,7:4,7:1|0:272186_T_TG:272186:3,7,8,6
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=104,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:5,4,5,4
chr2	283231	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:4,0:3,5:0,7,1,4
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:1079130_G_A:1079130:2,0,1,0
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:1079130_G_A:1079130:2,0,1,0
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:5,2,5,4
chr2	1099077	.	A	C,T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=24,19,24;MFRL=105,103,0;MMQ=60,60,60;MPOS=6,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.54,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,15,5:0.524,0.190:27:3,3,0:3,4,4:3,4,11,9
chr2	1099131	.	G	GTAATC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=158,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	1099150	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1099150_A_G:1099150:0,2,0,1
chr2	1099152	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1099150_A_G:1099150:0,2,0,1
chr2	1099153	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:1099150_A_G:1099150:0,2,0,1
chr2	1099166	.	CAG	TGA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr2	1168756	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	1204720	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	1320241	.	C	CAGGCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.481:2:0,1:1,0:0|1:1320241_C_CAGGCATA:1320241:0,1,0,1
chr2	1320245	.	C	CCACTCTCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1320241_C_CAGGCATA:1320241:0,1,0,1
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	1442688	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr2	1499959	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1499959_CTT_C:1499959:1,0,0,1
chr2	1499963	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1499959_CTT_C:1499959:1,0,0,1
chr2	1499966	.	C	CTACAGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1499959_CTT_C:1499959:1,0,0,1
chr2	1651900	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=94,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,4:12,0:13,6,4,0
chr2	1667310	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	1680663	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,163;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:4,2,3,0
chr2	1683923	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	1805489	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,1:6,6:5,2,3,4
chr2	1844458	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	1855436	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:7,3:6,9,1,2
chr2	1855526	.	T	TAGTCACTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:2,3,1,1
chr2	1891289	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,0:10,2:9,11,1,1
chr2	1892926	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:0,0,1,0
chr2	1892927	.	TAACG	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:0,0,1,0
chr2	1892933	.	ATGTGC	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:1,0,1,0
chr2	1892940	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:1,0,1,0
chr2	1892944	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:1,0,1,0
chr2	1892945	.	CTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:1,0,1,0
chr2	1892953	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1892926_A_T:1892926:1,0,1,0
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,5:0,17:0,0,8,15
chr2	1946944	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:6,0:13,3:0|1:1946944_A_C:1946944:9,10,0,3
chr2	1946946	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:6,0:13,3:0|1:1946944_A_C:1946944:9,10,0,3
chr2	1946968	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,2:3,9:5,2,4,7
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr2	1983395	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=77,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr2	3197850	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=1294604,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,5:1,1:0,1,1,6
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,3:1,5:2,1,4,4
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr2	3393546	.	A	AGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,1,1
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	3460983	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=154,158;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3460983_T_C:3460983:0,1,0,1
chr2	3460985	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=154,158;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3460983_T_C:3460983:0,1,0,1
chr2	3470115	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0|1:3470115_T_C:3470115:0,0,9,10
chr2	3470124	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,5:0,7:0|1:3470115_T_C:3470115:0,0,7,10
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	3483299	.	A	ATGCTTTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3483299_A_ATGCTTTTCTC:3483299:0,1,0,1
chr2	3483300	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3483299_A_ATGCTTTTCTC:3483299:0,1,0,1
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	3504687	.	ATCGAAGTACCCAC	A,GTCGAAGTACCCAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,20,26;MFRL=119,58,66;MMQ=60,60,60;MPOS=8,23;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.65,4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.280:8:1,2,0:3,0,2:2,2,3,1
chr2	3504703	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,0:0|1:3504703_C_G:3504703:4,2,1,1
chr2	3504706	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:3,0:0|1:3504703_C_G:3504703:4,2,1,1
chr2	3504819	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	3593432	.	TATA	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:3593432_TATA_T:3593432:1,7,1,1
chr2	3593436	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:3593432_TATA_T:3593432:1,6,1,1
chr2	3593437	.	A	AGCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=123,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:3593432_TATA_T:3593432:1,5,1,1
chr2	3598101	.	AC	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr2	3627648	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	3651367	.	C	CTCTCTCTCTGTCTCTCTCTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	3652616	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,1:3,9:3,3,5,5
chr2	3653844	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr2	3661086	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	3685046	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	3685074	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr2	3721632	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:4,4,1,1
chr2	3726162	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=83,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0|1:3726162_G_A:3726162:2,5,0,2
chr2	3726163	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=109,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.364:9:0,2:6,1:1|0:3726162_G_A:3726162:0,6,2,1
chr2	3749151	.	GGAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,3:2,1:1,2,2,2
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=103,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:1,5,2,1
chr2	3815250	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	5834276	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:2,2,2,2
chr2	5834853	.	C	CAATAACCTTCACCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	5835564	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:6,1:0,1:6,0,1,1
chr2	5835697	.	GTTTT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=15,17;MFRL=115,111;MMQ=44,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr2	5835714	.	T	TAGCTGAGGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	5837581	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,30;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:5837581_C_T:5837581:0,1,0,1
chr2	5837590	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5837581_C_T:5837581:0,1,0,1
chr2	5837594	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5837581_C_T:5837581:0,1,0,1
chr2	5837596	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5837581_C_T:5837581:0,1,0,1
chr2	5839848	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5839848_T_TC:5839848:0,1,0,1
chr2	5839852	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5839848_T_TC:5839848:0,1,0,1
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chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	7005992	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.537:13:2,1:4,6:4,2,2,5
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chr2	7170404	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=104,61817652;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,1:9,1:0|1:7170404_G_A:7170404:4,14,1,1
chr2	7170408	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=105,61817652;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:7,1:0|1:7170404_G_A:7170404:4,13,1,1
chr2	7208324	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:8,2:7,4:10,5,3,3
chr2	8822266	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	8871872	.	C	CTTTTTTGTGTTAAATAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.244:9:7,2:0,0:5,2,0,2
chr2	8890179	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=2466,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	8911010	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	8919983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:0|1:8919983_G_A:8919983:0,2,0,1
chr2	8919986	.	CCAAGAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:8919983_G_A:8919983:0,2,0,1
chr2	8943291	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8943291_G_A:8943291:0,0,0,1
chr2	8943308	.	A	ATTTGAAGAGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8943291_G_A:8943291:0,0,0,1
chr2	8946568	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr2	8998773	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8998773_A_AT:8998773:0,0,1,0
chr2	8998775	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8998773_A_AT:8998773:0,0,1,0
chr2	9002929	.	T	TCAAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,5,0
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,6,0
chr2	9458670	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=110,87;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,5:2,0:5,4,5,0
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,4:7,2:2,8,2,4
chr2	9499115	.	G	GAGGGCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	9515142	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	9528340	.	G	GAGCTCACCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=99,18142537;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9528340_G_GAGCTCACCAT:9528340:1,0,1,0
chr2	9528342	.	T	TCAGTGAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=99,18142537;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9528340_G_GAGCTCACCAT:9528340:1,0,1,0
chr2	9528639	.	A	ACTGTCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9528639_A_ACTGTCCT:9528639:0,3,0,1
chr2	9528641	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9528639_A_ACTGTCCT:9528639:0,3,0,1
chr2	9531257	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:4,5,1,1
chr2	9547708	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	9548371	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:4,0:3,3:1,6,0,3
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=112,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:7,2:9,1,3,0
chr2	9554274	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=104,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:4,1:6,1:0|1:9554274_G_A:9554274:5,5,3,0
chr2	9554280	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:9554274_G_A:9554274:5,5,2,0
chr2	9554460	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9554460_A_T:9554460:0,3,0,1
chr2	9554462	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9554460_A_T:9554460:0,3,0,1
chr2	9554492	.	A	AAAAAGAGTGTTTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	9576553	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=145,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	9597152	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	9599832	.	GC	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:9599832_GC_AA:9599832:0,2,0,1
chr2	9599842	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:0,0:0|1:9599832_GC_AA:9599832:0,2,0,1
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=124,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:4,2,7,2
chr2	9616099	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:9,0:13,4:0|1:9616099_G_A:9616099:15,7,0,4
chr2	9616105	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:8,0:5,4:0|1:9616099_G_A:9616099:8,6,0,4
chr2	9616173	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:12,16,3,0
chr2	9631340	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	9632968	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,69;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,0:3,4:9,1,4,0
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:0|1:9633137_T_G:9633137:2,8,1,6
chr2	9633140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.165:16:4,2:10,0:1|0:9633137_T_G:9633137:2,12,1,1
chr2	9642478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	9642481	.	T	TTTGTTCAGATGAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	9657947	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=104,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,3:6,4:6,1,7,0
chr2	9658288	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:10,0:15,5:11,14,5,0
chr2	9658388	.	CAAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=18,34;MFRL=121,136;MMQ=48,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr2	9658411	.	G	GAATAGGCAAATCCGTCGAGGCAGAAAGGAGACCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=153,84;MMQ=60,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr2	9676756	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	9676779	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	9683210	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr2	9983529	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr2	9986107	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=118,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,2:6,0:0|1:9986107_G_GT:9986107:8,5,1,1
chr2	9986109	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=116,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:0|1:9986107_G_GT:9986107:7,5,1,1
chr2	9989442	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	10008872	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	10008888	.	A	ATTAACTGTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=130,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	10023032	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.596:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	10044941	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	10051053	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr2	10053412	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	10059213	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:3,10,2,1
chr2	10059340	.	T	TCCACAGGTACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10059340_T_TCCACAGGTACC:10059340:0,1,0,1
chr2	10059342	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10059340_T_TCCACAGGTACC:10059340:0,1,0,1
chr2	10186528	.	C	CCATAATGTTAACAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.483:6:1,3:2,0:0|1:10186528_C_CCATAATGTTAACAAAAA:10186528:1,2,2,1
chr2	10186533	.	C	CCAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.483:6:1,3:1,0:0|1:10186528_C_CCATAATGTTAACAAAAA:10186528:1,2,2,1
chr2	10186536	.	T	TCCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:10186528_C_CCATAATGTTAACAAAAA:10186528:1,2,0,1
chr2	10192722	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10192722_CA_C:10192722:0,1,0,1
chr2	10192729	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10192722_CA_C:10192722:0,1,0,1
chr2	10192731	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10192722_CA_C:10192722:0,1,0,1
chr2	10225187	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,1,1
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,8,6
chr2	10226078	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	10282147	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr2	10282396	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:10,2:10,4:8,13,4,2
chr2	10350743	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,25;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	10560281	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr2	10584820	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=121,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:10584820_CA_C:10584820:0,3,0,1
chr2	10584824	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:10584820_CA_C:10584820:0,2,0,1
chr2	10584827	.	CCAATAGCCAGCGA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:10584820_CA_C:10584820:0,3,0,1
chr2	10717714	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr2	10729446	.	C	CCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	10729499	.	A	ATTTATTTATTTTATTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:10729499_A_ATTTATTTATTTTATTTTAT:10729499:0,0,0,1
chr2	10729503	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10729499_A_ATTTATTTATTTTATTTTAT:10729499:0,0,0,1
chr2	10729897	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,2,4
chr2	10741141	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	10743153	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,4:2,0:1,1,3,1
chr2	10743191	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:4,0,2,4
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr2	10794737	.	AC	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:10794737_AC_CA:10794737:0,4,0,1
chr2	10794740	.	G	GGCAAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:10794737_AC_CA:10794737:0,4,0,1
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,12:0,0,12,8
chr2	10813740	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	10829941	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:16,0:11,4:16,12,1,3
chr2	10914867	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:10,3:4,4:8,6,3,5
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=69,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,4:3,4:1,2,4,4
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr2	10929163	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10929163_A_AT:10929163:0,2,0,1
chr2	10929165	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10929163_A_AT:10929163:0,2,0,1
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,4:4,8:5,4,10,2
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:7,4:0,6:1,6,3,7
chr2	10931046	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=101,137;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr2	10931050	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=137,86;MMQ=60,40;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	10931054	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=166,101;MMQ=53,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:10931054_C_G:10931054:0,2,0,1
chr2	10931056	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=166,101;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10931054_C_G:10931054:0,2,0,1
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr2	10959356	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=61,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr2	10959461	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,3:0,1:3,1,3,2
chr2	10959475	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:1,1,2,2
chr2	10987862	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:10987862_G_A:10987862:0,1,0,1
chr2	10987864	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:10987862_G_A:10987862:0,1,0,1
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	10994614	.	C	CTGTAGCCTTTGCAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=106,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr2	11053106	.	CC	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11053106_CC_AT:11053106:0,0,1,0
chr2	11053113	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11053106_CC_AT:11053106:0,0,1,0
chr2	11053117	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11053106_CC_AT:11053106:0,0,1,0
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,4:7,4:5,5,5,3
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,1,8
chr2	11300924	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11300924_A_C:11300924:0,1,0,1
chr2	11300926	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11300924_A_C:11300924:0,1,0,1
chr2	11304471	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,41;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr2	11312874	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11312875	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11312877	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11312888	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11312891	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11312893	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=107,126;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:11312874_C_G:11312874:1,1,0,1
chr2	11348364	.	C	CTAACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	11348609	.	CAAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	11356190	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:4,1,4,0
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr2	11702661	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.460:20:7,6:2,3:5,6,4,5
chr2	11716433	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=78,134;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,0:1,3:4,0,3,1
chr2	11718510	.	C	CTCTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr2	11718591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	11725241	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:2,1:2,3:4,1,5,0
chr2	11738091	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr2	11738103	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	11758536	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=196,154;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr2	11760976	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11760976_C_T:11760976:1,0,1,0
chr2	11760980	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11760976_C_T:11760976:1,0,1,0
chr2	11775467	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	11780670	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11780670_T_C:11780670:0,1,0,1
chr2	11780672	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:11780670_T_C:11780670:0,1,0,1
chr2	11780676	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,28;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:11780670_T_C:11780670:0,1,0,1
chr2	11780679	.	TGGAC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:11780670_T_C:11780670:0,2,0,1
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=115,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:1,2,1,6
chr2	11907842	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	11913869	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:10,4,0,2
chr2	11922636	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,0:2,7:1,4,0,7
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	11932148	.	A	AGTAGGGCAGCGCCGCAGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	11945373	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11945373_G_A:11945373:0,1,0,1
chr2	11945377	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11945373_G_A:11945373:0,1,0,1
chr2	11945380	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11945373_G_A:11945373:0,1,0,1
chr2	11945381	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11945373_G_A:11945373:0,1,0,1
chr2	11945384	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11945373_G_A:11945373:0,1,0,1
chr2	14778337	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,18,25;MFRL=157,0,143;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,18,20;RU=A;STR;TLOD=4.83,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.307,0.377:6:0,0,1:0,0,0:0,2,1,3
chr2	14779227	.	T	TAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.494:12:2,1:4,2:4,2,6,0
chr2	15319070	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:7,2:8,4,1,1
chr2	15319304	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,2:7,0:0,7,0,2
chr2	15359024	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,0:4,3:9,4,2,1
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr2	15427229	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr2	15427356	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:15427356_GAC_G:15427356:0,1,0,1
chr2	15427359	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15427356_GAC_G:15427356:0,1,0,1
chr2	15427366	.	A	ATAGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15427356_GAC_G:15427356:0,1,0,1
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	15514891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,18,9
chr2	15523535	.	G	GCACC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15523535_G_GCACC:15523535:0,3,0,1
chr2	15523536	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15523535_G_GCACC:15523535:0,3,0,1
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,2:0,3:0,0,5,2
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,13,4
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,1,7
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,0,7
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,0,6
chr2	15536509	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.163:24:10,2:7,0:14,7,2,1
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr2	15601441	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	15616013	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	15674846	.	A	ATTTTATTGTATGAATAGCTCATGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=176,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:0,1:1,0:0|1:15674846_A_ATTTTATTGTATGAATAGCTCATGAT:15674846:0,2,0,1
chr2	15674854	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,21;MFRL=191,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15674846_A_ATTTTATTGTATGAATAGCTCATGAT:15674846:0,1,0,1
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	15676737	.	G	GGAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:15676737_G_GGAA:15676737:0,0,0,1
chr2	15676738	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:15676737_G_GGAA:15676737:0,0,0,1
chr2	15676740	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:15676737_G_GGAA:15676737:0,0,0,1
chr2	15676742	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=237,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:15676737_G_GGAA:15676737:0,1,0,1
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,7:0,0,12,4
chr2	15735146	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=142,1763;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15735146_T_TCA:15735146:1,0,1,0
chr2	15735147	.	AGATTTG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=142,1763;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15735146_T_TCA:15735146:1,0,1,0
chr2	15735440	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,1,5
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,0:11,3:13,5,2,1
chr2	15768981	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,1,11
chr2	15770293	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr2	15840505	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=190,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr2	15840522	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:4,3,2,2
chr2	15840645	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,5:4,2:2,9,6,1
chr2	16747037	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	16747064	.	G	GATACAGCTGTGCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	16747089	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16747089_G_GAA:16747089:0,0,0,1
chr2	16747091	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16747089_G_GAA:16747089:0,0,0,1
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,12:0,0,6,23
chr2	17830945	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=11,33;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	17836621	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=156,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:17836621_C_T:17836621:1,3,2,0
chr2	17836625	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:17836621_C_T:17836621:1,3,2,0
chr2	17860036	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,155;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:17860036_C_CT:17860036:4,0,1,0
chr2	17860039	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=159,155;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:17860036_C_CT:17860036:4,0,1,0
chr2	17860043	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=159,155;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.283:5:1,1:3,0:0|1:17860036_C_CT:17860036:4,0,1,0
chr2	17897279	.	CTTCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:3,1:5,0,4,0
chr2	17898113	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,137;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,0:8,1:7,12,0,2
chr2	17899243	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,138;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17899243_A_ACC:17899243:1,0,1,0
chr2	17899246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=150,138;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17899243_A_ACC:17899243:1,0,1,0
chr2	17899248	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=150,138;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:17899243_A_ACC:17899243:1,0,1,0
chr2	17907552	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr2	17954027	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	17962993	.	CAAGTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,2,2
chr2	17997932	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:9,3,1,1
chr2	18764320	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18764320_A_T:18764320:0,0,0,1
chr2	18764323	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18764320_A_T:18764320:0,0,0,1
chr2	18764324	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18764320_A_T:18764320:0,0,0,1
chr2	18764328	.	G	GGCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18764320_A_T:18764320:0,1,0,1
chr2	18764330	.	GGAAGCATC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:18764320_A_T:18764320:0,1,0,1
chr2	18768231	.	C	CAACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=103,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chr2	19553351	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:3,0:0|1:19553351_C_CCA:19553351:1,3,0,1
chr2	19553353	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:19553351_C_CCA:19553351:1,3,0,1
chr2	19553357	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:19553351_C_CCA:19553351:1,3,0,1
chr2	19553429	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=183,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,2,0
chr2	20096936	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr2	20130145	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:2,3:0,0:2,0,3,1
chr2	20131071	.	TCA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=118,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:20131071_TCA_T:20131071:5,8,1,1
chr2	20131077	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:0|1:20131071_TCA_T:20131071:5,9,1,1
chr2	20131079	.	T	C,TCTTTTTCTTTCTTTC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20,20;MFRL=120,100,44;MMQ=60,60,60;MPOS=13,-2;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.33,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,2:0.444,0.167:15:5,3,2:1,4,0:1,5,5,4
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	20160209	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20166713	.	A	AATCAACACGAGTGGAATGAAATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr2	20174175	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:3,1:6,2:9,1,4,0
chr2	20189089	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=70,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:1,4:2,1:1,2,0,5
chr2	20194036	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr2	20194248	.	G	GGCAAGTGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	20202930	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=89,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:3,4,2,1
chr2	20205423	.	A	AAAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chr2	20234233	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:20234233_T_C:20234233:0,2,0,1
chr2	20234239	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20234233_T_C:20234233:0,1,0,1
chr2	20234240	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20234233_T_C:20234233:0,1,0,1
chr2	20251070	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,1,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,1,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251070_T_TGC:20251070:0,0,1,0
chr2	20460307	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20460307_C_T:20460307:0,0,0,1
chr2	20460310	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20460307_C_T:20460307:0,0,0,1
chr2	20648933	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26,26;MFRL=116,82,145;MMQ=60,60,60;MPOS=26,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=T;STR;TLOD=3.70,16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,8:0.143,0.459:16:3,1,0:2,1,5:3,3,5,5
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	20700914	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=110,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr2	20792063	.	GGATTCCCTGTCTGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr2	20798060	.	GC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr2	20824658	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=99,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,1:2,1:3,5,1,2
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr2	20884586	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:4,1,2,1
chr2	20939706	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,0,1
chr2	20939708	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,0,1
chr2	21001309	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21001309_G_A:21001309:0,1,0,1
chr2	21001311	.	A	AGTAAATCAGGCTTTTGCTGAGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:21001309_G_A:21001309:0,1,0,1
chr2	21227383	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:3,2,2,1
chr2	21234536	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:5,2,1,1
chr2	21236470	.	CTGA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:21236470_CTGA_C:21236470:0,5,0,2
chr2	21236475	.	C	CAGG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:21236470_CTGA_C:21236470:0,5,0,2
chr2	21236479	.	A	AAG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,25;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0|1:21236470_CTGA_C:21236470:0,5,0,2
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chr2	21265141	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	21363348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	21363394	.	A	AGTTGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	21363893	.	C	CCCTCTTCTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	23608644	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	23862187	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	23980822	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,0:7,4:7,12,2,2
chr2	23980838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:8,9,0,2
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=102,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr2	24110911	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=215,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr2	24205821	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:24205821_G_A:24205821:9,2,1,1
chr2	24205827	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:24205821_G_A:24205821:9,2,1,1
chr2	24222629	.	C	CCTATGCTGAGCG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:8,7,1,1
chr2	24246152	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:24246152_T_C:24246152:0,3,0,1
chr2	24246153	.	C	CAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:24246152_T_C:24246152:0,3,0,1
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	24283845	.	G	GTTGTAGTGCATGGTCACATATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=112,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24283845_G_GTTGTAGTGCATGGTCACATATA:24283845:0,1,0,1
chr2	24283847	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=112,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24283845_G_GTTGTAGTGCATGGTCACATATA:24283845:0,1,0,1
chr2	24300470	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=130,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	24306107	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0|1:24306107_C_T:24306107:0,1,0,1
chr2	24306112	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24306107_C_T:24306107:0,1,0,1
chr2	24306116	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:24306107_C_T:24306107:0,1,0,1
chr2	24345196	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:24345196_CA_C:24345196:1,0,1,0
chr2	24345209	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:24345196_CA_C:24345196:1,0,1,0
chr2	24345217	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:24345196_CA_C:24345196:2,0,1,0
chr2	24384275	.	TTG	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=147,150;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:24384275_TTG_T:24384275:6,0,2,0
chr2	24384279	.	A	ATG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=147,150;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:24384275_TTG_T:24384275:6,0,2,0
chr2	24384289	.	CA	TC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=139,163;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:24384289_CA_TC:24384289:6,0,2,0
chr2	24384298	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=135,163;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:24384289_CA_TC:24384289:7,0,2,0
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	24395506	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,21:0,10:0,0,9,22
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,4,12
chr2	24413334	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=131,86;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:13,4:10,2:12,11,3,3
chr2	24413438	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,112;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,0:7,8:9,4,0,8
chr2	24432620	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	24507817	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:10,3:1,0:0,11,0,3
chr2	24509298	.	C	CTGTTTTCACACTTCTGATAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	24516639	.	A	AATGACTG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:6,2:15,1:0|1:24516639_A_AATGACTG:24516639:8,13,1,2
chr2	24516642	.	T	TCAG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:6,1:15,1:0|1:24516639_A_AATGACTG:24516639:8,14,0,2
chr2	24516644	.	C	CACATTGTTA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:13,1:0|1:24516639_A_AATGACTG:24516639:8,13,0,2
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	24550867	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31,31;MFRL=145,149,128;MMQ=60,60,60;MPOS=27,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.08,10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,4:0.222,0.630:6:0,0,2:1,1,2:1,0,5,0
chr2	24929871	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=113,522;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:9,3:1,0:7,3,0,3
chr2	24952729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24952729_A_G:24952729:0,2,0,1
chr2	24952732	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=230,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	24952736	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24952729_A_G:24952729:0,2,0,1
chr2	24952737	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:24952737_TCA_T:24952737:0,2,0,1
chr2	24952740	.	C	CGTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,24;MFRL=230,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:24952737_TCA_T:24952737:0,1,0,1
chr2	24974945	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:2,5:3,3:0,5,3,5
chr2	25016260	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:5,5,2,0
chr2	25016404	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:8,11,0,2
chr2	25037188	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,3,1
chr2	25039508	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:0,2:6,1:2,4,2,1
chr2	25046090	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=95,153;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:4,4,1,2
chr2	25061270	.	GGGGTGGGGTGGGTGGGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=51,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=GGGTGGGGT;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:0,3:1,0,3,0
chr2	25100738	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr2	25100902	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	25180839	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:4,5,1,1
chr2	25190175	.	AAAATACAGGCATTTAGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:4,8,0,2
chr2	25314186	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,3:2,7:1,2,6,4
chr2	25326502	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	25352991	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:25352991_A_AG:25352991:2,2,1,1
chr2	25352994	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:25352991_A_AG:25352991:2,2,1,1
chr2	25352997	.	TG	AT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:25352991_A_AG:25352991:2,2,1,1
chr2	25353000	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=111,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:25352991_A_AG:25352991:2,2,1,1
chr2	25353580	.	A	AAAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	25354184	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr2	25355756	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr2	25355858	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,0:6,4:6,4,2,2
chr2	25358363	.	ATGATGT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=100,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:7,0:0|1:25358363_ATGATGT_A:25358363:8,2,1,1
chr2	25358371	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=100,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,2:6,0:0|1:25358363_ATGATGT_A:25358363:7,2,1,1
chr2	25360196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	25360387	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=103,95;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:3,8,0,3
chr2	25360414	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=52,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	25364377	.	G	GGGCTGAAAAGAAAAGCCAGTGCTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	25364385	.	A	AGTATAAAACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	25366830	.	G	GCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25366830_G_GCAC:25366830:0,0,0,1
chr2	25366832	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25366830_G_GCAC:25366830:0,0,0,1
chr2	25368005	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	25368030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	25374912	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,104629520;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	25376748	.	GTAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	25377261	.	C	CACAGCTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	25457229	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:5,6,2,2
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr2	25463483	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:4,2,3,0
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,7,2
chr2	25470526	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:4,5,1,1
chr2	25470636	.	A	ACCAATGCCACCATCCACAAACAGGGAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=183,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	25475035	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr2	25536894	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25536894_G_A:25536894:0,1,0,1
chr2	25536896	.	G	GATCACTTGAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25536894_G_A:25536894:0,1,0,1
chr2	25606842	.	C	CCTACAGCCAGGAGCTGTTAGCTAGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	25642517	.	C	CTTGAAGATTCACAATAAATAGGTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	25650578	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25650578_C_A:25650578:0,0,0,1
chr2	25650579	.	T	TCACAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25650578_C_A:25650578:0,0,0,1
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,16:0,7:0,0,6,18
chr2	25678446	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25678446_C_G:25678446:0,0,0,1
chr2	25678448	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25678446_C_G:25678446:0,0,0,1
chr2	25875401	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=122,175;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:0,1:1,0:1,1,1,1
chr2	25964845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr2	25965041	.	C	CTCATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	25966145	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=92,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,0:4,4:4,8,1,3
chr2	25966266	.	AA	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=190,325;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25966266_AA_GT:25966266:0,1,1,0
chr2	25966269	.	C	CATTCAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=190,325;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:25966266_AA_GT:25966266:0,1,1,0
chr2	25966272	.	T	TTAAAGAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=148,325;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:25966266_AA_GT:25966266:2,0,1,0
chr2	25966276	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=148,325;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:25966266_AA_GT:25966266:2,0,1,0
chr2	25973060	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:5,2,6,3
chr2	25973309	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:2,7,0,2
chr2	25994257	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr2	25994412	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:5,3:4,4:1,8,4,3
chr2	26068509	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr2	26152001	.	G	GAGAAGAGTAAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26152001_G_GAGAAGAGTAAAAAC:26152001:0,1,0,1
chr2	26152003	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:26152001_G_GAGAAGAGTAAAAAC:26152001:0,1,0,1
chr2	26174826	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	26179285	.	CCCCCGA	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:26179285_CCCCCGA_C:26179285:1,7,1,1
chr2	26179294	.	A	ACAATAAGAGCCTTGTGCTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:26179285_CCCCCGA_C:26179285:1,5,1,1
chr2	26179314	.	C	CCAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr2	26203678	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr2	26204042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:26204042_C_T:26204042:2,2,1,0
chr2	26204055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26204042_C_T:26204042:1,1,1,0
chr2	26204075	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:26204042_C_T:26204042:1,3,1,0
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.438:23:5,6:8,4:3,10,4,6
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=77,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	26410214	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,1:1,3,1,2
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr2	26420688	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=66,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26420688_G_A:26420688:0,2,0,1
chr2	26420689	.	G	GAACCTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=66,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26420688_G_A:26420688:0,2,0,1
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	26424237	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:0,3,1,1
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=99.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,15:0,0,15,10
chr2	26486379	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=111,150;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:3,2:5,0:3,6,0,2
chr2	26496424	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr2	26496504	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=132,4;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,4:12,0:14,9,0,4
chr2	26496671	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=117,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:3,0:0,2:0,4,0,2
chr2	26532009	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:26532009_T_C:26532009:5,4,1,1
chr2	26532015	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0|1:26532009_T_C:26532009:4,5,1,1
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,4,2
chr2	26534187	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=94,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,0:8,4:11,7,0,4
chr2	26534485	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26534485_A_G:26534485:0,1,0,1
chr2	26534495	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26534485_A_G:26534485:0,1,0,1
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,7,9
chr2	26539346	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26539346_C_G:26539346:0,1,0,1
chr2	26539349	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=130,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:26539346_C_G:26539346:0,1,0,1
chr2	26541861	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,3:0,0:2,1,2,1
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,2,2
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr2	26596370	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,0:15,4:11,18,0,4
chr2	26625049	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	26647277	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr2	26647301	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=100,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:3,7,1,1
chr2	26647303	.	T	C,TGAATACTTACTATGTGCCAAACATTCTTGTGTTTTG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,32,20;MFRL=104,108,47;MMQ=60,60,51;MPOS=15,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.30,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.200,0.200:12:4,0,0:4,2,2:2,6,2,2
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	26653837	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,132;MMQ=40,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26653837_T_TG:26653837:0,1,0,1
chr2	26653841	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=157,132;MMQ=40,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26653837_T_TG:26653837:0,1,0,1
chr2	26654833	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,39;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr2	26663215	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=53,126;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.670:12:1,2:1,4:2,2,5,3
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr2	26676322	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chr2	26676494	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	26688749	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,124;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,2:0|1:26688749_C_T:26688749:4,1,0,3
chr2	26688759	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=120,124;MMQ=60,46;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,0:2,1:0|1:26688749_C_T:26688749:4,1,0,3
chr2	26688764	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=152,124;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:26688749_C_T:26688749:3,1,0,3
chr2	26690161	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=648,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:26690161_A_T:26690161:0,2,0,1
chr2	26690165	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=648,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26690161_A_T:26690161:0,2,0,1
chr2	26693988	.	C	CACGTGCACACACACGCACA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=46,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr2	26694060	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26694060_G_T:26694060:0,0,1,0
chr2	26694063	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26694060_G_T:26694060:0,0,1,0
chr2	26694066	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26694060_G_T:26694060:0,0,1,0
chr2	26694069	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:26694060_G_T:26694060:0,1,1,0
chr2	26694082	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,24;MFRL=0,0;MMQ=60,35;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:26694060_G_T:26694060:0,1,1,0
chr2	26696353	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26696353_C_CT:26696353:0,0,0,1
chr2	26696354	.	C	CAAAACACACCCCCGCTTCTGGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:26696353_C_CT:26696353:0,0,0,1
chr2	26700806	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=79,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr2	26706235	.	TTACCTGCCCAGCTGCCCCAGGCCCCACACCCATCAGCCTGCCCTTGTGATACCTGTCACCCAGCCCCAGCCTCCTG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=108,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:2,0:1,2:17,12,1,1
chr2	26726557	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	26802225	.	C	CCCTAATATGCTCCAACCATTTTGAACTACT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr2	26804338	.	C	CATAACTGACACATTGGCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:26804338_C_CATAACTGACACATTGGCAA:26804338:0,3,0,1
chr2	26804342	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:26804338_C_CATAACTGACACATTGGCAA:26804338:0,3,0,1
chr2	26817945	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	26997031	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	26998105	.	AG	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=125,94;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:1,9,0,2
chr2	26998472	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:2,3,1,1
chr2	26998499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	27000929	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.143:23:11,0:8,2:10,10,0,3
chr2	27147880	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:27147880_C_CA:27147880:4,4,2,0
chr2	27147883	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:27147880_C_CA:27147880:4,4,2,0
chr2	27157396	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:27157396_G_A:27157396:0,0,2,0
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:27157396_G_A:27157396:0,0,2,0
chr2	27163044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=72,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:2,1,2,3
chr2	27248936	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27255942	.	C	CCTTTGGAGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	27256045	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:27256045_GC_TT:27256045:2,1,1,1
chr2	27256048	.	C	CTCTATTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:27256045_GC_TT:27256045:2,1,1,1
chr2	27258761	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,3,1
chr2	27261329	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27279736	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=188,146;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:27279736_TG_CA:27279736:0,1,0,1
chr2	27279739	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=188,146;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27279736_TG_CA:27279736:0,1,0,1
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	27281565	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	27282372	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27282372_G_C:27282372:0,0,0,1
chr2	27282374	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27282372_G_C:27282372:0,0,0,1
chr2	27282375	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27282372_G_C:27282372:0,0,0,1
chr2	27282376	.	G	GCTAAAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27282372_G_C:27282372:0,0,0,1
chr2	27282379	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27282372_G_C:27282372:0,0,0,1
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	27292670	.	TTTTGAGCAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,2:4,6:1,5,1,7
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr2	27305525	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27306970	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27306970_T_TC:27306970:0,0,0,1
chr2	27306975	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27306970_T_TC:27306970:0,0,0,1
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	27308895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:4,7,0,2
chr2	27322083	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=86,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,7:6,0:11,5,7,0
chr2	27351485	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=76,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27351485_A_AGC:27351485:0,1,0,1
chr2	27351487	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=76,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27351485_A_AGC:27351485:0,1,0,1
chr2	27354258	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	27354971	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	27355695	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:5,1:0,0:3,4,4,0
chr2	27355835	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:2,6,0,2
chr2	27356274	.	C	CAGGCGCCCCATTCCGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=143,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27356274_C_CAGGCGCCCCATTCCGG:27356274:1,0,0,1
chr2	27356280	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=133,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27356274_C_CAGGCGCCCCATTCCGG:27356274:2,0,0,1
chr2	27361562	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=84,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,0:10,7:9,8,0,7
chr2	27361663	.	T	TAGAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	27424396	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27424396_C_CT:27424396:0,0,0,1
chr2	27424397	.	G	GTTCCTGTTCCTTTTCTCATCCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27424396_C_CT:27424396:0,0,0,1
chr2	27426808	.	C	CTGTAGTCCAAGGACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr2	27429470	.	CC	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=112,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr2	27430428	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,3:1,0:4,4,3,0
chr2	27430451	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,3:1,0:1,7,3,0
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	27447860	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr2	27448119	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=70,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr2	27448202	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27448202_T_C:27448202:0,0,0,1
chr2	27448208	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27448202_T_C:27448202:0,0,0,1
chr2	27448887	.	T	TATCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	27462299	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,1,1
chr2	27463091	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.422:12:1,1:5,1:6,1,2,3
chr2	27463513	.	G	GCAACCGTGCCCAGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr2	27465714	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:6,1,0,2
chr2	27465979	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27466213	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=178,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27466213_AC_GG:27466213:0,1,0,1
chr2	27466216	.	T	TCAGAGAGGTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=178,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27466213_AC_GG:27466213:0,1,0,1
chr2	27501218	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:1,1:1,0:0|1:27501218_G_GT:27501218:1,1,0,1
chr2	27501219	.	G	GCTATTATGCGTCAGTATATC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=119,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.405:3:1,1:1,0:0|1:27501218_G_GT:27501218:1,1,0,1
chr2	27501275	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27501275_A_G:27501275:0,0,0,1
chr2	27501277	.	AA	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27501275_A_G:27501275:0,0,0,1
chr2	27501286	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27501275_A_G:27501275:0,0,0,1
chr2	27501301	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	27532921	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:27532921_G_GGC:27532921:0,2,0,1
chr2	27532922	.	A	ATGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27532921_G_GGC:27532921:0,2,0,1
chr2	27532927	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27532921_G_GGC:27532921:0,2,0,1
chr2	27532928	.	C	CGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:27532921_G_GGC:27532921:0,2,0,1
chr2	27532931	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:27532921_G_GGC:27532921:0,2,0,1
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	27535929	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:7,2,3,0
chr2	27547247	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=108,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:2,2,2,1
chr2	27550199	.	G	A,GTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28,14;MFRL=166,154,133;MMQ=60,40,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.284,0.284:4:1,0,0:1,1,0:0,2,0,2
chr2	27550208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=158,142;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr2	27550252	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=175,130;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	27551339	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:5,1,0,5
chr2	27552282	.	TGGTCATGGGCTAGGAAACACTGGAAGGGGTAGAGCTTTAAGGAGCCATCAGAGAGCCGTATCCGCTGCAGGGGTGAGTTAGTGGGAAGG	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=128,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:7,0:12,2:0|1:27552282_TGGTCATGGGCTAGGAAACACTGGAAGGGGTAGAGCTTTAAGGAGCCATCAGAGAGCCGTATCCGCTGCAGGGGTGAGTTAGTGGGAAGG_T:27552282:14,23,1,1
chr2	27552375	.	CAGAAAACCACCA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:27552282_TGGTCATGGGCTAGGAAACACTGGAAGGGGTAGAGCTTTAAGGAGCCATCAGAGAGCCGTATCCGCTGCAGGGGTGAGTTAGTGGGAAGG_T:27552282:1,9,1,1
chr2	27552390	.	CCTGAAATAAGGACAGAATGTGTGAGCATTAAAAGCAAGTTCTCTCTTCCTTGCTCTAATTTCTTTCTCTGGGCTCCTAGGACCTTTGTCTTCTACCCTCAGAT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:27552282_TGGTCATGGGCTAGGAAACACTGGAAGGGGTAGAGCTTTAAGGAGCCATCAGAGAGCCGTATCCGCTGCAGGGGTGAGTTAGTGGGAAGG_T:27552282:1,9,1,1
chr2	27560867	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:27560867_T_C:27560867:10,9,1,1
chr2	27560873	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=93,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:0|1:27560867_T_C:27560867:8,9,1,1
chr2	27565818	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:7,5,1,1
chr2	27589740	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=103,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:8,6,1,1
chr2	27589769	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:5,2:7,7,2,0
chr2	27591138	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:27591138_C_A:27591138:2,0,0,1
chr2	27591140	.	T	TAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0|1:27591138_C_A:27591138:2,0,0,1
chr2	27594279	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27594279_T_C:27594279:0,1,0,1
chr2	27594280	.	TTACCCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27594279_T_C:27594279:0,1,0,1
chr2	27594291	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27594279_T_C:27594279:0,0,0,1
chr2	27594296	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27594279_T_C:27594279:0,0,0,1
chr2	27596230	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=133,103;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:12,0:12,4:12,14,1,3
chr2	27596260	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=148,137;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0,14,0,2
chr2	27597190	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.201:28:5,3:10,3:20,2,5,1
chr2	27597335	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:6,0:3,5,0,2
chr2	27598285	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=145,168;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	27600644	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,2:12,0:8,6,2,0
chr2	27602920	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:10,2:18,1,2,0
chr2	27606257	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:8,3,1,1
chr2	27607569	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:27607569_C_G:27607569:3,2,1,1
chr2	27607577	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0|1:27607569_C_G:27607569:1,2,1,1
chr2	27656458	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:27656458_A_G:27656458:1,0,1,0
chr2	27656462	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27656458_A_G:27656458:1,0,1,0
chr2	27668363	.	G	GACCCTGAAGCCTGCGATGGAGCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.362:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr2	27669034	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	27676612	.	CA	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	27680652	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,0:4,3:1,4,1,2
chr2	27684145	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,1,2
chr2	27695314	.	C	CAAGGTTGGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=182,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:27695314_C_CAAGGTTGGTT:27695314:0,1,0,1
chr2	27695315	.	C	CAACACACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=182,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27695314_C_CAAGGTTGGTT:27695314:0,1,0,1
chr2	27708050	.	A	AGAACAATAAAACTCTAACAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	27717199	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=87,17678;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,0:2,2:3,5,2,0
chr2	27717575	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	27720336	.	C	CTATCCCTGCCCTCCTCAGATCTGCCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:27720336_C_CTATCCCTGCCCTCCTCAGATCTGCCA:27720336:2,1,0,1
chr2	27720338	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:27720336_C_CTATCCCTGCCCTCCTCAGATCTGCCA:27720336:2,1,0,1
chr2	27721597	.	T	TCTCTCCTGTTCTGTGTCCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=127,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:3,3,1,1
chr2	27721733	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=257,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:0|1:27721733_AC_A:27721733:0,1,0,1
chr2	27721736	.	TTTAG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,24;MFRL=257,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27721733_AC_A:27721733:0,1,0,1
chr2	27721743	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=257,190;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27721733_AC_A:27721733:0,1,0,1
chr2	27789329	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=124,72;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,0:2,4:0,5,1,3
chr2	27801134	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=132,239;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:3,2,0,2
chr2	27806036	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr2	27806050	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	27806073	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	27806571	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:6,0:7,9,2,0
chr2	27822751	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,10,6
chr2	27851918	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,6,5
chr2	27852112	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:27852112_G_GA:27852112:0,3,0,1
chr2	27852114	.	G	GATTGCTTGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:27852112_G_GA:27852112:1,3,0,1
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.717:5:0,0:1,3:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:0,1,2,2
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.717:5:0,0:1,3:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:0,1,2,2
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	27857661	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr2	27884050	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=121,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:10,0:18,4:13,15,4,0
chr2	27892023	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	27908140	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=119,95;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.157:27:11,0:12,3:6,17,1,3
chr2	27908162	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=126,95;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:0|1:27908162_C_T:27908162:3,10,0,3
chr2	27908169	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=136,95;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,0:6,3:0|1:27908162_C_T:27908162:2,10,0,3
chr2	27910706	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	27910820	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=105,101;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:9,5:21,10:14,16,10,5
chr2	27916636	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,0:11,4:12,15,0,4
chr2	28066122	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0|1:28066122_T_C:28066122:0,2,0,3
chr2	28066131	.	T	TAAAAAAGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=190,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:28066122_T_C:28066122:0,4,0,1
chr2	28066137	.	A	AGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=211,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:28066122_T_C:28066122:0,3,0,1
chr2	28084530	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=G;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28084530_TGG_T:28084530:0,1,1,0
chr2	28084532	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.583:2:0,1:1,0:1|0:28084530_TGG_T:28084530:1,0,0,1
chr2	28084533	.	GGGGGGGGT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:28084530_TGG_T:28084530:1,0,0,1
chr2	28084550	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:28084530_TGG_T:28084530:1,0,0,1
chr2	28084553	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:28084530_TGG_T:28084530:1,1,0,1
chr2	28210879	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:6,9,1,1
chr2	28210896	.	C	CATATGGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=123,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:6,9,1,1
chr2	28268742	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.695:8:2,1:0,4:0,2,1,5
chr2	28561437	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:28561437_AC_A:28561437:1,2,0,1
chr2	28561440	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:28561437_AC_A:28561437:1,2,0,1
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chr2	28615553	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:2,0,1,0
chr2	28615558	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,11;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:2,0,1,0
chr2	28615567	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,16;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:2,0,1,0
chr2	28615570	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:2,0,1,0
chr2	28615573	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=17,12;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:2,0,1,0
chr2	28615576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=22,12;MFRL=116,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:3,0,1,0
chr2	28615581	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:1,0:0|1:28615553_A_C:28615553:3,1,1,0
chr2	28615812	.	GGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.722:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	28748034	.	ACTGGCAGGAGGGGGAGTT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	28748238	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	28748661	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,5,10
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,7,2
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:28771452_CTA_C:28771452:0,0,0,2
chr2	28771473	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:28771452_CTA_C:28771452:0,0,0,2
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	28800894	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr2	28804835	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=49,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	28808539	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr2	28812285	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:1,1,2,0
chr2	28812387	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=127,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:2,4:2,0:0,5,2,2
chr2	28812982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=90,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,2,1
chr2	28814033	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=111,82;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:2,0:3,1:2,3,2,0
chr2	28816605	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:8,0:14,3:10,12,0,3
chr2	28816828	.	TGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,3:7,0:8,0,3,0
chr2	28816948	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:11,9:9,3:9,11,4,8
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0,4,1,4
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:1,2,0,4
chr2	28843653	.	ACCCATGT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:0,1:1,0:0|1:28843653_ACCCATGT_A:28843653:1,0,0,1
chr2	28843666	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28843653_ACCCATGT_A:28843653:1,0,0,1
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=85,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr2	29041951	.	C	CTGATGATGATTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:29041951_C_CTGATGATGATTGT:29041951:3,3,1,1
chr2	29041954	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:29041951_C_CTGATGATGATTGT:29041951:3,3,1,1
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	29052281	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,28;MFRL=169,128;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:29052281_G_A:29052281:0,3,0,1
chr2	29052285	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=169,128;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:29052281_G_A:29052281:0,3,0,1
chr2	29088040	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,0,0,1
chr2	29088044	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,1,0,1
chr2	29088046	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,1,0,1
chr2	29088049	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,1,0,1
chr2	29088050	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,1,0,1
chr2	29088054	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=178,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29088040_C_A:29088040:0,1,0,1
chr2	29092679	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,5:0,0,5,13
chr2	29140711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=183,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.567:5:1,3:0,0:2,0,2,1
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,5:4,9:8,3,8,6
chr2	29145954	.	GA	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=304,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29145954_GA_AC:29145954:0,1,0,1
chr2	29145957	.	T	TGACAGGCTAAAAGAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=304,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29145954_GA_AC:29145954:0,1,0,1
chr2	29145960	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=304,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29145954_GA_AC:29145954:0,1,0,1
chr2	29164538	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	29169611	.	A	AGGAACACTAACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=186,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	29221994	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	29222388	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	29225502	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0|1:29225502_T_G:29225502:0,0,6,5
chr2	29225504	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:29225502_T_G:29225502:0,0,6,5
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,13:0,1:0,0,3,11
chr2	29245210	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:29245210_C_CAG:29245210:0,2,0,1
chr2	29245211	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:29245210_C_CAG:29245210:0,2,0,1
chr2	29245921	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,3:6,0:8,4,2,1
chr2	29245933	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr2	29246919	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	29249670	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr2	29255955	.	G	GATA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:29255955_G_GATA:29255955:2,4,1,1
chr2	29255956	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:29255955_G_GATA:29255955:2,4,1,1
chr2	29255959	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:29255955_G_GATA:29255955:2,5,1,1
chr2	29268304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:29268304_C_T:29268304:0,2,0,1
chr2	29268327	.	T	TCCTTGTCATTAGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:29268304_C_T:29268304:0,0,0,1
chr2	29274720	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0|1:29274720_A_G:29274720:0,0,4,7
chr2	29274730	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,5:0|1:29274720_A_G:29274720:0,0,3,6
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=121,78;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr2	29287989	.	TGCCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29287989_TGCCCC_T:29287989:0,1,0,1
chr2	29287996	.	CCCCTGTCCTCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29287989_TGCCCC_T:29287989:0,1,0,1
chr2	29288011	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29287989_TGCCCC_T:29287989:0,1,0,1
chr2	29288016	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29287989_TGCCCC_T:29287989:0,1,0,1
chr2	29294356	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29294356_C_T:29294356:0,1,1,0
chr2	29294366	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=117,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29294356_C_T:29294356:0,1,1,0
chr2	29295617	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=95,35;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:8,0:5,7,1,1
chr2	29295676	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:1,0,1,4
chr2	29356445	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,144;MMQ=56,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr2	29375775	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	29379976	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	29380347	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29380347_A_C:29380347:0,1,0,1
chr2	29380355	.	C	CCAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29380347_A_C:29380347:0,1,0,1
chr2	29380356	.	G	GCCAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29380347_A_C:29380347:0,1,0,1
chr2	29380358	.	A	ACAGTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29380347_A_C:29380347:0,1,0,1
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr2	29390299	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,2:0,4:4,2,4,2
chr2	29390301	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:4,0:6,3,3,1
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	29420551	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,0:2,4:1,4,2,2
chr2	29420609	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:29420609_AGG_A:29420609:0,3,0,2
chr2	29420618	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:29420609_AGG_A:29420609:0,3,0,2
chr2	29448361	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=96,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr2	29448509	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:29448509_C_CT:29448509:0,0,1,1
chr2	29448512	.	C	CATCCCCGTCTCAGGGCCCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:29448509_C_CT:29448509:0,0,1,1
chr2	29451957	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,1,4
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	29543663	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,12,5
chr2	29940529	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:13,9:7,8:12,9,12,5
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:6,6,1,1
chr2	30682630	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	30748373	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	30756196	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=102,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:1,5,1,3
chr2	30756265	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	30756280	.	C	CCCTCCTTTTTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=168,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	30968197	.	A	AAAGACAGGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:30968197_A_AAAGACAGGT:30968197:2,1,1,1
chr2	30968199	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:30968197_A_AAAGACAGGT:30968197:2,1,1,1
chr2	30974107	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:1,6,0,4
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=43,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,1:5,5:2,5,1,5
chr2	31147666	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=86,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31147666_C_T:31147666:2,0,1,0
chr2	31147673	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=103,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31147666_C_T:31147666:3,0,1,0
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	31420245	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31420245_A_G:31420245:0,1,0,1
chr2	31420247	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:31420245_A_G:31420245:0,1,0,1
chr2	31420250	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=108,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:31420245_A_G:31420245:0,1,0,1
chr2	31422452	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr2	31422479	.	G	GAGAATGTGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:31422479_G_GAGAATGTGGT:31422479:0,2,0,1
chr2	31422482	.	C	CCATGTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:31422479_G_GAGAATGTGGT:31422479:0,2,0,1
chr2	31423523	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr2	31457436	.	TGAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	31457670	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:11,9,0,2
chr2	31457680	.	GGCCAGTACT	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:11,2:10,11,0,2
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	31489007	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=126,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr2	31565212	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	31567688	.	C	CCTCAGCACTTTCACCTCCATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	31571330	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31571330_C_A:31571330:0,0,0,1
chr2	31571331	.	ATTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31571330_C_A:31571330:0,0,0,1
chr2	31571933	.	TCCTTGGGGTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31571933_TCCTTGGGGTTG_T:31571933:0,1,0,1
chr2	31571947	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31571933_TCCTTGGGGTTG_T:31571933:0,1,0,1
chr2	31571952	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31571933_TCCTTGGGGTTG_T:31571933:0,1,0,1
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	31621366	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=128,31757137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:31621366_C_T:31621366:3,1,1,0
chr2	31621376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=128,31757137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:31621366_C_T:31621366:3,1,1,0
chr2	31621630	.	CGA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31621630_CGA_C:31621630:0,1,0,1
chr2	31621634	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31621630_CGA_C:31621630:0,1,0,1
chr2	31621636	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31621630_CGA_C:31621630:0,1,0,1
chr2	31621638	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:31621630_CGA_C:31621630:0,1,0,1
chr2	31621643	.	CACATGTTG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31621630_CGA_C:31621630:0,1,0,1
chr2	31806130	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	32095023	.	TAAAA	T,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=15,11,10;MFRL=155,135,154;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=A;STR;TLOD=5.28,6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,7:0.121,0.334:20:2,0,0:1,0,1:0,11,0,9
chr2	32117217	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.510:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr2	32146009	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:32146009_A_C:32146009:5,11,1,1
chr2	32146015	.	GC	TA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:32146009_A_C:32146009:4,7,1,1
chr2	32146018	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:32146009_A_C:32146009:4,7,1,1
chr2	32264453	.	TGCACACC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,1:8,1:15,11,0,2
chr2	32264464	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:6,1:14,11,0,2
chr2	32312700	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr2	32362079	.	G	GTATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TA;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr2	32368320	.	CA	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,133;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr2	32409340	.	AGTTTAATGACAT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:4,2:12,8,1,1
chr2	32418146	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32418146_A_C:32418146:0,1,0,1
chr2	32418149	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32418146_A_C:32418146:0,1,0,1
chr2	32418150	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,22;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32418146_A_C:32418146:0,1,0,1
chr2	32418152	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32418146_A_C:32418146:0,1,0,1
chr2	32449706	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=111,44;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:9,3,1,1
chr2	32461226	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	32631452	.	CT	GT,GC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33,33;MFRL=170,156,140;MMQ=60,60,40;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,1:2,0,0:3,0,2,0
chr2	32631459	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=163,140;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32631459_C_T:32631459:4,0,1,0
chr2	32631465	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=163,140;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:32631459_C_T:32631459:4,0,1,0
chr2	32661074	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32667562	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.208:32:11,5:10,1:17,8,6,1
chr2	32690253	.	AT	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.491:16:2,1:6,6:2,7,1,6
chr2	32706560	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=118,138;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:20,1:15,0:14,21,0,2
chr2	32706561	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=120,55;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:21,0:14,2:13,22,1,1
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,3,25
chr2	32707476	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,2,1
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	32712961	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	32726704	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=176,142;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:32726704_T_C:32726704:1,0,2,0
chr2	32726707	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=176,142;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:32726704_T_C:32726704:1,0,2,0
chr2	32726718	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=145,169;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32726718_A_G:32726718:2,0,1,0
chr2	32726727	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=176,169;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:32726718_A_G:32726718:3,0,1,0
chr2	32733422	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32733422_T_TG:32733422:0,1,0,1
chr2	32733424	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32733422_T_TG:32733422:0,1,0,1
chr2	32735714	.	T	TGTATGTAAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:32735714_T_TGTATGTAAA:32735714:1,2,0,1
chr2	32735718	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:1,0:0|1:32735714_T_TGTATGTAAA:32735714:1,2,0,1
chr2	32735729	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=0,185;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:32735729_G_T:32735729:0,1,0,1
chr2	32735737	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:32735729_G_T:32735729:0,0,0,1
chr2	32735744	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,59;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:32735729_G_T:32735729:0,0,0,1
chr2	32735745	.	A	ACACACACAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,59;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:32735729_G_T:32735729:0,0,0,1
chr2	32740655	.	G	GTCACCCAGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,6,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,7,0
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,7,1
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,6,2
chr2	32768501	.	GATTATT	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr2	32768611	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32768611_A_C:32768611:0,0,0,1
chr2	32768613	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32768611_A_C:32768611:0,0,0,1
chr2	32768615	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32768611_A_C:32768611:0,0,0,1
chr2	32800218	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=99,36;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,0:2,2:5,3,1,1
chr2	32800516	.	G	GTTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0|1:32800516_G_GTTCT:32800516:0,0,0,1
chr2	32800518	.	G	GTTAGTATTTCTGTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,0:0,1:0|1:32800516_G_GTTCT:32800516:0,1,0,1
chr2	32800521	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32800516_G_GTTCT:32800516:0,1,0,1
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr2	32961691	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	32991672	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:32991672_T_TC:32991672:0,1,0,1
chr2	32991673	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32991672_T_TC:32991672:0,1,0,1
chr2	33007631	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,0:11,6:11,10,6,0
chr2	33007740	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:10,0:13,3:10,14,0,3
chr2	33036338	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr2	33046083	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33046083_T_A:33046083:0,0,0,1
chr2	33046084	.	ATTGATTTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33046083_T_A:33046083:0,0,0,1
chr2	33246274	.	G	GAAAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=169,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33246274_G_GAAAC:33246274:0,3,0,1
chr2	33246275	.	T	TCCTTTATGACGTATGCACTCACCTAACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=169,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33246274_G_GAAAC:33246274:0,3,0,1
chr2	33413949	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	33442540	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:33442540_G_A:33442540:1,0,1,0
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:33442540_G_A:33442540:1,0,1,0
chr2	33442750	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	33477964	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	33477977	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33477977_G_T:33477977:0,0,0,1
chr2	33477979	.	A	ATGGAAAAGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33477977_G_T:33477977:0,0,0,1
chr2	33500848	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr2	33505028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	33568098	.	C	CCGTGAGCCATGCACCCAGCCAACAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=109,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	33586464	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	33741704	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,2:8,3:2,7,2,3
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr2	33748913	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	33749054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:4,6,0,2
chr2	33752152	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:1,0,3,3
chr2	33759395	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=72,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,5:4,0:2,3,3,2
chr2	33768787	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33768787_G_A:33768787:0,1,0,1
chr2	33768791	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33768787_G_A:33768787:0,1,0,1
chr2	33783873	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=131,83;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,0:6,3:6,2,0,3
chr2	36605417	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=198,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	36668395	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=100,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,6:5,0:5,4,2,4
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=72,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:2,2:0,1:1,1,4,0
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=168,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr2	36783127	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.289:43:14,7:16,5:17,14,7,5
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=110,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,4:4,7:6,5,3,8
chr2	36805676	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,26;MFRL=205,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr2	36806021	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:2,3,0,5
chr2	36806051	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr2	36808350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,5,1
chr2	36808835	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:36808835_TA_T:36808835:0,10,1,1
chr2	36808837	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,1:0|1:36808835_TA_T:36808835:0,10,1,1
chr2	36810473	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=95,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.435:12:3,2:3,3:4,3,2,3
chr2	36825137	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr2	36943474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:36943474_G_A:36943474:5,3,2,0
chr2	36943480	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,0:0|1:36943474_G_A:36943474:5,4,2,0
chr2	37009029	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	37010581	.	T	TACAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:37010581_T_TACAA:37010581:2,1,0,1
chr2	37010582	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:37010581_T_TACAA:37010581:2,1,0,1
chr2	37010584	.	A	AAAGGAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37010581_T_TACAA:37010581:2,1,0,1
chr2	37014391	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:8,3,1,1
chr2	37041550	.	C	CATTTGTTTCTCCATGCCCTGCCCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	37076638	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=102,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:3,3,2,0
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	37077037	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	37078095	.	A	ATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr2	37096929	.	A	ATAGTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	37096933	.	G	GCTTTCCATCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:37096933_G_GCTTTCCATCC:37096933:1,3,0,1
chr2	37096937	.	T	TGAGCCTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:37096933_G_GCTTTCCATCC:37096933:1,2,0,1
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	37104948	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	37104966	.	CCG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37104966_CCG_C:37104966:0,0,1,0
chr2	37104970	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37104966_CCG_C:37104966:0,0,1,0
chr2	37105219	.	C	CTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37105219_C_CTTTTT:37105219:0,0,0,1
chr2	37105223	.	T	TTTATTTTTGTAAATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37105219_C_CTTTTT:37105219:0,0,0,1
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr2	37111236	.	GGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:37111236_GGGT_G:37111236:1,2,0,1
chr2	37111240	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:37111236_GGGT_G:37111236:1,2,0,1
chr2	37111246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37111236_GGGT_G:37111236:0,1,0,1
chr2	37111249	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:37111236_GGGT_G:37111236:0,2,0,1
chr2	37111252	.	AA	GG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37111236_GGGT_G:37111236:0,2,0,1
chr2	37114012	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr2	37132813	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:0,11,0,3
chr2	37152155	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=147,153;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,1:15,1:19,0,2,0
chr2	37152166	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:5,1:18,2:23,0,3,0
chr2	37195642	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr2	37195648	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=137,150;MMQ=60,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr2	37195652	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=139,149;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr2	37208991	.	T	TACTCAAAGAAATCAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=89,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	37234543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=163,160;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:0|1:37234543_A_G:37234543:0,7,0,2
chr2	37234547	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=163,160;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,0:0|1:37234543_A_G:37234543:0,7,0,2
chr2	37241255	.	C	CAATAAAATAGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37241255_C_CAATAAAATAGCA:37241255:0,0,0,1
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chr2	37268508	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=209,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
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chr2	37287683	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,3:3,0:5,3,2,1
chr2	37292890	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=124,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:2,1,5,0
chr2	37296092	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	37297285	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=0,149;MMQ=46,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,3:1,0,4,0
chr2	37297306	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=65,149;MMQ=53,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,0:0,6:2,0,6,0
chr2	37297329	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:4,1,4,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	37306340	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:6,0:2,5:0|1:37306340_T_C:37306340:3,5,5,0
chr2	37306343	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:37306340_T_C:37306340:0,0,10,5
chr2	37316717	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,24,24;MFRL=117,115,128;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.87,15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,9:0.171,0.395:24:2,1,0:3,2,8:5,6,10,3
chr2	37317063	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	37319156	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=99,100;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.556:36:11,9:4,11:6,10,12,8
chr2	37319223	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:6,4:2,3:2,6,2,5
chr2	37319495	.	TTATA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=84,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	37322685	.	T	TCTTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=138,2090615;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,1:8,1:8,14,0,2
chr2	37334526	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=140,2096562;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:37334526_GT_G:37334526:3,3,1,1
chr2	37334528	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=145,2096562;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:37334526_GT_G:37334526:4,3,1,1
chr2	37334532	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=145,2096562;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:37334526_GT_G:37334526:4,3,1,1
chr2	37347015	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:37347015_G_C:37347015:3,0,1,0
chr2	37347025	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.278:5:0,1:4,0:0|1:37347015_G_C:37347015:4,0,1,0
chr2	37362765	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr2	37365798	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr2	37374740	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=172,155;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:37374740_A_G:37374740:3,0,1,0
chr2	37374743	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=172,155;MMQ=40,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:37374740_A_G:37374740:3,0,1,0
chr2	37374772	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=155,148;MMQ=24,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,0:0,6:1,0,6,0
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:5,7:5,4:4,6,5,6
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:1,3,2,3
chr2	37406761	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr2	37406808	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=160,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,0,2
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,5,1
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,14,2
chr2	37428926	.	GTTT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:9,5:8,10:6,11,5,10
chr2	37438993	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=101,69;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:3,4,3,2
chr2	37444267	.	G	GCCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=169,123;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:37444267_G_GCCAT:37444267:0,3,0,1
chr2	37444268	.	TGGTG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=169,123;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:37444267_G_GCCAT:37444267:0,3,0,1
chr2	37444288	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=199,123;MMQ=55,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr2	37444304	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=226,123;MMQ=55,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr2	37447463	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.721:1:0,1:0,0:0|1:37447463_A_AAG:37447463:0,0,1,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,112;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.511:2:0,1:1,0:0|1:37447463_A_AAG:37447463:0,1,1,0
chr2	37447569	.	A	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.076:50:23,3:24,0:0|1:37447569_A_C:37447569:22,25,3,0
chr2	37447593	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:47,2:0.058:49:23,1:23,0:1|0:37447569_A_C:37447569:28,19,0,2
chr2	37447604	.	A	ATGCTATATATATAT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:49,2:0.056:51:27,2:22,0:1|0:37447569_A_C:37447569:23,26,0,2
chr2	37455246	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,0:0|1:37455246_G_A:37455246:8,2,1,1
chr2	37455248	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:37455246_G_A:37455246:8,2,1,1
chr2	37459208	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,5:4,2:5,2,4,3
chr2	37474386	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=96,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,5:9,2:8,7,6,1
chr2	37480319	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:5,2,3,1
chr2	37483960	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=113,126;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:0|1:37483960_T_C:37483960:9,4,0,3
chr2	37483966	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=119,126;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,0:5,3:0|1:37483960_T_C:37483960:7,4,0,3
chr2	37499577	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=136,161;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,0:9,5:6,11,0,5
chr2	37506939	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=90,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:4,4:0,4:3,1,4,4
chr2	37516481	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=153,981;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr2	37516583	.	ACGTCTC	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,2:7,0:0|1:37516583_ACGTCTC_A:37516583:7,4,1,1
chr2	37516593	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=156,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:37516583_ACGTCTC_A:37516583:7,4,1,1
chr2	37516595	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=156,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:0|1:37516583_ACGTCTC_A:37516583:7,4,1,1
chr2	37543526	.	GT	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=107,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:10,2:4,0:6,8,1,1
chr2	37543544	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=88,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,6:3,0:3,4,2,4
chr2	38156703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,141;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:4,3,0,4
chr2	38179373	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr2	38202502	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	38244818	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:38244818_A_C:38244818:0,0,1,7
chr2	38244824	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:38244818_A_C:38244818:0,0,0,7
chr2	38244851	.	G	GCTTTTATTATCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	38294107	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=110,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:4,2,2,1
chr2	38301600	.	CCACCGTGCG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:5,0:10,8,0,2
chr2	38301971	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr2	38523288	.	A	ACCCCAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	38526324	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=104,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr2	38526333	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=111,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.396:11:5,2:1,2:6,1,4,0
chr2	38526547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:0,4,0,3
chr2	38527522	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=124,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr2	38537626	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	38542573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	38545955	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=203,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38545955_T_G:38545955:2,0,1,0
chr2	38545957	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=203,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:38545955_T_G:38545955:2,0,1,0
chr2	38546213	.	A	AATAGATTAATGGCTAGGAGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0|1:38546213_A_AATAGATTAATGGCTAGGAGTGTG:38546213:0,3,0,1
chr2	38546216	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:38546213_A_AATAGATTAATGGCTAGGAGTGTG:38546213:0,3,0,1
chr2	38809162	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:2,4:4,3,4,5
chr2	38813019	.	C	CCCCTGGCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38813019_C_CCCCTGGCG:38813019:0,1,0,1
chr2	38813020	.	A	AATTTTGTATTTTTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38813019_C_CCCCTGGCG:38813019:0,1,0,1
chr2	38818868	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=165,126;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	38818882	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38818882_T_C:38818882:0,2,0,1
chr2	38818884	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38818882_T_C:38818882:0,2,0,1
chr2	38818886	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38818882_T_C:38818882:0,2,0,1
chr2	38893301	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,3:5,3,4,5
chr2	38916906	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=89,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,1,1
chr2	38925666	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38925666_A_AC:38925666:0,0,0,1
chr2	38925668	.	A	ACCCCATCAAAAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38925666_A_AC:38925666:0,0,0,1
chr2	38925671	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38925666_A_AC:38925666:0,0,0,1
chr2	38956840	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:1,4,3,3
chr2	38974282	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.294:5:3,1:1,0:0|1:38974282_G_GT:38974282:1,3,0,1
chr2	38974284	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.294:5:3,1:1,0:0|1:38974282_G_GT:38974282:1,3,0,1
chr2	38974285	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.294:5:2,1:1,0:0|1:38974282_G_GT:38974282:1,3,0,1
chr2	38974301	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38974301_C_CA:38974301:0,1,0,1
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chr2	38974303	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38974301_C_CA:38974301:0,1,0,1
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr2	39006308	.	G	GGTTAATATATGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	39040966	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:39040966_C_T:39040966:13,7,1,1
chr2	39040968	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,0:10,2:0|1:39040966_C_T:39040966:13,7,1,1
chr2	39041127	.	AA	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=149,160;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,2:1,0:0|1:39041127_AA_TG:39041127:0,4,0,2
chr2	39041130	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=149,162;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39041127_AA_TG:39041127:0,4,0,1
chr2	39041136	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=149,162;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:39041127_AA_TG:39041127:0,4,0,1
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr2	39043388	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr2	39043430	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=159,148;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	39046321	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,3:5,0:3,7,1,2
chr2	39046333	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,94;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:8,0:1,2:0|1:39046333_CA_C:39046333:2,7,1,1
chr2	39046339	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,94;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:1,2:0|1:39046333_CA_C:39046333:2,7,1,1
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	39055637	.	AAAATTTTTTTAAAAAAGAATATGAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=190,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	39070246	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,96;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,0:3,4:4,6,2,2
chr2	39081365	.	A	ATGCACATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	39085782	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,39667871;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:3,1,2,0
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr2	39108778	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr2	39117001	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=109,76;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:6,5,2,0
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,3,3
chr2	39148393	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=105,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,2,0
chr2	39156806	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,5:2,2:2,0,6,1
chr2	39158446	.	C	CGACCACACACCAAAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	39184123	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:7,0:7,2:6,8,1,1
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr2	39213230	.	T	TC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=99,54;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:13,2:15,1:0|1:39213230_T_TC:39213230:10,19,1,2
chr2	39213237	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=111,54;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:13,2:18,0:0|1:39213230_T_TC:39213230:12,19,0,2
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	39234158	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr2	39237816	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=138,6096482;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:39237816_TT_AA:39237816:0,1,0,1
chr2	39237820	.	A	AACCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=138,6096482;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39237816_TT_AA:39237816:0,1,0,1
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	39241223	.	A	ACGCCACTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	39262396	.	A	ACT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:13,2:18,0:15,16,0,2
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr2	39285763	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,87;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:12,5,2,0
chr2	39347596	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:39347596_G_T:39347596:1,2,0,1
chr2	39347606	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=87,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39347596_G_T:39347596:0,1,0,1
chr2	39411855	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,2,0,1
chr2	39411856	.	CGT	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,2,0,1
chr2	39411861	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,2,0,1
chr2	39411864	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,1,0,1
chr2	39411865	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,1,0,1
chr2	39411871	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39411855_G_A:39411855:0,1,0,1
chr2	39440699	.	G	GTACAGGAAACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=85.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,17,8
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	39535209	.	A	ATGTATATATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:39535209_A_ATGTATATATAT:39535209:0,0,0,1
chr2	39535211	.	A	AACAATTCATATGTTATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:39535209_A_ATGTATATATAT:39535209:0,0,0,1
chr2	39536743	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=176,139;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0|1:39536743_C_G:39536743:0,1,0,2
chr2	39536746	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=176,139;MMQ=50,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39536743_C_G:39536743:0,1,0,1
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,9,9
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	39664132	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,2,4
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	39971713	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	39983203	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:1,5,2,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=95,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.565:37:5,12:11,9:9,7,12,9
chr2	39996341	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,1,5
chr2	39998832	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:6,0:4,2:0|1:39998832_A_C:39998832:1,9,1,1
chr2	39998835	.	T	TTTATCCCACAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:3,2:0|1:39998832_A_C:39998832:1,9,1,1
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	40655563	.	CCACA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	40656898	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=66,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr2	40657469	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40657469_G_A:40657469:0,0,0,1
chr2	40657472	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40657469_G_A:40657469:0,0,0,1
chr2	40657473	.	A	AATGAAACTGGTGAATGTACTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40657469_G_A:40657469:0,0,0,1
chr2	42165754	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,7:2,2:1,3,6,3
chr2	42180478	.	T	TCTGAGAAAGATGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	42284921	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	42472894	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=71,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	42508023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:6,6,1,1
chr2	42508204	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	42528546	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:6,8,0,2
chr2	42552742	.	TTATATATATATATATATA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,9;RU=TA;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.712:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	42579743	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr2	42936035	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:5,9,2,0
chr2	42950185	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=80,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,3:5,3:2,7,2,4
chr2	42994756	.	A	AAATCATCGAATGGGATCAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=198,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	42997538	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	43010467	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr2	43655276	.	CAGA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:3,3:2,7,2,2
chr2	43657478	.	T	TGAGAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0|1:43657478_T_TGAGAC:43657478:0,2,1,1
chr2	43657480	.	C	CAGTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:43657478_T_TGAGAC:43657478:0,2,1,1
chr2	43768230	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,141;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,5:4,0:6,1,5,0
chr2	43793963	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	43793983	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:43793983_C_A:43793983:0,2,0,2
chr2	43793985	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:43793983_C_A:43793983:0,2,0,2
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,594;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	43814105	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,641;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:4,8,3,0
chr2	43817945	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:11,3,5,0
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr2	43905898	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,30;MFRL=89,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr2	43926885	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:3,5,1,1
chr2	43926943	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,3:5,3:5,6,4,2
chr2	43937500	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=125,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:1,6,1,2
chr2	43937859	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43937859_G_GA:43937859:0,0,0,1
chr2	43937863	.	C	CCCCAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43937859_G_GA:43937859:0,0,0,1
chr2	43939525	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr2	43968237	.	T	TTTGAGGTAGGGGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	43989587	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,2,2
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,7:3,2:3,4,4,5
chr2	43992823	.	C	CTCAGGATGAAATCTCAACATGAGATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	44032347	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:4,7,3,2
chr2	44055300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:44055300_G_T:44055300:0,3,0,1
chr2	44055307	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:44055300_G_T:44055300:0,3,0,1
chr2	44055323	.	G	GTTACAGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44055323_G_GTTACAGCT:44055323:0,1,0,1
chr2	44055326	.	GA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44055323_G_GTTACAGCT:44055323:0,1,0,1
chr2	44065103	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=99,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44065103_G_C:44065103:0,2,0,1
chr2	44065113	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:44065103_G_C:44065103:0,4,0,1
chr2	44065115	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:44065103_G_C:44065103:0,3,0,1
chr2	44066174	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=203,132;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,3,1
chr2	44071625	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr2	44071639	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr2	44071800	.	AATTCCCCGGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44071800_AATTCCCCGGGT_A:44071800:0,1,0,1
chr2	44071817	.	TA	CC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44071800_AATTCCCCGGGT_A:44071800:0,0,0,1
chr2	44071821	.	AG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44071800_AATTCCCCGGGT_A:44071800:0,0,0,1
chr2	44071827	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44071800_AATTCCCCGGGT_A:44071800:0,0,0,1
chr2	44071829	.	CC	AA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44071800_AATTCCCCGGGT_A:44071800:0,0,0,1
chr2	44078714	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr2	44079004	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	44101649	.	G	GCCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=C;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	44102477	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44102477_T_C:44102477:2,0,0,1
chr2	44102478	.	T	TCACGTCAGAGCCCTCCTCCCACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44102477_T_C:44102477:2,0,0,1
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	44117420	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:10,4,4,0
chr2	44117575	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:8,2:8,15,0,2
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	44128756	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44128756_T_A:44128756:0,0,0,1
chr2	44128758	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44128756_T_A:44128756:0,0,0,1
chr2	44128761	.	A	ACCCATTCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44128756_T_A:44128756:0,0,0,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=111,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,1:4,6:3,3,3,4
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:3,0:2,2:5,2,2,0
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=97,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	44173422	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	44209321	.	C	A,G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,30,27;MFRL=103,146,99;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.01,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,3:0.139,0.122:26:8,3,3:11,0,0:8,12,6,0
chr2	44209334	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=104,90;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:21,1:15,0:0|1:44209334_A_C:44209334:16,24,1,1
chr2	44209337	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=104,90;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:22,2:17,0:0|1:44209334_A_C:44209334:15,24,1,1
chr2	44209338	.	G	GC	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=104,90;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:23,2:17,0:0|1:44209334_A_C:44209334:16,24,1,1
chr2	44436538	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	44445604	.	GT	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.325:33:13,4:8,6:15,7,9,2
chr2	44445695	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:27,0:18,3:12,33,0,3
chr2	44471326	.	CAT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:5,1:9,3,2,1
chr2	44527263	.	T	TAGAACCATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=147,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,1,3
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr2	44553761	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44553761_G_A:44553761:0,0,1,0
chr2	44553763	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44553761_G_A:44553761:0,0,1,0
chr2	44553766	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44553761_G_A:44553761:0,0,1,0
chr2	44553770	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44553761_G_A:44553761:0,0,1,0
chr2	44553773	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44553761_G_A:44553761:0,0,1,0
chr2	44566504	.	TAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,2:1,4:1,5,4,2
chr2	44569737	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	44570804	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=96,75012433;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=96876507,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	44993693	.	ACTC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:0|1:44993693_ACTC_A:44993693:1,0,0,1
chr2	44993698	.	AAGGTTAGTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44993693_ACTC_A:44993693:1,0,0,1
chr2	45235667	.	G	GTTGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45235667_G_GTTGC:45235667:1,0,0,1
chr2	45235668	.	A	ACTCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=102,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45235667_G_GTTGC:45235667:1,0,0,1
chr2	45235765	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,0:6,2:6,2,1,1
chr2	45235785	.	A	AGGTTTTG	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:4,2:0|1:45235785_A_AGGTTTTG:45235785:8,3,1,1
chr2	45235786	.	C	CATACTGTAGGAA	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:45235785_A_AGGTTTTG:45235785:8,3,1,1
chr2	45235788	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=20,30;MFRL=107,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:7,1:0|1:45235785_A_AGGTTTTG:45235785:8,3,1,1
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	45774050	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	45778233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:45780962_C_G:45780962:0,0,0,5
chr2	45780965	.	G	GGGCCAGGGCAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:45780962_C_G:45780962:0,4,0,1
chr2	45780969	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:45780962_C_G:45780962:0,4,0,1
chr2	45807058	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:4,5,0,2
chr2	45807178	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	45812859	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	45832428	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	45879610	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	46070243	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=87,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:46070243_G_A:46070243:1,2,0,1
chr2	46070248	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=87,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:46070243_G_A:46070243:1,2,0,1
chr2	46583235	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	46583278	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=203,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.630:9:1,2:1,4:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,2,2,4
chr2	46583279	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=203,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,2:1,4:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,2,2,5
chr2	46583281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:0,4:2,2,2,5
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,8:3,4:6,5,6,6
chr2	46605882	.	GGCC	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.274:9:3,0:3,2:0|1:46605882_GGCC_G:46605882:1,6,1,1
chr2	46605886	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:46605882_GGCC_G:46605882:1,6,1,1
chr2	46605890	.	ACCAATGCAGTACCCAGGT	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=112,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:46605882_GGCC_G:46605882:1,8,1,1
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=61,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr2	46607835	.	A	ACCATTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	46609260	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=124,306;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46609260_GG_AA:46609260:0,1,1,0
chr2	46609264	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,23;MFRL=124,306;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46609260_GG_AA:46609260:0,1,1,0
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,1,2
chr2	46839487	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.232:23:5,1:7,1:6,12,0,5
chr2	46987935	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:3,8:1,4:2,2,10,2
chr2	46988655	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=94,147;MMQ=53,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr2	47044363	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,0:1,0,4,0
chr2	47081092	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	47081239	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	47085382	.	C	CTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=130,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	47085398	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	47206061	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:10,3:5,9,1,2
chr2	47251515	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=97,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:2,2,0,3
chr2	47251555	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,0,3
chr2	47279039	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr2	47378611	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=93,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,5:3,2:2,7,2,5
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,0,5
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	47387989	.	CAAA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.555:8:2,1:0,0:2,2,1,3
chr2	47388765	.	CA	GG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	47388997	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:5,3:15,0:6,14,2,1
chr2	47600544	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47600544_G_C:47600544:0,0,1,0
chr2	47600546	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47600544_G_C:47600544:0,0,1,0
chr2	47635523	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	47739533	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=86,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:3,4,0,4
chr2	47748614	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,4353349;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47748614_T_C:47748614:0,0,1,0
chr2	47748621	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,4353349;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47748614_T_C:47748614:0,0,1,0
chr2	48018291	.	GTT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=93,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.130:26:13,0:9,2:11,12,2,1
chr2	48018342	.	T	TATCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:0,7,1,7
chr2	48032740	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.282:18:6,3:5,1:9,4,5,0
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:2,3:5,6:1,7,3,7
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:6,7:1,5:2,5,9,3
chr2	48040849	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=131,185;MMQ=55,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48040849_G_A:48040849:2,0,1,0
chr2	48040851	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=131,185;MMQ=55,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48040849_G_A:48040849:2,0,1,0
chr2	48040853	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=131,185;MMQ=55,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:48040849_G_A:48040849:2,0,1,0
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr2	48046012	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:1,1:5,1:2,6,0,3
chr2	48047485	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	48050551	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48050551_G_T:48050551:0,1,0,1
chr2	48050554	.	ATGCCATT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,27;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48050551_G_T:48050551:0,1,0,1
chr2	48059471	.	AAAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:5,2,2,1
chr2	48061940	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:16,0:13,3:17,12,2,1
chr2	48678295	.	G	GATTTGCTTTTTTCAGTCAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr2	48685353	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=105,296;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,4:9,0:7,10,0,4
chr2	48686989	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,3:12,0:16,10,3,0
chr2	48688258	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.325:23:5,2:4,4:11,5,6,1
chr2	48688463	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	48692135	.	G	GAAATGGAGAAGC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=115,7775440;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:7,1:8,1:0|1:48692135_G_GAAATGGAGAAGC:48692135:5,10,0,2
chr2	48692139	.	A	AGAGCCTGAC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=115,7775440;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:0|1:48692135_G_GAAATGGAGAAGC:48692135:5,10,0,2
chr2	48692141	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=115,7775440;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:0|1:48692135_G_GAAATGGAGAAGC:48692135:5,10,0,2
chr2	48692866	.	C	CATTCAGTCATCTCCCACTGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=228,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	48698165	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,2:8,0:10,0,2,0
chr2	48698329	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,0:8,4:5,9,0,4
chr2	48698532	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:6,0:5,3:3,8,3,0
chr2	48722755	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	48722896	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=124,14429;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:6,0:4,3,0,2
chr2	48725610	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	48808041	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=64,115;MMQ=60,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:4,4:6,0:5,5,4,0
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	48869647	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr2	48874046	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48874046_A_T:48874046:1,0,0,1
chr2	48874049	.	C	CTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48874046_A_T:48874046:1,0,0,1
chr2	48896798	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	48898790	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=113,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:7,3:7,0:0|1:48898790_G_A:48898790:6,9,1,2
chr2	48898798	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0|1:48898790_G_A:48898790:0,0,10,13
chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr2	48915871	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=164905603,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,7:0,6:0,1,5,8
chr2	48915941	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,61;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	48916030	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48916030_G_A:48916030:0,0,0,1
chr2	48916032	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48916030_G_A:48916030:0,0,0,1
chr2	48916034	.	AT	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48916030_G_A:48916030:0,0,0,1
chr2	48925746	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	48925987	.	T	TTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=119,125;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:48925987_T_TTA:48925987:2,2,0,1
chr2	48926003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=132,125;MMQ=49,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48925987_T_TTA:48925987:1,3,0,1
chr2	48952701	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	49003381	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,5:0,3,1,5
chr2	49196018	.	T	TTAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	49210401	.	G	GGGCCAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49210401_G_GGGCCAAC:49210401:0,1,0,1
chr2	49210403	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,21;MFRL=160,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:49210401_G_GGGCCAAC:49210401:0,1,0,1
chr2	49216284	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	50201383	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:2,0:2,4:2,2,2,2
chr2	50246442	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:12,12,2,0
chr2	50282003	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=8832,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,6,4
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr2	50733545	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	50755909	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:50755909_A_C:50755909:0,4,0,1
chr2	50755911	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:50755909_A_C:50755909:0,4,0,1
chr2	50755914	.	A	ACCG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50755909_A_C:50755909:0,3,0,1
chr2	50755917	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50755909_A_C:50755909:0,3,0,1
chr2	50755919	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50755909_A_C:50755909:0,3,0,1
chr2	50758546	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0|1:50758546_AT_A:50758546:1,2,1,1
chr2	50758550	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:50758546_AT_A:50758546:1,2,1,1
chr2	50779734	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:15,1:5,2:13,7,2,1
chr2	50850409	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50850409_C_A:50850409:2,0,1,0
chr2	50850417	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:50850409_C_A:50850409:2,0,1,0
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	50858269	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,3:2,7:3,5,4,7
chr2	51147212	.	G	GTACTGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=134,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr2	51253672	.	C	CTATTATTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:51253672_C_CTATTATTAT:51253672:1,2,0,1
chr2	51253673	.	C	CTTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:51253672_C_CTATTATTAT:51253672:1,2,0,1
chr2	53990616	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:7,4,0,2
chr2	53999078	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=107,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:26,2:11,1:23,14,3,0
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:2,6:2,6:2,2,9,4
chr2	54026197	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.097:38:13,3:21,0:17,18,1,2
chr2	54026343	.	G	GTTCTTGGCCAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	54035374	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	54042128	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:54042128_T_C:54042128:2,2,0,1
chr2	54042133	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:54042128_T_C:54042128:2,2,0,1
chr2	54042136	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:54042128_T_C:54042128:2,2,0,1
chr2	54042142	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:54042128_T_C:54042128:1,2,0,1
chr2	54080959	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr2	54081223	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:8,0:4,2:6,6,1,1
chr2	54081993	.	A	AAAACTGTTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=104,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	54093206	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr2	54101387	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=189,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:54101387_GC_TT:54101387:2,0,1,0
chr2	54101391	.	C	CTCCAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:54101387_GC_TT:54101387:2,0,1,0
chr2	54114967	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=95,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,5,1
chr2	54116003	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=187,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:1,2,2,1
chr2	54122768	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:7,0:6,11,1,1
chr2	54125185	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:0,0:3,2:0,4,0,4
chr2	54126949	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=145,124;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr2	54127041	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,9:5,5:1,11,2,12
chr2	54127248	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54127248_AG_A:54127248:0,1,0,1
chr2	54127250	.	ACACAAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54127248_AG_A:54127248:0,1,0,1
chr2	54133697	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:11,3,1,1
chr2	54135429	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr2	54153215	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr2	54155240	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:3,3,3,1
chr2	54158957	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,1:3,2:3,5,1,2
chr2	54163854	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:12,1,2,0
chr2	54365851	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:18,0:17,3:24,11,0,3
chr2	54365976	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:11,0:0,2:0,14,0,2
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr2	54562093	.	A	ACACCACACACACAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=131,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,0:14,2:15,6,0,2
chr2	54587692	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,156;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:3,10,0,2
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr2	54844790	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,6,7
chr2	54852970	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=143,125;MMQ=46,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:54852970_TG_CA:54852970:2,0,1,0
chr2	54852975	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=143,125;MMQ=46,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:54852970_TG_CA:54852970:2,0,1,0
chr2	54853005	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:11,0,3,0
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	54857969	.	GCTGTCTGCCCCTGCACTCACAGGTGGAGCCAGTTCAGAGAACTGGTTGACAGGAAGAAGGATGCCCTC	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.110:26:7,0:5,2:9,15,1,1
chr2	54872402	.	ATC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:9,4,2,0
chr2	54872636	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:54872636_TG_T:54872636:0,1,0,1
chr2	54872638	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:54872636_TG_T:54872636:0,1,0,1
chr2	54874466	.	C	CAATGCCTGTACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	54876731	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=148,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr2	54887296	.	C	CTTCTACAATGATTGTAAGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=229,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	54891503	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	54894649	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	55047612	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:7,0:7,2:3,13,0,2
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	55080703	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	55086885	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,1,0,1
chr2	55086887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,1,0,1
chr2	55086892	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=20,27;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,1,0,1
chr2	55086894	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,1,0,1
chr2	55086896	.	A	AGGGTG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,0,0,1
chr2	55086900	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,0,0,1
chr2	55086901	.	CTA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55086885_CA_C:55086885:0,0,0,1
chr2	55093842	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=255,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,8:0,1:1,0,8,1
chr2	55094041	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=113,9;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:5,16,3,0
chr2	55122187	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=144,1004;MMQ=60,51;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55122187_G_T:55122187:0,2,1,0
chr2	55122196	.	GT	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=144,1004;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55122187_G_T:55122187:0,2,1,0
chr2	55122589	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,2,4
chr2	55155663	.	A	ATACTTCTTGAATCTTGCGTGCTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,27;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:4,0,0,1
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	55186394	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:55186394_A_C:55186394:0,0,1,0
chr2	55186401	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:55186394_A_C:55186394:0,0,1,0
chr2	55191350	.	GT	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0|1:55191350_GT_TG:55191350:0,2,0,1
chr2	55191360	.	T	TAAACCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55191350_GT_TG:55191350:0,2,0,1
chr2	55191361	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55191350_GT_TG:55191350:0,2,0,1
chr2	55195768	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:1,0,1,2
chr2	55200800	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=105,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:4,4,1,5
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	55201065	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=172,117;MMQ=60,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55201065_C_T:55201065:0,1,0,1
chr2	55201069	.	A	ATCATCCTGATTTGGCTAATAAATTATATGGTGAACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=172,117;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55201065_C_T:55201065:0,1,0,1
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr2	55214894	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:55214894_C_T:55214894:0,3,0,1
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1|0:55214894_C_T:55214894:0,1,0,2
chr2	55252214	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=111,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:6,1,2,1
chr2	55253758	.	C	CTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.277:5:1,1:2,0:4,0,0,1
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	55490700	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	55522747	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=127,137;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,4:4,0:5,4,4,0
chr2	55522771	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=127,137;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:7,4:4,0:5,7,4,0
chr2	55523307	.	ACC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	55561283	.	CCTTATTTTCTTTTTCTAGTTCTTTCAGACGGACACAAGATTCTTTATATATACCAATTTCTTTGGATAGGGTTTTGTTTTCTTTTTCCAAATTTCCAATCTTCACATTATTTTCTTCTAATGTGGTATCTTTAATTTCTGCTTGTTGTCGGAGTCT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.066:56:6,7:6,1:24,22,5,5
chr2	55582935	.	C	CTTCTTTATTGTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=191,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55582935_C_CTTCTTTATTGTTTG:55582935:0,1,0,1
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chr2	55646140	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=122,57;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:6,3:14,0:7,15,3,0
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chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	55762957	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,9,8
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chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,17,4
chr2	55800992	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	55815949	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr2	55863360	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr2	55864827	.	T	TGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	55873301	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	55874687	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,172;MMQ=60,30;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	55881910	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=156,204;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	55883509	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.377:9:4,2:1,1:1,5,0,3
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,17:0,0,20,9
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	55900283	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	55910955	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.234:19:4,4:11,0:11,4,2,2
chr2	56098272	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	56102084	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,88;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:7,5:6,0:10,5,5,1
chr2	56144903	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0|1:56144903_G_T:56144903:1,2,0,3
chr2	56144909	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:56144903_G_T:56144903:1,0,0,3
chr2	56145270	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,1,2
chr2	56603118	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=90,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:1,1,0,3
chr2	56603153	.	TTGCTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56603153_TTGCTTG_T:56603153:0,1,0,1
chr2	56603161	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=140,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:56603153_TTGCTTG_T:56603153:0,1,0,1
chr2	56611584	.	TCATGGAATAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:0,2,1,0
chr2	58387000	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,1,3
chr2	58388696	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,5:0,14:0,0,13,7
chr2	58388727	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:2,0:12,2:5,9,0,2
chr2	58390538	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0|1:58390538_T_C:58390538:0,0,13,4
chr2	58390547	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.915:21:0,9:1,10:0|1:58390538_T_C:58390538:0,1,16,4
chr2	58431412	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=81,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:58431412_G_GAT:58431412:1,2,0,1
chr2	58431414	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=81,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:58431412_G_GAT:58431412:1,2,0,1
chr2	58431420	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:58431412_G_GAT:58431412:0,2,0,1
chr2	58431428	.	T	TGGGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58431428_T_TGGGA:58431428:0,1,0,1
chr2	58431429	.	T	TACCTTCTTATTAAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58431428_T_TGGGA:58431428:0,1,0,1
chr2	58453843	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=62,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:7,2:0,1:7,3,3,0
chr2	59482474	.	G	GGATGTGTTAAGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	59504776	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,2,10
chr2	60687944	.	T	TATATACACCACCAAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60687944_T_TATATACACCACCAAAC:60687944:0,0,0,1
chr2	60687945	.	G	GCTTTCCATAGCATGCTGTAGTGGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,124;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60687944_T_TATATACACCACCAAAC:60687944:0,0,0,1
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.610:34:6,9:5,11:8,5,17,4
chr2	60996116	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	61007986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	61009807	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=125,126;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.301:28:8,7:11,0:12,8,8,0
chr2	61009813	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.163:29:12,4:9,0:16,9,4,0
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=194.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,38:0,25:0,0,24,39
chr2	61009938	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=241,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.834:15:1,6:0,6:0,2,0,13
chr2	61009953	.	A	AGAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=130,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:6,0:0,13,0,2
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	61022016	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:61022016_TC_T:61022016:2,1,1,0
chr2	61022036	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=117,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.212:12:6,2:4,0:1|0:61022016_TC_T:61022016:3,7,2,0
chr2	61108829	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,10,5
chr2	61128284	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,0:0,2:0|1:61128284_T_C:61128284:0,0,1,3
chr2	61128285	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=141,149;MMQ=48,49;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,0:0|1:61128284_T_C:61128284:0,2,0,1
chr2	61143927	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:2,0,1,0
chr2	61145512	.	G	GAGATGGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:61145512_G_GAGATGGA:61145512:0,3,0,1
chr2	61145515	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:61145512_G_GAGATGGA:61145512:0,3,0,1
chr2	61147147	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:19,4:7,0:17,9,4,0
chr2	61172180	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,547;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:7,0:8,4:10,7,2,2
chr2	61233700	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:7,2,2,1
chr2	61238010	.	CT	TC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=157,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:61238010_CT_TC:61238010:1,3,1,1
chr2	61238014	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=157,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:61238010_CT_TC:61238010:1,3,1,1
chr2	61238019	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:61238010_CT_TC:61238010:1,2,1,1
chr2	61238021	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:61238010_CT_TC:61238010:1,2,1,1
chr2	61300556	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:8,3:3,0:10,1,3,0
chr2	61344708	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,3:5,0:2,5,1,2
chr2	61389561	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr2	61389609	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	61413092	.	AATAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	61417451	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,3:8,2:6,5,2,3
chr2	61449919	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=167,145;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:61449919_CTT_C:61449919:0,2,0,1
chr2	61449924	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=167,145;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:61449919_CTT_C:61449919:0,2,0,1
chr2	61449925	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=167,145;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:61449919_CTT_C:61449919:0,2,0,1
chr2	61456611	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,63;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr2	61468991	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr2	61483715	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	61483980	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,3:8,0:13,1,1,2
chr2	61515835	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,3:10,0:10,10,2,1
chr2	61522047	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr2	61528299	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr2	61552411	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:1,1:1,0:4,0,1,0
chr2	61552439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:1,2:6,0:7,1,2,0
chr2	61552484	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,14:0,15:0,0,17,14
chr2	61570886	.	AAAGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	61576489	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:61576489_G_T:61576489:0,7,1,1
chr2	61576492	.	G	GATTCCTTGACCTAGTTACCAAAGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,2:0|1:61576489_G_T:61576489:0,7,1,1
chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	61577667	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=147,113;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.223:7:2,0:2,1:6,0,1,0
chr2	61605379	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	61605614	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr2	61622374	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.301:17:3,1:7,4:3,9,2,3
chr2	61708497	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=138,157;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	61709747	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=15,30;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,6;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0,4,0,1
chr2	61709759	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	61722847	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=196,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	61726154	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	62063093	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.789:13:0,8:2,1:2,1,8,2
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	62067686	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=52,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0|1:62067686_A_G:62067686:1,1,1,1
chr2	62067697	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=52,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62067686_A_G:62067686:1,1,0,1
chr2	62067700	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=52,71;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:62067686_A_G:62067686:1,1,0,1
chr2	62067703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62067686_A_G:62067686:1,0,0,1
chr2	62081012	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	62451476	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,633;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.166:20:12,2:5,0:11,6,0,3
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	62974698	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr2	62974700	.	TGA	T,TGAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28,27;MFRL=0,166,169;MMQ=60,60,60;MPOS=1,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.36,7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.375,0.477:4:0,1,2:0,1,0:0,0,0,4
chr2	62974704	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:0,2,0,2
chr2	63092049	.	A	AGTCTGCACCTCTTTAAAGGGAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=122,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:3,1,1,1
chr2	63101765	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:1,1:0,0:0|1:63101765_G_GA:63101765:0,1,0,1
chr2	63101768	.	G	GTTTGCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63101765_G_GA:63101765:0,1,0,1
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=79,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.601:5:2,3:0,0:1,1,1,2
chr2	63220868	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,147;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	63401805	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=147,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:3,2:4,2,2,0
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr2	63631590	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=111,187194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:12,0:3,3:7,8,3,0
chr2	63666905	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:13,2:7,0:0|1:63666905_T_A:63666905:14,7,3,0
chr2	63666910	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:15,3:7,0:0|1:63666905_T_A:63666905:15,8,3,0
chr2	63666924	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,2:0.103:27:20,0:5,2:1|0:63666905_T_A:63666905:16,9,1,1
chr2	63666929	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.097:29:20,0:5,2:1|0:63666905_T_A:63666905:18,9,1,1
chr2	63711899	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	63719887	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr2	63831745	.	TATTTAAGGGCATTTGTCAAAACAGGTCCCAATTGGAAATAAAAACCATTTGTCTCAGTAATGTATTTGTTTTCA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:2,1,1,0
chr2	63832429	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	63833242	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=145,171;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:63833242_A_G:63833242:0,1,0,1
chr2	63833251	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,171;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:63833242_A_G:63833242:0,1,0,1
chr2	63833258	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=145,171;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:63833242_A_G:63833242:0,1,0,1
chr2	63833267	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=180,171;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:63833242_A_G:63833242:0,2,0,1
chr2	63834198	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:63834198_T_A:63834198:0,1,0,1
chr2	63834204	.	TA	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:63834198_T_A:63834198:0,1,0,1
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	64111110	.	AC	GG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:64111110_AC_GG:64111110:4,3,1,1
chr2	64111113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,2:3,0:0|1:64111110_AC_GG:64111110:4,3,1,1
chr2	64124689	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:5,10,1,1
chr2	64126775	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	64139831	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,1:2,2:2,4,0,4
chr2	64140301	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,4:0,8:0,0,12,1
chr2	64143937	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:64143937_C_G:64143937:3,0,1,0
chr2	64143940	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,11;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:64143937_C_G:64143937:3,0,1,0
chr2	64322134	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:4,3,1,1
chr2	64323751	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=53,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr2	64683600	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:64683600_G_GT:64683600:0,2,1,1
chr2	64683602	.	G	GATTCCATTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:64683600_G_GT:64683600:0,2,1,1
chr2	64683604	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=107,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:2,1:0,0:0|1:64683600_G_GT:64683600:0,2,1,1
chr2	64794614	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	64800239	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr2	65299011	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=109,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:65299011_G_GC:65299011:3,3,1,1
chr2	65299012	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:65299011_G_GC:65299011:3,3,1,1
chr2	65299157	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=237,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:0,1,4,1
chr2	65315880	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,1:5,5:5,5,1,5
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	65492340	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr2	65540683	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=18767705,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:1,2:0,2,1,1
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	66662875	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=51,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=24,19;RU=T;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.455:7:0,2:1,1:2,2,3,0
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	66667837	.	CTAGACCGG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	66667848	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=164,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:66667848_T_A:66667848:0,1,0,1
chr2	66667851	.	CC	TC,TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,24,27;MFRL=0,164,119;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr2	66667855	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66667848_T_A:66667848:0,0,0,1
chr2	66667857	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:66667848_T_A:66667848:0,0,0,1
chr2	66670050	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,3:9,0:0|1:66670050_A_G:66670050:9,10,3,0
chr2	66670060	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=112,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,2:0.142:19:10,0:6,2:1|0:66670050_A_G:66670050:10,7,1,1
chr2	66670085	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.130:21:11,0:7,2:1|0:66670050_A_G:66670050:7,12,1,1
chr2	66670087	.	G	GAAATATCTTCGTATA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,2:0.130:21:10,0:8,2:1|0:66670050_A_G:66670050:7,12,1,1
chr2	66688914	.	TGAATCGGAATGCCTCACAGATCATAGCG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:8,0:12,2:22,7,1,1
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,4,16
chr2	68273060	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr2	68274510	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	68280248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=86,1236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:2,6,2,0
chr2	68358341	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=113,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:0,1:6,6:5,1,4,4
chr2	68362022	.	A	AAAGATGGGGAAAGGGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	68385516	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,6:6,6:5,6,7,5
chr2	68389557	.	T	TTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	68402012	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	68402047	.	T	TCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=149,158;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68402047_T_TCCC:68402047:0,2,0,1
chr2	68402048	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=149,158;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:68402047_T_TCCC:68402047:0,2,0,1
chr2	68415563	.	CTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr2	68415697	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,0:15,3:18,14,3,0
chr2	68444143	.	TAC	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:1,4:4,1:12,1,5,0
chr2	68444168	.	A	G,ACG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,29,23;MFRL=158,136,122;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.48,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,2:0.297,0.264:11:0,4,1:4,0,0:4,0,7,0
chr2	68444171	.	C	G,CGCAG	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=0,34,30;MFRL=0,134,158;MMQ=60,60,60;MPOS=13,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.79,7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,4:0.644,0.335:11:0,5,0:0,2,4:0,0,11,0
chr2	68511506	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	68511724	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:68511724_T_A:68511724:0,0,0,1
chr2	68511726	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:68511724_T_A:68511724:0,0,0,1
chr2	68511729	.	AGGTCAGG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:68511724_T_A:68511724:0,0,0,1
chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	68592390	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	68592496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:5,3:1,0:4,2,3,2
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr2	68622952	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=78,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:5,1:3,5:2,7,2,4
chr2	68622990	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:1,1,0,4
chr2	68623036	.	GG	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:68623036_GG_TA:68623036:0,2,0,1
chr2	68623040	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:68623036_GG_TA:68623036:0,2,0,1
chr2	68772301	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:4,2,4,1
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,9:3,2:1,4,2,9
chr2	69046506	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:69046506_A_T:69046506:1,3,0,1
chr2	69046508	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:69046506_A_T:69046506:1,3,0,1
chr2	69053115	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	69053379	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69053379_T_A:69053379:0,0,0,1
chr2	69053382	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69053379_T_A:69053379:0,0,0,1
chr2	69053384	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69053379_T_A:69053379:0,0,0,1
chr2	69173570	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=104,138;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,3:4,3:6,5,3,3
chr2	69177311	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:4,2,3,2
chr2	69179901	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	69179974	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,1,1
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=63,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:1,1,1,6
chr2	69208021	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	69267280	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,2,3
chr2	69298817	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:2,1,3,2
chr2	69302890	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	69330075	.	AAGTCCTTGCAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	69379424	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=119,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:0,0:3,5:0,3,2,4
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:4,1:7,1:3,8,1,2
chr2	69420582	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=64,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.438:3:0,0:2,1:0|1:69420582_C_CTT:69420582:1,1,0,1
chr2	69420590	.	C	CTCTTGTTTTTGGTATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=64,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.438:3:0,0:2,1:0|1:69420582_C_CTT:69420582:1,1,0,1
chr2	69475343	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.212:27:12,4:8,1:6,16,3,2
chr2	69553375	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,16;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr2	69573029	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=118,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,3:8,6:9,4,5,4
chr2	69586370	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,0:6,3:6,4,3,0
chr2	69597051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr2	69614161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	69642513	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr2	69659231	.	A	ATGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69659231_A_ATGT:69659231:0,1,0,1
chr2	69659233	.	T	TACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69659231_A_ATGT:69659231:0,1,0,1
chr2	69659234	.	T	TATATGTGTTATGGAGCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69659231_A_ATGT:69659231:0,1,0,1
chr2	69709774	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=105,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,3:4,0:3,7,0,3
chr2	69710008	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69710008_AT_A:69710008:0,1,0,1
chr2	69710010	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69710008_AT_A:69710008:0,1,0,1
chr2	69710015	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69710008_AT_A:69710008:0,1,0,1
chr2	69723229	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=107,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.447:18:6,4:3,3:3,7,4,4
chr2	69769870	.	CG	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:69769870_CG_GT:69769870:0,2,0,1
chr2	69769873	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:69769870_CG_GT:69769870:0,2,0,1
chr2	69769895	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69769895_A_C:69769895:0,0,0,1
chr2	69769898	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:69769895_A_C:69769895:0,0,0,1
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,2,3
chr2	70033649	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.450:25:8,5:4,6:7,7,3,8
chr2	70037804	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:9,5,2,0
chr2	70039900	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=149,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70039900_C_A:70039900:0,4,0,1
chr2	70039902	.	T	TA,TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,25,28;MFRL=149,103,105;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.296:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr2	70039903	.	T	A,TACAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,21,25;MFRL=149,103,105;MMQ=60,60,60;MPOS=5,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.250,0.296:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr2	70039905	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70039900_C_A:70039900:0,3,0,1
chr2	70046455	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:7,4:5,3:6,7,4,3
chr2	70048016	.	A	AAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70048016_A_AAGC:70048016:0,1,0,1
chr2	70048017	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70048016_A_AAGC:70048016:0,1,0,1
chr2	70048019	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:70048016_A_AAGC:70048016:0,1,0,1
chr2	70066571	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=111,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:2,0:6,3:6,3,2,2
chr2	70068057	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr2	70068226	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:70068226_G_A:70068226:0,0,0,1
chr2	70068232	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70068226_G_A:70068226:0,0,0,1
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	70098808	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	70098899	.	AGTAGTGGAAAACTAATAT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:4,1:4,9,2,0
chr2	70106122	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,113;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:13,2:9,0:0|1:70106122_GA_G:70106122:7,15,1,1
chr2	70106131	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=124,113;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:11,2:11,0:0|1:70106122_GA_G:70106122:7,17,1,1
chr2	70131584	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	70189331	.	GACACACACAC	G,GAC,GACAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,35,18,30;MFRL=102,0,105,111;MMQ=60,48,49,60;MPOS=28,25,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,11,12,13;RU=AC;STR;TLOD=5.30,3.85,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,2:0.189,0.212,0.229:10:2,0,1,1:2,2,0,1:2,2,0,6
chr2	70392793	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr2	70408870	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:70408870_C_T:70408870:6,8,1,1
chr2	70408876	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:70408870_C_T:70408870:7,9,1,1
chr2	70408880	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:70408870_C_T:70408870:6,10,1,1
chr2	70408882	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:70408870_C_T:70408870:6,10,1,1
chr2	70408885	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=99,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,1:0|1:70408870_C_T:70408870:5,10,1,1
chr2	70463168	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	70516363	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=197,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:70516363_C_G:70516363:2,0,1,0
chr2	70516365	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=197,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:70516363_C_G:70516363:2,0,1,0
chr2	70516373	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=187,175;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:70516363_C_G:70516363:2,1,1,0
chr2	70516375	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=175,175;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:70516363_C_G:70516363:3,1,1,0
chr2	70516377	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=175,175;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:70516363_C_G:70516363:3,1,1,0
chr2	70520846	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:1,2,0,6
chr2	70528983	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	70529165	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:70901785_A_G:70901785:1,1,2,1
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:0|1:70901785_A_G:70901785:2,1,2,1
chr2	70915355	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	70931622	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70931622_CA_C:70931622:1,1,0,1
chr2	70931624	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70931622_CA_C:70931622:1,1,0,1
chr2	70931628	.	CTCTCA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:70931622_CA_C:70931622:1,1,0,1
chr2	70931637	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70931622_CA_C:70931622:0,1,0,1
chr2	71004368	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,1:1,11:1,0,12,0
chr2	71004413	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=104,154;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.142:20:2,0:2,1:3,15,0,2
chr2	71036771	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=134,53;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.660:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	71046536	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:3,3:6,3:4,5,2,4
chr2	71047061	.	C	CCCATTGTAGGCCTGCAAAGAAGAAACCAATGGCTCCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=116,69;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.297:7:1,0:2,0:3,3,0,1
chr2	71058184	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	71060212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=91,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr2	71061172	.	A	AAACATTGATCTAGTTTTACATCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=50.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr2	71163096	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=95,19010819;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr2	71187104	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:1,1:2,6:1,2,4,3
chr2	71188119	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=61,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:2,5,1,1
chr2	71190700	.	A	ACTTCATAAACAGTTAGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr2	71191681	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr2	71192263	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	71212380	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=170,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:0,2,3,4
chr2	71212407	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=69,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr2	71215913	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:71215913_A_C:71215913:1,1,0,1
chr2	71215914	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:71215913_A_C:71215913:1,1,0,1
chr2	71216890	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=111,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:8,8,2,0
chr2	71221962	.	A	ACCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=CCG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	71303861	.	G	GATTTGTCAAAATTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:71303861_G_GATTTGTCAAAATTCC:71303861:1,3,1,1
chr2	71303863	.	T	TGTAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:71303861_G_GATTTGTCAAAATTCC:71303861:1,3,1,1
chr2	71303866	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:71303861_G_GATTTGTCAAAATTCC:71303861:1,3,0,1
chr2	71304729	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=126,148;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,0:3,2:4,4,0,2
chr2	71305359	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	71351622	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:4,6,3,0
chr2	71351659	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	71351727	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71351727_A_C:71351727:0,1,0,1
chr2	71351728	.	A	ATTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71351727_A_C:71351727:0,1,0,1
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=92,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:5,2:5,3:4,8,2,3
chr2	71360605	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:22,2:15,2:30,9,4,0
chr2	71360625	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=86,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.362:61:22,12:17,9:25,14,18,4
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0|1:71360723_A_G:71360723:0,0,0,11
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,2:0|1:71360723_A_G:71360723:0,0,0,10
chr2	71361332	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=330,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	71365805	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=106,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,5:4,1:3,5,3,3
chr2	71366876	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=98,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr2	71366957	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=95,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr2	71375065	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,1:2,1:2,1,2,1
chr2	71417134	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=84,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:4,1,5,2
chr2	71429687	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,1:7,4:3,6,2,3
chr2	71591447	.	T	TCTTTCTTTCTTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	71592844	.	TTTAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAA;STR;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,2,3
chr2	71620563	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:2,0:7,2:6,3,1,2
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	71625767	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr2	71645628	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	71645854	.	TGTA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	71645890	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	71651691	.	GT	G,GTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=161,108,120;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=T;STR;TLOD=6.40,22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,12:0.163,0.656:18:2,2,9:1,0,3:3,0,13,2
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	71654450	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=105,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,1:4,3:5,7,1,3
chr2	71660498	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=217,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71660498_C_CA:71660498:0,1,0,1
chr2	71660499	.	C	CCCCCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=217,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71660498_C_CA:71660498:0,1,0,1
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:3,9:6,6:6,3,9,6
chr2	71708151	.	G	GTGGAGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71708151_G_GTGGAGGT:71708151:0,1,0,1
chr2	71708154	.	C	CAGTGAGCCAAGATCATACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71708151_G_GTGGAGGT:71708151:0,1,0,1
chr2	71709131	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr2	71730368	.	A	AAAAAGGAAGCCACCTGGCAATGCCTTGGACCTTAACCTGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,63;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr2	71741077	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71741077_C_T:71741077:1,0,0,1
chr2	71741086	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71741077_C_T:71741077:1,1,0,1
chr2	71741095	.	T	TCACCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	71744238	.	A	ACAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71744238_A_ACAGC:71744238:0,1,0,1
chr2	71744240	.	G	GTATCTCATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71744238_A_ACAGC:71744238:0,1,0,1
chr2	71744241	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71744238_A_ACAGC:71744238:0,1,0,1
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr2	71747432	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	71747455	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71747455_T_G:71747455:0,1,0,1
chr2	71747459	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:71747455_T_G:71747455:0,1,0,1
chr2	71747830	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71747830_C_A:71747830:0,0,0,1
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:71747830_C_A:71747830:0,0,1,1
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	71755380	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	71762232	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,3:0,0,11,6
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr2	71762567	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71762567_C_T:71762567:0,0,0,1
chr2	71762569	.	C	CGTTGTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71762567_C_T:71762567:0,0,0,1
chr2	71778294	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr2	71778328	.	C	CAAATGGCTGAGGTGCAAAGTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=166,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:71778328_C_CAAATGGCTGAGGTGCAAAGTCT:71778328:1,3,0,1
chr2	71778330	.	C	CCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=166,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:71778328_C_CAAATGGCTGAGGTGCAAAGTCT:71778328:1,3,0,1
chr2	71778829	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=96,64;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,3:1,0:0,1,3,1
chr2	71778873	.	G	GAATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:71778873_G_GAATT:71778873:0,0,1,1
chr2	71778874	.	G	GTCTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:71778873_G_GAATT:71778873:0,0,1,1
chr2	71783052	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,3:3,6:4,1,7,2
chr2	71791204	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:8,4,1,1
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	71797890	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:2,0:0,1:0|1:71797890_G_T:71797890:0,3,0,1
chr2	71797893	.	G	GTAAGTGGACATTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:3,0:0,1:0|1:71797890_G_T:71797890:0,3,0,1
chr2	71797897	.	G	GCACTTTCCGGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=144,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71797890_G_T:71797890:0,2,0,1
chr2	71797899	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=144,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:71797890_G_T:71797890:0,2,0,1
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	71838412	.	G	GTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=79,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:3,2:7,0:0|1:71838412_G_GTA:71838412:5,6,1,1
chr2	71838413	.	G	GCAAACA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=79,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:71838412_G_GTA:71838412:5,6,1,1
chr2	71871230	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=71,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:7,0:3,3:0|1:71871230_G_A:71871230:4,6,1,2
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=109,35;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1|0:71871230_G_A:71871230:1,4,1,3
chr2	71886188	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr2	71896059	.	T	TATATATAATAAATATTAATCCTTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	71896390	.	C	CAGGTCTCCCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	71896674	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=75,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr2	72359312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr2	72725617	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=110,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:3,6,3,2
chr2	72741705	.	CAATAAATA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AATA;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	72742083	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=156,144,154;MMQ=60,60,60;MPOS=4,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=AC;STR;TLOD=12.78,17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,7:0.372,0.517:13:0,3,2:0,2,4:1,0,12,0
chr2	72786528	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,3:1,5:5,1,4,4
chr2	72802869	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72802869_G_C:72802869:0,0,0,1
chr2	72802878	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72802869_G_C:72802869:0,0,0,1
chr2	72802882	.	A	ATGCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72802869_G_C:72802869:0,0,0,1
chr2	72802885	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:72802869_G_C:72802869:0,0,0,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	73118572	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=98,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:4,1:4,0:0|1:73118572_T_A:73118572:4,4,1,1
chr2	73118574	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=98,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:73118572_T_A:73118572:4,4,1,1
chr2	73215539	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:0,6,0,4
chr2	73215561	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73215561_A_C:73215561:0,1,0,1
chr2	73215562	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73215561_A_C:73215561:0,1,0,1
chr2	73215565	.	G	GCATGAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:73215561_A_C:73215561:0,1,0,1
chr2	73285721	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:73285721_G_A:73285721:2,4,0,2
chr2	73285728	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:73285721_G_A:73285721:1,4,0,2
chr2	73315239	.	C	CTCTGTGCACATGCACCTCTCTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr2	73339579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	73447736	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:1,1,3,0
chr2	73447775	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	73449126	.	G	GAACTTGGATTTCAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	73449145	.	C	CCTCCAGGGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73449145_C_CCTCCAGGGTG:73449145:0,0,0,1
chr2	73449147	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73449145_C_CCTCCAGGGTG:73449145:0,0,0,1
chr2	73449150	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73449145_C_CCTCCAGGGTG:73449145:0,0,0,1
chr2	73450139	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=91,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:2,2,2,3
chr2	73455600	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=138,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:6,4:2,2:3,5,4,2
chr2	73455747	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,1,2
chr2	73456548	.	A	ATGCCTGCCCACTCCTCGTGTCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGCCTGCCCACTCCTCGTGTCC;STR;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.722:6:1,3:0,1:1,0,4,1
chr2	73460293	.	AGGGCC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	73467676	.	GAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=98,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,1:7,4:3,5,3,3
chr2	73471280	.	C	CTTCG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=146,164;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73471280_C_CTTCG:73471280:0,1,0,1
chr2	73471282	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=146,164;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73471280_C_CTTCG:73471280:0,1,0,1
chr2	73471289	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=146,164;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:73471280_C_CTTCG:73471280:0,1,0,1
chr2	73471296	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73471280_C_CTTCG:73471280:0,0,0,1
chr2	73471653	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr2	73476065	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,2:6,2:3,3,3,1
chr2	73477351	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr2	73478461	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,2:3,1:2,3,1,3
chr2	73486271	.	AC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73486271_AC_CT:73486271:0,0,0,1
chr2	73486276	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73486271_AC_CT:73486271:0,0,0,1
chr2	73490412	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	73492779	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	73493783	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	73495977	.	T	TTTTTAATGGCTAATATTTCATCATGTATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	73518548	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:3,2,3,0
chr2	73649928	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=1779,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	73650122	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	73677875	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=142,126;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:73677875_C_T:73677875:4,2,2,0
chr2	73677898	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=124,126;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:0|1:73677875_C_T:73677875:5,5,2,2
chr2	73679534	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=118,1554;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:0|1:73679534_C_A:73679534:7,13,2,0
chr2	73679537	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=118,1554;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:13,2:0|1:73679534_C_A:73679534:7,13,2,0
chr2	73679785	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:73679785_T_A:73679785:4,5,1,1
chr2	73679787	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:73679785_T_A:73679785:4,5,1,1
chr2	73679789	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:73679785_T_A:73679785:4,5,1,1
chr2	73747130	.	T	TGCTAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTCTTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr2	73828310	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:2,1,3,2
chr2	73828538	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=91,106;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,2:7,5:3,5,3,4
chr2	73868328	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,149;MMQ=60,51;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:3,3,1,1
chr2	73868378	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=143,165;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:2,3,3,0
chr2	73927931	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=115,120;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,3:7,4:7,9,2,5
chr2	73928098	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,1:9,4:3,9,2,3
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	73989875	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:5,7,4,0
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	74072384	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:7,3:7,0:6,9,2,1
chr2	74087290	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=89,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:1,2,0,2
chr2	74089266	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=82,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.414:11:3,0:2,3:0|1:74089266_G_GA:74089266:6,1,3,1
chr2	74089276	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,118;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.161:16:6,2:8,0:1|0:74089266_G_GA:74089266:9,5,1,1
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,2,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,2,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0,1,1,1
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=163,53;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,1,1
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,12337088;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,1,1
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=332,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:6,0,2,1
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.790:7:0,2:1,4:1,0,5,1
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	74184414	.	A	ATCTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:74184414_A_ATCTCC:74184414:0,1,0,1
chr2	74184416	.	C	CCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74184414_A_ATCTCC:74184414:0,1,0,1
chr2	74184417	.	A	AAACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74184414_A_ATCTCC:74184414:0,1,0,1
chr2	74273383	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=87,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.639:11:2,3:2,4:2,2,4,3
chr2	74307778	.	A	AGTTTTTCTTTTATTCTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	74327444	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=91,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74327444_C_T:74327444:1,0,1,0
chr2	74327453	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:74327444_C_T:74327444:1,0,1,1
chr2	74328680	.	A	AATTGAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	74328796	.	C	CAGGGGATTTCAACTCGGCCCTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr2	74328812	.	G	GCAGGTTTGTTGGAC,GGTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31,31;MFRL=189,132,100;MMQ=60,60,60;MPOS=2,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.59,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.353,0.286:3:1,1,1:0,0,0:1,0,0,2
chr2	74328813	.	A	ATTTGAATTAGGAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=132,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr2	74450058	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:6,4,7,5
chr2	74479262	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	74481872	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:74481872_G_T:74481872:1,2,0,1
chr2	74481873	.	A	AAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:74481872_G_T:74481872:1,2,0,1
chr2	74481891	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	74512971	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr2	74590191	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=109,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:1,5,1,1
chr2	74590246	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	74593273	.	C	CTGAGGAGAGATAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,1362;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74593273_C_CTGAGGAGAGATAA:74593273:0,0,1,0
chr2	74593274	.	C	CAGACAGACAACTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,1362;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:74593273_C_CTGAGGAGAGATAA:74593273:0,0,1,0
chr2	74596168	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	74596677	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74596677_T_C:74596677:1,0,0,1
chr2	74596683	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74596677_T_C:74596677:1,0,0,1
chr2	74596692	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=12,30;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:74596677_T_C:74596677:1,0,0,1
chr2	74596708	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74596708_T_C:74596708:1,0,0,1
chr2	74596710	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74596708_T_C:74596708:1,0,0,1
chr2	74597290	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74597290_G_C:74597290:1,0,0,1
chr2	74597292	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74597290_G_C:74597290:1,0,0,1
chr2	74597297	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:74597290_G_C:74597290:2,0,0,1
chr2	74597527	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	74600115	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=145,113;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	74600172	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=55907272,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,0:1,1,0,3
chr2	74601369	.	C	CCGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,16;MFRL=127,187;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:1,0,1,0
chr2	74601370	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=15,23;MFRL=127,187;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:1,0,1,0
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,33;MFRL=187,127;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:1,0,1,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,22;MFRL=93,157;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.602:3:0,1:1,0:0|1:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:1,0,2,0
chr2	74601386	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=102,127;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1|0:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:3,0,1,0
chr2	74601389	.	G	GGCCCCCCCTTCAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,19;MFRL=102,127;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1|0:74601369_C_CCGGGGGG:74601369:3,0,1,0
chr2	74605358	.	G	GACAACTACCATTCTACTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	74641624	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=111,93;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,6:8,5:5,7,5,6
chr2	74642139	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	74649921	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=141,104;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.444:13:1,0:5,5:0|1:74649921_C_A:74649921:5,2,3,3
chr2	74649922	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=104,144;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:0,1:6,5:3,5,5,1
chr2	74649934	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=95,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,9:0.526:17:2,4:6,4:1|0:74649921_C_A:74649921:2,6,7,2
chr2	74652641	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:0|1:74652641_A_AC:74652641:2,2,1,1
chr2	74652644	.	GG	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:0|1:74652641_A_AC:74652641:2,3,1,1
chr2	74657135	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:2,1:7,2:7,2,2,1
chr2	74682512	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=67,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,7:2,2:2,0,7,2
chr2	74686527	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,0:5,3:4,7,2,1
chr2	74686616	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74686616_T_C:74686616:0,1,0,1
chr2	74686618	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74686616_T_C:74686616:0,1,0,1
chr2	74686620	.	A	AAGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=114,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74686616_T_C:74686616:0,1,0,1
chr2	74687258	.	A	ACACATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=164,147;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACATTT;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr2	74687278	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,147;MMQ=60,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr2	74687550	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.434:23:6,5:6,5:3,10,6,4
chr2	74719546	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:1,5,1,1
chr2	74719910	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	74719916	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=158,101;MMQ=60,32;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74719916_G_GA:74719916:0,3,0,1
chr2	74719917	.	G	GATAACTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=158,101;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74719916_G_GA:74719916:0,3,0,1
chr2	74719921	.	A	ATAGGATGAATTTACATATGCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=158,101;MMQ=60,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:74719916_G_GA:74719916:0,3,0,1
chr2	74720002	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	74732415	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=108,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:3,2:1,0:2,4,1,1
chr2	74745790	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74746080	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	74754817	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:74754817_C_CA:74754817:2,0,1,0
chr2	74754818	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:74754817_C_CA:74754817:2,0,1,0
chr2	74756111	.	G	GA,GAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,17,17;MFRL=149,131,113;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.78,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.442,0.337:6:0,1,0:1,0,0:0,1,1,4
chr2	74756176	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,1,2
chr2	74761422	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:4,3,2,2
chr2	74764152	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74764152_CA_TT:74764152:1,0,0,1
chr2	74764156	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74764152_CA_TT:74764152:1,0,0,1
chr2	74776594	.	C	CAGGTGGGGTGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr2	74779823	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74779823_G_GTT:74779823:0,0,0,1
chr2	74779824	.	C	CCAGGGAAATTTCTGTACAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74779823_G_GTT:74779823:0,0,0,1
chr2	74782049	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74782049_A_AG:74782049:0,0,0,1
chr2	74782051	.	A	AGAGCTGGGGGTGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74782049_A_AG:74782049:0,0,0,1
chr2	74783257	.	TGGGGCAGGACAGAAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74783257_TGGGGCAGGACAGAAAG_T:74783257:1,0,0,1
chr2	74783279	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74783257_TGGGGCAGGACAGAAAG_T:74783257:0,0,0,1
chr2	74883779	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=113,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:3,0:5,9,1,1
chr2	74900673	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,2:4,0:0|1:74900673_C_T:74900673:6,7,1,1
chr2	74900686	.	T	TGACCAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,2:4,0:0|1:74900673_C_T:74900673:6,7,1,1
chr2	74901012	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74901012_T_TC:74901012:0,0,0,1
chr2	74901014	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74901012_T_TC:74901012:0,0,0,1
chr2	74901895	.	TCTCCCGCCTTTGGCTGCATGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.342:4:0,1:2,0:1,2,1,0
chr2	75061873	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	75101104	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=85,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,4:0,0,10,8
chr2	75112802	.	A	ATCTCATGCTGTTTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75112802_A_ATCTCATGCTGTTTGC:75112802:0,0,0,1
chr2	75112804	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75112802_A_ATCTCATGCTGTTTGC:75112802:0,0,0,1
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	75113745	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,2:7,1:4,13,2,1
chr2	75116627	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=104,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.617:24:1,5:8,10:5,4,10,5
chr2	75280972	.	G	GTGTACAGATAATATTGTCACCAGGTAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	75347713	.	T	TCTTTTATTTTC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,0:4,2:0|1:75347713_T_TCTTTTATTTTC:75347713:3,5,1,1
chr2	75347717	.	G	GACATC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:75347713_T_TCTTTTATTTTC:75347713:3,5,1,1
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	75720313	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	75745328	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:75745328_T_C:75745328:0,2,0,1
chr2	75745334	.	T	TTTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75745328_T_C:75745328:0,1,0,1
chr2	75745336	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75745328_T_C:75745328:0,1,0,1
chr2	75745338	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75745328_T_C:75745328:0,1,0,1
chr2	75874390	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr2	75879452	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:3,4:3,11:3,5,2,13
chr2	75882256	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:12,4:12,0:11,13,0,4
chr2	75900700	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr2	75915035	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,5:4,5:2,2,6,4
chr2	75919272	.	AATAT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,0,0,1
chr2	75919292	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,0,0,1
chr2	75919294	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,0,0,1
chr2	75919296	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,0,0,1
chr2	75928270	.	ATA	TCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,0,1
chr2	75928300	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,59776386;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	77748893	.	CTGTCAT	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:1,4,1,1
chr2	77748902	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:0,4,1,1
chr2	77748905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:0,3,0,1
chr2	77748909	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:0,2,0,1
chr2	77748914	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:0,2,0,1
chr2	77748917	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,21;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:77748893_CTGTCAT_C:77748893:0,2,0,1
chr2	79253146	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,66777;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	79253229	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=112,63;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,0:4,2:0|1:79253229_C_T:79253229:4,4,1,1
chr2	79253232	.	ATGGCCCTGCCCAGTGTGTCCTGGATGCTG	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=87,63;MMQ=60,38;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:4,0:4,2:0|1:79253229_C_T:79253229:5,9,1,1
chr2	79253252	.	C	CCAATG	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=126,60;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,0:2,3,1,1
chr2	79253263	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=126,63;MMQ=60,38;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.195:13:3,0:6,2:0|1:79253229_C_T:79253229:4,7,1,1
chr2	79255426	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=78,37623764;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,1,1
chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	79350112	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:4,5,1,1
chr2	79350131	.	AGGGAT	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=156,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.235:11:6,2:3,0:0|1:79350131_AGGGAT_A:79350131:2,7,1,1
chr2	79350140	.	ACTGGGACTGGGATAGAGGAAAGGTGAACTCCTCATTAAGGAAATGGATGTTTGGTTTTTGTCCTGAGTCCTAAAGCCAGGAG	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=156,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:3,0:0|1:79350131_AGGGAT_A:79350131:3,10,1,1
chr2	79350186	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr2	79350387	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	79385609	.	AA	GC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:79385609_AA_GC:79385609:2,2,1,1
chr2	79385615	.	AG	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,2:0|1:79385609_AA_GC:79385609:2,3,1,1
chr2	79385919	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:79385919_G_T:79385919:0,2,0,1
chr2	79385921	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:1,0:0|1:79385919_G_T:79385919:0,2,0,1
chr2	79385931	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79385919_G_T:79385919:0,1,0,1
chr2	79878664	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr2	80096938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=84,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr2	80136699	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=116,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:7,4:2,0:6,3,4,0
chr2	80529604	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80529604_G_T:80529604:0,0,0,1
chr2	80529606	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:80529604_G_T:80529604:0,0,0,1
chr2	80646750	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=134,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr2	80646797	.	T	TATTGAATAGGGAGTTGTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	80772232	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:80772232_T_TC:80772232:1,3,0,1
chr2	80772234	.	AGTG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:80772232_T_TC:80772232:1,3,0,1
chr2	80772240	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:80772232_T_TC:80772232:1,3,0,1
chr2	80808817	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr2	80835507	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:80835507_T_C:80835507:0,1,0,1
chr2	80835508	.	T	TGGGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:80835507_T_C:80835507:0,1,0,1
chr2	84670587	.	A	AGGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr2	84676834	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=101,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:18,2:25,1:33,12,2,1
chr2	84744919	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:10,4,3,0
chr2	84755996	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	84771480	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,14,9
chr2	84774476	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:0|1:84774476_A_C:84774476:14,7,1,1
chr2	84774482	.	ACC	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=117,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:84774476_A_C:84774476:14,6,1,1
chr2	84775617	.	G	GCAGAGCAGTGTAAGTTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=817,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:84775617_G_GCAGAGCAGTGTAAGTTTC:84775617:0,2,0,1
chr2	84775620	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=817,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:84775617_G_GCAGAGCAGTGTAAGTTTC:84775617:0,2,0,1
chr2	84775621	.	A	AATACAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=817,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:84775617_G_GCAGAGCAGTGTAAGTTTC:84775617:0,2,0,1
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	84897517	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,14,17
chr2	84908395	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,5128616;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	84913505	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:9,0,2,0
chr2	84915469	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	84924823	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=116,107;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:4,5,3,6
chr2	84955090	.	TTTGAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=140,119;MMQ=55,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0|1:84955090_TTTGAA_T:84955090:0,2,0,1
chr2	84955104	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=163,119;MMQ=49,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:84955090_TTTGAA_T:84955090:0,1,0,1
chr2	85012028	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr2	85023554	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=108,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,1:6,3:1,5,3,1
chr2	85024731	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr2	85041319	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85041319_A_C:85041319:0,0,0,1
chr2	85041321	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85041319_A_C:85041319:0,0,0,1
chr2	85043266	.	CC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,32;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:85043266_CC_GA:85043266:0,1,0,1
chr2	85043269	.	A	ATGGGGGAAAAGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85043266_CC_GA:85043266:0,0,0,1
chr2	85046540	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	85051122	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr2	85066245	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=62,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr2	85133216	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=84,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.533:45:15,12:6,12:12,9,18,6
chr2	85133320	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,0,11
chr2	85510667	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:9,0:4,7,2,0
chr2	85510777	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	85529694	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,10;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,6,2,0
chr2	85529702	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=31,12;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,6,2,0
chr2	85529706	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=27,23;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:4,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,6,2,0
chr2	85529710	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,6,2,0
chr2	85529713	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,21;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,1:5,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,7,2,0
chr2	85529715	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,0:4,0:0|1:85529694_G_C:85529694:0,7,2,0
chr2	85529747	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85529747_G_C:85529747:0,3,0,1
chr2	85529748	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85529747_G_C:85529747:0,3,0,1
chr2	85534950	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	85536621	.	A	ACCGTTACCATTTCATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	85549868	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0|1:85549868_A_G:85549868:0,0,8,7
chr2	85549874	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=108,76;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.371:17:6,4:4,2:0|1:85549868_A_G:85549868:3,8,3,3
chr2	85550124	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:29,0:16,3:14,33,2,1
chr2	85550212	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=214,174;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:85550212_CA_TG:85550212:0,2,0,1
chr2	85550218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=214,174;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:85550212_CA_TG:85550212:0,2,0,1
chr2	85550221	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=214,174;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:85550212_CA_TG:85550212:0,2,0,1
chr2	85554950	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,12:3,5:8,0,14,4
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,144;MMQ=21,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr2	85571352	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,100;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.393:18:7,6:4,0:5,6,5,2
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	85573049	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	85589482	.	G	GTGAATAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85589482_G_GTGAATAA:85589482:0,1,0,1
chr2	85589483	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:85589482_G_GTGAATAA:85589482:0,1,0,1
chr2	85590171	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,14;MFRL=69,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:85590171_G_T:85590171:1,1,1,0
chr2	85590173	.	GG	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,16;MFRL=69,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:85590171_G_T:85590171:1,1,1,0
chr2	85590181	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=84,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:85590171_G_T:85590171:3,1,1,0
chr2	85616769	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	85617579	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=92,51;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,0:3,6:1,3,0,6
chr2	85618138	.	TCAGTGGAGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	85628519	.	C	CTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=104,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	85628556	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:3,0,7,1
chr2	85662052	.	TGGGTGCCG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=117,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:4,1:9,6,1,2
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0|1:85662650_A_G:85662650:1,0,2,1
chr2	85662655	.	CCC	TTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1|0:85662650_A_G:85662650:2,2,1,0
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	85777339	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	85781318	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,22:0,0,23,16
chr2	85788134	.	TG	GC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:85788134_TG_GC:85788134:0,4,0,1
chr2	85788138	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:85788134_TG_GC:85788134:0,4,0,1
chr2	85788141	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:85788134_TG_GC:85788134:0,4,0,1
chr2	85788143	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:85788134_TG_GC:85788134:0,4,0,1
chr2	85788144	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:85788144_G_T:85788144:0,4,0,1
chr2	85788146	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:85788134_TG_GC:85788134:0,4,0,1
chr2	85788151	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:85788144_G_T:85788144:0,3,0,1
chr2	85788175	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	85788402	.	AC	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	85807082	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	85818797	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	85820027	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	85823062	.	T	TGCA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.418:5:3,0:0,2:0|1:85823062_T_TGCA:85823062:0,3,1,1
chr2	85823065	.	T	TCTTTCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0|1:85823062_T_TGCA:85823062:0,3,1,1
chr2	85823066	.	G	GCATT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:85823062_T_TGCA:85823062:0,3,1,1
chr2	85823068	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:85823062_T_TGCA:85823062:0,3,1,1
chr2	85823072	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=151,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:85823062_T_TGCA:85823062:0,3,1,1
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr2	85824256	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:9,2:0|1:85824256_G_T:85824256:6,10,1,1
chr2	85824262	.	C	CGTCTTGGCCTCCTAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:0|1:85824256_G_T:85824256:7,9,1,1
chr2	85824264	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:0|1:85824256_G_T:85824256:7,9,1,1
chr2	85826132	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	85826721	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0|1:85826721_G_A:85826721:0,0,13,8
chr2	85826731	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,0:0|1:85826721_G_A:85826721:7,5,1,1
chr2	85848747	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr2	85863116	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:85863116_GTT_G:85863116:1,0,4,2
chr2	85863119	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:85863116_GTT_G:85863116:1,0,4,2
chr2	85863120	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=123,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0|1:85863116_GTT_G:85863116:1,0,4,2
chr2	85872187	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=100,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr2	85890758	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:85890758_T_C:85890758:0,0,2,2
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:85890758_T_C:85890758:2,0,2,0
chr2	85894373	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=89,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:85894373_C_T:85894373:1,2,0,1
chr2	85894385	.	C	CTGCCGCCTTGTAGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=63,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr2	85894388	.	A	ATTTCCATCTTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=45,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:85894373_C_T:85894373:1,1,0,1
chr2	85922606	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:85922606_G_C:85922606:0,0,0,1
chr2	85922608	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:85922606_G_C:85922606:0,0,0,1
chr2	86014100	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,0:1,1:0|1:86014100_C_CG:86014100:0,2,0,1
chr2	86014101	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:86014101_G_A:86014101:0,2,0,1
chr2	86014102	.	T	TTTGGCTGGGTGAGGGCGGAGGGGAGAG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,0:1,1:0|1:86014100_C_CG:86014100:0,2,0,1
chr2	86014104	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:86014101_G_A:86014101:0,2,0,1
chr2	86014105	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:86014101_G_A:86014101:0,2,0,1
chr2	86014111	.	CCA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:86014111_CCA_C:86014111:0,0,0,2
chr2	86014114	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:86014111_CCA_C:86014111:0,0,0,2
chr2	86090660	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=134,126;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	86090678	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86090678_T_TTG:86090678:0,0,0,1
chr2	86090679	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86090678_T_TTG:86090678:0,0,0,1
chr2	86090682	.	A	ACACT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86090678_T_TTG:86090678:0,0,0,1
chr2	86257434	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,3:2,8,2,1
chr2	86265972	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.117:33:7,0:11,3:0|1:86265972_C_T:86265972:14,16,2,1
chr2	86265978	.	C	CAAATGATAATGGAATCACAACATACCAAA	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=119,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.120:32:12,0:13,3:0|1:86265972_C_T:86265972:13,16,2,1
chr2	86270264	.	T	TATTTGG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:7,2:7,0:7,7,1,1
chr2	86274419	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86274419_T_A:86274419:0,1,0,1
chr2	86274420	.	T	TGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86274419_T_A:86274419:0,1,0,1
chr2	86276458	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86276458_G_GC:86276458:0,1,0,1
chr2	86276461	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86276458_G_GC:86276458:0,1,0,1
chr2	86276465	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:86276458_G_GC:86276458:0,1,0,1
chr2	86281206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=196,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	86281379	.	C	CATTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,1:0|1:86281379_C_CATTT:86281379:1,3,1,1
chr2	86281382	.	GG	CC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:86281379_C_CATTT:86281379:1,3,1,1
chr2	86292633	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:86292633_T_C:86292633:0,3,0,1
chr2	86292636	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:86292633_T_C:86292633:0,3,0,1
chr2	86292641	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:86292633_T_C:86292633:0,3,0,1
chr2	86292645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:86292633_T_C:86292633:0,3,0,1
chr2	86292647	.	A	ATTTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:86292633_T_C:86292633:0,3,0,1
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	86304934	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0|1:86304934_G_A:86304934:0,0,6,0
chr2	86304963	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=93,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.234:11:4,0:5,1:0|1:86304934_G_A:86304934:5,4,2,0
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr2	86334314	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=76,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:7,0:13,3:10,10,1,2
chr2	86334356	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=175,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0|1:86334356_C_T:86334356:2,3,1,1
chr2	86334360	.	GCCTGAAGCAGAATCT	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=163,69;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,0:1,2:0|1:86334356_C_T:86334356:2,4,1,1
chr2	86334378	.	TCCTCAGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=151,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,0:0,1:0|1:86334356_C_T:86334356:0,3,1,1
chr2	86334393	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=141,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:86334356_C_T:86334356:0,2,0,1
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=85.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,5,25
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	86352312	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	86352626	.	A	ATATTTTTATTTGTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=109,44;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,0:1,2:2,3,1,1
chr2	86352825	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	86375012	.	GAAA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86375012_GAAA_G:86375012:0,0,0,1
chr2	86375017	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86375012_GAAA_G:86375012:0,0,0,1
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	86389275	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	86400824	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,6,11
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr2	86439575	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=95,177;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:3,8,3,0
chr2	86440833	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=126,155;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	86491215	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86491215_C_G:86491215:0,1,0,1
chr2	86491220	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86491215_C_G:86491215:0,1,0,1
chr2	86491222	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=110,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86491215_C_G:86491215:0,1,0,1
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.918:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	86684260	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	86694040	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86694040_G_A:86694040:0,0,0,1
chr2	86694049	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86694040_G_A:86694040:0,0,0,1
chr2	86694051	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86694040_G_A:86694040:0,0,0,1
chr2	86694056	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86694040_G_A:86694040:0,0,0,1
chr2	86705426	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=153,146;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:86705426_C_T:86705426:0,4,0,1
chr2	86705430	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=189,146;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:86705426_C_T:86705426:0,3,0,1
chr2	86705431	.	T	TATCACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=189,146;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:86705426_C_T:86705426:0,3,0,1
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr2	86709230	.	GTGTT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTT;STR;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:3,3:9,3:2,10,2,4
chr2	86711336	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr2	86711975	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	86716841	.	ACA	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=128,1517;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86716841_ACA_TGG:86716841:0,1,1,0
chr2	86716846	.	T	TTTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=128,1517;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:86716841_ACA_TGG:86716841:0,1,1,0
chr2	86719151	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr2	86719258	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=129,77;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,0:1,3:1,2,1,2
chr2	86734791	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86734791_C_T:86734791:0,0,0,1
chr2	86734802	.	C	CCATCCTCCCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86734791_C_T:86734791:0,0,0,1
chr2	86737649	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	86769472	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:4,11,1,1
chr2	86832132	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:2,4,2,3
chr2	86947783	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=85.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,7,15
chr2	86998659	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.568:8:3,1:0,3:3,0,5,0
chr2	87015633	.	T	TGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr2	87049358	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.509:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	87072121	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,148;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:3,5,0,2
chr2	87073734	.	G	GTTGCAAGAATTTTAGTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=173,57;MMQ=49,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr2	87073852	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=67,125;MMQ=33,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:1,2,4,3
chr2	87073921	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=97,96;MMQ=57,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,7:4,6:4,1,6,7
chr2	87777552	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=182,116;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr2	87808726	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,141;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:6,1,2,2
chr2	88328021	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=170,795;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.271:14:4,3:5,0:3,8,0,3
chr2	88396029	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	88402760	.	C	CCAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88402760_C_CCAA:88402760:0,0,0,1
chr2	88402761	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88402760_C_CCAA:88402760:0,0,0,1
chr2	88402765	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88402760_C_CCAA:88402760:0,0,0,1
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr2	88474403	.	G	GTGTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0,5,0,1
chr2	88474789	.	GTGCTGCCATTGAGAGTGTTCAAGGGGCAAAGAACATGGACATTATCGTTC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:4,2:2,0:7,10,1,1
chr2	88478545	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=70,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr2	88748390	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	88890400	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:10,6,2,1
chr2	88997926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr2	89034204	.	A	AAAAACCACTCGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	89160002	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:89160002_A_G:89160002:3,0,1,0
chr2	89160007	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:89160002_A_G:89160002:3,0,1,0
chr2	89160020	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:89160020_A_G:89160020:2,1,1,0
chr2	89160029	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89160020_A_G:89160020:3,1,1,0
chr2	89160156	.	C	CCAATTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	89278179	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,69;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:5,0:7,4:6,7,1,3
chr2	89292358	.	AGAGCAGCAG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,77;MMQ=40,22;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:5,2:8,7,1,1
chr2	89292429	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,103;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:89292429_C_A:89292429:0,2,1,0
chr2	89292434	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=132,103;MMQ=60,31;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:89292429_C_A:89292429:0,2,1,0
chr2	89292436	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=132,103;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:89292429_C_A:89292429:0,2,1,0
chr2	89326630	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,66;MMQ=27,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr2	89339927	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,121;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	89417175	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=134,100;MMQ=27,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:89417175_T_A:89417175:2,1,0,1
chr2	89417181	.	AG	GT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=134,100;MMQ=27,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:89417175_T_A:89417175:2,1,0,1
chr2	89417185	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=134,100;MMQ=27,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:89417175_T_A:89417175:2,1,0,1
chr2	89417192	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=137,100;MMQ=34,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89417175_T_A:89417175:3,1,0,1
chr2	89417194	.	A	ATAGG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=137,100;MMQ=34,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89417175_T_A:89417175:3,1,0,1
chr2	89417197	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=137,100;MMQ=34,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:89417175_T_A:89417175:3,1,0,1
chr2	89417199	.	AAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=134,100;MMQ=40,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,1:3,0:0|1:89417175_T_A:89417175:4,1,0,1
chr2	89417287	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=114,704328;MMQ=48,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.169:22:7,0:11,3:12,7,3,0
chr2	89476603	.	AAGGAGCCTCATTGTGAGAAGGTGACCTG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=91,42;MMQ=33,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,0:3,2:4,5,1,1
chr2	89567972	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89567972_T_C:89567972:0,0,1,0
chr2	89567980	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:89567972_T_C:89567972:0,0,1,0
chr2	89976278	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=135,155;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89976278_T_C:89976278:1,0,1,0
chr2	89976281	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=135,155;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89976278_T_C:89976278:1,0,1,0
chr2	89999633	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,185;MMQ=27,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89999633_A_G:89999633:1,3,0,1
chr2	89999637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=124,185;MMQ=27,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:89999633_A_G:89999633:0,3,0,1
chr2	90043523	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,159;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	90121923	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:3,2:3,0:2,4,1,2
chr2	90139237	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90139237_C_T:90139237:0,0,0,1
chr2	90139239	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,145;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90139237_C_T:90139237:0,0,0,1
chr2	90193275	.	CT	TC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=145,72;MMQ=23,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr2	90193281	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,35;MFRL=72,145;MMQ=50,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90193281_A_C:90193281:2,1,0,1
chr2	90193288	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,35;MFRL=72,145;MMQ=50,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90193281_A_C:90193281:2,1,0,1
chr2	90193292	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,28;MFRL=72,145;MMQ=50,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90193281_A_C:90193281:2,1,0,1
chr2	90193298	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=105,145;MMQ=39,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90193281_A_C:90193281:0,2,0,1
chr2	90193319	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=137,145;MMQ=27,23;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90193319_A_C:90193319:0,1,0,1
chr2	90193328	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=137,145;MMQ=27,23;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:90193319_A_C:90193319:0,1,0,1
chr2	90211627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=67012,102;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,1:2,0,1,1
chr2	90211657	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,21;MFRL=186,102;MMQ=25,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90211657_G_C:90211657:0,1,0,1
chr2	90211664	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=186,102;MMQ=25,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90211657_G_C:90211657:0,1,0,1
chr2	90211669	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=186,102;MMQ=25,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:90211657_G_C:90211657:0,1,0,1
chr2	90249269	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=120,149;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,1:0|1:90249269_T_A:90249269:8,2,2,0
chr2	90249273	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=111,149;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:90249269_T_A:90249269:8,3,2,0
chr2	90249290	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=111,127;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:0|1:90249290_A_C:90249290:7,5,3,0
chr2	90249299	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=111,127;MMQ=60,45;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:5,2:0|1:90249290_A_C:90249290:7,4,3,0
chr2	90249415	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=137,123;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:1,8,2,3
chr2	90249468	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=130,152;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,0:0,3:0|1:90249468_C_T:90249468:1,1,0,3
chr2	90249478	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=103,152;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.501:6:2,0:0,3:0|1:90249468_C_T:90249468:1,2,0,3
chr2	95537480	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=105,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:95537480_C_T:95537480:1,1,0,1
chr2	95537486	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:95537480_C_T:95537480:0,1,0,1
chr2	95537490	.	T	TGGCTAATTTTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=209,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:95537480_C_T:95537480:0,1,0,1
chr2	95542415	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,92;MMQ=60,35;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,2:4,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:4,4,2,2
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,92;MMQ=60,35;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,2:3,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:4,4,2,2
chr2	95542534	.	C	CACACG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	95753358	.	TC	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:95753358_TC_GT:95753358:1,1,0,1
chr2	95753363	.	A	AATAAAAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:95753358_TC_GT:95753358:1,1,0,1
chr2	95753365	.	T	TCTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=67,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:95753358_TC_GT:95753358:1,1,0,1
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chr2	95944857	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:1,4:3,6:1,3,3,7
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
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chr2	95951535	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:95951533_T_TTGCTTGAGCCC:95951533:0,1,0,2
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
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chr2	95952389	.	GA	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95952374_GGGACAGTGAA_G:95952374:0,0,0,1
chr2	95963242	.	C	CACTTGAGCCTGTGATGTCCAGGCTGCAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,127642449;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	96259781	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=129,95;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr2	96259911	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96259911_A_T:96259911:0,0,0,1
chr2	96259920	.	C	CTAATTCTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96259911_A_T:96259911:0,0,0,1
chr2	96259924	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96259911_A_T:96259911:0,0,0,1
chr2	96260812	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=121,124;MMQ=45,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,2:3,0:4,7,1,1
chr2	96260894	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=110,80;MMQ=58,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,3:8,0:4,10,3,0
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,34;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	96689084	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,4:4,4:5,4,3,5
chr2	96690640	.	GCCTGGTCCCTC	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=121,148;MMQ=52,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0|1:96690640_GCCTGGTCCCTC_G:96690640:2,3,0,2
chr2	96690655	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=132,148;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0|1:96690640_GCCTGGTCCCTC_G:96690640:1,4,0,2
chr2	96690657	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=127,148;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:96690640_GCCTGGTCCCTC_G:96690640:0,4,0,2
chr2	96692085	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,0:1,2,2,1
chr2	96795857	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr2	96795914	.	G	GCTCCGAGACTTGATGAAGTTGATTTCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,1,1
chr2	96809666	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:10,2:8,8,1,1
chr2	96906392	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0|1:96906392_G_A:96906392:2,4,1,1
chr2	96906393	.	C	CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0|1:96906392_G_A:96906392:2,4,1,1
chr2	96933306	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	96933630	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:0,2:6,0:2,4,0,2
chr2	96935006	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,3:11,0:7,9,3,0
chr2	96943037	.	C	CATTACACACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,34;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:96943037_C_CATTACACACA:96943037:0,1,0,1
chr2	96943040	.	G	GATCCACACTCACCACACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96943037_C_CATTACACACA:96943037:0,1,0,1
chr2	96949182	.	G	GACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	96951133	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	96953794	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=500,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96953794_A_AT:96953794:2,1,0,1
chr2	96953795	.	G	GTTCATCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=500,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96953794_A_AT:96953794:2,1,0,1
chr2	96954530	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=88,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96954530_GTC_G:96954530:0,1,0,1
chr2	96954533	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=88,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:96954530_GTC_G:96954530:0,1,0,1
chr2	96954534	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=88,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:96954530_GTC_G:96954530:0,1,0,1
chr2	96955480	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	96966661	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,5,1
chr2	96991492	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,6,2
chr2	96992792	.	TGAG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:6,2:6,7,1,1
chr2	96993884	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:2,4,4,2
chr2	97020170	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=129,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	97020185	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:97020185_T_C:97020185:0,2,0,1
chr2	97020189	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97020185_T_C:97020185:0,2,0,1
chr2	97217938	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	97268109	.	TGTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97268109_TGTC_T:97268109:0,0,0,1
chr2	97268114	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:97268109_TGTC_T:97268109:0,0,0,1
chr2	97270134	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=85,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr2	97297299	.	ATC	TGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	97315971	.	T	TTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:97315971_T_TTG:97315971:3,6,1,1
chr2	97315974	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:97315971_T_TTG:97315971:3,6,1,1
chr2	97319453	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=135,52;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:7,0:3,3:4,6,1,2
chr2	97328063	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97328063_AG_A:97328063:0,1,0,1
chr2	97328071	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97328063_AG_A:97328063:0,1,0,1
chr2	97328083	.	G	GTGGATCCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97328083_G_GTGGATCCCT:97328083:0,0,0,1
chr2	97328086	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:97328083_G_GTGGATCCCT:97328083:0,0,0,1
chr2	97338970	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,0:3,4:2,7,0,4
chr2	97353460	.	G	GGGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=71,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:1,2,2,1
chr2	97353730	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=19,27;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:97353730_T_A:97353730:2,2,0,1
chr2	97353733	.	G	GGCAGAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:97353730_T_A:97353730:2,2,0,1
chr2	97353736	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=11,32;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:0,1:0|1:97353730_T_A:97353730:1,2,0,1
chr2	97354850	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	97355298	.	ATGGGAACGCTTGGCCAGCAGAAGACGGCCCTAGGGGCTGCTTGGGGAGTTGTGC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=109,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.340:8:0,3:0,0:3,1,3,1
chr2	97358002	.	A	AATGTTTGAGCTCTAGAAGATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	97373095	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:7,5,1,1
chr2	97378973	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,25;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97378973_G_A:97378973:0,1,0,1
chr2	97378975	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97378973_G_A:97378973:0,1,0,1
chr2	97378976	.	G	GTTCATCATCT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97378973_G_A:97378973:0,1,0,1
chr2	97378978	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97378973_G_A:97378973:0,1,0,1
chr2	97378992	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:97378992_C_CA:97378992:0,1,0,1
chr2	97378995	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,26;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97378992_C_CA:97378992:0,1,0,1
chr2	97378996	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97378992_C_CA:97378992:0,1,0,1
chr2	97378997	.	T	TGGAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97378992_C_CA:97378992:0,1,0,1
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	97428219	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	97428232	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97428232_G_GTT:97428232:0,0,0,1
chr2	97428234	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97428232_G_GTT:97428232:0,0,0,1
chr2	97463287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr2	97464971	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=143,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:0,0:0,3,1,1
chr2	97490752	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr2	97506322	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=159,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97506322_C_CTA:97506322:0,1,0,1
chr2	97506324	.	AG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97506322_C_CTA:97506322:0,1,0,1
chr2	97506731	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	97507770	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	97529360	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	97568453	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,10:1,0:2,0,4,6
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
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chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr2	97617199	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=97,61136360;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:12,7,1,1
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=82,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,4:0,7:0,1,5,7
chr2	97637905	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	97749599	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=107,835508;MMQ=59,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:3,5,0,2
chr2	97751457	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,98;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,0:5,4:4,4,2,3
chr2	97757347	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=155,156;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:4,1,2,1
chr2	97779604	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,92;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:15,4:6,0:10,11,4,0
chr2	97783831	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,145;MMQ=32,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,6:2,1:3,1,3,4
chr2	97784177	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=115,124;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,8:4,4:5,8,3,9
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=145,149;MMQ=27,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:0,9:1,5:0,1,14,0
chr2	98128183	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=122,158;MMQ=25,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,7:5,4:8,1,10,1
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=122,142;MMQ=27,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=76.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,10:1,7:2,1,17,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=20,26;MFRL=113,137;MMQ=27,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:6,2:11,6,1,2
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=103,136;MMQ=27,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,2,0,10
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=103,136;MMQ=27,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:2,5:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,2,0,10
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=25,24;MFRL=148,186;MMQ=25,25;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=199,145;MMQ=25,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,0:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,2,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=199,145;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,2,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=142,134;MMQ=25,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,0:3,1,6,0
chr2	98129690	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=24,34;MFRL=150,134;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr2	98129707	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=30,26;MFRL=132,125;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,6:2,4:2,0,10,0
chr2	98129716	.	AC	GT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=108,121;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:2,6:2,6:6,0,15,2
chr2	98129731	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=113,105;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,29:0.769:37:3,15:4,10:6,2,21,8
chr2	98129733	.	AT	CC	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=113,105;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=77.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:3,15:4,14:7,2,21,8
chr2	98129744	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=99,103;MMQ=25,25;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,47:0.717:65:11,25:7,22:11,7,22,25
chr2	98129878	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=149,172;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:98129878_A_AT:98129878:0,7,0,2
chr2	98129879	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=149,172;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0|1:98129878_A_AT:98129878:0,7,0,2
chr2	98129924	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	98164084	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=135,180;MMQ=27,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,3:7,0,6,0
chr2	98164316	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,19;MFRL=175,244;MMQ=48,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:98164316_T_C:98164316:1,1,0,1
chr2	98164326	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=175,244;MMQ=48,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98164316_T_C:98164316:1,1,0,1
chr2	98164328	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=175,244;MMQ=48,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98164316_T_C:98164316:1,1,0,1
chr2	98169742	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=133,98;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:8,6:14,5:12,10,6,5
chr2	98171480	.	T	TAA	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=114,54;MMQ=60,26;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,7:3,6:0|1:98171480_T_TAA:98171480:6,5,12,2
chr2	98171482	.	TCTG	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=114,54;MMQ=60,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,8:4,6:0|1:98171480_T_TAA:98171480:6,5,12,2
chr2	98171488	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=21,26;MFRL=118,54;MMQ=50,26;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:5,8:4,6:0|1:98171480_T_TAA:98171480:5,5,12,2
chr2	98171493	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=114,54;MMQ=50,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:2,8:5,6:0|1:98171480_T_TAA:98171480:5,4,12,2
chr2	98171496	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=81,52;MMQ=49,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,4:7,3:10,5,6,1
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=106,112;MMQ=28,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,5:6,6:8,4,7,4
chr2	98173480	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=122,113;MMQ=24,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	98192743	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=190,162;MMQ=58,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:98192743_A_AAC:98192743:3,0,1,0
chr2	98192749	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=177,162;MMQ=52,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:98192743_A_AAC:98192743:4,0,1,0
chr2	98196849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=154,145;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:0|1:98196849_G_A:98196849:7,0,2,0
chr2	98196859	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=154,114;MMQ=60,38;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:1,2:6,2:0|1:98196849_G_A:98196849:7,0,4,0
chr2	98201528	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,11;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,10:3,0:2,4,0,10
chr2	98206188	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,2:7,6:3,8,2,6
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chr2	98277126	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:4,6,1,4
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chr2	98349678	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:98349678_G_A:98349678:2,1,1,0
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chr2	98349685	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:98349678_G_A:98349678:2,0,1,0
chr2	98349871	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98349871_TG_T:98349871:0,1,0,1
chr2	98349875	.	ATGGAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98349871_TG_T:98349871:0,1,0,1
chr2	98349884	.	GGGGTGCC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:98349871_TG_T:98349871:1,1,0,1
chr2	98349892	.	T	TA,A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=21,27,27;MFRL=145,114,131;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,1,1:1,0,0,2
chr2	98349895	.	G	GTTTTTGA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr2	98349897	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=-11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:98349871_TG_T:98349871:1,1,0,1
chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:4,2,2,1
chr2	98392524	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	98392539	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,5:6,0:6,0,3,2
chr2	98422097	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:9,3:8,9,1,2
chr2	98431845	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98431845_C_A:98431845:0,0,0,1
chr2	98431853	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98431845_C_A:98431845:0,0,0,1
chr2	98435241	.	CC	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98435241_CC_GT:98435241:0,0,0,1
chr2	98435244	.	T	TCAAAGGGAAAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:98435241_CC_GT:98435241:0,0,0,1
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr2	98451036	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:4,0:1,2:5,1,2,0
chr2	98504681	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98504681_TT_CA:98504681:0,1,0,1
chr2	98504684	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:98504681_TT_CA:98504681:0,1,0,1
chr2	98525066	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=100,375;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:16,3,1,1
chr2	98737918	.	G	GAACGTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:98737918_G_GAACGTC:98737918:0,1,0,1
chr2	98737922	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98737918_G_GAACGTC:98737918:0,1,0,1
chr2	98737923	.	T	TGATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98737918_G_GAACGTC:98737918:0,1,0,1
chr2	98737938	.	G	GTGCATGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98797757	.	AGGG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=180,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:98797757_AGGG_A:98797757:0,1,0,1
chr2	98797762	.	AAGG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:98797757_AGGG_A:98797757:0,2,0,1
chr2	98797769	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98797757_AGGG_A:98797757:0,2,0,1
chr2	98797774	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:98797757_AGGG_A:98797757:0,2,0,1
chr2	98810923	.	G	GTGTTAGTGCCATAGCTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr2	98833365	.	C	CCCACTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:98833365_C_CCCACTCAT:98833365:0,1,0,1
chr2	98833367	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98833365_C_CCCACTCAT:98833365:0,1,0,1
chr2	98833371	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98833365_C_CCCACTCAT:98833365:0,1,0,1
chr2	98851017	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	98866980	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98866980_CTT_C:98866980:0,1,0,1
chr2	98866994	.	T	TGAGACGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	98866995	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:98866980_CTT_C:98866980:0,1,0,1
chr2	98887116	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr2	98887427	.	C	CAGAAGCTTGACGATGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31,31;MFRL=145,159,113;MMQ=60,60,60;MPOS=16,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.13,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.296,0.240:13:2,2,0:3,2,2:3,3,3,4
chr2	98928683	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=116,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:4,4,2,0
chr2	98928748	.	TGCC	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=135,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0|1:98928748_TGCC_T:98928748:0,4,1,1
chr2	98928754	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=135,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:98928748_TGCC_T:98928748:0,4,1,1
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chr2	98928778	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=175,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:98928772_AC_A:98928772:1,3,0,1
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chr2	98950072	.	T	TGCACAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:98950066_CT_TA:98950066:0,2,0,1
chr2	98950076	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	99160363	.	G	GAATTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:99160363_G_GAATTT:99160363:3,3,1,1
chr2	99160365	.	G	GTCTAATGTTCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:99160363_G_GAATTT:99160363:3,3,1,1
chr2	99160367	.	G	GGGAAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:0|1:99160363_G_GAATTT:99160363:3,3,1,1
chr2	99172244	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr2	99181315	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:4,4:2,5:4,2,6,4
chr2	99234589	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,0:1,4:2,1,2,2
chr2	99234774	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:99234774_AG_A:99234774:0,4,1,1
chr2	99234777	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0|1:99234774_AG_A:99234774:0,4,1,1
chr2	99242333	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	99256571	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,9:5,3:5,1,8,4
chr2	99438271	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:99438271_G_T:99438271:2,0,1,0
chr2	99438274	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:99438271_G_T:99438271:2,0,1,0
chr2	99443371	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	99681427	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,113;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:12,5:2,0:9,6,5,0
chr2	99685261	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,5:2,0:3,0,5,0
chr2	99695061	.	TAGTTTAACATTTAACATTTCATTTAAACGTTTCTTATAAACCAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=97,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:1,0:2,2,1,1
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,11;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,4,7
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	99859863	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:3,2:1,6:3,1,6,2
chr2	99863338	.	T	TAAGTTAAGCAGGCAGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,2:4,0:0,4,1,1
chr2	99901239	.	C	CAATAATTGAATAAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=157,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr2	99901282	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=136,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,0,2
chr2	99909078	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=71,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:4,1:1,1:2,3,1,2
chr2	99912166	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:5,3:5,10,1,2
chr2	99936265	.	TAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,18;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:4,1:3,1:0,7,1,3
chr2	99939031	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,8,3
chr2	99953959	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.523:15:3,2:4,5:5,2,5,3
chr2	99976813	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,41;MMQ=60,57;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:2,9,1,1
chr2	99980177	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=101,120;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:24,0:21,4:26,20,0,4
chr2	99992784	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	99992822	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	99995458	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=108,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.760:8:0,2:1,3:1,1,5,1
chr2	99995517	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,4:5,2:6,9,3,3
chr2	99998561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr2	100006620	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,8,2
chr2	100006890	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,0:0,1:0,0,0,3
chr2	100010685	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:0,2:4,5:3,1,5,3
chr2	100015124	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	100019496	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,11,11
chr2	100021184	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	100022270	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	100022772	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,9,5
chr2	100029106	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	100079143	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:3,0:0,4,0,2
chr2	100081317	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.501:12:3,0:3,6:0|1:100081317_T_C:100081317:5,1,6,0
chr2	100081323	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0|1:100081317_T_C:100081317:0,0,12,1
chr2	100170678	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	100170714	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=50,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr2	100170730	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=50,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr2	100170985	.	G	GAGCTGGGAATCTGCATTTTATTTATTTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr2	100210064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=83,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr2	100217993	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr2	100247411	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=129,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:100247411_G_T:100247411:6,11,1,1
chr2	100247417	.	AA	CC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=132,67;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:100247411_G_T:100247411:7,10,1,1
chr2	100247420	.	G	GTCTTCAGCCTTA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=132,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,1:0|1:100247411_G_T:100247411:7,10,1,1
chr2	100247494	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,3:6,0:6,9,3,0
chr2	100266204	.	A	ATATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0|1:100266204_A_ATATT:100266204:0,2,0,1
chr2	100266206	.	A	ATTCCCTTATAACTGAACATTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:2,1:0,0:0|1:100266204_A_ATATT:100266204:0,2,0,1
chr2	100454072	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	100623519	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:100623519_G_T:100623519:2,1,0,1
chr2	100623522	.	G	GCCT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100623519_G_T:100623519:2,1,0,1
chr2	100623524	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100623519_G_T:100623519:2,1,0,1
chr2	100623526	.	A	ACCCAGGAGAGGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:100623519_G_T:100623519:2,1,0,1
chr2	100623544	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100623544_T_C:100623544:0,0,0,1
chr2	100623546	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100623544_T_C:100623544:0,0,0,1
chr2	100623772	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr2	100903387	.	G	GTCTAGTCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,0,1
chr2	100903424	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr2	100910859	.	A	AGAAAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,24;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	100910880	.	T	TCAAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100910880_T_TCAAGAGG:100910880:1,0,0,1
chr2	100910882	.	T	TATTTTCTATTTGCTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100910880_T_TCAAGAGG:100910880:1,0,0,1
chr2	100910912	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	100912032	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:100912032_T_C:100912032:0,2,1,1
chr2	100912035	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:100912032_T_C:100912032:0,2,1,1
chr2	100912037	.	TGATA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:100912032_T_C:100912032:0,2,1,1
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=60,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,1:5,3:4,7,3,1
chr2	101023192	.	C	CACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	101086945	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr2	101188373	.	C	CCTGTGTATGAGTGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=105,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.589:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	101437403	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	101437561	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:5,1,1,4
chr2	101437762	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	101521173	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24,31;MFRL=192,122,54;MMQ=60,60,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=T;STR;TLOD=3.58,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.473,0.301:7:1,1,2:0,3,0:1,0,5,1
chr2	101541734	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=102,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,3:12,0:12,11,1,2
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,3,6
chr2	101564628	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr2	101587545	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=120,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,0:3,2:4,7,0,2
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:3,6,2,8
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=114,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:0,3,0,5
chr2	101635369	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:3,2,3,1
chr2	101643985	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	101646185	.	C	CTAATTAGAAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,41;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:3,2:1,0:0|1:101646185_C_CTAATTAGAAG:101646185:0,4,1,1
chr2	101646189	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=107,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:3,2:1,0:0|1:101646185_C_CTAATTAGAAG:101646185:0,4,1,1
chr2	101646192	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=107,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:3,2:1,0:0|1:101646185_C_CTAATTAGAAG:101646185:0,4,1,1
chr2	101648708	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:3,1,1,0
chr2	101648934	.	A	ACGCACAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	101650114	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:9,10,2,0
chr2	101656726	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=108,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,4:6,10:9,2,11,3
chr2	101656749	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.169:21:8,0:10,3:9,9,2,1
chr2	101656899	.	G	GAAAAACTAGGATAGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr2	101670745	.	G	GACTAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:101670745_G_GACTAT:101670745:3,7,1,1
chr2	101670746	.	G	GTTTACCTTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:101670745_G_GACTAT:101670745:3,7,1,1
chr2	101670747	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:101670745_G_GACTAT:101670745:3,7,1,1
chr2	101767705	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=124,74;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:21,0:18,4:18,21,1,3
chr2	101874442	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=103,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:4,5:3,9,2,7
chr2	101881549	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:4,1:6,7,3,1
chr2	101883046	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	101885701	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=92,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:8,6:6,0:8,7,6,0
chr2	101885935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:101885935_C_T:101885935:0,1,0,1
chr2	101885938	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:101885935_C_T:101885935:0,3,0,1
chr2	101885939	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:101885935_C_T:101885935:0,3,0,1
chr2	101911385	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:6,0,6,0
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	102000225	.	C	CACTAAAAATAGAGGCCACAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr2	102014202	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:4,2:2,5,0,2
chr2	102027050	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.400:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr2	102031423	.	C	CACTTATTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031423_C_CACTTATTTTT:102031423:0,0,0,1
chr2	102031426	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031423_C_CACTTATTTTT:102031423:0,0,0,1
chr2	102031489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102038902	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:7,16,0,2
chr2	102083183	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	102314437	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	102440577	.	CGGGGGTGGGGGCGGGGGAAAGAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	102484627	.	A	ATTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr2	102501837	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:102501837_T_C:102501837:0,2,0,1
chr2	102501840	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=145,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:102501837_T_C:102501837:0,2,0,1
chr2	102632579	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=165,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	102632582	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=96,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	102632609	.	GCA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CA;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102641201	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=200,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	102642558	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.638:11:2,4:2,3:2,2,5,2
chr2	102781166	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,29;MFRL=120,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr2	102785156	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,2:4,1:5,11,1,3
chr2	102785158	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.735:21:4,10:2,5:3,3,4,11
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	102791129	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:102791129_C_T:102791129:6,9,1,1
chr2	102791132	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:102791129_C_T:102791129:6,9,1,1
chr2	102818256	.	T	TTTATTTACTTCTCTTGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102818256_T_TTTATTTACTTCTCTTGCC:102818256:0,1,0,1
chr2	102818259	.	A	ATTGCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102818256_T_TTTATTTACTTCTCTTGCC:102818256:0,1,0,1
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr2	102959646	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	102968007	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,9:1,6:1,0,6,10
chr2	102968211	.	CA	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0,0,6,5
chr2	102968356	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:102968356_C_T:102968356:0,0,2,4
chr2	102968362	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:102968356_C_T:102968356:0,0,2,4
chr2	102979251	.	T	TTTCAAGATGCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	103006488	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:103006488_TC_T:103006488:4,0,1,0
chr2	103006491	.	TTTCCTTTTTCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:103006488_TC_T:103006488:4,0,1,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,9:0,0,11,10
chr2	103039686	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:5,0,5,1
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=69.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,11,6
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,11,6
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:0,1,1,4
chr2	103057910	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,17;MFRL=105,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:103057910_C_G:103057910:1,3,0,1
chr2	103057920	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,14;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:103057910_C_G:103057910:0,3,0,1
chr2	103057924	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,17;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:103057910_C_G:103057910:0,3,0,1
chr2	103057926	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,15;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:103057910_C_G:103057910:0,3,0,1
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	103063489	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,3,1
chr2	103067554	.	C	CTACTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103067554_C_CTACTAA:103067554:0,1,0,1
chr2	103067558	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:103067554_C_CTACTAA:103067554:0,1,0,1
chr2	103120086	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr2	103121966	.	G	GGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:103121966_G_GGGC:103121966:0,2,0,1
chr2	103121968	.	T	TCGGTTGCCTCATCTATAAAACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:103121966_G_GGGC:103121966:0,2,0,1
chr2	103121983	.	C	CCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=196,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,4
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,4
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=251,114;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.937:18:0,7:0,10:1,0,5,12
chr2	103136482	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=131,191;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.277:8:2,0:4,1:0,6,1,1
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	103149053	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=70,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:3,6,0,2
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	103281540	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	103318814	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr2	103324575	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	103347606	.	A	AGAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:103347606_A_AGAC:103347606:0,4,0,1
chr2	103347608	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:103347606_A_AGAC:103347606:0,4,0,1
chr2	103347609	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1|0:103347606_A_AGAC:103347606:0,3,0,2
chr2	103347613	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:103347606_A_AGAC:103347606:0,4,0,1
chr2	103348856	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,0:14,2:0|1:103348856_C_T:103348856:13,17,1,1
chr2	103348863	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:15,0:19,2:0|1:103348856_C_T:103348856:12,22,1,1
chr2	103414541	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:103414541_C_G:103414541:0,2,0,1
chr2	103414545	.	CTTCTAGTA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:103414541_C_G:103414541:0,2,0,1
chr2	103414556	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:103414541_C_G:103414541:0,2,0,1
chr2	103414558	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:103414558_T_C:103414558:0,2,0,1
chr2	103414560	.	A	ACTACC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:103414558_T_C:103414558:0,2,0,1
chr2	103431493	.	G	GTGACTGGCTTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:103431493_G_GTGACTGGCTTA:103431493:0,0,0,1
chr2	103431499	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103431493_G_GTGACTGGCTTA:103431493:0,0,0,1
chr2	103431501	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103431493_G_GTGACTGGCTTA:103431493:0,0,0,1
chr2	103431503	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103431493_G_GTGACTGGCTTA:103431493:0,0,0,1
chr2	105654716	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr2	105665534	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	105665581	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=181,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr2	105707849	.	TGAC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,37;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:105707849_TGAC_T:105707849:2,6,1,1
chr2	105707853	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=142,37;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:105707849_TGAC_T:105707849:2,6,1,1
chr2	105860020	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:105860020_A_G:105860020:0,0,0,1
chr2	105860024	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105860020_A_G:105860020:0,0,0,1
chr2	105886036	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	105961788	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:2,4:14,6:10,6,7,3
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr2	106498471	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,0:5,2:0|1:106498471_AG_A:106498471:7,5,1,1
chr2	106498475	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=110,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:5,2:0|1:106498471_AG_A:106498471:7,5,1,1
chr2	106498508	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:106498508_A_G:106498508:4,5,1,1
chr2	106498510	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:106498508_A_G:106498508:4,5,1,1
chr2	106498513	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=114,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:106498508_A_G:106498508:4,5,1,1
chr2	106687269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=132,146;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:106687269_A_G:106687269:1,0,1,0
chr2	106687277	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=132,146;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:106687269_A_G:106687269:1,0,1,0
chr2	106690542	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	106713363	.	C	CTATTCACACCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	106715342	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	106717656	.	G	GTTCTTGTCTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	106742177	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,1:0,8:0,0,7,4
chr2	106781286	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	107032279	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=108,142;MMQ=40,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:4,2:0,2:2,2,3,1
chr2	107040806	.	T	TATGTTATGTTATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,22;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	107423395	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.827:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	107446637	.	G	GATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr2	108443567	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr2	108477968	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=111,147;MMQ=22,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:108477968_G_GGT:108477968:3,0,1,0
chr2	108477972	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=111,147;MMQ=22,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:108477968_G_GGT:108477968:3,0,1,0
chr2	108507268	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr2	108618540	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	108625186	.	T	TTCCACCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr2	108863650	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=110,123;MMQ=60,59;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.669:19:4,11:2,2:4,2,11,2
chr2	108868736	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	108875198	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:1,4:6,5:2,5,3,6
chr2	108910900	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	109065858	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	109069008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:109069008_T_C:109069008:0,0,0,3
chr2	109069027	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:109069008_T_C:109069008:0,2,0,1
chr2	109069031	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109069008_T_C:109069008:0,1,0,1
chr2	109069034	.	GT	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109069008_T_C:109069008:0,1,0,1
chr2	109085373	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	109088108	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=123,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr2	109089404	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	109092121	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,5,17
chr2	109098994	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	109099477	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,538;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	109099711	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:109099711_A_C:109099711:0,2,0,1
chr2	109099718	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:109099711_A_C:109099711:0,3,0,1
chr2	109100746	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,128;MMQ=60,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:20,4:15,0:18,17,4,0
chr2	109103108	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr2	109104243	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,0:9,4:11,7,4,0
chr2	109113659	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=166,157;MMQ=45,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	109123950	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr2	109123988	.	C	CT,CTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31,20;MFRL=118,113,70;MMQ=60,60,53;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=13.00,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,6:0.452,0.298:20:3,3,1:2,5,2:4,1,11,4
chr2	109278823	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=131,135;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:3,4:6,0:0,9,0,4
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	109292979	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr2	109294584	.	C	CTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,187;MMQ=36,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	109300388	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=113,95;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.242:34:18,1:8,6:17,9,0,8
chr2	109371576	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,116;MMQ=24,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:3,7:2,6:2,3,10,3
chr2	109408246	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,220;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:2,3,2,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	109415130	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:109415130_T_G:109415130:0,0,0,1
chr2	109415131	.	A	AAGAACTTCAAAAGCGAGAACG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:109415130_T_G:109415130:0,0,0,1
chr2	109429426	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,107;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.218:11:7,0:2,2:0|1:109429426_C_T:109429426:1,8,1,1
chr2	109429429	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=146,107;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.191:13:9,0:2,0:0|1:109429426_C_T:109429426:1,10,1,1
chr2	109490146	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	109527373	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,7,10
chr2	110322207	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=53,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110322207_G_T:110322207:1,0,0,1
chr2	110322211	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110322207_G_T:110322207:0,0,0,1
chr2	110342992	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:110342992_A_G:110342992:0,1,0,1
chr2	110342994	.	T	TAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110342992_A_G:110342992:0,1,0,1
chr2	110342996	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110342992_A_G:110342992:0,1,0,1
chr2	110375308	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=143,91;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0|1:110375308_AT_A:110375308:4,5,1,1
chr2	110375312	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=143,91;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:110375308_AT_A:110375308:4,5,1,1
chr2	110375318	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=148,91;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:110375308_AT_A:110375308:3,4,1,1
chr2	110375323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=148,91;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:110375308_AT_A:110375308:3,4,1,1
chr2	110375333	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=147,91;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,0:0,3:0,2,1,2
chr2	110375592	.	CAAAAA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=87,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:2,2:0,4:1,13,5,4
chr2	110376288	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,6:7,2:6,4,5,3
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:3,1,2,1
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	110919321	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr2	110922064	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	110959131	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	111399208	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=150,558;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr2	111406968	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.451:5:0,0:1,0:2,1,0,2
chr2	111413438	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,2:7,0:11,10,1,1
chr2	111416381	.	A	ATCACTGGGAATGGTTCAGGCAACGCCATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=174,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,2,1
chr2	111417729	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:111417729_A_C:111417729:0,0,0,2
chr2	111417731	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:111417729_A_C:111417729:0,0,0,2
chr2	111417733	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:111417729_A_C:111417729:0,0,0,1
chr2	111427190	.	ATC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111427193	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111427196	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111427200	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111427204	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111427205	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111427190_ATC_A:111427190:0,1,0,1
chr2	111556523	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	111644491	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	111753449	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,1:2,4:4,1,3,2
chr2	111886332	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:3,10:2,3:2,3,5,8
chr2	111921652	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=924,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111921652_A_C:111921652:0,1,1,0
chr2	111921657	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=924,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.534:3:1,1:0,0:0|1:111921652_A_C:111921652:0,1,1,1
chr2	111921662	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=924,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.534:3:1,1:0,1:0|1:111921652_A_C:111921652:0,1,1,1
chr2	112566724	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,89;MMQ=24,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	112578794	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	112582766	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr2	112583476	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr2	112604685	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,118;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,2:0,11:0,1,10,3
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	112614429	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,105;MMQ=25,31;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:9,5:15,3:9,15,3,5
chr2	112615933	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,96;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,21:0.385:55:18,6:16,14:13,21,11,10
chr2	112616064	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=180,210;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112616064_GC_AT:112616064:0,3,0,1
chr2	112616067	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=180,210;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112616064_GC_AT:112616064:0,3,0,1
chr2	112616069	.	G	GGTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=180,187;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:112616069_G_GGTTC:112616069:0,3,0,1
chr2	112616075	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=187,187;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:112616069_G_GGTTC:112616069:0,2,0,1
chr2	112620260	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=139,2815830;MMQ=60,31;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,1,0,2
chr2	112620264	.	C	CCAAAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=139,2815830;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,1,0,2
chr2	112620268	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=139,2815830;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,1,0,2
chr2	112620270	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,2815830;MMQ=60,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,0,0,2
chr2	112620273	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,23;MFRL=0,2815830;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,0,0,2
chr2	112620275	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,2815830;MMQ=60,31;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:112620260_TC_T:112620260:0,0,0,2
chr2	112621199	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,17,9
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATTTATTTATTTATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=TATT;STR;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=133,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:2,2,2,2
chr2	112704871	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,200;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	112725684	.	A	ATGTGTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TG;STR;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,4:0,0,7,5
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,9,3
chr2	112740596	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0|1:112740596_GA_G:112740596:1,4,0,3
chr2	112740598	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:0|1:112740596_GA_G:112740596:1,4,0,3
chr2	112751928	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr2	112754828	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=170,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr2	112755001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr2	112761643	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,34;MFRL=55,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:112761643_A_C:112761643:0,2,0,1
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	112761655	.	C	CTCTTTTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112761643_A_C:112761643:0,1,0,1
chr2	112767483	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,3:0,1:1,1,4,0
chr2	112776979	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr2	112778067	.	TCTCTTCCTTTTATTCTTTCTTCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=90,189;MMQ=44,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:2,0,1,0
chr2	112780026	.	T	TAACAGCAGTCCCTTTCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0,4,1,1
chr2	112786523	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=106,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.560:9:2,3:1,2:1,3,1,4
chr2	112817675	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.144:23:10,0:10,3:1,19,2,1
chr2	112817679	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:10,3:1,19,2,1
chr2	112832502	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,1:12,1:12,16,0,2
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:6,11:3,6:3,6,8,9
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,3:4,2:6,1,5,0
chr2	112854985	.	A	ATAACTCTGTAAAAAATAGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.669:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:7,8:6,8:9,4,8,8
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	112863521	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	112863618	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:1,3,3,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	112994129	.	ATTCCAATACCTC	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:5,2:9,0:16,5,1,1
chr2	112994219	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=103,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:13,1:0|1:112994219_T_C:112994219:7,15,1,1
chr2	112994224	.	T	TCC	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:14,2:0|1:112994219_T_C:112994219:6,15,1,1
chr2	113057505	.	GA	G	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:22,0:31,2:0|1:113057505_GA_G:113057505:29,27,1,1
chr2	113057511	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=107,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:25,0:32,2:0|1:113057505_GA_G:113057505:31,28,1,1
chr2	113057514	.	A	ATGTG	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=106,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,2:0.048:61:25,0:33,2:0|1:113057505_GA_G:113057505:31,28,1,1
chr2	113057516	.	A	ACAAT	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=106,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:24,0:33,2:0|1:113057505_GA_G:113057505:30,28,1,1
chr2	113069454	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=123,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:8,2:0|1:113069454_A_G:113069454:9,11,1,1
chr2	113069456	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:113069454_A_G:113069454:10,11,1,1
chr2	113074775	.	CT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,24,34,16;MFRL=125,86,130,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,9,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=9.31,6.11,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,7,7,5:0.213,0.252,0.195:28:4,2,5,0:3,3,0,1:7,2,10,9
chr2	113079496	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:0,9,0,3
chr2	113082250	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.579:7:3,4:0,0:1,2,0,4
chr2	113089920	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,5:7,0:11,4,3,2
chr2	113089932	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=107,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:10,5:7,0:12,5,3,2
chr2	113127685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=135,140;MMQ=25,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr2	113127809	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=7;MBQ=20,34;MFRL=124,2514293;MMQ=25,23;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:5,0:5,2:0|1:113127809_G_C:113127809:6,8,0,3
chr2	113127816	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=23,26;MFRL=114,2514293;MMQ=25,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:0|1:113127809_G_C:113127809:4,8,0,3
chr2	113127819	.	A	ACAAC	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=114,2514293;MMQ=25,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:0|1:113127809_G_C:113127809:4,8,0,3
chr2	113127820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=114,2514293;MMQ=25,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,0:6,3:0|1:113127809_G_C:113127809:4,8,0,3
chr2	113127827	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=108,2514293;MMQ=25,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:0|1:113127809_G_C:113127809:3,6,0,3
chr2	113127829	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=108,2514293;MMQ=25,23;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:3,3:0|1:113127809_G_C:113127809:3,6,0,3
chr2	113127831	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=108,2514293;MMQ=25,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0|1:113127809_G_C:113127809:3,5,0,3
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:2,4,1,4
chr2	113307023	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,2:0,1:0,3,1,2
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr2	113326534	.	G	GCCCCCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:113326534_G_GCCCCCT:113326534:0,1,0,1
chr2	113326536	.	A	ATGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=16,25;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:0,1:0|1:113326534_G_GCCCCCT:113326534:0,1,0,1
chr2	113326538	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:113326534_G_GCCCCCT:113326534:0,1,0,1
chr2	113344047	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,2,1
chr2	113344176	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=83,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr2	113346459	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	113417077	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=131,33;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,0:8,2:7,11,1,1
chr2	113418023	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=113,114;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:12,0:19,3:0|1:113418023_C_T:113418023:16,15,0,3
chr2	113418032	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=115,114;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:10,1:20,4:0|1:113418023_C_T:113418023:15,15,1,4
chr2	113479877	.	A	ATTTCACGTTCCCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr2	113481431	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	113481439	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	113481536	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	113482779	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,7,5
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	113513825	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:2,4:1,3:3,0,6,2
chr2	113532871	.	T	TGGTTCTATCTCCAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:2,4,1,1
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.712:5:1,4:0,0:1,0,1,3
chr2	113535770	.	GGTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=GT;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.708:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	113541335	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:14,5,2,0
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	113764400	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	113764411	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	113765432	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr2	113785779	.	ACTG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113785779_ACTG_A:113785779:0,0,0,1
chr2	113785788	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113785779_ACTG_A:113785779:0,0,0,1
chr2	113819696	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr2	113820273	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113820273_A_G:113820273:0,2,0,1
chr2	113820280	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113820273_A_G:113820273:0,2,0,1
chr2	113820303	.	G	GCAGAAGCAGGGGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113820303_G_GCAGAAGCAGGGGCAGA:113820303:0,1,0,1
chr2	113820305	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113820303_G_GCAGAAGCAGGGGCAGA:113820303:0,1,0,1
chr2	113820309	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:113820303_G_GCAGAAGCAGGGGCAGA:113820303:0,1,0,1
chr2	113832064	.	CAGCAGAGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113832064_CAGCAGAGGG_C:113832064:0,0,0,1
chr2	113832077	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113832064_CAGCAGAGGG_C:113832064:0,0,0,1
chr2	113832333	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:0,6:3,2:2,1,4,5
chr2	113887267	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113887267_G_A:113887267:1,1,0,1
chr2	113887274	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:113887267_G_A:113887267:1,1,0,1
chr2	113887277	.	A	ATGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,21;MFRL=101,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:113887267_G_A:113887267:1,2,0,1
chr2	113890304	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=85,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:2,6:5,2:4,3,5,4
chr2	113940834	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.811:14:1,6:1,4:0|1:113940834_C_T:113940834:1,1,5,7
chr2	113940839	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.811:14:1,6:1,5:0|1:113940834_C_T:113940834:1,1,5,7
chr2	113943411	.	TGCCTCCTGCCCTGTGCCC	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=68,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:9,0:0|1:113943411_TGCCTCCTGCCCTGTGCCC_T:113943411:5,7,1,1
chr2	113943453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=98,101;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,2:7,0:0|1:113943411_TGCCTCCTGCCCTGTGCCC_T:113943411:4,8,1,1
chr2	113943470	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=100,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:1,3,1,1
chr2	113951576	.	G	GATATTTGTGGCTTGCATATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=104,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	113953631	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,133;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=134,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:0,2,1,4
chr2	113953984	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=148,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr2	113955233	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,5:1,3:0,2,5,3
chr2	113976265	.	TGA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	114002233	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr2	114257388	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=123,157;MMQ=49,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr2	114258024	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=138,95;MMQ=27,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,2:4,1:1,7,2,2
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,110;MMQ=25,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:6,1,5,1
chr2	114340450	.	AGAG	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=147,130;MMQ=22,22;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,1:5,2:9,1,3,0
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=123,125;MMQ=22,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,3:12,1:16,2,4,0
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=120,144;MMQ=22,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.154:47:21,3:19,3:35,5,6,1
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=116,120;MMQ=40,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,19:0.306:63:23,9:21,10:29,15,13,6
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=110,150;MMQ=40,22;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.231:41:14,5:18,4:16,16,4,5
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=120,120;MMQ=41,28;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:16,3:18,2:17,17,1,4
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=122,156;MMQ=49,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,2:15,1:11,15,0,3
chr2	114399145	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=250,151;MMQ=27,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,3:1,0,1,3
chr2	114476894	.	A	AGTGTTTTCTAGATAACTGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr2	114480855	.	A	AGCTGACTTCAAATTATACTATACAGTTATAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr2	114483038	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.100:58:33,0:20,5:25,28,0,5
chr2	114483212	.	C	CATACATACCAGTTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	114486880	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	114501242	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr2	114504010	.	CAGAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114504010_CAGAA_C:114504010:0,1,0,1
chr2	114504016	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:114504010_CAGAA_C:114504010:0,1,0,1
chr2	114508244	.	A	AATGGATCTAAAATACTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114508244_A_AATGGATCTAAAATACTTTT:114508244:0,1,0,1
chr2	114508246	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114508244_A_AATGGATCTAAAATACTTTT:114508244:0,1,0,1
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.931:27:0,14:1,12:0,1,20,6
chr2	114513554	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,0:2,6:1,3,0,6
chr2	114513933	.	CCCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	114713358	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=172,158;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:114713358_CT_C:114713358:0,4,0,1
chr2	114713363	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=172,158;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:114713358_CT_C:114713358:0,4,0,1
chr2	114713381	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=172,158;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:114713358_CT_C:114713358:0,3,0,1
chr2	114713384	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=172,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:114713358_CT_C:114713358:0,1,0,1
chr2	114713387	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=177,158;MMQ=54,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:114713358_CT_C:114713358:0,2,0,1
chr2	115200258	.	ACAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAG;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,1,1
chr2	115822286	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,5:3,1:5,3,6,0
chr2	116101434	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr2	116283649	.	ATGTCTAGTAACTACCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:1,1:5,0,2,0
chr2	116593695	.	GAT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:1,0,6,1
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	118572471	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,3:2,2:0,2,1,5
chr2	118575215	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.377:43:14,6:13,10:16,11,8,8
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	118693142	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr2	118693157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:118693157_T_C:118693157:2,0,0,1
chr2	118693166	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:118693157_T_C:118693157:1,0,0,1
chr2	118698699	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	118702211	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	118703272	.	A	ACCCACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr2	118704503	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:1,5,1,6
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	118707084	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	118758550	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,1,3
chr2	118764242	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:1,3:1,2:2,0,3,2
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	118860998	.	A	AAACTACAGAGCTGACAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	119700025	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr2	119729034	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,1:4,2:8,4,2,1
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:2,2,3,2
chr2	119732073	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=114,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:5,6,1,1
chr2	119732121	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,2,0
chr2	119735160	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr2	119735165	.	CA	C,CTGCCCCCACCAACTATGTA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,33,33;MFRL=176,92,98;MMQ=60,60,60;MPOS=18,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:3,1,1:0,3,0,2
chr2	119735167	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:119735167_TC_T:119735167:0,4,0,1
chr2	119735172	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=176,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:119735167_TC_T:119735167:0,3,0,1
chr2	119735189	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:119735189_C_CCT:119735189:0,2,0,1
chr2	119735191	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=189,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:119735189_C_CCT:119735189:0,2,0,1
chr2	119735215	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119735215_T_A:119735215:0,0,0,1
chr2	119735217	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119735215_T_A:119735215:0,0,0,1
chr2	119739063	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:3,3,3,0
chr2	119739182	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,1:3,4:5,0,2,3
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=43298947,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	119748135	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.290:12:5,1:3,2:1,8,0,3
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	119915509	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	119988739	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	120020641	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,3:0,2:3,1,5,0
chr2	120069165	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=69,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:4,3,0,3
chr2	120125053	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:0|1:120125053_C_G:120125053:3,0,3,0
chr2	120125058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:120125053_C_G:120125053:3,0,3,0
chr2	120125324	.	A	AAAGACAGTAGATGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	120125384	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	120125406	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	120125689	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr2	120125910	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=114,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	120129841	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr2	120197885	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120197885_G_T:120197885:0,1,0,1
chr2	120197887	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120197885_G_T:120197885:0,1,0,1
chr2	120197894	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120197885_G_T:120197885:0,1,0,1
chr2	120199140	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr2	120223542	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120223542_G_GGA:120223542:0,0,0,1
chr2	120223545	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120223542_G_GGA:120223542:0,0,0,1
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	120236334	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	120252112	.	G	GGTACGTTGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	120366057	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr2	120369387	.	T	TTGAAGACTGTGTCCAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120369387_T_TTGAAGACTGTGTCCAGG:120369387:0,0,0,1
chr2	120369392	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120369387_T_TTGAAGACTGTGTCCAGG:120369387:0,0,0,1
chr2	120373192	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=106,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:13,5,1,1
chr2	120373372	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,1:0|1:120373372_T_C:120373372:0,2,0,1
chr2	120373380	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120373372_T_C:120373372:0,1,0,1
chr2	120373383	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120373372_T_C:120373372:0,1,0,1
chr2	120373385	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:120373372_T_C:120373372:0,1,0,1
chr2	120387637	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,43870458;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	120388529	.	A	AAATATGTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:120388529_A_AAATATGTGC:120388529:0,2,0,1
chr2	120388531	.	T	TTCTCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:120388529_A_AAATATGTGC:120388529:0,2,0,1
chr2	120409616	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,3:0,1:0,6,1,3
chr2	120438515	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,2:6,0:0|1:120438515_G_C:120438515:4,6,0,2
chr2	120438523	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,6:0.792:7:1,3:0,3:1|0:120438515_G_C:120438515:0,1,2,4
chr2	120438838	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr2	120620092	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,6:4,1:0|1:120704164_A_AT:120704164:2,7,3,4
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,6:4,1:0|1:120704164_A_AT:120704164:2,7,3,4
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,7:0,11:0,0,8,12
chr2	120849106	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:7,5,6,0
chr2	120885410	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=90,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,4:7,4:5,6,3,5
chr2	120889173	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr2	120918585	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	121708924	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,0:7,3:1,7,1,2
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,2
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,1
chr2	121726217	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:0,0,1,0
chr2	121726218	.	T	TGGGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:0,0,1,0
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,5,3
chr2	121736235	.	A	ACGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,1,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,1,0
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	121747091	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=136,0;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121747091_A_G:121747091:0,2,1,0
chr2	121747098	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=136,0;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121747091_A_G:121747091:0,2,1,0
chr2	121981950	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr2	121992711	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	121995151	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	121997120	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,3,2
chr2	121997330	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	122006700	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,2,3
chr2	122038736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,1:1,4:0,1,2,3
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	122106311	.	C	CATCCACCCGGAGCAGTGCAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=103,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,0:2,3,1,1
chr2	122139865	.	T	TGTAGGTTGGATTTAATTTGATTTAGAGAAAATAAGGGA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.165:21:10,3:8,0:10,8,2,1
chr2	122139958	.	GA	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	122139970	.	A	AGGGAAGGGCATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,27;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	122139972	.	T	TCTCTG,C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28,32;MFRL=0,172,169;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.92,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.460,0.331:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr2	122162103	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=201,157;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,3,0,1
chr2	122162108	.	TCATAG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=201,172;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	122162110	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=202,157;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,2,0,1
chr2	122162112	.	AG	GC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=203,157;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,1,0,1
chr2	122162117	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=188,157;MMQ=51,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,2,0,1
chr2	122162120	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=203,157;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,1,0,1
chr2	122162123	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,22;MFRL=203,157;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,1,0,1
chr2	122162125	.	CTTGA	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=203,157;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122162103_TG_CA:122162103:0,1,0,1
chr2	122168594	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122168594_T_C:122168594:0,1,0,1
chr2	122168597	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122168594_T_C:122168594:0,1,0,1
chr2	122168603	.	T	TTTTTTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:122168594_T_C:122168594:0,1,0,1
chr2	122184950	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=105,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.384:49:17,7:12,9:22,8,13,6
chr2	122202650	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,0:3,1:0|1:122202650_A_AG:122202650:0,3,0,1
chr2	122202653	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:122202650_A_AG:122202650:0,3,0,1
chr2	122202655	.	A	AGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:122202650_A_AG:122202650:0,3,0,1
chr2	122202656	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:122202650_A_AG:122202650:0,3,0,1
chr2	122209500	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=158,63080943;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	122227590	.	CAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AT;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	122273426	.	A	AGCTTGATATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:122273426_A_AGCTTGATATT:122273426:0,0,0,1
chr2	122273432	.	CA	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122273426_A_AGCTTGATATT:122273426:0,0,0,1
chr2	122283313	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	122485106	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr2	122489374	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr2	122514251	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:9,2:5,0:0|1:122514251_C_T:122514251:1,15,1,2
chr2	122514254	.	CCA	GTG	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,3:6,0:0|1:122514251_C_T:122514251:0,15,1,2
chr2	122514260	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:5,0:0|1:122514251_C_T:122514251:0,13,1,1
chr2	122514378	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122514378_G_A:122514378:0,0,0,1
chr2	122514388	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122514378_G_A:122514378:0,0,0,1
chr2	122516480	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	122520646	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=126,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:22,0:12,4:25,9,4,0
chr2	122522774	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=106,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	122522935	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=112,120;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:2,4,0,3
chr2	124783404	.	T	TGTTAATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=125,91641849;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	125175095	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:7,10,0,2
chr2	125191979	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr2	125672836	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.143:36:14,4:17,0:18,13,2,3
chr2	127453811	.	CAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AG;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:1,3,3,1
chr2	127809786	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	127811525	.	GG	AA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,889;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:6,2:1,0:4,3,1,1
chr2	127816717	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:7,2,1,1
chr2	127821452	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=105,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,1,1
chr2	127828465	.	A	ATCCTCTGCACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	127864546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=155,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,0:0,3:1,0,0,3
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr2	127950904	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,2,0
chr2	127951458	.	GC	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,7:2,3:4,3,5,6
chr2	127961012	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:6,4,2,0
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	128017110	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=289,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128017110_G_T:128017110:0,1,0,1
chr2	128017112	.	CAC	TTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=289,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128017110_G_T:128017110:0,1,0,1
chr2	128017118	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=289,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128017110_G_T:128017110:0,1,0,1
chr2	128018732	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	128029066	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=143,114;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:5,3:2,0:0|1:128029066_A_G:128029066:3,4,0,4
chr2	128029071	.	A	ACGGGTGGTAAGGGATAGATGAGGGATGAAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,37;MFRL=143,114;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:0|1:128029066_A_G:128029066:0,5,0,4
chr2	128029085	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0|1:128029085_A_T:128029085:0,2,0,1
chr2	128029086	.	T	TTGCCAAGACACAGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0|1:128029085_A_T:128029085:0,2,0,1
chr2	128044623	.	A	ACATACACAGGTTTCAAGAAACATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=213,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	128046461	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr2	128079679	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:13,0:6,2:0|1:128079679_C_A:128079679:6,15,1,1
chr2	128079684	.	C	CTTGG	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:4,2:0|1:128079679_C_A:128079679:5,14,1,1
chr2	128079689	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:128079679_C_A:128079679:5,11,1,1
chr2	128079691	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=22,25;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:4,1:0|1:128079679_C_A:128079679:5,10,1,1
chr2	128083220	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128083220_C_T:128083220:0,0,1,0
chr2	128083229	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128083220_C_T:128083220:0,0,1,0
chr2	128083239	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128083220_C_T:128083220:0,0,1,0
chr2	128088070	.	TGGAATTACCAACTAAAAACAAACATAAGGAACCATGCAGCTATCTCACCAGGTCAAGTTCTTCCATGAGCATCTCCACTACTAA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.153:22:5,3:8,2:5,12,2,3
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	128260549	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	128262528	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,3:12,0:12,15,3,0
chr2	128263041	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=109,254;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:7,3,0,2
chr2	128263328	.	T	TTCACAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128263328_T_TTCACAC:128263328:0,1,0,1
chr2	128263329	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128263328_T_TTCACAC:128263328:0,1,0,1
chr2	128263335	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,22;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128263328_T_TTCACAC:128263328:0,1,0,1
chr2	128263338	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128263328_T_TTCACAC:128263328:0,1,0,1
chr2	128331645	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr2	128339456	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	128342270	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128342270_C_T:128342270:0,0,1,0
chr2	128342286	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=157,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:128342270_C_T:128342270:1,0,1,0
chr2	128345960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	128350374	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	128354191	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:128354191_G_GC:128354191:0,2,0,1
chr2	128354195	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:128354191_G_GC:128354191:0,2,0,1
chr2	128354196	.	C	CCCTCCTGGGAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	128354197	.	AG	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:128354191_G_GC:128354191:0,2,0,1
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	128380959	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128380959_C_G:128380959:0,1,0,1
chr2	128380961	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128380959_C_G:128380959:0,1,0,1
chr2	128380963	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128380959_C_G:128380959:0,1,0,1
chr2	128380965	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:128380959_C_G:128380959:0,1,0,1
chr2	128388452	.	ACCCTGGAGGAGTTCTCCTATGAGTTCTTCAGGTGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACCTCCCAGCCCCACCTCACCTCATTGCACC	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.160:31:13,4:7,0:15,10,4,2
chr2	128393705	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,350;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128393705_G_A:128393705:0,0,0,1
chr2	128393718	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,350;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128393705_G_A:128393705:0,0,0,1
chr2	128397599	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=102,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:3,3,3,1
chr2	128397824	.	G	GTCAAAGTTCCCATGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,0:3,3,1,1
chr2	128399756	.	C	CAGTATTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128399756_C_CAGTATTTT:128399756:1,0,0,1
chr2	128399759	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128399756_C_CAGTATTTT:128399756:1,0,0,1
chr2	128407750	.	A	ATGGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	128408627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=86,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:128408627_C_T:128408627:1,2,1,0
chr2	128408637	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,0:1,0:0|1:128408627_C_T:128408627:1,2,1,1
chr2	128408639	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:1,0:1,2:0|1:128408627_C_T:128408627:1,2,1,1
chr2	128410179	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:128410179_T_C:128410179:0,0,0,1
chr2	128410180	.	A	ATTGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:128410179_T_C:128410179:0,0,0,1
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	128431188	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	128461697	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,104;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,2:6,0:7,0,2,0
chr2	128462449	.	CC	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	128462503	.	AACACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=AC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	128464203	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	128467041	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:4,0,2,1
chr2	128467473	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:1,5,0,2
chr2	128474887	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	128477775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	128520547	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	128522189	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:4,11:5,5:4,5,7,9
chr2	128522506	.	C	CCCGCCTTGGCCTCCCA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:128522506_C_CCCGCCTTGGCCTCCCA:128522506:2,4,1,1
chr2	128522508	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:128522506_C_CCCGCCTTGGCCTCCCA:128522506:2,4,1,1
chr2	128525916	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,17;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:128525916_G_T:128525916:0,1,0,1
chr2	128525917	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128525916_G_T:128525916:0,1,0,1
chr2	128525920	.	A	AAAATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,17;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:128525916_G_T:128525916:0,1,0,1
chr2	128525923	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=106,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:128525916_G_T:128525916:0,1,0,1
chr2	128526579	.	T	TTAAATAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TAAA;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	128528266	.	AAAATAAATAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28,26;MFRL=0,144,143;MMQ=60,45,60;MPOS=32,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,7,8;RU=AAAT;STR;TLOD=3.33,11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.286,0.584:4:0,0,1:0,1,2:0,0,4,0
chr2	128608271	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.958:17:0,7:0,6:0|1:128608271_GA_G:128608271:0,0,9,8
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:128608271_GA_G:128608271:0,0,7,8
chr2	128615577	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:2,4,2,2
chr2	128628954	.	A	AGAATACAGCTCTGGAATCTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	128628965	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128628965_G_C:128628965:0,1,0,1
chr2	128628967	.	C	CTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128628965_G_C:128628965:0,1,0,1
chr2	128703092	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr2	128707561	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128707561_T_TCA:128707561:0,4,0,1
chr2	128707562	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128707561_T_TCA:128707561:0,4,0,1
chr2	128707566	.	C	CCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:128707561_T_TCA:128707561:0,4,0,1
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr2	128757439	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	128770710	.	ACAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr2	128774115	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:5,0:5,6,1,1
chr2	128775501	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128775501_A_ACC:128775501:0,1,0,1
chr2	128775502	.	T	TGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128775501_A_ACC:128775501:0,1,0,1
chr2	128849114	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	128861454	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=101,62;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:11,3:6,0:13,4,4,0
chr2	128872595	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	128885016	.	GA	TG	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:128885016_GA_TG:128885016:5,11,0,2
chr2	128885021	.	A	ACACAT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:6,0:0|1:128885016_GA_TG:128885016:5,12,0,2
chr2	128885024	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:128885016_GA_TG:128885016:4,13,0,2
chr2	128885027	.	G	GAAA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:128885016_GA_TG:128885016:3,13,0,2
chr2	128885028	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:128885016_GA_TG:128885016:3,13,0,2
chr2	128910341	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr2	128917271	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,5:5,0:6,6,5,0
chr2	128936000	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	128936171	.	TATG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATG;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr2	128937483	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr2	128939695	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=200,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	128947452	.	T	TTTCATCACTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	130738244	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130738244_GAA_G:130738244:0,0,0,1
chr2	130738247	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=250,151;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:130738244_GAA_G:130738244:0,1,0,1
chr2	130738253	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=250,151;MMQ=40,27;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130738244_GAA_G:130738244:0,1,0,1
chr2	130738698	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=146,146;MMQ=39,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,7,18
chr2	130872658	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	130877752	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=0,143;MMQ=20,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr2	130897055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	130914462	.	A	ATTCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,81;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130914462_A_ATTCAT:130914462:0,0,0,1
chr2	130914464	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,81;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:130914462_A_ATTCAT:130914462:0,0,0,1
chr2	130914875	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,255;MMQ=27,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr2	130918936	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130918936_G_GCCA:130918936:1,0,0,1
chr2	130918937	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130918936_G_GCCA:130918936:1,0,0,1
chr2	130922083	.	A	AACAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130922083_A_AACAT:130922083:0,0,0,1
chr2	130922084	.	G	GGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130922083_A_AACAT:130922083:0,0,0,1
chr2	130922087	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130922083_A_AACAT:130922083:0,0,0,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=102,109;MMQ=52,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr2	130934310	.	G	GTCT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=143,142;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr2	130934311	.	CA	AG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=144,132;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0,5,0,2
chr2	130934316	.	AGCAGCACG	A,AAGCACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,23,24;MFRL=143,135,144;MMQ=57,60,60;MPOS=5,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr2	130934318	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=151,128;MMQ=59,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	130934319	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=151,144;MMQ=59,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,2:5,7:4,4,6,3
chr2	130948250	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=108,71;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,1:16,1:13,9,2,0
chr2	130948303	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=113,100;MMQ=56,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:130948303_T_C:130948303:1,1,0,3
chr2	130948321	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=130,0;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:130948303_T_C:130948303:1,0,0,1
chr2	130951615	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=119,68;MMQ=51,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:4,0:3,2:0|1:130951615_A_C:130951615:7,1,1,1
chr2	130951620	.	G	GCTC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,68;MMQ=51,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:130951615_A_C:130951615:7,1,1,1
chr2	130951621	.	A	ATACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=119,68;MMQ=51,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,1:0|1:130951615_A_C:130951615:7,1,1,1
chr2	131097247	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:3,4:2,4:0|1:131097247_G_A:131097247:5,1,1,7
chr2	131097253	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:0|1:131097247_G_A:131097247:5,1,1,6
chr2	131097420	.	C	CCTTCCTTCCTTTTTTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	131102374	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131102374_A_AGCC:131102374:0,2,0,1
chr2	131102376	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131102374_A_AGCC:131102374:0,2,0,1
chr2	131102378	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131102374_A_AGCC:131102374:0,2,0,1
chr2	131102380	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=205,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:131102374_A_AGCC:131102374:0,2,0,1
chr2	131103611	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:131103611_C_T:131103611:10,3,1,1
chr2	131103627	.	A	ACTGGAGTGCCTGCTGGGGC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,17;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,1:0|1:131103611_C_T:131103611:10,4,1,1
chr2	131103802	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:5,9,1,2
chr2	131103939	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,615;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,1,1
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	131119781	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=135,135;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr2	131119786	.	TT	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=136,99;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0,9,0,2
chr2	131127771	.	A	ATCTTATTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	131221283	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131221283_GTT_G:131221283:0,0,0,1
chr2	131221288	.	TG	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131221283_GTT_G:131221283:0,0,0,1
chr2	131221291	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131221283_GTT_G:131221283:0,0,0,1
chr2	131232617	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr2	131356388	.	C	CTGTGTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,201;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	131403183	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,94;MMQ=48,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	131414061	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,154;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr2	131414073	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=141,146;MMQ=50,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:6,2,7,0
chr2	131486886	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,1,0
chr2	131522114	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131522114_G_A:131522114:1,0,0,1
chr2	131522118	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131522114_G_A:131522114:1,0,0,1
chr2	131524166	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131524166_C_T:131524166:0,0,0,1
chr2	131524171	.	G	GTGATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131524166_C_T:131524166:0,0,0,1
chr2	131673199	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:4,2:13,1:6,11,2,1
chr2	131674753	.	G	GTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:131674753_G_GTC:131674753:1,0,0,1
chr2	131674755	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131674753_G_GTC:131674753:1,0,0,1
chr2	131675066	.	A	AATCTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	131813041	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:0|1:131813041_C_T:131813041:0,11,1,1
chr2	131813049	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:0|1:131813041_C_T:131813041:0,11,1,1
chr2	131813052	.	G	GAGACCA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=128,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:3,2:0|1:131813041_C_T:131813041:0,10,1,1
chr2	131813054	.	G	GAGGTGAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=128,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:131813041_C_T:131813041:0,8,1,1
chr2	131888435	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131888435_C_T:131888435:0,1,0,1
chr2	131888439	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131888435_C_T:131888435:0,1,0,1
chr2	131888443	.	T	TCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131888435_C_T:131888435:0,1,0,1
chr2	131888445	.	TCG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131888435_C_T:131888435:0,1,0,1
chr2	131890649	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131890649_T_TG:131890649:0,1,0,1
chr2	131890650	.	A	AATTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131890649_T_TG:131890649:0,1,0,1
chr2	131890654	.	A	ATAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131890649_T_TG:131890649:0,1,0,1
chr2	131897642	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,13:0,0,13,7
chr2	132238097	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,123;MMQ=52,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:4,2:1,1:0|1:132238097_A_G:132238097:4,1,2,1
chr2	132238100	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,123;MMQ=52,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:132238097_A_G:132238097:4,1,2,1
chr2	132240521	.	C	CTGTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=154,183;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	132290478	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,159;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:6,6,2,0
chr2	132290723	.	GC	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=106,88;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	132290780	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr2	132291005	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:132291005_A_C:132291005:0,3,0,1
chr2	132291007	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:132291005_A_C:132291005:0,3,0,1
chr2	132291069	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=123,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr2	132558367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=62,107;MMQ=57,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	132558426	.	A	AACAGTCCCCAGAGTGTGATGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=131,62;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,1,1
chr2	132919241	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,141;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,0:5,2:5,5,0,2
chr2	133542014	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=85,131;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:3,4,2,5
chr2	133542459	.	G	GATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:133542459_G_GATA:133542459:1,1,0,1
chr2	133542461	.	AGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:133542459_G_GATA:133542459:1,1,0,1
chr2	133636600	.	T	TGCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	133887574	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,2,0
chr2	135076357	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:2,0:1,1:0|1:135076357_C_T:135076357:0,3,0,1
chr2	135076360	.	T	TCTTGGCTATATGGGC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:135076357_C_T:135076357:0,3,0,1
chr2	135076369	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=23,27;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:135076369_TG_T:135076369:0,2,0,1
chr2	135076372	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:135076369_TG_T:135076369:0,3,0,1
chr2	135076374	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135076369_TG_T:135076369:0,1,0,1
chr2	135076378	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,31;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135076369_TG_T:135076369:0,1,0,1
chr2	135076382	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135076382_TG_CA:135076382:0,0,0,1
chr2	135076386	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:135076382_TG_CA:135076382:0,0,0,1
chr2	135093786	.	AGG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:3,2:0|1:135093786_AGG_A:135093786:5,5,1,1
chr2	135093791	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:135093786_AGG_A:135093786:5,5,1,1
chr2	135180516	.	C	CAAGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:6,2:1,0:0|1:135180516_C_CAAGG:135180516:1,6,1,1
chr2	135180517	.	T	TCTAGCTACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:6,2:1,0:0|1:135180516_C_CAAGG:135180516:1,6,1,1
chr2	135186082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	135206277	.	T	TTTCAGTCTTTGGGTATCCATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr2	135625118	.	CCTCT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CT;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr2	135630237	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:5,2:1,0:0|1:135630237_G_GC:135630237:1,5,1,1
chr2	135630240	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=103,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,2:1,0:0|1:135630237_G_GC:135630237:1,5,1,1
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=100,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr2	135700323	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,0:2,1:0|1:135700323_T_G:135700323:0,3,0,1
chr2	135700324	.	TCTAGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:135700323_T_G:135700323:0,3,0,1
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,6:4,7:3,6,5,8
chr2	135711383	.	GGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:135711383_GGGA_G:135711383:0,0,0,1
chr2	135711387	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135711383_GGGA_G:135711383:0,0,0,1
chr2	135711393	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135711383_GGGA_G:135711383:1,0,0,1
chr2	135711395	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135711383_GGGA_G:135711383:1,0,0,1
chr2	135712110	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=92,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:5,13,2,1
chr2	135712273	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	135740958	.	G	GGACATCAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:7,1,4,0
chr2	135870725	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:0,0:0|1:135870725_G_A:135870725:3,4,1,1
chr2	135870727	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=96,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:135870725_G_A:135870725:3,4,1,1
chr2	135884267	.	T	TCTATAGAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	135884304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	135887514	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28,29;MFRL=119,157,152;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.29,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,3:0.149,0.225:16:4,0,2:5,2,1:8,3,5,0
chr2	135922158	.	TCCTAG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:1,2:5,0:0|1:135922158_TCCTAG_T:135922158:4,4,1,1
chr2	135922166	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,34;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:135922158_TCCTAG_T:135922158:4,4,1,1
chr2	135926390	.	G	GCTATCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:135926390_G_GCTATCA:135926390:0,0,1,1
chr2	135926393	.	G	GTCTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:135926390_G_GCTATCA:135926390:0,0,1,1
chr2	136107782	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107784	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107788	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107789	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107791	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,23;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107793	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,21;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107795	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,1,0,1
chr2	136107798	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136107782_TC_T:136107782:0,0,0,1
chr2	136148405	.	A	ATGACTAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:5,3,0,2
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=109,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,5:7,3:5,4,4,4
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:9,3:0,6:4,5,4,5
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr2	136479421	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=206,130;MMQ=54,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:136479421_T_A:136479421:2,0,1,0
chr2	136479426	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=165,130;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:136479421_T_A:136479421:3,0,1,0
chr2	136527443	.	G	GTGAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=113,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGAT;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,3:3,2:1,4,1,4
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	136555525	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	136558157	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:2,3:5,1:4,3,3,1
chr2	136567300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	136594743	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	136614255	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	136615635	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr2	136615661	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:0|1:136615661_A_G:136615661:0,4,0,2
chr2	136615663	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,1:1,0:0|1:136615661_A_G:136615661:0,4,0,2
chr2	136615665	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=134,128;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:136615665_CA_TG:136615665:0,2,0,1
chr2	136615666	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,30;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136615661_A_G:136615661:0,1,0,1
chr2	136615668	.	G	GGTGGAT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=130,136;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:136615661_A_G:136615661:0,2,0,1
chr2	136615669	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=22,25;MFRL=134,128;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:136615665_CA_TG:136615665:0,2,0,1
chr2	136615673	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,30;MFRL=131,128;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:136615665_CA_TG:136615665:0,1,0,1
chr2	136620305	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:0|1:136620305_T_A:136620305:6,9,1,1
chr2	136620312	.	T	TGTTGAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:136620305_T_A:136620305:6,9,1,1
chr2	136620313	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:0|1:136620305_T_A:136620305:6,9,1,1
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	136623650	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr2	136623667	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=147,134;MMQ=60,58;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr2	136665076	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	136672018	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=106,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,3:8,0:10,4,3,0
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	136680282	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	136680534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=243,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr2	136690406	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=147,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:8,2:3,6,1,1
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=10,28;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.559:7:0,1:0,3:0|1:136690414_TA_T:136690414:0,3,1,3
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0|1:136690414_TA_T:136690414:0,3,1,3
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr2	136873016	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,0:11,3:11,9,1,2
chr2	136873868	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=118,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,0:2,1,0,2
chr2	137639957	.	C	CTCCCTCTTCAAAGTGCACAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137639957_C_CTCCCTCTTCAAAGTGCACAGA:137639957:0,1,0,1
chr2	137639964	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137639957_C_CTCCCTCTTCAAAGTGCACAGA:137639957:0,1,0,1
chr2	137639966	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:137639957_C_CTCCCTCTTCAAAGTGCACAGA:137639957:0,1,0,1
chr2	137814804	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr2	137917922	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,0:0,0,4,4
chr2	138000191	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	138033428	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=478,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr2	138169172	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=104,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	138169441	.	TGGTAAGGAGATGGATGGA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:0,1:1,0:0|1:138169441_TGGTAAGGAGATGGATGGA_T:138169441:1,1,0,1
chr2	138169463	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:138169441_TGGTAAGGAGATGGATGGA_T:138169441:1,1,0,1
chr2	138414774	.	TGAG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138414774_TGAG_T:138414774:0,1,0,1
chr2	138414780	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138414774_TGAG_T:138414774:0,1,0,1
chr2	138414786	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138414774_TGAG_T:138414774:0,1,0,1
chr2	138420996	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=74,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.627:22:6,6:2,8:3,5,5,9
chr2	139316627	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=127,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,3:4,5:1,5,3,5
chr2	139316900	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:3,5,4,1
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=107,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.249:19:7,5:3,0:13,1,4,1
chr2	139318372	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.198:43:18,0:15,8:14,21,4,4
chr2	139322639	.	T	TGTTTATTGACCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	139326625	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,55;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:4,3:5,7,1,2
chr2	139429148	.	CG	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	139429286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:1,4:2,3:1,2,5,2
chr2	141026986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=137,65;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:1,5,0,4
chr2	141032160	.	G	GCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:141032160_G_GCT:141032160:1,5,1,1
chr2	141032165	.	C	CCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:141032160_G_GCT:141032160:1,5,1,1
chr2	141032166	.	G	GTAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,2:0|1:141032160_G_GCT:141032160:1,5,1,1
chr2	141079694	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.594:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=97,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr2	141528592	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr2	141571440	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	141625410	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,1,3
chr2	141625630	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr2	141625672	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:11,5,2,0
chr2	141625828	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,9;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.231:20:8,0:7,0:0|1:141625828_G_T:141625828:12,4,0,4
chr2	141625834	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,14;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.270:17:6,0:5,1:0|1:141625828_G_T:141625828:10,3,0,4
chr2	141641587	.	A	ATTTTAACCAGAATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	141643945	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	141660831	.	A	AAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=108519315,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141660831_A_AAAGAG:141660831:0,1,0,1
chr2	141660834	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=108519315,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141660831_A_AAAGAG:141660831:0,1,0,1
chr2	141708066	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	141773484	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:141773484_A_T:141773484:0,1,0,2
chr2	141773485	.	C	CCATCCATCCATCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:141773484_A_T:141773484:0,1,0,2
chr2	141777763	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	141812870	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=140,33358238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:141812870_AA_TT:141812870:0,2,2,0
chr2	141812873	.	A	ATGCTTTCTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=140,33358238;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:141812870_AA_TT:141812870:0,2,2,0
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr2	141987065	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141987065_A_T:141987065:0,1,0,1
chr2	141987068	.	T	TACGTTTAAATATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141987065_A_T:141987065:0,1,0,1
chr2	142012027	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	142012200	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=83,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:6,7,1,1
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	142238169	.	A	ATAGGCTAACTTCAATGTCTCTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	142238190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	143643066	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:7,3:3,0:5,5,1,2
chr2	143676146	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=122,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.306:17:9,0:3,5:11,1,4,1
chr2	143715137	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=206,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,11:0,0,9,4
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,6,13
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	143959863	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=245,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	144007986	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	145147390	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:145147390_CG_C:145147390:4,0,0,1
chr2	145147392	.	CCGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:145147390_CG_C:145147390:4,0,0,1
chr2	145147399	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:145147390_CG_C:145147390:4,0,0,1
chr2	145156331	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=135,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0,5,1,1
chr2	145255210	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	145274908	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:3,4,1,5
chr2	148602718	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,4:12,0:5,16,0,4
chr2	148674797	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr2	148683798	.	CTGCACA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	148684855	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,2:5,0:0|1:148684855_T_A:148684855:1,4,1,1
chr2	148684858	.	G	GGGCCCTCTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=125,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,2:3,0:0|1:148684855_T_A:148684855:1,4,1,1
chr2	148710093	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:7,2:1,7,2,0
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.567:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr2	149226520	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:6,2:6,1:1,11,4,0
chr2	149227043	.	A	AATTCC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:149227043_A_AATTCC:149227043:0,1,0,1
chr2	149227048	.	CGATGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149227043_A_AATTCC:149227043:0,1,0,1
chr2	149227054	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149227043_A_AATTCC:149227043:0,1,0,1
chr2	149227060	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149227043_A_AATTCC:149227043:0,2,0,1
chr2	149227065	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149227043_A_AATTCC:149227043:0,2,0,1
chr2	149227929	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:4,6,1,2
chr2	149240657	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	149246904	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=55,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:149246904_G_T:149246904:0,2,0,1
chr2	149246912	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,14;MFRL=44,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:149246904_G_T:149246904:1,3,0,1
chr2	149449185	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:3,1:5,3:4,4,3,1
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=105,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,2:4,7:5,3,5,4
chr2	149541392	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:149541392_T_TG:149541392:1,2,0,1
chr2	149541394	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:149541392_T_TG:149541392:1,2,0,1
chr2	149541395	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:149541392_T_TG:149541392:1,1,0,1
chr2	149541399	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:149541392_T_TG:149541392:1,2,0,1
chr2	149541402	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:149541392_T_TG:149541392:0,2,0,1
chr2	149639294	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.862:26:1,10:2,13:3,0,20,3
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=238;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=691.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,231:0.975:236:4,92:1,136:5,0,140,91
chr2	149798512	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:4,1,2,5
chr2	149799370	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149799370_A_ATT:149799370:0,1,0,1
chr2	149799372	.	G	GCTCAAAGTTGGACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:149799370_A_ATT:149799370:0,1,0,1
chr2	149862063	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149862063_TAA_T:149862063:0,0,0,1
chr2	149862066	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149862063_TAA_T:149862063:0,0,0,1
chr2	149864678	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149864678_T_C:149864678:0,0,0,1
chr2	149864681	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149864678_T_C:149864678:0,0,0,1
chr2	150064955	.	GT	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:150064955_GT_TG:150064955:1,6,1,1
chr2	150064958	.	A	AAACAACT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:150064955_GT_TG:150064955:1,6,1,1
chr2	150305703	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,2:4,1:1,5,0,3
chr2	150320627	.	TA	T,TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26,25;MFRL=74,102,131;MMQ=60,60,60;MPOS=20,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.59,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,5:0.304,0.445:12:3,2,2:0,2,2:2,1,8,1
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	150432976	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,8,10
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,1,7
chr2	151328284	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,17;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:1,0:0,0:1,0,0,4
chr2	151343317	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	151857764	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	151857799	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	151900441	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151900441_A_C:151900441:0,0,0,1
chr2	151900443	.	A	ACCACTAAAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151900441_A_C:151900441:0,0,0,1
chr2	152107630	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=125,313;MMQ=60,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,6:3,6:4,0,8,4
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	152132204	.	TCAGAAATATGGATGAGAGAAGTGCTTGTGATGAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:0,2:1,0:3,1,1,1
chr2	152138522	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:1,5:9,5:5,5,3,7
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,5:5,6:2,4,3,8
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr2	152273503	.	G	A,GGTGTACCATTTTTTAATCTTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24,32;MFRL=0,200,156;MMQ=60,60,60;MPOS=11,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.34,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr2	152292062	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=132,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,0:2,2:3,3,2,0
chr2	152295141	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=90,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:5,1,4,2
chr2	152300273	.	G	GTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:152300273_G_GTTTT:152300273:0,3,0,2
chr2	152300276	.	A	AATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:152300273_G_GTTTT:152300273:0,4,0,1
chr2	152302851	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:152302851_T_C:152302851:0,0,0,3
chr2	152302853	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:152302851_T_C:152302851:0,0,0,3
chr2	152311570	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.445:21:5,5:4,4:6,6,4,5
chr2	152314375	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:152314375_T_C:152314375:5,3,1,1
chr2	152314377	.	A	AATACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:152314375_T_C:152314375:5,3,1,1
chr2	152314385	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=132,88;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152317821	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=108,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:3,10,0,2
chr2	152318713	.	TATC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=119,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:4,1:5,9,2,0
chr2	152322411	.	GTCTGGCA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:13,0:10,14,1,1
chr2	152330428	.	TTTG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,2:10,1:23,7,2,1
chr2	152350015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:152350015_A_G:152350015:0,2,0,1
chr2	152350017	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:152350015_A_G:152350015:0,2,0,1
chr2	152350018	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,21;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152350015_A_G:152350015:0,2,0,1
chr2	152350021	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152350015_A_G:152350015:0,2,0,1
chr2	152350044	.	G	GGACCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152354940	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	152359276	.	ATTT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:4,0,0,1
chr2	152362734	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:10,1:6,1:6,11,2,0
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr2	152380980	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:6,1,2,1
chr2	152381207	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=148,134;MMQ=50,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:8,2:0,0:0|1:152381207_A_G:152381207:0,8,0,2
chr2	152381209	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,134;MMQ=50,35;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:8,1:0,0:0|1:152381207_A_G:152381207:0,8,0,2
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr2	152382511	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:1,3,2,2
chr2	152385897	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=164,384;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr2	152387553	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:2,2:4,4:3,5,2,4
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=123,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,2:0,3,0,4
chr2	152390847	.	A	AGATTCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=63,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,2:4,0:0|1:152390847_A_AGATTCC:152390847:3,2,1,1
chr2	152390850	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=63,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:152390847_A_AGATTCC:152390847:3,2,1,1
chr2	152390851	.	C	CTTCAGTTTTGGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=63,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:4,0:0|1:152390847_A_AGATTCC:152390847:3,2,1,1
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	152403051	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	152406168	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,6:7,0:12,7,6,0
chr2	152417057	.	G	GGGGAGGAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,0;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	152420265	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=114,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	152422213	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,2,0
chr2	152426885	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152426885_C_G:152426885:0,1,0,1
chr2	152426891	.	CAA	TGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:152426885_C_G:152426885:0,1,0,1
chr2	152427147	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr2	152432886	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,1,4
chr2	152466728	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152472417	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=116,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	152487574	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	152512259	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=89,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,1:1,0:2,2,1,0
chr2	152512276	.	G	GAACAGTGGCCGTCCACACAGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=105,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	152514704	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	152520171	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,105;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:8,7,3,0
chr2	152522556	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	152525471	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	152527752	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr2	152528879	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,101;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:6,0:7,5,0,3
chr2	152531781	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:3,0:7,5:6,4,2,4
chr2	152544069	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=118,62;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.334:10:1,2:6,1:0|1:152544069_A_G:152544069:3,4,2,1
chr2	152544078	.	T	TGCCACTACCATTTCCAGCCTCTGGTATCCTTCTA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,62;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,2:6,1:0|1:152544069_A_G:152544069:5,4,2,1
chr2	152551210	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	152552062	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:4,0,3,1
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=123,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:2,2,7,2
chr2	152580041	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:152580041_C_CTT:152580041:0,1,0,1
chr2	152580042	.	ACG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:152580041_C_CTT:152580041:0,1,0,1
chr2	152580049	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152580041_C_CTT:152580041:0,1,0,1
chr2	152580051	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152580041_C_CTT:152580041:0,1,0,1
chr2	152580057	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:152580041_C_CTT:152580041:0,1,0,1
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=230,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	152684704	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.661:12:1,6:1,2:1,3,4,4
chr2	152729096	.	C	CAAACAAATTACCTTATTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	152737393	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,5:8,5:10,5,7,3
chr2	152955065	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,11;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:152955065_A_C:152955065:0,2,1,0
chr2	152955077	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:152955065_A_C:152955065:0,2,1,0
chr2	152955084	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:152955065_A_C:152955065:0,2,1,0
chr2	152955090	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152955065_A_C:152955065:0,2,1,0
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	153192242	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=125,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:4,2:1,3:1,5,2,3
chr2	153378574	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr2	153399327	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:5,6,2,0
chr2	153415377	.	G	GATTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chr2	153463984	.	TACACAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=AC;STR;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.709:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	153475263	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=106,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,5,3
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:6,2,1,1
chr2	153496514	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=104,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,3:5,0:7,5,2,1
chr2	153496662	.	G	GTGGTGGCTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153496662_G_GTGGTGGCTCA:153496662:0,0,0,1
chr2	153496667	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153496662_G_GTGGTGGCTCA:153496662:0,0,0,1
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,0,2
chr2	153514610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,3:10,1:5,10,1,3
chr2	153526932	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	153530167	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,101;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:12,0:14,11,3,0
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,4,16
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=156,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:5,3:1,0:5,1,1,2
chr2	154800916	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	155098771	.	T	TTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0|1:155098771_T_TTTG:155098771:0,0,0,1
chr2	155098772	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0|1:155098771_T_TTTG:155098771:0,0,0,1
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,4:4,0:2,3,0,4
chr2	155303365	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,6,2
chr2	155711841	.	G	GGAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	155711843	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.772:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	155711848	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	155711850	.	T	TCATCGCCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	155711854	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	155711857	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0|1:155711841_G_GGAA:155711841:0,0,1,1
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	157184929	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,128;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:6,11,0,2
chr2	157186040	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	157406249	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=84,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:2,4:2,6:3,1,5,5
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=89,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:3,2,3,3
chr2	157425521	.	TA	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:2,0:1,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:1,2,0,1
chr2	157425526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:0,2,0,1
chr2	157425530	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:0,2,0,1
chr2	157425532	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:0,2,0,1
chr2	157425537	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:0,2,0,1
chr2	157425540	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:157425521_TA_AG:157425521:0,2,0,1
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	157427837	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:0,1,1,4
chr2	157427850	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	157467106	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	158115129	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:4,4,4,4
chr2	158115979	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=142,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:8,1,1,2
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	158275111	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.696:9:0,3:3,2:0,3,0,6
chr2	158291091	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=151,69;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.336:19:7,5:4,1:12,1,5,1
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=18,24,25;MFRL=54,146,131;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AG;STR;TLOD=6.34,34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,16:0.149,0.726:21:1,1,6:0,2,5:1,1,13,6
chr2	158390343	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	158390590	.	C	CAGGGTGTGGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:158390590_C_CAGGGTGTGGTG:158390590:0,4,0,1
chr2	158390593	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=181,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:158390590_C_CAGGGTGTGGTG:158390590:0,4,0,1
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:3,1,3,3
chr2	158401137	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:2,5,0,5
chr2	158617570	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=113,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr2	158637136	.	GAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.397:7:0,0:1,0:0,4,0,3
chr2	158851887	.	C	CACCACACCACACCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	158958551	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=105,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:5,2,3,1
chr2	158958605	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.590:13:4,5:1,1:2,3,5,3
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr2	159035607	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	159477980	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,0:12,3:11,13,2,1
chr2	159477995	.	TG	CA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=116,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:3,12,1,2
chr2	159478012	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=136,134;MMQ=50,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=104,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:3,1,6,0
chr2	159526461	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:6,5:1,2:3,4,3,4
chr2	159533414	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	159663599	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.928:12:0,9:0,2:0|1:159663599_T_C:159663599:0,0,6,6
chr2	159663601	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=112,145;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:0|1:159663599_T_C:159663599:3,6,2,0
chr2	159682848	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=114,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:0,0:6,3:5,1,0,3
chr2	159683021	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=94,119;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.787:16:0,11:3,2:1,2,6,7
chr2	159954323	.	C	CCCTAACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:159954323_C_CCCTAACA:159954323:0,3,0,1
chr2	159954327	.	AG	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=117,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:159954323_C_CCCTAACA:159954323:0,3,0,1
chr2	160031747	.	ACAGGTGGTCCCCAGAAGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=74,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	160053379	.	C	CAGAAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160053379_C_CAGAAGAAA:160053379:0,0,0,1
chr2	160053380	.	C	CGAATCAAAGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160053379_C_CAGAAGAAA:160053379:0,0,0,1
chr2	160055668	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,19;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:160055668_T_C:160055668:0,1,0,1
chr2	160055672	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160055668_T_C:160055668:0,1,0,1
chr2	160055674	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:160055668_T_C:160055668:0,1,0,1
chr2	160075886	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0,5,1,5
chr2	160082267	.	GAGGA	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:5,0:8,9,1,1
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	160082364	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	160082384	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,14:0,0,14,10
chr2	160128273	.	CCA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=119,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,1:13,0:7,16,0,2
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	160139463	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:2,5,1,2
chr2	160176757	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,3:3,0:10,1,3,0
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,12:0,10:0,0,8,16
chr2	160181365	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:7,3:8,0:6,9,1,2
chr2	160181543	.	TTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TA;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.707:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	160188952	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:160188952_C_T:160188952:2,0,1,0
chr2	160188955	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:160188952_C_T:160188952:2,0,1,0
chr2	160203934	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	160241930	.	A	AAAAGCAGCAGTGAAGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	160243178	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:160243178_T_G:160243178:0,3,0,1
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.604:3:0,2:0,0:1|0:160243178_T_G:160243178:0,1,0,2
chr2	160245844	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,5:5,2:6,2,5,2
chr2	160252392	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:2,4,0,6
chr2	160261425	.	C	CAGCAAAACAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:160261425_C_CAGCAAAACAA:160261425:0,3,1,1
chr2	160261429	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=150,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:160261425_C_CAGCAAAACAA:160261425:0,3,1,1
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	160269142	.	T	TTTAAGGAAGTAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160269142_T_TTTAAGGAAGTAC:160269142:0,0,0,1
chr2	160269149	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160269142_T_TTTAAGGAAGTAC:160269142:0,0,0,1
chr2	160269151	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160269142_T_TTTAAGGAAGTAC:160269142:0,0,0,1
chr2	160285660	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	160289552	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr2	160304741	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=84,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:8,7:7,9:5,10,3,14
chr2	160602258	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:4,0,3,0
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=129,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	160640017	.	G	GTATCTTTGCTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=95,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,4:0,1:0,0,1,6
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr2	160676445	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=107,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.912:10:0,6:1,3:0,1,3,6
chr2	160688351	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	160688397	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	160692117	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=81,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:4,5:2,2:2,5,2,5
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	160708923	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=14,19;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:0,0:0,2,0,5
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:0,0:0,3,0,5
chr2	160711045	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,2:9,8:7,11,3,7
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	160735008	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	160738835	.	A	ATGAAAATCTTACAGTTTGATCCCACAGATCAGCCCTGTCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=140,142;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	160741898	.	T	TGAAATATGTTCCCTTTTAAGACAGGCCCAGTGCACCTAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,2,1
chr2	160742862	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr2	160761082	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	160798548	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=132,59;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,0:6,4:11,7,3,1
chr2	160840359	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	160843623	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,2,1
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	160862353	.	G	GGACAGTTATTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:3,0:0,5,1,1
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:3,0:4,4:1,6,1,3
chr2	160982793	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	161028992	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	161135000	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:2,1,3,0
chr2	161141613	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=116,202;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:2,8,0,2
chr2	161141642	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=26,18;MFRL=171,202;MMQ=58,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,2,0,1
chr2	161141643	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=171,202;MMQ=58,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,2,0,1
chr2	161141646	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,25;MFRL=186,202;MMQ=56,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,1,0,1
chr2	161141650	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,17;MFRL=186,202;MMQ=56,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,1,0,1
chr2	161141655	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,33;MFRL=186,202;MMQ=56,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.508:2:1,0:0,1:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,1,0,1
chr2	161141657	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=186,202;MMQ=56,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,1,0,1
chr2	161141658	.	CTGG	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=186,202;MMQ=56,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161141642_C_CAG:161141642:0,1,0,1
chr2	161141672	.	G	GCAGAAGAA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	161143445	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:161143445_T_C:161143445:0,3,2,0
chr2	161143451	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=90,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0|1:161143445_T_C:161143445:1,5,2,0
chr2	161143456	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=90,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,0:2,0:0|1:161143445_T_C:161143445:1,5,2,0
chr2	161169828	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:1,0:0,3,0,3
chr2	162076160	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,3:10,0:11,2,1,2
chr2	162092071	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:162092071_T_TAC:162092071:0,0,0,1
chr2	162092072	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162092071_T_TAC:162092071:0,0,0,1
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	162276873	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162276873_CA_C:162276873:0,0,0,1
chr2	162276875	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162276873_CA_C:162276873:0,0,0,1
chr2	162276878	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162276873_CA_C:162276873:0,0,0,1
chr2	162276884	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162276873_CA_C:162276873:0,0,0,1
chr2	162276888	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:162276873_CA_C:162276873:0,0,0,1
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:6,2:0,1:1,5,1,3
chr2	162661056	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:7,0:6,10,4,0
chr2	162696285	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,3,1
chr2	162813807	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,1,2
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	162873680	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.121:30:14,3:12,0:9,18,1,2
chr2	162875411	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:162875411_G_GA:162875411:0,1,0,1
chr2	162875412	.	G	GATCTCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:162875411_G_GA:162875411:0,1,0,1
chr2	162875415	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:162875411_G_GA:162875411:0,1,0,1
chr2	162875418	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:162875411_G_GA:162875411:0,1,0,1
chr2	162877028	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,1:7,0,3,0
chr2	162890175	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0,0,2,6
chr2	162890217	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	162890252	.	C	CCCCCTGCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:162890252_C_CCCCCTGCT:162890252:0,2,0,1
chr2	162890254	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:162890252_C_CCCCCTGCT:162890252:0,2,0,1
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,7:0,0,4,9
chr2	162894766	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.433:21:9,6:3,3:8,4,7,2
chr2	162895465	.	ATGACCCACTGGTGACCATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:9,4:3,0:7,8,2,2
chr2	163046224	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:18,3:20,0:15,24,3,0
chr2	163051362	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	163080294	.	CTAGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	163124825	.	G	GATAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	163144923	.	A	AGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=85,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	163167377	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:8,3:0|1:163167377_T_C:163167377:7,7,0,3
chr2	163167380	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,0:6,3:0|1:163167377_T_C:163167377:7,7,0,3
chr2	163167386	.	T	TCATGTATCATCTTGCTCAAC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,37;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:0|1:163167377_T_C:163167377:7,6,0,3
chr2	164468306	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=100,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:3,5,2,0
chr2	164468414	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	165365365	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.310:13:3,2:6,2:2,7,1,3
chr2	165477649	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,25;MFRL=91,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:0|1:165477649_G_A:165477649:0,1,0,1
chr2	165477667	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165477649_G_A:165477649:0,0,0,1
chr2	165550970	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,120;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:5,4,2,0
chr2	165551424	.	A	ATTGTAGTCCTGTCTATAAAGTGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr2	165552403	.	T	TGCTCAGACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165552403_T_TGCTCAGACA:165552403:0,0,0,1
chr2	165552405	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165552403_T_TGCTCAGACA:165552403:0,0,0,1
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	165578593	.	TCTCATCCACG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=123,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:2,0:4,3,2,0
chr2	165579065	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=100,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:2,4,0,5
chr2	165586445	.	TTTTTTCTTATCCAACATTTTTGGC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:5,0:9,2:11,8,1,1
chr2	165586466	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:3,3,5,3
chr2	165586652	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=100,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,2:2,4,1,2
chr2	165586693	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=100,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	165586705	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	165809138	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr2	165947877	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=150,297415;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:165947877_GCT_G:165947877:0,2,0,3
chr2	165947881	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=150,297415;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0|1:165947877_GCT_G:165947877:0,2,0,3
chr2	165947884	.	A	ACACACACAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=150,297415;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,3:0,0:0|1:165947877_GCT_G:165947877:0,2,0,3
chr2	165947885	.	G	GCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=164,297415;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:165947877_GCT_G:165947877:0,1,0,3
chr2	165947887	.	T	TAATC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=164,297415;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:165947877_GCT_G:165947877:0,1,0,3
chr2	165972157	.	ATTGTG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:165972157_ATTGTG_A:165972157:0,4,0,1
chr2	165972163	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:165972157_ATTGTG_A:165972157:0,4,0,1
chr2	165972168	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:165972157_ATTGTG_A:165972157:0,2,0,1
chr2	165972170	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:165972157_ATTGTG_A:165972157:0,2,0,1
chr2	165972179	.	G	GGTGGGGATCACAAGTCAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	165988026	.	A	ACAGCAGCCAGACAAAAAAGGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	165994680	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	165996155	.	C	CTTCCTTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=188,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	166018764	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,1:7,3,5,1
chr2	166019384	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	166020295	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=267641,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:1,3,1,3
chr2	166020893	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=78,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,6:7,8:6,8,9,5
chr2	166026859	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	166032775	.	CATT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=103,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:5,6:0,7:3,2,6,7
chr2	166152407	.	T	TCTGAGTTTCTA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=107,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:9,2,1,1
chr2	166152476	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=99,114;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr2	166221582	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	166231243	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:5,0:4,2:6,5,0,2
chr2	166237768	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr2	166246329	.	A	AAGAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:166246329_A_AAGAGC:166246329:0,1,0,1
chr2	166246333	.	A	AGGCTCTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166246329_A_AAGAGC:166246329:0,1,0,1
chr2	166535918	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=52,113;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,0:2,3:2,0,3,1
chr2	166618262	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr2	166618282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr2	166621630	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr2	166626788	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:5,0:7,4:5,7,2,2
chr2	166626852	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:5,2:0|1:166626852_GCA_G:166626852:8,5,0,2
chr2	166626855	.	T	TGC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:7,2:0|1:166626852_GCA_G:166626852:8,5,0,2
chr2	166731269	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:16,3:22,0:19,19,3,0
chr2	166758447	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.340:10:5,1:0,1:2,5,0,3
chr2	166768062	.	A	AGAAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.802:4:1,3:0,0:0|1:166768062_A_AGAAAAAG:166768062:0,1,2,1
chr2	166768063	.	T	TTCTTCAGCATGCTCTGGCTCATGAAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.802:4:0,1:0,0:0|1:166768062_A_AGAAAAAG:166768062:0,1,2,1
chr2	166771663	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,1:0,4:3,1,4,1
chr2	166781242	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:0,3,2,5
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	166848894	.	A	ATCCGCACGCTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,51;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:2,5,1,1
chr2	166893081	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr2	166894230	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=120,396;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:5,3,2,0
chr2	166895913	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30,25,31;MFRL=93,129,136,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,8,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.46,5.18,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,2:0.225,0.312,0.262:9:0,2,2,0:1,0,0,2:1,1,6,1
chr2	166896143	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.757:10:1,3:1,5:0,2,2,6
chr2	166896172	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:166896172_T_A:166896172:0,3,0,1
chr2	166896175	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:166896172_T_A:166896172:0,3,0,1
chr2	166896177	.	A	AAAAACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:0,1:3,0:0|1:166896172_T_A:166896172:0,3,0,1
chr2	166897794	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:166897794_C_T:166897794:6,1,1,1
chr2	166897796	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:166897794_C_T:166897794:6,1,1,1
chr2	166897801	.	C	CCCTGCAAAATCGCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,0:2,2:0|1:166897794_C_T:166897794:5,1,1,1
chr2	166897989	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	166901667	.	ATCTTTCTCTTCCCCACCAGACTGCTCTTTCTGTTTTCTTTTCTTCCTCCGATTTCT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=147,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:166901667_ATCTTTCTCTTCCCCACCAGACTGCTCTTTCTGTTTTCTTTTCTTCCTCCGATTTCT_A:166901667:1,3,0,1
chr2	166901679	.	CCCACCAGACTGCTCT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=115,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.509:2:1,0:0,1:1|0:166901667_ATCTTTCTCTTCCCCACCAGACTGCTCTTTCTGTTTTCTTTTCTTCCTCCGATTTCT_A:166901667:0,1,0,1
chr2	166901897	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	166903179	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:166903179_T_A:166903179:0,0,1,0
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:166903179_T_A:166903179:0,0,1,0
chr2	166903228	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=75,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	166904062	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	166904346	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	166905375	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=86,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:2,5:8,5:5,6,6,4
chr2	166905480	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=93,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,2:4,2:2,4,2,2
chr2	166905558	.	A	ATAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	166908418	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:9,7,1,1
chr2	166909544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:3,3,2,2
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	167082978	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	167090042	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	167108386	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=134,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,0,3
chr2	167133479	.	ATCT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=121,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:6,5,6,1
chr2	167138411	.	T	TAAGAAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	167142786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr2	167142979	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=95,84;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:3,2:6,3:3,6,2,4
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr2	167149923	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:167149923_G_T:167149923:0,2,0,1
chr2	167149932	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:167149923_G_T:167149923:0,1,0,1
chr2	167149940	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:167149923_G_T:167149923:0,1,0,1
chr2	167149971	.	TT	AG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167149971_TT_AG:167149971:0,0,0,1
chr2	167149973	.	CTAT	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167149971_TT_AG:167149971:0,0,0,1
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	167163199	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	167273115	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	167289012	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=101,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:3,3,4,5
chr2	167289315	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	167313313	.	AATATATATATATAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=146,191;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,6;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr2	167327064	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.406:5:2,1:1,0:3,0,1,1
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	167330869	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=121,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr2	167760451	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=228,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:5,1,2,4
chr2	168098509	.	G	GATGTTTGAAACAAGGCCATTGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=204,1491;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr2	168106367	.	ATC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=157,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:168106367_ATC_A:168106367:3,3,1,1
chr2	168106370	.	AGGGACCATCAATGATTGGTC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:5,0:0|1:168106367_ATC_A:168106367:5,3,1,1
chr2	168114436	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:3,3,1,1
chr2	168115461	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=177,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr2	168116204	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:168116204_T_A:168116204:7,8,1,1
chr2	168116209	.	C	CAA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=138,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:5,2:0|1:168116204_T_A:168116204:5,9,1,1
chr2	168116210	.	TTC	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:168116204_T_A:168116204:4,8,1,1
chr2	168116214	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:168116204_T_A:168116204:4,8,1,1
chr2	168116218	.	A	AGCAGTCTCAT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=148,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:168116204_T_A:168116204:4,8,1,1
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr2	168996751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr2	169547670	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169547670_G_A:169547670:0,1,0,1
chr2	169547673	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169547670_G_A:169547670:0,1,0,1
chr2	169547676	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,21;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:169547670_G_A:169547670:0,1,0,1
chr2	169547679	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169547670_G_A:169547670:0,1,0,1
chr2	169574553	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:169574553_C_CT:169574553:0,2,0,1
chr2	169574554	.	C	CAGTGTGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:169574553_C_CT:169574553:0,2,0,1
chr2	169574557	.	T	TTCTCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:169574553_C_CT:169574553:0,2,0,1
chr2	169574561	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=175,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:169574553_C_CT:169574553:0,2,0,1
chr2	169622221	.	T	TGG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=145,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:11,2:5,0:0|1:169622221_T_TGG:169622221:9,8,1,1
chr2	169622225	.	GAAA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:169622221_T_TGG:169622221:9,9,1,1
chr2	169622229	.	A	ACTTTCATTTGGTTT	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:169622221_T_TGG:169622221:9,10,1,1
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTG;STR;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.450:17:7,5:2,3:0,9,1,7
chr2	169690729	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=312,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,1:1,4:1,1,2,3
chr2	169728069	.	GAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,1:0,3:0,1,1,7
chr2	169759129	.	A	AAGTGAAAAGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169759129_A_AAGTGAAAAGC:169759129:0,0,0,1
chr2	169759131	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169759129_A_AAGTGAAAAGC:169759129:0,0,0,1
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	169764524	.	GTGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:2,1,0,1
chr2	169764546	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=-15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	169764616	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=99,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.561:6:3,1:0,2:1,2,1,2
chr2	169780202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=129,415;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:3,7,0,2
chr2	169780251	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=139,58;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:5,0:10,3,1,1
chr2	169780264	.	G	GAGTGGGCTTTCCCCTGTGCCTGCCAGCATGCCT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=131,58;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:169780264_G_GAGTGGGCTTTCCCCTGTGCCTGCCAGCATGCCT:169780264:11,5,1,1
chr2	169780266	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=131,58;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:5,0:0|1:169780264_G_GAGTGGGCTTTCCCCTGTGCCTGCCAGCATGCCT:169780264:11,5,1,1
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr2	169791794	.	C	CTGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,8:0,0,6,6
chr2	169814655	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	169814698	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169814698_A_G:169814698:0,0,0,1
chr2	169814703	.	T	TCTGTTCAATTATTTCACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169814698_A_G:169814698:0,0,0,1
chr2	169824983	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=122,412;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr2	169826732	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:169826732_G_A:169826732:0,4,1,1
chr2	169826737	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:169826732_G_A:169826732:0,4,1,1
chr2	169826749	.	A	AAACCCG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:169826749_A_AAACCCG:169826749:0,2,0,1
chr2	169826750	.	T	TTACAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:169826749_A_AAACCCG:169826749:0,2,0,1
chr2	169826753	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:169826749_A_AAACCCG:169826749:0,2,0,1
chr2	169828325	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:5,1:6,2,3,2
chr2	169830155	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	169850344	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:9,3:4,0:5,8,1,2
chr2	169852084	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=152,136710760;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:169852084_T_A:169852084:0,1,0,1
chr2	169852092	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=152,136710760;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:169852084_T_A:169852084:0,1,0,1
chr2	169869774	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	169985258	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:6,10,1,1
chr2	169989046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:169989046_C_T:169989046:4,2,1,1
chr2	169989052	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:2,0:2,3:0|1:169989046_C_T:169989046:4,2,2,1
chr2	169989197	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:2,5,3,1
chr2	169994021	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=0,143;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr2	169994067	.	T	TCAGCCTAAAGTCCTGTAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=148,137;MMQ=60,53;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	170002419	.	T	TGGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,1:10,1:0|1:170002419_T_TGGA:170002419:4,9,0,2
chr2	170002421	.	T	TGCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,1:10,1:0|1:170002419_T_TGGA:170002419:4,9,0,2
chr2	170010933	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=138,1991;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:8,2,2,0
chr2	170010985	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,5:5,2:2,4,2,5
chr2	170013914	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,1:10,2:12,6,1,2
chr2	170019166	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:170019166_T_TA:170019166:0,1,0,1
chr2	170019169	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:170019166_T_TA:170019166:0,1,0,1
chr2	170033077	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr2	170038881	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	170038901	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170038901_C_T:170038901:0,0,0,1
chr2	170038902	.	C	CTTGCATGATGGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170038901_C_T:170038901:0,0,0,1
chr2	170050187	.	T	TTAGCTTTTATTTTTTAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	170055255	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	170059190	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=46,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	170062201	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	170062728	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:170062728_AGC_A:170062728:0,2,0,2
chr2	170062731	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:170062728_AGC_A:170062728:0,2,0,1
chr2	170062733	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:170062728_AGC_A:170062728:0,2,0,1
chr2	170062735	.	A	AATCATTAATGGAGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	170062737	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:170062728_AGC_A:170062728:0,2,0,1
chr2	170062739	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:1,0:0|1:170062728_AGC_A:170062728:0,2,0,1
chr2	170063836	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:170063836_A_AG:170063836:0,2,0,1
chr2	170063838	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:170063836_A_AG:170063836:0,2,0,1
chr2	170063842	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170063836_A_AG:170063836:0,1,0,1
chr2	170077170	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	170081889	.	AG	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=137,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	170093792	.	A	ACCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:170093792_A_ACCCC:170093792:0,2,0,1
chr2	170093793	.	A	ATCAACCTCCCACCTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:170093792_A_ACCCC:170093792:0,2,0,1
chr2	170103351	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,5:6,4:5,8,5,4
chr2	170104093	.	A	ACATATTACAGATATTTATGGGGGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	170112823	.	C	CTTTAGAGTTGCTTTTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	170115537	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:1,1:8,5,0,2
chr2	170129528	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	170131833	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	170134459	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=118,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:170134459_T_C:170134459:1,3,0,1
chr2	170134463	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=118,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:170134459_T_C:170134459:1,3,0,1
chr2	170134467	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=118,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:170134459_T_C:170134459:1,3,0,1
chr2	170134470	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0|1:170134459_T_C:170134459:0,1,0,2
chr2	170134474	.	A	AACCC,AAAAACCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,22,24;MFRL=118,168,185;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.284,0.283:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr2	170145700	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170145700_A_C:170145700:0,1,0,1
chr2	170145701	.	CAAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170145700_A_C:170145700:0,1,0,1
chr2	170145708	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170145700_A_C:170145700:0,1,0,1
chr2	170163768	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170344242	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,539;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:9,1,0,2
chr2	170355944	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	170386535	.	C	CAGTAGAGGTTCACAGGCTATCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	170387960	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=106,61;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:6,9,1,1
chr2	170393925	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	170393950	.	A	AGTGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=151,170;MMQ=55,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	170394487	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr2	170425787	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=114,127;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:8,0:5,4:0|1:170425787_C_T:170425787:3,10,0,4
chr2	170425793	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=114,127;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:6,4:0|1:170425787_C_T:170425787:3,10,0,4
chr2	170428127	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr2	170463551	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	170488332	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=142,128;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:8,2:0|1:170488332_G_A:170488332:8,10,1,1
chr2	170488334	.	C	CCATCCATCCATCCATCCTTGCACT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,128;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:170488332_G_A:170488332:8,10,1,1
chr2	170507124	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170507124_G_T:170507124:0,0,0,1
chr2	170507131	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:170507124_G_T:170507124:0,0,0,1
chr2	170605981	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr2	170632960	.	C	CA,CAA	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=18,30,20;MFRL=59,124,109;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=20.59,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,13,6:0.617,0.271:21:0,7,6:0,5,0:0,2,11,8
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,9:0,0,13,16
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,4:0,0,2,10
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	170677855	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=127,92;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.629:6:0,1:1,3:0|1:170677855_G_GT:170677855:0,2,0,4
chr2	170677865	.	T	TTGAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=92,127;MMQ=51,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.370:6:1,0:3,2:1|0:170677855_G_GT:170677855:0,4,0,2
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,3,3
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=126,147;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.857:7:0,1:0,5:1,0,5,1
chr2	170871895	.	T	TTTTGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=115,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	170871973	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170871973_G_A:170871973:0,0,0,1
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170871973_G_A:170871973:0,0,0,1
chr2	170917983	.	CTT	C,CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34,32;MFRL=0,160,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=6.43,11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.378,0.546:10:0,1,4:0,3,1:0,0,1,9
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	171071369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	171074008	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	171092445	.	AG	GA,GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28,33;MFRL=0,125,129;MMQ=60,60,60;MPOS=5,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.17,22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.244,0.676:9:0,2,6:0,0,1:0,0,7,2
chr2	171192074	.	G	GACGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171192074_G_GACGTGC:171192074:0,1,0,1
chr2	171192076	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171192074_G_GACGTGC:171192074:0,1,0,1
chr2	171239598	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=129,19;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:0|1:171239598_C_T:171239598:7,3,5,0
chr2	171239604	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=128,19;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:6,0:2,5:0|1:171239598_C_T:171239598:5,3,5,0
chr2	171247960	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,13:4,0:9,0,13,0
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	171319811	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	171356274	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,14:0,4:0,0,8,10
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	171508103	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=107,144;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr2	171693455	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	171702480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,10,5
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr2	171786239	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.514:43:6,10:14,12:12,9,12,10
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	171850543	.	G	GTAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171850543_G_GTAC:171850543:0,0,0,1
chr2	171850545	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171850543_G_GTAC:171850543:0,0,0,1
chr2	171863669	.	A	AGAATTAATACACTGTCTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=119,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	171879648	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:12,2:3,0:8,7,2,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	171906469	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:4,2:3,4:5,2,3,3
chr2	171911713	.	CAA	CAAA,C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=18,24,20;MFRL=0,123,97;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,19,16;RU=A;STR;TLOD=8.19,6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,3:0.540,0.188:13:0,2,1:1,3,1:0,3,1,9
chr2	171911738	.	ACAAAACAGATTTCT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:1,0:10,2:1,12,0,2
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:2,6:3,1:4,1,6,1
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	172182292	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr2	172188429	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr2	172305175	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:2,2:0|1:172305175_C_CT:172305175:4,1,3,1
chr2	172305177	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.503:10:2,2:2,2:0|1:172305175_C_CT:172305175:4,1,4,1
chr2	172333295	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr2	172336541	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:8,1:2,7:6,6,4,4
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,0,0,2
chr2	172378893	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:172378889_C_G:172378889:0,0,0,1
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,8:0,4:0,0,9,5
chr2	172398365	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:172398365_T_A:172398365:0,2,0,1
chr2	172398372	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:172398365_T_A:172398365:0,1,0,1
chr2	172398374	.	TT	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:172398365_T_A:172398365:0,1,0,1
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,4:9,7:10,8,9,3
chr2	172549312	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:17,2:0|1:172549312_C_T:172549312:13,13,1,1
chr2	172549315	.	C	CTGATATGTAACTAGATTGTCCTG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,0:16,2:0|1:172549312_C_T:172549312:12,13,1,1
chr2	172563877	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=112,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,2:10,1:9,14,2,1
chr2	172563922	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=125,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr2	172582108	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.226:25:7,1:8,3:12,7,0,6
chr2	172582112	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=77,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.217:23:4,2:13,3:5,13,4,1
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=19,26;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:0,3:0,1,3,3
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:3,1,5,0
chr2	172604438	.	G	GAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,152;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	172642057	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=81,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr2	172644214	.	C	CTTGGGAGGCGAAGGTGGGTGGGGACGTCGGGCGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:172644214_C_CTTGGGAGGCGAAGGTGGGTGGGGACGTCGGGCGAG:172644214:0,0,0,1
chr2	172644217	.	AT	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:172644214_C_CTTGGGAGGCGAAGGTGGGTGGGGACGTCGGGCGAG:172644214:0,0,0,1
chr2	172683461	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,91;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.235:13:5,1:5,1:1,9,1,2
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr2	172809571	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=66,157;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:172809571_AT_A:172809571:1,1,0,1
chr2	172809575	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=66,157;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:172809571_AT_A:172809571:1,1,0,1
chr2	172809578	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=66,157;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:172809571_AT_A:172809571:1,1,0,1
chr2	172809579	.	T	TAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=66,157;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:172809571_AT_A:172809571:1,1,0,1
chr2	172848077	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,0:1,2:6,1,2,0
chr2	172935715	.	G	GGAGGAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,2:6,0:6,6,1,1
chr2	172937086	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:9,0:14,7,3,0
chr2	172965678	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=94,78;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,2,0
chr2	172967302	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	173292709	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:8,2:1,6:0|1:173292709_A_G:173292709:3,7,2,6
chr2	173292713	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,2:2,6:0|1:173292709_A_G:173292709:3,7,2,6
chr2	173292728	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:3,7:3,5,2,6
chr2	173332115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	173333840	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	173334161	.	T	TATGATTTAGTACC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	173335600	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	173344474	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:1,4,2,4
chr2	173352571	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:173352571_T_G:173352571:3,0,0,1
chr2	173352573	.	C	CACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:173352571_T_G:173352571:3,0,0,1
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=108,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.228:16:7,2:4,1:1,12,1,2
chr2	173369000	.	A	T,AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,27,24;MFRL=117,184,108;MMQ=60,60,60;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.81,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.222,0.262:13:4,2,2:2,1,1:1,6,1,5
chr2	173369039	.	T	TCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	173427412	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	173429496	.	TTAGG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAGG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173429496_TTAGG_T:173429496:0,0,0,1
chr2	173429506	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:173429496_TTAGG_T:173429496:0,0,0,1
chr2	173429721	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:6,13,0,2
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	173659942	.	T	TCTTTCTACCCACTTCCTTTATCTCATTGGCCCCTGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,57;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr2	173662354	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:2,3:1,3:1,3,2,4
chr2	173686798	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	173831934	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	173850154	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:2,2,2,0
chr2	173853350	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173853350_TG_T:173853350:1,0,1,0
chr2	173853356	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173853350_TG_T:173853350:1,0,1,0
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chr2	174081790	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:3,1,3,1
chr2	174097106	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=86,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:4,3:5,8:6,3,8,3
chr2	174123399	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
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chr2	174228237	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:174228235_C_T:174228235:0,2,0,1
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chr2	174228245	.	C	CTTTGTAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:174228235_C_T:174228235:0,2,0,1
chr2	174228496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:4,5,2,0
chr2	174228570	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:6,10,2,1
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chr2	174229479	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=156,114;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174229471_TA_GC:174229471:1,0,0,1
chr2	174229480	.	T	TTGATTGCTAAACAAAGCACGTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,31;MFRL=156,114;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174229471_TA_GC:174229471:1,0,0,1
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=111,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.564:7:1,3:2,1:2,1,3,1
chr2	174231090	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=113,96;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:6,3:6,6,3,0
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chr2	175112577	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	175200903	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr2	175246391	.	AAAAAAAAGAAAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:8,2:16,0:25,16,1,1
chr2	175246545	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.361:13:4,0:3,4:3,5,3,2
chr2	175263218	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	175264627	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=33,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,1:0,1:0,2,3,0
chr2	175306804	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,4:5,7:3,6,6,5
chr2	175318422	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=114,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:1,0:1,0:2,2,1,0
chr2	175318590	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=71088652,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,5:0,2:0,2,4,3
chr2	175326258	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,4:1,0:3,0,2,2
chr2	175326363	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,3:7,10,0,4
chr2	175426750	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	175431990	.	AAGAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AG;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	175432591	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,2:7,0:4,3,0,2
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	175439681	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.274:17:3,0:8,3:7,6,0,4
chr2	175439754	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:175439754_A_AT:175439754:0,2,0,1
chr2	175439757	.	C	CTCACCAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:175439754_A_AT:175439754:0,2,0,1
chr2	175446066	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:9,2:12,0:5,16,3,0
chr2	175446248	.	TACGGGAAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=205,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175446248_TACGGGAAGC_T:175446248:0,1,0,1
chr2	175446259	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=205,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175446248_TACGGGAAGC_T:175446248:0,1,0,1
chr2	175446264	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:175446248_TACGGGAAGC_T:175446248:0,0,0,1
chr2	175446267	.	AGG	TTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:175446248_TACGGGAAGC_T:175446248:0,0,0,1
chr2	175613080	.	A	AAAATAGGGACATTCTAGGATTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	175618334	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,2:6,1:5,11,0,3
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,5:0,13:0,0,10,8
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,6,3
chr2	175629035	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,6:5,1:4,2,5,2
chr2	175957343	.	CACTTTAAATAA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:175957343_CACTTTAAATAA_C:175957343:3,2,1,1
chr2	175957360	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,20;MFRL=106,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:4,2:0,0:0|1:175957343_CACTTTAAATAA_C:175957343:2,3,1,1
chr2	175957413	.	C	CATGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175957413_C_CATGA:175957413:0,1,0,1
chr2	175957415	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175957413_C_CATGA:175957413:0,1,0,1
chr2	175957420	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175957413_C_CATGA:175957413:0,1,0,1
chr2	175982957	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:5,1,3,2
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,0,3
chr2	176046007	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:5,2,4,0
chr2	176804434	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:176804434_T_C:176804434:0,4,0,1
chr2	176804435	.	A	ACCCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=142,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:176804434_T_C:176804434:0,4,0,1
chr2	176965568	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176965568_G_A:176965568:0,0,0,1
chr2	176965573	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176965568_G_A:176965568:0,0,0,1
chr2	176973834	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,1:7,5,1,1
chr2	176988290	.	C	CGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCA;STR;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:3,2:4,3:3,4,1,4
chr2	176995167	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176995167_G_A:176995167:0,1,0,1
chr2	176995185	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:176995167_G_A:176995167:0,1,0,1
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	177014970	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr2	177016315	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,1:0,0:0|1:177016315_A_G:177016315:3,0,1,0
chr2	177016323	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0|1:177016315_A_G:177016315:3,0,1,0
chr2	177054109	.	CCCGCCTCCGG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:1,7,1,1
chr2	177465819	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:177465819_C_A:177465819:1,3,0,1
chr2	177465822	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:177465819_C_A:177465819:1,3,0,1
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	178301689	.	T	TGGCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,2
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178326838_C_G:178326838:0,1,0,1
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	178364342	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=200,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	178482998	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=131,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:4,0:7,4:3,9,0,4
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=80,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:6,5:3,0:6,3,2,3
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,3:0,1:0,0,2,4
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr2	178576626	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	178592982	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_GA_G:178592982:0,1,0,1
chr2	178592984	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_GA_G:178592982:0,1,0,1
chr2	178592987	.	GCCACA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178592982_GA_G:178592982:0,1,0,1
chr2	178592996	.	A	ATGCAGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178592982_GA_G:178592982:0,0,0,1
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	178681570	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:0,0:0|1:178681570_A_AG:178681570:2,0,0,1
chr2	178681571	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:178681570_A_AG:178681570:2,0,0,1
chr2	178682558	.	A	ATATAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	178684878	.	A	AAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.639:9:2,1:1,5:0|1:178684878_A_AAG:178684878:3,0,6,0
chr2	178684879	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.639:9:2,1:1,5:0|1:178684878_A_AAG:178684878:3,0,6,0
chr2	178684921	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,3:5,6:11,3,5,4
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	178769979	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,24;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:178769979_A_AT:178769979:0,2,0,1
chr2	178769981	.	T	TAGCCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,27;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:178769979_A_AT:178769979:0,2,0,1
chr2	178769983	.	G	GGTCTTTAGCATGACATAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:178769979_A_AT:178769979:0,2,0,1
chr2	178769988	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:178769988_C_A:178769988:0,0,0,1
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178769988_C_A:178769988:0,0,0,1
chr2	178977620	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	178990386	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:4,3,2,0
chr2	179196269	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:13,2:14,0:15,12,2,0
chr2	179213942	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	179226625	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=71,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr2	179251820	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,91;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:5,6,2,0
chr2	179257060	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	179296821	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=106,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:5,2,8,1
chr2	179296984	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=128,2073;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:0|1:179296984_G_A:179296984:2,4,1,1
chr2	179296986	.	A	ATCCAAAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=140,2073;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0|1:179296984_G_A:179296984:2,5,1,1
chr2	179306432	.	C	CAGTTTCCATAAATGACTCTAGCCTGCAAAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,96;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,1:6,3:4,10,1,3
chr2	179319161	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=132,1100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:3,8,4,0
chr2	179323420	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179323420_GCT_G:179323420:0,3,0,1
chr2	179323440	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179323420_GCT_G:179323420:0,3,0,1
chr2	179323445	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1|0:179323420_GCT_G:179323420:0,2,0,2
chr2	179323446	.	T	TCCCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1|0:179323420_GCT_G:179323420:0,2,0,2
chr2	179323449	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	179350276	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	179363909	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:6,3:2,1:7,1,3,1
chr2	179363920	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:18,4,3,0
chr2	179392548	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179392573	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179396932	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=59435796,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:179396932_TT_AG:179396932:1,0,0,1
chr2	179396936	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179396932_TT_AG:179396932:0,0,0,1
chr2	179398421	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:6,2:0,0:2,5,2,0
chr2	179400373	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=138,57272322;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:6,1:5,8,2,0
chr2	179403631	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr2	179413224	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,150;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,0:6,4:7,2,4,0
chr2	179413336	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:4,3:15,0:6,13,2,1
chr2	179413452	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=54,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:1,1,0,5
chr2	179417964	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=7943,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179417964_A_C:179417964:0,1,0,1
chr2	179417967	.	C	CCACCATCTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=7943,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:179417964_A_C:179417964:0,1,0,1
chr2	179418610	.	A	ACCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179418610_A_ACCT:179418610:0,0,0,1
chr2	179418612	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179418610_A_ACCT:179418610:0,0,0,1
chr2	179418614	.	G	GTGAACAAAGACAGACTTATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179418610_A_ACCT:179418610:0,0,0,1
chr2	179430321	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=92,78;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:8,3,1,2
chr2	179432294	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=172,410;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr2	179433583	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=137,719;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179433583_GT_AC:179433583:1,0,1,0
chr2	179433586	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,719;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179433583_GT_AC:179433583:1,0,1,0
chr2	179442461	.	CTGGGA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0|1:179442461_CTGGGA_C:179442461:3,6,0,2
chr2	179442467	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:0|1:179442461_CTGGGA_C:179442461:3,5,0,2
chr2	179446292	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=94,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr2	179446325	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=140,19;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,1,0
chr2	179446811	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179451632	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=613,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179451632_T_A:179451632:0,1,0,1
chr2	179451634	.	C	CTAGGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=613,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179451632_T_A:179451632:0,1,0,1
chr2	179452329	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179455137	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:6,1,2,0
chr2	179455212	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:2,7,0,2
chr2	179455568	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,2,0
chr2	179455981	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=133,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:4,8,1,1
chr2	179455991	.	G	GAAAGAAGCTTGAAGACAGAGTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:5,8,1,1
chr2	179456271	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,718;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:3,0,0,4
chr2	179458768	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,2:4,1:5,7,2,1
chr2	179462312	.	T	TTA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:0|1:179462312_T_TTA:179462312:5,8,1,1
chr2	179462314	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:179462312_T_TTA:179462312:5,8,1,1
chr2	179462318	.	A	ATTTTTCACT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:179462312_T_TTA:179462312:5,8,1,1
chr2	179462319	.	G	GTCATT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:9,0:0|1:179462312_T_TTA:179462312:5,8,1,1
chr2	179464647	.	T	TGCTAAGAAAATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179473500	.	TTTGTC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGTC;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:2,2:3,5,1,1
chr2	179476673	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179476673_A_T:179476673:0,1,0,1
chr2	179476675	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179476673_A_T:179476673:0,1,0,1
chr2	179476929	.	A	ATCTGTATTTTTTCTTATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.668:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179479598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=77,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:2,0:6,2:0|1:179479598_C_T:179479598:3,5,1,1
chr2	179479623	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=99,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:2,2:0|1:179479598_C_T:179479598:2,4,1,1
chr2	179479625	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:179479598_C_T:179479598:1,3,1,1
chr2	179479627	.	C	CTTGATAA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:179479598_C_T:179479598:1,3,1,1
chr2	179479628	.	C	CATCATAAATAAT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:179479598_C_T:179479598:1,3,1,1
chr2	179480246	.	A	AATGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=161,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	179480563	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179480563_C_T:179480563:0,1,0,1
chr2	179480565	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179480563_C_T:179480563:0,1,0,1
chr2	179490120	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:1,2,1,1
chr2	179515404	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	179535122	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:179535122_A_C:179535122:0,2,0,1
chr2	179535130	.	T	TATACTTGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:179535122_A_C:179535122:0,2,0,1
chr2	179535134	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:179535122_A_C:179535122:0,2,0,1
chr2	179542307	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	179545129	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:179545129_AC_TG:179545129:0,0,0,1
chr2	179545132	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179545129_AC_TG:179545129:0,0,0,1
chr2	179548695	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.642:8:2,3:0,2:1,2,5,0
chr2	179549217	.	T	TGTTTTTGTGTGTGTGCCTTGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	179553755	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:3,1:2,0:0|1:179553755_GT_G:179553755:2,5,2,0
chr2	179553760	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=100,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:3,0:2,5,2,0
chr2	179553767	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:4,0:8,0:0|1:179553755_GT_G:179553755:2,11,2,0
chr2	179556890	.	T	TAGAGGAGACACCTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179557353	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr2	179560725	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,1289;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:4,4:7,0:3,8,0,5
chr2	179566038	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	179566849	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,4:5,0:9,3,2,2
chr2	179567080	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179567080_A_AAG:179567080:1,0,0,1
chr2	179567081	.	T	TAAAAGAAATTCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179567080_A_AAG:179567080:1,0,0,1
chr2	179567086	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179567080_A_AAG:179567080:1,0,0,1
chr2	179577210	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=174,868;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr2	179585447	.	A	AGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179585447_A_AGC:179585447:0,0,0,1
chr2	179585448	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179585447_A_AGC:179585447:0,0,0,1
chr2	179585451	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179585447_A_AGC:179585447:0,0,0,1
chr2	179588401	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179588401_T_A:179588401:0,1,0,1
chr2	179588405	.	T	TTTAATTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=190,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179588401_T_A:179588401:0,1,0,1
chr2	179590568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:4,4,2,0
chr2	179592416	.	A	ATGCTGCCTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:1,1:0|1:179592416_A_ATGCTGCCTT:179592416:2,1,1,1
chr2	179592418	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:179592416_A_ATGCTGCCTT:179592416:2,1,1,1
chr2	179593250	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=62,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr2	179593286	.	G	GGTTAGAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179594308	.	GGA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:179594308_GGA_G:179594308:2,4,1,1
chr2	179594311	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:179594308_GGA_G:179594308:2,4,1,1
chr2	179594312	.	G	GTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:179594308_GGA_G:179594308:2,4,1,1
chr2	179595394	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr2	179595492	.	TTGG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179595492_TTGG_T:179595492:0,2,0,1
chr2	179595497	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179595492_TTGG_T:179595492:0,2,0,1
chr2	179595499	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=120,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179595492_TTGG_T:179595492:0,2,0,1
chr2	179605271	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:179605271_G_T:179605271:2,6,1,1
chr2	179605273	.	C	CTCCAATTTGGTGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,2:2,0:0|1:179605271_G_T:179605271:2,6,1,1
chr2	179610550	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,53;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,2,0
chr2	179611381	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr2	179612070	.	A	ACCAGTCTTGGCAATTCATGCTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	179613717	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=98,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0|1:179613717_T_C:179613717:5,5,1,1
chr2	179613722	.	C	CCTTGAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:179613717_T_C:179613717:4,5,1,1
chr2	179614375	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,100;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr2	179616682	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:8,0:7,8:6,9,0,8
chr2	179618019	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,1034;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	179621477	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,3,6
chr2	179623939	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	179632710	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr2	179635882	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	179642425	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	179642665	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=75,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,0,1
chr2	179642748	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179642748_C_A:179642748:0,1,0,1
chr2	179642750	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179642748_C_A:179642748:0,1,0,1
chr2	179643886	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179669350	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:9,0:4,3:4,9,1,2
chr2	179721225	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179749827	.	A	AATTAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:179749827_A_AATTAT:179749827:0,4,0,1
chr2	179749828	.	G	GCTTTTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:179749827_A_AATTAT:179749827:0,4,0,1
chr2	179749833	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:179749827_A_AATTAT:179749827:0,4,0,1
chr2	179749836	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:179749827_A_AATTAT:179749827:0,4,0,1
chr2	179986589	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	179986604	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=131,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:0,2:4,7:3,1,7,2
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,5,2
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	180311394	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=121,26;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:180311394_TG_T:180311394:8,10,0,2
chr2	180311403	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=129,26;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:8,2:0|1:180311394_TG_T:180311394:8,9,0,2
chr2	180311440	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=105,72;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,0:10,4:9,15,1,3
chr2	180311454	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=96,72;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:10,0:9,4:6,13,1,3
chr2	180409496	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr2	180810264	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,4:3,2:7,1,3,3
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr2	181922605	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr2	182344846	.	G	GT,GTT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=17,31,32;MFRL=110,100,109;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=25.80,7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,18,5:0.645,0.199:29:3,6,1:0,8,3:2,4,12,11
chr2	182347378	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=92,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:1,1:7,2:6,2,3,0
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	182396588	.	A	ATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:182396588_A_ATGT:182396588:0,1,0,1
chr2	182396590	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:182396588_A_ATGT:182396588:0,1,0,1
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:1,7,2,2
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,8,3
chr2	182404058	.	A	ACCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=225,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:182404058_A_ACCG:182404058:0,1,0,1
chr2	182404061	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=225,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:182404058_A_ACCG:182404058:0,1,0,1
chr2	182412633	.	G	GACACACACACACAC,GACACACACACATATAACTTTGATTGCCAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24,32;MFRL=159,120,137;MMQ=60,50,60;MPOS=16,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.99,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.323:6:1,1,2:1,0,0:1,1,0,4
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	182430120	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:0,0:4,2:2,2,2,1
chr2	182543023	.	G	GTCAGACAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	182775424	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,74817143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr2	182783602	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:2,0:0,5,0,2
chr2	182792863	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:8,0:7,7:13,2,7,0
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr2	183011912	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183011912_A_ATC:183011912:0,1,0,1
chr2	183011914	.	A	ATTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183011912_A_ATC:183011912:0,1,0,1
chr2	183011917	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183011912_A_ATC:183011912:0,1,0,1
chr2	183011919	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:183011912_A_ATC:183011912:0,1,0,1
chr2	183050832	.	AA	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:8,0:1,8:2,7,0,8
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr2	183099137	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,3:7,6:8,2,6,3
chr2	183582742	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,1,1
chr2	183593735	.	TTA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:183593735_TTA_T:183593735:0,2,0,1
chr2	183593738	.	G	GGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:183593735_TTA_T:183593735:0,2,0,1
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:6,2,5,2
chr2	183624120	.	TT	GG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	183699612	.	A	ATTTTACCTTTATAAACATTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=68,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr2	183730769	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:9,3:0,1:6,3,3,1
chr2	183791693	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183791693_T_TGGG:183791693:0,0,0,1
chr2	183791694	.	T	TCATTCTGAGCACATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183791693_T_TGGG:183791693:0,0,0,1
chr2	183791699	.	GT	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:183791693_T_TGGG:183791693:0,0,0,1
chr2	183793628	.	C	CAGAAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:8,12,0,2
chr2	183806893	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:3,2:4,1:2,7,0,3
chr2	183822364	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=170,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr2	183827072	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:183827072_C_T:183827072:0,2,0,1
chr2	183827089	.	A	ATAGCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:183827072_C_T:183827072:0,1,0,1
chr2	183827092	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:183827072_C_T:183827072:0,1,0,1
chr2	183831965	.	GTTTCCACCAACA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:8,0:10,11,1,1
chr2	183841516	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=112,138;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,6:7,0:13,0,6,0
chr2	183848095	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=89,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:3,6,0,3
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	183859707	.	ACTAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	183888653	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=121,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:0|1:183888653_C_A:183888653:3,13,0,3
chr2	183888658	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,0:6,3:0|1:183888653_C_A:183888653:3,12,0,3
chr2	183943782	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:11,0:10,2:18,4,1,1
chr2	183998366	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:2,3:0,2:0,3,2,3
chr2	183998424	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:183998424_G_A:183998424:0,2,0,1
chr2	183998428	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:183998424_G_A:183998424:0,2,0,1
chr2	183998438	.	G	GCTCACTTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	184016449	.	C	CTTTGCCCTATATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	185463887	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=87,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:185463887_G_GA:185463887:0,2,0,1
chr2	185463890	.	T	TGAACTTCATCATCGCTGAGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=87,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:185463887_G_GA:185463887:0,2,0,1
chr2	185463893	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=87,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:185463887_G_GA:185463887:0,2,0,1
chr2	185731045	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,2:0,6:0,1,6,2
chr2	185801597	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=141,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,6:3,2:3,4,6,2
chr2	185801755	.	AG	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:1,1,6,0
chr2	185802291	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:185802291_G_A:185802291:1,0,0,1
chr2	185802298	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:185802291_G_A:185802291:1,0,0,1
chr2	185803089	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,0,2
chr2	186673805	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:6,5,2,0
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	186678818	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=180,377;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186678818_A_C:186678818:0,1,0,1
chr2	186678821	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=180,377;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186678818_A_C:186678818:0,1,0,1
chr2	186678822	.	A	ATGCATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=180,377;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186678818_A_C:186678818:0,1,0,1
chr2	186678835	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186678835_A_C:186678835:0,0,0,1
chr2	186678837	.	G	GAAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186678835_A_C:186678835:0,0,0,1
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	187373529	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:187373529_T_A:187373529:0,0,0,1
chr2	187373534	.	C	CCTCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:187373529_T_A:187373529:0,0,0,1
chr2	187490371	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=117,187;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:3,6,0,3
chr2	187490389	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=159,187;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:1,1:0,6,0,3
chr2	187490405	.	TGAGA	T,TGTGAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30,22;MFRL=0,164,192;MMQ=60,60,40;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.56,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.467:3:0,0,1:0,1,0:0,0,0,3
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,1:1,2:1,0,6,0
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:187698037_G_A:187698037:0,0,0,4
chr2	187698053	.	C	CCAAGTTCACATTTTCCCAATG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187698037_G_A:187698037:0,2,0,1
chr2	187698751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr2	187698758	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=0,112;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr2	187698783	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=127,112;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0|1:187698783_G_A:187698783:0,3,0,1
chr2	187698785	.	A	ACAGCGTCATTGGAAATAAGGCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=127,112;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:187698783_G_A:187698783:0,3,0,1
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	188361878	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188361878_TAA_T:188361878:0,1,0,1
chr2	188361882	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188361878_TAA_T:188361878:0,1,0,1
chr2	188361884	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188361878_TAA_T:188361878:0,1,0,1
chr2	188361885	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188361878_TAA_T:188361878:0,1,0,1
chr2	188361889	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188361878_TAA_T:188361878:0,1,0,1
chr2	189393794	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,149;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,5:7,0:12,4,5,0
chr2	189599552	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=86,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,3:9,0:14,11,3,0
chr2	189855674	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,3:0,0,9,5
chr2	189859684	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=173,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr2	189863028	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=111,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	189867198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	189867710	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:3,2:11,0:9,5,2,0
chr2	189867875	.	C	CTTTGTCTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:189867875_C_CTTTGTCTGT:189867875:0,1,0,1
chr2	189867879	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:189867875_C_CTTTGTCTGT:189867875:0,1,0,1
chr2	189870070	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=115,66;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,2:10,0:9,5,3,0
chr2	189872756	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:5,2,1,1
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	189910080	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=141,136;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:15,0:5,3:1,19,0,3
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,24,26;MFRL=139,156,128;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.99,22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,10:0.232,0.660:14:1,2,6:0,1,3:0,1,5,8
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	189929407	.	G	GTGAATATGTTAATATGTGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=95,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:2,2,1,1
chr2	189929851	.	TTTTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:189929851_TTTTTA_T:189929851:0,1,0,1
chr2	189929863	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=59,111;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:189929851_TTTTTA_T:189929851:0,2,0,1
chr2	189929865	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=59,111;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:189929851_TTTTTA_T:189929851:0,2,0,1
chr2	189933439	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	189949996	.	A	AAGGTAAATATTCTTTTTTTCCTTTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	189950540	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=148,736;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,5:4,0:1,3,0,5
chr2	190319966	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190331057	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	190333976	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190333976_G_C:190333976:1,0,1,0
chr2	190333977	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190333976_G_C:190333976:1,0,1,0
chr2	190333979	.	T	TCCTAATTCAGAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190333976_G_C:190333976:1,0,1,0
chr2	190333982	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190333976_G_C:190333976:1,0,1,0
chr2	190333986	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=149,292;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190333976_G_C:190333976:1,0,1,0
chr2	190428948	.	G	GGGGAGACAGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	190437667	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:13,9,2,1
chr2	190443276	.	C	CACACTTGTACAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:190443276_C_CACACTTGTACAA:190443276:0,0,0,1
chr2	190443281	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:190443276_C_CACACTTGTACAA:190443276:0,0,0,1
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	190570029	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:190570029_T_A:190570029:0,4,0,1
chr2	190570034	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:190570029_T_A:190570029:0,4,0,1
chr2	190593289	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=210,172;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:190593289_A_G:190593289:0,3,0,1
chr2	190593291	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=210,172;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:190593289_A_G:190593289:0,3,0,1
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	190593317	.	C	CAGGCACACACCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=50358766,210;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	190617502	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,138;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,3:3,0:8,2,3,0
chr2	190619136	.	GAAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190619136_GAAAT_G:190619136:0,1,0,1
chr2	190619142	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190619136_GAAAT_G:190619136:0,1,0,1
chr2	190619144	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190619136_GAAAT_G:190619136:0,1,0,1
chr2	190619149	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,24;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190619136_GAAAT_G:190619136:0,1,0,1
chr2	190619151	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=133,117;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:190619136_GAAAT_G:190619136:0,1,0,1
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190722324	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,79;MMQ=60,20;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.258:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr2	190728568	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,136;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:13,6:20,0:17,17,6,0
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,1:7,5:3,6,0,6
chr2	191114558	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:1,6,0,4
chr2	191116869	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr2	191159232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,5,4
chr2	191224981	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=115,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:4,11:11,6:6,9,8,9
chr2	191227235	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	191227492	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr2	191231404	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:4,4,0,2
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:3,2:2,2:6,1,2,2
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:3,1,4,0
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=204,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr2	191354662	.	A	AAAATTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:191354662_A_AAAATTG:191354662:0,3,0,1
chr2	191354667	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,22;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:191354662_A_AAAATTG:191354662:0,3,0,1
chr2	191354669	.	GA	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:191354662_A_AAAATTG:191354662:0,3,0,1
chr2	191374139	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	191375331	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=133,209;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:191375331_A_G:191375331:0,2,0,1
chr2	191375335	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=133,209;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:191375331_A_G:191375331:0,3,0,1
chr2	191375336	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:191375336_C_G:191375336:0,2,0,1
chr2	191375338	.	GTGGCTC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:191375336_C_G:191375336:0,3,0,1
chr2	191375355	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=161,209;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:191375355_T_TC:191375355:0,1,0,1
chr2	191375362	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=161,209;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:191375355_T_TC:191375355:0,1,0,1
chr2	191383951	.	CTCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=122,174;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	191383993	.	AA	GC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,1:3,2:2,3,0,4
chr2	191523862	.	CTTTTT	C,CTTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33,31;MFRL=132,193,116;MMQ=60,60,60;MPOS=34,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,17;RU=T;STR;TLOD=3.17,5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.230,0.461:6:1,1,2:1,0,1:2,0,4,0
chr2	191523894	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=114,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,0:2,0:1,3,3,0
chr2	191537793	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.304:5:1,0:1,1:0|1:191537793_GT_G:191537793:2,2,0,1
chr2	191537807	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.304:5:1,0:3,1:0|1:191537793_GT_G:191537793:2,2,0,1
chr2	191760470	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:10,2:5,2:3,12,2,3
chr2	191765421	.	T	TTAGTAGGCCAC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:191765421_T_TTAGTAGGCCAC:191765421:2,8,1,1
chr2	191765423	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:191765421_T_TTAGTAGGCCAC:191765421:2,8,1,1
chr2	191765426	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:191765421_T_TTAGTAGGCCAC:191765421:2,8,1,1
chr2	191795394	.	C	CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	191835429	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=87,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr2	191841759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:2,5,4,6
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	191848320	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=148,145595415;MMQ=60,34;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:191848320_TGG_T:191848320:2,0,1,0
chr2	191848325	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=148,145595415;MMQ=60,34;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:191848320_TGG_T:191848320:2,0,1,0
chr2	191848327	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,26;MFRL=148,145595415;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:191848320_TGG_T:191848320:2,0,1,0
chr2	191848332	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,14;MFRL=148,145595415;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:191848320_TGG_T:191848320:2,0,1,0
chr2	191848340	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=19,16;MFRL=125,145595415;MMQ=60,34;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:0,0:0|1:191848320_TGG_T:191848320:1,1,1,0
chr2	191849190	.	T	TAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:191849190_T_TAAAA:191849190:0,1,0,1
chr2	191849193	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:191849190_T_TAAAA:191849190:0,1,0,1
chr2	191854423	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.750:21:2,9:2,7:1,4,6,10
chr2	191859685	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	191873592	.	C	CAATTGAGCACACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=112,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:5,12:8,2:8,6,10,5
chr2	191894667	.	AACGT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=227,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:191894667_AACGT_A:191894667:0,1,0,1
chr2	191894674	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=227,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:191894667_AACGT_A:191894667:0,1,0,1
chr2	191894676	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=227,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:191894667_AACGT_A:191894667:0,1,0,1
chr2	191894680	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,19;MFRL=227,183;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:191894667_AACGT_A:191894667:0,1,0,1
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	191923084	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	191923543	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,0,8
chr2	191941003	.	AGTTTG	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:9,2:4,0:0|1:191941003_AGTTTG_A:191941003:8,7,0,2
chr2	191941012	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:191941003_AGTTTG_A:191941003:8,6,0,2
chr2	191941117	.	T	TGCAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	191996518	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:2,5,2,2
chr2	191996724	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:191996724_G_T:191996724:0,2,0,1
chr2	191996726	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:191996724_G_T:191996724:0,2,0,1
chr2	192011556	.	T	TTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:192011556_T_TTTC:192011556:1,2,0,1
chr2	192011561	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=79,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:192011556_T_TTTC:192011556:1,2,0,1
chr2	192011565	.	T	TGAAACCATGGCAACGATTCTTCCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=158,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.593:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr2	192194672	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=104,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,0,2
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=103,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:4,1,3,1
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:0,3:5,2:4,1,3,2
chr2	192228610	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	192257829	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:10,8,2,1
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr2	192701383	.	CT	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=147,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr2	192701393	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	192818646	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=145,164;MMQ=32,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	192818661	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=164,145;MMQ=40,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	196545817	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=99,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	196619324	.	G	GATTGGAGTGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:0,0:0|1:196619324_G_GATTGGAGTGGT:196619324:1,0,0,1
chr2	196619326	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:196619324_G_GATTGGAGTGGT:196619324:1,0,0,1
chr2	196636591	.	T	TTGAATATTTAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr2	196636618	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,8016247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	196689138	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:196689138_A_C:196689138:0,1,0,1
chr2	196689139	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:196689138_A_C:196689138:0,1,0,1
chr2	196722541	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	196726590	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,122;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:3,3:7,0:4,7,3,0
chr2	196738365	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:2,2,6,5
chr2	196749544	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	196750840	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=251,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,0,2
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=102,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:0,2,0,4
chr2	196762532	.	TAA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196762532_TAA_T:196762532:0,0,0,1
chr2	196762535	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196762532_TAA_T:196762532:0,0,0,1
chr2	196771780	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=142,142;MMQ=54,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,0,2
chr2	196788571	.	TCAAAATTATTTTGAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	196799297	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:2,1,5,1
chr2	196837129	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,1:1,4:1,1,1,4
chr2	196851841	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,1:4,5:2,5,3,3
chr2	196891656	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=115,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:196891656_G_T:196891656:1,3,0,1
chr2	196891660	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:196891656_G_T:196891656:0,3,0,1
chr2	196891663	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:196891656_G_T:196891656:0,3,0,1
chr2	196891664	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:196891656_G_T:196891656:0,3,0,1
chr2	196891683	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,34;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,4,0
chr2	197006113	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:197006113_A_G:197006113:0,2,0,1
chr2	197006121	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:197006113_A_G:197006113:0,2,0,1
chr2	197085742	.	A	AGTTCACACATCACAAACAAGTTTATGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	197092767	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:3,4:3,3:7,0,7,0
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=155,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,6:0,1:2,0,3,4
chr2	197138653	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:197171175_C_T:197171175:0,0,6,2
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0|1:197171175_C_T:197171175:0,0,5,3
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr2	197298173	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:197298173_G_A:197298173:0,3,0,1
chr2	197298182	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=144,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:197298173_G_A:197298173:0,3,0,1
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	197523686	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0|1:197523686_GAC_G:197523686:0,0,0,1
chr2	197523689	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197523686_GAC_G:197523686:0,0,0,1
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr2	197577049	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=291,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	197577060	.	C	CTTTTCTGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=139,291;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	197577064	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,17;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:197577064_A_AC:197577064:0,1,0,1
chr2	197577066	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:197577064_A_AC:197577064:0,1,0,1
chr2	197577070	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:197577064_A_AC:197577064:0,1,0,1
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	197643854	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:0|1:197643854_CT_C:197643854:0,1,1,1
chr2	197643869	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:197643854_CT_C:197643854:1,2,0,1
chr2	197643873	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:197643854_CT_C:197643854:1,2,0,1
chr2	197643876	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=124,147;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1|0:197643854_CT_C:197643854:1,2,0,1
chr2	197657761	.	TTCC	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TCC;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:12,2:8,1:9,11,0,3
chr2	197750208	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:23,0:8,5:13,18,0,5
chr2	197767535	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:197767535_AG_A:197767535:0,0,0,1
chr2	197767537	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:197767535_AG_A:197767535:0,0,0,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr2	197781338	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,82320067;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:3,3,1,1
chr2	197832205	.	AAAGT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	197854200	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	197854247	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.446:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	197873736	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=113,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:8,3,0,2
chr2	197873839	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=148,130;MMQ=50,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr2	197873847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=169,140;MMQ=50,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	197873855	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=145,193;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:197873855_C_CA:197873855:0,3,0,1
chr2	197873856	.	G	GC,C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33,31;MFRL=145,140,193;MMQ=60,32,40;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.90,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.429,0.286:4:1,0,1:0,2,0:0,1,0,3
chr2	197873862	.	CT	TA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=145,193;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:197873855_C_CA:197873855:0,3,0,1
chr2	197878485	.	T	TTAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,29;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:197878485_T_TTAGAA:197878485:0,2,0,1
chr2	197878486	.	C	CAACATCAGTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:197878485_T_TTAGAA:197878485:0,2,0,1
chr2	197878489	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:197878485_T_TTAGAA:197878485:0,2,0,1
chr2	197878492	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:197878485_T_TTAGAA:197878485:0,2,0,1
chr2	197889969	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:9,5,0,3
chr2	197943413	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=117,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr2	197948047	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:197948047_T_C:197948047:2,0,1,0
chr2	197948057	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:197948047_T_C:197948047:3,0,1,0
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	197953597	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:197953597_AGT_A:197953597:0,4,0,1
chr2	197953600	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:197953597_AGT_A:197953597:0,4,0,1
chr2	197953602	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=134,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:197953597_AGT_A:197953597:0,2,0,1
chr2	197954670	.	T	TTAAAAATA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0|1:197954670_T_TTAAAAATA:197954670:4,3,1,1
chr2	197954673	.	C	CATT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:197954670_T_TTAAAAATA:197954670:4,3,1,1
chr2	197954676	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=93,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,1:5,0:0|1:197954670_T_TTAAAAATA:197954670:4,3,1,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,1,7
chr2	198011805	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,2:19,0:15,16,0,2
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	198257075	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:3,4:3,3:5,2,5,3
chr2	198261042	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:5,8,0,2
chr2	198263146	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:5,2,6,0
chr2	198264903	.	AAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:3,4:3,4:2,4,2,6
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr2	198265726	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:198265726_G_C:198265726:0,1,0,1
chr2	198265729	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:198265726_G_C:198265726:0,1,0,1
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,11,12
chr2	198273347	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	198273394	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198273394_C_T:198273394:0,0,0,1
chr2	198273395	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198273394_C_T:198273394:0,0,0,1
chr2	198273399	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198273394_C_T:198273394:0,0,0,1
chr2	198273402	.	AAA	TTT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198273394_C_T:198273394:0,0,0,1
chr2	198281539	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:16,0:13,4:11,18,1,3
chr2	198288776	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=9520,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr2	198351754	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	198358261	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:1,4,0,5
chr2	198359315	.	CAGATAACTCAAACTTTTGATCATA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:2,1:2,5:8,4,2,4
chr2	198359953	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,0:9,3:14,0,3,0
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr2	198365788	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=90,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:13,16:15,5:12,16,14,7
chr2	198368031	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=169,151;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198368031_T_A:198368031:0,1,0,1
chr2	198368035	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=169,151;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198368031_T_A:198368031:0,1,0,1
chr2	198368040	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=169,151;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198368031_T_A:198368031:0,1,0,1
chr2	198368042	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=169,151;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198368031_T_A:198368031:0,1,0,1
chr2	198460748	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.550:16:3,2:4,6:3,4,4,5
chr2	198482491	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:1,4,2,0
chr2	198496028	.	T	TAACGTAAAATGTTCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	198508951	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,10,15
chr2	198509058	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	198572076	.	A	ATTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,4:1,6,2,5
chr2	198636653	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=122,51;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:10,12,0,4
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:198643631_G_A:198643631:0,1,0,2
chr2	198643651	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=28,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:4,1:0,3:0|1:198643631_G_A:198643631:2,2,0,4
chr2	198950968	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr2	198953816	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:198953816_G_A:198953816:0,2,0,2
chr2	198953828	.	GTGAAATC	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,0:0|1:198953816_G_A:198953816:0,4,0,2
chr2	198953837	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:198953816_G_A:198953816:0,3,0,1
chr2	200173598	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,113;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:8,4,0,2
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	200298277	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	200800756	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:13,0:17,3:16,14,1,2
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	200824632	.	T	TTGTATTTACATCAACAGGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=93,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:1,5,1,1
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,6:3,1:5,2,5,3
chr2	201171191	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=119,122;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:13,3:17,4:13,17,2,5
chr2	201171207	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:12,4:12,6:10,14,2,8
chr2	201171355	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:2,4,0,4
chr2	201304137	.	C	CTACATTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201304137_C_CTACATTAA:201304137:0,0,0,1
chr2	201304139	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201304137_C_CTACATTAA:201304137:0,0,0,1
chr2	201332157	.	CCAGAGAGCTGATCCCAATTATGTTTGTTTTGCATCCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.345:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr2	201357866	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201357866_A_G:201357866:2,0,0,1
chr2	201357871	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:201357866_A_G:201357866:3,0,0,1
chr2	201357873	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:201357866_A_G:201357866:3,0,0,1
chr2	201358064	.	C	CCTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201358064_C_CCTATT:201358064:0,1,0,1
chr2	201358065	.	G	GCCCCTCTTGATCCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=111,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:201358064_C_CCTATT:201358064:0,1,0,1
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,7:3,4:1,4,4,7
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr2	201445307	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=22,31;MFRL=130,113;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:201445307_T_C:201445307:1,3,0,1
chr2	201445316	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=122,113;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:201445307_T_C:201445307:1,2,0,1
chr2	201445320	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=151,113;MMQ=50,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201445307_T_C:201445307:0,2,0,1
chr2	201445321	.	G	GAGGC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=151,113;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201445307_T_C:201445307:0,2,0,1
chr2	201445337	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201445337_T_C:201445337:0,0,0,1
chr2	201445342	.	CC	AT	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201445337_T_C:201445337:0,0,0,1
chr2	201445346	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201445337_T_C:201445337:0,0,0,1
chr2	201445351	.	CG	TC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201445337_T_C:201445337:0,0,0,1
chr2	201464551	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=176,159;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:201464551_G_A:201464551:0,4,0,2
chr2	201464560	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,159;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:201464551_G_A:201464551:0,4,0,2
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:4,2,2,3
chr2	201474234	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	201477442	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=115,100;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:4,5,3,0
chr2	201477458	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=82,100;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:3,2,3,1
chr2	201478728	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,90;MMQ=60,60;MPOS=-60;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	201485747	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	201485830	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:2,2,2,1
chr2	201488758	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	201505953	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=94,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr2	201507519	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=106,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr2	201526231	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,12,3
chr2	201683160	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201683160_C_A:201683160:0,2,0,1
chr2	201683162	.	T	TGAGTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201683160_C_A:201683160:0,2,0,1
chr2	201683390	.	TAG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.483:4:1,0:1,1:0|1:201683390_TAG_T:201683390:2,0,1,1
chr2	201683396	.	T	TTTCATCTCCTCCTTGACATATAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,1:0|1:201683390_TAG_T:201683390:3,1,1,1
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	201686122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	201719258	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,136;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,3:1,3:3,0,6,0
chr2	201719483	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	201724360	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,5:4,4:11,0,8,1
chr2	201724566	.	A	ACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201724566_A_ACT:201724566:0,0,0,1
chr2	201724569	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201724566_A_ACT:201724566:0,0,0,1
chr2	201724573	.	TCC	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:201724566_A_ACT:201724566:0,0,0,1
chr2	201760162	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	201806129	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=168,118;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:5,2:1,0:0|1:201806129_G_A:201806129:0,6,0,2
chr2	201806131	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=168,118;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.302:8:5,2:1,0:0|1:201806129_G_A:201806129:0,6,0,2
chr2	201814413	.	TAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:201814413_TAAC_T:201814413:0,3,0,1
chr2	201814418	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:201814413_TAAC_T:201814413:0,3,0,1
chr2	201822357	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=143,536;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201822357_T_TA:201822357:1,0,1,0
chr2	201822358	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=143,536;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201822357_T_TA:201822357:1,0,1,0
chr2	201822361	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=143,536;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:201822357_T_TA:201822357:1,0,1,0
chr2	201873886	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201873886_A_C:201873886:0,0,0,1
chr2	201873893	.	T	TTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:201873886_A_C:201873886:0,0,0,1
chr2	202025375	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:8,4:2,3:6,4,2,5
chr2	202025621	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:2,2,2,4
chr2	202074098	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=98,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,3:6,2:2,4,2,3
chr2	202139739	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr2	202151399	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=169,135;MMQ=45,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0|1:202151399_C_T:202151399:0,6,0,2
chr2	202151400	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=160,195;MMQ=40,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.299:8:5,1:1,1:1|0:202151399_C_T:202151399:0,6,0,2
chr2	202151401	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=169,135;MMQ=45,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:202151399_C_T:202151399:0,6,0,2
chr2	202164082	.	AGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,1,0
chr2	202211458	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	202211491	.	A	AAAAGTTCACGCCTGTAATCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	202215399	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=146,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:1,4:8,0:9,1,1,3
chr2	202215409	.	C	CAAAACAAAACAAAACAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAACAAAACAAAACAA;STR;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:6,2:10,2:7,9,1,6
chr2	202215492	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,2:7,4:2,12,0,6
chr2	202216203	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202216203_T_TGC:202216203:0,1,0,1
chr2	202216204	.	A	AGTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202216203_T_TGC:202216203:0,1,0,1
chr2	202216206	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,28;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:202216203_T_TGC:202216203:0,1,0,1
chr2	202216220	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202216220_A_T:202216220:0,0,0,1
chr2	202216222	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202216220_A_T:202216220:0,0,0,1
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	202245944	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=114,84552276;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,0:2,2:0|1:202245944_TAA_T:202245944:1,6,0,2
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=114,84552276;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:202245944_TAA_T:202245944:1,6,0,2
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:1,4:5,2:1,5,2,5
chr2	202251059	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=88,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.239:10:2,0:6,2:3,5,1,1
chr2	202252340	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	202252478	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=69,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,9:1,2:2,0,8,3
chr2	202259653	.	C	CCCTTCTTTACTGTCTTCCATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	202262332	.	T	TTCTTTGGTAGGGTATCTCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=124,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr2	202264286	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=142,544;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:202264286_G_A:202264286:0,4,0,1
chr2	202264302	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=143,544;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:202264286_G_A:202264286:0,3,0,1
chr2	202323636	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:11,2:5,2:0|1:202323636_A_G:202323636:3,13,2,2
chr2	202323641	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:11,1:3,1:0|1:202323636_A_G:202323636:3,13,2,1
chr2	202342802	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=107,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:3,2:4,5:5,3,4,3
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,12:0,3:0,0,10,5
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr2	202402265	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,3:5,0:0,6,0,3
chr2	202410300	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,19:0,28:0,0,37,11
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,1,7
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	202489109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=104,990;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:1,4,1,1
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	202501610	.	T	TCAAGTAATCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	202504551	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.736:16:2,8:1,4:2,2,6,6
chr2	202505740	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	202505764	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=134,126;MMQ=45,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:202505764_G_A:202505764:0,2,0,1
chr2	202505770	.	AAC	GGT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=126,124;MMQ=40,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202505770_AAC_GGT:202505770:0,1,0,1
chr2	202505771	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=144,126;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:202505764_G_A:202505764:0,1,0,1
chr2	202505775	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=124,126;MMQ=30,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202505764_G_A:202505764:0,1,0,1
chr2	202505776	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:202505770_AAC_GGT:202505770:0,0,0,1
chr2	202505778	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=126,124;MMQ=40,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202505770_AAC_GGT:202505770:0,1,0,1
chr2	202505782	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,26;MFRL=124,126;MMQ=30,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202505764_G_A:202505764:0,1,0,1
chr2	202512637	.	G	GGC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=165,136;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.384:3:2,1:0,0:0|1:202512637_G_GGC:202512637:0,2,0,1
chr2	202512640	.	G	GATCTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=165,136;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:202512637_G_GGC:202512637:0,2,0,1
chr2	202512643	.	A	AACT,C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23,29;MFRL=0,139,136;MMQ=60,60,58;MPOS=1,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.96,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.455,0.333:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr2	202514424	.	AA	TG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:0|1:202514424_AA_TG:202514424:1,8,0,2
chr2	202514433	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,1:4,1:0|1:202514424_AA_TG:202514424:0,7,0,2
chr2	202514434	.	A	ACACACACACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,1:4,1:0|1:202514424_AA_TG:202514424:0,7,0,2
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.530:34:6,6:10,11:9,7,6,12
chr2	202529074	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=130,84693842;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,2:0|1:202529074_A_T:202529074:4,10,0,2
chr2	202529076	.	T	TATTAAAGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=130,84693842;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:202529074_A_T:202529074:4,10,0,2
chr2	202529079	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=130,84693842;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:202529074_A_T:202529074:4,10,0,2
chr2	202529786	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,104;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.850:7:1,3:0,2:1,0,3,3
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:2,1,3,3
chr2	202539998	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=104,9972057;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	202545849	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202545849_TT_CC:202545849:0,0,0,1
chr2	202545852	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:202545849_TT_CC:202545849:0,0,0,1
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	202549794	.	C	CTCTGCTTAGGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:2,2:7,0:0|1:202549794_C_CTCTGCTTAGGG:202549794:2,8,0,2
chr2	202549798	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:3,2:6,0:0|1:202549794_C_CTCTGCTTAGGG:202549794:2,8,0,2
chr2	202557702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr2	202587706	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	202589257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	202591877	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:7,1,3,0
chr2	202593186	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,4:6,1,4,2
chr2	202593953	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202593953_C_CA:202593953:0,1,0,1
chr2	202593954	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202593953_C_CA:202593953:0,1,0,1
chr2	202593957	.	T	TTACAAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:202593953_C_CA:202593953:0,1,0,1
chr2	202598113	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,2:2,1:3,7,2,2
chr2	202606578	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=126,33558;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:1,5,1,1
chr2	202626025	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:6,8,0,3
chr2	202626566	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:1,2:0,6,0,2
chr2	202630424	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	202698612	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=107,100;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,0,1
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr2	202901279	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,8:0,3:0,0,5,8
chr2	202901526	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=101,1151;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:4,11,0,3
chr2	202902385	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:10,0:6,3:10,8,3,0
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	202955725	.	C	CATGATAGTAGGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202955725_C_CATGATAGTAGGTA:202955725:0,1,0,1
chr2	202955726	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202955725_C_CATGATAGTAGGTA:202955725:0,1,0,1
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	202962387	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=173,166;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	202962394	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=166,196;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:202962394_C_T:202962394:0,1,0,1
chr2	202962398	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=158,196;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:202962394_C_T:202962394:0,2,0,1
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	202970651	.	CCAG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr2	202970660	.	CTCGGGAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=110,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:202970660_CTCGGGAA_C:202970660:1,1,0,1
chr2	202970671	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:202970660_CTCGGGAA_C:202970660:1,0,0,1
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	202979615	.	T	TTGAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGAA;STR;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr2	203003066	.	G	GGTGT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=73,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=GT;STR;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.787:10:1,3:0,4:1,1,6,2
chr2	203019329	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr2	203051657	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:3,3:3,0:3,5,3,0
chr2	203051886	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	203052947	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,76;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:5,4,2,0
chr2	203058233	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	203058861	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:4,2:0,1:3,1,3,0
chr2	203130685	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,4:6,0:11,6,2,2
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	203149026	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.422:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr2	203149198	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:4,5,2,0
chr2	203152355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chr2	203378574	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=109,115;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:5,0:4,5:2,8,0,5
chr2	203378616	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,3,3
chr2	203384776	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=40,30;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	203421166	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=93,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:203421166_T_A:203421166:3,3,1,1
chr2	203421169	.	TGGGCCA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=93,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:203421166_T_A:203421166:3,3,1,1
chr2	203421183	.	C	CAAACTATTAACTACTTGG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=93,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr2	203560795	.	TGAAGCTAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	203676382	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=78,110;MMQ=58,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.745:12:2,3:1,2:3,1,3,5
chr2	203676505	.	A	ACCTACAG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,3:8,0:1,12,0,3
chr2	203679559	.	T	TAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203679559_T_TAAC:203679559:1,3,0,1
chr2	203679562	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203679559_T_TAAC:203679559:1,3,0,1
chr2	203679565	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=93,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:203679559_T_TAAC:203679559:1,3,0,1
chr2	203684370	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:203684370_G_A:203684370:0,0,0,1
chr2	203684373	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:203684370_G_A:203684370:0,0,0,1
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr2	203693817	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:203693817_AT_A:203693817:0,2,0,1
chr2	203693821	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:203693817_AT_A:203693817:0,2,0,1
chr2	203693823	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:203693817_AT_A:203693817:0,2,0,1
chr2	203747320	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,162;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr2	203759475	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	203765897	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203765897_AG_A:203765897:0,1,0,1
chr2	203765899	.	AGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203765897_AG_A:203765897:0,1,0,1
chr2	203765907	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=212,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:203765897_AG_A:203765897:0,2,0,1
chr2	203765909	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=212,110;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:203765897_AG_A:203765897:0,2,0,1
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=127.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,23:0,16:0,0,25,14
chr2	203921301	.	T	TTTCCCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=134,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,1:4,1:2,14,1,1
chr2	203964456	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=104,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:5,2:4,1:4,6,0,3
chr2	203991488	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,1,2
chr2	203992431	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=126,143;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr2	203992435	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=135,142;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:203992435_A_G:203992435:4,0,1,0
chr2	203992437	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=135,142;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:203992435_A_G:203992435:4,0,1,0
chr2	203992440	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=135,142;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:203992435_A_G:203992435:4,0,1,0
chr2	203996635	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=192,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	204022610	.	G	GCTGCAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr2	204111735	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,3:0,4:4,0,5,2
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	204137574	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,222;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	204143502	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,126;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr2	204154673	.	A	AGTGTGTG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr2	204154697	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=125,168;MMQ=56,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:204154697_CT_C:204154697:1,3,0,1
chr2	204154700	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=125,168;MMQ=56,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:204154697_CT_C:204154697:1,3,0,1
chr2	204260440	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=88,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:18,3:13,0:17,16,1,2
chr2	204281878	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204281878_G_C:204281878:0,0,0,1
chr2	204281880	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204281878_G_C:204281878:0,0,0,1
chr2	204281882	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204281878_G_C:204281878:0,0,0,1
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=44,99;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.590:14:3,6:0,2:3,3,6,2
chr2	204305713	.	C	CGTGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204305713_C_CGTGTG:204305713:0,0,0,1
chr2	204305719	.	GT	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204305713_C_CGTGTG:204305713:0,0,0,1
chr2	204305722	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204305713_C_CGTGTG:204305713:0,0,0,1
chr2	204322298	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=130,114;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:7,6,1,1
chr2	204355868	.	CAGTTGTACTGCTCCTACATTGTGTGACTTAGCATACTATTTTACATTTTATTTCCAATTACATCTTACCATTCA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=119,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,0:0,2:6,1,1,1
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	204821494	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=97,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,4:2,6,3,5
chr2	204824200	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=99,55;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,3:4,1:2,2,2,2
chr2	205830091	.	C	CAGTGATATCTGAATATATAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.262:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	205830127	.	G	GTCCATGTATATCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	205978347	.	T	TGATTTGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GATTTGA;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr2	206023639	.	G	GGGTTCATGTTGTCCCTGTCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:206023639_G_GGGTTCATGTTGTCCCTGTCT:206023639:1,3,1,1
chr2	206023642	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:206023639_G_GGGTTCATGTTGTCCCTGTCT:206023639:1,3,0,1
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	206041366	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=0,131;MMQ=54,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	206418178	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206480617	.	C	CCTTCCCTTACCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	206562536	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:206562536_A_C:206562536:0,2,0,1
chr2	206562538	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:206562536_A_C:206562536:0,2,0,1
chr2	206592534	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	206605180	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	206605223	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:3,0,2,1
chr2	206614598	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	206869385	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:21,4:15,0:19,17,4,0
chr2	206870251	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206870251_T_A:206870251:0,0,0,1
chr2	206870252	.	TCTTCCCTGA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206870251_T_A:206870251:0,0,0,1
chr2	206870264	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206870251_T_A:206870251:0,0,0,1
chr2	206870267	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206870251_T_A:206870251:0,0,0,1
chr2	206870277	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:206870251_T_A:206870251:0,0,0,1
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr2	206892880	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:6,2:4,5,1,1
chr2	206911191	.	C	CA,CAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31,31;MFRL=0,132,129;MMQ=60,60,40;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=16.73,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,3:0.649,0.273:10:0,2,1:0,5,2:0,0,10,0
chr2	206911228	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:4,2:7,7:6,5,4,6
chr2	206995010	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	207006825	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	207006890	.	C	CTTTCTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	207014559	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.084:45:13,0:25,3:0|1:207014559_T_A:207014559:24,18,2,1
chr2	207014568	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,3:0.074:52:15,0:26,3:0|1:207014559_T_A:207014559:25,24,2,1
chr2	207014570	.	C	CTTCATGCTGAAAACTCTCAATAA	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:20,0:28,1:0|1:207014559_T_A:207014559:24,24,2,2
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr2	207040951	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:207040951_T_G:207040951:3,0,0,1
chr2	207040959	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.316:5:1,0:2,0:0|1:207040951_T_G:207040951:3,1,0,1
chr2	207041053	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr2	207041896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:207041896_A_C:207041896:2,1,0,1
chr2	207041899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:207041896_A_C:207041896:2,1,0,1
chr2	207041901	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:207041896_A_C:207041896:3,1,0,1
chr2	207041905	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:207041896_A_C:207041896:3,1,0,1
chr2	207041908	.	A	AACAC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:207041896_A_C:207041896:2,1,0,1
chr2	207041933	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=102,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr2	207175242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr2	207424903	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	207438012	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,30;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:207438012_A_C:207438012:0,4,0,1
chr2	207438014	.	GATTTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:207438012_A_C:207438012:0,4,0,1
chr2	207438019	.	T	TAAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:207438012_A_C:207438012:0,1,0,1
chr2	207438020	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:207438012_A_C:207438012:0,1,0,1
chr2	207438023	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:0,0:1|0:207438012_A_C:207438012:0,2,0,1
chr2	207438029	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:207438012_A_C:207438012:0,0,0,1
chr2	207451965	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:2,1,3,2
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,7:1,5:0,1,2,10
chr2	207527840	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:3,4,4,1
chr2	207559633	.	C	CACATACCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,174418081;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:207559633_C_CACATACCAA:207559633:0,0,0,1
chr2	207559638	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,174418081;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:207559633_C_CACATACCAA:207559633:0,0,0,1
chr2	207564815	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=89,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:4,2,2,1
chr2	207604327	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr2	207604456	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:207604456_C_CTTA:207604456:0,2,0,1
chr2	207604460	.	T	TACAAGTGGAACTGGGTAATAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:207604456_C_CTTA:207604456:0,2,0,1
chr2	207610485	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=183,167;MMQ=40,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:207610485_T_C:207610485:0,4,0,1
chr2	207610487	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=183,167;MMQ=40,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:207610485_T_C:207610485:0,4,0,1
chr2	207610933	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr2	207639218	.	CCATAGTCAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	207653484	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=212,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,0:1,0,2,0
chr2	207814273	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,0;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:207814273_C_A:207814273:1,2,1,0
chr2	207814278	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=130,0;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:207814273_C_A:207814273:1,2,1,0
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	207824558	.	A	AGGCCTTAGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	207833983	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,0,5
chr2	207946092	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207946092_C_CTG:207946092:0,1,0,1
chr2	207946097	.	GCA	TTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:207946092_C_CTG:207946092:0,1,0,1
chr2	208133936	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr2	208133995	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:9,1:5,9:8,6,4,6
chr2	208461711	.	GA	TT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=110,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:0|1:208461711_GA_TT:208461711:7,8,0,2
chr2	208461713	.	A	AGCTCCTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=110,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,1:9,1:0|1:208461711_GA_TT:208461711:7,8,0,2
chr2	208478055	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:2,2,3,2
chr2	208489146	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=152,110;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	208489169	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=103,110;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208489169_G_C:208489169:0,1,0,1
chr2	208489171	.	T	TGGTTTTCTTGCCCTTCTCTACATATGAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=103,110;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208489169_G_C:208489169:0,1,0,1
chr2	208591523	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	208615850	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:0|1:208615850_C_CT:208615850:2,5,1,1
chr2	208615852	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:0|1:208615850_C_CT:208615850:2,5,1,1
chr2	208633627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	208693284	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:208693284_CCT_C:208693284:0,2,0,1
chr2	208693289	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208693284_CCT_C:208693284:0,2,0,1
chr2	208693292	.	C	CAGGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:208693284_CCT_C:208693284:0,2,0,1
chr2	208693293	.	T	TTACAGAGCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:208693284_CCT_C:208693284:0,2,0,1
chr2	208726054	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208726054_G_C:208726054:0,1,0,1
chr2	208726058	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208726054_G_C:208726054:0,1,0,1
chr2	208811284	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	208865712	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:1,2:5,2:4,2,1,3
chr2	208986696	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:208986696_A_C:208986696:0,0,0,1
chr2	208986699	.	A	AATTCACTGTCAAGTTATGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:208986696_A_C:208986696:0,0,0,1
chr2	209007559	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=105,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,4:5,6:2,3,4,6
chr2	209010777	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=110,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:3,3:5,1:5,4,0,4
chr2	209027995	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:4,6,2,2
chr2	209028191	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,4:2,7:5,1,7,4
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	209049830	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr2	209049840	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.814:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	209110006	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:1,1:2,2:4,0,2,1
chr2	209113239	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:8,3:9,0:5,12,1,2
chr2	209141591	.	C	CAAACATCACAAGATACTTTCAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:209141591_C_CAAACATCACAAGATACTTTCAAG:209141591:1,3,0,1
chr2	209141594	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:209141591_C_CAAACATCACAAGATACTTTCAAG:209141591:1,3,0,1
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,3,11
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	209169493	.	TCCTCCAATACCCTGATAAAACCCATTTTTACTCC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:3,0:2,2:13,5,1,1
chr2	209182724	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=98,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr2	209190330	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr2	209193079	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:209193079_A_AG:209193079:0,3,0,1
chr2	209193080	.	A	AATTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:209193079_A_AG:209193079:0,3,0,1
chr2	209193085	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:209193085_T_A:209193085:0,1,0,1
chr2	209193088	.	T	TACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:209193085_T_A:209193085:0,1,0,1
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	209201528	.	CAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	209204714	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:5,6:3,8:5,3,7,7
chr2	209209827	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,18:0,0,14,23
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr2	209210022	.	T	TACCCTA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.367:3:0,1:2,0:0|1:209210022_T_TACCCTA:209210022:0,2,0,1
chr2	209210024	.	G	GTTGTAAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.367:3:0,1:2,0:0|1:209210022_T_TACCCTA:209210022:0,2,0,1
chr2	209210026	.	A	AATACCGAAATGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:209210022_T_TACCCTA:209210022:0,2,0,1
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	209218727	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:5,9,2,0
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,473;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	209220078	.	A	AATGAAAACTAGCTAATTTGTAAAATTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,1:4,6:2,9,0,9
chr2	209345944	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32,27;MFRL=144,161,180;MMQ=40,60,40;MPOS=19,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.86,7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.315,0.410:10:2,2,3:1,1,0:0,3,0,7
chr2	209358027	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,5:0,0,6,3
chr2	209358443	.	TT	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=135,80;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.272:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	210558247	.	T	TTGGAGCCTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	210558484	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=84,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,1,1
chr2	210561714	.	A	AGCTACTTTTCTTTCAGGAGTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:4,2,1,1
chr2	210575026	.	T	TAGAGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=117,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr2	210636744	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=86,90;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:6,5:3,2:5,4,6,2
chr2	210640814	.	G	GTCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:210640814_G_GTCAT:210640814:0,0,0,1
chr2	210640816	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210640814_G_GTCAT:210640814:0,0,0,1
chr2	210640819	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210640814_G_GTCAT:210640814:0,0,0,1
chr2	210714440	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210714440_G_A:210714440:0,0,0,1
chr2	210714442	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210714440_G_A:210714440:0,0,0,1
chr2	210714447	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:210714440_G_A:210714440:0,0,0,1
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,6,3
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	210787105	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=97,64;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:10,2:6,0:9,8,0,2
chr2	210787168	.	T	TCTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:210787168_T_TCTCC:210787168:0,2,0,1
chr2	210787170	.	A	ACATGGTTTTTTCACCCATTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:210787168_T_TCTCC:210787168:0,2,0,1
chr2	210791486	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=154,140;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	210791492	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:210791492_C_T:210791492:8,0,1,1
chr2	210791495	.	AT	GC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:210791492_C_T:210791492:8,0,1,1
chr2	210804468	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=203,152;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:210804468_T_C:210804468:0,2,0,1
chr2	210804470	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=203,152;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:210804468_T_C:210804468:0,2,0,1
chr2	210837125	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:210837125_C_T:210837125:0,1,0,1
chr2	210837127	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:210837125_C_T:210837125:0,1,0,1
chr2	210846867	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr2	210846967	.	A	ATCTCCAGCAACACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	210880798	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=84,96;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,2:11,0:9,9,2,0
chr2	210880893	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,4:6,8:6,5,6,6
chr2	210880950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:5,4,1,2
chr2	210882171	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=61,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:1,1,1,3
chr2	210889759	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	211081233	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=485,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr2	211081268	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=777,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:211081268_T_A:211081268:0,1,0,1
chr2	211081269	.	A	AGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,23;MFRL=777,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:211081268_T_A:211081268:0,1,0,1
chr2	211155922	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211155922_TG_AA:211155922:0,1,0,1
chr2	211155932	.	G	GATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211155922_TG_AA:211155922:0,0,0,1
chr2	211163063	.	TACAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	211167132	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:2,3,2,1
chr2	211168181	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=132,727;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr2	211299389	.	A	ATGACCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:211299389_A_ATGACCC:211299389:0,1,0,1
chr2	211299394	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:211299389_A_ATGACCC:211299389:0,1,0,1
chr2	211299397	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:211299389_A_ATGACCC:211299389:0,1,0,1
chr2	211302627	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	211320041	.	G	GAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=A;STR;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,1:0,0,1,3
chr2	211340937	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,4:7,9:9,4,6,7
chr2	211444543	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:2,1,0,1
chr2	211444556	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211444556_GT_G:211444556:0,0,0,1
chr2	211444558	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:211444556_GT_G:211444556:0,0,0,1
chr2	211455625	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:211455625_CAA_C:211455625:1,2,0,1
chr2	211455628	.	C	CCG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:211455625_CAA_C:211455625:1,2,0,1
chr2	211455629	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:211455625_CAA_C:211455625:1,2,0,1
chr2	211455635	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:211455625_CAA_C:211455625:1,2,0,1
chr2	211456637	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0|1:211456637_A_G:211456637:3,5,1,2
chr2	211456639	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,2:1,1:0|1:211456637_A_G:211456637:3,5,1,2
chr2	211456656	.	AA	CT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:211456656_AA_CT:211456656:2,6,1,1
chr2	211456660	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,0:0|1:211456656_AA_CT:211456656:2,6,1,1
chr2	211456735	.	CGCAGGGCTTTTAAAAATAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	211515058	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr2	211521227	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,33,32;MFRL=123,54,143;MMQ=60,60,55;MPOS=8,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.37,4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.445,0.335:6:0,1,1:0,2,1:0,1,3,2
chr2	211527827	.	GTT	G,GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30,31;MFRL=122,74,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.09,10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,5:0.322,0.532:9:1,2,1:0,1,4:0,1,4,4
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	212248377	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212248377_G_A:212248377:2,0,0,1
chr2	212248381	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212248377_G_A:212248377:2,0,0,1
chr2	212295875	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	212483950	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=91,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:3,5,2,0
chr2	212522450	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,1:0,2:1,0,3,1
chr2	212530065	.	A	AAATTCTTCGAAAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=129,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:4,4,1,1
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:1,2,2,1
chr2	212543942	.	CAGAGGATTGTGTCAAAACTTAAAATCTTCCTAGGTAATGCTATTTCTAAAGGAGTTCACTTAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=124,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.419:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	212589857	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=98,126;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,0:9,3:10,9,0,3
chr2	213291135	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	213878721	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:213878721_C_T:213878721:0,4,0,1
chr2	213878731	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:213878721_C_T:213878721:0,4,0,1
chr2	213878753	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:213878753_G_A:213878753:0,1,0,1
chr2	213878754	.	C	CAAATCCTCTGGTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:213878753_G_A:213878753:0,1,0,1
chr2	213878756	.	A	ATAT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:213878753_G_A:213878753:0,0,0,1
chr2	213878759	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:213878753_G_A:213878753:0,0,0,1
chr2	213886647	.	A	ATTTTATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTATCT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,4:0,4:2,1,5,3
chr2	214160897	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,3:4,2:1,7,2,3
chr2	214182152	.	A	ATATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATG;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	214182162	.	TACCAGAGCCTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	214239778	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:15,2:2,4:9,8,4,2
chr2	214727150	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr2	214727367	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	215013801	.	G	GTATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=97,144;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TA;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	215632124	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=181,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	215632155	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	215632192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=112,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr2	215634055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:1,4,0,5
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215797332	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	215797527	.	AATTC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	215798724	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	215812297	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr2	215820155	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:215820155_T_C:215820155:0,5,0,2
chr2	215820157	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:215820155_T_C:215820155:0,5,0,2
chr2	215820180	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=151,147;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:215820180_T_A:215820180:0,1,0,1
chr2	215820182	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=151,147;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:215820180_T_A:215820180:0,1,0,1
chr2	215820186	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:215820180_T_A:215820180:0,0,0,1
chr2	215840829	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	215847177	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr2	215862542	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=112,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:2,13,0,2
chr2	215865608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=88,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:2,9,2,0
chr2	215865745	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865745_CT_C:215865745:0,0,0,1
chr2	215865748	.	AAAAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865745_CT_C:215865745:0,0,0,1
chr2	215865754	.	A	AGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:215865745_CT_C:215865745:0,0,0,1
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	215876870	.	C	CAAACAAACAACAACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:215876870_C_CAAACAAACAACAACA:215876870:1,5,1,1
chr2	215876872	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:215876870_C_CAAACAAACAACAACA:215876870:1,5,1,1
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	215901592	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr2	215929028	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr2	216177424	.	C	CTATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	216191515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,2,3
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	216198049	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=58,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,1:3,3:3,2,2,2
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	216226175	.	TAAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=201,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAGA;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	216235089	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr2	216240216	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	216244084	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:216244084_G_A:216244084:0,0,0,1
chr2	216244088	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:216244084_G_A:216244084:0,0,0,1
chr2	216244090	.	A	AGTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:216244084_G_A:216244084:0,0,0,1
chr2	216244138	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	216257711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:216257711_C_T:216257711:1,6,1,1
chr2	216257716	.	A	ATACTTACGCAATTTGG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=116,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0|1:216257711_C_T:216257711:2,6,1,1
chr2	216257746	.	G	GACTCTTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:2,1,0,1
chr2	216257981	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216257981_A_T:216257981:0,1,0,1
chr2	216257982	.	A	ATCTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:216257981_A_T:216257981:0,1,0,1
chr2	216262621	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	216262653	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	216263926	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	216269095	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:5,5,3,2
chr2	216271763	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	216271812	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	216272819	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,3:1,1:1,0,3,2
chr2	216285556	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=115,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr2	216288294	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr2	216295337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	216299571	.	T	TTAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAC;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.575:10:4,1:0,4:0,4,0,6
chr2	216299629	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr2	216977701	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:3,2,4,2
chr2	216990820	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	217001989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:217001989_C_T:217001989:0,3,0,1
chr2	217001991	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:217001989_C_T:217001989:0,3,0,1
chr2	217001994	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:217001989_C_T:217001989:0,3,0,1
chr2	217142381	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=84,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,2:0|1:217142381_A_T:217142381:4,2,1,1
chr2	217142404	.	C	CCCTGTCCTTACTTCTTCAGCCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=95,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:217142381_A_T:217142381:4,2,1,1
chr2	217142670	.	A	ACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:217142670_A_ACCC:217142670:0,1,0,1
chr2	217142671	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:217142670_A_ACCC:217142670:0,1,0,1
chr2	217142673	.	T	TTTGATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:217142670_A_ACCC:217142670:0,1,0,1
chr2	217300272	.	T	TCTGTTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	217303033	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	217347687	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=112,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:2,5,0,2
chr2	217347703	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr2	217363896	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=143,113;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:217363896_GG_CA:217363896:4,0,0,1
chr2	217363899	.	C	CATGGGAAAAATTATTTGATATATACAATGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,113;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:217363896_GG_CA:217363896:4,0,0,1
chr2	217364764	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=88,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,4:8,7:5,10,6,5
chr2	217543728	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,1:4,4:6,6,3,2
chr2	217559287	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr2	217724570	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:4,2,3,0
chr2	218672782	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=102,70;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,2:0,1:1,4,2,1
chr2	218675099	.	TGGCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=56,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCTG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,13,4
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,13,4
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr2	218694962	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	218750921	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:218750921_G_GA:218750921:0,1,0,1
chr2	218750925	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218750921_G_GA:218750921:0,0,0,1
chr2	218750927	.	A	AGAGGATATATCAGGGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218750921_G_GA:218750921:0,0,0,1
chr2	218938222	.	C	CATGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218938222_C_CATGAG:218938222:0,1,0,1
chr2	218938224	.	T	TCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218938222_C_CATGAG:218938222:0,1,0,1
chr2	218938228	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218938222_C_CATGAG:218938222:0,1,0,1
chr2	218938642	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,2:3,3:2,6,2,3
chr2	218940150	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=105,95;MMQ=60,31;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:7,6,3,0
chr2	218940169	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,95;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,3:5,0:6,12,3,0
chr2	218940323	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:218940323_A_T:218940323:2,1,0,1
chr2	218940324	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:218940323_A_T:218940323:2,1,0,1
chr2	218940325	.	C	CTTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:218940323_A_T:218940323:2,1,0,1
chr2	218940554	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218940554_C_CA:218940554:0,0,0,1
chr2	218940555	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:218940554_C_CA:218940554:0,0,0,1
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr2	219000966	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.404:28:10,7:5,4:6,11,7,4
chr2	219118551	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,3:0,0:4,1,3,0
chr2	219130506	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219130506_G_A:219130506:1,0,1,0
chr2	219130510	.	AGTCG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:219130506_G_A:219130506:2,0,1,0
chr2	219130724	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:219130724_TG_T:219130724:1,1,0,1
chr2	219130727	.	CCCAGGT	C,ACCAGGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31,22;MFRL=176,120,96;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:0,0,0:1,1,0,2
chr2	219130729	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,1:0,0:1|0:219130724_TG_T:219130724:1,1,0,1
chr2	219130735	.	CTCAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:219130724_TG_T:219130724:1,3,0,1
chr2	219130741	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:219130724_TG_T:219130724:1,3,0,1
chr2	219130908	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr2	219130941	.	G	GCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:219130941_G_GCAA:219130941:0,0,1,1
chr2	219130943	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:219130941_G_GCAA:219130941:0,0,1,1
chr2	219131351	.	C	CTATCTCCCTTTGCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219134678	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:7,4,1,1
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	219142491	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr2	219142594	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	219143327	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr2	219144149	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	219144782	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=116,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:9,9,2,1
chr2	219144815	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,5,6
chr2	219146603	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=107,114;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:219146603_C_A:219146603:8,3,2,0
chr2	219146607	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0|1:219146603_C_A:219146603:0,0,10,3
chr2	219146868	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,2:0,6:0,0,3,8
chr2	219146882	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,4:0,0,1,9
chr2	219204698	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	219204715	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219204715_G_C:219204715:1,0,0,1
chr2	219204717	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219204715_G_C:219204715:1,0,0,1
chr2	219204957	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,0;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	219205471	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr2	219209430	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219221982	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TC;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	219231850	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr2	219254622	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,8:0,0,10,13
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	219257890	.	T	TAGGACAGACCCACTTAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	219266204	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	219267706	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,195;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:219267706_A_C:219267706:0,0,2,0
chr2	219267712	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,195;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:219267706_A_C:219267706:0,0,2,0
chr2	219267714	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,195;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:219267706_A_C:219267706:0,0,2,0
chr2	219267716	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,195;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:219267706_A_C:219267706:0,0,2,0
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr2	219289006	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,1:7,1:4,5,0,2
chr2	219293057	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,4:1,1:4,3,3,2
chr2	219300215	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:219300215_T_C:219300215:0,1,0,1
chr2	219300219	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219300215_T_C:219300215:0,1,0,1
chr2	219300222	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219300215_T_C:219300215:0,1,0,1
chr2	219300224	.	A	AAGTTAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219300215_T_C:219300215:0,1,0,1
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr2	219319657	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,8,7
chr2	219320233	.	GAAA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr2	219320498	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,31;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:219320498_C_T:219320498:0,3,0,1
chr2	219320500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=24,33;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:219320498_C_T:219320498:0,3,0,1
chr2	219320503	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=107,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:219320503_GCT_G:219320503:0,3,0,1
chr2	219320507	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=25,23;MFRL=107,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:219320503_GCT_G:219320503:0,3,0,1
chr2	219320509	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:219320498_C_T:219320498:0,3,0,1
chr2	219320519	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=144,136;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	219320534	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,24;MFRL=180,107;MMQ=55,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219320534_G_A:219320534:0,1,0,1
chr2	219320536	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=180,107;MMQ=55,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219320534_G_A:219320534:0,1,0,1
chr2	219320542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,28;MFRL=180,107;MMQ=55,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219320534_G_A:219320534:0,1,0,1
chr2	219330877	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.294:9:1,2:4,0:0|1:219330877_T_A:219330877:2,5,1,1
chr2	219330878	.	A	AGTCTCCTTGTTTGGCTGTTTTGTTTGTCTGCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.294:9:1,2:5,0:0|1:219330877_T_A:219330877:2,5,1,1
chr2	219339257	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=120,166;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:3,1,1,0
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:0,3:1,0,3,1
chr2	219346949	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:8,12,1,1
chr2	219350387	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.217:24:9,0:10,2:7,12,5,0
chr2	219350394	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=102,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.093:35:13,0:15,1:10,22,3,0
chr2	219350398	.	G	A,T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,22,16;MFRL=103,104,166;MMQ=60,60,52;MPOS=2,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,3,2:0.096,0.073:38:15,2,0:18,1,0:10,23,3,2
chr2	219362735	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:6,1,2,2
chr2	219374922	.	C	CCATGTGAGTATTCTATTTCGCAATTTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219414447	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:3,2,5,0
chr2	219447612	.	CTT	C,CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,13,31;MFRL=0,127349,133;MMQ=60,25,60;MPOS=19,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.37,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.286,0.546:3:0,0,1:0,0,1:0,0,3,0
chr2	219447627	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=11,17;MFRL=170,127349;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:219447627_C_G:219447627:3,0,1,0
chr2	219447631	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=11,16;MFRL=143,127349;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:219447627_C_G:219447627:4,0,1,0
chr2	219487587	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:219487587_A_T:219487587:3,7,1,1
chr2	219487588	.	A	ACCTTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=126,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:219487587_A_T:219487587:3,7,1,1
chr2	219496837	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=101,2514;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:4,1,0,4
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:3,1,1,5
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=86,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr2	219507309	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr2	219508088	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:219508088_C_CA:219508088:2,1,0,1
chr2	219508090	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:219508088_C_CA:219508088:2,1,0,1
chr2	219508092	.	G	GTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:219508088_C_CA:219508088:2,1,0,1
chr2	219508299	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:4,6,0,2
chr2	219526316	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,2,0,1
chr2	219526318	.	CATT	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,2,0,1
chr2	219526323	.	GACAT	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,2,0,1
chr2	219526330	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,1,0,1
chr2	219526331	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,26;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,1,0,1
chr2	219526340	.	TT	CA	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,0,0,1
chr2	219526343	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,0,0,1
chr2	219526346	.	AA	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219526316_GA_G:219526316:0,0,0,1
chr2	219527005	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:0,0:3,5:1,2,3,3
chr2	219527075	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=507,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:219527075_A_C:219527075:1,2,0,1
chr2	219527079	.	G	GCCGTGAACATCCCGTCTGATGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=507,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219527075_A_C:219527075:1,2,0,1
chr2	219527082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=507,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:219527075_A_C:219527075:1,2,0,1
chr2	219528611	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=158,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	219528886	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:219528886_G_A:219528886:0,3,0,1
chr2	219528892	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:219528886_G_A:219528886:0,3,0,1
chr2	219532903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=16105100,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:219532903_C_T:219532903:1,1,1,4
chr2	219532905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=16105100,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:219532903_C_T:219532903:1,1,1,4
chr2	219533127	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219533165	.	T	TACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219538775	.	A	AATTTCAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219538775_A_AATTTCAT:219538775:0,0,0,1
chr2	219538778	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219538775_A_AATTTCAT:219538775:0,0,0,1
chr2	219538780	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219538775_A_AATTTCAT:219538775:0,0,0,1
chr2	219541056	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	219545309	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=84,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,2:0,2:1,3,4,0
chr2	219549758	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=239,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	219555324	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,0:1,7:0,1,0,8
chr2	219558133	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=47,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:219558133_G_C:219558133:0,2,0,1
chr2	219558137	.	C	CTAGAAATATCT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=47,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:219558133_G_C:219558133:0,2,0,1
chr2	219558149	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:219558149_G_T:219558149:0,0,0,1
chr2	219558151	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219558149_G_T:219558149:0,0,0,1
chr2	219558155	.	CTA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219558149_G_T:219558149:0,0,0,1
chr2	219558159	.	A	AGC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219558149_G_T:219558149:0,0,0,1
chr2	219558163	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219558149_G_T:219558149:0,0,0,1
chr2	219562675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr2	219566769	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=161,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:6,0:1,4:0|1:219566769_G_C:219566769:2,5,1,3
chr2	219566773	.	G	GGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=150,76;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:1,4:0|1:219566769_G_C:219566769:2,4,1,3
chr2	219603313	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=164,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	219603927	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:219603927_T_C:219603927:0,0,0,1
chr2	219603929	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219603927_T_C:219603927:0,0,0,1
chr2	219603931	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219603927_T_C:219603927:0,0,0,1
chr2	219603932	.	A	ACCATGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:219603927_T_C:219603927:0,0,0,1
chr2	219609776	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	219612282	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr2	219618830	.	AT	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:219618830_AT_TG:219618830:1,1,1,0
chr2	219618833	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:219618830_AT_TG:219618830:1,1,1,0
chr2	219618835	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:219618830_AT_TG:219618830:1,1,1,0
chr2	219677799	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=133,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr2	219689205	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:219689205_A_C:219689205:2,2,1,0
chr2	219689208	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:219689205_A_C:219689205:2,2,1,0
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	219692172	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=54,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:219692172_G_T:219692172:1,1,0,1
chr2	219692177	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=54,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:219692172_G_T:219692172:1,1,0,1
chr2	219692202	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219692202_G_GT:219692202:1,2,0,1
chr2	219692204	.	C	CCTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=134,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219692202_G_GT:219692202:1,2,0,1
chr2	219692339	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=51,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:4,4,0,3
chr2	219692372	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:219692372_C_T:219692372:3,3,1,1
chr2	219692380	.	G	GCACATGGCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:219692372_C_T:219692372:3,3,1,1
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,4,5
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr2	219696155	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,0,2
chr2	219696439	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=57,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,2,1
chr2	219754737	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,2:2,1:5,2,2,1
chr2	219824868	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219857030	.	C	CATTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219857030_C_CATTTA:219857030:0,1,0,1
chr2	219857031	.	G	GCTTTTTCTGTAATCAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219857030_C_CATTTA:219857030:0,1,0,1
chr2	219867931	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	219870847	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,28;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:1,1:2,3,1,0
chr2	219870960	.	G	GATTGACTTCATGGCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr2	219878413	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=212,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219878413_G_T:219878413:0,1,0,1
chr2	219878415	.	G	GCGTGTCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=212,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:219878413_G_T:219878413:0,1,0,1
chr2	219884491	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219884491_C_T:219884491:0,1,0,1
chr2	219884494	.	G	GTGGGGGTGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219884491_C_T:219884491:0,1,0,1
chr2	219884499	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219884491_C_T:219884491:0,1,0,1
chr2	219884501	.	C	CCTGGGAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219884491_C_T:219884491:0,1,0,1
chr2	219884505	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=174,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:219884491_C_T:219884491:0,1,0,1
chr2	219892558	.	GCAC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:219892558_GCAC_G:219892558:2,2,0,1
chr2	219892562	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:219892558_GCAC_G:219892558:2,2,0,1
chr2	219892564	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:219892558_GCAC_G:219892558:2,2,0,1
chr2	219896025	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=120,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,0:1,2:2,2,1,2
chr2	219896029	.	TGGG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:1,2:0|1:219896029_TGGG_T:219896029:2,3,1,1
chr2	219896033	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:0|1:219896029_TGGG_T:219896029:2,3,1,1
chr2	219905399	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219905399_T_A:219905399:0,1,0,1
chr2	219905401	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219905399_T_A:219905399:0,1,0,1
chr2	219905406	.	T	TCAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:219905399_T_A:219905399:0,1,0,1
chr2	219906367	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219920074	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:219920074_AG_CA:219920074:0,3,1,1
chr2	219920078	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:219920074_AG_CA:219920074:0,3,1,1
chr2	219920082	.	G	GGGAACTCCCCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:219920074_AG_CA:219920074:0,3,0,1
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,4,1
chr2	220030220	.	C	CCTGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	220033456	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:3,7,0,2
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr2	220034497	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	220037393	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,7,6
chr2	220037564	.	G	GTATTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:1,1:0,0:0|1:220037564_G_GTATTA:220037564:1,0,0,1
chr2	220037566	.	G	GAAGGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=158,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:220037564_G_GTATTA:220037564:1,0,0,1
chr2	220037567	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=158,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:220037564_G_GTATTA:220037564:1,0,0,1
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	220045035	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	220046975	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,3,1
chr2	220047374	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220047374_G_A:220047374:0,0,0,1
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220047374_G_A:220047374:0,0,0,1
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220072362	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:7,7,2,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,7,15
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	220077268	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=167,141;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:220077268_C_G:220077268:0,2,0,1
chr2	220077271	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=167,141;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220077268_C_G:220077268:0,2,0,1
chr2	220077280	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=190,141;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220077268_C_G:220077268:0,1,0,1
chr2	220077282	.	T	TCG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=190,141;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220077268_C_G:220077268:0,1,0,1
chr2	220077284	.	A	C,ACG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,32,22;MFRL=0,190,141;MMQ=60,60,57;MPOS=10,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.333,0.455:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr2	220077290	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=209,190;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:220077268_C_G:220077268:0,2,0,1
chr2	220077293	.	G	GACAC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=276,190;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:220077268_C_G:220077268:0,1,0,1
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr2	220082365	.	CA	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=116,143;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.111:32:4,0:14,3:17,12,2,1
chr2	220082374	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=107,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:15,5:25,0:21,19,5,0
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	220099665	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:6,5,1,1
chr2	220100569	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=104,75;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:11,6:21,0:10,23,5,1
chr2	220103462	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:15,0:12,3:9,18,0,3
chr2	220104867	.	ACCCCTTGTACCTTCTTCCCCTGCTCCAGTCACTTC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:0,0:2,2:5,3,1,1
chr2	220107149	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr2	220116999	.	G	GGTGCTTGGGAAAATAAATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220117428	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr2	220147991	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:2,6,3,3
chr2	220149514	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:6,1,2,0
chr2	220155360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=101,114;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,0:4,3:5,9,0,3
chr2	220158927	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,0:7,3:7,12,0,3
chr2	220161657	.	C	CAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,1:1,0:0|1:220161657_C_CAGAA:220161657:0,2,0,1
chr2	220161659	.	C	CATGTGTCCCGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:220161657_C_CAGAA:220161657:0,2,0,1
chr2	220172247	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:3,5,0,3
chr2	220197818	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:15,0:15,5:31,0,5,0
chr2	220197821	.	CTA	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:13,2:15,2:29,0,4,0
chr2	220197926	.	G	T	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=86,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.066:66:21,0:33,1:50,11,0,5
chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,5,6
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,1:0,0,2,5
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220251590	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:1,0:1,0:0|1:220251590_C_G:220251590:0,2,2,0
chr2	220251592	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:1,0:1,0:0|1:220251590_C_G:220251590:0,2,2,0
chr2	220251598	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:1,0:1,0:0|1:220251590_C_G:220251590:0,2,2,0
chr2	220251603	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:1,0:1,1:0|1:220251590_C_G:220251590:0,2,2,0
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	220286381	.	C	CCACAGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220288378	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,160;MMQ=40,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	220306413	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220308635	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,26;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:1,0,1,0
chr2	220308636	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,24;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:1,0,1,0
chr2	220308641	.	ACTGGGTGCCT	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,28;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:1,0,1,0
chr2	220308656	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:1,0,1,0
chr2	220308657	.	CCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=50,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:4,0,1,0
chr2	220308662	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=28,27;MFRL=50,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,0:1,1:0|1:220308635_C_A:220308635:4,0,1,1
chr2	220308663	.	TGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=27,20;MFRL=100,68;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:1,2:0|1:220308635_C_A:220308635:5,0,1,1
chr2	220309712	.	C	CTGGGGGTCAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:220309712_C_CTGGGGGTCAGAGG:220309712:1,0,1,0
chr2	220309714	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:220309712_C_CTGGGGGTCAGAGG:220309712:1,0,1,0
chr2	220312597	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220313831	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:220313831_G_T:220313831:7,1,1,1
chr2	220313833	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:220313831_G_T:220313831:7,1,1,1
chr2	220313836	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:220313831_G_T:220313831:7,1,1,1
chr2	220313838	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:220313831_G_T:220313831:6,1,1,1
chr2	220313839	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:220313831_G_T:220313831:6,1,1,1
chr2	220313842	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:220313831_G_T:220313831:6,1,1,1
chr2	220315970	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr2	220316085	.	C	CTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220316381	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	220330724	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	220337825	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:220337825_C_A:220337825:0,3,0,1
chr2	220337831	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220337825_C_A:220337825:0,2,0,1
chr2	220337834	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220337825_C_A:220337825:0,1,0,1
chr2	220337836	.	T	TATG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220337825_C_A:220337825:0,1,0,1
chr2	220337837	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220337825_C_A:220337825:0,1,0,1
chr2	220342225	.	CTCCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr2	220344867	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	220347440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=95,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:220347440_C_T:220347440:2,2,2,0
chr2	220347447	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=72,42;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:220347440_C_T:220347440:4,3,2,0
chr2	220347470	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=61,42;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:5,2,2,0
chr2	220347729	.	T	TTCACTCCATTAGGTTAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220352954	.	G	GACAACCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:220352954_G_GACAACCC:220352954:2,0,0,1
chr2	220352955	.	T	TAGACACTCACAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:220352954_G_GACAACCC:220352954:2,0,0,1
chr2	220356609	.	C	CTTTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	220369030	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	220369034	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=112,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	220369887	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	220371181	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	220371224	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:220371224_G_GA:220371224:0,1,0,1
chr2	220371225	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:220371224_G_GA:220371224:0,1,0,1
chr2	220396915	.	G	GCGTGCGTGCGTGCGTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	220404648	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,3:5,6:6,6,4,6
chr2	220404905	.	C	CTGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=189,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:1,2:3,0:0|1:220404905_C_CTGG:220404905:1,4,1,1
chr2	220404907	.	G	GCCTGGTGATGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:220404905_C_CTGG:220404905:1,4,1,1
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	220412256	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr2	220413918	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:4,2:9,2:7,6,2,2
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	220416570	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr2	220416942	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=93,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:3,3,2,2
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,1,2
chr2	220420641	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	220420956	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,5,5
chr2	220421479	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:4,2:1,6:1,4,2,7
chr2	220421510	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=144,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:220421510_C_A:220421510:0,3,0,1
chr2	220421512	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220421510_C_A:220421510:0,3,0,1
chr2	220422400	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220423045	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220423045_CA_C:220423045:0,1,0,1
chr2	220423049	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220423045_CA_C:220423045:0,1,0,1
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	220428192	.	C	CAATA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:5,2:0|1:220428192_C_CAATA:220428192:8,4,0,2
chr2	220428194	.	G	GCC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:220428192_C_CAATA:220428192:8,4,0,2
chr2	220428196	.	A	AAGAGTCACTAATC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:220428192_C_CAATA:220428192:8,4,0,2
chr2	220428200	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:3,2:0|1:220428192_C_CAATA:220428192:6,3,0,2
chr2	220428370	.	G	GAGGAGAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220428370_G_GAGGAGAGTGA:220428370:0,1,0,1
chr2	220428372	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220428370_G_GAGGAGAGTGA:220428370:0,1,0,1
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220428381_A_T:220428381:0,0,0,1
chr2	220428398	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220428381_A_T:220428381:0,0,0,1
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	220432957	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,4:1,5:0,3,2,7
chr2	220462640	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,12,8
chr2	220466344	.	G	GTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:0,0:2,0:1,3,0,2
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	220471557	.	CA	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:220471557_CA_AT:220471557:2,2,1,1
chr2	220471561	.	C	CTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=105,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,0:0|1:220471557_CA_AT:220471557:2,2,1,1
chr2	220473355	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,3:6,6:3,3,6,3
chr2	220476608	.	C	CGTGTGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,0:2,1,0,1
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	220479055	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220480936	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,0,3
chr2	220480948	.	G	GTGACCCGCCTC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.324:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr2	220480985	.	G	GTCTTTCCACAACCCTAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220480985_G_GTCTTTCCACAACCCTAC:220480985:0,0,0,1
chr2	220480989	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220480985_G_GTCTTTCCACAACCCTAC:220480985:0,0,0,1
chr2	220492712	.	G	GAGAGATTCTCAGGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	220494053	.	TGAGGAAGAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAGGAAGAG;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.618:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	220496832	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220498550	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	220501478	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:220501478_C_G:220501478:1,0,0,1
chr2	220501486	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:220501478_C_G:220501478:1,1,0,1
chr2	220501488	.	C	CCTTGACATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:220501478_C_G:220501478:1,1,0,1
chr2	220501671	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220501671_GG_CT:220501671:0,1,0,1
chr2	220501677	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220501671_GG_CT:220501671:0,1,0,1
chr2	220501678	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220501671_GG_CT:220501671:0,1,0,1
chr2	220501686	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220501671_GG_CT:220501671:0,1,0,1
chr2	220502372	.	G	GTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=67,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	220502982	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220506522	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=75,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr2	222291429	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:222291429_G_T:222291429:0,1,0,1
chr2	222291434	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:222291429_G_T:222291429:0,1,0,1
chr2	222291437	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:222291429_G_T:222291429:0,1,0,1
chr2	222291438	.	A	AATACTCTCTCATGTCTCTCAGGTTGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=72,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:222291438_A_AATACTCTCTCATGTCTCTCAGGTTGT:222291438:0,1,0,1
chr2	222291439	.	G	GCTGCTGGTTATACCACA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:222291429_G_T:222291429:0,1,0,1
chr2	222291440	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=72,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:222291438_A_AATACTCTCTCATGTCTCTCAGGTTGT:222291438:0,1,0,1
chr2	222307600	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr2	222429209	.	T	TATTGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	223066053	.	CA	TT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=108,145;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,0,2
chr2	223066062	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,28;MFRL=108,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:223066062_T_G:223066062:2,2,0,2
chr2	223066064	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=108,145;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:223066062_T_G:223066062:2,2,0,2
chr2	223097074	.	C	CCCTCCCCTCTCTTGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	223160203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=268,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	223386539	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:6,5,0,3
chr2	223464582	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:3,0,1,0
chr2	223493640	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=131,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	223559334	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559337	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559338	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559340	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559343	.	C	CCAAGGACAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,32;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559345	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223559347	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=276,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:223559334_T_TC:223559334:0,1,0,1
chr2	223781017	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr2	223786203	.	T	TGTCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	223793471	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,2,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,2,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	223799493	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:223799493_T_C:223799493:0,2,0,1
chr2	223799495	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,17;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:223799493_T_C:223799493:0,2,0,1
chr2	223806189	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=139,138;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	223918363	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	224463485	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:3,2,2,0
chr2	224629895	.	C	CATCATA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:6,1,1,1
chr2	224640803	.	C	CAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.480:25:5,6:8,5:6,7,6,6
chr2	224640928	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:224640928_A_T:224640928:0,2,0,1
chr2	224640931	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:224640928_A_T:224640928:0,2,0,1
chr2	224640949	.	CTCAACA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:224640949_CTCAACA_C:224640949:0,1,0,1
chr2	224640958	.	A	AGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:224640949_CTCAACA_C:224640949:0,1,0,1
chr2	224746863	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=157,142;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:224746863_A_C:224746863:0,3,0,1
chr2	224746869	.	TCA	CTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,142;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:224746863_A_C:224746863:0,3,0,1
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,6,11
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=65.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,3,13
chr2	224856740	.	AGGG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:0|1:224856740_AGGG_A:224856740:2,4,1,1
chr2	224856746	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:224856740_AGGG_A:224856740:2,4,1,1
chr2	224866576	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=156,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	225339059	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:7,0:2,3:4,5,1,2
chr2	225362478	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	225365056	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	225367669	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	225376034	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,6,4
chr2	225400185	.	CCTTCAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTCAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	225635319	.	T	TAGATGTCTATC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:4,5,1,1
chr2	225660940	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225660940_C_T:225660940:0,0,1,0
chr2	225660964	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225660940_C_T:225660940:0,0,1,0
chr2	225669729	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=181,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr2	225710042	.	C	CAGACCTGAATTTACCATTTCCTGGATT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=66,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:3,3,1,1
chr2	225710081	.	C	CACCTGCCTTTCTGACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	225710084	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:225710084_C_T:225710084:0,0,0,1
chr2	225710088	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=152,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:225710084_C_T:225710084:0,1,0,1
chr2	225710092	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=152,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:225710084_C_T:225710084:0,1,0,1
chr2	225719818	.	A	ACACAGAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=139,95;MMQ=48,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:2,1:0,0:0|1:225719818_A_ACACAGAGG:225719818:0,2,0,1
chr2	225719822	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=139,95;MMQ=48,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:225719818_A_ACACAGAGG:225719818:0,2,0,1
chr2	225729224	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=99,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:1,0:4,2:5,2,2,0
chr2	225758456	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	225761148	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=2833,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:225761148_G_T:225761148:0,1,0,1
chr2	225761151	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=2833,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225761148_G_T:225761148:0,1,0,1
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,5,10
chr2	226446621	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	226516282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:226516282_C_T:226516282:1,3,0,1
chr2	226516285	.	C	CCCGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=128,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:226516282_C_T:226516282:1,3,0,1
chr2	226516297	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=199,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	227662608	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	227771355	.	TGGACTGAGTTAAATGCTGCTTAGCATAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:227771355_TGGACTGAGTTAAATGCTGCTTAGCATAA_T:227771355:1,1,1,0
chr2	227771386	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.411:3:0,1:2,0:0|1:227771355_TGGACTGAGTTAAATGCTGCTTAGCATAA_T:227771355:1,1,1,0
chr2	227771637	.	A	AAGTCCTAGGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=105,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	227887337	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:227887337_TG_CA:227887337:0,1,0,1
chr2	227887340	.	G	GTTTTTTATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:227887337_TG_CA:227887337:0,1,0,1
chr2	227898287	.	C	CTCTACAGCAACAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	227917063	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,1:4,1:5,3,2,0
chr2	227922236	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=114,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,1,0
chr2	227924065	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=123,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr2	227927198	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=124,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr2	227945250	.	C	CCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,194803918;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr2	227966298	.	T	TA,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28,27;MFRL=0,169,132;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.92,5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.510,0.402:7:0,2,2:0,2,0:0,0,1,6
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.767:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=94,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:0,3:0,7:2,0,5,5
chr2	227967993	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=182,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:227967993_T_TAC:227967993:0,1,0,1
chr2	227967996	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=182,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:227967993_T_TAC:227967993:0,1,0,1
chr2	227967997	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=182,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:227967993_T_TAC:227967993:0,1,0,1
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	227983476	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227983476_C_T:227983476:0,0,0,1
chr2	227983477	.	C	CTGAAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227983476_C_T:227983476:0,0,0,1
chr2	227983478	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:227983476_C_T:227983476:0,0,0,1
chr2	228102723	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.452:18:4,4:6,4:4,6,4,4
chr2	228102752	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,6:4,3:2,4,3,6
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr2	228110820	.	T	TGCTAAGACAATCTCGAATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	228112143	.	TTTGCTTTGTAAGGCCGTGGGAGGTGTACAGTGGGGAGAGGATACACAATAGCAGAGAGGGCAGAGCAGACCGAGTAGGAGTGTGTGCGTTTGATATTCCTCTAGTTGTTCATAGG	T	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=110,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.051:59:5,2:1,0:28,28,2,1
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,8:0,0,14,7
chr2	228112235	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:15,3:14,0:13,16,2,1
chr2	228113191	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:228113191_T_TAG:228113191:2,2,0,1
chr2	228113197	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:228113191_T_TAG:228113191:2,2,0,1
chr2	228113219	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr2	228118403	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr2	228134759	.	G	GCCTAGTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr2	228141240	.	A	AATGGAAAGATTATTTAAATTCATTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr2	228141270	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	228145811	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	228146991	.	AATAT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.839:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr2	228157942	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:7,0:6,6,3,0
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr2	228194480	.	AG	TT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,4:8,7:7,7,7,5
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	228210900	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:7,0,2,2
chr2	228211071	.	T	TTAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	228220528	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:2,4,0,4
chr2	228356364	.	GT	G,GTT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,30,32;MFRL=126,108,128;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=25.85,9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,18,7:0.483,0.207:36:6,8,3:5,10,3:4,7,9,16
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=91,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	228476394	.	G	GAAAGGTCCAAAATAAGCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	228477814	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,4,5
chr2	228560834	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr2	228680153	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=152,146;MMQ=39,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	228736313	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	228736527	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	228741250	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	228750239	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	228788789	.	TGCAAGTCAAC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228788789_TGCAAGTCAAC_T:228788789:0,2,0,1
chr2	228788801	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228788789_TGCAAGTCAAC_T:228788789:0,2,0,1
chr2	228788805	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=114,112;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:228788789_TGCAAGTCAAC_T:228788789:0,1,0,2
chr2	228881310	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:228881310_T_C:228881310:6,5,1,1
chr2	228881315	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:5,0:0|1:228881310_T_C:228881310:6,5,1,1
chr2	228892238	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:8,5,0,2
chr2	228996637	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr2	228996650	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chr2	228996672	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,4,2
chr2	229890584	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:11,0:9,5,3,0
chr2	230020688	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.315:7:4,0:0,1:2,3,0,2
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,0:0,0,4,4
chr2	230223304	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=136,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:5,6,1,1
chr2	230223315	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:230223315_CA_C:230223315:6,7,1,1
chr2	230223318	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=133,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:230223315_CA_C:230223315:6,7,1,1
chr2	230223322	.	GAT	CTC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=133,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:6,2:0|1:230223315_CA_C:230223315:6,7,1,1
chr2	230312261	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,4:4,11:1,5,8,7
chr2	230453214	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,3:0,0:0,0,2,4
chr2	230636134	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:230636134_T_TC:230636134:1,0,1,0
chr2	230636138	.	T	TAGATATAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:230636134_T_TC:230636134:1,0,1,0
chr2	230643364	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	230662620	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:230662620_T_TTG:230662620:0,3,0,1
chr2	230662621	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,0:3,1:0|1:230662620_T_TTG:230662620:0,3,0,1
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:2,1,2,5
chr2	230673108	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:230673108_AC_TT:230673108:0,1,0,1
chr2	230673111	.	A	ACTGGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:230673108_AC_TT:230673108:0,1,0,1
chr2	230673113	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:230673108_AC_TT:230673108:0,1,0,1
chr2	230705516	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:2,1:6,1:9,3,2,1
chr2	230723777	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,2:7,3:6,9,2,3
chr2	230841074	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:1,4,0,3
chr2	230910330	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.147:31:15,4:12,0:10,17,2,2
chr2	231036768	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:1,2,3,0
chr2	231042276	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr2	231048445	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=114,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:231048445_T_TTC:231048445:0,1,0,1
chr2	231048450	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=114,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:231048445_T_TTC:231048445:0,1,0,1
chr2	231048453	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231048445_T_TTC:231048445:0,0,0,1
chr2	231076289	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr2	231081708	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=158,97;MMQ=46,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231081708_CC_AT:231081708:0,2,0,1
chr2	231081711	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=158,97;MMQ=46,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231081708_CC_AT:231081708:0,2,0,1
chr2	231081742	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=209,152;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	231120255	.	CG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	231152612	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=112,128;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,3:9,0:13,7,3,0
chr2	231152627	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=112,128;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:13,4:11,0:18,6,3,1
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,2:3,3:1,5,1,5
chr2	231175851	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,91;MMQ=48,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr2	231176038	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=169,122;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:4,1,1,2
chr2	231226488	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr2	231226517	.	C	CAAGAAGAAATAGGGTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:231226517_C_CAAGAAGAAATAGGGTT:231226517:0,3,0,1
chr2	231226519	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:231226517_C_CAAGAAGAAATAGGGTT:231226517:0,3,0,1
chr2	231253434	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	231254570	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	231254809	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	231256755	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr2	231305191	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:9,12:6,7:11,5,13,6
chr2	231328720	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:231328720_C_T:231328720:1,0,4,0
chr2	231328728	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0|1:231328720_C_T:231328720:1,0,4,0
chr2	231330899	.	C	CAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,23;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	231331160	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:0,1:1,0:0|1:231331160_A_AGG:231331160:0,1,0,1
chr2	231331162	.	T	TGGGAGAAGGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231331160_A_AGG:231331160:0,1,0,1
chr2	231331163	.	T	TCTTCTACTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231331160_A_AGG:231331160:0,1,0,1
chr2	231331799	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,1112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	231333834	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,4:3,1:5,5,2,3
chr2	231333852	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:3,4,1,3
chr2	231333890	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr2	231334421	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=123,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:2,2,2,5
chr2	231334504	.	AAAAG	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=109,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,27:0.585:46:3,11:11,16:9,10,21,6
chr2	231334532	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.451:61:10,5:19,18:24,9,9,19
chr2	231334613	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:1,7,1,5
chr2	231334679	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:6,2,4,2
chr2	231334773	.	GCTTC	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.261:25:8,6:9,0:0|1:231334773_GCTTC_G:231334773:9,10,0,6
chr2	231334778	.	AGGAAACCTGCAGCTCATCCCTAAGAAGAGG	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.182:37:9,6:8,0:0|1:231334773_GCTTC_G:231334773:17,14,0,6
chr2	231338211	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	231359098	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,1,2
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.639:14:1,4:2,4:2,3,3,6
chr2	231405572	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:1,1,3,3
chr2	231406194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	231407519	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr2	231407663	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:3,7:8,7:3,8,5,9
chr2	231741725	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	231742694	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=123,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr2	231742711	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	231927492	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,1:0|1:231927492_T_C:231927492:0,3,0,1
chr2	231927498	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231927492_T_C:231927492:0,2,0,1
chr2	231927506	.	C	CCAGGAGGGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231927492_T_C:231927492:0,2,0,1
chr2	231927507	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=137,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231927492_T_C:231927492:0,2,0,1
chr2	231940383	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231940383_T_A:231940383:0,1,0,1
chr2	231940386	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:231940383_T_A:231940383:0,1,0,1
chr2	231943520	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:231943520_T_C:231943520:1,2,0,1
chr2	231943522	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:0,0:0|1:231943520_T_C:231943520:1,2,0,1
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:5,2:2,6:0,7,3,5
chr2	231948515	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:231948515_C_A:231948515:0,1,0,1
chr2	231948524	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:231948515_C_A:231948515:0,0,0,1
chr2	231948529	.	C	CCCTAAGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,18;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:231948515_C_A:231948515:0,0,0,1
chr2	231948532	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:231948515_C_A:231948515:0,0,0,1
chr2	231948533	.	T	TCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:231948515_C_A:231948515:0,0,0,1
chr2	231974050	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:13,2:10,1:14,9,0,3
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:1,3:4,3:0,6,2,4
chr2	232035432	.	A	ATTTAACAAGTATTTACTCTAGATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:1,9,1,1
chr2	232072796	.	ATTTG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr2	232081546	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=104,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,2:6,0:1,6,0,2
chr2	232091473	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:5,6,3,1
chr2	232141250	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=144,196;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:232141250_T_TG:232141250:1,0,1,0
chr2	232141255	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=144,196;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:232141250_T_TG:232141250:1,0,1,0
chr2	232141265	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=148,196;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:232141250_T_TG:232141250:2,0,1,0
chr2	232196564	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,2,2
chr2	232196570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr2	232196597	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr2	232263127	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.430:18:3,2:7,3:5,5,2,6
chr2	232317351	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=122,102;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:10,1:14,2:18,6,2,1
chr2	232317621	.	C	CTGATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	232378231	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,1:0,12:0,0,5,8
chr2	232393423	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:4,9,0,2
chr2	232576551	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:12,3,4,0
chr2	232646521	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=101,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:1,5:13,6:9,5,5,6
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:1,2,0,3
chr2	232656567	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:0,3:1,1,1,3
chr2	232790053	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:233028070_A_G:233028070:1,0,2,0
chr2	233028086	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:233028070_A_G:233028070:2,0,1,0
chr2	233194495	.	T	TGCCCGGGGGGGGGGGGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=95,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,1:1,1:0|1:233194495_T_TGCCCGGGGGGGGGGGGCC:233194495:1,4,2,0
chr2	233194499	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=89,107;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.360:6:3,0:1,1:0|1:233194495_T_TGCCCGGGGGGGGGGGGCC:233194495:0,4,2,0
chr2	233198665	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233198665_T_C:233198665:1,0,0,1
chr2	233198666	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233198665_T_C:233198665:1,0,0,1
chr2	233199039	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	233199484	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,158;MMQ=52,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr2	233200652	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	233244007	.	ATA	TCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=123,14044;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.323:7:4,0:1,2:0|1:233244007_ATA_TCC:233244007:2,3,0,2
chr2	233244013	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=131,14044;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:233244007_ATA_TCC:233244007:1,3,0,2
chr2	233244015	.	C	CCCTCAAGAGCTTGTAGTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=138,14044;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:233244007_ATA_TCC:233244007:1,2,0,2
chr2	233246088	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=114,94;MMQ=60,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:13,4:8,0:5,18,1,3
chr2	233271697	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=103,118;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.534:9:0,4:3,0:0|1:233271697_TAC_T:233271697:2,2,1,4
chr2	233271716	.	A	ACACC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,17;MFRL=129,59;MMQ=51,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:5,0:5,1:1|0:233271697_TAC_T:233271697:3,11,2,0
chr2	233344991	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.679:6:0,2:0,2:0,2,2,2
chr2	233345819	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=84,83;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:3,2,3,1
chr2	233346541	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,59;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	233347043	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,72;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233347043_A_T:233347043:0,0,0,1
chr2	233347047	.	T	TGAGTACATAGCTTGCCCTGTTTGTGGCTGAGGGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,72;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233347043_A_T:233347043:0,0,0,1
chr2	233347407	.	C	CCTTGTGATCCACCCGCCTTAGCCTCCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	233348240	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr2	233393721	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	233393781	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233394888	.	A	AACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:233394888_A_AACC:233394888:0,2,0,1
chr2	233394889	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:233394888_A_AACC:233394888:0,2,0,1
chr2	233394894	.	C	CGGTCTCCCT,CAATTTTGAATGCATAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,25,33;MFRL=113,161,105;MMQ=60,60,60;MPOS=4,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr2	233394897	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	233398729	.	G	GGAAGTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,1,1
chr2	233407120	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=62,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	233408193	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233408193_C_CCCT:233408193:0,0,0,1
chr2	233408200	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233408193_C_CCCT:233408193:0,0,0,1
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	233408239	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	233413060	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=109176852,145;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233413060_GG_AA:233413060:0,2,0,1
chr2	233413063	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=109176852,145;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233413060_GG_AA:233413060:0,2,0,1
chr2	233413771	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=151,124;MMQ=60,52;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:2,5:3,1,9,3
chr2	233414449	.	GCTAA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:17,0:17,2:23,12,2,0
chr2	233414998	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:5,2:0|1:233414998_T_C:233414998:6,7,1,1
chr2	233415004	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:233414998_T_C:233414998:6,7,1,1
chr2	233415006	.	C	CTACCCTAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=115,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:233414998_T_C:233414998:6,7,1,1
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=76,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:1,4,2,6
chr2	233431751	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:4,2,0,3
chr2	233470991	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233470991_T_C:233470991:0,1,0,1
chr2	233470994	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233470991_T_C:233470991:0,1,0,1
chr2	233470995	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233470991_T_C:233470991:0,1,0,1
chr2	233537125	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=89,57;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:4,5,2,3
chr2	233537236	.	C	CCCTACCCTGTCCACTCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233612413	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=110,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,3:8,0:5,7,2,1
chr2	233633376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,1:1,1:5,3,2,0
chr2	233633431	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=151,116;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:11,5,3,0
chr2	233636055	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:233636055_G_GC:233636055:2,6,1,1
chr2	233636058	.	A	ACTCTCTCGCT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:5,2:0|1:233636055_G_GC:233636055:3,6,1,1
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,3,0
chr2	233641166	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:9,7,1,1
chr2	233641208	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:1,3,0,3
chr2	233655361	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	233655940	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,23;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,6:5,0:9,1,0,6
chr2	233659380	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=136,272;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233659380_G_GA:233659380:2,0,1,0
chr2	233659381	.	T	TGTCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=136,272;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233659380_G_GA:233659380:2,0,1,0
chr2	233660846	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:2,2,2,5
chr2	233709022	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,12,10
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=183,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,4:0,6:0,1,3,8
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr2	233755595	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:8,0,2,1
chr2	233759362	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	233759726	.	G	GATGGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	233785143	.	GCTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=149,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTC;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,1:0,2,2,0
chr2	233878044	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=57,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:233878044_C_CTT:233878044:1,1,0,1
chr2	233878045	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=57,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:233878044_C_CTT:233878044:1,1,0,1
chr2	233878047	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=57,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:233878044_C_CTT:233878044:1,1,0,1
chr2	233880548	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	233925166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	233986993	.	G	GGAAGGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=73,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233986993_G_GGAAGGAGA:233986993:0,2,0,1
chr2	233986998	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=73,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:233986993_G_GGAAGGAGA:233986993:0,2,0,1
chr2	233990412	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr2	233990588	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.148:22:5,3:14,0:7,12,0,3
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr2	234073101	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234073101_CA_AG:234073101:0,1,0,1
chr2	234073104	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:234073101_CA_AG:234073101:0,1,0,1
chr2	234073107	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:234073101_CA_AG:234073101:0,0,0,1
chr2	234078056	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr2	234078582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,335;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	234079288	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=118,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:3,2:10,10,0,2
chr2	234079345	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=152,114;MMQ=48,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.482:6:2,2:1,0:0,3,0,3
chr2	234091158	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,3,3
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr2	234104218	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=155,196;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,2,0,1
chr2	234104222	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,33;MFRL=155,196;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,2,0,1
chr2	234104226	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=153,196;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,1,0,1
chr2	234104230	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,31;MFRL=153,196;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,1,0,1
chr2	234104234	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=153,196;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,1,0,1
chr2	234104243	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=153,196;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234104218_TG_CT:234104218:0,1,0,1
chr2	234106806	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,78;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	234115497	.	G	GTCTGGGACAAGAACAGAAGGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=124,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:234115497_G_GTCTGGGACAAGAACAGAAGGGC:234115497:0,1,0,1
chr2	234115500	.	T	TCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=124,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:234115497_G_GTCTGGGACAAGAACAGAAGGGC:234115497:0,1,0,1
chr2	234160584	.	G	GCACCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:234160584_G_GCACCT:234160584:1,1,0,1
chr2	234160587	.	G	GCGCCACCAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:234160584_G_GCACCT:234160584:1,1,0,1
chr2	234160590	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:234160584_G_GCACCT:234160584:1,1,0,1
chr2	234160596	.	GC	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:234160584_G_GCACCT:234160584:1,1,0,1
chr2	234171958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,0:1,1:0|1:234171958_T_C:234171958:0,1,0,1
chr2	234171962	.	A	ACAACCTTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=154,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:234171958_T_C:234171958:0,1,0,1
chr2	234173503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=212,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	234178624	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:2,1:3,3:5,1,4,1
chr2	234181593	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,7:8,4:9,7,8,3
chr2	234183468	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,0:1,4:0,4,1,3
chr2	234198435	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234198435_T_G:234198435:1,1,1,0
chr2	234198438	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234198435_T_G:234198435:1,1,1,0
chr2	234198440	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234198435_T_G:234198435:1,1,1,0
chr2	234201939	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,3:7,0:7,7,2,1
chr2	234224866	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=114,201083536;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234224866_T_TG:234224866:0,1,0,1
chr2	234224870	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=114,201083536;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234224866_T_TG:234224866:0,1,0,1
chr2	234227693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	234231765	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=141,180;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234231765_C_T:234231765:0,1,0,1
chr2	234231772	.	TTG	ACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=148,180;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234231765_C_T:234231765:0,2,0,1
chr2	234235749	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:6,1:0,1:4,2,2,1
chr2	234237165	.	CA	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=126,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr2	234237340	.	C	CCCA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:0,0,0,1
chr2	234237344	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:0,0,0,1
chr2	234237346	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:0,0,0,1
chr2	234237349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,29;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:1,0,0,1
chr2	234237351	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,22;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:1,0,0,1
chr2	234237354	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234237340_C_CCCA:234237340:1,0,0,1
chr2	234238254	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	234240351	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=99,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,3:12,0:16,10,2,1
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,3:8,0:6,4,2,1
chr2	234343221	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234343221_A_T:234343221:0,1,0,1
chr2	234343223	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234343221_A_T:234343221:0,1,0,1
chr2	234343224	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234343221_A_T:234343221:0,1,0,1
chr2	234371049	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	234371101	.	C	CCTGGAGGGCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234372985	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	234389792	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr2	234394329	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:4,2,7,4
chr2	234396542	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:2,1,4,1
chr2	234398195	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	234400010	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	234405374	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	234407160	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=114,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,3:2,6:5,4,7,2
chr2	234408415	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,6:2,0:4,1,0,6
chr2	234408462	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,9:10,0:13,2,9,0
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:2,7,3,3
chr2	234433053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=135,159;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:9,2,2,0
chr2	234433055	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=147,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,3:6,0:9,1,2,1
chr2	234433056	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,4:6,0:7,1,3,1
chr2	234433066	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=143,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:9,2,1,1
chr2	234433071	.	C	T,G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,28,20;MFRL=139,62,70;MMQ=60,60,60;MPOS=26,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.94,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,2:0.158,0.158:16:5,2,2:5,0,0:11,1,2,2
chr2	234438247	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234438247_T_TC:234438247:0,1,0,1
chr2	234438248	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:234438247_T_TC:234438247:0,1,0,1
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,288;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr2	234449316	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=99,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:3,7,3,3
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=243,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.551:9:4,1:0,4:2,2,0,5
chr2	234526506	.	GG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=144,113;MMQ=46,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:234526506_GG_CT:234526506:1,1,1,0
chr2	234526512	.	TG	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=144,113;MMQ=46,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:234526506_GG_CT:234526506:1,1,1,0
chr2	234602157	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr2	234622367	.	TC	AA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=150,54;MMQ=55,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:234622367_TC_AA:234622367:5,7,1,1
chr2	234622371	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=153,54;MMQ=54,21;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:4,2:0|1:234622367_TC_AA:234622367:6,7,1,1
chr2	234622374	.	T	TCTGTTA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=153,54;MMQ=55,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:234622367_TC_AA:234622367:6,5,1,1
chr2	234622376	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=153,54;MMQ=55,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,1:0|1:234622367_TC_AA:234622367:6,5,1,1
chr2	234637905	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,62;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:234637905_C_CA:234637905:5,1,1,1
chr2	234637908	.	G	GTCTGGACTCCTTTTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=104,62;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:234637905_C_CA:234637905:5,1,1,1
chr2	234678110	.	CGT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:4,1:4,3,1,1
chr2	234704966	.	A	ACTTGTCTGATCTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=64,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	234708428	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,4,3
chr2	234708556	.	C	CCTATCTCCCCAACCAGTCATAGCATGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr2	234708840	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:6,2,2,1
chr2	234712203	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234712203_T_C:234712203:0,1,0,1
chr2	234712205	.	C	CACCCCACAAGTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234712203_T_C:234712203:0,1,0,1
chr2	234712207	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234712203_T_C:234712203:0,1,0,1
chr2	234713241	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:234713241_G_GGA:234713241:0,3,0,1
chr2	234713245	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:234713241_G_GGA:234713241:0,3,0,1
chr2	234713286	.	T	TGAGACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234713651	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234713651_TT_AG:234713651:1,0,1,0
chr2	234713656	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:234713651_TT_AG:234713651:1,0,1,0
chr2	234716513	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=110,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:234716513_T_C:234716513:1,3,0,1
chr2	234716520	.	AC	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=119,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:234716513_T_C:234716513:0,3,0,1
chr2	234716523	.	A	AGCATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=119,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:234716513_T_C:234716513:0,3,0,1
chr2	234726662	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=115,41;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr2	234727478	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	234731102	.	C	CCTTATGAAGTCATGCCTTGCTTCCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr2	234740797	.	C	CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:2,1,2,1
chr2	234740798	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=106,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:2,1,2,1
chr2	234740967	.	G	GATGAGCGGGGAGGATCGCTTGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,21;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:0,1,2,2
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=88,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	234846247	.	C	CCTTCGTTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234846247_C_CCTTCGTTGG:234846247:0,0,0,1
chr2	234846248	.	A	AAACG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234846247_C_CCTTCGTTGG:234846247:0,0,0,1
chr2	234847809	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=176,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr2	234878502	.	ACA	GTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=130,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.255:10:4,2:3,0:0|1:234878502_ACA_GTG:234878502:0,8,0,2
chr2	234878506	.	GCATCCACA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:234878502_ACA_GTG:234878502:0,7,0,2
chr2	234878516	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:234878502_ACA_GTG:234878502:0,6,0,2
chr2	235404575	.	TCCATCCATCCAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:3,0,1,0
chr2	235405230	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	235950967	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=164,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0,8,1,2
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	236617736	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr2	236682850	.	GGCACATCTATAAACTAAAAAT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr2	236682856	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	236682914	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	236685731	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:3,3:4,0:4,5,0,3
chr2	236685762	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=144,137;MMQ=40,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	236685770	.	AGGCG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=142,134;MMQ=40,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:236685770_AGGCG_A:236685770:0,2,0,1
chr2	236685779	.	GATC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=142,134;MMQ=40,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:236685770_AGGCG_A:236685770:0,2,0,1
chr2	236706590	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236706590_TTC_T:236706590:0,0,0,1
chr2	236706593	.	C	CACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:236706590_TTC_T:236706590:0,0,0,1
chr2	236716006	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	236761396	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,4:5,8:2,5,2,10
chr2	236761414	.	C	CCAGG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=138,126;MMQ=59,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGG;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:4,2:8,3:7,5,2,3
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	236954534	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,2,1
chr2	236954560	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=81,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,0:4,3:4,4,2,2
chr2	237028990	.	C	CTCCCCGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	237029104	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:2,2,2,1
chr2	237076579	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,0:1,2:1,1,1,1
chr2	237103666	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=107,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:14,0:5,5:13,6,0,5
chr2	237104772	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	237105076	.	GTCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=46,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:237105076_GTCTC_G:237105076:1,3,0,2
chr2	237105084	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:237105076_GTCTC_G:237105076:1,2,0,2
chr2	237247005	.	T	TTATATTGTATTTGATATAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=87,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:0,0:3,1:0|1:237247005_T_TTATATTGTATTTGATATAA:237247005:1,2,0,1
chr2	237247008	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=87,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:237247005_T_TTATATTGTATTTGATATAA:237247005:1,2,0,1
chr2	237252454	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:2,2,0,2
chr2	237255303	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.274:15:1,3:10,0:5,6,2,2
chr2	237272694	.	A	AAAATACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237272694_A_AAAATACC:237272694:0,0,0,1
chr2	237272696	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:237272694_A_AAAATACC:237272694:0,0,0,1
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chr2	237405706	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	237490793	.	TGTTTTG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:9,9:3,9:7,7,12,8
chr2	237994575	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr2	237997369	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	238166238	.	C	CTCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:1,0:2,2:0|1:238166238_C_CTCA:238166238:0,3,1,1
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chr2	238166240	.	A	AAGCCTGGCTTCACTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=173,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:1,0:2,2:0|1:238166238_C_CTCA:238166238:0,3,1,1
chr2	238245091	.	GGTCACCGGCTTCGTCGTA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:8,0:9,2:8,22,1,1
chr2	238262160	.	A	ATTGGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238262160_A_ATTGGTT:238262160:0,0,0,1
chr2	238262162	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:238262160_A_ATTGGTT:238262160:0,0,0,1
chr2	238269833	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:4,5,2,2
chr2	238271991	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.512:31:4,9:11,6:8,7,8,8
chr2	238283463	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,2:8,2:7,6,2,2
chr2	238285884	.	A	ACACATCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr2	238289995	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	238290000	.	T	TCAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238290000_T_TCAA:238290000:0,2,0,1
chr2	238290001	.	G	GAAAAGGTAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238290000_T_TCAA:238290000:0,2,0,1
chr2	238290005	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238290005_C_CTG:238290005:0,2,0,1
chr2	238290006	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,21;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:238290005_C_CTG:238290005:0,2,0,1
chr2	238296769	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=109,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:6,5,5,0
chr2	238303300	.	T	TGGGAAAACCATTTTATGAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.307:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr2	238402228	.	C	CACAACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238402228_C_CACAACA:238402228:0,1,0,1
chr2	238402230	.	C	CTAACTTCATAAGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238402228_C_CACAACA:238402228:0,1,0,1
chr2	238419543	.	C	CGTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=GT;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	238419611	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,2:1,1:2,1,1,3
chr2	238449107	.	AG	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	238475221	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	238475826	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=56,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,1:1,7:0,2,2,6
chr2	238485256	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,2:2,3:8,2,2,3
chr2	238485799	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	238494161	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.427:14:5,1:3,3:3,5,3,3
chr2	238499863	.	A	AAATTCTTCAGGAGACTCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:4,5:5,4:0|1:238499863_A_AAATTCTTCAGGAGACTCT:238499863:8,3,6,7
chr2	238499866	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:0|1:238499863_A_AAATTCTTCAGGAGACTCT:238499863:8,3,4,6
chr2	238499969	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:1,6,1,2
chr2	238500642	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=132,117;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:238500642_A_G:238500642:0,1,0,3
chr2	238500666	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238500642_A_G:238500642:0,1,0,1
chr2	238500668	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:238500642_A_G:238500642:0,1,0,1
chr2	238500671	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238500642_A_G:238500642:0,0,0,1
chr2	238500676	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238500642_A_G:238500642:0,0,0,1
chr2	238648020	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:238648020_TT_CC:238648020:0,1,0,1
chr2	238648024	.	AA	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:238648020_TT_CC:238648020:0,1,0,1
chr2	238648027	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:238648020_TT_CC:238648020:0,1,0,1
chr2	238662184	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238662184_A_G:238662184:0,0,0,1
chr2	238662185	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238662184_A_G:238662184:0,0,0,1
chr2	238662188	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238662184_A_G:238662184:0,0,0,1
chr2	238662190	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:238662184_A_G:238662184:0,0,0,1
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	238726696	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=109,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr2	238730057	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=123,3313;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:6,13,0,2
chr2	238730334	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,73;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,4:5,0:8,0,3,1
chr2	238733082	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	238899110	.	G	GACTAATTCTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	238899129	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=154,165;MMQ=60,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:238899129_C_T:238899129:0,1,0,1
chr2	238899137	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=154,165;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:238899129_C_T:238899129:0,1,0,1
chr2	238899139	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=165,154;MMQ=42,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:238899139_G_A:238899139:0,1,0,1
chr2	238899145	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=165,154;MMQ=42,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:238899139_G_A:238899139:0,1,0,1
chr2	238899152	.	TT	CA,CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30,32;MFRL=0,154,165;MMQ=60,60,42;MPOS=7,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,0,2
chr2	238899157	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=165,154;MMQ=42,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:238899139_G_A:238899139:0,1,0,1
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	238982451	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,163;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr2	238990328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:3,5,2,0
chr2	238990387	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=92,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:4,5,0,2
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=29.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:4,1,7,2
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:2,3:3,5:3,2,4,4
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr2	239033901	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,1:1,1:1,1,1,2
chr2	239033918	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,0:0,8,2,0
chr2	239034043	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.671:10:2,5:1,2:2,1,5,2
chr2	239036270	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=92,123;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,4:9,3:6,7,6,2
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	239053685	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	239054358	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:4,3,5,5
chr2	239056746	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	239059767	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239059767_G_C:239059767:0,0,0,1
chr2	239059769	.	C	CATGCATCATTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239059767_G_C:239059767:0,0,0,1
chr2	239073046	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr2	239079766	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,4,3
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,0:1,5:2,0,4,1
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr2	239136450	.	G	GATC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=109,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:239136450_G_GATC:239136450:2,3,1,1
chr2	239136452	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:239136450_G_GATC:239136450:2,3,1,1
chr2	239139821	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:3,6:6,2:3,7,4,4
chr2	239148970	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr2	239155241	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:239155241_GGC_G:239155241:0,1,0,1
chr2	239155246	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=172,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:239155241_GGC_G:239155241:0,1,0,1
chr2	239162182	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,2,1
chr2	239170376	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr2	239185889	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:239185889_T_C:239185889:0,0,0,1
chr2	239185890	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:239185889_T_C:239185889:0,0,0,1
chr2	239185894	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:239185889_T_C:239185889:0,0,0,1
chr2	239233977	.	CTCTACACAGACGCCGAGATGAAGTCTGATAATGTGAAGGTGGGTTTGAGTCGGGCT	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=131,63;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:5,2:4,0:9,7,1,1
chr2	239234060	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=147,107;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	239234107	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:239234107_G_GAT:239234107:0,0,0,1
chr2	239234109	.	T	TTTTACATCCTTACAAATTCCTCTCCTCCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239234107_G_GAT:239234107:0,0,0,1
chr2	239234110	.	G	GCCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239234107_G_GAT:239234107:0,0,0,1
chr2	239237751	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=102,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,37:0.440:85:24,22:21,15:21,27,17,20
chr2	239238036	.	C	CTCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239238036_C_CTCT:239238036:0,0,0,1
chr2	239238040	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239238036_C_CTCT:239238036:0,0,0,1
chr2	239238041	.	A	ACGGACATG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239238036_C_CTCT:239238036:0,0,0,1
chr2	239238047	.	TT	AA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:239238036_C_CTCT:239238036:0,0,0,1
chr2	239241445	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.245:15:8,2:3,1:7,5,1,2
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=95,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:1,1:1,4:1,3,5,3
chr2	239247029	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,6:7,6:5,9,9,3
chr2	239353001	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=78,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:7,1:5,4,2,2
chr2	239355213	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	240003921	.	A	ATGAGAGTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=97,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr2	240009199	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,4,1
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	240037032	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr2	240048445	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:240048445_G_C:240048445:0,2,0,1
chr2	240048446	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:240048445_G_C:240048445:0,2,0,1
chr2	240048447	.	G	GGAAGGAAGGAAGGAGAAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=119,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	240056428	.	G	GCCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240056428_G_GCCCA:240056428:0,1,0,1
chr2	240056433	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240056428_G_GCCCA:240056428:0,1,0,1
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr2	240085674	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	240323905	.	T	TG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:5,4:12,10:10,7,9,5
chr2	240500294	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=111,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:5,1,2,0
chr2	240500413	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,3,3
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	240701908	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	240834539	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=55959876,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr2	240900607	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,2:2,4:4,3,1,5
chr2	240923146	.	TC	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=100,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,7:3,4:2,3,3,8
chr2	240946897	.	T	TTCTCTCCCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:240946897_T_TTCTCTCCCTC:240946897:0,0,0,1
chr2	240946903	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:240946897_T_TTCTCTCCCTC:240946897:0,0,0,1
chr2	240946905	.	A	ATCTTTCTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:240946897_T_TTCTCTCCCTC:240946897:0,0,0,1
chr2	240954110	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr2	240958098	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=143,75;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:240958098_T_TC:240958098:1,3,0,1
chr2	240958100	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=143,75;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:240958098_T_TC:240958098:1,3,0,1
chr2	240958101	.	C	CTTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=143,75;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:240958098_T_TC:240958098:1,3,0,1
chr2	240958106	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=143,75;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:240958098_T_TC:240958098:1,3,0,1
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	240958136	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr2	240961852	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	240969391	.	G	GAAGGCTGACTGACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,186;MMQ=27,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	240981179	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	240984526	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=104,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:6,0:4,3:4,6,1,2
chr2	240985511	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	240985552	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=143,136;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:240985552_G_T:240985552:0,1,0,1
chr2	240985553	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=143,136;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:240985552_G_T:240985552:0,1,0,1
chr2	240985558	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,136;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:240985552_G_T:240985552:0,1,0,1
chr2	241066180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:3,8,1,2
chr2	241066395	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241073450	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:1,4:4,3:1,4,3,4
chr2	241075809	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241390516	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr2	241403955	.	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	241404941	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:6,3,1,1
chr2	241405454	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=122,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,3,2
chr2	241405485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,2:3,3:2,1,4,2
chr2	241420288	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241439809	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:3,1,2,3
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:3,2,1,4
chr2	241463880	.	TGCCCGTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,208322549;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241463880_TGCCCGTGG_T:241463880:0,0,0,1
chr2	241463891	.	TAGAGC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,208322549;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241463880_TGCCCGTGG_T:241463880:0,0,0,1
chr2	241463897	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,208322549;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241463880_TGCCCGTGG_T:241463880:0,0,0,1
chr2	241468999	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:241468999_C_T:241468999:0,0,0,1
chr2	241469001	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:241468999_C_T:241468999:0,0,0,1
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr2	241513249	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr2	241517127	.	C	CTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr2	241531255	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	241531978	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr2	241532024	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=126,146;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:241532024_AAG_A:241532024:0,1,0,1
chr2	241532032	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=126,146;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:241532024_AAG_A:241532024:0,1,0,1
chr2	241532039	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=126,146;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:241532024_AAG_A:241532024:0,1,0,1
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	241556361	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:8,0:9,8,2,0
chr2	241621866	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:241621866_C_T:241621866:0,0,1,0
chr2	241621883	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=174,162;MMQ=57,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241621866_C_T:241621866:0,1,1,0
chr2	241666418	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	241667867	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=111,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:241667867_A_G:241667867:1,3,0,1
chr2	241667869	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=111,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:241667867_A_G:241667867:1,3,0,1
chr2	241674086	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=72,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:9,3,2,0
chr2	241674222	.	TG	CA,CG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32,22;MFRL=0,166,86;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.46,17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,7:0.308,0.620:10:0,2,3:0,1,4:0,0,1,9
chr2	241685268	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=63,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,3:9,0:6,6,3,0
chr2	241685525	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=132,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:241685525_C_T:241685525:5,6,1,1
chr2	241685530	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=132,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:241685525_C_T:241685525:5,6,1,1
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.725:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241705288	.	C	CAGCTTCCCCCGTTCAGTCTTTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=184,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:241705288_C_CAGCTTCCCCCGTTCAGTCTTTCA:241705288:0,4,0,1
chr2	241705290	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:241705288_C_CAGCTTCCCCCGTTCAGTCTTTCA:241705288:0,4,0,1
chr2	241705301	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	241706766	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,0,1
chr2	241706851	.	A	AAGAGCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	241710675	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0|1:241710675_AT_A:241710675:0,1,0,1
chr2	241710677	.	GGGGCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241710675_AT_A:241710675:0,1,0,1
chr2	241710688	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241710675_AT_A:241710675:0,1,0,1
chr2	241710690	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241710675_AT_A:241710675:0,1,0,1
chr2	241710698	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241710675_AT_A:241710675:0,1,0,1
chr2	241712020	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,0:4,2:0|1:241712020_G_A:241712020:8,7,0,2
chr2	241712025	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:241712020_G_A:241712020:10,7,0,2
chr2	241712028	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:4,2:0|1:241712020_G_A:241712020:10,7,0,2
chr2	241712031	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=30,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:241712020_G_A:241712020:10,2,0,2
chr2	241712034	.	G	GGACCCTCATGA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=30,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:5,2:0|1:241712020_G_A:241712020:10,2,0,2
chr2	241722360	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241722445	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=65,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	241723197	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=95,664;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr2	241726646	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	241726703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr2	241737017	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	241808307	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:2,0:1,3,2,0
chr2	241808825	.	AGGCCTCCCT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCCTCCCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr2	241827618	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr2	241830944	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,55991376;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:241830944_G_T:241830944:0,0,1,1
chr2	241830969	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:241830944_G_T:241830944:0,0,1,2
chr2	241831264	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	241831296	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr2	241861904	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241869646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr2	241872206	.	C	CAAACACACACACCCCTATAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,34;MFRL=81,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:241872206_C_CAAACACACACACCCCTATAGA:241872206:1,1,0,1
chr2	241872210	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=81,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:241872206_C_CAAACACACACACCCCTATAGA:241872206:1,1,0,1
chr2	241873291	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241873908	.	CACAA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:4,1:0|1:241873908_CACAA_C:241873908:0,12,2,0
chr2	241873917	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,1:7,0:0|1:241873908_CACAA_C:241873908:0,12,2,0
chr2	241874450	.	A	AGTAGGGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0|1:241874450_A_AGTAGGGT:241874450:5,4,1,1
chr2	241874453	.	A	ATTC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:241874450_A_AGTAGGGT:241874450:5,5,1,1
chr2	241874454	.	G	GATCCCTAT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,1:0|1:241874450_A_AGTAGGGT:241874450:5,5,1,1
chr2	241888528	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:6,7:6,1:7,5,2,6
chr2	241904781	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,0:0,3:1,2,2,1
chr2	241905189	.	A	AGGTGTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:241905189_A_AGGTGTT:241905189:4,3,1,1
chr2	241905191	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:241905189_A_AGGTGTT:241905189:4,3,1,1
chr2	241905194	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:241905189_A_AGGTGTT:241905189:4,3,1,1
chr2	241932596	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	241976394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241980164	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	242004166	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:242004166_G_C:242004166:2,0,1,0
chr2	242004169	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:242004166_G_C:242004166:2,0,1,0
chr2	242004175	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,15;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:242004166_G_C:242004166:2,0,1,0
chr2	242004180	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,24;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:242004166_G_C:242004166:2,0,1,0
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	242004310	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr2	242005035	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=107,138;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:242005035_T_C:242005035:0,4,0,1
chr2	242005036	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:242005036_C_T:242005036:0,4,0,1
chr2	242005041	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=107,138;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:242005035_T_C:242005035:0,4,0,1
chr2	242005042	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:242005036_C_T:242005036:0,4,0,1
chr2	242005043	.	C	CTGTCTCTAGTTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=107,138;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:242005035_T_C:242005035:0,4,0,1
chr2	242005052	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=77,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:242005036_C_T:242005036:0,2,0,1
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242011330	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr2	242028878	.	G	GGGAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,1:5,1:0|1:242028878_G_GGGAA:242028878:1,8,0,2
chr2	242028879	.	T	TTAG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:3,1:5,1:0|1:242028878_G_GGGAA:242028878:1,9,0,2
chr2	242028881	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:6,1:0|1:242028878_G_GGGAA:242028878:1,9,0,2
chr2	242028882	.	C	CACA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=120,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:0|1:242028878_G_GGGAA:242028878:1,9,0,2
chr2	242029737	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,11:5,4:4,10,9,6
chr2	242029864	.	TC	CG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:242029864_TC_CG:242029864:0,0,0,1
chr2	242029873	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242029864_TC_CG:242029864:0,0,0,1
chr2	242029876	.	ATGAAGAGTATAGT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242029864_TC_CG:242029864:0,0,0,1
chr2	242035500	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=133,99;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:7,2:18,1:11,14,0,3
chr2	242035506	.	ATTGTCCTCC	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=112,110;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:8,2:19,0:0|1:242035506_ATTGTCCTCC_A:242035506:13,21,0,2
chr2	242035524	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=108,110;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:7,2:21,0:0|1:242035506_ATTGTCCTCC_A:242035506:11,19,0,2
chr2	242035530	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=107,110;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:8,2:20,0:0|1:242035506_ATTGTCCTCC_A:242035506:10,19,0,2
chr2	242035536	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=108,110;MMQ=60,40;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:9,1:19,0:0|1:242035506_ATTGTCCTCC_A:242035506:10,18,0,2
chr2	242036852	.	A	AAACCTATTC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=135,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr2	242036912	.	C	CAGTTGCCCCTCTGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242054410	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,0:9,4:5,7,1,3
chr2	242054563	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:242054563_G_A:242054563:1,4,1,1
chr2	242054565	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:242054563_G_A:242054563:1,4,1,1
chr2	242062130	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=94,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:8,1,4,1
chr2	242065601	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,4,2
chr2	242079116	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	242079233	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	242082222	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr2	242122768	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,77;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:13,6,1,2
chr2	242135224	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=94,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:4,3,1,2
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	242147085	.	G	GCATTTCTTAAAAAAAATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:242147085_G_GCATTTCTTAAAAAAAATA:242147085:0,0,1,1
chr2	242147086	.	G	GTTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:242147085_G_GCATTTCTTAAAAAAAATA:242147085:0,0,1,1
chr2	242151585	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr2	242152090	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,136;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:1,0:9,3:0|1:242152090_C_T:242152090:1,9,0,3
chr2	242152094	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=133,136;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,0:8,3:0|1:242152090_C_T:242152090:1,9,0,3
chr2	242168967	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=118,71;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:1,1:3,3,1,1
chr2	242176081	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=76,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:10,7,1,1
chr2	242179134	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	242186311	.	A	ACAAAGGCAGAAAACTGCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:242186311_A_ACAAAGGCAGAAAACTGCT:242186311:0,2,0,1
chr2	242186314	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:242186311_A_ACAAAGGCAGAAAACTGCT:242186311:0,2,0,1
chr2	242186317	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:242186311_A_ACAAAGGCAGAAAACTGCT:242186311:0,2,0,1
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,13,6
chr2	242275181	.	TTTTAACCTTCCCCAGTAGCACAATAATCTTAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242276204	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,1:13,3:17,11,1,3
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	242312477	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:3,1:2,2:6,0,2,1
chr2	242371263	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=176,97;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:242371263_T_TC:242371263:0,4,0,1
chr2	242371266	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=176,97;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:242371263_T_TC:242371263:0,4,0,1
chr2	242373819	.	GTGT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:242373819_GTGT_G:242373819:0,1,0,1
chr2	242373823	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:242373819_GTGT_G:242373819:0,1,0,1
chr2	242373826	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:242373819_GTGT_G:242373819:0,1,0,1
chr2	242374519	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chr2	242381187	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=87,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:242381187_A_C:242381187:0,1,0,1
chr2	242381191	.	TGA	CCG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:242381187_A_C:242381187:0,2,0,1
chr2	242396087	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	242402061	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr2	242403491	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:242403491_G_T:242403491:0,1,0,1
chr2	242403492	.	A	ATAAACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:242403491_G_T:242403491:0,1,0,1
chr2	242407478	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	242432704	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	242440305	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:242440305_G_A:242440305:1,4,1,1
chr2	242440313	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:242440305_G_A:242440305:1,4,1,1
chr2	242440316	.	C	CTGTTTTCTTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=110,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:242440305_G_A:242440305:1,3,1,1
chr2	242541390	.	TCGCCCTCCTCCACTTCCACCA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=115,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	242573365	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:2,9,1,1
chr2	242573384	.	T	TTCAGAGGGATAACTGGACTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:3,2:5,6,1,1
chr2	242593114	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242594006	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=99,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:16,4:12,0:12,16,0,4
chr2	242605963	.	GC	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=194,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	242610159	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=111,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr2	242610203	.	T	TTGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242610203_T_TTGG:242610203:0,0,0,1
chr2	242610205	.	G	GTTTGCTGGAGGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242610203_T_TTGG:242610203:0,0,0,1
chr2	242610208	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242610203_T_TTGG:242610203:0,0,0,1
chr2	242610210	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:242610203_T_TTGG:242610203:0,0,0,1
chr2	242615676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=144,73;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.493:4:1,0:0,2:0|1:242615676_G_A:242615676:0,2,1,1
chr2	242615682	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=156,73;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:242615676_G_A:242615676:0,2,0,1
chr2	242615684	.	G	GACTCAGCGAAGAATTCCTCACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=156,73;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:242615676_G_A:242615676:0,2,0,1
chr2	242615687	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=156,73;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:242615676_G_A:242615676:0,2,0,1
chr2	242619834	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,166;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,4,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,4,0
chr2	242664457	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,1,0
chr2	242680366	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.827:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	242682029	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	242684115	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	242688203	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,7,5
chr2	242695497	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	242741124	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242743651	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	242756130	.	G	GCGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:242756130_G_GCGGA:242756130:0,0,0,1
chr2	242756137	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:242756130_G_GCGGA:242756130:0,0,0,1
chr2	242757489	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:4,2:5,7,2,2
chr2	242757890	.	C	CATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	242814569	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr3	391100	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	402125	.	C	CATCAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:402125_C_CATCAG:402125:1,2,0,1
chr3	402128	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=111,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:402125_C_CATCAG:402125:1,2,0,1
chr3	402131	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:402125_C_CATCAG:402125:1,1,0,1
chr3	402141	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:402141_T_A:402141:1,0,0,1
chr3	402143	.	T	TGTATGGTTAATC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:402141_T_A:402141:1,0,0,1
chr3	403288	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:403288_G_A:403288:0,0,1,0
chr3	403297	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:403288_G_A:403288:0,0,2,0
chr3	403308	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	425619	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	430970	.	A	ACATTTGTTTTTTGTTTTTGTTGTTTGTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=91,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:6,2:3,0:5,4,1,1
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	1363607	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	1367520	.	A	ACGGAACGGAACGGAACGGACTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	1371517	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:7,6,0,2
chr3	1414557	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,772;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr3	1443070	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	2861255	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=127,46;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:3,4,2,0
chr3	3076324	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:3076324_G_A:3076324:3,1,0,1
chr3	3076328	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:3076324_G_A:3076324:3,1,0,1
chr3	3076331	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:3076324_G_A:3076324:3,1,0,1
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	3084008	.	C	CTTAAGTTTAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,0:6,2:5,3,1,1
chr3	3084129	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=87,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:3084129_G_GGA:3084129:0,1,0,1
chr3	3084132	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=87,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3084129_G_GGA:3084129:0,1,0,1
chr3	3085418	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3085418_T_A:3085418:0,1,0,1
chr3	3085420	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3085418_T_A:3085418:0,1,0,1
chr3	3095404	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	3116371	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	3116630	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	3118330	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,166;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.365:23:8,0:7,8:4,11,0,8
chr3	3134139	.	ACTCACTGT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	3137155	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.914:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=101,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr3	3189059	.	TG	CA,CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30,29;MFRL=0,142,138;MMQ=60,60,60;MPOS=21,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.77,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.637,0.272:8:0,3,0:0,2,2:0,0,8,0
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,1:3,5,1,2
chr3	3194107	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=97,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.220:27:8,5:8,1:11,10,4,2
chr3	3195574	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.684:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	3195824	.	T	TTGGCAGTGCTATCCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,16:0,6:0,0,13,9
chr3	3197952	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=108,104;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:15,1:10,5:13,12,1,5
chr3	3209242	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	3216012	.	C	CATAGATTCCAAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	3888664	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,4:2,5:2,2,3,6
chr3	3889222	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	4345864	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=151,139;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4345864_C_T:4345864:0,1,0,1
chr3	4345873	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=151,139;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4345864_C_T:4345864:0,1,0,1
chr3	4403817	.	TT	AC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=73,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr3	4403837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,2,1
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr3	4491113	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4491113_T_G:4491113:0,0,0,1
chr3	4491120	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4491113_T_G:4491113:0,0,0,1
chr3	4491121	.	G	GGAAGTCATAAGAAAGAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4491113_T_G:4491113:0,0,0,1
chr3	4669364	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr3	4693983	.	T	TCTATATCTCTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	4695446	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:5,1,1,2
chr3	4704966	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=139,105;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4704966_G_A:4704966:0,4,0,1
chr3	4704970	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,105;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:4704966_G_A:4704966:0,4,0,1
chr3	4707049	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=143,143;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr3	4716672	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=73,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	4738774	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	4739032	.	G	GCATGGTGTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	4748076	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4748076_T_TC:4748076:0,0,0,1
chr3	4748078	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4748076_T_TC:4748076:0,0,0,1
chr3	4748080	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4748076_T_TC:4748076:0,0,0,1
chr3	4829575	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,6,2
chr3	4856234	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:3,6,2,2
chr3	4856278	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4856278_AG_A:4856278:1,0,0,1
chr3	4856285	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:4856278_AG_A:4856278:1,0,0,1
chr3	4856991	.	G	GTTTAAGGGGATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	4878445	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=27973748,205;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4878445_A_T:4878445:0,2,1,0
chr3	4878448	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=27973748,205;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:4878445_A_T:4878445:0,2,1,0
chr3	5025401	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:5025401_T_TGC:5025401:0,0,0,1
chr3	5025405	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5025401_T_TGC:5025401:0,0,0,1
chr3	5213919	.	T	TGGGAAAACC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:14,2:10,0:0|1:5213919_T_TGGGAAAACC:5213919:9,15,1,1
chr3	5213920	.	T	TGGG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:14,1:8,0:0|1:5213919_T_TGGGAAAACC:5213919:9,15,1,1
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	7188072	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	7188116	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=100,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:2,2,3,0
chr3	7340583	.	G	GAACTAGGAAGTTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	7494565	.	CTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	7621093	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,3:1,1:0,1,2,3
chr3	7721906	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=126,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,1,3
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr3	8578921	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,0:3,2:3,4,2,0
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	8669361	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:8669361_C_A:8669361:0,0,7,3
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.921:9:0,4:0,4:0|1:8669361_C_A:8669361:0,0,6,3
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,3:0,0,5,4
chr3	8673678	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	8673897	.	A	AATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8673897_A_AATAT:8673897:0,1,0,1
chr3	8673898	.	CTGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=101,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8673897_A_AATAT:8673897:0,1,0,1
chr3	8775661	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=147,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8775661_C_T:8775661:0,2,0,1
chr3	8775669	.	T	TAAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8775661_C_T:8775661:0,1,0,1
chr3	8775671	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8775661_C_T:8775661:0,1,0,1
chr3	8775673	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8775661_C_T:8775661:0,1,0,1
chr3	8809162	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:8809162_C_T:8809162:1,3,0,5
chr3	8809184	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:8809162_C_T:8809162:0,0,3,4
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr3	8940765	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr3	8944303	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	9034558	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:7,2,3,1
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr3	9055273	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:9055273_G_GCT:9055273:0,0,0,2
chr3	9055275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:9055273_G_GCT:9055273:0,0,0,2
chr3	9055282	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:9055273_G_GCT:9055273:0,0,0,2
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr3	9069873	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	9098098	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	9102133	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=204,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:9102133_CA_TG:9102133:0,3,0,1
chr3	9102136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:9102133_CA_TG:9102133:0,3,0,1
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	9407022	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	9407094	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9407094_G_GC:9407094:0,1,0,1
chr3	9407095	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9407094_G_GC:9407094:0,1,0,1
chr3	9407101	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9407094_G_GC:9407094:0,1,0,1
chr3	9407104	.	GC	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9407094_G_GC:9407094:0,1,0,1
chr3	9419572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=106,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,2:8,0:2,7,0,2
chr3	9419592	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:9419592_T_C:9419592:0,3,0,1
chr3	9419594	.	TT	AG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=141,72;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:9419592_T_C:9419592:0,4,0,1
chr3	9419599	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,25;MFRL=141,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9419592_T_C:9419592:0,4,0,1
chr3	9419603	.	AGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,21;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9419592_T_C:9419592:0,3,0,1
chr3	9419608	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9419592_T_C:9419592:0,3,0,1
chr3	9426330	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,1370;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr3	9478642	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,3:3,0:3,9,1,2
chr3	9486990	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=111,131;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,1:0|1:9486990_C_T:9486990:4,10,2,0
chr3	9486992	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=111,131;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:9486990_C_T:9486990:4,10,2,0
chr3	9486996	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=134,34;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr3	9488735	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,0:5,3:6,7,1,2
chr3	9489045	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9489045_A_T:9489045:0,1,0,1
chr3	9489047	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9489045_A_T:9489045:0,1,0,1
chr3	9489048	.	C	CTTTGTCCTCTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9489045_A_T:9489045:0,1,0,1
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr3	9594398	.	T	TAGGAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	9691526	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	9712875	.	C	CCCTATTCCTTTGGCAGATGGTCTCAAGAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:4,5,2,1
chr3	9719141	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr3	9726838	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,7:6,0:5,4,7,0
chr3	9730541	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:9730541_T_G:9730541:1,2,0,2
chr3	9730543	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:9730541_T_G:9730541:1,2,0,2
chr3	9730545	.	TCCCAG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,27;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:9730541_T_G:9730541:1,2,0,2
chr3	9730553	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:9730541_T_G:9730541:1,2,0,2
chr3	9730555	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,30;MFRL=113,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:9730541_T_G:9730541:1,2,0,2
chr3	9757086	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:4,2,1,2
chr3	9757582	.	CCCT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,5:3,1:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:2,1,4,3
chr3	9757586	.	ATGGGCCTCACTT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,5:3,1:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:2,1,4,3
chr3	9757754	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	9759922	.	C	CTTATT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9759922_C_CTTATT:9759922:0,1,0,1
chr3	9759923	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9759922_C_CTTATT:9759922:0,1,0,1
chr3	9759925	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9759922_C_CTTATT:9759922:0,1,0,1
chr3	9759928	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9759922_C_CTTATT:9759922:0,1,0,1
chr3	9759929	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=218,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:9759922_C_CTTATT:9759922:0,1,0,1
chr3	9771336	.	C	CAATGCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr3	9781322	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=214,117;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:2,1,0,3
chr3	9785559	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=146,61;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,0:1,2:0,4,0,3
chr3	9799263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,1,3
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr3	9822275	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9825978	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9825978_G_A:9825978:0,0,0,1
chr3	9825984	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9825978_G_A:9825978:0,0,0,1
chr3	9831554	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:9831554_G_C:9831554:1,0,0,1
chr3	9831559	.	C	CAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=12,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:9831554_G_C:9831554:1,0,0,1
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	9852347	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:7,2:6,0:8,6,2,0
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr3	9871180	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9882572	.	C	CATTTAAAACCTGGATCTACCACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9912003	.	G	GGTTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9912003_G_GGTTGT:9912003:0,0,0,1
chr3	9912005	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9912003_G_GGTTGT:9912003:0,0,0,1
chr3	9920161	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:8,4,0,2
chr3	9932337	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr3	9934759	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=110,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.184:29:8,0:14,4:14,10,0,5
chr3	9944767	.	G	GAGTGCGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=219,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	9959821	.	G	GTGAAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:9959821_G_GTGAAAT:9959821:0,0,0,1
chr3	9959823	.	G	GATCTATGTAGGTTTATTATAGTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9959821_G_GTGAAAT:9959821:0,0,0,1
chr3	9960288	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=108,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:3,2:1,3:1,3,1,4
chr3	9960291	.	G	GGATC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:1,6,1,1
chr3	9962623	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr3	9965649	.	C	CCCTTCCCATCACTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:9965649_C_CCCTTCCCATCACTTT:9965649:1,2,1,1
chr3	9965653	.	G	GGCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:9965649_C_CCCTTCCCATCACTTT:9965649:1,2,1,1
chr3	9965655	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:9965649_C_CCCTTCCCATCACTTT:9965649:1,2,1,1
chr3	9965679	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	9965955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=47,83;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	9974582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	9976159	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,10,7
chr3	9979271	.	G	GGATTTAAATAAATAAATGGAAATAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:8,3,1,1
chr3	9982923	.	G	GATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=291,43616633;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr3	10005919	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	10049334	.	T	TAATTAGTAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,26;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:0,0:1,2,0,1
chr3	10081592	.	AT	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10081592_AT_GA:10081592:0,1,0,1
chr3	10081596	.	AA	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10081592_AT_GA:10081592:0,1,0,1
chr3	10081600	.	A	ATTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10081592_AT_GA:10081592:0,1,0,1
chr3	10089658	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=111,139;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr3	10102103	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:0|1:10102103_CT_C:10102103:5,6,1,1
chr3	10102105	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=103,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:10102103_CT_C:10102103:5,6,1,1
chr3	10103759	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=177,155;MMQ=31,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.154:18:3,2:13,0:16,0,2,0
chr3	10103769	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=154,156;MMQ=31,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.185:20:2,3:15,0:17,0,3,0
chr3	10103969	.	AC	GG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:10103969_AC_GG:10103969:0,7,0,2
chr3	10103974	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:10103969_AC_GG:10103969:0,7,0,2
chr3	10104011	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=198,176;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	10109024	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr3	10109101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	10136123	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,1:0,0:0|1:10136123_TGG_T:10136123:0,0,0,1
chr3	10136130	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10136123_TGG_T:10136123:0,0,0,1
chr3	10136134	.	GTGTT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10136123_TGG_T:10136123:0,0,0,1
chr3	10136141	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10136123_TGG_T:10136123:0,0,0,1
chr3	10146197	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=139,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr3	10146227	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=196,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:10146227_C_CAG:10146227:2,1,1,1
chr3	10146230	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=196,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:10146227_C_CAG:10146227:2,1,1,1
chr3	10146488	.	A	AACATAAAATTCTTATCTACCCATCTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=199,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	10188138	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,202;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr3	10219508	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	10242243	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	10258773	.	C	CAAGCTTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=109,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10258773_C_CAAGCTTGCAT:10258773:0,4,0,1
chr3	10258776	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=109,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:10258773_C_CAAGCTTGCAT:10258773:0,4,0,1
chr3	10258777	.	C	CTGAAAGATTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=109,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:10258773_C_CAAGCTTGCAT:10258773:0,4,0,1
chr3	10258787	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=107,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10258787_G_C:10258787:0,2,0,1
chr3	10258790	.	AAGGGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=107,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:10258787_G_C:10258787:0,3,0,1
chr3	10258799	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:0,0:2,1:0|1:10258787_G_C:10258787:0,2,0,1
chr3	10261294	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	10283716	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	10302369	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	10302395	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	10302428	.	TCCTAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr3	10342876	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr3	10345935	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10345935_CCA_C:10345935:0,0,0,1
chr3	10345947	.	TCT	CAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10345935_CCA_C:10345935:0,0,0,1
chr3	10346842	.	T	TCTGTAGATTAATA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=105,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:3,4,1,1
chr3	10346900	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	10354272	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,3:4,0:4,5,2,1
chr3	10370486	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr3	10380093	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=107,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:2,2,1,3
chr3	10380106	.	C	CTTCCCCAGCTGGAAGGCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.480:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	10413526	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=106,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:2,3,2,3
chr3	10417082	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10417082_AG_CT:10417082:0,0,1,0
chr3	10417089	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10417082_AG_CT:10417082:0,0,1,0
chr3	10417095	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10417082_AG_CT:10417082:0,0,1,0
chr3	10420080	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=111,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	10420087	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=91,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	10420875	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	10428217	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,0,2
chr3	10428284	.	TG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:10428284_TG_CC:10428284:1,2,0,1
chr3	10428291	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:10428284_TG_CC:10428284:1,2,0,1
chr3	10436070	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	10442779	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	10443842	.	C	CTA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:10443842_C_CTA:10443842:6,6,1,1
chr3	10443843	.	C	CACA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:7,2:0|1:10443842_C_CTA:10443842:6,6,1,1
chr3	10443844	.	G	GCAATCAAATGACCAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:5,0:6,2:0|1:10443842_C_CTA:10443842:6,6,1,1
chr3	10452470	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10452470_T_G:10452470:0,0,0,1
chr3	10452472	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10452470_T_G:10452470:0,0,0,1
chr3	10452473	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10452470_T_G:10452470:0,0,0,1
chr3	10861133	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=92,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:17,4,2,0
chr3	10861378	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10861378_C_T:10861378:0,0,0,1
chr3	10861382	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10861378_C_T:10861378:0,0,0,1
chr3	10971100	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10971100_C_T:10971100:0,1,0,1
chr3	10971106	.	G	GTGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10971100_C_T:10971100:0,1,0,1
chr3	10974902	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,81;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr3	10980029	.	G	GTGTGCGTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	10980078	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	11060430	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	11060448	.	C	CACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	11067315	.	T	TAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=95,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:0|1:11067315_T_TAAGAG:11067315:0,3,0,1
chr3	11067316	.	T	TGTGTGTGCTTGCGCACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=95,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:2,0:0|1:11067315_T_TAAGAG:11067315:0,3,0,1
chr3	11067348	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11067348_A_C:11067348:0,1,0,1
chr3	11067350	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11067348_A_C:11067348:0,1,0,1
chr3	11067353	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11067348_A_C:11067348:0,1,0,1
chr3	11071095	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11071095_C_A:11071095:0,1,0,1
chr3	11071098	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11071095_C_A:11071095:0,0,0,1
chr3	11076184	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,10;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11076184_C_A:11076184:0,0,1,0
chr3	11076189	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,14;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11076184_C_A:11076184:0,0,1,0
chr3	11076193	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,13;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11076184_C_A:11076184:0,0,1,0
chr3	11076197	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11076184_C_A:11076184:0,0,1,0
chr3	11076198	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,13;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:11076184_C_A:11076184:0,1,1,0
chr3	11076203	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,12;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:11076184_C_A:11076184:0,1,1,0
chr3	11076206	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,26;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:11076184_C_A:11076184:1,1,1,0
chr3	11076210	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:11076184_C_A:11076184:1,1,1,0
chr3	11076212	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:11076184_C_A:11076184:1,1,1,0
chr3	11076303	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=99,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:5,5,1,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	11302814	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=121,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,2:1,0:3,0,1,1
chr3	11303293	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,2:0,0:0,8,0,2
chr3	11303331	.	TG	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=179,176;MMQ=53,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	11303338	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=161,186;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	11303343	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=161,196;MMQ=60,45;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	11305151	.	TGGCTGGAGTC	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=163,139;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11305151_TGGCTGGAGTC_T:11305151:0,2,0,1
chr3	11305164	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=187,139;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305151_TGGCTGGAGTC_T:11305151:0,1,0,1
chr3	11305168	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=187,139;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305151_TGGCTGGAGTC_T:11305151:0,1,0,1
chr3	11305170	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=139,187;MMQ=51,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305170_C_T:11305170:0,1,0,1
chr3	11305171	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=187,139;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11305151_TGGCTGGAGTC_T:11305151:0,1,0,1
chr3	11305176	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=139,187;MMQ=51,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:11305170_C_T:11305170:0,1,0,1
chr3	11305179	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11305170_C_T:11305170:0,0,0,1
chr3	11348557	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=101,30;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,2:3,0:2,8,1,1
chr3	11350553	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,3,3
chr3	11600864	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=206,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,6,2
chr3	11643435	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:5,8,0,3
chr3	11643465	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,6,14
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr3	11858581	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11858581_A_G:11858581:0,0,1,0
chr3	11858583	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:11858581_A_G:11858581:0,0,1,0
chr3	11858589	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11858581_A_G:11858581:0,0,1,0
chr3	11858803	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr3	11871188	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:9,1,2,3
chr3	11871215	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr3	11880790	.	TG	CC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:3,5,0,2
chr3	11885494	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,2,3
chr3	12046362	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:12046362_G_C:12046362:0,0,1,1
chr3	12046364	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:12046362_G_C:12046362:0,0,1,1
chr3	12046372	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:12046362_G_C:12046362:0,0,1,1
chr3	12187246	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=83,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,1,2
chr3	12198937	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,112;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:4,1,3,0
chr3	12203127	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12203127_CTG_C:12203127:1,2,0,1
chr3	12203131	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:12203127_CTG_C:12203127:1,2,0,1
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	12208878	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:12208878_G_T:12208878:0,1,0,2
chr3	12208882	.	T	TATAAAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:12208878_G_T:12208878:0,1,0,2
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12421361	.	A	AGAACAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,0:0|1:12421361_A_AGAACAT:12421361:3,1,1,1
chr3	12421365	.	C	CTAGCAAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12421361_A_AGAACAT:12421361:3,1,0,1
chr3	12421367	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12421361_A_AGAACAT:12421361:3,1,0,1
chr3	12421368	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=100,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:12421361_A_AGAACAT:12421361:3,1,0,1
chr3	12423089	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12423089_C_T:12423089:0,0,0,1
chr3	12423091	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12423089_C_T:12423089:0,0,0,1
chr3	12537955	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	12560774	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12560774_G_A:12560774:0,0,0,1
chr3	12560776	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12560774_G_A:12560774:0,0,0,1
chr3	12571420	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12598643	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12610544	.	A	ATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,0:0|1:12610544_A_ATTT:12610544:0,3,0,1
chr3	12610548	.	G	GAGACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12610544_A_ATTT:12610544:0,4,0,1
chr3	12611670	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr3	12613537	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=84,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,2:9,1:7,6,2,1
chr3	12618269	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=134,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:0,2,2,6
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr3	12776428	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	12778203	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:12778203_T_A:12778203:0,1,1,0
chr3	12778208	.	CCTG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,1:0|1:12778203_T_A:12778203:3,1,1,0
chr3	12778213	.	A	ACCCCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,14;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,7;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:12778203_T_A:12778203:3,1,1,0
chr3	12778216	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12778203_T_A:12778203:3,1,1,0
chr3	12778221	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,13;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:12778203_T_A:12778203:3,1,1,0
chr3	12778223	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:12778203_T_A:12778203:3,1,1,0
chr3	12778381	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=117,106;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:7,0:1,2:5,3,1,1
chr3	12778435	.	T	TGGCACAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	12784128	.	G	GTAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12784128_G_GTAT:12784128:0,0,0,1
chr3	12784130	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12784128_G_GTAT:12784128:0,0,0,1
chr3	12790206	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,5:6,0:6,2,5,0
chr3	12790330	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,1,0
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	12791337	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=106,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:8,2:5,8,0,2
chr3	12838293	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	12838371	.	C	CAGCCTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	12845158	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	12851738	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	12857823	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	12858717	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	12859114	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	12872890	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,1,1
chr3	12881130	.	C	CCTCCGTAGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	12940863	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:5,3,1,1
chr3	12943109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	12957173	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr3	12976863	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	12977133	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr3	12983283	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr3	13360563	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=73,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,0:0,4:2,2,3,1
chr3	13381282	.	T	TGGGGCCGCTGATGTGGAGGACACGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,84;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	13399948	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	13399969	.	C	CAACTACCCACACG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr3	13420546	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr3	13421303	.	AC	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	13427971	.	A	AACCAGGGTGGTAGCAGTGGACATACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr3	13438863	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:0,6:2,2:1,1,4,4
chr3	13545803	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13545803_G_GAT:13545803:0,1,0,1
chr3	13545804	.	TCTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=88,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:13545803_G_GAT:13545803:0,2,0,1
chr3	13545811	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=88,82;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:13545803_G_GAT:13545803:0,2,0,1
chr3	13613140	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13613140_A_AT:13613140:0,4,0,1
chr3	13613143	.	C	CATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13613140_A_AT:13613140:0,4,0,1
chr3	13613147	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13613140_A_AT:13613140:0,4,0,1
chr3	13651155	.	TGTGGCCTTCAAGGCAGGGTGGGGTGGGGCGGGGCGGGAGGCTGGCCTGGGCCTGAAGGTCCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.600:5:0,2:0,1:0,1,0,4
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	13670887	.	C	CAACCATGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	13860903	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0|1:13860903_C_T:13860903:0,0,0,5
chr3	13860911	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,104;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0|1:13860903_C_T:13860903:0,0,0,5
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	14173936	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14176195	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14176195_G_A:14176195:0,0,1,0
chr3	14176215	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=167,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:14176195_G_A:14176195:1,1,1,0
chr3	14176821	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14176821_G_C:14176821:0,0,0,1
chr3	14176823	.	C	CATCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14176821_G_C:14176821:0,0,0,1
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	14201352	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,2,2
chr3	14207158	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14207158_G_A:14207158:0,0,0,1
chr3	14207159	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14207158_G_A:14207158:0,0,0,1
chr3	14219932	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=105,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	14508184	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14508184_C_T:14508184:0,2,0,1
chr3	14508190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14508184_C_T:14508184:0,2,0,1
chr3	14509804	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=126,264;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14509804_G_GT:14509804:0,1,0,1
chr3	14509806	.	G	GTGGCATCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=126,264;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:14509804_G_GT:14509804:0,1,0,1
chr3	14509810	.	T	TGAGCATGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=126,264;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:14509804_G_GT:14509804:0,1,0,1
chr3	14520772	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,89;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:14520772_CA_C:14520772:0,0,0,3
chr3	14520782	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:14520772_CA_C:14520772:0,0,0,3
chr3	14536505	.	CAGA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=53,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,2:2,4:1,4,2,4
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	14548308	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=78,70;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr3	14548325	.	A	AACAGGGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548328	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548329	.	TCG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548332	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548336	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548339	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=136,70;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:14548325_A_AACAGGGG:14548325:2,0,0,1
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=71,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:4,5,5,2
chr3	14551444	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=198,50;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:14551444_A_G:14551444:0,1,2,1
chr3	14551465	.	C	CGTGTGCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=198,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14551444_A_G:14551444:0,1,1,0
chr3	14551467	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=198,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:14551444_A_G:14551444:0,1,1,0
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr3	14556021	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=90,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr3	14558473	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14559373	.	AGCGGTGCAGCT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=93,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.332:4:1,1:1,0:0|1:14559373_AGCGGTGCAGCT_A:14559373:1,2,0,1
chr3	14559388	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=93,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:14559373_AGCGGTGCAGCT_A:14559373:1,2,0,1
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr3	14565268	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14565268_C_T:14565268:0,1,0,1
chr3	14565273	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:14565268_C_T:14565268:0,1,0,1
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,3:0,4:2,2,5,2
chr3	14709058	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr3	14712624	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=70,70;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,0:1,3:1,6,1,2
chr3	14712640	.	C	CGTCGCTGAGTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	14725962	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:14725962_AC_A:14725962:0,1,0,1
chr3	14725966	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=92,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:14725962_AC_A:14725962:0,1,0,1
chr3	14725969	.	G	T,GAAAACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26,29;MFRL=0,98,92;MMQ=60,60,60;MPOS=2,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	14725970	.	T	TCATACCAGGACAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=98,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:14725962_AC_A:14725962:0,1,0,1
chr3	14731665	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:0|1:14731665_C_CT:14731665:1,4,1,1
chr3	14731667	.	G	GGTTCATCCAGACC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:2,0:2,2:0|1:14731665_C_CT:14731665:1,4,1,1
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14763252	.	G	GGCCCCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:14763252_G_GGCCCCA:14763252:6,6,0,2
chr3	14763257	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=113,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,1:5,0:0|1:14763252_G_GGCCCCA:14763252:6,6,0,2
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14770136	.	TCCTGTGAGCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=129,115;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,2,0,2
chr3	14770148	.	A	ATTTTTATTAAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,14;MFRL=129,115;MMQ=60,53;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,2,0,2
chr3	14770152	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=65,115;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,1,0,2
chr3	14770155	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,10;MFRL=65,115;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,1,0,2
chr3	14770164	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,11;MFRL=65,115;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,1,0,2
chr3	14770166	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=65,115;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:1,1,0,2
chr3	14770170	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=129,115;MMQ=60,53;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:14770136_TCCTGTGAGCCC_T:14770136:2,1,0,2
chr3	14814464	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:14814464_GTC_G:14814464:0,3,0,1
chr3	14814467	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:14814464_GTC_G:14814464:0,3,0,1
chr3	14814478	.	C	CCAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:14814478_C_CCAG:14814478:0,2,0,2
chr3	14814480	.	TCC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:14814478_C_CCAG:14814478:0,2,0,2
chr3	14861377	.	A	ACCGGCTGGGGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:2,2:3,0:0|1:14861377_A_ACCGGCTGGGGG:14861377:2,3,1,1
chr3	14861379	.	A	AGCTGAGGGGCGAGGCTGAGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=140,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:2,1:3,0:0|1:14861377_A_ACCGGCTGGGGG:14861377:2,3,1,1
chr3	14862791	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=58,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr3	14939119	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=110,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,0:7,3:6,7,0,3
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:14939198_G_A:14939198:0,0,0,1
chr3	14939199	.	GGTTCCA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:14939198_G_A:14939198:0,0,0,1
chr3	14939208	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:14939198_G_A:14939198:0,0,0,1
chr3	14939364	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14939679	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	14941793	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	14942054	.	TAT	CTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:14942054_TAT_CTG:14942054:0,4,0,1
chr3	14942061	.	C	CTGAGAAGCTCTGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:14942054_TAT_CTG:14942054:0,3,0,1
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	14964726	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,761;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr3	14965727	.	T	TCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15076116	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	15084405	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:15,0:7,2:11,12,0,2
chr3	15115519	.	T	TTGAAGGTGCAGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,0:1,5,1,1
chr3	15269340	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:3,5:13,0:12,5,5,0
chr3	15276684	.	C	CCTATGCATTAATTACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.485:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	15283799	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr3	15301363	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	15345801	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15452980	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15452980_C_A:15452980:0,1,0,1
chr3	15452982	.	T	TAGGAAATAACCC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=125,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.460:2:1,1:0,0:0|1:15452980_C_A:15452980:0,1,0,1
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	15467706	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:15467706_C_A:15467706:1,0,2,0
chr3	15467711	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:15467706_C_A:15467706:1,0,2,0
chr3	15471528	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr3	15471539	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=158,296;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:15471539_T_G:15471539:1,6,1,1
chr3	15471540	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=158,296;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:15471539_T_G:15471539:1,6,1,1
chr3	15473515	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	15498084	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=145,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr3	15499923	.	AGGTT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15499923_AGGTT_A:15499923:0,0,0,1
chr3	15499929	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15499923_AGGTT_A:15499923:0,0,0,1
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=91,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=125,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=108,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:3,2,2,2
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	15609501	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:15609501_G_A:15609501:1,1,0,1
chr3	15609503	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:15609501_G_A:15609501:1,2,0,1
chr3	15609505	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:15609501_G_A:15609501:1,2,0,1
chr3	15609508	.	G	GTGCCGGTGAGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:15609501_G_A:15609501:1,2,0,1
chr3	15628109	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:7,2:7,10,1,1
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15726766	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=111,62;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,0:1,2:4,4,2,0
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,2,6
chr3	15756039	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,2,11
chr3	15807692	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr3	15807806	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=149,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:4,4:1,10:1,4,7,7
chr3	16216934	.	G	GAAAGCTAACTTGAACAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,32;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	16237410	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=67,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16237412	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=67,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16237414	.	GGAC	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=67,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAC;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16237416	.	ACGACCTCAGC	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,24;MFRL=67,95;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.282:5:3,1:1,0:1|0:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16237423	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=67,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16237430	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=67,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.282:5:3,1:1,0:1|0:16237410_T_G:16237410:3,1,0,1
chr3	16254267	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16254267_CA_C:16254267:0,1,0,1
chr3	16254272	.	T	TTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16254267_CA_C:16254267:0,1,0,1
chr3	16254275	.	G	GGCACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16254267_CA_C:16254267:0,1,0,1
chr3	16302432	.	T	TCAATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	16313320	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=97,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	16364846	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	16368436	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	16419708	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,3,3
chr3	16451080	.	A	AGTGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=209,147;MMQ=24,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,2:0,0:0|1:16451080_A_AGTGGT:16451080:0,1,0,2
chr3	16451082	.	TGACGC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=209,147;MMQ=24,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:16451080_A_AGTGGT:16451080:0,1,0,2
chr3	16636093	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=130,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,4:3,0:3,2,2,2
chr3	16638675	.	ACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	16639101	.	C	CTATGGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:16639101_C_CTATGGG:16639101:2,5,1,1
chr3	16639103	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,1:3,0:0|1:16639101_C_CTATGGG:16639101:2,5,1,1
chr3	16639754	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,460;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	17052630	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:5,9,3,0
chr3	17053595	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr3	17053667	.	T	TTCTAAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17053667_T_TTCTAAC:17053667:0,1,0,1
chr3	17053671	.	T	TTATTGAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17053667_T_TTCTAAC:17053667:0,1,0,1
chr3	17053672	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17053667_T_TTCTAAC:17053667:0,1,0,1
chr3	17209153	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	17209195	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=147,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,3:2,0:1,2,2,2
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.366:14:5,3:2,2:9,0,5,0
chr3	17469901	.	GTGTATATA	G,GTATA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32,34;MFRL=129,124,146;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.71,6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,3:0.134,0.200:17:9,0,3:3,2,0:11,1,5,0
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	18427924	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,5,4
chr3	18438839	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:18438839_A_T:18438839:0,2,0,1
chr3	18438841	.	A	AGTTGCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:18438839_A_T:18438839:0,2,0,1
chr3	18438848	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:18438848_C_T:18438848:0,1,0,1
chr3	18438851	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:18438848_C_T:18438848:0,1,0,1
chr3	18438855	.	GTGGCAAC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:18438848_C_T:18438848:0,1,0,1
chr3	18438866	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:18438848_C_T:18438848:0,0,0,1
chr3	18456752	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr3	18457543	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr3	18457719	.	CACAAGCAGTACCGTTATT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr3	19384133	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=88,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,0:6,4:14,5,2,2
chr3	19389502	.	G	GCACATAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	19492962	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19492962_G_T:19492962:0,0,0,1
chr3	19492963	.	GGGAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=217,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:19492962_G_T:19492962:0,1,0,1
chr3	19492970	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=217,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:19492962_G_T:19492962:0,1,0,1
chr3	19941017	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,78;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr3	19941060	.	TGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:19941060_TGCC_T:19941060:1,0,0,1
chr3	19941067	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=142,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:19941060_TGCC_T:19941060:1,0,0,1
chr3	19941069	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:19941060_TGCC_T:19941060:0,0,0,1
chr3	20017489	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=108,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:5,5,4,0
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	20114024	.	G	GCCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,1
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,1
chr3	20141301	.	T	C,G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31,32;MFRL=0,152,144;MMQ=60,60,60;MPOS=19,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.17,16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,5:0.462,0.462:10:0,3,3:0,2,2:0,0,10,0
chr3	20141308	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:5,0,5,0
chr3	20141522	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=208,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr3	20142797	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	20153342	.	C	CATTTTATATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20153342_C_CATTTTATATA:20153342:0,1,0,1
chr3	20153344	.	A	AGTATTTCATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20153342_C_CATTTTATATA:20153342:0,1,0,1
chr3	20153346	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20153342_C_CATTTTATATA:20153342:0,1,0,1
chr3	20156542	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20156542_C_CAGG:20156542:0,1,0,1
chr3	20156545	.	TTCA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20156542_C_CAGG:20156542:0,1,0,1
chr3	20168982	.	C	CATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=99,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,1:0|1:20168982_C_CATT:20168982:5,9,1,1
chr3	20168983	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=99,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:20168982_C_CATT:20168982:5,9,1,1
chr3	20178467	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=103,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:20178467_G_A:20178467:3,2,1,1
chr3	20178469	.	A	ATTTTTCTCCCCAGTCTAATGTATTTGTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=103,28;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.357:9:3,2:2,0:0|1:20178467_G_A:20178467:3,2,1,3
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr3	20212754	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.805:8:0,6:1,1:0|1:20212754_TA_T:20212754:0,1,1,6
chr3	20212771	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,7:1,1:0|1:20212754_TA_T:20212754:0,1,1,7
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0|1:20212754_TA_T:20212754:0,1,0,5
chr3	21706481	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=102,139;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:3,5:7,1:6,4,0,7
chr3	23848835	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=89,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,4:5,1:7,4,3,2
chr3	23934772	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,2:3,1,3,2
chr3	23960794	.	T	TTCAGTGAAGCCACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=171,145;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	24006688	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=123,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:8,7,2,1
chr3	24006726	.	CTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=162,142;MMQ=50,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr3	24009546	.	C	CTGCCA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=148,26;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:2,0:2,2:0|1:24009546_C_CTGCCA:24009546:0,4,1,1
chr3	24009551	.	A	AAACAAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=143,26;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:24009546_C_CTGCCA:24009546:0,5,1,1
chr3	24009553	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=143,26;MMQ=60,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0|1:24009546_C_CTGCCA:24009546:0,5,1,1
chr3	24164471	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,3:1,0:2,1,3,0
chr3	24169283	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,1:0|1:24169283_A_C:24169283:0,3,0,1
chr3	24169285	.	G	GCTGATTGCTGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:1,1:0|1:24169283_A_C:24169283:0,3,0,1
chr3	24169310	.	T	TCCTTGAGTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24169310_T_TCCTTGAGTA:24169310:0,1,0,1
chr3	24169312	.	C	CAACATTAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24169310_T_TCCTTGAGTA:24169310:0,1,0,1
chr3	24169315	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24169310_T_TCCTTGAGTA:24169310:0,1,0,1
chr3	25636007	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr3	25639849	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr3	25674291	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:11,2:0|1:25674291_G_A:25674291:9,15,1,1
chr3	25674294	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:0|1:25674291_G_A:25674291:9,17,1,1
chr3	25675596	.	CT	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	25685347	.	ATCCTG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:25685347_ATCCTG_A:25685347:0,1,0,1
chr3	25685354	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25685347_ATCCTG_A:25685347:0,1,0,1
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	25775532	.	A	AAAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	26751611	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr3	26751935	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=67,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:26751935_G_GGC:26751935:2,0,0,1
chr3	26751938	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26751935_G_GGC:26751935:1,0,0,1
chr3	26751942	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26751935_G_GGC:26751935:1,0,0,1
chr3	26751948	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:26751935_G_GGC:26751935:1,0,0,1
chr3	26751970	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=166,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr3	26752125	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:9,3:9,6,1,2
chr3	27173450	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:5,0:1,2:0|1:27173450_C_CT:27173450:3,3,1,1
chr3	27173455	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:27173450_C_CT:27173450:3,3,1,1
chr3	27173456	.	A	ATTTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=161,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0|1:27173450_C_CT:27173450:3,3,1,1
chr3	27204333	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:27204333_ATT_A:27204333:0,3,0,1
chr3	27204340	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27204333_ATT_A:27204333:0,2,0,1
chr3	27243119	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr3	27326242	.	T	TGACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	27332282	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=159,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,1,5
chr3	27332332	.	A	AATGATACAAGGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27332332_A_AATGATACAAGGAG:27332332:0,0,0,1
chr3	27332335	.	T	TAAAGAACACAATGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27332332_A_AATGATACAAGGAG:27332332:0,0,0,1
chr3	27335190	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	27346319	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr3	27349416	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,2:3,0:0|1:27349416_A_C:27349416:5,7,1,1
chr3	27349424	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:27349416_A_C:27349416:5,9,1,1
chr3	27349426	.	T	TTC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:27349416_A_C:27349416:5,9,1,1
chr3	27349427	.	A	ATTT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:0|1:27349416_A_C:27349416:5,9,1,1
chr3	27350384	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=109,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,5:4,0:7,2,3,2
chr3	27353741	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27353741_GC_G:27353741:0,0,0,1
chr3	27353746	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27353741_GC_G:27353741:0,0,0,1
chr3	27387803	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	27433397	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	27436074	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:0|1:27436074_G_T:27436074:3,4,1,1
chr3	27436077	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:27436074_G_T:27436074:3,4,1,1
chr3	27439617	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr3	27439778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=102,50;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,0:9,2:0|1:27439778_C_T:27439778:10,12,1,1
chr3	27439803	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=91,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:27439778_C_T:27439778:8,10,1,1
chr3	27439806	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=91,50;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:27439778_C_T:27439778:8,10,1,1
chr3	27439808	.	CTGA	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=91,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:27439778_C_T:27439778:8,11,1,1
chr3	27439818	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=104,50;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,1:0|1:27439778_C_T:27439778:4,11,1,1
chr3	27446548	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	27462296	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27462296_T_G:27462296:0,2,0,1
chr3	27462298	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27462296_T_G:27462296:0,2,0,1
chr3	27462300	.	G	GCGTAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:27462296_T_G:27462296:0,2,0,1
chr3	27465664	.	C	CTTCTCAAAAAAAATAAATGAATAAAATAATA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=117,55;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr3	27465671	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=107,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:1,3,1,1
chr3	27478797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=132,146;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	27494069	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	28373461	.	A	ATAAGAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	28555548	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:28555548_G_T:28555548:11,7,1,1
chr3	28555550	.	T	TGAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=112,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:28555548_G_T:28555548:11,7,1,1
chr3	29323348	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:2,0:0,1:0|1:29323348_T_C:29323348:0,2,0,1
chr3	29323351	.	C	CCCCTGTAATCTGCAGTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29323348_T_C:29323348:0,1,0,1
chr3	29529907	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29529907_G_A:29529907:1,0,1,0
chr3	29529913	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29529907_G_A:29529907:1,0,1,0
chr3	29628745	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=102,92;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.647:5:1,3:0,0:0|1:29628745_G_T:29628745:1,1,3,0
chr3	29628747	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=106,92;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:29628745_G_T:29628745:0,1,3,0
chr3	29628768	.	T	TTTTAACTTACATACACTGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,106;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	29910338	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:29910338_T_C:29910338:2,2,0,1
chr3	29910347	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29910338_T_C:29910338:1,2,0,1
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	30032730	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,148;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr3	30664797	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=97,133;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,0:7,4:2,9,4,0
chr3	30686479	.	G	GCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:30686479_G_GCCC:30686479:0,1,0,1
chr3	30686481	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30686479_G_GCCC:30686479:0,1,0,1
chr3	30686485	.	GTA	TGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30686479_G_GCCC:30686479:0,1,0,1
chr3	30686490	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=108,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:30686479_G_GCCC:30686479:0,1,0,1
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,1:1,3:3,1,2,2
chr3	30715704	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=91,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,0:3,2:5,7,0,2
chr3	30715719	.	T	TTGAACATGTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=106,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:4,5,0,2
chr3	30819865	.	T	TGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30819865_T_TGTC:30819865:0,1,0,1
chr3	30819866	.	A	AACCATGTTAATTTGTTAAATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30819865_T_TGTC:30819865:0,1,0,1
chr3	30885642	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr3	30885652	.	TGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=90,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GC;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,0:1,1:5,4,1,1
chr3	30892445	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=9,33;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,1,0,1
chr3	30892451	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30892455	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30892457	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30892459	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30892461	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,23;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30892463	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30892445_T_C:30892445:0,2,0,1
chr3	30903330	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30903330_GCA_G:30903330:0,1,0,1
chr3	30903335	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30903330_GCA_G:30903330:0,1,0,1
chr3	30903337	.	T	TCTCAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30903330_GCA_G:30903330:0,1,0,1
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	31638394	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=113,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,0,2
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	31674692	.	T	TTGTGCCAGTGCCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	31677395	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	31789650	.	A	ATTTCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=88,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31789650_A_ATTTCCCCC:31789650:0,1,0,1
chr3	31789651	.	A	ATGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=88,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:31789650_A_ATTTCCCCC:31789650:0,1,0,1
chr3	31789658	.	TC	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31789650_A_ATTTCCCCC:31789650:0,0,0,1
chr3	31921315	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr3	32032575	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:7,5,1,1
chr3	32032665	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=104,86;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:32032665_G_C:32032665:12,7,1,1
chr3	32032673	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=96,86;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:32032665_G_C:32032665:10,6,1,1
chr3	32032675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=96,86;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:32032665_G_C:32032665:10,6,1,1
chr3	32032694	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:6,5,2,1
chr3	32032966	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=122,133;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:8,3,1,1
chr3	32200322	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	32200972	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	32398820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=74,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:3,3:3,0:3,4,3,0
chr3	32533246	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.607:21:6,7:2,5:3,5,8,5
chr3	32570132	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:0|1:32570132_C_G:32570132:0,1,0,1
chr3	32570134	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32570132_C_G:32570132:0,1,0,1
chr3	32570135	.	A	AGGTTCAACTCTGTTTGCTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32570132_C_G:32570132:0,1,0,1
chr3	32571124	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr3	32571822	.	TGA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:3,2:7,0:0|1:32571822_TGA_T:32571822:8,4,0,4
chr3	32571825	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:4,0:5,0:0|1:32571822_TGA_T:32571822:8,4,0,4
chr3	32578505	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:5,3:7,5:9,4,5,4
chr3	32745475	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr3	32746288	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:6,3:8,2:11,5,4,2
chr3	32757887	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=8244166,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32757887_G_A:32757887:0,2,0,1
chr3	32757890	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=8244166,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32757887_G_A:32757887:0,2,0,1
chr3	32757891	.	C	CAGTTTCTCTGGGTGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=8244166,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32757887_G_A:32757887:0,2,0,1
chr3	32761771	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32761771_A_C:32761771:0,1,0,1
chr3	32761776	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32761771_A_C:32761771:0,1,0,1
chr3	32761779	.	T	TAGTAGCCCCAGTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32761771_A_C:32761771:0,1,0,1
chr3	32761804	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32761804_G_GC:32761804:0,0,0,1
chr3	32761805	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32761804_G_GC:32761804:0,0,0,1
chr3	32766905	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr3	32804185	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=101,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:4,1,3,3
chr3	32805828	.	C	CAAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=165,183;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,18;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:32805828_C_CAAAA:32805828:1,0,1,0
chr3	32805843	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=164,183;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32805828_C_CAAAA:32805828:3,0,1,0
chr3	32805853	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,13;MFRL=164,183;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:32805828_C_CAAAA:32805828:3,0,1,0
chr3	32805858	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=155,183;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:32805828_C_CAAAA:32805828:4,0,1,0
chr3	32805861	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,16;MFRL=155,183;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:32805828_C_CAAAA:32805828:4,0,1,0
chr3	32806038	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	32806134	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	32815053	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,0:1,1:0|1:32815053_C_G:32815053:2,1,0,1
chr3	32815056	.	A	AGTTGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=112,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:32815053_C_G:32815053:2,1,0,1
chr3	32927509	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr3	32927599	.	C	CTCCCTAATTGTTTGCAACCCAACTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	32996970	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=136,137;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:6,2:7,0,3,0
chr3	32997029	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=71;ECNT=7;MBQ=18,20,18;MFRL=79,91,91;MMQ=60,60,60;MPOS=9,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,19;RU=A;STR;TLOD=4.69,11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,6,12:0.131,0.361:33:1,1,2:1,3,1:1,14,5,13
chr3	32997048	.	T	A	.	.	DP=80;ECNT=7;MBQ=28,25;MFRL=97,86;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,2:0.037:78:29,0:42,2:0|1:32997048_T_A:32997048:22,54,2,0
chr3	32997053	.	T	A	.	.	DP=88;ECNT=7;MBQ=27,17;MFRL=101,86;MMQ=60,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,2:0.033:88:31,0:41,1:0|1:32997048_T_A:32997048:32,54,2,0
chr3	32997056	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=105,86;MMQ=60,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,2:0.031:94:39,0:43,2:0|1:32997048_T_A:32997048:38,54,2,0
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chr3	32997060	.	T	A	.	.	DP=104;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=101,86;MMQ=60,37;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,2:0.028:104:46,0:44,1:0|1:32997048_T_A:32997048:48,54,2,0
chr3	32997096	.	G	GTTTTTTTT	.	.	DP=81;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=71,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,31;RU=T;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.847:30:4,17:0,7:4,0,22,4
chr3	32997183	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=138,122;MMQ=52,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:9,2:0,0:0,9,0,2
chr3	32997225	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=191,171;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32997225_C_T:32997225:0,1,0,2
chr3	32997227	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=191,171;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:32997225_C_T:32997225:0,1,0,2
chr3	32997247	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	33038564	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:6,1,1,1
chr3	33058399	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=163,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33058399_G_T:33058399:0,3,0,1
chr3	33058403	.	A	AGAAACCTCTTTGTGATGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=163,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:33058399_G_T:33058399:0,3,0,1
chr3	33059981	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr3	33099628	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,7:6,0:6,5,7,0
chr3	33099658	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=101,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,8:6,0:7,4,7,1
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	33175839	.	G	GGTTGCAGTAAGCCGAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	33183942	.	C	CCGGCCTCTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,598;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	33194990	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=72,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:6,5,3,1
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33216357_G_A:33216357:0,0,1,0
chr3	33216359	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33216357_G_A:33216357:0,0,1,0
chr3	33339136	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr3	33400812	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=118,43;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:33400812_A_AC:33400812:0,4,1,1
chr3	33400814	.	A	AAGTTACTATATCCAAGAAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=128,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:3,0:0,2:0|1:33400812_A_AC:33400812:0,3,1,1
chr3	33400820	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=159,104;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:33400812_A_AC:33400812:0,4,0,1
chr3	33431954	.	C	CATTCTCTCTCGCTCTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.359:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	33444334	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=121,31;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:2,0:4,2:0|1:33444334_A_T:33444334:2,4,1,1
chr3	33444337	.	G	GGTGTGTGTGTGGTGTATGTATGTGT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=121,31;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:33444334_A_T:33444334:2,4,1,1
chr3	33453006	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:7,0,2,2
chr3	33584843	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr3	33584856	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:33584856_C_CT:33584856:4,0,1,0
chr3	33584859	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:33584856_C_CT:33584856:4,0,1,0
chr3	33617781	.	AGAAGGAAAATAGATTTGAAGGAGTCATAAATATAACAGTGTCAGGTTGGGAAACTTTAAGACCTTTACAGGG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.212:23:7,4:6,1:4,14,3,2
chr3	33626434	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=88,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33626434_A_AC:33626434:0,1,0,1
chr3	33626435	.	A	ACACACACAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=88,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33626434_A_AC:33626434:0,1,0,1
chr3	33626437	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=88,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33626434_A_AC:33626434:0,1,0,1
chr3	33649972	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,101;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,4:3,0:5,0,5,0
chr3	33705117	.	TA	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=193,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33705117_TA_AT:33705117:0,1,0,1
chr3	33705120	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=193,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33705117_TA_AT:33705117:0,1,0,1
chr3	33725861	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:17,3:13,0:10,23,0,3
chr3	33853680	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	33866868	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	33887102	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	33893987	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=55,96;MMQ=44,43;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,1,4
chr3	33894078	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=157,176;MMQ=40,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr3	35748488	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr3	35758898	.	TAGAATCAATG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:35758898_TAGAATCAATG_T:35758898:1,1,0,1
chr3	35758912	.	AA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35758898_TAGAATCAATG_T:35758898:0,0,0,1
chr3	35780735	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	35781051	.	ACA	TTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35781051_ACA_TTT:35781051:0,0,0,1
chr3	35781056	.	C	CTGTCTTCTGTATTGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35781051_ACA_TTT:35781051:0,0,0,1
chr3	36422064	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	36422126	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=207,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	36485020	.	G	GCAGT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:2,2,0,1
chr3	36485022	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:2,2,0,1
chr3	36485023	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:2,2,0,1
chr3	36485028	.	C	CCTG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:1,2,0,1
chr3	36485032	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:1,2,0,1
chr3	36485033	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:1,2,0,1
chr3	36485035	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36485020_G_GCAGT:36485020:0,2,0,1
chr3	36570279	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	36570463	.	C	CAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:36570463_C_CAAT:36570463:0,2,0,1
chr3	36570466	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:36570463_C_CAAT:36570463:0,2,0,1
chr3	36570482	.	G	GATTCCTAAAATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=127,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	36587826	.	T	TTCTGAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	36778837	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:36778837_G_T:36778837:2,1,0,1
chr3	36778840	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:36778837_G_T:36778837:2,1,0,1
chr3	36778842	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:36778837_G_T:36778837:2,1,0,1
chr3	36778846	.	C	CCAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36778837_G_T:36778837:1,0,0,1
chr3	36778855	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,31;MFRL=59,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,0:3,3:2,1,1,2
chr3	36779379	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36779379_T_C:36779379:0,0,0,1
chr3	36779380	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36779379_T_C:36779379:0,0,0,1
chr3	36779383	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:36779379_T_C:36779379:0,0,0,1
chr3	36780121	.	G	GACCGTGTGAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:36780121_G_GACCGTGTGAGGAAA:36780121:1,1,0,1
chr3	36780124	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36780121_G_GACCGTGTGAGGAAA:36780121:1,1,0,1
chr3	36780127	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36780121_G_GACCGTGTGAGGAAA:36780121:1,1,0,1
chr3	36871151	.	CCG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36871151_CCG_C:36871151:0,2,0,1
chr3	36871154	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:36871151_CCG_C:36871151:0,2,0,1
chr3	36888869	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr3	37034946	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:4,1,4,0
chr3	37048506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,0,2
chr3	37053563	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=99,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr3	37067392	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:6,11,3,0
chr3	37089272	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,160;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	37095956	.	ATTCTC	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:0|1:37095956_ATTCTC_A:37095956:8,7,1,1
chr3	37095962	.	AGCAG	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,25;MFRL=110,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:37095956_ATTCTC_A:37095956:8,7,1,1
chr3	37096013	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=115,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:1,3,2,3
chr3	37096024	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,2,2
chr3	37100254	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr3	37327643	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=176,145;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:37327643_TT_AA:37327643:0,1,0,1
chr3	37327647	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=176,145;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:37327643_TT_AA:37327643:0,1,0,1
chr3	37343735	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=93,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,7:5,0:5,4,7,0
chr3	37365171	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=114,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,3:10,0:10,10,3,0
chr3	37369859	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=109,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:9,3,0,3
chr3	37370467	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr3	37370477	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr3	37378705	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr3	37396635	.	A	ACCAGTGATGATGAGCATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	37402865	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:37402865_T_TG:37402865:0,0,0,1
chr3	37402867	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37402865_T_TG:37402865:0,0,0,1
chr3	37402870	.	GAATTC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37402865_T_TG:37402865:0,0,0,1
chr3	37476578	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr3	37523146	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37523146_T_TCC:37523146:1,1,0,1
chr3	37523147	.	A	AAATGTCCAGTTGCAGATTCTAGAAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:37523146_T_TCC:37523146:1,1,0,1
chr3	37670909	.	C	CCTAAGCCTCTTTCTCCATCCTAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	37774304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	37778481	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:0|1:37778481_G_C:37778481:3,5,0,3
chr3	37778483	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=117,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:4,2:0|1:37778483_G_GT:37778483:1,7,1,1
chr3	37778486	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.347:9:2,0:4,2:1|0:37778481_G_C:37778481:0,6,2,1
chr3	37778488	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=117,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:37778483_G_GT:37778483:1,6,1,1
chr3	37778490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=117,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:37778483_G_GT:37778483:1,6,1,1
chr3	37792069	.	T	TTTAAGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37792069_T_TTTAAGGA:37792069:0,0,0,1
chr3	37792070	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:37792069_T_TTTAAGGA:37792069:0,0,0,1
chr3	37826366	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	37845419	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,1:6,1:2,6,0,2
chr3	37860417	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:2,2,2,0
chr3	38045818	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:3,4,0,2
chr3	38045946	.	TGTAACTGG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:38045946_TGTAACTGG_T:38045946:0,2,0,2
chr3	38045967	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38045946_TGTAACTGG_T:38045946:0,1,0,1
chr3	38045968	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38045946_TGTAACTGG_T:38045946:0,1,0,1
chr3	38045970	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38045946_TGTAACTGG_T:38045946:0,1,0,1
chr3	38045975	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=170,90;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38045946_TGTAACTGG_T:38045946:0,2,0,1
chr3	38049414	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:38049414_G_C:38049414:1,1,0,1
chr3	38049418	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38049414_G_C:38049414:1,1,0,1
chr3	38049420	.	G	GTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38049414_G_C:38049414:1,1,0,1
chr3	38049422	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38049414_G_C:38049414:1,1,0,1
chr3	38050591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr3	38051271	.	T	TCAAATGCACATAAAACATTCCCAGAATATACCATATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	38103977	.	G	GAAATTTAAGGCCTTAATAGGGCTGGAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	38104352	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.564:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	38105498	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=117,143;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	38138732	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,0:2,3:3,6,2,1
chr3	38139084	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr3	38139425	.	C	CGAGCTCCCTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	38153262	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38153262_T_G:38153262:0,0,0,1
chr3	38153265	.	G	GGAAGAAAGCTGTGGGGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38153262_T_G:38153262:0,0,0,1
chr3	38163724	.	GC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:1,4,0,4
chr3	38163972	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38163972_CT_C:38163972:1,2,0,1
chr3	38163975	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38163972_CT_C:38163972:1,2,0,1
chr3	38163979	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38163972_CT_C:38163972:1,2,0,1
chr3	38163981	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38163972_CT_C:38163972:1,2,0,1
chr3	38163984	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38163972_CT_C:38163972:1,2,0,1
chr3	38168125	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr3	38168156	.	G	GGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	38178290	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38265225	.	GCCT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=166,197;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:38265225_GCCT_G:38265225:1,1,1,0
chr3	38265232	.	C	CTGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=166,197;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:38265225_GCCT_G:38265225:1,1,1,0
chr3	38265233	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=166,197;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:38265225_GCCT_G:38265225:1,1,1,0
chr3	38271948	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=118,176;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:9,13,3,0
chr3	38284378	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38291600	.	GCTTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38291600_GCTTTT_G:38291600:0,0,0,1
chr3	38291606	.	A	AAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38291600_GCTTTT_G:38291600:0,0,0,1
chr3	38293060	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38293904	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=103,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.691:14:1,3:3,7:2,2,3,7
chr3	38316517	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:6,1,1,1
chr3	38317599	.	G	GACTCTGGGGCAGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	38317628	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38317628_C_G:38317628:0,0,0,1
chr3	38317630	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38317628_C_G:38317628:0,0,0,1
chr3	38318988	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38318988_C_T:38318988:1,0,0,1
chr3	38319001	.	AAA	CTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38318988_C_T:38318988:0,0,0,1
chr3	38319007	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38318988_C_T:38318988:0,0,0,1
chr3	38319008	.	T	TTACCAATG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38318988_C_T:38318988:0,0,0,1
chr3	38347633	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:2,1,6,1
chr3	38347833	.	G	GAAGTGGAAGGGATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=64,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	38347851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr3	38348870	.	CTGGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=97,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38348870_CTGGT_C:38348870:0,1,0,1
chr3	38348877	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=97,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38348870_CTGGT_C:38348870:0,1,0,1
chr3	38349036	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	38355178	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,1:0,0:0|1:38355178_C_T:38355178:0,1,2,0
chr3	38355180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,26;MFRL=57,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:0|1:38355178_C_T:38355178:0,2,2,0
chr3	38355182	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=57,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0|1:38355178_C_T:38355178:0,2,2,0
chr3	38355186	.	T	TGTGCGCGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=57,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:38355178_C_T:38355178:0,2,2,0
chr3	38355189	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=57,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,2,0
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38357993	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=58,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:38357993_C_CT:38357993:0,4,1,1
chr3	38357995	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=58,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:38357993_C_CT:38357993:0,4,1,1
chr3	38388487	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,23;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:38388487_A_AG:38388487:0,1,0,1
chr3	38388488	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38388487_A_AG:38388487:0,1,0,1
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	38408228	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:38408228_C_T:38408228:4,0,1,0
chr3	38408232	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:38408228_C_T:38408228:4,0,1,0
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	38442315	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr3	38454550	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=133,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	38601851	.	GAAGA	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:4,2:0|1:38601851_GAAGA_G:38601851:4,6,1,1
chr3	38601858	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=146,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:0|1:38601851_GAAGA_G:38601851:4,6,1,1
chr3	38601930	.	C	CTCTT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:38601930_C_CTCTT:38601930:0,4,1,1
chr3	38601932	.	G	GGTTTGCAAAGAATAT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0|1:38601930_C_CTCTT:38601930:0,4,1,1
chr3	38601938	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:38601930_C_CTCTT:38601930:0,4,0,1
chr3	38601941	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,19;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:38601930_C_CTCTT:38601930:0,3,0,1
chr3	38618307	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	38627153	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=5,16;RU=GT;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,3:0,1:0,0,7,7
chr3	38627629	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	38647642	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,65;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	38671980	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:38671980_G_GCT:38671980:0,1,0,1
chr3	38671984	.	A	ATTGTCCGCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38671980_G_GCT:38671980:0,1,0,1
chr3	38671986	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38671980_G_GCT:38671980:0,1,0,1
chr3	38674712	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr3	38674731	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr3	38755398	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38755398_C_T:38755398:1,0,1,0
chr3	38755403	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38755398_C_T:38755398:1,0,1,0
chr3	38755407	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38755398_C_T:38755398:1,0,1,0
chr3	38755409	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38755398_C_T:38755398:1,0,1,0
chr3	38765090	.	C	CTCCAGGGAGAAGAGCAGTGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38765090_C_CTCCAGGGAGAAGAGCAGTGTT:38765090:0,1,0,1
chr3	38765093	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38765090_C_CTCCAGGGAGAAGAGCAGTGTT:38765090:0,1,0,1
chr3	38802856	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=115,37;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr3	38835323	.	C	CAGTGTTAAATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38835323_C_CAGTGTTAAATT:38835323:0,3,0,1
chr3	38835328	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=60,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:38835323_C_CAGTGTTAAATT:38835323:0,4,0,1
chr3	38835333	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=60,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:38835323_C_CAGTGTTAAATT:38835323:0,4,0,1
chr3	38888451	.	T	TTCCTACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	38921627	.	A	AGAGAGAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38921627_A_AGAGAGAAG:38921627:0,1,0,1
chr3	38921631	.	T	TTTGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:38921627_A_AGAGAGAAG:38921627:0,1,0,1
chr3	38921634	.	C	CATATG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38921627_A_AGAGAGAAG:38921627:0,1,0,1
chr3	38921635	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38921627_A_AGAGAGAAG:38921627:0,1,0,1
chr3	38926732	.	CCCATCCAAAGATTCTGTGAACTGGATGCAGAAATACTGCCACTTACCTTTGGGCAAACATCTCTCTGGTTGCTTTTTGGGAACCATCTCAGGTAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:0,2:0|1:38926732_CCCATCCAAAGATTCTGTGAACTGGATGCAGAAATACTGCCACTTACCTTTGGGCAAACATCTCTCTGGTTGCTTTTTGGGAACCATCTCAGGTAA_C:38926732:5,2,1,1
chr3	38926816	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=139,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.425:5:2,0:1,2:1|0:38926732_CCCATCCAAAGATTCTGTGAACTGGATGCAGAAATACTGCCACTTACCTTTGGGCAAACATCTCTCTGGTTGCTTTTTGGGAACCATCTCAGGTAA_C:38926732:2,1,1,1
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.277:9:5,1:1,1:3,4,0,2
chr3	38941607	.	A	AAATCCAATC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38941607_A_AAATCCAATC:38941607:0,3,0,1
chr3	38941609	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:38941607_A_AAATCCAATC:38941607:0,3,0,1
chr3	38946683	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=72,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,0:5,2:4,3,2,0
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	38949643	.	C	CAGAGCTAGCGTAGTCCAGGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=208,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0|1:38949643_C_CAGAGCTAGCGTAGTCCAGGT:38949643:0,1,0,1
chr3	38949648	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=208,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38949643_C_CAGAGCTAGCGTAGTCCAGGT:38949643:0,1,0,1
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38961537	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr3	38962763	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38962763_G_A:38962763:0,1,0,1
chr3	38962765	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38962763_G_A:38962763:0,1,0,1
chr3	38988447	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=67,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr3	38991899	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,30;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38991899_TCA_T:38991899:1,0,0,1
chr3	38991902	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38991899_TCA_T:38991899:1,0,0,1
chr3	38991910	.	GAATA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38991910_GAATA_G:38991910:1,0,0,1
chr3	38991918	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,34;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38991910_GAATA_G:38991910:1,1,0,1
chr3	39107993	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	39110246	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,5,2
chr3	39119594	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=103,110;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0|1:39119594_T_G:39119594:5,2,2,0
chr3	39119615	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=50,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.753:14:1,9:2,2:0|1:39119594_T_G:39119594:1,2,8,3
chr3	39125609	.	CTTAATA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr3	39129742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr3	39139774	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:39139774_C_T:39139774:4,3,1,1
chr3	39139793	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:39139774_C_T:39139774:2,2,1,1
chr3	39139799	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:39139774_C_T:39139774:0,1,1,1
chr3	39144910	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr3	39152575	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	39153907	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	39154086	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:0|1:39154086_A_G:39154086:1,2,1,1
chr3	39154088	.	GGAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.287:5:2,1:2,0:1|0:39154086_A_G:39154086:2,2,0,1
chr3	39154097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:39154086_A_G:39154086:2,2,0,1
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	39166769	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39166769_A_G:39166769:1,0,0,1
chr3	39166771	.	CAAAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39166769_A_G:39166769:1,0,0,1
chr3	39170281	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:39170281_T_G:39170281:6,5,1,1
chr3	39170284	.	AG	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:39170281_T_G:39170281:6,5,1,1
chr3	39170814	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39170814_G_A:39170814:0,1,0,1
chr3	39170816	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39170814_G_A:39170814:0,1,0,1
chr3	39170819	.	C	CTGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39170814_G_A:39170814:0,1,0,1
chr3	39170822	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39170814_G_A:39170814:0,1,0,1
chr3	39171498	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,4:2,0:5,1,4,0
chr3	39171676	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=84,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:0,2,4,2
chr3	39175851	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:0,1:0|1:39175851_TC_T:39175851:1,1,0,1
chr3	39175860	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:39175851_TC_T:39175851:1,1,0,1
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,4:6,3:3,5,5,2
chr3	39185077	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=124,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,1:9,2:2,11,1,2
chr3	39185892	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr3	39185937	.	C	CTCCAGGTGGCCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=113,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	39188182	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=73,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr3	39225929	.	G	GCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39225929_G_GCTT:39225929:0,0,1,0
chr3	39225930	.	G	GGTTCTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39225929_G_GCTT:39225929:0,0,1,0
chr3	39226984	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=95,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr3	39227783	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39227783_G_T:39227783:1,0,0,1
chr3	39227785	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39227783_G_T:39227783:1,0,0,1
chr3	39227791	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39227783_G_T:39227783:1,1,0,1
chr3	39227793	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39227783_G_T:39227783:1,1,0,1
chr3	39228954	.	GTGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGTC;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr3	39307920	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=93,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:3,0:11,3:6,8,1,2
chr3	39374067	.	TGCTTTTTGTCTTCTCCTTCCCCTTTCAGACCTACTATCTGCTGGACCAGTGGGTGTTTGGGACTGTAATGTGCAAAGTGGTGTCTG	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:2,2:7,0:20,12,1,1
chr3	39374120	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=98,138;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:1,9:9,0:6,4,9,0
chr3	39375168	.	A	AGCTGGTTCTTTTCCAGGCCTGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	39425188	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,2:9,5,2,1
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr3	39435865	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,1:6,2:5,2,3,0
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	39450065	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:11,3:6,1:12,5,4,0
chr3	39453722	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=112,92;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:3,2,3,0
chr3	39543487	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	39554946	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=92,100;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,5:0,2:2,2,2,5
chr3	39554987	.	A	AGGCCTGTGCATATCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	40204178	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr3	40208735	.	G	GAGATTATAAATGGAAACAGGAGGTTGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=786618,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	40223628	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	40251582	.	A	AGGTGAAACAAGCATTAGAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	40251628	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	40352355	.	ATT	A,AT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29,30;MFRL=112,85,137;MMQ=60,60,60;MPOS=12,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.15,9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.248,0.387:19:2,3,4:3,2,2:6,1,10,2
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,0,4
chr3	40352647	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:40352640_A_G:40352640:0,2,0,2
chr3	40352900	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:9,1,2,0
chr3	40503520	.	ACTGCTG	A,ACTGCTGCTGCTGCTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,15,27;MFRL=0,121,138;MMQ=60,27,27;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,13;RU=CTG;STR;TLOD=3.31,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.294,0.485:2:0,0,1:0,0,0:0,0,1,1
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:40503809_G_A:40503809:0,3,0,3
chr3	40503818	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,1:0|1:40503809_G_A:40503809:0,2,0,3
chr3	40503824	.	A	ATCGTTGAAGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:40503809_G_A:40503809:0,2,0,1
chr3	40519532	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,2,3
chr3	40552916	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:9,1:1,3:6,4,3,1
chr3	40557312	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=127,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:6,4,1,1
chr3	40558156	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:7,3,1,1
chr3	40574107	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=111,90;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr3	40574657	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=189,130;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	40574680	.	AG	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=159,219;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	41291160	.	G	GGGGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41291160_G_GGGGTT:41291160:0,0,0,1
chr3	41291162	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41291160_G_GGGGTT:41291160:0,0,0,1
chr3	41291164	.	T	TGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41291160_G_GGGGTT:41291160:0,0,0,1
chr3	41439841	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41439841_G_GT:41439841:0,1,0,1
chr3	41439843	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41439841_G_GT:41439841:0,1,0,1
chr3	41439855	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	41496924	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	41746765	.	C	CTGTGCCTGGCTCACCCTTGGCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=106,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr3	41831396	.	A	AAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=196,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41831396_A_AAAAC:41831396:0,1,0,1
chr3	41831398	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=196,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41831396_A_AAAAC:41831396:0,1,0,1
chr3	41831399	.	G	GTAAAAGTGAATATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=196,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41831396_A_AAAAC:41831396:0,1,0,1
chr3	41860993	.	T	TCCCCCTGTATTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=126,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr3	41877512	.	A	AACAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41877512_A_AACAAT:41877512:0,0,0,1
chr3	41877513	.	G	GGATTGCATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:41877512_A_AACAAT:41877512:0,0,0,1
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr3	41952937	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:41952937_TA_T:41952937:0,3,1,0
chr3	41952945	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41952937_TA_T:41952937:0,1,1,0
chr3	41973275	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	41996136	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	42133149	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	42202060	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr3	42230627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	42234758	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr3	42242606	.	G	GCATGTCCTTTATAGAATTCTCTACATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.489:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr3	42251263	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=74,101;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr3	42251329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=91,109;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,1:4,6:5,2,4,3
chr3	42261067	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=144,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr3	42264515	.	G	GGACCATCTTGCAGGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr3	42264621	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42264621_G_T:42264621:1,0,0,1
chr3	42264625	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42264621_G_T:42264621:1,0,0,1
chr3	42264626	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42264621_G_T:42264621:1,0,0,1
chr3	42264629	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42264621_G_T:42264621:1,0,0,1
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr3	42438796	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=102,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,0,2
chr3	42567566	.	G	GCTAAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	42568929	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr3	42569081	.	CCTCCA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	42569459	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:42569459_C_T:42569459:1,0,1,0
chr3	42569469	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:42569459_C_T:42569459:2,0,1,0
chr3	42576776	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=97,60;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:12,0,3,0
chr3	42576779	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=97,97;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:2,4:9,0:11,0,4,0
chr3	42599049	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.369:4:0,0:3,1:2,1,1,0
chr3	42605232	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,115;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr3	42632905	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=229,130;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	42660489	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=146,138,96;MMQ=60,60,60;MPOS=25,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.11,11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,8:0.312,0.560:14:0,2,2:1,3,5:1,0,11,2
chr3	42674028	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr3	42676265	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr3	42676925	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:0,6,0,5
chr3	42679497	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	42701240	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,2:0,0:4,2,1,1
chr3	42705274	.	AAA	CCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,1:1,1:2,5,2,0
chr3	42705281	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,0:1,0:1,5,2,0
chr3	42727909	.	A	ATTATAGCAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:42727909_A_ATTATAGCAGG:42727909:2,1,1,1
chr3	42727911	.	G	GGTAGGGCACCACAGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:42727909_A_ATTATAGCAGG:42727909:2,1,1,1
chr3	42727913	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:0|1:42727909_A_ATTATAGCAGG:42727909:2,1,1,1
chr3	42733468	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr3	42733499	.	A	ACATAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42733499_A_ACATAT:42733499:0,2,1,1
chr3	42733502	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42733499_A_ACATAT:42733499:0,2,1,1
chr3	42733503	.	A	ACTGTAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42733499_A_ACATAT:42733499:0,2,1,1
chr3	42734609	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=79,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr3	42735099	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42735099_C_CA:42735099:0,0,0,1
chr3	42735100	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:42735099_C_CA:42735099:0,0,0,1
chr3	42738297	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	42738309	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42738309_C_G:42738309:0,0,1,0
chr3	42738311	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	42738317	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42738309_C_G:42738309:0,1,1,0
chr3	42738322	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42738309_C_G:42738309:0,1,1,0
chr3	42751261	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr3	42774428	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:6,0:3,2:3,7,0,2
chr3	42774475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	42781138	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	42781316	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	42787619	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	42794230	.	A	ATCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42794230_A_ATCAT:42794230:0,0,0,1
chr3	42794231	.	G	GGTGATGATGATGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42794230_A_ATCAT:42794230:0,0,0,1
chr3	42799568	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=70,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:42799568_CA_C:42799568:2,2,1,0
chr3	42799570	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=70,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:42799568_CA_C:42799568:2,2,1,0
chr3	42799765	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=52,86590332;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr3	42799844	.	C	CGGCTAATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	42827437	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	42907386	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=117,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:1,7,1,1
chr3	42907403	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr3	42907408	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr3	42907434	.	T	TCCTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=205,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42907434_T_TCCTA:42907434:0,1,0,1
chr3	42907438	.	CCCTT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=205,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42907434_T_TCCTA:42907434:0,1,0,1
chr3	42908461	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42908461_G_C:42908461:0,0,0,1
chr3	42908466	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42908461_G_C:42908461:0,0,0,1
chr3	42908658	.	C	CCT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=109,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,2:13,0:0|1:42908658_C_CCT:42908658:14,13,1,1
chr3	42908659	.	AGG	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=108,101;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:11,2:15,0:0|1:42908658_C_CCT:42908658:15,14,1,1
chr3	42917432	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=120,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:42917432_G_A:42917432:2,2,1,1
chr3	42917434	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=120,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:42917432_G_A:42917432:2,2,1,1
chr3	42917504	.	G	GACCTTCTGAAATCAACTAT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=83,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:0|1:42917504_G_GACCTTCTGAAATCAACTAT:42917504:4,4,1,1
chr3	42917506	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=83,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,0:0|1:42917504_G_GACCTTCTGAAATCAACTAT:42917504:4,4,1,1
chr3	42956273	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr3	43074430	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:43074430_A_G:43074430:0,0,2,0
chr3	43074434	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:43074430_A_G:43074430:0,0,2,0
chr3	43121559	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	43121598	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=135,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,1,0
chr3	43122584	.	G	GGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr3	43642126	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	43642136	.	T	TCTCTTTTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	43743801	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=304,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr3	43744158	.	T	TATCTGTTTTTATGCCAGTATCATGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43744158_T_TATCTGTTTTTATGCCAGTATCATGC:43744158:0,0,0,1
chr3	43744161	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43744158_T_TATCTGTTTTTATGCCAGTATCATGC:43744158:0,0,0,1
chr3	43744163	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43744158_T_TATCTGTTTTTATGCCAGTATCATGC:43744158:0,0,0,1
chr3	43756577	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=35,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=TG;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:0,1:2,1:2,0,0,3
chr3	43759377	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43759377_T_G:43759377:1,2,0,1
chr3	43759379	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43759377_T_G:43759377:1,2,0,1
chr3	43759381	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43759377_T_G:43759377:1,2,0,1
chr3	43759383	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43759377_T_G:43759377:1,2,0,1
chr3	43759386	.	G	GTTGGAATCTGGGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43759377_T_G:43759377:1,2,0,1
chr3	44284584	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,87;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr3	44285980	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=117,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:3,0:10,4:7,6,2,2
chr3	44286097	.	A	AATCTAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=118,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44286097_A_AATCTAC:44286097:0,1,0,1
chr3	44286099	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=118,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44286097_A_AATCTAC:44286097:0,1,0,1
chr3	44286102	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=118,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44286097_A_AATCTAC:44286097:0,1,0,1
chr3	44286125	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	44286168	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	44296403	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr3	44310863	.	C	CCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:44310863_C_CCCT:44310863:0,1,0,1
chr3	44310868	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44310863_C_CCCT:44310863:0,1,0,1
chr3	44310873	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44310863_C_CCCT:44310863:0,1,0,1
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	44351227	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr3	44399408	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44399408_C_T:44399408:0,2,0,1
chr3	44399428	.	C	CATGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44399408_C_T:44399408:0,0,0,1
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	44403041	.	CAAGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=118,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:44403041_CAAGCT_C:44403041:0,2,0,1
chr3	44403052	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44403041_CAAGCT_C:44403041:0,1,0,1
chr3	44403054	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,24;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44403041_CAAGCT_C:44403041:0,1,0,1
chr3	44403056	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44403041_CAAGCT_C:44403041:0,1,0,1
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,6,12
chr3	44441841	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr3	44598987	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,594;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	44609781	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:0,1,2,3
chr3	44672765	.	C	CAAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:44672765_C_CAAGA:44672765:0,1,0,1
chr3	44672766	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44672765_C_CAAGA:44672765:0,1,0,1
chr3	44778102	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=192,105;MMQ=48,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr3	44778144	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=128,48;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,0:6,6,1,1
chr3	44778147	.	C	CCGCGCCCAGCCCCATATG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=126,48;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,2:4,0:6,5,1,1
chr3	44816705	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=112,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	44816979	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=167,135;MMQ=56,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	44817010	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=184,150;MMQ=52,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	44826315	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,0:0,4:1,0,5,0
chr3	44826411	.	T	TGTGCCCTGGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:0|1:44826411_T_TGTGCCCTGGG:44826411:6,10,0,2
chr3	44826413	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=23,37;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:5,1:0|1:44826411_T_TGTGCCCTGGG:44826411:6,10,0,2
chr3	44826434	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=103,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:3,8,1,1
chr3	44827793	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	44846477	.	GAAA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=104,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:1,1:4,1:4,5,2,1
chr3	44852384	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:9,11,0,2
chr3	44854471	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44854471_T_G:44854471:0,0,1,0
chr3	44854473	.	TC	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44854471_T_G:44854471:0,0,1,0
chr3	44854488	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44854471_T_G:44854471:0,0,1,0
chr3	44854563	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr3	44854764	.	T	TGGATGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44854764_T_TGGATGTA:44854764:0,0,0,1
chr3	44854767	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44854764_T_TGGATGTA:44854764:0,0,0,1
chr3	44879744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr3	44879974	.	T	TGAGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=204,150498034;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:2,0:2,1:0|1:44879974_T_TGAGGAAA:44879974:0,4,1,0
chr3	44879975	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=204,150498034;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44879974_T_TGAGGAAA:44879974:0,4,1,0
chr3	44879995	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=212,204;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:44879995_A_G:44879995:0,2,0,1
chr3	44880001	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=212,204;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:44879995_A_G:44879995:0,2,0,1
chr3	44880003	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=212,204;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:44879995_A_G:44879995:0,2,0,1
chr3	44880013	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=212,204;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:44879995_A_G:44879995:0,2,0,1
chr3	44881851	.	ACC	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:44881851_ACC_A:44881851:1,3,1,1
chr3	44881855	.	A	AAAACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:44881851_ACC_A:44881851:1,3,1,1
chr3	44881859	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=158,63;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:44881851_ACC_A:44881851:1,3,0,1
chr3	44882768	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:44882768_TAA_T:44882768:0,3,0,1
chr3	44882776	.	CC	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:44882768_TAA_T:44882768:0,2,0,2
chr3	44882779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:44882768_TAA_T:44882768:0,2,0,2
chr3	44882785	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:44882768_TAA_T:44882768:0,2,0,2
chr3	44906738	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=136,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	44906746	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	44927084	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44927084_G_A:44927084:0,0,0,1
chr3	44927086	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44927084_G_A:44927084:0,0,0,1
chr3	44932270	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	44943069	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr3	44943389	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	44952492	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:44952492_A_C:44952492:4,5,1,1
chr3	44952501	.	C	CCAACA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:44952492_A_C:44952492:4,7,1,1
chr3	44952942	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	44959725	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	45017904	.	AG	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	45052661	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=124,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr3	45052775	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=114,94;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,3:4,1:1,3,3,1
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:1,3,1,4
chr3	45187671	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.420:10:4,1:2,2:3,3,3,1
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	45515856	.	A	AGAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:45515856_A_AGAG:45515856:1,3,1,1
chr3	45515859	.	A	ACAAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:45515856_A_AGAG:45515856:1,3,1,1
chr3	45515862	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=120,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:45515856_A_AGAG:45515856:1,3,0,1
chr3	45515870	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:45515856_A_AGAG:45515856:1,2,0,1
chr3	45527218	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr3	45533051	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:4,3,1,2
chr3	45542076	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45542076_G_A:45542076:0,0,0,1
chr3	45542083	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45542076_G_A:45542076:0,0,0,1
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,3:0,7:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,7,5
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,7,5
chr3	45677676	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=115,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:8,7,2,1
chr3	45677782	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=117,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.729:9:2,3:0,3:0|1:45748429_G_A:45748429:1,1,3,4
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:2,4:0,3:0|1:45748429_G_A:45748429:1,1,3,5
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,1,6
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	45765132	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,3:1,3:4,1,6,0
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=116,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.662:18:4,5:1,7:4,2,9,3
chr3	45776900	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,3:1,2,0,5
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,2,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:0,0,3,0
chr3	45812990	.	G	GTGGGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=198,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45812990_G_GTGGGGT:45812990:0,2,0,1
chr3	45812992	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=198,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:45812990_G_GTGGGGT:45812990:0,2,0,1
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	45817555	.	G	GTGGCTCAGTCCGTCTGAAGCTGGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	45874667	.	A	ATTTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45874667_A_ATTTCCT:45874667:0,1,0,1
chr3	45874668	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45874667_A_ATTTCCT:45874667:0,1,0,1
chr3	45883560	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:45883560_G_T:45883560:0,1,0,1
chr3	45883562	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45883560_G_T:45883560:0,1,0,1
chr3	45883569	.	C	CTGAGAGAGAATGATATGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:45883560_G_T:45883560:0,1,0,1
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	45988748	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,408;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	45989044	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,4,3
chr3	45989289	.	T	TAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	45989779	.	A	ACACACACATCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	45989791	.	T	TACATAAAAGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	46000210	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46000210_A_C:46000210:0,0,0,1
chr3	46000211	.	T	TTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46000210_A_C:46000210:0,0,0,1
chr3	46001063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	46007982	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,1,1
chr3	46008913	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=79,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr3	46010055	.	GT	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=194,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr3	46010077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	46026259	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=132,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:3,2,1,1
chr3	46026463	.	T	TACAGGCATGCGCCACCACATCCGGCTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=90,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.322:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr3	46026488	.	A	AAAAACCGTTTGATT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46026488_A_AAAAACCGTTTGATT:46026488:0,0,0,1
chr3	46026490	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46026488_A_AAAAACCGTTTGATT:46026488:0,0,0,1
chr3	46063516	.	T	TTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=65,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46063516_T_TTTTC:46063516:1,1,0,1
chr3	46063519	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=65,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:46063516_T_TTTTC:46063516:1,1,0,1
chr3	46245813	.	C	CCATGCCAGGCTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr3	46306961	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,4:1,0:5,2,3,1
chr3	46399101	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,4;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:16,0:17,5:15,18,5,0
chr3	46416470	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,2:5,3,3,5
chr3	46479668	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr3	46480958	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr3	46480989	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=134,155;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,3,0
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	46484964	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:2,4,1,1
chr3	46486829	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=166,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr3	46490366	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr3	46491560	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,547;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr3	46492173	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=110,134;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:46492173_A_G:46492173:2,1,0,2
chr3	46492175	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=110,134;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0|1:46492173_A_G:46492173:2,1,0,2
chr3	46492252	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46492252_T_A:46492252:0,0,0,1
chr3	46492254	.	G	GGTGTCAATGGTAAATAAGGAGGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46492252_T_A:46492252:0,0,0,1
chr3	46501100	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr3	46574256	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,2:2,5:3,2,6,1
chr3	46580771	.	AAA	CTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46580771_AAA_CTG:46580771:0,1,0,1
chr3	46580776	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46580771_AAA_CTG:46580771:0,1,0,1
chr3	46580782	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46580771_AAA_CTG:46580771:0,1,0,1
chr3	46580784	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46580771_AAA_CTG:46580771:0,1,0,1
chr3	46580785	.	A	AACCTCAAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46580771_AAA_CTG:46580771:0,1,0,1
chr3	46621297	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=132,79;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.358:9:2,1:4,2:0|1:46621297_C_T:46621297:3,3,1,2
chr3	46621301	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=123,79;MMQ=52,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:46621297_C_T:46621297:3,2,1,1
chr3	46621327	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=133,79;MMQ=52,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr3	46718298	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	46722006	.	G	GACCTTGGTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr3	46722771	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:46722771_C_T:46722771:1,2,1,1
chr3	46722785	.	A	AGGACGGAGGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0|1:46722771_C_T:46722771:2,1,1,1
chr3	46730879	.	C	CAGGCTCCTGTAGTCCCAGCTACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:2,3,1,1
chr3	46754427	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,163016;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:46754427_C_CCT:46754427:3,1,0,1
chr3	46754429	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,163016;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:46754427_C_CCT:46754427:3,1,0,1
chr3	46783823	.	AGGAAAAGGTAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=134,98;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr3	46783847	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=134,98;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46783847_C_T:46783847:1,0,1,0
chr3	46783850	.	ATCTGGGGCTGC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=104,98;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:46783847_C_T:46783847:2,1,1,0
chr3	46784537	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:0,0:2,1,1,1
chr3	46871974	.	CAGAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	46871975	.	A	AGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:46871975_A_AGC:46871975:1,1,0,1
chr3	46871977	.	A	ATCCCGTTCTTACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:46871975_A_AGC:46871975:1,1,0,1
chr3	46874971	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	46874991	.	CCCGCGTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	46904796	.	GC	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46904796_GC_CT:46904796:0,0,0,1
chr3	46904799	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46904796_GC_CT:46904796:0,0,0,1
chr3	46904802	.	G	GAGGTTTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46904796_GC_CT:46904796:0,0,0,1
chr3	46904805	.	G	GCTGAGATGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46904796_GC_CT:46904796:0,0,0,1
chr3	46904922	.	C	CTAATTGAGCACAATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr3	46935417	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:4,7:11,0:10,5,7,0
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,1:0,0,2,5
chr3	47038633	.	G	GGTGTGCTCTCGTTACTAGTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=84,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.365:5:4,1:0,0:0|1:47038633_G_GGTGTGCTCTCGTTACTAGTA:47038633:1,3,0,1
chr3	47038635	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=84,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.365:5:2,1:0,0:0|1:47038633_G_GGTGTGCTCTCGTTACTAGTA:47038633:1,3,0,1
chr3	47038638	.	G	T,GAAACAGAAAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,20,31;MFRL=0,55,91;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,2,1:0,0,0:0,0,1,2
chr3	47038639	.	G	GAATGTTCTTACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=91,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1|0:47038633_G_GGTGTGCTCTCGTTACTAGTA:47038633:0,1,1,1
chr3	47041094	.	C	CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=142,107;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:47041094_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG:47041094:1,1,2,0
chr3	47041095	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=142,107;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:47041094_C_CCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG:47041094:1,1,2,0
chr3	47041531	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47041531_G_C:47041531:0,0,1,0
chr3	47041540	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=97,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:47041531_G_C:47041531:1,0,1,0
chr3	47041544	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=16,27;MFRL=97,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:47041531_G_C:47041531:1,0,1,0
chr3	47041549	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,12;MFRL=97,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:47041531_G_C:47041531:1,0,1,0
chr3	47041557	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,11;MFRL=97,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:47041531_G_C:47041531:1,0,1,0
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	47044398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	47044639	.	GCT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47046842	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr3	47047499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	47048686	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:47048686_C_CTT:47048686:0,2,1,1
chr3	47048690	.	GC	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:47048686_C_CTT:47048686:0,2,1,1
chr3	47048694	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:47048686_C_CTT:47048686:0,2,0,1
chr3	47048796	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:47048796_C_T:47048796:0,1,1,1
chr3	47048799	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=93,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:47048796_C_T:47048796:0,1,1,1
chr3	47059287	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.335:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	47079112	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	47084216	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	47084218	.	T	TTTGCATTTCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=118,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	47103861	.	GTT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=85,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.873:16:1,5:1,8:0,2,2,12
chr3	47125385	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,8,7
chr3	47125916	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,130;MMQ=54,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr3	47129776	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:47129776_AAC_A:47129776:0,3,0,2
chr3	47129785	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:47129776_AAC_A:47129776:0,3,0,2
chr3	47142907	.	TCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	47155346	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:7,8,1,2
chr3	47161613	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	47162661	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr3	47162667	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47162667_T_TC:47162667:2,5,1,1
chr3	47162669	.	T	TTG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:47162667_T_TC:47162667:2,5,1,1
chr3	47162675	.	TTC	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=135,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:47162667_T_TC:47162667:1,5,1,1
chr3	47276968	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	47277458	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr3	47282303	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr3	47282475	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=113,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:4,0:1,2:2,4,2,1
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	47287603	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	47288995	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:2,4,0,3
chr3	47308732	.	C	CAATGATCTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:1,5,1,1
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	47364216	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47364216_G_T:47364216:0,0,0,1
chr3	47364218	.	CTGGTGG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:47364216_G_T:47364216:0,0,0,1
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	47382182	.	C	CCGTGGAGA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=101,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:47382182_C_CCGTGGAGA:47382182:1,4,1,1
chr3	47382185	.	T	TACTCACC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=101,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0|1:47382182_C_CCGTGGAGA:47382182:1,4,1,1
chr3	47382188	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=81,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:0|1:47382182_C_CCGTGGAGA:47382182:1,2,1,1
chr3	47437798	.	TCAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	47437799	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=151,143;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:47437799_C_T:47437799:0,3,0,1
chr3	47437801	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=151,143;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:47437799_C_T:47437799:0,3,0,1
chr3	47437812	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=158,143;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47437799_C_T:47437799:0,3,0,1
chr3	47437816	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=155,143;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47437799_C_T:47437799:0,2,0,1
chr3	47448362	.	T	TCCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	47450021	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:47450021_A_G:47450021:1,5,1,1
chr3	47450023	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:47450021_A_G:47450021:1,5,1,1
chr3	47450026	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:47450021_A_G:47450021:1,5,1,1
chr3	47450028	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:47450021_A_G:47450021:1,4,1,1
chr3	47450033	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:47450021_A_G:47450021:0,4,1,1
chr3	47450035	.	G	GCT	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:47450021_A_G:47450021:0,4,1,1
chr3	47451177	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47451633	.	C	CGAGTAGGTACCAGGGGGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	47453874	.	G	GGTTCTGTTGATTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	47462594	.	C	CAATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	47464070	.	C	CCTCCCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=80,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	47464090	.	C	CACTCACACCCACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47468973	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:6,8,0,3
chr3	47484393	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:0|1:47484393_G_A:47484393:7,6,1,2
chr3	47484400	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,2:8,0:0|1:47484393_G_A:47484393:10,7,1,2
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	47555142	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	47604086	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=89,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:2,3:3,6:3,3,3,6
chr3	47610655	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,104;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,0,3
chr3	47610672	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=136,104;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,0:8,3:7,7,0,3
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	47618983	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	47718343	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=172,277;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr3	47731045	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	47734882	.	G	GACAATCTATGTAGAAAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47755809	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=156,136;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,1:7,1:7,0,2,0
chr3	47779598	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:2,13,0,2
chr3	47868941	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=111,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:6,8,1,1
chr3	47882535	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:5,2,2,0
chr3	47883158	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:3,1,2,0
chr3	47888820	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,38797896;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:4,5,1,1
chr3	47891036	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,24;MFRL=260,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.757:5:0,3:0,1:1,0,2,2
chr3	47891111	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr3	47894224	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	47894316	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47912703	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,6,11
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	48019417	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:4,5:4,3:5,3,4,5
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	48309880	.	GAAGGCAGTCACAGCAGAAAAATCTTCAGACAA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:11,2:5,0:18,9,1,1
chr3	48337486	.	CATGA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,134;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:48337486_CATGA_C:48337486:4,0,1,0
chr3	48337497	.	GTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:48337486_CATGA_C:48337486:4,0,1,0
chr3	48339944	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=112,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:48339944_G_T:48339944:6,4,1,1
chr3	48339949	.	G	GTGCCATTGGGC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:48339944_G_T:48339944:6,5,1,1
chr3	48339951	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,0:0|1:48339944_G_T:48339944:5,5,1,1
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr3	48414215	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=104,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:1,0,6,4
chr3	48414865	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:3,4,1,1
chr3	48414877	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:48414877_T_A:48414877:2,4,1,1
chr3	48414879	.	A	AGGGGTCCTGGTGG	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:48414877_T_A:48414877:2,4,1,1
chr3	48414915	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48414915_T_C:48414915:0,1,0,1
chr3	48414920	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48414915_T_C:48414915:0,1,0,1
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=124,296;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr3	48417032	.	AG	TA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48417032_AG_TA:48417032:0,0,0,1
chr3	48417035	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48417032_AG_TA:48417032:0,0,0,1
chr3	48417037	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48417032_AG_TA:48417032:0,0,0,1
chr3	48417039	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48417032_AG_TA:48417032:0,0,0,1
chr3	48417043	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48417032_AG_TA:48417032:0,0,0,1
chr3	48419723	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	48423395	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,2,0
chr3	48423656	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,153;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr3	48423674	.	T	TTGGCTTACTGCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=187,153;MMQ=60,47;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr3	48451300	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:3,1:2,4:4,2,3,4
chr3	48453366	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=106,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:7,0:3,3:4,6,0,4
chr3	48454433	.	TT	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:48454433_TT_AG:48454433:1,3,0,1
chr3	48454441	.	G	GGTAGACCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:0,1:0|1:48454433_TT_AG:48454433:0,3,0,1
chr3	48454468	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr3	48459920	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:7,2,1,1
chr3	48463618	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:1,2,1,5
chr3	48463711	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,2:1,3:0,1,3,2
chr3	48464441	.	C	CACTCACCCATCCTACCATACACATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=93,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:48464441_C_CACTCACCCATCCTACCATACACATT:48464441:0,1,0,1
chr3	48464443	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=105,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1|0:48464441_C_CACTCACCCATCCTACCATACACATT:48464441:0,1,0,1
chr3	48474022	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	48502282	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	48505302	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr3	48505339	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	48505599	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=243,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48505599_T_TTC:48505599:0,1,0,1
chr3	48505604	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=243,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48505599_T_TTC:48505599:0,1,0,1
chr3	48505964	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,4:0,0,7,4
chr3	48604184	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=188,1752;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,7:0,0:1,1,0,7
chr3	48605394	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:48605394_C_T:48605394:2,0,0,1
chr3	48605406	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:48605394_C_T:48605394:3,0,0,1
chr3	48605408	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48605394_C_T:48605394:4,0,0,1
chr3	48605411	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:48605394_C_T:48605394:4,0,0,1
chr3	48606065	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	48609941	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:48609941_C_T:48609941:1,4,1,1
chr3	48609949	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=114,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:48609941_C_T:48609941:1,3,1,1
chr3	48609950	.	C	CCCATAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=114,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:0|1:48609941_C_T:48609941:1,3,1,1
chr3	48611603	.	AAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	48611793	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr3	48612473	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	48612939	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=102,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr3	48613600	.	CATGGCAAGGGGAAGGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,0;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:1,1:1,0:4,0,0,1
chr3	48617806	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:0|1:48617806_C_T:48617806:3,5,1,1
chr3	48617816	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,0:2,1:0|1:48617806_C_T:48617806:3,5,1,1
chr3	48617838	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.508:2:1,1:0,0:0|1:48617838_AG_A:48617838:0,1,0,1
chr3	48617840	.	CACCATGAGGACTCA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=81,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:48617838_AG_A:48617838:0,2,0,1
chr3	48618456	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	48619171	.	GCCCAGCGGGCCCCACATCTCCCTGGAGGTGACAAAGACCATCAGTGCTAGTCCCAGGCTCCAGTTAACCCCCTGA	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:1,0:4,4,1,1
chr3	48619242	.	C	CCCTTTCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48619242_C_CCCTTTCT:48619242:0,1,0,1
chr3	48619245	.	G	GGGCCCGTTCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48619242_C_CCCTTTCT:48619242:0,1,0,1
chr3	48619246	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48619242_C_CCCTTTCT:48619242:0,1,0,1
chr3	48619974	.	GAGGGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr3	48622054	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	48624430	.	C	CTGGCGGATGTGGTGTTCCTACCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,1,1
chr3	48625039	.	GAAGGGAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	48626745	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,2:0,0:1,1,1,2
chr3	48628997	.	T	TGGGATGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48628997_T_TGGGATGAG:48628997:0,0,0,1
chr3	48629000	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48628997_T_TGGGATGAG:48628997:0,0,0,1
chr3	48630133	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	48630878	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48630878_C_T:48630878:0,0,0,1
chr3	48630886	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:48630878_C_T:48630878:0,0,0,1
chr3	48631224	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48637215	.	AAC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:48637215_AAC_A:48637215:0,0,1,1
chr3	48637218	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:48637215_AAC_A:48637215:0,0,1,1
chr3	48663794	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=178,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48663794_G_GA:48663794:0,1,0,1
chr3	48663796	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=178,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48663794_G_GA:48663794:0,1,0,1
chr3	48663797	.	A	ACAGGGGGAGCTTCTTGTGGATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=178,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48663794_G_GA:48663794:0,1,0,1
chr3	48667942	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=122,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,0:3,4:6,3,1,3
chr3	48667973	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:5,0:2,2:3,5,0,3
chr3	48668656	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,1:0|1:48668656_C_T:48668656:1,3,1,1
chr3	48668658	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:48668656_C_T:48668656:1,3,1,1
chr3	48668673	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr3	48681828	.	GC	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48682722	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	48682907	.	A	ATGCTGGGGTAAGATATTGTGGTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr3	48685947	.	GG	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48697455	.	CC	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:3,1:3,7,1,1
chr3	48725646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr3	48726145	.	G	GCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGAGAGACTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.338:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr3	48726264	.	GG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48789049	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr3	48802324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=138,164;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	48897150	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	48897166	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48897166_T_A:48897166:0,1,0,1
chr3	48897174	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48897166_T_A:48897166:0,1,0,1
chr3	48916970	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48916970_G_T:48916970:0,1,0,1
chr3	48916976	.	A	AAAAAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48916970_G_T:48916970:0,1,0,1
chr3	48916979	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48916970_G_T:48916970:0,1,0,1
chr3	48956841	.	C	CAGCCCTTCGCTCAAACTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=104,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	48965078	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=104,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:1,2:3,2,5,1
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=73,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,2,4
chr3	49012485	.	A	ACTGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49012485_A_ACTGAG:49012485:0,1,0,1
chr3	49012488	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:49012485_A_ACTGAG:49012485:0,1,0,1
chr3	49020460	.	G	GAAAAAAATGAAGTGATAGTGTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr3	49044767	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,1:3,1:2,2,2,0
chr3	49050323	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49051913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,183;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:1,4:2,10:3,0,9,5
chr3	49054361	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	49054375	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49054375_CT_C:49054375:0,0,0,1
chr3	49054380	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49054375_CT_C:49054375:0,0,0,1
chr3	49054692	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr3	49056080	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49056080_A_G:49056080:0,1,0,1
chr3	49056085	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49056080_A_G:49056080:0,1,0,1
chr3	49056088	.	G	GGTCTGCGAGAGCGCCAGCTATCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49056080_A_G:49056080:0,1,0,1
chr3	49094703	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=133,545;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,3:3,0:6,3,0,3
chr3	49135961	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	49136932	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,81;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:7,1,3,1
chr3	49137698	.	C	CAGCCACACTGGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	49137712	.	G	GATGGAGGATGGCAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr3	49138864	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=109,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,2:4,0:6,6,1,1
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:1,4,0,3
chr3	49140015	.	T	TCTACTCAACATCACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=210,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	49147980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49151323	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49151323_A_G:49151323:0,0,1,0
chr3	49151327	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:49151323_A_G:49151323:0,0,1,0
chr3	49152811	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr3	49154146	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0|1:49154146_A_C:49154146:0,0,3,0
chr3	49154152	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,1:0,0:0|1:49154146_A_C:49154146:0,0,3,0
chr3	49160840	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:49160840_A_C:49160840:5,5,1,1
chr3	49160841	.	C	CTTCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=120,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:0|1:49160840_A_C:49160840:5,5,1,1
chr3	49163970	.	G	GAAAAGAAGCAGTTGGGGAATTGTCAATTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=121,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:1,4,1,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=109,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,4,2
chr3	49166311	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49166311_A_T:49166311:0,1,0,1
chr3	49166312	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49166311_A_T:49166311:0,1,0,1
chr3	49166316	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49166311_A_T:49166311:0,1,0,1
chr3	49166320	.	C	CACGATCACTCTCAAGGACTTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49166311_A_T:49166311:0,1,0,1
chr3	49169852	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=105,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:5,2:1,0:1,7,2,0
chr3	49200374	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:2,3:9,0:7,5,3,0
chr3	49201720	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:49201720_T_A:49201720:0,1,0,1
chr3	49201721	.	A	AATGGACAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=108,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0|1:49201720_T_A:49201720:0,1,0,1
chr3	49210257	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=147,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,2:0,0:2,0,1,1
chr3	49212471	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:49249381_A_G:49249381:0,0,0,6
chr3	49249391	.	CAG	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=143,132;MMQ=40,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:49249381_A_G:49249381:0,3,0,2
chr3	49294384	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:2,3,0,2
chr3	49322324	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr3	49336073	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:0,2:4,0:0|1:49336073_A_G:49336073:2,3,1,1
chr3	49336095	.	C	CCCAGCTGGTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0|1:49336073_A_G:49336073:0,6,1,1
chr3	49338173	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:49338173_G_C:49338173:0,2,0,1
chr3	49338177	.	C	CTTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49338173_G_C:49338173:0,1,0,1
chr3	49338179	.	G	GCCATTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49338173_G_C:49338173:0,1,0,1
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	49395673	.	GGCCGCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,175;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	49397782	.	CC	TT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=143,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:6,10,1,1
chr3	49406030	.	CACTTTTAGAAAAAGTGACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145874283,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49406030_CACTTTTAGAAAAAGTGACA_C:49406030:0,1,0,1
chr3	49406051	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49406030_CACTTTTAGAAAAAGTGACA_C:49406030:0,0,0,1
chr3	49406057	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:49406030_CACTTTTAGAAAAAGTGACA_C:49406030:0,0,0,1
chr3	49413043	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,33;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:49413043_A_C:49413043:1,2,0,1
chr3	49413049	.	C	CATTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49413043_A_C:49413043:0,2,0,1
chr3	49413050	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49413043_A_C:49413043:0,2,0,1
chr3	49413055	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:49413043_A_C:49413043:0,2,0,1
chr3	49413057	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=147,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49413043_A_C:49413043:0,2,0,1
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	49463962	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	49570544	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=110,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,2:1,1,1,1
chr3	49679649	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	49680368	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=76,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0|1:49680368_G_C:49680368:0,1,1,1
chr3	49680373	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49680368_G_C:49680368:0,0,0,1
chr3	49690079	.	C	CACATCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr3	49691210	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	49693647	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	49695055	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=104,87;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:49695055_A_C:49695055:1,2,0,1
chr3	49695060	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=52,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49695055_A_C:49695055:0,2,0,1
chr3	49695063	.	G	GCACCACCCCCACTAACCCTCTCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=52,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:49695055_A_C:49695055:0,2,0,1
chr3	49695071	.	C	CCCCACTAACCCTCTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49695263	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49699722	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49714307	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=108,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:3,4,3,0
chr3	49714367	.	T	TCTCTCTTTCTTTTTCTGCGTCTCTCTGTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=151,77;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:1,6,0,2
chr3	49719886	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:49719886_CT_C:49719886:1,3,1,1
chr3	49719889	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:49719886_CT_C:49719886:1,3,1,1
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	49720603	.	G	GATT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=109,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,1,1
chr3	49720632	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,11;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:49720632_A_C:49720632:0,4,1,0
chr3	49720640	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:49720632_A_C:49720632:0,4,1,0
chr3	49721533	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=110,178;MMQ=60,25;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:13,1:4,2:8,9,2,1
chr3	49722987	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=113,49;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:0|1:49722987_G_T:49722987:12,8,0,2
chr3	49722995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=113,49;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:8,2:0|1:49722987_G_T:49722987:13,9,0,2
chr3	49723001	.	T	TCTCGCTCCGTCGCC	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=111,49;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:8,2:0|1:49722987_G_T:49722987:15,10,0,2
chr3	49723004	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=111,49;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:10,0:9,2:0|1:49722987_G_T:49722987:15,10,0,2
chr3	49724312	.	G	GATTGCCAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,50;MMQ=54,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:49724312_G_GATTGCCAAAA:49724312:2,2,1,1
chr3	49724316	.	T	TCAGAGCCCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=128,50;MMQ=54,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:49724312_G_GATTGCCAAAA:49724312:2,2,1,1
chr3	49724962	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=136,150;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:49724962_A_C:49724962:4,0,1,0
chr3	49724972	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=120,150;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:49724962_A_C:49724962:3,1,1,0
chr3	49726195	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=137,155;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:2,2:4,3:0,8,0,5
chr3	49739290	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:4,5,0,4
chr3	49740257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,27;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49740261	.	G	GGGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,14;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49740264	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,26;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49740266	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,23;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49740268	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49740272	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49740257_T_C:49740257:0,1,0,1
chr3	49743157	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:49743157_T_A:49743157:0,2,0,1
chr3	49743159	.	TT	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:49743157_T_A:49743157:0,2,0,1
chr3	49744392	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=74,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	49753777	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:49753777_G_A:49753777:0,1,4,0
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:49753777_G_A:49753777:0,0,4,4
chr3	49753967	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=158,413;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr3	49757009	.	GGAGGCACGGC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:49757009_GGAGGCACGGC_G:49757009:2,3,1,1
chr3	49757022	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:49757009_GGAGGCACGGC_G:49757009:2,3,1,1
chr3	49758612	.	TTGTAGAG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0|1:49758612_TTGTAGAG_T:49758612:0,2,0,1
chr3	49758622	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49758612_TTGTAGAG_T:49758612:0,2,0,1
chr3	49758764	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=95,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,4:0,2:2,1,1,5
chr3	49759587	.	G	GCAGTGCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,28;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:49759587_G_GCAGTGCA:49759587:2,5,1,1
chr3	49759592	.	G	GCTGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,28;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:49759587_G_GCAGTGCA:49759587:2,5,1,1
chr3	49765483	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	49765762	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1,3,0,1
chr3	49765773	.	A	ACACTGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	49765778	.	A	AGCTAATTTCTTTTTAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=171,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	49770484	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	49830075	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49830075_T_TAC:49830075:0,1,0,1
chr3	49830076	.	T	TTCTGTCATTTCAGCCATCTCAGCCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49830075_T_TAC:49830075:0,1,0,1
chr3	49833189	.	GCCTGCTCGCTGGACCAAAAGGGGGGCACTGGTTCCTGCCCATT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=111,10004;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.312:8:2,0:2,2:3,3,1,1
chr3	49837314	.	T	TGCCACTCTACGTTCTTCCATCAGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	49842881	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,1:2,6:1,1,1,7
chr3	49884913	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,6:3,6:5,2,8,4
chr3	49896824	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	49898000	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,2,3
chr3	49899084	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	49927462	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=92,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:1,2,1,1
chr3	49932513	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49933110	.	GGGTAGGGGCTGATTAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr3	49934337	.	A	ATTAGTGCTATATTTTCATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.759:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	49936102	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	49936398	.	G	GAATACATGAGTAGAACATGTGTTCTGGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=214,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	49936552	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,6:4,0:6,1,5,1
chr3	49941005	.	A	ATCTATCTTGAACGTAGATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50091941	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,254;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50112605	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=113,152;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:7,1:10,10,1,1
chr3	50129425	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	50147826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:2,6,0,2
chr3	50148305	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50153504	.	A	ACAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50153504_A_ACAT:50153504:0,0,0,1
chr3	50153507	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:50153504_A_ACAT:50153504:0,0,0,1
chr3	50155887	.	TGA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,116;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:0,2:2,0:0,3,0,3
chr3	50155919	.	G	GGGATATAAGTAAGCAAGACAAACT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=189,109;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	50212512	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,2:3,2:3,1,0,4
chr3	50212656	.	C	CCTTGCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50212656_C_CCTTGCTGT:50212656:1,0,0,1
chr3	50212658	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50212656_C_CCTTGCTGT:50212656:1,0,0,1
chr3	50222926	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=110,72;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,7:4,0:3,4,4,3
chr3	50223274	.	G	GCTCTTTTCCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	50223794	.	GGCCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	50252007	.	A	AAGGATTAAGAAGTGGGTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=221,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	50253162	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=80,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:3,2:0|1:50253162_C_T:50253162:5,2,0,2
chr3	50253167	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=80,83;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0|1:50253162_C_T:50253162:5,2,0,2
chr3	50254806	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:2,5,3,0
chr3	50255663	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:50255663_C_T:50255663:0,0,4,2
chr3	50255666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:50255663_C_T:50255663:0,0,4,2
chr3	50289640	.	AC	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	50289915	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:2,1,1,1
chr3	50290058	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50290058_C_G:50290058:0,1,0,1
chr3	50290062	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50290058_C_G:50290058:0,1,0,1
chr3	50307822	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50307822_A_G:50307822:2,1,1,0
chr3	50307827	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:50307822_A_G:50307822:2,1,1,0
chr3	50307844	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,2:0.305:8:3,2:2,0:1|0:50307822_A_G:50307822:3,3,0,2
chr3	50312576	.	CCG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:50312576_CCG_C:50312576:0,1,0,1
chr3	50312579	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50312576_CCG_C:50312576:0,1,0,1
chr3	50337823	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50337823_G_A:50337823:1,0,1,0
chr3	50337831	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50337823_G_A:50337823:1,0,1,0
chr3	50339396	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=137,115;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.261:10:2,2:1,0:8,0,2,0
chr3	50386761	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	50403007	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:1,0,1,0
chr3	50403009	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,18;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:1,0,1,0
chr3	50403011	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:1,0,1,0
chr3	50403012	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=11,16;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:1,0,1,0
chr3	50403015	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=20,19;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:1,0,1,0
chr3	50403020	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,13;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:2,0,1,0
chr3	50403022	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,18;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:50403007_G_GT:50403007:2,0,1,0
chr3	50405748	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	50407710	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,1:5,0:3,3,1,1
chr3	50413040	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,28;MFRL=50,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:50413040_A_C:50413040:1,1,1,0
chr3	50413044	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=50,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:50413040_A_C:50413040:1,1,1,0
chr3	50413062	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=50,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr3	50415494	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=-33;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:50415494_A_T:50415494:1,1,1,1
chr3	50415496	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=-34;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:50415494_A_T:50415494:1,1,1,1
chr3	50415502	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,18;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=-37;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:50415494_A_T:50415494:0,1,1,1
chr3	50415504	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,16;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=-38;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:50415494_A_T:50415494:0,1,1,1
chr3	50415550	.	G	GATTTGTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	50597205	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=145,22561149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	50597242	.	C	CACTCCATTAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=22561134,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:4,3,2,1
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	50679244	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,4:2,2:2,5,2,4
chr3	50679647	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr3	50679804	.	A	AGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50679804_A_AGC:50679804:1,0,0,1
chr3	50679806	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50679804_A_AGC:50679804:1,0,0,1
chr3	50679807	.	TTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:50679804_A_AGC:50679804:1,0,0,1
chr3	50681982	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:50681982_A_T:50681982:0,1,0,1
chr3	50681988	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50681982_A_T:50681982:0,1,0,1
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	51102054	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=222,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:51102054_T_TG:51102054:0,1,0,1
chr3	51102057	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=222,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51102054_T_TG:51102054:0,1,0,1
chr3	51251489	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr3	51251723	.	G	GAAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51251723_G_GAAAA:51251723:0,0,0,1
chr3	51251724	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51251723_G_GAAAA:51251723:0,0,0,1
chr3	51266880	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:2,0:5,4:6,2,2,2
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	51273773	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=98,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,0:4,3:3,2,2,1
chr3	51312619	.	CGTCAAGACCAGCTCTCTGGTAGTGGCCCCACACCCACTCCACCCTGTTCAGCTCTTCCCTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.356:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr3	51395571	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	51399330	.	T	TGAGAAACTGCTAATGTCATG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=103,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:1,5,1,1
chr3	51412046	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=73,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51412046_T_A:51412046:1,1,0,1
chr3	51412047	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=73,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51412046_T_A:51412046:1,1,0,1
chr3	51412053	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51412053_C_T:51412053:0,0,0,1
chr3	51412055	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51412053_C_T:51412053:0,0,0,1
chr3	51418726	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:51418726_C_CTT:51418726:4,3,1,1
chr3	51418728	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:51418726_C_CTT:51418726:4,3,1,1
chr3	51425401	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51425401_AG_A:51425401:0,1,0,1
chr3	51425404	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51425401_AG_A:51425401:0,1,0,1
chr3	51425407	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:51425401_AG_A:51425401:0,1,0,1
chr3	51433090	.	C	CCTACCTCAGCATCACAAAATG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr3	51433256	.	C	CACT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:3,2:3,0:0|1:51433256_C_CACT:51433256:3,3,1,1
chr3	51433257	.	G	GGTGGTGTGCCACTGTTCT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,2:3,0:0|1:51433256_C_CACT:51433256:3,3,1,1
chr3	51434140	.	TG	AC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:51434140_TG_AC:51434140:2,5,1,1
chr3	51434143	.	T	TAG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=132,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0|1:51434140_TG_AC:51434140:2,5,1,1
chr3	51440794	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=97,127;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:9,14,0,4
chr3	51457873	.	G	GAAAAAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	51459807	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:5,7,0,2
chr3	51474908	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,2:10,0:14,1,2,1
chr3	51474911	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=142,96;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,1:9,1:0|1:51474911_G_A:51474911:15,1,1,1
chr3	51474916	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=136,96;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:0|1:51474911_G_A:51474911:14,3,1,1
chr3	51477951	.	GG	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	51691570	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:3,0,1,2
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	51864345	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=176,99;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:51864345_G_C:51864345:1,0,1,0
chr3	51864349	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=176,99;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:51864345_G_C:51864345:1,0,1,0
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr3	51907736	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	51907991	.	A	ACGAAGATCTTGCCTATGGCTTCG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=89,50;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:2,0:6,1,1,1
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	51969203	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr3	51970405	.	C	CCGAGCTAATTTTTTTTAATATTTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=715,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr3	51970603	.	G	GAGAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,20;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:51970603_G_GAGAGC:51970603:0,1,1,1
chr3	51970605	.	T	TTAAGACAAATACCTAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=14,29;MFRL=138,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0|1:51970603_G_GAGAGC:51970603:0,1,1,1
chr3	51972086	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:51972086_A_T:51972086:1,1,1,0
chr3	51972089	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:51972086_A_T:51972086:1,1,1,0
chr3	51978948	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,1,0,1
chr3	51978950	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,1,0,1
chr3	51978952	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,26;MFRL=183,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,1,0,1
chr3	51978957	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,0,0,1
chr3	51978959	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,0,0,1
chr3	51978961	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51978948_G_GT:51978948:0,0,0,1
chr3	51979194	.	C	CGCCATGG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr3	51979457	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	51990930	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=65,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,5:0,0:1,1,1,4
chr3	51990931	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,2:0,0:0|1:51990931_G_T:51990931:2,5,1,1
chr3	51990932	.	TCTGGG	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:0|1:51990931_G_T:51990931:2,6,1,1
chr3	51992445	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51992445_G_GCC:51992445:0,1,0,1
chr3	51992447	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51992445_G_GCC:51992445:0,1,0,1
chr3	51994966	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:51994966_C_T:51994966:2,1,1,0
chr3	51994971	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:51994966_C_T:51994966:2,1,1,0
chr3	52003655	.	A	ACAAGATAAGTTTTTAAACCACTCTCTGAAAATCCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=92,125;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr3	52015062	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52015062_G_GT:52015062:0,3,0,1
chr3	52015064	.	A	AACATAGCGAAACCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52015062_G_GT:52015062:0,3,0,1
chr3	52015096	.	CTGA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52015096_CTGA_C:52015096:0,1,0,1
chr3	52015100	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52015096_CTGA_C:52015096:0,1,0,1
chr3	52089925	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:52089925_A_G:52089925:0,1,1,0
chr3	52089926	.	C	CGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=9,32;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52089925_A_G:52089925:0,1,1,0
chr3	52089930	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52089925_A_G:52089925:0,1,1,0
chr3	52089933	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52089925_A_G:52089925:0,1,1,0
chr3	52089935	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,33;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52089925_A_G:52089925:0,1,1,0
chr3	52089966	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52156342	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=141,109;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr3	52156483	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=93,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr3	52159214	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=20,24;MFRL=84,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52159214_A_AC:52159214:1,2,0,1
chr3	52159218	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=22,29;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52159214_A_AC:52159214:1,3,0,1
chr3	52159221	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=26,21;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52159214_A_AC:52159214:1,3,0,1
chr3	52159223	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=21,29;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:52159223_C_T:52159223:1,3,0,1
chr3	52159225	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=20,29;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:52159223_C_T:52159223:1,3,0,1
chr3	52159233	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=33,29;MFRL=175,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:52159233_G_T:52159233:0,2,0,1
chr3	52159244	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=30,28;MFRL=175,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:52159233_G_T:52159233:0,2,0,1
chr3	52159246	.	C	CGAGTCCAT	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=35,26;MFRL=207,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52159223_C_T:52159223:0,1,0,1
chr3	52159247	.	T	TAAA	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=175,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:52159233_G_T:52159233:0,2,0,1
chr3	52159252	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=20,22;MFRL=207,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52159233_G_T:52159233:0,1,0,1
chr3	52181022	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=61,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,8,14
chr3	52255663	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52255663_T_C:52255663:1,0,0,1
chr3	52255687	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52255663_T_C:52255663:1,1,0,1
chr3	52257565	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52257565_C_T:52257565:1,0,0,1
chr3	52257570	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:0,0:0|1:52257565_C_T:52257565:0,1,0,1
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	52258399	.	AT	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52258399_AT_TC:52258399:0,1,0,1
chr3	52258404	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52258399_AT_TC:52258399:0,1,0,1
chr3	52258407	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52258399_AT_TC:52258399:0,1,0,1
chr3	52258409	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52258399_AT_TC:52258399:0,1,0,1
chr3	52265064	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=150,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,0,4
chr3	52283002	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=129,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,3:5,0:2,5,2,1
chr3	52293312	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.364:25:7,5:9,3:7,9,2,7
chr3	52304738	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=104,176;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,3:8,0:9,8,0,3
chr3	52324683	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=113,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:4,3,0,2
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	52327141	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr3	52361989	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=74,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	52362033	.	GAGCAA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:1,2:0,0:0|1:52362033_GAGCAA_G:52362033:1,1,1,1
chr3	52362040	.	GCCAC	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:52362033_GAGCAA_G:52362033:1,1,1,1
chr3	52362048	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:52362033_GAGCAA_G:52362033:1,1,1,1
chr3	52365210	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,4:5,0:6,2,4,0
chr3	52381844	.	CG	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:52381844_CG_AT:52381844:5,2,1,1
chr3	52381848	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0|1:52381844_CG_AT:52381844:5,2,1,1
chr3	52390613	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:1,0:3,0,1,1
chr3	52392038	.	G	GCCCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0|1:52392038_G_GCCCT:52392038:0,1,0,1
chr3	52392040	.	C	CAGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52392038_G_GCCCT:52392038:0,1,0,1
chr3	52392043	.	A	AATGTGTGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52392038_G_GCCCT:52392038:0,1,0,1
chr3	52394156	.	GAG	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52394156_GAG_CTA:52394156:0,1,0,1
chr3	52394160	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52394156_GAG_CTA:52394156:0,1,0,1
chr3	52396944	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	52397203	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52397203_T_TC:52397203:0,0,0,1
chr3	52397204	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52397203_T_TC:52397203:0,0,0,1
chr3	52397207	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52397203_T_TC:52397203:0,0,0,1
chr3	52400740	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=80,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr3	52400915	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	52404111	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr3	52406041	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0|1:52406041_CCA_C:52406041:0,0,1,1
chr3	52406045	.	C	CTCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.780:2:0,2:0,0:0|1:52406041_CCA_C:52406041:0,0,1,1
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52416446	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:52416446_T_C:52416446:2,4,1,1
chr3	52416448	.	AC	CG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:52416446_T_C:52416446:2,4,1,1
chr3	52416452	.	TCC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=86,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr3	52418890	.	C	CCAATTTATGTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=86,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:2,1,0,1
chr3	52418913	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	52420901	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:2,0,1,2
chr3	52426768	.	C	CTCTCCTCTCCTTTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=187,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	52426792	.	CAAACCCCCT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52426792_CAAACCCCCT_C:52426792:0,0,0,1
chr3	52426802	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52426792_CAAACCCCCT_C:52426792:0,0,0,1
chr3	52428690	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=101,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52429635	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr3	52429688	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:2,3,1,2
chr3	52429787	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52429787_T_C:52429787:0,0,0,1
chr3	52429789	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52429787_T_C:52429787:0,0,0,1
chr3	52429792	.	C	CATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52429787_T_C:52429787:0,0,0,1
chr3	52430860	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:1,1:2,2:0|1:52430860_A_AG:52430860:2,2,4,0
chr3	52430865	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=12,12;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:1,0:0,0:0|1:52430860_A_AG:52430860:2,2,4,0
chr3	52430867	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=14,19;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:1,1:0,1:0|1:52430860_A_AG:52430860:2,2,4,0
chr3	52430871	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=14,30;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:0,2:0,2:0|1:52430860_A_AG:52430860:2,1,4,0
chr3	52430875	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,22;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:1,1:0|1:52430860_A_AG:52430860:1,1,4,0
chr3	52433528	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=133,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,13;RU=TG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:2,2,1,1
chr3	52437923	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52438636	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52438636_GC_AT:52438636:0,1,0,1
chr3	52438642	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52438636_GC_AT:52438636:0,0,0,1
chr3	52438643	.	G	GTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52438636_GC_AT:52438636:0,0,0,1
chr3	52439302	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=106,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr3	52441015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52441015_G_A:52441015:0,1,0,1
chr3	52441017	.	CAG	TGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52441015_G_A:52441015:0,1,0,1
chr3	52441021	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52441015_G_A:52441015:0,1,0,1
chr3	52447045	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:52447045_T_TGG:52447045:0,0,0,1
chr3	52447047	.	T	TGCAGCCCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0|1:52447045_T_TGG:52447045:0,0,0,1
chr3	52476905	.	C	CTGACCGACCCCTTAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=50,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:4,1:1,0:3,2,0,1
chr3	52485954	.	TCACC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52485954_TCACC_T:52485954:0,1,0,1
chr3	52485956	.	A	AATGTTCAGTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:52485954_TCACC_T:52485954:0,0,0,1
chr3	52485959	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52485954_TCACC_T:52485954:0,1,0,1
chr3	52486141	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=101,282;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:6,4,1,1
chr3	52492707	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0,0,2,1
chr3	52506230	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	52506491	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52510697_G_A:52510697:0,0,0,1
chr3	52510701	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52510697_G_A:52510697:0,0,0,1
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	52512345	.	G	GAAGCCCTTCCAAGGAGGAGAGCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	52523351	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=113,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:6,3,2,2
chr3	52525401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr3	52525901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=163,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	52535713	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:4,4,1,1
chr3	52537608	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52537608_G_GAA:52537608:0,1,0,1
chr3	52537609	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52537608_G_GAA:52537608:0,1,0,1
chr3	52537613	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=181,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:52537608_G_GAA:52537608:0,1,0,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	52538168	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52538168_A_G:52538168:0,1,0,1
chr3	52538178	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52538168_A_G:52538168:0,1,0,1
chr3	52539449	.	C	CAAGATGGCCGAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52539449_C_CAAGATGGCCGAAT:52539449:0,0,0,1
chr3	52539453	.	A	AACAGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52539449_C_CAAGATGGCCGAAT:52539449:0,0,0,1
chr3	52544462	.	A	AGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=139,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:52544462_A_AGG:52544462:2,3,1,1
chr3	52544464	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=139,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:52544462_A_AGG:52544462:2,3,1,1
chr3	52544470	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	52548104	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	52548681	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	52548734	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52548734_GC_G:52548734:1,0,0,1
chr3	52548738	.	CT	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:52548734_GC_G:52548734:1,0,0,1
chr3	52549983	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549983_G_C:52549983:0,0,1,0
chr3	52549985	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549983_G_C:52549983:0,0,1,0
chr3	52549987	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549983_G_C:52549983:0,0,1,0
chr3	52549994	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,18;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.622:3:0,0:0,1:0|1:52549983_G_C:52549983:1,0,1,1
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,3,0
chr3	52551284	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,4,0
chr3	52552060	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52552060_G_C:52552060:0,1,0,1
chr3	52552065	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52552060_G_C:52552060:0,0,0,1
chr3	52552067	.	A	AGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52552060_G_C:52552060:0,0,0,1
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	52554400	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52554400_T_A:52554400:0,1,0,1
chr3	52554402	.	TT	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52554400_T_A:52554400:0,1,0,1
chr3	52555316	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52555673	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52555673_C_T:52555673:1,1,1,0
chr3	52555680	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=257,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52555673_C_T:52555673:0,1,1,0
chr3	52555957	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	52556890	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52570935	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:5,7,0,2
chr3	52584431	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52584715	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,4,2
chr3	52613289	.	A	AAATGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	52621538	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=75,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	52621627	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,265;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52637486	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	52643307	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr3	52658831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=111,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr3	52658876	.	TTAAAAGAATGTTTATGCA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:2,0:5,3,1,1
chr3	52659054	.	A	ACAACTAGACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=201,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52692359	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	52721305	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,24:0,12:0,0,23,14
chr3	52722266	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	52724746	.	GT	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	52725718	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,187;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr3	52727257	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr3	52730148	.	G	A,C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,22,31;MFRL=162,0,122;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.74,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,2,1:2,0,0:1,2,0,3
chr3	52730152	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52730152_A_T:52730152:1,3,0,1
chr3	52730154	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:52730152_A_T:52730152:1,3,0,1
chr3	52730336	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr3	52778311	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	52778347	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52804635	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52804635_G_C:52804635:0,0,1,0
chr3	52804641	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52804635_G_C:52804635:0,0,1,0
chr3	52814256	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr3	52815905	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52816937	.	G	GAATGTCAAGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,13970;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	52819327	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	52821346	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52821346_G_C:52821346:0,0,0,1
chr3	52821354	.	AG	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52821346_G_C:52821346:0,0,0,1
chr3	52821359	.	C	CCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52821346_G_C:52821346:0,0,0,1
chr3	52821992	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52822140	.	GTC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr3	52822162	.	CTGGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr3	52825634	.	A	ACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:52825634_A_ACTG:52825634:0,0,0,1
chr3	52825637	.	G	GGGTTAGAGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52825634_A_ACTG:52825634:0,0,0,1
chr3	52836249	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52836864	.	G	GTGGGCTTGCCTAGCATAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=86,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr3	52836919	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52837793	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52837855	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=109,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	52840445	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	52852060	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,2,12
chr3	52852360	.	A	AGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52852360_A_AGGAAG:52852360:0,1,0,1
chr3	52852364	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52852360_A_AGGAAG:52852360:0,1,0,1
chr3	52852367	.	A	AGCCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52852360_A_AGGAAG:52852360:0,1,0,1
chr3	52852527	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=104,99;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,4:8,0:5,5,4,0
chr3	52852538	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=110,69;MMQ=45,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,1:2,3:5,3,1,3
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	52853913	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,99;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.266:12:3,0:6,2:6,3,3,0
chr3	52854186	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52860104	.	T	TGCCGGTCCCTGGTGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52864635	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:7,3:4,7,2,2
chr3	52864693	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr3	52867811	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr3	52869045	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:52869045_C_CCTT:52869045:0,2,0,1
chr3	52869048	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:52869045_C_CCTT:52869045:0,2,0,1
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,1,0
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,1,0
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	52877851	.	G	GGATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52877851_G_GGATA:52877851:0,1,0,1
chr3	52877852	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52877851_G_GGATA:52877851:0,1,0,1
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,1:0,0,1,2
chr3	52886605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr3	52946473	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr3	52952433	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,0:3,2:3,1,1,1
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr3	53125862	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr3	53126143	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	53137996	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,2:7,1:10,7,2,1
chr3	53139722	.	C	CTTTCCTCCTAAAACTCCCACT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=103,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:8,8,0,2
chr3	53140900	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:12,0:24,2:0|1:53140900_G_A:53140900:16,20,0,2
chr3	53140906	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:13,0:22,2:0|1:53140900_G_A:53140900:16,19,0,2
chr3	53145948	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.382:3:0,1:2,0:0|1:53145948_C_CAA:53145948:1,1,0,1
chr3	53145954	.	C	CCCTGTAGCTTGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=155,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:53145948_C_CAA:53145948:1,1,0,1
chr3	53154076	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=158,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53154076_T_A:53154076:0,1,0,1
chr3	53154079	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=158,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53154076_T_A:53154076:0,1,0,1
chr3	53154081	.	TA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=158,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53154076_T_A:53154076:0,1,0,1
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=93,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	53213815	.	C	CGTGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr3	53215378	.	T	TTTTAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	53215819	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53215819_A_C:53215819:1,2,0,1
chr3	53215821	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53215819_A_C:53215819:1,2,0,1
chr3	53215822	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53215819_A_C:53215819:1,2,0,1
chr3	53215824	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:53215819_A_C:53215819:1,2,0,1
chr3	53215875	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	53217584	.	A	ACAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53217584_A_ACAC:53217584:1,2,0,1
chr3	53217585	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=110,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:53217584_A_ACAC:53217584:1,2,0,1
chr3	53222761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	53223262	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=86,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0|1:53223262_G_A:53223262:1,2,0,1
chr3	53223275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=86,107;MMQ=48,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53223262_G_A:53223262:0,1,0,1
chr3	53223286	.	G	GGCCTAAAACTTGAGGTAAGGATGGTTGCCAGGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=107,86;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.665:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	53259817	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:5,5,0,5
chr3	53260948	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	53267183	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:4,4,2,4
chr3	53269028	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:0|1:53269028_G_T:53269028:3,4,1,1
chr3	53269036	.	G	GTTCTGCATATCCATGC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=116,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.200:13:5,0:5,2:1|0:53269028_G_T:53269028:7,4,1,1
chr3	53269038	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=128,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.214:12:5,0:5,2:1|0:53269028_G_T:53269028:6,4,1,1
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,5,20
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:0,3,0,8
chr3	53326296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=92,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:6,7,1,1
chr3	53376081	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	53529140	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	53531239	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:53531239_C_T:53531239:6,3,1,1
chr3	53531241	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:53531239_C_T:53531239:6,3,1,1
chr3	53766212	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	53777176	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=87,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:3,2,2,2
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	53783546	.	T	TTCTGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125162249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53814197	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	53834440	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:53834440_GG_AA:53834440:0,1,0,1
chr3	53834444	.	G	GGTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53834440_GG_AA:53834440:0,1,0,1
chr3	53844098	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr3	53882661	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=105,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:1,2,2,2
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr3	53885948	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:53885948_G_C:53885948:2,0,1,0
chr3	53885957	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,0:0|1:53885948_G_C:53885948:2,0,1,0
chr3	53886231	.	CG	TT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=136,120;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:53886231_CG_TT:53886231:0,3,0,1
chr3	53886236	.	AT	TC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,29;MFRL=136,120;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:53886231_CG_TT:53886231:0,3,0,1
chr3	53886246	.	G	GAAAGCTC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=120,136;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:53886231_CG_TT:53886231:0,1,0,1
chr3	53886248	.	GA	G,AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,30,23;MFRL=0,136,120;MMQ=60,40,40;MPOS=8,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	53886249	.	A	ATAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,120;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:53886231_CG_TT:53886231:0,0,0,1
chr3	53886253	.	CAATCTT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=120,136;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:53886231_CG_TT:53886231:0,1,0,1
chr3	53890787	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	53903991	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	53904200	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,1,0
chr3	53910117	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=221,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.748:6:0,2:1,3:0|1:53910117_G_GA:53910117:1,0,1,4
chr3	53910122	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=221,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.762:6:0,2:1,2:0|1:53910117_G_GA:53910117:1,0,1,4
chr3	53911783	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:3,4,2,1
chr3	53914093	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:5,11:2,7:3,4,10,8
chr3	53919724	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	53921028	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	54157712	.	C	CTTCACCCTACAGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54157712_C_CTTCACCCTACAGGG:54157712:0,0,0,1
chr3	54157715	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54157712_C_CTTCACCCTACAGGG:54157712:0,0,0,1
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,0,5
chr3	54615971	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=132,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	54919480	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	54921903	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	54930940	.	G	GGCTGTCAGATGCTCGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	54930959	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGGCTAGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr3	54961949	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=81,115;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr3	54961961	.	T	TTACCATATTTG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr3	54961968	.	C	CACCCCACCCACTCCCCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=118,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=76,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr3	55021825	.	A	AGTTCTCTTCATTTCTTCACTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	55041723	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr3	55041886	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:4,2:4,5,1,2
chr3	55052414	.	T	TCATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	55107661	.	GAAATA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=264,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55107661_GAAATA_G:55107661:0,1,0,1
chr3	55107670	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=264,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55107661_GAAATA_G:55107661:0,1,0,1
chr3	55107674	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=264,145;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55107661_GAAATA_G:55107661:0,1,0,1
chr3	55107676	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=264,145;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55107661_GAAATA_G:55107661:0,1,0,1
chr3	55107930	.	A	ACCCCTTAGAGCTGCTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0|1:55107930_A_ACCCCTTAGAGCTGCTCCT:55107930:0,2,0,1
chr3	55107934	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55107930_A_ACCCCTTAGAGCTGCTCCT:55107930:0,2,0,1
chr3	55107944	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,1,0
chr3	55108064	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,1,0
chr3	55108234	.	CACTGACTGAGATGTTCTCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGACTGAGATGTTCTCTT;STR;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.644:6:0,1:2,3:0,2,2,2
chr3	55108252	.	C	CCCCAGATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:2,1,5,0
chr3	56183071	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:7,10,0,2
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,2:0,3:0,0,6,1
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,11,6
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr3	56601167	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56601167_A_C:56601167:0,0,0,1
chr3	56601169	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56601167_A_C:56601167:0,0,0,1
chr3	56605404	.	TA	T,TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,18,28;MFRL=0,170,127;MMQ=60,60,60;MPOS=19,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.76,10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.300,0.602:7:0,1,0:0,0,5:0,0,0,7
chr3	56647677	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:4,2:0|1:56647677_A_G:56647677:14,5,1,1
chr3	56647682	.	G	GCATTCCCCTTGA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=122,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,0:5,2:0|1:56647677_A_G:56647677:14,5,1,1
chr3	56650051	.	A	ACTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,4:5,0:4,1,3,1
chr3	56651687	.	GTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:56651687_GTTT_G:56651687:0,4,0,1
chr3	56651692	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:56651687_GTTT_G:56651687:0,3,0,1
chr3	56667350	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,288;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:8,8,0,2
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	56675658	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:2,0:6,2:4,5,1,1
chr3	56695060	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr3	56771251	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:4,8,2,0
chr3	56807854	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,2:2,1:0,3,1,2
chr3	57132169	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57132169_G_A:57132169:0,4,0,1
chr3	57132172	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57132169_G_A:57132169:0,4,0,1
chr3	57132302	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr3	57136657	.	T	TCTGTGAGTGGTTGAATTATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	57143463	.	GC	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=152,175;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr3	57143464	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=150,210;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr3	57143468	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=149,193;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	57144326	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,27128632;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:2,6,2,0
chr3	57264801	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=109,83;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:23,0:16,2:16,25,1,1
chr3	57264807	.	G	T,GT	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,20,32;MFRL=111,83,262;MMQ=60,50,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.01,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,2,3:0.071,0.129:28:12,0,1:9,2,2:5,18,3,2
chr3	57282397	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:0,9,0,3
chr3	57293797	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57293797_G_T:57293797:1,0,1,0
chr3	57293802	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57293797_G_T:57293797:1,0,1,0
chr3	57301915	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,23;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:57301915_T_A:57301915:0,1,0,1
chr3	57301917	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=164,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57301915_T_A:57301915:0,1,0,1
chr3	57303478	.	A	AGAATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	57303765	.	GTGAAATGGCAGAAGGTAACAACTATGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,165;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr3	57317348	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=119,52;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:57317348_C_A:57317348:4,3,1,1
chr3	57317362	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:57317348_C_A:57317348:2,3,1,1
chr3	57317364	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:57317348_C_A:57317348:2,3,1,1
chr3	57317368	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:57317348_C_A:57317348:2,1,1,1
chr3	57327763	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:1,0:1,1:0|1:57327763_G_GT:57327763:2,0,1,0
chr3	57327780	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:57327763_G_GT:57327763:2,0,1,0
chr3	57348607	.	T	TTTGGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=56,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:57348607_T_TTTGGAA:57348607:3,1,0,1
chr3	57348609	.	T	TTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=56,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:57348607_T_TTTGGAA:57348607:3,1,0,1
chr3	57390659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:5,1,3,0
chr3	57391284	.	GTTCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	57414200	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:4,5,3,4
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=122,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:1,2:1,3:3,0,5,0
chr3	57448666	.	A	ATGATTTCATTTGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:0,1,3,4
chr3	57457295	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=114,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:7,6,1,1
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:1,1,5,1
chr3	57484336	.	T	TTCACGTTTTGATGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,3:1,0:0,4,2,1
chr3	57487221	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr3	57493608	.	ATAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57493608_ATAT_A:57493608:0,0,0,1
chr3	57493616	.	CT	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57493608_ATAT_A:57493608:0,0,0,1
chr3	57528503	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=131,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:2,4,4,2
chr3	57544925	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	57544959	.	AAAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=101,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAC;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:1,1:2,0:3,1,1,0
chr3	57545634	.	T	TTTAAATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:57545634_T_TTTAAATC:57545634:0,1,0,1
chr3	57545637	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=107,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:57545634_T_TTTAAATC:57545634:0,1,0,1
chr3	57563120	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:5,4:0,1:1,4,2,4
chr3	57563156	.	CACTCTCTA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,69;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	57582784	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:7,2,2,1
chr3	57627495	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57627495_CA_C:57627495:0,1,0,1
chr3	57627505	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57627495_CA_C:57627495:0,1,0,1
chr3	57627542	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	57649496	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=170,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:57649496_C_G:57649496:2,2,1,1
chr3	57649497	.	T	TGTTTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:57649496_C_G:57649496:2,2,1,1
chr3	57651933	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,0:13,5:8,16,0,5
chr3	57652022	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57652022_C_T:57652022:0,0,0,1
chr3	57652024	.	T	TAAAAGGAGTACAACTATACAACCAGCACACAGAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57652022_C_T:57652022:0,0,0,1
chr3	57743337	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chr3	57850486	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:10,0:20,4:20,11,3,1
chr3	57850505	.	C	CTT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:5,1:11,1:12,4,1,1
chr3	57898185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,31;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:6,3,3,0
chr3	58080613	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr3	58087974	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=132,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:2,4,2,0
chr3	58088021	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:5,4,2,0
chr3	58095073	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:3,1:0|1:58095073_G_T:58095073:1,3,0,1
chr3	58095075	.	T	TGATAGAGACA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,0:1,1:0|1:58095073_G_T:58095073:1,3,0,1
chr3	58095078	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:58095073_G_T:58095073:0,2,0,1
chr3	58095080	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,34;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:58095073_G_T:58095073:0,2,0,1
chr3	58095082	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=300,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:58095073_G_T:58095073:0,1,0,1
chr3	58107131	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr3	58112488	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=99,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:1,7,0,4
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	58116659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=75,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:4,2,3,0
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:0|1:58118700_A_G:58118700:0,2,3,3
chr3	58118728	.	G	GCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:58118700_A_G:58118700:0,3,0,1
chr3	58131794	.	T	TAGAACTGGAGTGGGCTCTCTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,27;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.464:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	58131823	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58132778	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	58140455	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	58140624	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:4,3:1,7,2,1
chr3	58156572	.	G	GGTTTCCTTCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58196706	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58253156	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,92;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.784:7:1,6:0,0:0|1:58270963_T_C:58270963:1,0,5,1
chr3	58270968	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,4:0,0:0|1:58270963_T_C:58270963:2,1,4,0
chr3	58279519	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr3	58279523	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:58279523_A_T:58279523:0,3,0,1
chr3	58279530	.	G	GGCACCTCCCTGGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:58279523_A_T:58279523:0,2,0,1
chr3	58279575	.	T	TCCTCTAGGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.568:5:0,1:1,1:0,2,1,2
chr3	58303069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=83,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	58351491	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=130,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:58351491_T_C:58351491:2,0,2,0
chr3	58351493	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=130,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:58351491_T_C:58351491:2,0,2,0
chr3	58351497	.	T	TTTTTAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,26;MFRL=130,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,2:0|1:58351491_T_C:58351491:2,0,2,0
chr3	58351660	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:2,3:3,5,1,3
chr3	58351715	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	58355273	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	58368449	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,2,4
chr3	58376992	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,1,2
chr3	58380815	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=120,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr3	58384995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58410431	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	58410554	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,3:2,1:1,4,3,2
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	58415983	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr3	58416017	.	T	TACTGAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58416017_T_TACTGAGTGC:58416017:0,1,0,1
chr3	58416022	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=126,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:58416017_T_TACTGAGTGC:58416017:0,1,0,1
chr3	58416293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	58416663	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=98,70;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,0:14,3:12,19,0,3
chr3	58417416	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=96,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:5,8:1,8:3,3,15,1
chr3	58484386	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:58484386_C_T:58484386:3,0,1,0
chr3	58484388	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:0,0:3,1:0|1:58484386_C_T:58484386:3,0,1,0
chr3	58487302	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=107,113;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,6:4,0:10,3,6,0
chr3	58508259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:4,4,2,1
chr3	58514763	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=202,5045;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58514763_T_A:58514763:0,1,1,0
chr3	58514766	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=202,5045;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:58514763_T_A:58514763:0,1,1,0
chr3	58514768	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,29;MFRL=202,5045;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:58514763_T_A:58514763:0,1,1,0
chr3	58520256	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=119,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	58639489	.	G	GGATTTGGGAAGAACTCACACGTGGTCTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.814:3:0,3:0,0:0|1:58639489_G_GGATTTGGGAAGAACTCACACGTGGTCTT:58639489:0,0,2,1
chr3	58639492	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:58639489_G_GGATTTGGGAAGAACTCACACGTGGTCTT:58639489:0,0,0,1
chr3	58639494	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:58639489_G_GGATTTGGGAAGAACTCACACGTGGTCTT:58639489:0,0,0,1
chr3	58641352	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,1,3
chr3	58817391	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=94,46;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,2,0
chr3	58854962	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,2505;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	59908109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr3	59999943	.	TA	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:59999943_TA_GG:59999943:0,1,0,1
chr3	59999947	.	C	CTGGTCCG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:59999943_TA_GG:59999943:0,1,0,1
chr3	59999949	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=150,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:59999943_TA_GG:59999943:0,1,0,1
chr3	61734689	.	G	GCAGCGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	62187276	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62187276_G_C:62187276:1,0,0,1
chr3	62187278	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62187276_G_C:62187276:1,0,0,1
chr3	62187281	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62187276_G_C:62187276:1,0,0,1
chr3	62187282	.	A	ATTGGTATAGTTTTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:62187276_G_C:62187276:1,0,0,1
chr3	62189189	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=88,92;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:2,1,4,0
chr3	62189268	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=134,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:4,1:0|1:62189268_A_T:62189268:6,5,1,1
chr3	62189279	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=127,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:4,0:4,2:0|1:62189268_A_T:62189268:5,3,1,1
chr3	62356873	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr3	62431387	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=9,32;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.633:4:0,2:0,1:0,1,3,0
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr3	62477218	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62477218_A_G:62477218:0,0,0,1
chr3	62477229	.	CACAAACACACACACACACACACA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:62477218_A_G:62477218:0,0,0,1
chr3	62479406	.	A	AGAAGGGCTACTCCTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:0|1:62479406_A_AGAAGGGCTACTCCTTT:62479406:0,1,1,1
chr3	62479408	.	T	TCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:62479406_A_AGAAGGGCTACTCCTTT:62479406:0,1,1,1
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	62535668	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,0:3,2:4,6,0,2
chr3	62556729	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	62570953	.	T	TTTTTGAAACGGAGTCTCGCTCTTTTCCCCCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=101,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr3	62571070	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:62571070_A_C:62571070:0,3,0,1
chr3	62571072	.	T	TCTGTGATGGCAGCACGCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=115,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:62571070_A_C:62571070:0,3,0,1
chr3	62636767	.	A	AGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=89,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	62636803	.	G	GCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=225,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	62739532	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62739532_C_CA:62739532:0,1,0,1
chr3	62739535	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:62739532_C_CA:62739532:0,1,0,1
chr3	63542379	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	63640325	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	63825249	.	TTTGA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=97,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr3	63898623	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=119,74;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,0:5,7:0,14,1,6
chr3	63937992	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,4:1,1:4,2,5,0
chr3	63965867	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=104,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:1,3,1,4
chr3	63974084	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	63982082	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=73,99;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:13,5:2,9:8,7,6,8
chr3	63996262	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr3	64004776	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	64004943	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,22:0.743:29:2,11:5,11:5,2,11,11
chr3	64133349	.	CATCA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:2,2:1,0:0|1:64133349_CATCA_C:64133349:2,2,1,1
chr3	64133350	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,3:0.824:3:0,2:0,1:1|0:64133349_CATCA_C:64133349:0,0,2,1
chr3	64133358	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:64133349_CATCA_C:64133349:1,2,1,1
chr3	64133361	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=121,60;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:64133349_CATCA_C:64133349:1,2,1,1
chr3	64139064	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:64139064_A_ACC:64139064:0,1,0,1
chr3	64139065	.	T	TACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64139064_A_ACC:64139064:0,1,0,1
chr3	64145739	.	G	GACATCTAAGAAGGAACTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=61,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	64184397	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	64184530	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr3	64184599	.	A	ATTTTATTAGTGAAGATGATTTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	64524968	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:12,6,0,2
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	64527676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	64553963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	64582567	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr3	64582588	.	C	CCTTTGCTTGTGTT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:64582588_C_CCTTTGCTTGTGTT:64582588:5,4,1,1
chr3	64582590	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:64582588_C_CCTTTGCTTGTGTT:64582588:5,4,1,1
chr3	64589782	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64589782_A_C:64589782:0,1,0,1
chr3	64589783	.	A	AGTTCGGGGGCTGCTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64589782_A_C:64589782:0,1,0,1
chr3	64589786	.	A	ACCTCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=149,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64589782_A_C:64589782:0,1,0,1
chr3	64589851	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=148,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	64601550	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	64601873	.	A	ACACCACC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	64617423	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	64617690	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:64617690_A_G:64617690:0,0,0,3
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:64617690_A_G:64617690:0,0,0,3
chr3	64619468	.	G	GCAACAGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	64633622	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=50,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:6,4:0,1:0|1:64640206_TA_T:64640206:3,3,3,2
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=115,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,4:0,1:0|1:64640206_TA_T:64640206:3,3,3,2
chr3	64666913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=94,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr3	64666934	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=106,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:64666934_T_C:64666934:6,8,1,1
chr3	64666936	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=106,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:64666934_T_C:64666934:6,8,1,1
chr3	64666937	.	A	ACTCTCAGCAGCC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=93,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:7,0:0|1:64666934_T_C:64666934:6,9,1,1
chr3	64666940	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=24,20;MFRL=93,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:0|1:64666934_T_C:64666934:6,8,1,1
chr3	64667059	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	65377058	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=148,133;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:65377058_C_T:65377058:1,4,2,0
chr3	65377060	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=148,133;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:65377058_C_T:65377058:1,4,2,0
chr3	65439044	.	T	TCCTTTTTCATTTCTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	65456207	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=71799571,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	65464228	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=92,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr3	65607637	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=90,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.421:38:5,7:17,8:8,14,5,11
chr3	66023592	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	66430613	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	66444724	.	C	CCCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66444724_C_CCCTG:66444724:0,0,0,1
chr3	66444725	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:66444724_C_CCCTG:66444724:0,0,0,1
chr3	66449537	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.380:3:2,0:0,1:0|1:66449537_A_AGG:66449537:0,2,0,1
chr3	66449539	.	A	ATCAAAGGTGAACCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:66449537_A_AGG:66449537:0,2,0,1
chr3	66449554	.	A	AAATGCTGTAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	67048847	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:2,1:0|1:67048847_G_A:67048847:0,2,0,1
chr3	67048851	.	G	GAGATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:0,0:2,1:0|1:67048847_G_A:67048847:0,2,0,1
chr3	67048853	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:2,1:0|1:67048847_G_A:67048847:0,2,0,1
chr3	67579660	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67579660_G_T:67579660:0,1,0,1
chr3	67579667	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67579660_G_T:67579660:0,1,0,1
chr3	67579669	.	G	GATGGAGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=126,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:67579660_G_T:67579660:0,1,0,1
chr3	68055809	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=79,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:2,3,2,0
chr3	68055925	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=1612,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68055925_T_TG:68055925:0,1,0,1
chr3	68055927	.	T	TGGCCAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=1612,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68055925_T_TG:68055925:0,1,0,1
chr3	68055928	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=1612,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68055925_T_TG:68055925:0,1,0,1
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr3	68782213	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr3	69029036	.	T	TTGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:1,1:0|1:69029036_T_TTGGG:69029036:0,2,0,1
chr3	69029037	.	A	AGGCAGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,0:1,1:0|1:69029036_T_TTGGG:69029036:0,2,0,1
chr3	69036678	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:69036678_G_C:69036678:0,3,0,1
chr3	69036683	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:69036678_G_C:69036678:0,3,0,1
chr3	69036693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=49,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:69036678_G_C:69036678:0,2,0,1
chr3	69036700	.	T	TTTTGTTTATTATGTCCCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=90,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	69053447	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	69058967	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:6,3,4,3
chr3	69059083	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=123,189;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:1,0:0,1:0|1:69059083_AC_A:69059083:0,1,0,1
chr3	69059096	.	AAAAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0|1:69059083_AC_A:69059083:0,0,0,2
chr3	69079191	.	A	ACACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,80;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:69079191_A_ACACAC:69079191:0,0,0,1
chr3	69079194	.	T	TACACACACACACACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,80;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,9;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:69079191_A_ACACAC:69079191:0,0,0,1
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr3	69096614	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,6,3
chr3	69104685	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=99,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.184:41:18,0:16,7:17,17,0,7
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,11,16
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr3	69112495	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,0:7,4:14,0,4,0
chr3	69129630	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	69134415	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr3	69168135	.	G	GCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:69168135_G_GCA:69168135:1,4,0,1
chr3	69168136	.	G	GATTGTGAAGTCGGCAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:3,1:0|1:69168135_G_GCA:69168135:1,4,0,1
chr3	69168145	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:69168145_GG_CA:69168145:0,1,0,1
chr3	69168152	.	G	GCAGGTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:69168145_GG_CA:69168145:0,1,0,1
chr3	69168922	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:69168922_G_A:69168922:9,8,1,1
chr3	69168941	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0|1:69168922_G_A:69168922:5,9,1,1
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,10,9
chr3	69242712	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=183,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:69242712_C_T:69242712:1,0,1,0
chr3	69242733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=183,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:69242712_C_T:69242712:1,0,1,0
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	69246240	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69246240_T_TC:69246240:0,2,0,1
chr3	69246241	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:69246240_T_TC:69246240:0,2,0,1
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr3	69351620	.	A	ATCTGTCAGATCCATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=162,256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	69362706	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	69988391	.	GGTGGATCACACC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:69988391_GGTGGATCACACC_G:69988391:0,1,1,1
chr3	69988407	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:69988391_GGTGGATCACACC_G:69988391:0,1,1,1
chr3	69998236	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,669;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:8,3,1,1
chr3	70005718	.	T	TTACTGTGTGTTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70005718_T_TTACTGTGTGTTG:70005718:1,3,0,1
chr3	70005721	.	C	CTGGTTTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70005718_T_TTACTGTGTGTTG:70005718:1,3,0,1
chr3	70005724	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:70005718_T_TTACTGTGTGTTG:70005718:1,3,0,1
chr3	71008341	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	71015045	.	CTTGCATAGGAGATCTGCCTGGACTGCTGTCACTCTCGTTGCTGTTGGTATGCTCCATTGCCCCGTTCAGCTCTTCCCGTATTGCGCTGGCTAAG	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.108:27:3,2:5,0:12,12,1,2
chr3	71102811	.	CTGCTGGAGGAGAACCTGGAGCTGCTGAGGGCTCAGCACTTGTTGCTGGAGGATCTGCTGCATT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=108,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.124:23:6,2:3,0:11,10,1,1
chr3	71247304	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	71739343	.	A	ATTAGCCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	71739375	.	T	TTTAGAAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71739375_T_TTTAGAAAAGA:71739375:0,0,0,1
chr3	71739380	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71739375_T_TTTAGAAAAGA:71739375:0,0,0,1
chr3	71759742	.	A	ACTCCTAAGCTTCAGTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71759742_A_ACTCCTAAGCTTCAGTCTC:71759742:0,0,0,1
chr3	71759746	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71759742_A_ACTCCTAAGCTTCAGTCTC:71759742:0,0,0,1
chr3	71803983	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:0,0:2,0:3,0,1,0
chr3	71803993	.	C	CGGGGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,9;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,1,0
chr3	71803995	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:2,1,2,0
chr3	71804387	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71804387_G_A:71804387:0,0,0,1
chr3	71804390	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71804387_G_A:71804387:0,0,0,1
chr3	71804392	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71804387_G_A:71804387:0,0,0,1
chr3	71830778	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:71830778_A_C:71830778:0,3,0,1
chr3	71830784	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:71830778_A_C:71830778:0,4,0,1
chr3	71830786	.	A	ACTTCCAAGGACACAAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:71830778_A_C:71830778:0,3,0,1
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr3	72799555	.	CAGAGGCCCAGACACTCCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:1,0:1,1:1,1,1,0
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	73024268	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:12,4:14,0:12,14,2,2
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr3	73112723	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:73112723_T_C:73112723:3,0,1,0
chr3	73112729	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:73112723_T_C:73112723:4,0,1,0
chr3	73112732	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:73112723_T_C:73112723:4,0,1,0
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=55.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,5:0,15:0,0,8,12
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,3,5
chr3	73434086	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=106,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,1,2
chr3	73437112	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	73440108	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr3	73440324	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	73453325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,5:1,0:1,1,3,2
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	74313738	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=167,160;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74313738_C_T:74313738:0,1,0,1
chr3	74313741	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=167,160;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74313738_C_T:74313738:0,1,0,1
chr3	74313746	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=167,160;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74313738_C_T:74313738:0,1,0,1
chr3	74313749	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=167,160;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74313738_C_T:74313738:0,1,0,1
chr3	74347377	.	C	CGTGGCTGGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	74350997	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	74351805	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr3	74385882	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74385882_A_ACT:74385882:0,1,0,1
chr3	74385885	.	G	GCATTACTTATTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74385882_A_ACT:74385882:0,1,0,1
chr3	74385887	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=205,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74385882_A_ACT:74385882:0,1,0,1
chr3	74420534	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=142,978;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74420534_C_T:74420534:0,1,1,0
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chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=126,124;MMQ=25,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:1,0:7,3:0|1:75679988_A_G:75679988:1,9,1,2
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=14;MBQ=31,25;MFRL=125,107;MMQ=34,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,0:7,5:1,9,1,4
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chr3	75713669	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=108,122;MMQ=50,55;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.244:47:24,5:11,6:20,16,7,4
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=119,122;MMQ=51,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:18,3:10,2:0|1:75713725_C_T:75713725:12,16,2,3
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=110,122;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:14,3:5,2:0|1:75713725_C_T:75713725:7,15,2,3
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=26,23;MFRL=117,132;MMQ=50,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:8,3:2,5:3,8,2,6
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chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=128,122;MMQ=47,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:0|1:75713725_C_T:75713725:2,10,1,2
chr3	75713772	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=123,115;MMQ=56,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
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chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=114,96;MMQ=28,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.280:19:10,3:4,2:0|1:75714095_G_A:75714095:6,8,2,3
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=114,96;MMQ=28,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:10,2:4,1:0|1:75714095_G_A:75714095:6,8,0,3
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=197,115;MMQ=49,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,0,5
chr3	75714146	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=115,206;MMQ=25,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=134,126;MMQ=50,31;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,1:10,5:10,3,6,0
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=115,101;MMQ=60,31;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.569:42:6,10:12,14:12,6,21,3
chr3	75714337	.	T	G	.	.	DP=127;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=94,94;MMQ=60,43;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=290.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,92:0.739:124:16,52:16,39:18,14,69,23
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=138;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=90,99;MMQ=50,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,26:0.194:135:58,15:49,10:71,38,17,9
chr3	75714379	.	T	G	.	.	DP=108;ECNT=12;MBQ=25,30;MFRL=93,97;MMQ=54,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,13:0.136:100:49,5:35,8:48,39,4,9
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=101;ECNT=12;MBQ=30,28,24;MFRL=95,98,67;MMQ=52,60,27;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.43,33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:47,29,13:0.328,0.140:89:24,19,8:21,10,5:22,25,24,18
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=12;MBQ=30,20;MFRL=95,67;MMQ=52,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.132:74:35,5:24,4:28,37,6,3
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=12;MBQ=30,28;MFRL=99,99;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,21:0.338:63:26,10:16,10:0|1:75714391_G_T:75714391:17,25,8,13
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=12;MBQ=30,27;MFRL=99,100;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,19:0.333:58:23,9:15,8:0|1:75714391_G_T:75714391:17,22,7,12
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=56;ECNT=12;MBQ=27,28;MFRL=102,100;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,18:0.328:56:23,8:14,9:0|1:75714391_G_T:75714391:16,22,7,11
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=127,128;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,5:6,3:0,9,2,6
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=127,136;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,1:4,4:2,9,0,5
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=25,29;MFRL=106,143;MMQ=40,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:75714447_C_T:75714447:0,2,0,4
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=12;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:75714447_C_T:75714447:0,0,0,2
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=141,97;MMQ=50,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:4,3,3,1
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=135,97;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,4:3,4:8,3,4,4
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=100,135;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,4:9,1:13,6,2,3
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=105,100;MMQ=60,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,25:0.766:32:4,16:3,9:5,2,15,10
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=110,130;MMQ=59,25;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:22,1:12,2:21,13,2,1
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=140,124;MMQ=52,49;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:0|1:75714805_TG_T:75714805:2,7,1,2
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=140,124;MMQ=52,49;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:0|1:75714805_TG_T:75714805:2,7,1,2
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=140,124;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:1,6,2,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=138,119;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:3,1:5,3:0|1:75714840_A_G:75714840:3,7,2,2
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=135,119;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:3,1:7,3:0|1:75714840_A_G:75714840:3,8,2,2
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=108,124;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.236:19:6,1:9,3:0|1:75714840_A_G:75714840:8,7,2,2
chr3	75715173	.	CT	TG	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=123,143;MMQ=50,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,4:8,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:6,10,3,6
chr3	75715181	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=123,146;MMQ=52,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.347:24:7,4:9,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:5,11,2,6
chr3	75715199	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=149,122;MMQ=40,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:0|1:75715199_T_G:75715199:0,13,2,1
chr3	75715202	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=30,30;MFRL=149,122;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,2:6,1:0|1:75715199_T_G:75715199:1,13,2,1
chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=123,177;MMQ=30,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:3,8,0,5
chr3	75715220	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=130,130;MMQ=40,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:0|1:75715220_G_A:75715220:1,8,2,1
chr3	75715222	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=130,130;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,2:5,1:0|1:75715220_G_A:75715220:1,8,2,1
chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr3	75715264	.	CC	TG	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=0,20;MFRL=0,130;MMQ=60,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,2,3
chr3	75785942	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,23;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	75785954	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.755:4:1,0:0,2:0|1:75785954_C_A:75785954:1,0,3,0
chr3	75785959	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=26,24;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.528:6:2,1:1,2:0|1:75785954_C_A:75785954:3,0,3,0
chr3	75785970	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=32,27;MFRL=162,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,26;MFRL=181,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:2,0,7,0
chr3	75786019	.	GG	CA	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:1,1:3,0,4,0
chr3	75786041	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=30,24;MFRL=108,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,2:2,0,4,2
chr3	75786059	.	CA	TA,TG	.	.	DP=29;ECNT=10;MBQ=25,20,25;MFRL=75,92,121;MMQ=60,60,60;MPOS=0,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.91,45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,13:0.131,0.468:27:5,3,8:4,0,5:8,3,8,8
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:15,4:10,3:16,11,5,2
chr3	75786080	.	G	A,T	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=26,28,26;MFRL=90,113,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=79.16,7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,22,5:0.607,0.156:35:5,14,2:3,8,3:6,2,16,11
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=22;MBQ=27,27;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,6:0.123:55:24,4:24,2:0|1:75786132_T_C:75786132:26,23,3,3
chr3	75786163	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=22;MBQ=31,25;MFRL=108,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,5:0.101:57:20,3:29,1:0|1:75786132_T_C:75786132:20,32,3,2
chr3	75786175	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=22;MBQ=31,25;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,8:0.156:56:22,2:25,5:0|1:75786175_C_A:75786175:19,29,4,4
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=55;ECNT=22;MBQ=26,33;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.120:55:19,0:28,3:22,27,2,4
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=22;MBQ=26,29;MFRL=107,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,7:0.150:51:18,4:24,3:0|1:75786211_A_G:75786211:17,27,5,2
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=22;MBQ=32,25;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,11:0.231:50:13,7:24,3:0|1:75786175_C_A:75786175:17,22,4,7
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=22;MBQ=31,26;MFRL=113,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.407:47:12,7:14,12:12,16,8,11
chr3	75786230	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=22;MBQ=30,28;MFRL=104,116;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.254:45:16,3:17,8:17,17,3,8
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=22;MBQ=31,28;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.113:51:19,2:25,3:0|1:75786211_A_G:75786211:18,28,2,3
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=22;MBQ=27,24;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:18,2:24,3:0|1:75786211_A_G:75786211:17,27,2,3
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=52;ECNT=22;MBQ=31,28;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,8:0.170:51:12,6:25,2:0|1:75786175_C_A:75786175:16,27,3,5
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=22;MBQ=30,28;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.138:41:10,3:23,2:0|1:75786211_A_G:75786211:13,23,2,3
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=22;MBQ=26,28;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:17,3:24,2:0|1:75786211_A_G:75786211:16,27,2,3
chr3	75786261	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=22;MBQ=31,25;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,13:0.349:38:12,4:11,9:0|1:75786261_C_T:75786261:10,15,3,10
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=22;MBQ=27,32;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.485:29:7,5:8,8:0|1:75786278_A_C:75786278:5,10,3,11
chr3	75786288	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=22;MBQ=27,25;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.371:25:7,4:8,4:0|1:75786261_C_T:75786261:5,11,3,6
chr3	75786298	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=22;MBQ=28,32;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:8,3:5,3:0|1:75786261_C_T:75786261:5,10,2,5
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=22;MBQ=30,28;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:9,2:11,2:0|1:75786211_A_G:75786211:6,16,2,2
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=18;ECNT=22;MBQ=30,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.536:13:3,5:2,2:0|1:75786278_A_C:75786278:1,5,3,4
chr3	75786337	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0|1:75786261_C_T:75786261:1,5,1,1
chr3	75786354	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=22;MBQ=31,30;MFRL=145,136;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:2,1:0|1:75786261_C_T:75786261:1,5,2,0
chr3	75786355	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=22;MBQ=28,24;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:2,2:3,0:3,2,0,2
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=29;MBQ=25,32;MFRL=125,361;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:0|1:75786417_T_C:75786417:3,0,1,3
chr3	75786423	.	T	TTC	.	.	DP=11;ECNT=29;MBQ=28,26;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TC;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:2,1:4,0:4,2,1,1
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=29;MBQ=23,28;MFRL=119,243;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:3,1:5,3,1,1
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=29;MBQ=30,28;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:5,2:2,3:0|1:75786417_T_C:75786417:7,1,2,3
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=29;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=29;MBQ=27,29;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,3:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:7,6,3,3
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=29;MBQ=31,28;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:8,3:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:10,6,3,3
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=29;MBQ=32,27;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,1:7,1:0|1:75786469_G_A:75786469:11,8,2,1
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=29;MBQ=32,29;MFRL=105,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,1:6,1:0|1:75786469_G_A:75786469:11,8,1,1
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=29;MBQ=31,34;MFRL=105,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,1:9,1:0|1:75786469_G_A:75786469:12,12,1,1
chr3	75786500	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=29;MBQ=25,27;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.317:20:7,3:6,1:0|1:75786500_A_G:75786500:6,8,3,3
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=29;MBQ=28,23;MFRL=101,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:6,3:5,3:0|1:75786500_A_G:75786500:4,8,7,3
chr3	75786515	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=29;MBQ=27,28;MFRL=102,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,5:4,6:3,8,9,3
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=29;MBQ=25,31;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.476:15:4,3:3,3:0|1:75786500_A_G:75786500:4,4,5,2
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=21;ECNT=29;MBQ=32,30;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.715:19:3,6:2,8:0|1:75786555_C_CTG:75786555:3,2,9,5
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=29;MBQ=25,31;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:4,5:2,6:0|1:75786555_C_CTG:75786555:6,2,12,3
chr3	75786583	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=29;MBQ=28,32;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:12,7,1,1
chr3	75786586	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=29;MBQ=33,31;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:11,1:7,3:0|1:75786586_G_T:75786586:13,7,0,4
chr3	75786593	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=29;MBQ=33,26;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:12,1:9,3:0|1:75786586_G_T:75786586:13,9,0,4
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=29;MBQ=30,28;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,10:6,4:5,7,7,9
chr3	75786598	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=29;MBQ=30,23;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.200:28:14,2:9,3:0|1:75786586_G_T:75786586:12,11,0,5
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=29;MBQ=31,28;MFRL=129,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:7,6:6,6:0|1:75786555_C_CTG:75786555:6,9,6,7
chr3	75786608	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=29;MBQ=31,32;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,1:10,3:0|1:75786608_C_T:75786608:11,12,0,4
chr3	75786610	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=29;MBQ=28,31;MFRL=126,122;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,12:0.448:27:6,5:7,6:0|1:75786555_C_CTG:75786555:6,9,5,7
chr3	75786618	.	CT	AC	.	.	DP=28;ECNT=29;MBQ=33,24;MFRL=128,122;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:10,5:10,2:6,14,4,4
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=29;MBQ=28,25;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.423:28:8,7:8,5:6,10,4,8
chr3	75786620	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=29;MBQ=31,27;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.172:29:13,1:9,3:0|1:75786608_C_T:75786608:10,14,0,5
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=29;MBQ=32,25;MFRL=126,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.219:29:12,3:10,2:7,16,3,3
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=29;MBQ=30,28;MFRL=91,108;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.228:36:10,3:16,4:14,14,5,3
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=27,29;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:5,2:11,0:0|1:75786737_A_T:75786737:8,8,1,1
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:9,1:9,7,0,2
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=31,28;MFRL=117,95;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,2:4,1:0|1:75786737_A_T:75786737:6,6,1,2
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=26,27;MFRL=95,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,6:1,2,6,5
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=21,24;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:0|1:75786737_A_T:75786737:6,6,0,2
chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=30,30;MFRL=108,177;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,0,3
chr3	75786833	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.497:6:1,1:2,1:0|1:75786833_G_A:75786833:0,3,2,1
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=10;MBQ=30,20;MFRL=356,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:75786833_G_A:75786833:0,2,2,1
chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=29,25;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:3,2:0|1:75786888_C_T:75786888:7,6,2,1
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=30,30;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.256:17:10,1:3,3:0|1:75786888_C_T:75786888:7,6,1,3
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:12,4:18,2:13,20,4,2
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,2:14,2:4,19,2,2
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=110,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:7,13,1,1
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=133,73;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:10,2:3,5:0|1:75787049_C_A:75787049:8,5,2,5
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=125,73;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:10,2:3,5:0|1:75787049_C_A:75787049:7,6,2,5
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=133,90;MMQ=60,59;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:11,0:1,2:0|1:75787169_G_A:75787169:6,7,1,1
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=158,90;MMQ=60,59;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:2,2:0|1:75787169_G_A:75787169:9,8,1,1
chr3	75787199	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,90;MMQ=60,59;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:11,9,1,1
chr3	75787382	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.601:28:6,7:5,8:0|1:75787464_C_T:75787464:5,6,6,11
chr3	75787476	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:13,0:10,7:8,15,2,5
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:6,6:4,10:0|1:75787464_C_T:75787464:5,6,5,11
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.506:29:9,9:6,4:0|1:75787516_C_G:75787516:8,7,3,11
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.512:28:7,8:4,5:0|1:75787516_C_G:75787516:7,7,3,11
chr3	75787637	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,30;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:4,4:6,10:6,5,4,10
chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,4:9,9:6,8,3,10
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:1,3:11,5:5,9,7,3
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:1,4:11,6:4,9,7,3
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:0,3:7,8:2,5,5,6
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=25,22;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:1,6:2,9:3,1,9,7
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=22,25;MFRL=119,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,2:9,2:9,7,3,1
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=27,20;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.375:19:5,3:6,3:7,5,3,4
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,11,11
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,8:5,4:3,4,5,7
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,34;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:75787801_TG_CA:75787801:7,11,2,0
chr3	75787808	.	A	ACAGCTGAACATTTTTTCACACCAGT	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=25,30;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:75787801_TG_CA:75787801:6,11,2,0
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,2:2,2:6,7,1,3
chr3	75787812	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:3,1:6,7,0,2
chr3	75787829	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.311:18:9,4:4,1:3,10,2,3
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=90,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:4,8:2,1:0|1:75787869_CA_TG:75787869:2,4,2,7
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=90,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,6:2,1:0|1:75787869_CA_TG:75787869:2,4,1,6
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=24,32;MFRL=100,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:4,1:3,6,1,3
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=20,33;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:0|1:75787927_A_G:75787927:1,2,3,3
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,2:3,3:0|1:75787927_A_G:75787927:2,1,3,3
chr3	75787961	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=25,20;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:0,2:5,0:4,2,1,1
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:3,2,2,1
chr3	75787996	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=25,26;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:5,3,2,1
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=34,25;MFRL=103,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,2:3,3,6,2
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=27,20;MFRL=82,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.712:13:1,6:3,3:0|1:75788076_A_C:75788076:1,3,6,3
chr3	75788088	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=30,20;MFRL=167,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.612:12:2,5:3,2:0|1:75788076_A_C:75788076:2,3,4,3
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=30,25;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,2,3
chr3	75788152	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=22,30;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,5:2,4:2,1,5,4
chr3	75788192	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=24,32;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:4,2:14,0:0|1:75788192_T_C:75788192:9,11,0,2
chr3	75788195	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=20;MBQ=25,28;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,2:12,0:0|1:75788192_T_C:75788192:8,10,0,2
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=24,26;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,2:13,1:9,9,0,3
chr3	75788200	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=30,22;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,1:14,0:0|1:75788192_T_C:75788192:9,10,0,2
chr3	75788226	.	CA	AG,GG	.	.	DP=19;ECNT=20;MBQ=31,26,32;MFRL=139,121,134;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.44,21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,7:0.184,0.356:19:2,2,2:7,1,5:6,3,2,8
chr3	75788230	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=20;MBQ=31,28;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,1:10,2:7,9,1,2
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=20;MBQ=31,28;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,3:7,5:5,5,3,5
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:4,4,4,3
chr3	75788273	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=20;MBQ=32,27;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=27,29;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:4,0:4,6,2,2
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=20;MBQ=29,24;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:3,5,2,4
chr3	75788314	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=26,31;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:9,3:6,3:6,9,3,3
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=20;MBQ=27,20;MFRL=97,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:3,1:7,5:5,5,2,5
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=16;ECNT=20;MBQ=32,34,20;MFRL=159,120,75;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.32,23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,6:0.316,0.482:13:1,2,0:1,3,6:0,2,3,8
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=20;MBQ=33,20;MFRL=121,75;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,0:4,6:0|1:75788382_C_T:75788382:0,7,3,3
chr3	75788390	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=20;MBQ=27,20;MFRL=121,75;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,0:4,6:0|1:75788382_C_T:75788382:0,7,3,3
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=20;MBQ=34,24;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,0:4,4:0|1:75788382_C_T:75788382:0,6,2,3
chr3	75788411	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr3	75788426	.	T	TTCTG	.	.	DP=4;ECNT=20;MBQ=26,28;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75788426_T_TTCTG:75788426:0,3,0,1
chr3	75788427	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=20;MBQ=24,23;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:75788426_T_TTCTG:75788426:0,3,0,1
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0|1:75790370_A_C:75790370:1,0,6,0
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0|1:75790370_A_C:75790370:1,0,6,0
chr3	75790405	.	TG	AC	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,4:2,3:2,1,5,3
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=35,20;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.855:12:1,4:0,5:1,0,7,4
chr3	75790409	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,4:1,0,7,5
chr3	75790444	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=84,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,3:9,0:5,9,2,1
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=32,21;MFRL=55,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,4:4,5:0|1:75790446_GG_TA:75790446:2,4,5,5
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=31,22;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:0|1:75790446_GG_TA:75790446:2,5,5,3
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr3	75790516	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:75790516_T_A:75790516:3,2,1,1
chr3	75790525	.	A	AATGAGAAACATTGGAAGACTTTGTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=106,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:75790516_T_A:75790516:2,2,1,1
chr3	75790590	.	G	GATGAGAGGCCCTAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=15;MBQ=32,24;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:75790704_C_T:75790704:1,0,3,0
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:75790704_C_T:75790704:1,0,3,0
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=28,25;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0|1:75790704_C_T:75790704:1,0,4,0
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=15;MBQ=24,31;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:0|1:75790704_C_T:75790704:1,0,5,0
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=15;MBQ=28,25;MFRL=117,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:0|1:75790704_C_T:75790704:2,0,5,0
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=29,31;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.540:11:1,3:4,3:0|1:75790704_C_T:75790704:4,1,5,1
chr3	75790783	.	G	GGTCTCCAGCATCATGTCCCTGTACAGGTTTCTTCTGAGCATCATCCAGGTCCTGCTACTCCTCCCAGGTGAAGTGCATAGCTACCTCCTCAAAGGATGCCAACTCCTGTAATGATAGCAGGCTGTTATAA	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=32,33;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.437:32:4,0:13,1:13,5,5,9
chr3	75790791	.	GC	CA	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=31,31;MFRL=117,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,9:0.323:29:4,3:12,5:0|1:75790791_GC_CA:75790791:11,9,6,3
chr3	75790798	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=23,27;MFRL=123,99;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,2:15,4:0|1:75790798_G_A:75790798:14,8,2,4
chr3	75790807	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=30,31;MFRL=120,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:5,2:14,4:0|1:75790791_GC_CA:75790791:11,10,4,2
chr3	75790809	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=27,23;MFRL=120,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:5,2:14,3:0|1:75790791_GC_CA:75790791:11,9,4,2
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=28,26;MFRL=194,121;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,4:5,9:4,4,6,7
chr3	75790824	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=31,27;MFRL=124,44;MMQ=60,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:6,1:12,3:0|1:75790798_G_A:75790798:9,9,2,2
chr3	75790836	.	GCC	G	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,34;MFRL=119,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,1:11,3:0|1:75790791_GC_CA:75790791:11,8,1,3
chr3	75790839	.	ACTCCTCCCAGGTGAAGTGCACAGCTACCTCCTCAAAGGACACCAACTCCTGTAATGATACCAGGCTGTTGTAGGTCTCCAGCATCACGTTCCTGTACAGGGTCCTCTAAGCATCATCCACGTCCTGC	A	.	.	DP=41;ECNT=15;MBQ=27,27;MFRL=119,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:7,1:11,2:0|1:75790791_GC_CA:75790791:19,18,1,3
chr3	75790972	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=266,142;MMQ=57,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,2,4
chr3	77572023	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=129,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr3	77600033	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:2,2:0|1:77600033_A_G:77600033:2,4,1,1
chr3	77600043	.	C	CATGGTGGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:77600033_A_G:77600033:2,4,1,1
chr3	77645895	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=102,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:12,0:11,10,0,3
chr3	77645946	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,23;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:0,3:6,0:0,8,0,3
chr3	77645951	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=124,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,0:2,5:0,8,0,5
chr3	77645967	.	CT	TA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:77645967_CT_TA:77645967:0,4,0,2
chr3	77645971	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,27;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:77645967_CT_TA:77645967:0,4,0,2
chr3	77645978	.	T	TCTGATCATTTGCAATCTTTGCTATAATCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=131,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.481:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	77671473	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=104,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,2,1
chr3	77671640	.	A	ATCATCTGCAACATCCGTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=189,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	78655961	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=104,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:4,0:9,5:0|1:78655961_G_A:78655961:5,8,0,5
chr3	78655964	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=104,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:4,0:7,5:0|1:78655961_G_A:78655961:5,8,0,5
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:6,6,3,1
chr3	78695185	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	78717508	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr3	78737831	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:6,3:2,0:6,2,2,2
chr3	78737962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	78763761	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78763761_G_T:78763761:0,1,0,1
chr3	78763763	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78763761_G_T:78763761:0,1,0,1
chr3	78763767	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78763761_G_T:78763761:0,1,0,1
chr3	78763769	.	C	CTGTGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78763761_G_T:78763761:0,1,0,1
chr3	78766992	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=109,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,2:2,7:0,3,2,7
chr3	78796078	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	78987879	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=79,86;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:9,6,2,0
chr3	78988176	.	A	ACCCGGCCAGCTATTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	79067694	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CA;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr3	79639102	.	A	AAACAGCCAAATC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:79639102_A_AAACAGCCAAATC:79639102:0,2,0,1
chr3	79639106	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79639102_A_AAACAGCCAAATC:79639102:0,2,0,1
chr3	79639109	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79639102_A_AAACAGCCAAATC:79639102:0,2,0,1
chr3	79639139	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79639139_G_A:79639139:0,0,0,1
chr3	79639145	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79639139_G_A:79639139:0,0,0,1
chr3	81548209	.	T	TAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr3	81643251	.	AACT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81643251_AACT_A:81643251:0,0,0,1
chr3	81643258	.	A	ATAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81643251_AACT_A:81643251:0,0,0,1
chr3	81643263	.	AG	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81643251_AACT_A:81643251:0,0,0,1
chr3	81643266	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:81643251_AACT_A:81643251:0,0,0,1
chr3	81695544	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=114,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:0|1:81695544_T_C:81695544:8,8,1,1
chr3	81695555	.	A	AAT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:81695544_T_C:81695544:6,11,1,1
chr3	81695557	.	G	GCCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:81695544_T_C:81695544:6,11,1,1
chr3	81695560	.	G	GGTAACTTGAAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:81695544_T_C:81695544:6,11,1,1
chr3	81810516	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr3	85932657	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:85932657_CAT_C:85932657:0,0,0,1
chr3	85932663	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85932657_CAT_C:85932657:0,0,0,1
chr3	85932666	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85932657_CAT_C:85932657:0,0,0,1
chr3	85935413	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:5,3,6,4
chr3	87295049	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr3	87295157	.	G	GTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:87295157_G_GTTT:87295157:0,0,0,1
chr3	87295159	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:87295157_G_GTTT:87295157:0,0,0,1
chr3	87313353	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	87325634	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=238,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:87325634_T_C:87325634:0,2,0,1
chr3	87325635	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=238,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:87325634_T_C:87325634:0,2,0,1
chr3	87325645	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=238,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:87325634_T_C:87325634:0,2,0,1
chr3	87325710	.	T	TAGCACATACTAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	88040502	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:2,2,2,1
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr3	88202439	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=116,139;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:5,2,0,2
chr3	89448375	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr3	89456599	.	G	GGAAAACATTGCAATGGGCTCTTGTCAGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	89457347	.	AA	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=101,621;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:89457347_AA_CC:89457347:0,1,1,0
chr3	89457350	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=101,621;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89457347_AA_CC:89457347:0,1,1,0
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	89480466	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=118,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:6,9,2,1
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	89499259	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	93605126	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr3	93624987	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,1:4,2:3,8,1,2
chr3	93646022	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=175,176;MMQ=45,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	93646113	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=132,145;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:2,5,3,0
chr3	93754080	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,19;MFRL=0,168,85;MMQ=60,44,50;MPOS=28,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=A;STR;TLOD=3.67,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.438,0.432:4:0,0,0:0,2,1:0,0,3,1
chr3	93768347	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=105,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.289:28:8,0:11,1:0|1:93768347_A_C:93768347:3,17,8,0
chr3	93768353	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=114,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,8:0.309:26:8,0:7,2:0|1:93768347_A_C:93768347:2,16,8,0
chr3	93768359	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=115,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:8,0:7,0:0|1:93768347_A_C:93768347:1,16,3,0
chr3	93813171	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:3,5:6,0:3,6,2,3
chr3	93845062	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:1,7:6,5:5,2,6,7
chr3	97194242	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,6:3,0:7,3,6,0
chr3	97194317	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:1,5,0,3
chr3	97439335	.	A	AGGGACAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	97454667	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	97466432	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=108,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,2,4
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr3	97510752	.	TA	GA,T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,33,30;MFRL=131,89,107;MMQ=60,60,60;MPOS=1,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:2,1,1:0,3,0,2
chr3	97510754	.	T	TGCTCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:97510754_T_TGCTCC:97510754:0,4,0,1
chr3	97510758	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:97510754_T_TGCTCC:97510754:0,4,0,1
chr3	97510762	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:97510754_T_TGCTCC:97510754:0,3,0,1
chr3	97510765	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=172,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:97510754_T_TGCTCC:97510754:0,3,0,1
chr3	97596142	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:3,6,0,3
chr3	97596482	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,3:6,0:5,3,1,2
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,2:2,1:0,4,1,2
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:0,0:6,2:0,6,0,2
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:3,5:7,6:4,8,2,9
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,3,4
chr3	97666183	.	TCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTC;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:2,1,1,0
chr3	97666357	.	TT	AC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666360	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666364	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666370	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666371	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,23;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666373	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97666375	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,34;MFRL=88,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:97666357_TT_AC:97666357:0,2,0,1
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=188,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr3	97727736	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr3	97727737	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,0:4,0,2,1
chr3	97731434	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=63,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr3	97805954	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,1575;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	97806521	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97806521_A_C:97806521:1,0,0,1
chr3	97806522	.	C	CATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:97806521_A_C:97806521:1,0,0,1
chr3	97806804	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:1,6,0,2
chr3	97806999	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	97868795	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=113,95;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,3:3,3:6,4,3,3
chr3	97888197	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=119,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.686:7:2,5:0,0:1,1,2,3
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=34.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr3	98241789	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:2,2:5,1:2,9,0,3
chr3	98251507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:7,3,1,1
chr3	98304467	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,11:2,4:6,1,9,6
chr3	98311784	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:6,4,4,1
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:3,1,4,2
chr3	98503776	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=126,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,3:5,1:3,3,3,1
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr3	98518691	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:98518691_G_C:98518691:0,3,0,3
chr3	98518708	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=13,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:98518691_G_C:98518691:1,3,0,1
chr3	98531342	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,2:0,2,1,3
chr3	98536793	.	T	TAAGATCTCCAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	98538066	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:7,0,3,1
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	98600383	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=155,155;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.651:12:0,7:3,0:4,0,8,0
chr3	99509800	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	99514183	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr3	99552190	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,0:2,3:0,4,1,3
chr3	99567728	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:11,0:0|1:99567728_G_A:99567728:12,14,1,1
chr3	99567734	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,2:10,0:0|1:99567728_G_A:99567728:12,13,1,1
chr3	99865964	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=156,121;MMQ=60,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr3	99879346	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=111,91;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,4:15,0:6,23,3,1
chr3	99890783	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=91,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,1:5,5:1,4,2,4
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:2,3,2,2
chr3	100096811	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=161,157;MMQ=47,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100096811_C_T:100096811:0,2,0,1
chr3	100096818	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=161,157;MMQ=47,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:100096811_C_T:100096811:0,2,0,1
chr3	100096849	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=157,197;MMQ=40,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:100096849_G_A:100096849:0,3,0,1
chr3	100096855	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=157,197;MMQ=40,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:100096849_G_A:100096849:0,3,0,1
chr3	100096857	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=171,124;MMQ=45,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,6:6,2:4,7,3,5
chr3	100277182	.	G	GGAGAGAGACAGAGAGAGAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,0;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr3	100277476	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:1,0:8,3:2,7,1,2
chr3	100295733	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	100295953	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	100368546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,1:4,7:2,5,4,4
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100387709_A_G:100387709:0,0,1,0
chr3	100387714	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100387709_A_G:100387709:0,0,1,0
chr3	100387808	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:5,3:1,0:5,2,3,0
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	100432785	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	100438784	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=126,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:4,4:2,4:5,1,7,2
chr3	100438797	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=108,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.203:23:14,2:5,2:15,4,3,1
chr3	100451588	.	T	TGTCCAACTCCAGTCATGGCTGCAATCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	100451612	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100451612_G_A:100451612:0,1,0,1
chr3	100451614	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=151,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100451612_G_A:100451612:0,1,0,1
chr3	100455609	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	100467018	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,17:0,0,16,19
chr3	100467291	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:1,5,1,2
chr3	100473505	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=96,95;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:3,2:8,6:7,4,4,4
chr3	100489772	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=114,1483;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,0:12,3:4,17,3,0
chr3	100515197	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.265:20:9,2:6,3:11,4,4,1
chr3	100581261	.	AT	A,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,25,14;MFRL=162,169,153;MMQ=60,60,60;MPOS=17,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.16,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.382,0.296:10:1,2,0:1,1,0:0,3,1,6
chr3	100583651	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=94,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.579:7:2,0:1,2:2,1,1,3
chr3	100585694	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr3	100593659	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	100962645	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:4,4:0,5:3,1,5,4
chr3	100986219	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	100992548	.	TGT	CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr3	101038648	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=96,67;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:101038648_G_A:101038648:1,3,1,1
chr3	101038653	.	C	CTCTCTGCCAATATAATTCTGTCTTGGTTCCTAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=96,67;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:101038648_G_A:101038648:1,3,1,1
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:10,7:7,6:9,8,11,3
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,2:2,0:1,3,0,3
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	101059031	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:10,1:4,0:0|1:101059031_A_T:101059031:7,8,2,1
chr3	101059040	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,68;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:12,3:4,0:0|1:101059031_A_T:101059031:7,9,2,1
chr3	101070563	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.262:20:10,1:4,4:0|1:101070563_T_C:101070563:2,13,3,2
chr3	101070568	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.262:20:10,1:4,4:0|1:101070563_T_C:101070563:2,13,3,2
chr3	101070576	.	GT	AA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,0:3,2:0|1:101070563_T_C:101070563:2,11,3,1
chr3	101070579	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,0:1,1:0|1:101070563_T_C:101070563:2,11,1,1
chr3	101177848	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=92,87;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,4,4
chr3	101177946	.	G	GGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:101177946_G_GGAA:101177946:0,3,0,1
chr3	101177948	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=164,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:101177946_G_GGAA:101177946:0,3,0,1
chr3	101212855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr3	101231894	.	TA	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:3,1,2,1
chr3	101231921	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=88,79;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,4:2,2:4,3,4,2
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	101304414	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr3	101378930	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101378930_AC_A:101378930:0,2,0,1
chr3	101378934	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:101378930_AC_A:101378930:0,2,0,1
chr3	101378944	.	T	TCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	101399910	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr3	101404813	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr3	101445614	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:3,0:8,3:4,9,0,3
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	101571093	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:3,11,1,1
chr3	101571103	.	GGGGAGAGGGGTT	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=112,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:6,1:0|1:101571103_GGGGAGAGGGGTT_G:101571103:4,11,1,1
chr3	101571119	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:101571103_GGGGAGAGGGGTT_G:101571103:1,11,1,1
chr3	101571121	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:101571103_GGGGAGAGGGGTT_G:101571103:1,11,1,1
chr3	101573345	.	ATT	A,AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27,31;MFRL=117,164,142;MMQ=60,60,60;MPOS=8,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.79,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:1,0,2:1,2,0:2,0,4,0
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:0,0:2,0:3,0,4,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr3	102181073	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,0:1,0,3,1
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=60,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:0,2:1,0,4,3
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr3	105252619	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:105252619_G_T:105252619:0,3,0,1
chr3	105252621	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:105252619_G_T:105252619:0,3,0,1
chr3	105258993	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	105258996	.	GTTTGACTTCTAC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr3	105259010	.	TGGA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105259010_TGGA_T:105259010:0,1,0,1
chr3	105259015	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:105259010_TGGA_T:105259010:0,1,0,1
chr3	105259046	.	G	GGTACATCCCTAGGAATTT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	105264217	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=21,29;MFRL=75,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:3,2,0,1
chr3	105264220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr3	105264230	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=40899733,102;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.530:3:1,1:0,1:0|1:105264230_GG_CA:105264230:1,0,0,2
chr3	105264231	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,40899733;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0|1:105264231_G_C:105264231:0,0,1,0
chr3	105264233	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=102,40899733;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.470:3:0,1:1,0:0|1:105264231_G_C:105264231:0,2,1,0
chr3	105264234	.	T	TTATTCCTTCTTGCTTCTCCTCTA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=40899733,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105264230_GG_CA:105264230:1,0,0,1
chr3	105377985	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:9,5,1,1
chr3	105397365	.	G	GAT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:13,0:0|1:105397365_G_GAT:105397365:10,8,0,2
chr3	105397368	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=119,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,2:13,0:0|1:105397365_G_GAT:105397365:10,9,0,2
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	105421110	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,2,0
chr3	105422844	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr3	105422980	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.202:36:17,0:12,6:9,20,0,7
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	105495371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:105495371_T_C:105495371:5,5,1,1
chr3	105495376	.	T	TTAG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:105495371_T_C:105495371:4,5,1,1
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	107096923	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,152;MMQ=60,20;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:3,3:9,0:5,8,3,0
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	107491701	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,132;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.186:25:10,0:11,4:7,14,0,4
chr3	107510197	.	A	ATAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAG;STR;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,2,4
chr3	107524393	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:107524393_A_G:107524393:2,2,0,1
chr3	107524395	.	T	TGAACTTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:107524393_A_G:107524393:2,2,0,1
chr3	107524397	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=95,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:107524393_A_G:107524393:2,2,0,1
chr3	107769461	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:12,0:12,7:4,20,0,7
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	107778463	.	T	TAGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:107778463_T_TAGAC:107778463:1,1,0,1
chr3	107778466	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:107778463_T_TAGAC:107778463:1,1,0,1
chr3	107778477	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107778477_A_T:107778477:0,1,1,0
chr3	107778480	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:107778477_A_T:107778477:0,1,1,0
chr3	107799168	.	TATTAAATAGTAGCTGAGCTGATCCTGGAAAGGAAAAAGAAAAATGTTTC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=116,42;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.251:31:8,7:9,0:11,13,4,3
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	107886671	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:6,0:0|1:107886671_CTT_C:107886671:5,9,1,1
chr3	107886675	.	T	TGAAATAGAGCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=106,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:107886671_CTT_C:107886671:5,9,1,1
chr3	107932827	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=124,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:107932827_G_T:107932827:11,14,0,2
chr3	107932828	.	CAACGCT	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,2:10,0:0|1:107932827_G_T:107932827:12,18,0,2
chr3	107932845	.	AA	TC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:10,0:0|1:107932827_G_T:107932827:9,14,0,2
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr3	108100538	.	G	GGGGCGCTGCCTTCATTGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:108100538_G_GGGGCGCTGCCTTCATTGGCA:108100538:0,1,0,1
chr3	108100541	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:108100538_G_GGGGCGCTGCCTTCATTGGCA:108100538:0,1,0,1
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	108133350	.	T	TTTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:108133350_T_TTTTA:108133350:0,0,0,2
chr3	108133356	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:108133350_T_TTTTA:108133350:0,0,0,2
chr3	108133360	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:108133350_T_TTTTA:108133350:0,0,0,2
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,0,4,4
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,0,4,4
chr3	108135799	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,5:2,3:0,2,2,6
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr3	108174537	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=121,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,2,2
chr3	108174769	.	T	TTCTAAATGTATTATATTCATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	108179063	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr3	108179219	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,7:0,7:0,2,5,12
chr3	108182168	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=151,162;MMQ=50,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:108182168_C_CT:108182168:0,2,0,1
chr3	108182184	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=151,162;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108182168_C_CT:108182168:0,2,0,1
chr3	108182185	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=152,161;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:108182185_A_G:108182185:0,2,0,1
chr3	108182187	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=152,161;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:108182185_A_G:108182185:0,2,0,1
chr3	108183639	.	A	ACAGCCAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=206,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108183639_A_ACAGCCAAT:108183639:1,0,0,1
chr3	108183641	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=206,77;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108183639_A_ACAGCCAAT:108183639:1,0,0,1
chr3	108188993	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:5,8:0,1:2,3,4,5
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	108211532	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=191,232;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	108211544	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=191,232;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=148,136;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.790:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	108216807	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr3	108229457	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:108229457_G_C:108229457:1,4,1,1
chr3	108229459	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:108229457_G_C:108229457:1,4,1,1
chr3	108229462	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,1:0|1:108229457_G_C:108229457:1,4,1,1
chr3	108276264	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=46,145,146;MMQ=60,60,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.53,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.252,0.252:13:1,1,0:6,2,3:3,4,0,6
chr3	108288397	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:7,1:4,6:6,5,6,2
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr3	108300981	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=113,88;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:21,0:22,5:23,21,0,5
chr3	108303829	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	108335290	.	AAATTTTCTCCAATGAGCATGAATTATTTGTATAATGTAAACATATGTAGATGTTTGTTCAGACTTATAGACATTTTTAACTGAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.284:10:0,2:0,0:5,2,2,1
chr3	108344636	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.528:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	108353913	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108353913_T_TA:108353913:0,1,0,1
chr3	108353914	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108353913_T_TA:108353913:0,1,0,1
chr3	108353917	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:108353913_T_TA:108353913:0,1,0,1
chr3	108353920	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:108353913_T_TA:108353913:0,1,0,1
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=12,31,32;MFRL=118,144,116;MMQ=60,60,60;MPOS=31,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=5.32,13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,8:0.274,0.621:12:0,1,3:0,2,4:1,0,2,9
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	108369954	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,4:5,5:7,6,6,3
chr3	108392989	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=963,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	108403019	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.483:10:5,3:0,1:4,1,4,1
chr3	108403086	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr3	108406977	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108406977_T_TC:108406977:0,1,0,1
chr3	108406979	.	T	TCTTTCCCTTAGTGGGTCATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108406977_T_TC:108406977:0,1,0,1
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	108682218	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	108690221	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=97,92;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:5,4,2,4
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr3	108724202	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	108781952	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	108788616	.	A	AGAATATTAAGGGAATATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=157,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr3	109019392	.	GGTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=122,150;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	109019402	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:109019402_C_CA:109019402:0,3,0,1
chr3	109019403	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:109019402_C_CA:109019402:0,3,0,1
chr3	109019405	.	ACG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:109019402_C_CA:109019402:0,3,0,1
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr3	109049478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=74,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,1:1,1:0|1:109049478_G_A:109049478:3,2,0,2
chr3	109049480	.	A	ACTAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=74,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,1:1,1:0|1:109049478_G_A:109049478:3,2,0,2
chr3	109049482	.	T	TCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=102,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0|1:109049478_G_A:109049478:2,2,0,2
chr3	109049720	.	C	CTAAGGGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	109050972	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109050972_C_A:109050972:0,0,0,1
chr3	109050975	.	AA	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109050972_C_A:109050972:0,0,0,1
chr3	110790879	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=66,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	110852896	.	G	GAA	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:0|1:110852896_G_GAA:110852896:3,6,0,2
chr3	110852897	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,2:4,0:0|1:110852896_G_GAA:110852896:3,6,0,2
chr3	110852901	.	A	AGAAGTGAG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:110852896_G_GAA:110852896:3,6,0,2
chr3	110852906	.	AG	GA	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:110852896_G_GAA:110852896:3,6,0,2
chr3	110852952	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:1,6,2,0
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	111261255	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,3,0,1
chr3	111261258	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=176,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,3,0,1
chr3	111261263	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,26;MFRL=206,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,2,0,1
chr3	111261265	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=206,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,2,0,1
chr3	111261266	.	A	AGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=206,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,2,0,1
chr3	111261271	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=206,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111261255_A_C:111261255:0,2,0,1
chr3	111356083	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr3	111658290	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,12,6
chr3	111667937	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr3	111685374	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,6957317;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	111688810	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	111692693	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,2:0,6:2,1,1,7
chr3	111697867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	111710206	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	111764653	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,3:0,4:1,2,4,3
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	111769417	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr3	111812182	.	T	TTCATTTCTGTGTCTCTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.346:8:3,2:2,0:3,2,2,1
chr3	111812367	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=137,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr3	111842481	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:7,2:0,0:3,4,2,0
chr3	111844169	.	G	GAAGGAGAATGAGGATGGAGTTTATTCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	111844208	.	GGTAGCT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,6:5,7:4,3,8,5
chr3	111860222	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,475;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	111873902	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=10,10;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr3	111936207	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	111950367	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr3	111958679	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:1,2,1,1
chr3	111958802	.	TGAAATGTGCAACAAACCGATTTATATTTTGTTGATGTGGCATCACGAAGACCTTTGATACAAACACACATTTGATAAATAGTA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.169:24:5,5:2,2:4,12,5,3
chr3	111958862	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,3:0,2:0,4,1,4
chr3	111962774	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111981696_CA_C:111981696:1,0,1,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111981696_CA_C:111981696:1,0,1,0
chr3	111981924	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:3,7,1,6
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:1,6,2,6
chr3	111985048	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=109,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,1:9,5:6,8,6,0
chr3	111985237	.	A	AATGTATTGGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	111985251	.	C	CTCCTCCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.273:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr3	111993915	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,1,6
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	112190137	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr3	112253193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,146,191;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.52,6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.506:5:0,0,0:0,2,3:0,0,1,4
chr3	112253233	.	AAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr3	112356986	.	A	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.125:54:24,0:24,6:22,26,0,6
chr3	112357623	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,116;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,4:7,0:7,7,4,0
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	112538638	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:14,2:4,0:13,5,2,0
chr3	112693712	.	T	TCAGTTGACAGTGGACAGCACAGGGGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.185:15:6,0:7,2:6,7,1,1
chr3	112710194	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,2:2,4:2,2,1,5
chr3	112718504	.	A	AGGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=91,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	112719791	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.509:6:0,0:2,0:1,2,0,3
chr3	112727184	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:6,5:8,4,5,6
chr3	112732309	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,156;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	112993606	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112993606_G_T:112993606:0,1,0,1
chr3	112993613	.	CC	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112993606_G_T:112993606:0,1,0,1
chr3	112993617	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112993606_G_T:112993606:0,1,0,1
chr3	112993619	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:112993606_G_T:112993606:0,1,0,1
chr3	112993621	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:112993606_G_T:112993606:0,1,0,1
chr3	113003215	.	CCCTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:3,5,1,1
chr3	113003593	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:3,3,2,0
chr3	113004123	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	113005674	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=126,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:113005674_C_T:113005674:6,7,1,1
chr3	113005681	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:113005674_C_T:113005674:6,6,1,1
chr3	113005682	.	T	TGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,1:0|1:113005674_C_T:113005674:6,6,1,1
chr3	113114729	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	113119986	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,0:4,6:9,0,6,0
chr3	113122605	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	113145020	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=111,55;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,0:9,3:10,12,0,3
chr3	113165581	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=200,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:113165581_G_GAA:113165581:0,2,0,1
chr3	113165583	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=200,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:113165581_G_GAA:113165581:0,2,0,1
chr3	113166847	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr3	113225525	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113225525_C_A:113225525:0,0,0,1
chr3	113225526	.	ACCT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113225525_C_A:113225525:0,0,0,1
chr3	113304177	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113304177_AG_A:113304177:0,1,0,1
chr3	113304179	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113304177_AG_A:113304177:0,1,0,1
chr3	113304185	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:113304177_AG_A:113304177:0,1,0,1
chr3	113320479	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=99,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:6,5,2,0
chr3	113323808	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=85,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chr3	113323848	.	C	CACCAGGCGGCAGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr3	113346670	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113346670_C_A:113346670:0,0,0,1
chr3	113346672	.	A	AGGGTTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113346670_C_A:113346670:0,0,0,1
chr3	113376110	.	TTGCTGCTGC	T,TTGCTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26,26;MFRL=0,113,149;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,9,11;RU=TGC;STR;TLOD=6.01,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.441,0.394:3:0,1,1:0,1,0:0,0,2,1
chr3	113379611	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=99,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:7,0:8,5,0,4
chr3	113442784	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.275:15:5,3:6,1:9,2,3,1
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr3	113508732	.	GTG	ACA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.636:17:4,7:2,4:0,6,4,7
chr3	113528089	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,69;MMQ=50,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:4,0,0,1
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	113601761	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=139,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr3	113652364	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=87,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr3	113655365	.	A	AGGCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113655365_A_AGGCC:113655365:0,0,0,1
chr3	113655368	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113655365_A_AGGCC:113655365:0,0,0,1
chr3	113720517	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:1,4:4,1:3,3,3,2
chr3	113785149	.	ATATGT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,4:2,5:4,7,4,5
chr3	113789746	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113789746_G_GCT:113789746:0,4,0,1
chr3	113789747	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113789746_G_GCT:113789746:0,4,0,1
chr3	113789750	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:113789746_G_GCT:113789746:0,4,0,1
chr3	113789768	.	C	CATGCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.662:1:0,1:0,0:0|1:113789768_C_CATGCT:113789768:0,0,0,1
chr3	113789771	.	C	CACTTAACATGATTAGTCT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:113789768_C_CATGCT:113789768:0,0,0,1
chr3	113955265	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:3,1,3,1
chr3	114026673	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	114027053	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:6,0:2,2:1,7,0,4
chr3	114027065	.	C	CGTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=125,157;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr3	115561493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=160,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr3	115805312	.	G	GACCCCCGTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.411:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr3	118621833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	118623414	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr3	118623600	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=103,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:18,0:14,4:0|1:118623600_C_T:118623600:22,11,2,2
chr3	118623619	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=113,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:16,2:0|1:118623600_C_T:118623600:16,14,0,2
chr3	118649060	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr3	118824104	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,98;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=89,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr3	118870222	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr3	118870229	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:118870229_T_TC:118870229:0,4,0,1
chr3	118870231	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:118870229_T_TC:118870229:0,4,0,1
chr3	118870234	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:118870229_T_TC:118870229:0,4,0,1
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr3	118913154	.	G	GAAACTTTTTATCCTTGTTTGAAGACAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=60,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr3	118917962	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=28,18;MFRL=45,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,1:0|1:118917962_T_TC:118917962:1,6,1,1
chr3	118917963	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=45,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:118917962_T_TC:118917962:1,6,1,1
chr3	118917964	.	G	GAA	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=31,20;MFRL=45,44;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:118917962_T_TC:118917962:1,6,1,1
chr3	118917968	.	T	TGAGC	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=29,18;MFRL=77,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0|1:118917962_T_TC:118917962:1,5,1,1
chr3	118917969	.	T	TGGCGGCTC	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=77,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:118917962_T_TC:118917962:1,5,1,1
chr3	118917975	.	TCTCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:118917975_TCTCTG_T:118917975:0,5,1,1
chr3	118917982	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=28,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:118917975_TCTCTG_T:118917975:0,5,1,1
chr3	118917985	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=9;MBQ=25,20;MFRL=109,45;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:118917975_TCTCTG_T:118917975:0,5,1,1
chr3	118917989	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:0,0:0|1:118917975_TCTCTG_T:118917975:0,4,1,1
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	118942833	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr3	118943136	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118943136_G_A:118943136:0,0,0,1
chr3	118943138	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118943136_G_A:118943136:0,0,0,1
chr3	118943141	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118943136_G_A:118943136:0,0,0,1
chr3	118943143	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118943136_G_A:118943136:0,0,0,1
chr3	118943150	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:118943136_G_A:118943136:0,0,0,1
chr3	119013902	.	GG	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	119013928	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	119101039	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	119101319	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,28;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:119101319_A_AG:119101319:0,1,0,1
chr3	119101321	.	T	TATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:119101319_A_AG:119101319:0,1,0,1
chr3	119101324	.	T	TATTGTCTGTCTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119101319_A_AG:119101319:0,0,0,1
chr3	119121162	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,0:5,4:6,7,3,1
chr3	119121323	.	T	TTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119121323_T_TTTCC:119121323:0,0,0,1
chr3	119121324	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119121323_T_TTTCC:119121323:0,0,0,1
chr3	119121330	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:119121323_T_TTTCC:119121323:0,0,0,1
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:119128628_A_G:119128628:0,3,0,3
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:119128628_A_G:119128628:0,2,0,3
chr3	119133732	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr3	119134168	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	119134225	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	119156714	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=106,52;MMQ=60,21;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:13,0:10,3:0|1:119156714_C_T:119156714:13,11,0,3
chr3	119156724	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=102,52;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:14,0:10,3:0|1:119156714_C_T:119156714:10,15,0,3
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:6,8:7,0:8,6,6,2
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=80,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:3,1,3,1
chr3	119204063	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=1240694,164;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.723:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr3	119207869	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,127;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,0,4
chr3	119209613	.	TG	GT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=112,849;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:119209613_TG_GT:119209613:0,1,1,0
chr3	119209618	.	TTAAAA	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,849;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119209613_TG_GT:119209613:0,0,1,0
chr3	119209624	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,849;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119209613_TG_GT:119209613:0,0,1,0
chr3	119209627	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,849;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119209613_TG_GT:119209613:0,0,1,0
chr3	119209632	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,849;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119209613_TG_GT:119209613:0,0,1,0
chr3	119211384	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	119246643	.	C	CCCT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:119246643_C_CCCT:119246643:7,10,0,2
chr3	119246645	.	CAAT	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:119246643_C_CCCT:119246643:7,11,0,2
chr3	119246654	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:0|1:119246643_C_CCCT:119246643:6,11,0,2
chr3	119246658	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:119246643_C_CCCT:119246643:5,11,0,2
chr3	119246664	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:119246643_C_CCCT:119246643:5,10,0,2
chr3	119256020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr3	119256150	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=116,37;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr3	119263770	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	119348345	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,2:0,0:0,0,1,2
chr3	119348391	.	G	GATCTAAGCTCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	119361250	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	119367068	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,1,2
chr3	119379186	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr3	119379352	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	119421911	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:119421911_T_A:119421911:0,0,5,0
chr3	119421934	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:119421911_T_A:119421911:0,0,7,1
chr3	119421963	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr3	119422106	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr3	119448999	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	119456270	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=103,116;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,4:8,3:7,7,3,4
chr3	119466839	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	119469954	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,10;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,0:0,0:0|1:119469954_G_T:119469954:0,3,0,1
chr3	119469956	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:0,1:0|1:119469954_G_T:119469954:0,3,0,1
chr3	119469962	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:119469954_G_T:119469954:0,2,0,1
chr3	119469976	.	C	CCATACTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=78,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	119531731	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=125,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:119531731_C_CT:119531731:1,2,1,1
chr3	119531734	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=125,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:119531731_C_CT:119531731:1,2,1,1
chr3	119531738	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=154,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:119531731_C_CT:119531731:1,1,1,1
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	119534153	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	119585415	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:4,3:7,2:4,7,3,2
chr3	119634849	.	GAGGGGAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=122,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:4,2:6,3,1,1
chr3	119892057	.	A	AGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,311;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119892057_A_AGTGCT:119892057:1,0,1,0
chr3	119892059	.	A	AAATATTTGGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,311;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119892057_A_AGTGCT:119892057:1,0,1,0
chr3	119892063	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=165,311;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:119892057_A_AGTGCT:119892057:1,0,1,0
chr3	119900212	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	119912297	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr3	120130883	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=86,103;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:120130883_G_C:120130883:1,1,0,1
chr3	120130897	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=172,103;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120130883_G_C:120130883:0,1,0,1
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=103,172;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	120130900	.	A	ATACGTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=172,103;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120130883_G_C:120130883:0,1,0,1
chr3	120130902	.	A	AAAGACAGCATC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=172,103;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:120130883_G_C:120130883:0,1,0,1
chr3	120365296	.	C	CACCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	120369575	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr3	120394604	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=156,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:2,0,3,1
chr3	120394806	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,1,12
chr3	120424942	.	G	GGGATTAACATTGTTTTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:4,9,0,2
chr3	120489602	.	C	CCTCTCATTTTTCCTCCCAAATTAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:5,0:6,3,1,1
chr3	120833993	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	120924764	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,4:4,4:6,0,4,4
chr3	120924803	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=118,78;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,5:7,0:8,7,5,0
chr3	120976075	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:4,3,1,1
chr3	121037225	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121100357	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:4,10,2,0
chr3	121126308	.	G	GACAAAAACCACATGATTATCTCAATAGA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=110,64;MMQ=60,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:3,3,1,1
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	121158780	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,612;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	121159005	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=212,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121159005_TA_T:121159005:0,1,0,1
chr3	121159012	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=212,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121159005_TA_T:121159005:0,1,0,1
chr3	121159014	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=212,81;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121159005_TA_T:121159005:0,1,0,1
chr3	121187356	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=206,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121187356_A_C:121187356:0,1,0,1
chr3	121187357	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=206,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121187356_A_C:121187356:0,1,0,1
chr3	121192350	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	121202368	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:12,0:21,1:0|1:121202368_C_T:121202368:24,12,2,0
chr3	121202390	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=121,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,0:14,2:0|1:121202368_C_T:121202368:27,10,2,0
chr3	121202433	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:1,2:3,3,1,2
chr3	121208703	.	CTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,38093715;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:3,1:5,1,2,0
chr3	121209130	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:121209130_G_C:121209130:16,5,1,1
chr3	121209136	.	T	TGGTGTGCACACAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=105,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:7,2:0|1:121209130_G_C:121209130:14,5,1,1
chr3	121228400	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=91,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:4,1,2,1
chr3	121238749	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,7:0,0,12,9
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	121256126	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:0|1:121256126_A_C:121256126:1,0,0,1
chr3	121256130	.	CACTCTATTTAA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121256126_A_C:121256126:0,0,0,1
chr3	121256145	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121256126_A_C:121256126:0,0,0,1
chr3	121258521	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=123,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:121258521_T_C:121258521:1,0,0,1
chr3	121258525	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:121258521_T_C:121258521:2,0,0,1
chr3	121258527	.	T	TTCTCAGAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:121258521_T_C:121258521:2,0,0,1
chr3	121303990	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	121304970	.	C	CCTAATTTGATTATTTTCCTAAGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:2,0:1,3,1,1
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:6,1,2,2
chr3	121351315	.	G	GGGCTCAGGCTCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=112,92;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GGCTCA;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:2,2:2,3,3,1
chr3	121351480	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	121352068	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,5:7,3:5,6,6,2
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	121353328	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	121366123	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121383297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,3:6,4:7,2,6,1
chr3	121396390	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=73766532,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121396390_A_C:121396390:1,0,0,1
chr3	121396392	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=73766532,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121396390_A_C:121396390:1,0,0,1
chr3	121417826	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	121435621	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:121435621_T_C:121435621:0,0,6,3
chr3	121435624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0|1:121435621_T_C:121435621:0,0,6,3
chr3	121500510	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,171;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AT;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr3	121514216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=121,29;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:0,2:6,0:5,1,0,2
chr3	121514458	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=82,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.814:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr3	121517997	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=115,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,4:6,5:5,3,7,3
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr3	121527903	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr3	121527926	.	T	TGTTGCCCAGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	121545048	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.280:5:1,0:3,1:0|1:121545048_C_CT:121545048:0,4,0,1
chr3	121545049	.	G	GTCTCCATGGATTTCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:121545048_C_CT:121545048:0,4,0,1
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	121563330	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=99,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:4,0:4,3:6,3,3,0
chr3	121573455	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	121573729	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	121631841	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	121631899	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:7,0:11,2:8,10,0,3
chr3	121643353	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	121659424	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:121659424_A_T:121659424:0,0,0,1
chr3	121659426	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:121659424_A_T:121659424:0,0,0,1
chr3	121720398	.	T	TTCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121720398_T_TTCCA:121720398:0,0,0,1
chr3	121720399	.	G	GATGCTTCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121720398_T_TTCCA:121720398:0,0,0,1
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,5:0,5:0,0,9,3
chr3	121810458	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:9,6,0,2
chr3	121822658	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.199:15:7,2:5,1:7,5,3,0
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	121994916	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=120,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr3	122001099	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=82,88;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,8:5,3:1,7,1,10
chr3	122003045	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122003045_G_C:122003045:0,0,0,1
chr3	122003050	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:122003045_G_C:122003045:1,0,0,1
chr3	122078677	.	TAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=28,18;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:1,0:1,2,1,0
chr3	122121563	.	T	TTTTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTC;STR;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:4,6:3,2:4,4,6,3
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:7,3:4,8:6,6,6,6
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	122168341	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	122168683	.	C	CATCTTTAGAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	122186148	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:14,4,2,0
chr3	122255708	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr3	122256008	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:122256008_G_T:122256008:0,1,0,1
chr3	122256010	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=211,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:122256008_G_T:122256008:1,1,0,1
chr3	122256013	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=211,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:122256008_G_T:122256008:1,1,0,1
chr3	122259606	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:9,5:1,2:6,4,6,1
chr3	122259640	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:11,6:4,3:12,3,5,4
chr3	122259777	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=191,125;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr3	122259779	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=191,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr3	122259782	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=191,175;MMQ=59,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr3	122277320	.	A	ACTCACGCCTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	122351132	.	TAAATAACAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122351132_TAAATAACAC_T:122351132:0,0,0,1
chr3	122351142	.	C	CTTTCTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122351132_TAAATAACAC_T:122351132:0,0,0,1
chr3	122419908	.	C	CTTTTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	122422536	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr3	122422609	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:4,0:4,6,2,0
chr3	122437686	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:5,6,2,0
chr3	122437863	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr3	122439073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr3	122447512	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	122471407	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=77,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.646:10:1,2:1,5:2,1,5,2
chr3	122471428	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,0:3,0:6,4,4,0
chr3	122598055	.	GTGGTCTGCTGGTGATACATGAATGTTTAAAACTGCATGTTTTTTTGTCTTACAGAGTTGTCT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.113:26:4,1:2,2:15,8,2,1
chr3	122629589	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	122629656	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=114,108;MMQ=56,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.243:15:0,1:8,1:7,5,2,1
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	122646734	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr3	122680158	.	GA	CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:1,1:2,0:0|1:122680158_GA_CT:122680158:0,3,0,1
chr3	122680160	.	G	GTCCATCTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:1,1:2,0:0|1:122680158_GA_CT:122680158:0,3,0,1
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:2,1,3,2
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=157,182;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:1,3,1,2
chr3	122829765	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:6,2,3,0
chr3	122835210	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,2,1
chr3	122843302	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:122843302_A_C:122843302:0,1,0,1
chr3	122843305	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:122843302_A_C:122843302:0,1,0,1
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=63,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,2,1
chr3	122880163	.	C	CAGGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr3	122880376	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	122880899	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	123003447	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=63,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr3	123008519	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=194,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	123047635	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=183,69;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	123049678	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:1,2:0,2:1,0,5,1
chr3	123049938	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=179,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	123066774	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:123066774_C_T:123066774:2,1,1,1
chr3	123066801	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,11;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:123066774_C_T:123066774:0,1,1,1
chr3	123066810	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123066774_C_T:123066774:0,1,0,1
chr3	123066813	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123066774_C_T:123066774:0,1,0,1
chr3	123066817	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123066774_C_T:123066774:0,1,0,1
chr3	123247214	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,4:2,1:5,3,3,2
chr3	123301024	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=104,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:3,5:4,6:4,3,11,1
chr3	123301242	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=172,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:1,1:0,5,0,4
chr3	123303809	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,22;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:9,1:1,0:0|1:123303809_G_C:123303809:0,10,2,0
chr3	123303815	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,1:0|1:123303809_G_C:123303809:0,8,2,0
chr3	123303820	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,0:0|1:123303809_G_C:123303809:0,8,2,0
chr3	123303821	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,5:1,0:1,3,0,5
chr3	123348512	.	G	GTGGAATAGAATAGTATAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	123348537	.	TA	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:123348537_TA_AC:123348537:0,2,0,1
chr3	123348542	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:123348537_TA_AC:123348537:0,2,0,1
chr3	123348543	.	A	AGTGGGGTTTAGGTGCACG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:123348537_TA_AC:123348537:0,2,0,1
chr3	123348550	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123348550_A_G:123348550:0,1,0,1
chr3	123348551	.	G	GTCCTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123348550_A_G:123348550:0,1,0,1
chr3	123366028	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	123368013	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:3,2,0,3
chr3	123376067	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:2,2:1,4:3,1,3,3
chr3	123383033	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=115,99;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:7,3:9,0:12,4,4,0
chr3	123411731	.	G	GAAAGCATAATA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=146,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,2:1,0:0,5,1,1
chr3	123426839	.	C	CCAAAATTTGGTTTTTGCCTCAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=115,24020785;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:0|1:123426839_C_CCAAAATTTGGTTTTTGCCTCAG:123426839:6,6,0,2
chr3	123426842	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=22,21;MFRL=115,24020785;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:123426839_C_CCAAAATTTGGTTTTTGCCTCAG:123426839:6,6,0,2
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	123444785	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=92,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,5:9,4:7,6,4,5
chr3	123451773	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:123456432_C_T:123456432:0,0,1,1
chr3	123456440	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:123456432_C_T:123456432:0,0,1,0
chr3	123456442	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:123456432_C_T:123456432:0,0,1,0
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:4,2,2,0
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=78,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr3	123674879	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:5,2:6,1,1,1
chr3	123813848	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123813848_A_G:123813848:0,1,0,1
chr3	123813852	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:123813848_A_G:123813848:0,1,0,1
chr3	123953813	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr3	123983604	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr3	124017802	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,32;MFRL=123,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:1,0:2,1:0|1:124017802_GA_G:124017802:1,3,0,1
chr3	124017807	.	T	TTGGCGA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=13,30;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,1:0|1:124017802_GA_G:124017802:0,3,0,1
chr3	124017813	.	G	GTC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124017802_GA_G:124017802:0,3,0,1
chr3	124017815	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr3	124017833	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,10;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0,2,0,1
chr3	124017837	.	GA	CG,GAAGGAGTGAAAACATAAA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,27,32;MFRL=113,132,155;MMQ=60,60,60;MPOS=13,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr3	124017845	.	A	AATAATG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124017845_A_AATAATG:124017845:0,1,0,1
chr3	124017847	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,34;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124017845_A_AATAATG:124017845:0,1,0,1
chr3	124017849	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:124017845_A_AATAATG:124017845:0,1,0,1
chr3	124053297	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:124053297_C_T:124053297:5,4,2,0
chr3	124053300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:124053297_C_T:124053297:5,4,2,0
chr3	124117535	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:9,3,1,1
chr3	124160968	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:124160968_C_T:124160968:2,4,1,1
chr3	124160972	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=116,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:124160968_C_T:124160968:2,4,1,1
chr3	124160989	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=108,73;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124160968_C_T:124160968:1,2,0,1
chr3	124160993	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=108,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,0:2,1:0|1:124160968_C_T:124160968:1,2,0,1
chr3	124180903	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124180903_A_T:124180903:0,1,0,1
chr3	124180906	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124180903_A_T:124180903:0,1,0,1
chr3	124180908	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124180903_A_T:124180903:0,1,0,1
chr3	124180910	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124180903_A_T:124180903:0,1,0,1
chr3	124180915	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124180903_A_T:124180903:0,1,0,1
chr3	124193607	.	TG	CC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0|1:124193607_TG_CC:124193607:3,4,1,1
chr3	124193613	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,1:0|1:124193607_TG_CC:124193607:3,3,1,1
chr3	124193615	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=141,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,1:0|1:124193607_TG_CC:124193607:3,3,1,1
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	124215122	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:124215122_A_C:124215122:0,0,1,0
chr3	124215128	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124215122_A_C:124215122:0,0,1,0
chr3	124223915	.	A	ACAGATCACT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	124237385	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,0,1,1
chr3	124237387	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,1:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,1,1,1
chr3	124237390	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,1,0,1
chr3	124237391	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,1,0,1
chr3	124237397	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,1,0,1
chr3	124237402	.	AGA	TTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124237385_A_AGT:124237385:0,1,0,1
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr3	124351557	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=63,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:124351557_A_C:124351557:0,1,0,1
chr3	124351565	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:124351557_A_C:124351557:0,0,0,1
chr3	124356179	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=90,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:0|1:124356179_T_G:124356179:0,1,1,1
chr3	124356184	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=90,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,1:0|1:124356179_T_G:124356179:0,1,1,1
chr3	124390664	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=160,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,2,0
chr3	124390669	.	C	CAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=118,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:3,1,0,1
chr3	124390836	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,151;MMQ=56,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	124415169	.	CTG	TCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	124449291	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	124492795	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124492795_A_C:124492795:0,3,0,1
chr3	124492797	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:124492795_A_C:124492795:0,3,0,1
chr3	124492833	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124492838	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124492841	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124492843	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124492846	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124492849	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=21,33;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:124492833_A_C:124492833:0,1,0,1
chr3	124528063	.	C	CACCTGGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124528063_C_CACCTGGTT:124528063:0,1,0,1
chr3	124528066	.	CA	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:124528063_C_CACCTGGTT:124528063:0,1,0,1
chr3	124538746	.	C	CGGAAGGTCCTACACCCACGGAGTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	124567382	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124629222	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:4,1:4,2,1,1
chr3	124642586	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	124646594	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,17,9
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	124696807	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr3	124802677	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	124802979	.	A	AGAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124802979_A_AGAC:124802979:1,0,0,1
chr3	124802981	.	T	TACAAGCACCCAACAAACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124802979_A_AGAC:124802979:1,0,0,1
chr3	124802983	.	ATC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:124802979_A_AGAC:124802979:1,0,0,1
chr3	124802988	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:124802979_A_AGAC:124802979:1,0,0,1
chr3	124829240	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	124896686	.	C	CAAAGTTGAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=108,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr3	124909220	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,3:5,0:7,6,3,0
chr3	124909355	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=96,126;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:12,3:11,0:13,12,3,0
chr3	124951171	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=430,436;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.638:3:0,0:1,1:1,0,1,1
chr3	124998098	.	C	CAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=A;STR;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.908:7:0,1:0,3:0,0,2,5
chr3	125179732	.	C	CATAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:1,3,0,4
chr3	125223456	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,5:4,4:7,1,9,1
chr3	125297715	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	125301711	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:5,4,5,1
chr3	125313382	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	125726098	.	AGACC	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125726098_AGACC_A:125726098:0,2,0,1
chr3	125726104	.	AGTCAG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125726098_AGACC_A:125726098:0,1,0,1
chr3	125726113	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125726098_AGACC_A:125726098:0,1,0,1
chr3	125726136	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:125726136_A_T:125726136:0,0,0,1
chr3	125726138	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:125726136_A_T:125726136:0,0,0,1
chr3	125726141	.	AGGC	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:125726136_A_T:125726136:0,0,0,1
chr3	125727518	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	125734272	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	125735739	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125735739_C_T:125735739:0,0,0,1
chr3	125735746	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125735739_C_T:125735739:0,0,0,1
chr3	125735752	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:125735739_C_T:125735739:0,0,0,1
chr3	125741835	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=254,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125741835_G_GCT:125741835:0,1,0,1
chr3	125741837	.	A	ACCGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=254,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125741835_G_GCT:125741835:0,1,0,1
chr3	125769744	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=122,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,0:1,2:5,1,3,0
chr3	125833528	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=152,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr3	125833591	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125833591_G_C:125833591:0,1,0,1
chr3	125833594	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125833591_G_C:125833591:0,1,0,1
chr3	125833596	.	C	CCCGGCTAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125833591_G_C:125833591:0,1,0,1
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=63,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=124,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.732:8:0,4:1,2:1,1,3,3
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	125854451	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=57274227,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	125855665	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=119,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr3	125855799	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125855799_T_G:125855799:0,1,0,1
chr3	125855801	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125855799_T_G:125855799:0,1,0,1
chr3	125869241	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:7,2,3,0
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,3,3
chr3	126071370	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=112,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,3,2
chr3	126138077	.	CTAGCA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:126138077_CTAGCA_C:126138077:0,3,0,1
chr3	126138078	.	TAGCACCATGTGAA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	126138087	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:126138077_CTAGCA_C:126138077:0,1,0,1
chr3	126138095	.	CA	GG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:126142496_T_C:126142496:0,0,0,2
chr3	126142517	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126142496_T_C:126142496:0,1,0,1
chr3	126142519	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126142496_T_C:126142496:0,1,0,1
chr3	126158622	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	126160869	.	G	GTTTTACAAATATGTGCTTCTTAAGAAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	126189931	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=186,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:126189931_T_TG:126189931:0,3,0,1
chr3	126189935	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=186,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:126189931_T_TG:126189931:0,3,0,1
chr3	126189938	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=186,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:126189931_T_TG:126189931:0,3,0,1
chr3	126189941	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,23;MFRL=186,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:126189931_T_TG:126189931:0,3,0,1
chr3	126189944	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,33;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:126189931_T_TG:126189931:0,1,0,1
chr3	126191247	.	A	AAAGTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:0,1:1,0:0|1:126191247_A_AAAGTCTGT:126191247:0,1,0,1
chr3	126191249	.	A	AGAGGACCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.486:2:0,1:1,0:0|1:126191247_A_AAAGTCTGT:126191247:0,1,0,1
chr3	126208249	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	126218159	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=210,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr3	126218283	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,34;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126218286	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126218289	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=31,28;MFRL=138,76;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,2,0,1
chr3	126218291	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126218296	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126218299	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126218303	.	A	ATTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126218283_A_C:126218283:0,3,0,1
chr3	126219030	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	126219088	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126219088_C_CCCT:126219088:0,0,0,1
chr3	126219089	.	A	AGCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126219088_C_CCCT:126219088:0,0,0,1
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	126224673	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	126291451	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:126291451_C_T:126291451:0,1,0,1
chr3	126291455	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:126291451_C_T:126291451:0,1,0,1
chr3	126291460	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:126291451_C_T:126291451:0,1,0,1
chr3	126452133	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	126707631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=84,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:2,1,0,2
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	126737119	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr3	126739012	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	126741258	.	C	CATGTACCACCATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	126747805	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	126748352	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:0|1:126748352_A_T:126748352:7,5,1,1
chr3	126748358	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:0|1:126748352_A_T:126748352:7,5,1,1
chr3	126748360	.	CAAG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:6,2:0|1:126748352_A_T:126748352:7,5,1,1
chr3	126748364	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=108,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:126748352_A_T:126748352:6,4,1,1
chr3	126748688	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr3	126751711	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=103,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr3	126751730	.	T	TTTTAGACTGTCTCCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=190,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	127294199	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:127294199_C_T:127294199:2,0,1,0
chr3	127294215	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:127294199_C_T:127294199:2,0,1,0
chr3	127294266	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:5,8,1,1
chr3	127298772	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	127298798	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:127298798_CCA_C:127298798:0,0,0,1
chr3	127298804	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:127298798_CCA_C:127298798:0,0,0,1
chr3	127323830	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr3	127327428	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127327428_G_T:127327428:0,1,0,1
chr3	127327431	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127327428_G_T:127327428:0,1,0,1
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr3	127340159	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127340159_T_G:127340159:0,0,0,1
chr3	127340160	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127340159_T_G:127340159:0,0,0,1
chr3	127340161	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127340159_T_G:127340159:0,0,0,1
chr3	127358413	.	TCTAGGCAAAACA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1,3,0,1
chr3	127393476	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:1,7,0,2
chr3	127396015	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:3,9,0,2
chr3	127396459	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr3	127398875	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,0:2,3:3,2,2,2
chr3	127399098	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=117,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,2:4,2:2,2,1,3
chr3	127411243	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=247,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127411243_GCA_G:127411243:0,1,0,1
chr3	127411246	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=247,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127411243_GCA_G:127411243:0,1,0,1
chr3	127411250	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,26;MFRL=247,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:127411243_GCA_G:127411243:0,1,0,1
chr3	127411253	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=247,97;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127411243_GCA_G:127411243:0,1,0,1
chr3	127411256	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=247,97;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127411243_GCA_G:127411243:0,1,0,1
chr3	127429567	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	127440083	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	127440100	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127440100_GT_G:127440100:0,1,0,1
chr3	127440103	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127440100_GT_G:127440100:0,1,0,1
chr3	127440107	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127440100_GT_G:127440100:0,1,0,1
chr3	127641968	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,10,5
chr3	127642694	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:127642694_T_TA:127642694:5,3,1,1
chr3	127642696	.	T	TACAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=143,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:127642694_T_TA:127642694:5,3,1,1
chr3	127642698	.	T	TACACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=139,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0|1:127642694_T_TA:127642694:4,3,1,1
chr3	127649169	.	TCCTCAGCAGTTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr3	127771728	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,0:8,3:8,10,0,3
chr3	127786518	.	C	CATTATCATTGCATAATTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	127806459	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127806459_A_AAG:127806459:1,0,1,0
chr3	127806460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127806459_A_AAG:127806459:1,0,1,0
chr3	127838315	.	A	ATGCATTTAAGTTACCCCAATAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	127965604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=200,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:3,0:1,0:0|1:127965604_C_A:127965604:1,3,1,1
chr3	127965608	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=200,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:127965604_C_A:127965604:1,3,1,1
chr3	127965745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=110,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,3:5,0:6,3,1,2
chr3	128182835	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr3	128292060	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	128292062	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	128292213	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr3	128292676	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,2:5,0:11,8,2,0
chr3	128344660	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,3:7,0:7,1,3,0
chr3	128345718	.	T	TAGGGGGAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:2,3,1,1
chr3	128350893	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:10,0:10,5:10,10,0,5
chr3	128356852	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=75,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,4:2,3:3,6,3,4
chr3	128369661	.	C	CAGGCTGTGGGGCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,3:0,0,5,1
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,7:0,0,5,7
chr3	128618403	.	G	GATTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0|1:128618403_G_GATTA:128618403:0,0,0,1
chr3	128618405	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128618403_G_GATTA:128618403:0,0,0,1
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	128631531	.	G	GAATGTCTGGTATGTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	128711904	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=94,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:3,6,2,0
chr3	128751747	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,0:1,2,0,2
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,6:0,0,8,4
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,1,1
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,2,1
chr3	128875477	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=111,136;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:29,0:9,3:0|1:128875477_A_C:128875477:16,26,0,3
chr3	128875481	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=113,136;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:31,0:12,3:0|1:128875477_A_C:128875477:17,26,0,3
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	128982884	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	128986020	.	T	TGGCTTGTTTCCAA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:128986020_T_TGGCTTGTTTCCAA:128986020:1,3,0,1
chr3	128986023	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:128986020_T_TGGCTTGTTTCCAA:128986020:1,3,0,1
chr3	128986040	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128986040_A_C:128986040:0,0,0,1
chr3	128986042	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128986040_A_C:128986040:0,0,0,1
chr3	128986043	.	G	GGTGTTGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128986040_A_C:128986040:0,0,0,1
chr3	128990711	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:1,4,3,3
chr3	128994161	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=161,25837222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:2,6,0,2
chr3	129007910	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:129007910_A_G:129007910:0,4,0,1
chr3	129007912	.	CCT	GTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:129007910_A_G:129007910:0,4,0,1
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	129140594	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr3	129140742	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129140742_G_A:129140742:0,1,0,1
chr3	129140743	.	G	GTGAGATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129140742_G_A:129140742:0,1,0,1
chr3	129147418	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	129152181	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	129168785	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.136:27:12,0:11,3:0|1:129168785_G_A:129168785:14,10,1,2
chr3	129168791	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=112,66;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:12,0:10,3:0|1:129168785_G_A:129168785:14,10,1,2
chr3	129179678	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:4,0:7,5,3,0
chr3	129179990	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr3	129185631	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=145,131;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr3	129185634	.	C	CCG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=145,129;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:129185634_C_CCG:129185634:4,0,1,0
chr3	129185638	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=145,129;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:129185634_C_CCG:129185634:4,0,1,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr3	129261960	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	129266220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr3	129270186	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,0:5,4:1,9,0,4
chr3	129275413	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,1,2
chr3	129275551	.	TGGGGAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=123,33023721;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr3	129276082	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=111,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,2:9,1:7,9,1,2
chr3	129276104	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:2,2:3,0:0|1:129276104_G_A:129276104:0,5,1,1
chr3	129276106	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:129276104_G_A:129276104:0,5,1,1
chr3	129276109	.	A	ATAGTTTGGAGGAGGATTTAATG	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=27,20;MFRL=120,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:129276104_G_A:129276104:0,5,1,1
chr3	129276149	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:129276149_C_CTG:129276149:0,0,0,1
chr3	129276150	.	C	CCCACCCCTTCACTGAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:129276149_C_CTG:129276149:0,0,0,1
chr3	129278719	.	GGCT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129278719_GGCT_G:129278719:0,0,0,1
chr3	129278727	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:129278719_GGCT_G:129278719:0,0,0,1
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,9,9
chr3	129279611	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0|1:129279611_A_G:129279611:2,7,0,2
chr3	129279614	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:129279611_A_G:129279611:2,7,0,2
chr3	129279618	.	C	CTTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:129279611_A_G:129279611:2,8,0,2
chr3	129282172	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:129282172_C_CT:129282172:0,0,0,1
chr3	129282173	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:129282172_C_CT:129282172:0,0,0,1
chr3	129293106	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	129294207	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=194,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	129324758	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	129390185	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=115,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:129390185_G_A:129390185:0,1,0,1
chr3	129390190	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=115,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:129390185_G_A:129390185:0,1,0,1
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	129695538	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,28;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129695538_C_T:129695538:1,0,0,1
chr3	129695550	.	A	AGAAACG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,26;MFRL=38,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129695538_C_T:129695538:2,1,0,1
chr3	129695555	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,22;MFRL=81,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:129695538_C_T:129695538:3,1,0,1
chr3	129695557	.	AA	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=81,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:129695538_C_T:129695538:3,1,0,1
chr3	129695954	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	129695975	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	129800888	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,33;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	129800895	.	G	A,C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32,33;MFRL=0,119,87;MMQ=60,40,25;MPOS=25,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,1:0,0,1,1
chr3	129800901	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=119,87;MMQ=40,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:129800901_G_GAT:129800901:1,0,0,1
chr3	129800906	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=20,31;MFRL=119,87;MMQ=45,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:129800901_G_GAT:129800901:1,1,0,1
chr3	129800908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=20,32;MFRL=119,87;MMQ=45,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:129800901_G_GAT:129800901:1,1,0,1
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=0,84;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:129800934_C_G:129800934:0,0,2,2
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,84;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:129800934_C_G:129800934:0,0,2,2
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=114,158;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	129814863	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:129814863_G_A:129814863:0,0,11,5
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0|1:129814863_G_A:129814863:0,0,11,5
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=66.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,4,17
chr3	129815930	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	130095031	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr3	130095286	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,98;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:8,6,0,2
chr3	130104062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr3	130104120	.	A	AGGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:3,0,0,1
chr3	130104270	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130104270_G_C:130104270:0,1,0,1
chr3	130104278	.	G	GGAGTGCAGTGGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:130104270_G_C:130104270:0,1,0,1
chr3	130104306	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	130109993	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=103,883;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr3	130114155	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=191,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=60,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.766:11:2,2:0,6:2,0,7,2
chr3	130122552	.	TACAC	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.256:11:6,2:2,1:0,8,0,3
chr3	130122568	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:1,10,0,3
chr3	130122582	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=144,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:0|1:130122582_CTT_C:130122582:0,3,0,2
chr3	130122588	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:130122582_CTT_C:130122582:0,2,0,2
chr3	130125232	.	TGTGTCAGTGGTTATAGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,2,0
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,2,0
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,8:0,0:0,2,3,5
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	130134453	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=93,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,5:7,3:8,8,7,1
chr3	130134492	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=126,93;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:9,9:4,1:9,4,4,7
chr3	130134563	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr3	130145175	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=65,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,3,5
chr3	130150859	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130150859_TGG_T:130150859:0,2,0,1
chr3	130150863	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130150859_TGG_T:130150859:0,2,0,1
chr3	130150867	.	GTAGA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130150859_TGG_T:130150859:0,2,0,1
chr3	130150872	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130150859_TGG_T:130150859:0,2,0,1
chr3	130150874	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:130150859_TGG_T:130150859:0,2,0,1
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,156;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr3	130158991	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=163,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr3	130174334	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	130285929	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:2,3,2,1
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,1,1
chr3	130289781	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:130289781_GT_G:130289781:5,4,1,1
chr3	130289783	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,62;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:130289781_GT_G:130289781:5,4,1,1
chr3	130300650	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=194,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	130318618	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=126,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:130318618_AG_A:130318618:7,6,1,1
chr3	130318628	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=123,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:0|1:130318618_AG_A:130318618:11,7,1,1
chr3	130318738	.	G	GATTTATATCA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.201:12:2,2:7,0:0|1:130318738_G_GATTTATATCA:130318738:2,8,0,2
chr3	130318739	.	G	GGTTTCTCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.201:12:2,1:7,0:0|1:130318738_G_GATTTATATCA:130318738:2,8,0,2
chr3	130329544	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=82,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:14,0:15,13,2,1
chr3	130360600	.	TA	T,TAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=24,25,27;MFRL=103,109,111;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=9.08,4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,9,2:0.343,0.120:23:6,3,2:5,6,0:4,8,3,8
chr3	130367983	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=111,74;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:7,0:9,4:0|1:130367983_G_C:130367983:10,7,1,3
chr3	130367987	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=111,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:7,0:10,4:0|1:130367983_G_C:130367983:10,7,1,3
chr3	130368451	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,523;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	130403238	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:130403238_A_G:130403238:0,4,0,1
chr3	130403241	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:130403238_A_G:130403238:0,4,0,1
chr3	130403244	.	A	AGAGCAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:130403238_A_G:130403238:0,4,0,1
chr3	130403246	.	A	ATTGCTTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:130403238_A_G:130403238:0,4,0,1
chr3	130403249	.	A	AAGTAGTACT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:130403238_A_G:130403238:0,4,0,1
chr3	130452546	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=115,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:8,0:15,3:12,12,1,2
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	130686187	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:18,11,3,0
chr3	130743171	.	TC	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:130743171_TC_CA:130743171:6,3,1,1
chr3	130743175	.	GTAAACCA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=90,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:130743171_TC_CA:130743171:6,3,1,1
chr3	130748818	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:1,9:3,2:0,4,4,7
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=74,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr3	130881413	.	T	TCTCTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=125,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:130881413_T_TCTCTAC:130881413:2,2,0,1
chr3	130881418	.	G	GTGCATTAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:130881413_T_TCTCTAC:130881413:1,2,0,1
chr3	130889822	.	G	GAATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130889822_G_GAATT:130889822:0,1,0,1
chr3	130889823	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:130889822_G_GAATT:130889822:0,1,0,1
chr3	130889825	.	G	GCTGCTTCACATGTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130889822_G_GAATT:130889822:0,1,0,1
chr3	131186893	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr3	131186907	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=120,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.569:12:2,3:2,2:5,0,7,0
chr3	131217184	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:131217184_G_C:131217184:0,2,0,1
chr3	131217187	.	C	CCCTGCTTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:131217184_G_C:131217184:0,2,0,1
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	131268824	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:2,6:8,3:2,8,4,5
chr3	131271164	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	131271180	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	131283229	.	A	AGTGCATATGGGCTATACAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131283229_A_AGTGCATATGGGCTATACAG:131283229:0,1,0,1
chr3	131283234	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:131283229_A_AGTGCATATGGGCTATACAG:131283229:0,1,0,1
chr3	131300445	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,106;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,4:4,0:8,5,4,0
chr3	131300573	.	A	AAGTTCCCACATACTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	131388642	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr3	131404641	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=115,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:0,2:7,0:5,2,1,1
chr3	131415340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,1:1,2:3,1,4,0
chr3	131418898	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=23,17;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131418898_CTTTTTT_C:131418898:0,1,0,1
chr3	131418907	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:131418898_CTTTTTT_C:131418898:0,1,0,1
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=100,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:1,1,0,3
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr3	132068925	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132068925_A_T:132068925:0,0,0,1
chr3	132068939	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132068925_A_T:132068925:0,0,0,1
chr3	132075472	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	132075707	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=173,113;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,3:0,2,1,4
chr3	132075743	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132075743_G_C:132075743:0,1,0,1
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=135,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132075743_G_C:132075743:0,1,0,1
chr3	132172225	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:15,7:10,0:13,12,7,0
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.273:18:3,3:6,1:3,10,1,4
chr3	132179072	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.287:9:3,1:2,1:0|1:132179072_G_GT:132179072:5,2,2,0
chr3	132179085	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.221:12:2,0:3,0:0|1:132179072_G_GT:132179072:7,3,2,0
chr3	132179280	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr3	132179293	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:132179293_T_TC:132179293:0,4,0,1
chr3	132179295	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:132179293_T_TC:132179293:0,4,0,1
chr3	132179297	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:132179293_T_TC:132179293:0,4,0,1
chr3	132179301	.	GCCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,1;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	132181476	.	G	GGGAGCGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0|1:132181476_G_GGGAGCGGT:132181476:0,1,0,1
chr3	132181480	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132181476_G_GGGAGCGGT:132181476:1,1,0,1
chr3	132191909	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr3	132198234	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:132198234_G_C:132198234:0,2,0,1
chr3	132198236	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:132198234_G_C:132198234:0,2,0,1
chr3	132221076	.	CTT	C,CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,131,111;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.64,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.379,0.495:5:0,1,3:0,1,0:0,0,5,0
chr3	132232041	.	T	TGTATATTCATACCAGTTTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	132278607	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,2:1,1:6,2,3,0
chr3	132294646	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=105,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,2:9,2:5,7,2,2
chr3	132321249	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,4:6,0:12,3,4,0
chr3	132321274	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:11,3:9,0:16,5,1,2
chr3	132323860	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:132323860_C_T:132323860:2,0,1,0
chr3	132323866	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132323860_C_T:132323860:2,0,1,0
chr3	132411670	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr3	132432143	.	GAAAACATACAAAAGTTTAATGTATTTAACTAAAGATCAAGTGAGATTCATACTACTTAAAATAAAAAGCACGCTTT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=121,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.170:22:9,0:3,2:6,11,0,5
chr3	133099312	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=96,74;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,4:6,0:5,6,2,2
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	133114924	.	C	CTTCCTTTCTTTAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:133114924_C_CTTCCTTTCTTTAT:133114924:0,3,0,1
chr3	133114927	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0|1:133114924_C_CTTCCTTTCTTTAT:133114924:0,3,0,1
chr3	133114930	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:133114924_C_CTTCCTTTCTTTAT:133114924:0,3,0,1
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,2:2,3:1,6,0,5
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chr3	133329943	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr3	133330042	.	C	CTTGTCCAAGGTGTTGATCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=215,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	133331163	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=127,132;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr3	133337281	.	AG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,1:10,1:9,10,1,1
chr3	133341873	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	133347604	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.768:14:1,9:1,2:0,3,2,9
chr3	133347614	.	AAG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=161,301;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:3,0:1,9,1,1
chr3	133363281	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=156,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	133380026	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,12:5,3:2,6,0,15
chr3	133534430	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:10,2:10,8,1,1
chr3	133553478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=114,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	133553527	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0,1,1,6
chr3	133556964	.	ACCGTGCCGGGCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=169,140;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGTGCCGGGCC;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,0:0,3:1,0,4,0
chr3	133558499	.	C	CACAGAAGAATGTGAGAGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,1,1
chr3	133647663	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	133661684	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr3	133670269	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr3	133692557	.	GTGAGGA	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,2:10,0:15,5,1,1
chr3	133698280	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	133698494	.	CTGGACG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr3	133901999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133901999_C_T:133901999:0,1,0,1
chr3	133902004	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133901999_C_T:133901999:0,0,0,1
chr3	133902008	.	T	TTTAATGAGACTGCAGTAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:133901999_C_T:133901999:0,0,0,1
chr3	133969198	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	134076685	.	AAAGATCGTTCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	134078912	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr3	134078928	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:2,1,1,1
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	134201689	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.197:28:11,5:12,0:12,11,3,2
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,7:5,4:1,10,4,7
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	134277195	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:7,3:1,1:1,7,2,3
chr3	134280390	.	A	AAACACACACAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.379:3:0,1:1,0:0|1:134280390_A_AAACACACACAC:134280390:0,2,0,1
chr3	134280391	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.374:3:1,1:1,0:0|1:134280390_A_AAACACACACAC:134280390:0,2,0,1
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	135720572	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=116,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,4:0,1:1,3,1,4
chr3	135722432	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=194,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135722432_T_C:135722432:0,1,0,1
chr3	135722434	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=194,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:135722432_T_C:135722432:0,1,0,1
chr3	135742057	.	G	GTGTTTTGTTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TGTTT;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.380:10:0,1:6,2:0,6,1,3
chr3	135759669	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=101,61500701;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:5,0:0,2:2,3,1,1
chr3	135820877	.	G	GAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:135820877_G_GAT:135820877:4,4,1,1
chr3	135820878	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=130,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:3,0:0|1:135820877_G_GAT:135820877:4,4,1,1
chr3	135974780	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:8,2:8,0:8,9,2,0
chr3	136002809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr3	136046596	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,0:1,1:0|1:136046596_C_CA:136046596:0,1,0,1
chr3	136046598	.	T	TCATTCTATTTTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136046596_C_CA:136046596:0,1,0,1
chr3	136059231	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=155,172;MMQ=51,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:136059231_T_C:136059231:2,0,1,0
chr3	136059236	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=170,172;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:136059231_T_C:136059231:3,0,1,0
chr3	136059239	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=170,172;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:136059231_T_C:136059231:3,0,1,0
chr3	136059243	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=170,172;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:1,1:2,0:0|1:136059231_T_C:136059231:3,0,1,0
chr3	136059255	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=155,172;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:136059255_T_G:136059255:4,0,1,0
chr3	136059259	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=155,172;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:136059255_T_G:136059255:4,0,1,0
chr3	136059527	.	TTCTAACCAAGTGAAGTATACCTTCTAATCATGACCTAC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	136060427	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136060427_G_C:136060427:0,1,0,1
chr3	136060431	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136060427_G_C:136060427:0,1,0,1
chr3	136060436	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136060427_G_C:136060427:0,1,0,1
chr3	136060440	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:136060427_G_C:136060427:0,1,0,1
chr3	136060444	.	C	CAGACAAGTTACTTTCTTTCCACA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	136078157	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:136078157_G_A:136078157:0,4,0,1
chr3	136078160	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:136078157_G_A:136078157:0,4,0,1
chr3	136078163	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:136078157_G_A:136078157:0,4,0,1
chr3	136078164	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,30;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr3	136078168	.	CTATAGCT	C,CTTTACTTACCTTTATAGCT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,33,33;MFRL=139,112,210;MMQ=60,60,60;MPOS=3,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.33,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.284,0.344:4:2,0,0:0,1,1:0,2,0,2
chr3	136078173	.	GC	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=139,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.481:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr3	136082391	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:136082391_G_T:136082391:0,0,0,2
chr3	136082397	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,0:0|1:136082391_G_T:136082391:0,0,0,2
chr3	136117749	.	A	ATTTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,8;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136117749_A_ATTTTTTT:136117749:0,0,0,1
chr3	136117755	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136117749_A_ATTTTTTT:136117749:0,0,0,1
chr3	136117757	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136117749_A_ATTTTTTT:136117749:0,0,0,1
chr3	136139839	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	136141711	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr3	136191187	.	CATTAAAAATCCTGGGGAAAAGGT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:5,0:4,2:12,6,1,1
chr3	136191387	.	G	GGTCCCCAATCCTGGTCTGTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.363:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr3	136191405	.	T	TTTGTAATTTAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr3	136664485	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,311;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.132:43:21,5:17,0:18,20,0,5
chr3	136665191	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	136677064	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:11,3:6,3:5,12,2,4
chr3	137484074	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	137484494	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr3	137748586	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	137822806	.	GAC	TGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0|1:137822806_GAC_TGT:137822806:0,1,1,1
chr3	137822811	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:137822806_GAC_TGT:137822806:0,1,1,1
chr3	137822814	.	G	GTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:137822806_GAC_TGT:137822806:0,1,1,1
chr3	137849679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr3	137850045	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=107,71;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,4:7,0:10,6,3,1
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=99.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,8:0,22:0,0,22,9
chr3	137880740	.	ATCG	A	.	.	DP=89;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,5:0.085:68:18,3:45,2:14,49,1,4
chr3	137880743	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,25:0,49:0,0,20,55
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	138014797	.	G	GTGTGTGTTTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:138014797_G_GTGTGTGTTTTT:138014797:0,7,1,1
chr3	138014800	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:138014797_G_GTGTGTGTTTTT:138014797:0,7,1,1
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	138025354	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=115,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:138025354_AT_A:138025354:1,2,0,1
chr3	138025357	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=115,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:138025354_AT_A:138025354:1,2,0,1
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,33;MFRL=1137,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	138038498	.	C	CCTTCTGCACTTTGCATTAGTAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.624:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	138091952	.	G	GGTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,1,0
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr3	138181149	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:138181149_C_CA:138181149:0,1,0,1
chr3	138181150	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:138181149_C_CA:138181149:0,1,0,1
chr3	138187568	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:2,3:10,9:3,9,8,5
chr3	138187602	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:3,0:11,6:5,9,0,6
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:1,3,2,4
chr3	138189658	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr3	138189755	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,0:1,3:2,2,2,1
chr3	138191563	.	C	CACGACTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr3	138191716	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=123,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:3,0:2,1:2,3,0,1
chr3	138193242	.	T	TATAAAGATGCGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr3	138195529	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=78,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:3,2:3,4,3,1
chr3	138213986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr3	138218894	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=137,107;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,1:12,3:18,1,2,2
chr3	138248009	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31,34;MFRL=137,112,147;MMQ=60,60,52;MPOS=16,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.11,4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.265,0.205:12:2,1,2:4,2,0:6,1,5,0
chr3	138251302	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.332:22:10,4:4,3:0|1:138251302_G_T:138251302:9,6,6,1
chr3	138251311	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,15:0.668:22:4,10:3,4:1|0:138251302_G_T:138251302:5,2,9,6
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,5:7,9:5,9,3,11
chr3	138329862	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,11,15
chr3	138341284	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.793:7:0,1:0,5:0,1,3,3
chr3	138382909	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138382909_C_T:138382909:0,1,0,1
chr3	138382910	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=176,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138382909_C_T:138382909:0,1,0,1
chr3	138403390	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	138417989	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	138433568	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr3	138433626	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138433626_T_A:138433626:0,0,0,1
chr3	138433643	.	T	TTGAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138433626_T_A:138433626:0,0,0,1
chr3	138461402	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,2:11,0:0|1:138461402_G_A:138461402:13,4,1,1
chr3	138461404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:11,0:0|1:138461402_G_A:138461402:13,4,1,1
chr3	138461426	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=101,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:9,1:10,8:11,8,5,4
chr3	138665957	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	138669460	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr3	138724757	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,3,5
chr3	138725188	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	138763380	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	139078200	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,1:9,2:6,12,1,2
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	139098222	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=118,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:7,5:15,0:12,10,4,1
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	139173625	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=111,102;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,0:7,3:5,9,0,3
chr3	139180924	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=138,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:0|1:139180924_T_G:139180924:13,1,3,0
chr3	139180927	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:0|1:139180924_T_G:139180924:13,2,3,0
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,2:3,0,2,0
chr3	139257603	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:5,3,5,2
chr3	139258411	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.455:24:8,0:5,10:3,10,6,5
chr3	139280328	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	140122715	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:140122715_C_T:140122715:0,3,0,1
chr3	140122720	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:140122715_C_T:140122715:0,3,0,1
chr3	140122722	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:140122715_C_T:140122715:0,3,0,1
chr3	140123595	.	C	CTCCATATCTCCTCCTGCTCCCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=126,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr3	140277434	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr3	140281723	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,63;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,6:2,4:2,4,4,7
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	140282113	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	140283088	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr3	140401411	.	G	GTCTGCCACCATT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,38;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:5,2,1,1
chr3	140402015	.	CCA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:0|1:140402015_CCA_C:140402015:1,8,0,2
chr3	140402023	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,0:5,0:0|1:140402015_CCA_C:140402015:1,6,0,2
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr3	140678384	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:2,2:1,2:0,4,1,4
chr3	140695307	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	140979184	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	140997197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:4,3,0,2
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:4,5:1,0:5,0,3,3
chr3	141162185	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:5,1,4,3
chr3	141272796	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,0:11,6:6,12,0,6
chr3	141289847	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=108,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:12,2:9,1:15,6,1,2
chr3	141292959	.	T	TTTTTGTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,260;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:141292959_T_TTTTTGTTC:141292959:0,2,0,1
chr3	141292963	.	T	TTTGAGACGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:141292959_T_TTTTTGTTC:141292959:0,2,0,1
chr3	141295778	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr3	141326602	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:10,9:4,11:8,6,5,15
chr3	141328970	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	141331222	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=141,110;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.527:38:3,7:14,13:2,16,10,10
chr3	141497814	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141497814_T_TTG:141497814:0,1,0,1
chr3	141497815	.	A	AGACAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141497814_T_TTG:141497814:0,1,0,1
chr3	141497817	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141497814_T_TTG:141497814:0,1,0,1
chr3	141497822	.	AG	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=182,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141497814_T_TTG:141497814:0,1,0,1
chr3	141622675	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=166,124;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:11,2:1,1:0,12,0,3
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	141626123	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,2,5
chr3	141682799	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:4,10,0,2
chr3	141682825	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:2,9,1,4
chr3	141688903	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr3	141884460	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=129,119;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,2:7,0:9,5,2,0
chr3	141905472	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:0,2:0,2,1,3
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,8:8,5:10,6,8,5
chr3	142076059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	142084284	.	A	AAAGCTAGGAAAATAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=179,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr3	142116151	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:2,3:8,4:5,5,5,3
chr3	142122903	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:142122903_T_TGC:142122903:0,0,0,1
chr3	142122904	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:142122903_T_TGC:142122903:0,0,0,1
chr3	142122906	.	T	TCCACAGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:142122903_T_TGC:142122903:0,0,0,1
chr3	142122909	.	AT	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:142122903_T_TGC:142122903:0,0,0,1
chr3	142141352	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:4,0,3,0
chr3	142212072	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,0:13,3:13,17,0,3
chr3	142218388	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=144,120;MMQ=52,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr3	142218392	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=139,130;MMQ=59,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.190:14:3,0:8,1:0|1:142218392_G_T:142218392:11,1,2,0
chr3	142218395	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=135,130;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,0:8,2:0|1:142218392_G_T:142218392:12,1,2,0
chr3	142231062	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.584:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr3	142231090	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=61,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.305:7:5,0:0,0:2,3,2,0
chr3	142234456	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	142238422	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=165,171;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr3	142238431	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=146,161;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:142238431_T_C:142238431:8,0,2,0
chr3	142238437	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,161;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:142238431_T_C:142238431:8,0,2,0
chr3	142241719	.	A	ATTCATATTTGGCAAGAACGCCAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr3	142255090	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.555:18:3,5:5,5:0,8,2,8
chr3	142259706	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	142277423	.	GATAA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=105,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAA;STR;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,5:8,7:6,9,7,5
chr3	142279384	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=209,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,0:0,2:0,2,1,1
chr3	142383234	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,1:0|1:142383234_T_C:142383234:0,3,0,1
chr3	142383240	.	C	CATG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:142383234_T_C:142383234:0,2,0,1
chr3	142383247	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:142383234_T_C:142383234:0,1,0,2
chr3	142383250	.	CC	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:142383234_T_C:142383234:0,1,0,2
chr3	142402827	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=121,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.279:9:4,0:2,1:6,1,2,0
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,2,5
chr3	142455462	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=205,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:142455462_T_G:142455462:0,2,0,1
chr3	142455468	.	T	TCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=205,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:142455462_T_G:142455462:0,2,0,1
chr3	142521224	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:4,0:0,6,0,2
chr3	142523056	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:142523056_C_T:142523056:1,0,0,1
chr3	142523057	.	A	ATTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:142523056_C_T:142523056:1,0,0,1
chr3	142523060	.	CC	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:142523056_C_T:142523056:0,0,0,1
chr3	142523555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	142539933	.	G	GATTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	142567030	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:3,3,4,1
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	142738868	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=102,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:9,3:19,0:14,14,3,0
chr3	142741761	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:13,7,2,1
chr3	142741813	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=125,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:7,5:7,5:5,10,5,5
chr3	142753866	.	G	GTGATGAAATTATTTAGCCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr3	142775375	.	A	AAAACAGTAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:142775375_A_AAAACAGTAACT:142775375:0,3,0,2
chr3	142775377	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:142775375_A_AAAACAGTAACT:142775375:0,3,0,2
chr3	142840689	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr3	142841044	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:4,2,1,2
chr3	142985852	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,26;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:142985852_T_TGG:142985852:0,1,0,1
chr3	142985854	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:142985852_T_TGG:142985852:0,1,0,1
chr3	143185902	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=133,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:11,3:15,8,1,2
chr3	143271101	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=105,374;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:143271101_C_A:143271101:1,0,1,0
chr3	143271103	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=105,374;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:143271101_C_A:143271101:1,0,1,0
chr3	143371201	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:3,5:6,7:4,5,3,9
chr3	143513975	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	143551065	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,0:2,2:0,8,0,3
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:6,4,6,1
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr3	145794752	.	T	TAACACCTTTGGGGGGCTGAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=190,1057;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:145794752_T_TAACACCTTTGGGGGGCTGAGC:145794752:0,3,1,0
chr3	145794755	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=190,1057;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:145794752_T_TAACACCTTTGGGGGGCTGAGC:145794752:0,3,1,0
chr3	145794776	.	CTTTA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	145795669	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:7,7,2,0
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:5,1,5,0
chr3	145809750	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	145809788	.	GT	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:2,3:4,5:2,4,1,7
chr3	145820731	.	A	AAAAGAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	145824484	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:145824484_GGT_G:145824484:0,0,0,1
chr3	145824488	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:145824484_GGT_G:145824484:0,0,0,1
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=1227,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,3:1,1:2,1,2,3
chr3	145828282	.	C	CATTTACGGAAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:2,1,6,1
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr3	145912299	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	145914621	.	ATACACATACACT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr3	145914651	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:145914651_A_C:145914651:0,3,0,1
chr3	145914653	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:145914651_A_C:145914651:0,3,0,1
chr3	145918947	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,3:1,6:1,4,1,8
chr3	145924591	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	146159652	.	ACAGAGATCAGATG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,1,1
chr3	146171687	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr3	146177608	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,20;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,1:0,1:2,0,3,0
chr3	146243378	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,81;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.128:52:29,1:17,5:26,20,6,0
chr3	146246559	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,2:0|1:146246559_C_T:146246559:4,3,1,1
chr3	146246562	.	C	CATAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=144,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:1,2:0|1:146246559_C_T:146246559:4,3,1,1
chr3	146312698	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	147113979	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr3	147128911	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0|1:147128911_A_C:147128911:1,1,0,1
chr3	147128918	.	C	CCCATCTTTTTATTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:147128911_A_C:147128911:1,1,0,1
chr3	148459015	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=100,215;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:2,6,0,2
chr3	148459065	.	G	GCTATATTGTCTTTCAAGTAGTAGACCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:148459065_G_GCTATATTGTCTTTCAAGTAGTAGACCC:148459065:0,4,0,1
chr3	148459069	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:148459065_G_GCTATATTGTCTTTCAAGTAGTAGACCC:148459065:0,4,0,1
chr3	148459071	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	148459105	.	C	CTGAAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=481,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	148459554	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148459554_A_T:148459554:0,1,0,1
chr3	148459560	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148459554_A_T:148459554:0,1,0,1
chr3	148545575	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=89,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,2:0,2:4,1,4,0
chr3	148558447	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	148562397	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0|1:148562397_G_C:148562397:2,4,1,2
chr3	148562399	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=146,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,2:0|1:148562397_G_C:148562397:2,4,1,2
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=81,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,3:1,2:2,3,3,3
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:1,1,0,8
chr3	148575156	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr3	148577875	.	T	TACGAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148577875_T_TACGAC:148577875:0,0,0,1
chr3	148577877	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148577875_T_TACGAC:148577875:0,0,0,1
chr3	148586860	.	T	TACCAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=106,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148586860_T_TACCAGA:148586860:0,1,0,1
chr3	148586862	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=106,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148586860_T_TACCAGA:148586860:0,1,0,1
chr3	148596217	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:8,0:8,3:10,6,1,2
chr3	148597473	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr3	148597564	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=117,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:6,3,5,1
chr3	148597612	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=106,108;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,7:8,1:9,8,4,4
chr3	148603877	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:7,0:16,4:12,12,4,0
chr3	148603920	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=112,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,2:6,7:4,7,5,4
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	148714612	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:2,3:16,0:13,5,2,1
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	148757942	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr3	148766697	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,101;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:11,9,3,0
chr3	148781294	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:1,2,3,4
chr3	148789326	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=130,238;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:3,0:9,2:7,6,2,0
chr3	148791197	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:148791197_AG_A:148791197:0,1,0,1
chr3	148791202	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:148791197_AG_A:148791197:0,1,0,1
chr3	148791208	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:148791197_AG_A:148791197:0,1,0,1
chr3	148792063	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,0:3,3:8,4,0,3
chr3	148802448	.	A	ATTTAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:6,1,2,0
chr3	148804089	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.161:17:10,0:5,1:7,8,1,1
chr3	148858987	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=127,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chr3	148872987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.621:10:3,5:0,1:3,1,3,3
chr3	148879878	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=128,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0|1:148879878_A_G:148879878:2,2,3,1
chr3	148879883	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,3:1,1:0|1:148879878_A_G:148879878:2,2,4,1
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	148890100	.	A	AATTTTCCCTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	148896421	.	G	GTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=119,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	148897498	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=122,0;MMQ=60,35;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=AC;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.415:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr3	148904346	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=104,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:3,8:13,0:9,7,7,1
chr3	148925496	.	G	GCAGCAGGGACAGAGCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148925496_G_GCAGCAGGGACAGAGCCA:148925496:0,0,0,1
chr3	148925501	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148925496_G_GCAGCAGGGACAGAGCCA:148925496:0,0,0,1
chr3	148925503	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148925496_G_GCAGCAGGGACAGAGCCA:148925496:0,0,0,1
chr3	149039324	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:12,10:8,8:12,8,5,13
chr3	149040024	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,2,1
chr3	149050925	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,12:0,12:0,0,3,21
chr3	149093500	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,67;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:20,0:12,3:19,13,0,3
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	149192851	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	149216441	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr3	149260193	.	TCTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTG;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,2:9,1:9,7,3,0
chr3	149375182	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149375182_G_T:149375182:0,1,0,1
chr3	149375185	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149375182_G_T:149375182:0,1,0,1
chr3	149375187	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149375182_G_T:149375182:0,1,0,1
chr3	149484960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr3	149485901	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=92,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:4,1:5,1:5,5,0,3
chr3	149508552	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	149590014	.	T	TTAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149590014_T_TTAC:149590014:0,0,0,1
chr3	149590016	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149590014_T_TTAC:149590014:0,0,0,1
chr3	149590020	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149590014_T_TTAC:149590014:0,0,0,1
chr3	149590022	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149590014_T_TTAC:149590014:0,0,0,1
chr3	149613232	.	ATT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=130,115;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.883:14:0,9:0,2:1,0,11,2
chr3	149613456	.	C	CGTTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	149684104	.	G	GGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149684104_G_GGC:149684104:0,0,0,1
chr3	149684105	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:149684104_G_GGC:149684104:0,0,0,1
chr3	149686365	.	AAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.563:5:1,0:1,3:0|1:149686365_AAAC_A:149686365:0,2,0,3
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,5:0.771:6:0,1:1,4:1|0:149686365_AAAC_A:149686365:0,1,0,5
chr3	150128891	.	AGCC	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,1:8,0:0|1:150128891_AGCC_A:150128891:13,8,1,1
chr3	150128895	.	T	TAAAAATAAATGA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,1:11,0:0|1:150128891_AGCC_A:150128891:13,8,1,1
chr3	150128898	.	AGTCGGGC	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,1:11,1:0|1:150128891_AGCC_A:150128891:13,8,1,1
chr3	150128907	.	AGTCGAC	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=118,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:10,1:0|1:150128891_AGCC_A:150128891:13,10,1,1
chr3	150176393	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:22,1:20,1:15,27,1,1
chr3	150264003	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	150276153	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=90,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.296:11:2,3:5,0:6,2,2,1
chr3	150282061	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.236:14:6,2:2,1:9,2,3,0
chr3	150290298	.	A	AAAAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:150290298_A_AAAAAT:150290298:1,2,1,1
chr3	150290301	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:150290298_A_AAAAAT:150290298:1,2,1,1
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=105,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	150690524	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:150690524_G_C:150690524:1,1,1,0
chr3	150690527	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:150690524_G_C:150690524:1,1,1,0
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	150881901	.	C	CGATCTCCCCACCATGGCCTCCTTAGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	150883600	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,9,4
chr3	150906326	.	T	TTTTTTGTGAGACAGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	150908729	.	GG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=95,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.376:3:2,1:0,0:0|1:150908729_GG_CA:150908729:0,2,0,1
chr3	150908731	.	A	ATTTCCCTCCCTTCTCTCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=95,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:2,1:0,0:0|1:150908729_GG_CA:150908729:0,2,0,1
chr3	150908744	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:150908744_C_A:150908744:0,1,0,1
chr3	150908747	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=107,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:150908744_C_A:150908744:0,1,0,1
chr3	150916983	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:10,10,2,0
chr3	151011944	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,11:0,12:0,0,17,7
chr3	151011969	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,22:0,0,20,18
chr3	151012497	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,6,4
chr3	151073033	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,6:0,0,5,13
chr3	151085578	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr3	151103070	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	151112697	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr3	151127179	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	151165552	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=126,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:3,4,2,0
chr3	151166971	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1,3,0,1
chr3	151171233	.	T	TCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=128,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.133:20:4,0:13,2:0|1:151171233_T_TCA:151171233:7,11,0,2
chr3	151171239	.	CA	TT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:13,2:0|1:151171233_T_TCA:151171233:8,14,0,2
chr3	151463493	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:1,2,2,2
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	152018223	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	152553628	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr3	152554337	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:7,0:0|1:152554337_A_T:152554337:13,7,0,2
chr3	152554338	.	G	GGTGTCGT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,1:8,0:0|1:152554337_A_T:152554337:13,7,0,2
chr3	152554357	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:1,10:5,4:5,1,8,6
chr3	152555452	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=103,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:4,2,1,4
chr3	152881926	.	GTA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=105,142;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,1:8,1:15,10,1,1
chr3	152883395	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.139:39:11,5:14,1:25,8,6,0
chr3	152884217	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=133,65;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.121:27:15,0:8,2:0|1:152884217_A_T:152884217:15,9,1,2
chr3	152884223	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=129,65;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.102:32:18,0:10,1:0|1:152884217_A_T:152884217:20,9,1,2
chr3	153839959	.	CT	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,6,9
chr3	153847582	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	153994502	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr3	154001006	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=110,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,4:6,0:11,5,3,1
chr3	154002357	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:6,3,3,1
chr3	154002597	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,6:2,1,5,6
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,15,2
chr3	154022511	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=159,1314;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:7,0,5,0
chr3	154022538	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=156,1314;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:9,0,5,0
chr3	154024137	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=133,1369;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,0:1,6:0,3,6,0
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	154856120	.	C	CACACAAAACTTCATAATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154856120_C_CACACAAAACTTCATAATGT:154856120:1,0,0,1
chr3	154856126	.	CC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154856120_C_CACACAAAACTTCATAATGT:154856120:1,0,0,1
chr3	154858158	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,4:7,2:6,11,3,3
chr3	154878144	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:4,4:1,2:1,5,4,2
chr3	155201288	.	AGAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	155204077	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155204077_A_AC:155204077:0,0,0,1
chr3	155204078	.	A	AACTGTGTGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155204077_A_AC:155204077:0,0,0,1
chr3	155210718	.	GAAAC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	155267770	.	C	CTACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr3	155282979	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155282979_A_T:155282979:0,1,0,1
chr3	155282980	.	GGGGTCAAA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155282979_A_T:155282979:0,1,0,1
chr3	155282992	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:155282979_A_T:155282979:0,1,0,1
chr3	155301264	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=127,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:9,1:3,3:7,6,4,0
chr3	155520459	.	A	AATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155520459_A_AATG:155520459:0,1,0,1
chr3	155520462	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155520459_A_AATG:155520459:0,1,0,1
chr3	155551206	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	155551686	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,3:6,0:11,5,3,0
chr3	155551894	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr3	155628877	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,3:7,2:6,5,4,1
chr3	155637190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	155637225	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	155639959	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=108,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:9,6:7,2:11,5,4,4
chr3	155643189	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.246:32:15,2:7,4:15,10,2,5
chr3	155643204	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.201:25:12,0:6,0:2,18,5,0
chr3	156139307	.	A	AGAGTTTCTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=170,264;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	156233027	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	156746102	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:21,4:21,0:26,16,4,0
chr3	156867776	.	G	GAA,GAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,144,115;MMQ=60,60,60;MPOS=21,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,10,11;RU=A;STR;TLOD=25.66,5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,3:0.723,0.232:14:0,6,2:0,5,1:0,0,7,7
chr3	156870059	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=98.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,12:0,19:0,0,9,23
chr3	156870101	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:6,2:0|1:156870101_A_AG:156870101:1,10,0,2
chr3	156870103	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:0|1:156870101_A_AG:156870101:1,10,0,2
chr3	156870107	.	T	TAAAA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:156870101_A_AG:156870101:1,8,0,2
chr3	156870111	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:156870101_A_AG:156870101:1,8,0,2
chr3	156870114	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,1:0|1:156870101_A_AG:156870101:1,8,0,2
chr3	156870816	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr3	156876574	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	156876803	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	156877276	.	CAA	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,7,18
chr3	156877357	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	156978919	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr3	156983273	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,12,6
chr3	157004536	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=228,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:157004536_AG_A:157004536:0,1,0,1
chr3	157004542	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=228,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157004536_AG_A:157004536:0,1,0,1
chr3	157081604	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	157146307	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,4,7
chr3	157271181	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157271181_TA_T:157271181:0,1,0,1
chr3	157271184	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:157271181_TA_T:157271181:0,1,0,1
chr3	157288986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:4,6,1,1
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	158072623	.	ATT	A,AT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,24,26;MFRL=122,194,127;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.97,5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,3,5:0.114,0.182:29:10,2,1:10,1,4:12,9,2,6
chr3	158072637	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.127:32:6,0:14,0:9,19,4,0
chr3	158072776	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	158178856	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=117,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:4,2:3,2:0,7,1,3
chr3	158178890	.	ATGCTG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,1,5
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	158362391	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,3:2,8:1,3,10,1
chr3	158362526	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=89,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:7,6:1,8:3,5,4,10
chr3	158362588	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr3	158364586	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=131,80;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:10,0:13,4:12,11,1,3
chr3	158366900	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr3	158376886	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158376886_G_A:158376886:0,1,0,1
chr3	158376895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158376886_G_A:158376886:0,1,0,1
chr3	158384068	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=112,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:8,1:0,4:5,3,3,2
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,5:3,7:1,4,1,11
chr3	158386737	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,4:2,4:3,1,8,0
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	158388721	.	C	CAAAGAAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGAAA;STR;TLOD=112.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.599:48:6,12:13,14:7,12,21,8
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.640:14:4,4:1,5:4,1,7,2
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:4,1,5,1
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,5:3,2:6,1,3,4
chr3	158422506	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr3	158422789	.	A	AGACTTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	158428816	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158428816_G_A:158428816:0,1,0,1
chr3	158428818	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158428816_G_A:158428816:0,1,0,1
chr3	158431702	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr3	158520011	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:3,7:2,3:5,0,9,1
chr3	158522222	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,2,1
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,5:7,5:3,10,5,6
chr3	158539894	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:5,2:0|1:158539894_C_T:158539894:7,9,1,1
chr3	158539897	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:0|1:158539894_C_T:158539894:7,9,1,1
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:3,4,0,3
chr3	158546849	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.493:8:4,2:0,2:0,4,1,3
chr3	158980279	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr3	159604214	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	159610051	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:159610051_C_T:159610051:0,2,0,1
chr3	159610055	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:159610051_C_T:159610051:0,3,0,1
chr3	159713418	.	A	AAACAAACATGTAAGCATAACTTATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr3	159995102	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,4:2,6:3,0,7,3
chr3	160018642	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr3	160021681	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=78,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:5,8:9,9:7,7,11,6
chr3	160102424	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:15,7:16,4:19,12,0,11
chr3	160119631	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,1,2
chr3	160130110	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:5,0,7,0
chr3	160131236	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31,30;MFRL=103,120,112;MMQ=60,60,60;MPOS=28,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.94,14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,9:0.138,0.377:24:5,1,3:4,2,4:9,3,8,4
chr3	160134208	.	G	GT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,14;MFRL=111,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:5,0:5,1:3,12,1,3
chr3	160142810	.	A	ATGTGTGTGTGTG	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=26,15;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,21;RU=TG;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.477:9:1,1:2,0:0,4,0,5
chr3	160144022	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=108,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:4,5,3,7
chr3	160148756	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,4:2,6:5,1,9,1
chr3	160150024	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,4:4,9:5,6,8,5
chr3	160150068	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:19,0:18,4:11,26,0,4
chr3	160155857	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=108,97;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:6,4:17,0:15,8,4,0
chr3	160220006	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=108,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,2:6,1:4,11,0,3
chr3	160225927	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=117,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:20,0:14,3:18,17,1,2
chr3	160227606	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr3	160233406	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.429:24:7,2:5,7:4,10,0,10
chr3	160233427	.	AG	GA	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.175:26:13,1:7,3:0|1:160233427_AG_GA:160233427:3,19,0,4
chr3	160233431	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.205:22:11,1:5,3:0|1:160233427_AG_GA:160233427:1,17,0,4
chr3	160233433	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=129,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.224:20:11,0:5,1:0|1:160233427_AG_GA:160233427:0,16,0,4
chr3	160239788	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160239788_C_T:160239788:0,0,0,1
chr3	160239790	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160239788_C_T:160239788:0,0,0,1
chr3	160249231	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.353:31:8,2:12,8:11,9,9,2
chr3	160253263	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:6,4:8,7:6,8,9,2
chr3	160282965	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.585:8:1,1:1,0:0|1:160282965_A_C:160282965:1,2,5,0
chr3	160282974	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:3,0:1,0:0|1:160282965_A_C:160282965:2,2,3,0
chr3	160283126	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,8:0,3:0,2,0,11
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr3	160783108	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	160783123	.	C	CTCTTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	160804167	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,1,4
chr3	160939732	.	A	AATCCCAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATCCCAAC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C,CTTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,166,171;MMQ=60,60,60;MPOS=14,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=30,13,21;RU=T;STR;TLOD=16.48,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.625,0.250:5:0,2,1:0,1,0:0,0,5,0
chr3	160942667	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:2,0:5,1,3,1
chr3	160952651	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:160955879_G_T:160955879:0,0,3,1
chr3	160955882	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.719:5:0,2:0,2:0|1:160955879_G_T:160955879:0,1,3,1
chr3	160960283	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	161064170	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0|1:161064170_G_A:161064170:0,3,1,1
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=141,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:161064170_G_A:161064170:0,1,0,1
chr3	161214858	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:0,0:15,2:0|1:161214858_A_C:161214858:8,7,1,1
chr3	161214863	.	T	TGA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:1,0:14,2:0|1:161214858_A_C:161214858:8,8,1,1
chr3	161220819	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.552:20:6,9:2,2:6,3,8,3
chr3	161221529	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,2,0
chr3	161221645	.	A	AATGTTGCAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr3	161221814	.	T	TGACAGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	164700005	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=128,120;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:5,4,2,0
chr3	164700100	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:1,1,5,3
chr3	164700700	.	A	AAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0|1:164700700_A_AAG:164700700:7,0,3,0
chr3	164700702	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:3,2:0|1:164700700_A_AAG:164700700:8,0,3,0
chr3	164700707	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr3	164714532	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	164735531	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=101,70;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:164735531_A_G:164735531:1,1,1,0
chr3	164735533	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=101,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:164735531_A_G:164735531:1,1,1,0
chr3	164735537	.	AT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:164735531_A_G:164735531:3,1,1,0
chr3	164739178	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=109,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:5,9,0,3
chr3	164748665	.	C	CA,CAAAAAAAAAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30,30;MFRL=90,86,138;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,23;RU=A;STR;TLOD=4.84,4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,3:0.531,0.298:10:2,1,0:0,3,3:1,1,6,2
chr3	164748679	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=19,28;MFRL=109,113;MMQ=60,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.234:10:2,0:1,2:4,4,2,0
chr3	164751319	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	164764719	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,10,15
chr3	164766816	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,6:0,0,4,5
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr3	164777811	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:164777811_A_AG:164777811:1,4,1,1
chr3	164777815	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:164777811_A_AG:164777811:1,4,1,1
chr3	164777818	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:164777811_A_AG:164777811:1,4,1,1
chr3	164777819	.	A	AGTGC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=129,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:164777811_A_AG:164777811:1,4,1,1
chr3	164780156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,0:12,3:11,5,1,2
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=119,143;MMQ=53,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr3	164786431	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=128,126;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:6,0,2,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	164786962	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:18,4:12,0:13,17,3,1
chr3	165547398	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:4,6,2,1
chr3	165548706	.	CCA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:1,0:3,1:3,2,0,1
chr3	166958726	.	A	AAACTAATGAAGTAACATTTGATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	167006612	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=263,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,5,1
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,9,14
chr3	167090775	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,2:4,0:0,8,0,2
chr3	167223081	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:3,2,1,1
chr3	167223269	.	CTATGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0|1:167223269_CTATGTGT_C:167223269:0,0,0,1
chr3	167223279	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167223269_CTATGTGT_C:167223269:0,0,0,1
chr3	167254816	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr3	167272628	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:167272628_A_C:167272628:0,0,0,1
chr3	167272634	.	T	TTATTACAAGCCATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167272628_A_C:167272628:0,0,0,1
chr3	167272640	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167272628_A_C:167272628:0,1,0,1
chr3	167272643	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=174,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167272628_A_C:167272628:0,1,0,1
chr3	167508062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	167508439	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:1,5,0,3
chr3	167525072	.	AAGGCTCTTGGAATAACTGAAATTTTCATCAAAGATGCAAATTTGAC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.105:27:7,2:11,0:9,16,1,1
chr3	167728226	.	A	AAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	167742353	.	GTCC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,9:3,2:1,4,6,5
chr3	167742777	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=122,82;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,5:11,0:12,10,5,0
chr3	167747026	.	GG	AA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:5,2,1,1
chr3	167747915	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167747915_G_C:167747915:0,0,0,1
chr3	167747918	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167747915_G_C:167747915:0,0,0,1
chr3	167747919	.	T	TTGACATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167747915_G_C:167747915:0,0,0,1
chr3	167750594	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,92;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:5,3,2,0
chr3	167754756	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr3	167754767	.	A	ACCTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr3	167754799	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	168810980	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	168820069	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:168820069_A_AG:168820069:0,2,0,1
chr3	168820075	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:168820069_A_AG:168820069:0,2,0,1
chr3	168820078	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:168820069_A_AG:168820069:0,2,0,1
chr3	168820082	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:168820069_A_AG:168820069:0,2,0,1
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,2,3
chr3	168845737	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=145,103;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:7,0:9,5:0|1:168845737_A_T:168845737:7,9,0,5
chr3	168845741	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=145,103;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:6,0:9,4:0|1:168845737_A_T:168845737:7,9,0,5
chr3	169486220	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	169504181	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,1:3,1:5,3,2,0
chr3	169566046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=92,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:2,3,2,0
chr3	169569587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:5,0:3,4:2,6,0,4
chr3	169587493	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:10,0:16,4:12,15,1,3
chr3	169587661	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	169639225	.	GATC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	169642737	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=120,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	169656082	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,6:1,4:1,1,8,2
chr3	169684706	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:4,2:5,8,0,2
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr3	169992975	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=58,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	170013604	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.292:12:0,3:7,0:9,0,3,0
chr3	170013611	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:10,0,2,0
chr3	170015281	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:170015281_CA_TG:170015281:0,3,0,1
chr3	170015284	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=145,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	170015285	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:170015281_CA_TG:170015281:0,2,0,1
chr3	170141080	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:4,10,1,2
chr3	170198967	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=75,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,3:1,1,0,8
chr3	170204206	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,5:4,1:0,5,0,6
chr3	170204226	.	T	TTGTAGACTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	170715830	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,11,9
chr3	170723276	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	170723664	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:170723664_A_G:170723664:0,0,6,0
chr3	170723668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:170723664_A_G:170723664:0,0,7,0
chr3	170724883	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr3	170727739	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,12,6
chr3	170781729	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,3:3,0:5,8,2,1
chr3	170825905	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,6,9
chr3	170857167	.	G	GCACACA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,171;MMQ=60,56;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=CA;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.838:3:0,0:0,0:0,0,1,2
chr3	170857240	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=95,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.455:51:13,5:14,17:7,21,5,18
chr3	170879202	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:170879202_TAA_T:170879202:0,2,1,1
chr3	170879205	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:170879202_TAA_T:170879202:0,2,1,1
chr3	170879208	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:170879202_TAA_T:170879202:0,2,1,1
chr3	170879209	.	A	ACG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:170879202_TAA_T:170879202:0,2,1,1
chr3	170928820	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr3	171087469	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	171320907	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,0,2
chr3	171395280	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	171404423	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:8,2,3,0
chr3	171405384	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,0:2,2:1,5,1,1
chr3	171442387	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	171969077	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,23:0,30:0,0,32,21
chr3	172003831	.	CTT	C,CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,150,183;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.74,8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.333,0.563:6:0,1,1:0,1,2:0,0,0,6
chr3	172025383	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:172025383_TG_CA:172025383:0,0,0,1
chr3	172025388	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:172025383_TG_CA:172025383:0,0,0,1
chr3	172025392	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:172025383_TG_CA:172025383:0,0,0,1
chr3	172059094	.	A	ACGCCACCAAACCCGGCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	172060700	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	172064091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,4,2
chr3	172098952	.	T	TGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:172098952_T_TGCAG:172098952:0,1,0,1
chr3	172098955	.	A	AATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:172098952_T_TGCAG:172098952:0,1,0,1
chr3	172115101	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:3,6,2,0
chr3	172166048	.	T	TCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=128,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:172166048_T_TCCA:172166048:1,3,0,1
chr3	172166049	.	G	GGAGTTTGAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=128,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:172166048_T_TCCA:172166048:1,3,0,1
chr3	172229382	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=143,96;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:8,1,4,0
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:9,2:4,2:0|1:172480173_A_ATT:172480173:9,4,3,1
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.262:17:9,2:4,2:0|1:172480173_A_ATT:172480173:9,4,3,1
chr3	172486964	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:172486964_C_A:172486964:0,1,0,2
chr3	172486971	.	A	ATTTTTAACATCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:172486964_C_A:172486964:0,1,0,2
chr3	172486972	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:172486964_C_A:172486964:0,1,0,2
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	172533538	.	A	AGACATATAAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=120,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:7,0:5,2:4,9,1,1
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=106,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:6,1:8,3:8,6,3,2
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr3	172607535	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,117;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:1,4,2,0
chr3	172634027	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	172634106	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=105,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr3	172642065	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr3	172694662	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	172766764	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=117,127;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:9,2:9,4,0,2
chr3	173998959	.	A	ACTCTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:173998959_A_ACTCTT:173998959:3,1,0,1
chr3	173998962	.	A	AACCTCTGCCCG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:173998959_A_ACTCTT:173998959:3,1,0,1
chr3	173998964	.	T	TACCCAGTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:173998959_A_ACTCTT:173998959:3,1,0,1
chr3	173998969	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:2,1,1,0
chr3	174814920	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:11,4,5,0
chr3	174951756	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:6,1,4,3
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	175185060	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=73,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,8:0,7:2,0,9,6
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=129,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,6:5,6:9,4,8,4
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=102,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:8,6:6,5:5,9,7,4
chr3	175455116	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=117,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:7,2,4,5
chr3	175473047	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,11,4
chr3	175521008	.	T	TCTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:175521008_T_TCTCTC:175521008:0,0,0,1
chr3	175521010	.	T	TTCTCATC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:175521008_T_TCTCTC:175521008:0,0,0,1
chr3	176752202	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	176756230	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:1,6,1,3
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,14:0,27:0|1:176765253_G_A:176765253:0,0,35,8
chr3	176765269	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,32:0.534:60:8,16:18,15:0|1:176765253_G_A:176765253:22,6,20,12
chr3	176769608	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr3	178543581	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:4,3:0,0:0,4,1,2
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=109,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.300:31:15,6:7,3:9,13,2,7
chr3	178919397	.	ATTT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,21;MFRL=147,169;MMQ=45,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr3	178919422	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=183,169;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.437:4:2,1:0,1:0|1:178919422_A_G:178919422:0,2,0,2
chr3	178919427	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=183,146;MMQ=53,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:178919422_A_G:178919422:0,2,0,1
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=89,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:6,6:7,8:8,5,9,5
chr3	178922430	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=130,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,2:3,6:0,8,1,7
chr3	178922479	.	CA	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=168,154;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,1:0,7,0,2
chr3	178928435	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	178937526	.	AAAATAATGTAAAATAGT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=130,116;MMQ=60,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,2:19,0:9,25,1,1
chr3	178942065	.	G	GAAACAAATAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178942065_G_GAAACAAATAA:178942065:0,0,0,1
chr3	178942069	.	GT	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:178942065_G_GAAACAAATAA:178942065:0,0,0,1
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,4,2
chr3	178947832	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,668;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,3:13,0:14,14,0,3
chr3	178951976	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:6,11,0,2
chr3	178976591	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	178976777	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,16,16
chr3	178976821	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,9,15
chr3	179050859	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:9,3:12,13:9,12,10,6
chr3	179052195	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:3,4:2,2:0,5,2,4
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr3	179085791	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=88,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:10,9:17,6:16,11,8,7
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=69,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,2:2,3:4,4,4,1
chr3	179094811	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.371:38:12,8:12,5:12,12,10,4
chr3	179103342	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:2,2:2,2:4,0,3,2
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=89,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:3,1,2,1
chr3	179123060	.	GA	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:9,1:12,7,0,2
chr3	179144021	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr3	179291308	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.943:13:0,2:0,11:0,0,0,13
chr3	179294031	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=107,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,0:15,4:11,19,0,4
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr3	179304255	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:179304255_G_A:179304255:0,0,4,0
chr3	179304266	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=75,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.756:6:0,1:1,4:0|1:179304255_G_A:179304255:0,1,5,0
chr3	179320386	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=G;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	179341893	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:1,2,0,3
chr3	179399570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	179408034	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:24,3:14,0:26,13,3,0
chr3	179418995	.	G	GTGAGTGCACATGTATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	179419005	.	G	GCATGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	179424862	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:3,10:7,5:4,7,6,10
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr3	179463076	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179463076_A_G:179463076:0,0,0,1
chr3	179463081	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179463076_A_G:179463076:0,0,0,1
chr3	179472499	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=115,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	179472674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	179475001	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:179475001_G_GT:179475001:0,0,0,1
chr3	179475003	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179475001_G_GT:179475001:0,0,0,1
chr3	179482016	.	TAGC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=69,130;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179482016_TAGC_T:179482016:0,2,0,1
chr3	179482021	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=0,130;MMQ=60,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179482016_TAGC_T:179482016:0,1,0,1
chr3	179502024	.	A	AGAGCTGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	179592053	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	179592240	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr3	179593072	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,3,1
chr3	179593301	.	C	CTCATGCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	179689365	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:4,3:4,1,8,2
chr3	180320685	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:6,3:8,1:10,6,4,0
chr3	180322248	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:6,1:4,2:8,3,3,0
chr3	180328039	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,84;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:4,7,0,2
chr3	180365043	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:3,3:3,0:2,6,0,3
chr3	180372510	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr3	180379886	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180379886_GT_G:180379886:0,1,0,1
chr3	180379891	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180379886_GT_G:180379886:0,1,0,1
chr3	180379894	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180379886_GT_G:180379886:0,1,0,1
chr3	180666689	.	A	AAATGAGTCCGGGGTCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	180680953	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:180680953_TTTC_T:180680953:0,0,0,1
chr3	180680960	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:180680953_TTTC_T:180680953:0,1,0,1
chr3	180680962	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180680953_TTTC_T:180680953:0,1,0,1
chr3	180680965	.	A	AAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180680953_TTTC_T:180680953:0,1,0,1
chr3	180693215	.	GTT	G,GT	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=28,25,32;MFRL=113,121,122;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.44,9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,6,8:0.108,0.164:55:14,2,5:23,4,3:21,20,2,12
chr3	180693253	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=127,92;MMQ=60,29;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:10,0:14,5:2,24,1,4
chr3	180704645	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	181431226	.	GA	G	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.162:52:25,6:13,1:32,12,6,2
chr3	181431698	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=122,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.094:61:33,0:21,5:21,35,5,0
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,17:0,0,15,26
chr3	182559786	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=72,156;MMQ=60,47;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.219:28:8,0:12,4:1,21,6,0
chr3	182563324	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=122,52;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:14,5:19,0:12,21,0,5
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,16,3
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,23,3
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,3,17
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,2:0,11:0,0,7,7
chr3	182631879	.	G	GATAGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	182681853	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	182754995	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:10,9,2,0
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	182810144	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr3	182853564	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:11,0:13,3:0|1:182853564_A_C:182853564:14,13,0,3
chr3	182853565	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=120,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:13,0:14,3:0|1:182853564_A_C:182853564:14,13,0,3
chr3	182858228	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=130,119;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:2,2,1,0
chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,6:5,10:5,9,6,10
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=73,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=75,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	182871962	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=97,97;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,41:0.656:62:12,24:8,16:5,16,10,31
chr3	182897774	.	GAT	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=160,120;MMQ=60,21;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:182897774_GAT_G:182897774:1,1,1,0
chr3	182897777	.	G	GACA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=160,120;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:182897774_GAT_G:182897774:1,1,1,0
chr3	182897781	.	GCT	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=160,120;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:182897774_GAT_G:182897774:1,1,1,0
chr3	182897784	.	A	AGAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=160,120;MMQ=60,21;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:182897774_GAT_G:182897774:1,1,1,0
chr3	182897789	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=160,120;MMQ=60,21;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:182897774_GAT_G:182897774:1,1,1,0
chr3	182897920	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,4:0,4:0,2,5,4
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,2:5,5:0,9,0,7
chr3	182941306	.	A	AGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,4,3
chr3	182947413	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,0:1,8:2,0,5,3
chr3	183014733	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr3	183041201	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr3	183056541	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr3	183059490	.	T	TCCATTCCAACCATAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr3	183217324	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr3	183225788	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:6,2:5,0:10,1,3,0
chr3	183389031	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr3	183439936	.	G	GAAT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.236:10:5,2:1,0:0|1:183439936_G_GAAT:183439936:1,7,1,1
chr3	183439937	.	G	GGAATGGAATGGAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:5,1:3,0:0|1:183439936_G_GAAT:183439936:1,7,1,1
chr3	183439972	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	183465590	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=157,157;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:7,2:3,1:0|1:183465590_G_A:183465590:0,10,0,3
chr3	183465592	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=157,157;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:0,10,0,2
chr3	183465595	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,157;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:0|1:183465590_G_A:183465590:0,10,0,3
chr3	183480071	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:183480071_T_C:183480071:0,2,0,1
chr3	183480079	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:183480071_T_C:183480071:0,2,0,1
chr3	183491340	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr3	183515853	.	C	CACAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:1,5,1,1
chr3	183518281	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=121,153;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,0:13,4:15,15,0,4
chr3	183518443	.	T	TTGGAGGTGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=131,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	183518446	.	A	ATGTGAGTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	183521133	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,3:2,5:3,3,3,5
chr3	183524948	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	183526882	.	TAGGCTACAGAACAGCTGGTGAATGATATCCTGAGAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.109:26:9,2:5,0:14,10,1,1
chr3	183528442	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr3	183535094	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	183535763	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=97,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:7,4:4,1:8,3,5,0
chr3	183558497	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=20,16;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.295:16:4,1:5,0:0,11,2,3
chr3	183558505	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=126,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:7,2:8,16,0,2
chr3	183585883	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,1:1,5:1,3,1,5
chr3	183639021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,7:8,0:11,2,7,0
chr3	183677635	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:8,2:6,3:1,14,0,5
chr3	183700211	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,5:4,8:4,1,8,5
chr3	183700723	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:11,0:10,9,0,3
chr3	183731952	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr3	183750640	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=88,58;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:15,0:18,4:11,22,0,4
chr3	183754527	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr3	183755822	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:6,4:5,3:7,4,4,4
chr3	183756391	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=122,131;MMQ=52,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.371:23:11,5:4,3:10,5,3,5
chr3	183756441	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:9,6:2,0:7,5,2,4
chr3	183756780	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=82,143;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:1,8,0,7
chr3	183756808	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=76,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr3	183774872	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183777919	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183818221	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,6:2,1:5,3,5,2
chr3	183818416	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr3	183818511	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	183819155	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr3	183822504	.	C	CAAAAAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=22,33;RU=A;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.768:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	183822795	.	A	AACACCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	183823576	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr3	183857809	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.487:8:0,1:2,3:2,2,4,0
chr3	183860687	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=105,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,0:9,4:5,17,0,4
chr3	183882028	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=116,46;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:14,4:11,0:14,12,4,0
chr3	183883259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=127,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:4,1:7,7,1,1
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,4:6,1:7,2,2,3
chr3	183896989	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=0,455;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	183900041	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,137;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:13,2:6,12,0,2
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:1,3,1,1
chr3	183903935	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:6,1,6,0
chr3	183911568	.	C	CTCGGTGCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=207,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	183953080	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=88,53;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:11,12,1,1
chr3	183957458	.	T	TTCCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183957458_T_TTCCCA:183957458:2,2,0,1
chr3	183957460	.	C	CATCATCCCACTCCACTCCCTAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183957458_T_TTCCCA:183957458:2,2,0,1
chr3	183957467	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,2,1
chr3	183960252	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:6,0,6,2
chr3	183961543	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	183961834	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr3	183963381	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:5,6:7,4:4,9,4,6
chr3	183966499	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=48,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:183966499_C_CA:183966499:0,2,1,0
chr3	183966500	.	T	TGCCAAACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=48,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:183966499_C_CA:183966499:0,2,1,0
chr3	183966773	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	183975365	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr3	183975593	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:2,8,0,2
chr3	183994512	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=79,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:183994512_G_A:183994512:1,2,1,1
chr3	183994515	.	A	ACTATTCCTCACCCTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=79,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:183994512_G_A:183994512:1,2,1,1
chr3	183994536	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183995854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=96,113;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	184002696	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:7,0,3,0
chr3	184009246	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr3	184010048	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr3	184020905	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0,8,1,2
chr3	184022108	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=96,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,1:17,1:12,22,1,1
chr3	184022141	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.101:32:12,0:17,2:8,21,1,2
chr3	184025169	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:9,7,1,1
chr3	184026703	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,121;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr3	184038874	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:0,9,0,3
chr3	184039666	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,9,7
chr3	184043019	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=118,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr3	184046355	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	184046811	.	C	CCACG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CACG;STR;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,2:2,2,0,6
chr3	184062523	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	184070478	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:7,2,2,0
chr3	184071063	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,2:6,8:8,1,5,5
chr3	184071984	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,4:7,1:4,10,4,1
chr3	184072632	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.645:15:3,4:2,5:3,2,4,6
chr3	184073551	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,1:3,4:0,4,2,4
chr3	184075047	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=106,164;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,1,4
chr3	184075082	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	184076690	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,1,0
chr3	184081371	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:2,3,2,4
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.399:28:12,6:5,5:14,3,8,3
chr3	184090496	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=88,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:22,0:21,2:0|1:184090496_C_T:184090496:23,22,1,1
chr3	184090508	.	TGGCAGG	T	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=87,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:19,0:17,2:0|1:184090496_C_T:184090496:22,26,1,1
chr3	184090516	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=82,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:19,0:19,2:0|1:184090496_C_T:184090496:17,24,1,1
chr3	184090518	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=87,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:20,0:18,2:0|1:184090496_C_T:184090496:18,24,1,1
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	184101235	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:184101235_G_T:184101235:1,0,0,1
chr3	184101237	.	A	AGGCTCGCATGAAACTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0|1:184101235_G_T:184101235:1,0,0,1
chr3	184102917	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,141;MMQ=60,37;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,2:4,6,0,3
chr3	184103090	.	G	GGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184103090_G_GGGT:184103090:0,2,0,1
chr3	184103093	.	C	CTTGGGTGGCTTGGCTGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:184103090_G_GGGT:184103090:0,2,0,1
chr3	184103105	.	A	ACAGGGCCTATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	184105791	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=127,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:184105791_A_C:184105791:1,5,1,1
chr3	184105795	.	C	CAAGCTTGCAAATGACG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0|1:184105791_A_C:184105791:1,5,1,1
chr3	184293564	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,3:0,0:2,0,4,0
chr3	184293610	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=113,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,1:2,1:5,3,1,2
chr3	184295392	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:184295392_G_GAGT:184295392:1,0,0,1
chr3	184295394	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:184295392_G_GAGT:184295392:1,0,0,1
chr3	184297235	.	CCCTCTCACGCCCA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:3,2:9,4,1,1
chr3	184299414	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:0,7,1,8
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr3	184550427	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr3	184567039	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr3	184577917	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr3	184580917	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0|1:184580917_A_G:184580917:0,2,0,3
chr3	184580924	.	T	TGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:184580917_A_G:184580917:0,4,0,1
chr3	184580925	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:184580917_A_G:184580917:0,4,0,1
chr3	184580929	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:184580917_A_G:184580917:0,4,0,1
chr3	184588420	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,7:1,2:0,4,1,8
chr3	184633359	.	G	GGGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,1:0,1:0|1:184633359_G_GGGAA:184633359:0,1,0,3
chr3	184633363	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:184633359_G_GGGAA:184633359:0,1,0,1
chr3	184642587	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.701:5:0,3:1,0:1,0,3,1
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29,24,14;MFRL=0,144,108,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,22,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=6.83,32.58,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,12,2:0.173,0.647,0.142:17:0,2,1,0:0,1,9,0:0,0,1,16
chr3	184675095	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	184675147	.	CTTTTA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,2:3,7:6,1,7,2
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	184766210	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=124,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr3	184766249	.	TC	CT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=83,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:3,1,2,5
chr3	184766258	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:184766258_A_T:184766258:4,5,1,1
chr3	184766262	.	T	TGCTATTGAGTTGCTGTG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:184766258_A_T:184766258:4,5,1,1
chr3	184766264	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=102,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,1:7,0:0|1:184766258_A_T:184766258:4,5,1,1
chr3	184766392	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	184766414	.	T	TTTTATGTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:184766414_T_TTTTATGTGA:184766414:0,2,0,1
chr3	184766417	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:184766414_T_TTTTATGTGA:184766414:0,2,0,1
chr3	184935844	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184935844_C_T:184935844:0,0,1,0
chr3	184935848	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184935844_C_T:184935844:0,0,1,0
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=72,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.777:12:0,5:3,3:1,2,1,8
chr3	185198370	.	G	GTTATT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:185198370_G_GTTATT:185198370:0,5,0,2
chr3	185198372	.	T	TATTTTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:185198370_G_GTTATT:185198370:0,5,0,2
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,1:0,0,0,9
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	185241753	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=155,144;MMQ=57,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:185241753_A_G:185241753:10,0,2,0
chr3	185241758	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=155,144;MMQ=57,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,2:8,0:0|1:185241753_A_G:185241753:10,0,2,0
chr3	185241776	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=142,144;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:14,1,2,0
chr3	185241790	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=137,112;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,4:12,0:15,2,3,1
chr3	185245377	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:6,6,2,1
chr3	185324200	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=98,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:7,2:14,2:13,8,1,3
chr3	185327012	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr3	185330303	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	185337306	.	TAATGGTTAATTGTTGGACTTGGATAAAGGCCATTTTTTAAAAATAATGCTGCCTTTTTCTGCCCTGTGTATAGAGGCC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.659:6:1,3:0,1:0,1,1,4
chr3	185363243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	185363491	.	T	TTTTGCGGATGTGGACCTTGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:185363491_T_TTTTGCGGATGTGGACCTTGAG:185363491:0,1,0,1
chr3	185363495	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:185363491_T_TTTTGCGGATGTGGACCTTGAG:185363491:0,1,0,1
chr3	185367124	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,3,2
chr3	185636330	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:185636330_A_G:185636330:0,1,0,1
chr3	185636332	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=128,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:185636330_A_G:185636330:0,1,0,1
chr3	185766705	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	185766711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	185774813	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr3	185783744	.	G	GGA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,76;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.125:29:11,1:14,0:9,17,2,1
chr3	185868041	.	A	AACT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:185868041_A_AACT:185868041:0,0,0,1
chr3	185868042	.	G	GGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:185868041_A_AACT:185868041:0,0,0,1
chr3	185868044	.	C	CAAACTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185868041_A_AACT:185868041:0,0,0,1
chr3	185868048	.	G	GGAAGATGCAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185868041_A_AACT:185868041:0,0,0,1
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	185882643	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr3	185906229	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=149,178;MMQ=60,46;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906231	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=149,178;MMQ=60,46;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906241	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906243	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=149,178;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906246	.	CGTGT	C,TGTGT	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=26,26,30;MFRL=143,154,178;MMQ=60,60,46;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.23,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.257,0.222:5:2,1,0:0,0,1:0,3,0,2
chr3	185906253	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=161,178;MMQ=60,46;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906259	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=161,178;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185906261	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,32;MFRL=161,178;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:185906229_C_CA:185906229:0,4,0,1
chr3	185960192	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr3	185979491	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=146,89;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.204:16:9,0:4,2:9,4,0,3
chr3	185979658	.	A	ATAATCAAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	185982955	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	185993319	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:4,4,2,1
chr3	186006566	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,12,7
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr3	186015315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr3	186256754	.	TA	AG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=175,44;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,0:4,2:2,3,1,1
chr3	186256778	.	A	ATACATC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:0|1:186256778_A_ATACATC:186256778:0,3,1,1
chr3	186256781	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=160,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:186256778_A_ATACATC:186256778:0,3,1,1
chr3	186257133	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,142;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr3	186272377	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,0:3,2:9,6,1,1
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:1,1,1,4
chr3	186293820	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	186295417	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=260,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:1,4:0,8:1,0,13,3
chr3	186299800	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=111,102;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:19,3:19,0:26,15,3,0
chr3	186302391	.	A	ATTGTGTGTGT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,14:0,0,21,12
chr3	186337713	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,7,11
chr3	186337827	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	186338382	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,10,6
chr3	186358366	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr3	186358446	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=98,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:3,5,4,2
chr3	186360409	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,3:2,3:2,3,1,5
chr3	186370333	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.431:14:3,3:5,2:5,3,6,0
chr3	186384015	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr3	186389444	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,337;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:20,0:11,3:12,19,3,0
chr3	186437941	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:5,0:12,3:9,8,1,2
chr3	186442796	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	186442833	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr3	186459227	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,33:0.587:56:11,22:12,10:6,17,9,24
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,6,10
chr3	186793450	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:0|1:186793450_C_CT:186793450:11,9,0,2
chr3	186793451	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:9,1:0|1:186793450_C_CT:186793450:11,9,0,2
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:1,9,2,1
chr3	186943088	.	AGAGGTG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr3	186953633	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr3	186953845	.	A	ATAATTTATAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:186953845_A_ATAATTTATAT:186953845:0,0,0,1
chr3	186953848	.	T	TAGGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:186953845_A_ATAATTTATAT:186953845:1,0,0,1
chr3	186953849	.	C	CTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:186953845_A_ATAATTTATAT:186953845:1,0,0,1
chr3	186961375	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:6,9:3,9:8,1,7,12
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,0,5
chr3	186968209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr3	186980264	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,3:3,6:6,0,8,1
chr3	186980285	.	GGA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GA;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.196:28:11,1:11,4:14,9,4,1
chr3	187009416	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=116,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:17,0:10,5:16,12,1,4
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,5,3
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	187440223	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,4:7,3:8,5,6,1
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,5
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,3
chr3	188327368	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=121,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,0:11,3:13,8,2,1
chr3	188406618	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:188406618_T_C:188406618:15,9,1,1
chr3	188406620	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:0|1:188406618_T_C:188406618:15,9,1,1
chr3	188584186	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=99,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:6,9:1,7:1,6,5,11
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	188590446	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,4:8,9:6,9,5,8
chr3	189028395	.	G	GCTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	189038531	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,170;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:22,0:34,4:26,31,0,4
chr3	189038648	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:1,7:2,7:1,2,0,14
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=188.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,19:0,23:1,0,43,0
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,7:4,2:5,1,9,0
chr3	189590824	.	GG	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.700:30:7,9:2,12:2,7,4,17
chr3	189598059	.	C	CAGGTATATA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:189598059_C_CAGGTATATA:189598059:0,2,0,1
chr3	189598060	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:189598059_C_CAGGTATATA:189598059:0,2,0,1
chr3	189598063	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:189598059_C_CAGGTATATA:189598059:0,2,0,1
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=108,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,25:0.604:41:7,9:9,16:7,9,17,8
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=18,17;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:0,0:2,2:0,6,1,6
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,0,8
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr3	189705542	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	189706873	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,11,9
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.890:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	189713293	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr3	189837993	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:2,7:1,1:3,0,9,0
chr3	189838021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:6,5:2,0:5,3,6,0
chr3	190040064	.	A	ACAAGCTTTGTGCTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:190040064_A_ACAAGCTTTGTGCTTTCC:190040064:0,1,0,1
chr3	190040066	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:190040064_A_ACAAGCTTTGTGCTTTCC:190040064:0,1,0,1
chr3	190106071	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=48.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0|1:190106071_AG_A:190106071:0,0,7,4
chr3	190106074	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0|1:190106071_AG_A:190106071:0,0,7,4
chr3	190106242	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr3	190147620	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:190322271_T_C:190322271:0,0,1,4
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,0,1,4
chr3	190338010	.	GTTTTCTATGCATGTATCTAAAAAGTAAACTTTTTTTTTTTTTACT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,0:0,2:2,2,1,1
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,0,9
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.961:21:0,11:0,10:0,0,6,15
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	190573340	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=103,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:5,5:7,5:5,7,1,9
chr3	190573374	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,3,4
chr3	190573792	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CA;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	190578701	.	G	GCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:190578701_G_GCCT:190578701:0,1,0,1
chr3	190578703	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:190578701_G_GCCT:190578701:0,1,0,1
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:5,2,8,3
chr3	190993205	.	TA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr3	190993219	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:190993219_C_T:190993219:0,2,0,1
chr3	190993227	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:190993219_C_T:190993219:0,3,0,1
chr3	190993235	.	C	CTCAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	191093115	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:5,13,0,2
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	191093468	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:12,0,6,0
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.345:44:13,8:15,6:17,12,8,7
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,5:6,1:1,8,0,6
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:6,6:8,6:4,10,1,12
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr3	191179303	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	191861797	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=103,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:17,3:16,0:17,16,2,1
chr3	192053274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:4,12:4,7:2,6,4,15
chr3	192445113	.	C	CCTCCTCCTCTCCTTCCCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	192980673	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=157,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr3	192980692	.	T	TGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=118,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:192980692_T_TGTA:192980692:3,1,1,0
chr3	192980694	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,24;MFRL=118,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:192980692_T_TGTA:192980692:3,1,1,0
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,10:0,0,16,14
chr3	193031875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,2:0,6:2,2,2,6
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr3	193069080	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:193069080_T_C:193069080:0,3,0,1
chr3	193069084	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:193069080_T_C:193069080:0,3,0,1
chr3	193069087	.	C	CTCACCTCCCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=207,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:193069080_T_C:193069080:0,3,0,1
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	193081864	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:7,1,4,0
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:4,0,7,1
chr3	193120359	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	193120726	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	193128900	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,17:0,7:0,0,5,19
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=111,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,5:3,0:0,4,2,4
chr3	193156427	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	193182715	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=94,81;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr3	193184017	.	ACTGCTAGCTCTTCCAAACCTCAACACTGCCTTTGTTTTTCTCTG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.508:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	193185128	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,6:4,3:9,2,2,7
chr3	193185335	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,97;MMQ=60,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	193207751	.	CATCCCACACAATA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	193272442	.	CGTGT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=GT;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,1:1,4:0,1,5,1
chr3	193336639	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=113,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,7:3,2:7,4,6,3
chr3	193355074	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:16,8:15,3:11,20,6,5
chr3	193355102	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.434:28:8,9:8,3:6,10,3,9
chr3	193361917	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr3	193363267	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,5:2,0,8,3
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:0,5,1,7
chr3	193374770	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:193374770_A_C:193374770:2,0,1,0
chr3	193374774	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:193374770_A_C:193374770:2,0,1,0
chr3	193384203	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=163,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:2,6,2,5
chr3	193385193	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=106,87;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,0:8,2:9,11,1,1
chr3	193385197	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:6,11,1,2
chr3	193385200	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,1:6,2:3,10,0,3
chr3	193385207	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=109,87;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:3,9,1,1
chr3	193385238	.	AA	TC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=25,21;MFRL=155,143;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.307:7:2,1:3,0:0|1:193385238_AA_TC:193385238:0,5,0,2
chr3	193385242	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=161,110;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:193385238_AA_TC:193385238:0,4,0,1
chr3	193385275	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	193386466	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:193386466_A_C:193386466:0,1,0,1
chr3	193386468	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:193386466_A_C:193386466:0,1,0,1
chr3	193386470	.	GA	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:193386466_A_C:193386466:0,1,0,1
chr3	193386475	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:193386466_A_C:193386466:0,1,0,1
chr3	193386479	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:193386466_A_C:193386466:0,0,0,1
chr3	193854148	.	TAAA	T,TA,TAA,TAAAAAA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=24,25,25,24,25;MFRL=98,153,120,105,119;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=17,18,18,20;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,19;RU=A;STR;TLOD=6.75,6.73,12.51,11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:20,4,6,13,12:0.078,0.113,0.206,0.225:55:8,2,4,5,3:6,2,2,6,6:11,9,27,8
chr3	194063153	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:4,1,5,4
chr3	194063300	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr3	194140710	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:5,0:13,4:1,17,0,4
chr3	194149700	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr3	194150803	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:10,7,1,1
chr3	194158148	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=114,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:19,0:23,4:23,19,1,3
chr3	194159484	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr3	194159705	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,17;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.297:12:3,0:6,1:3,6,1,2
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr3	194176675	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.058:49:29,0:18,2:0|1:194176675_C_T:194176675:19,28,1,1
chr3	194176677	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:27,0:17,2:0|1:194176675_C_T:194176675:19,28,1,1
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,12:0,15:0,0,3,24
chr3	194180479	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,0,2
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr3	194325006	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.611:29:6,5:5,12:3,8,7,11
chr3	194331803	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:194331803_T_TGG:194331803:0,4,0,1
chr3	194331804	.	T	TATGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:194331803_T_TGG:194331803:0,4,0,1
chr3	194331807	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:194331803_T_TGG:194331803:0,3,0,1
chr3	194344163	.	TTAACCC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,5,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,4,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr3	194369579	.	CC	AA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	194373832	.	TG	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,14:0,12:0,0,10,16
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,14:0,0,15,15
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,8,2
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,8:0,20:0,0,15,13
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,6,10
chr3	194408837	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	194947396	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	195006668	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	195027425	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0|1:195027425_T_A:195027425:0,2,0,1
chr3	195027428	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=114,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:195027425_T_A:195027425:0,2,0,1
chr3	195027430	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=116,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:195027425_T_A:195027425:0,1,0,1
chr3	195041343	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,3,0
chr3	195053795	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:14,4:17,0:16,15,3,1
chr3	195102590	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=132,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.241:17:5,2:4,2:6,7,3,1
chr3	195245771	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:7,5:6,7:13,1,10,2
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,25:0,15:0,0,29,12
chr3	195295704	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.380:6:3,1:1,1:0|1:195295704_G_GC:195295704:3,1,2,0
chr3	195295708	.	G	GGGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.382:6:1,1:1,1:0|1:195295704_G_GC:195295704:3,1,2,0
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	195447805	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=148,151;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:5,2:10,1,4,0
chr3	195447860	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=126,138;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:25,3:19,1:32,12,3,1
chr3	195447886	.	G	C	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,16:0.220:75:31,8:27,8:34,25,11,5
chr3	195451880	.	AG	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,27;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,12:0,4:0,0,9,7
chr3	195453064	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,52;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,5,6
chr3	195453077	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=144,68;MMQ=46,56;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.224:12:6,1:4,1:0|1:195453077_GC_G:195453077:4,6,1,1
chr3	195453081	.	TCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=147,68;MMQ=40,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.208:13:4,1:5,1:0|1:195453077_GC_G:195453077:4,7,1,1
chr3	195460193	.	G	GGACTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=109,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	195460200	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	195474159	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.455:26:8,6:6,4:7,7,7,5
chr3	195477713	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	195477715	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=130,157;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.636:6:1,1:0,1:2,0,4,0
chr3	195478012	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	195483971	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=106,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,4:5,0:6,9,4,0
chr3	195484244	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,4,18
chr3	195487737	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,4:0,11:0,0,11,4
chr3	195489669	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	195490284	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr3	195492338	.	G	GAGA	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=142,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:195492338_G_GAGA:195492338:1,4,1,1
chr3	195492340	.	G	GCT	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=142,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:195492338_G_GAGA:195492338:1,4,1,1
chr3	195492341	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=150,50;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:2,2:0|1:195492338_G_GAGA:195492338:1,5,1,1
chr3	195492349	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:195492338_G_GAGA:195492338:1,6,1,1
chr3	195492351	.	ATC	GAG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=157,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:195492338_G_GAGA:195492338:1,6,1,1
chr3	195493674	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=176,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr3	195497174	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,2,7
chr3	195505072	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:195505072_C_T:195505072:2,0,2,0
chr3	195505091	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:195505072_C_T:195505072:0,0,5,0
chr3	195505417	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	195506091	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=119,136;MMQ=36,36;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,2:4,6:0|1:195506091_A_C:195506091:6,4,0,8
chr3	195506099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=113,136;MMQ=30,36;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,0:3,3:0|1:195506091_A_C:195506091:7,5,0,6
chr3	195506189	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=16,30;MFRL=6061,92;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.963:30:0,13:0,15:1,0,14,15
chr3	195506258	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,7:0,0,12,14
chr3	195506483	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,62;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:195506483_T_G:195506483:0,0,0,3
chr3	195506485	.	TC	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,62;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:195506483_T_G:195506483:0,0,0,3
chr3	195506499	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,0;MMQ=60,29;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	195506753	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr3	195506775	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=78,4163;MMQ=40,29;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:9,1:3,1:6,7,1,1
chr3	195506826	.	AACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTAGTGACAGGAAGAGGCATGGTGTCACCTGTGGATACTGAGGAAGGGATGGTG	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,31;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.946:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr3	195507226	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=72,121;MMQ=21,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.854:18:0,9:2,6:0|1:195507226_A_G:195507226:1,1,7,9
chr3	195507242	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=114,92;MMQ=40,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,5:0.138:41:24,5:10,0:1|0:195507226_A_G:195507226:19,17,4,1
chr3	195507858	.	G	T	.	.	DP=150;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=88,91;MMQ=57,40;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,22:0.156:143:76,13:34,8:0|1:195507858_G_T:195507858:69,52,13,9
chr3	195507915	.	T	C	.	.	DP=125;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=108,98;MMQ=60,45;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:106,17:0.134:123:52,10:48,4:1|0:195507858_G_T:195507858:53,53,6,11
chr3	195508187	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=107,89;MMQ=40,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.103:35:15,1:9,2:0|1:195508187_C_T:195508187:17,15,2,1
chr3	195508190	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=107,89;MMQ=40,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.104:35:17,1:12,2:0|1:195508187_C_T:195508187:17,15,2,1
chr3	195508367	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=98,105;MMQ=52,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,43:0.369:114:41,21:27,14:33,38,20,23
chr3	195508402	.	G	T	.	.	DP=97;ECNT=8;MBQ=28,28;MFRL=106,82;MMQ=60,28;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,4:0.044:92:39,2:34,0:39,49,2,2
chr3	195508416	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=108,110;MMQ=60,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,10:0.152:70:25,5:24,5:25,35,1,9
chr3	195508418	.	C	G	.	.	DP=66;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=98,113;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,12:0.184:65:23,4:22,4:25,28,1,11
chr3	195508441	.	GCTGAGGAAGGGCTGGTGACATGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGCGTCGGTGACAAGAAGAGGAGTGGCGTGACCTGTGGATA	G	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=112,111;MMQ=48,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,7:0.178:46:10,3:13,2:16,23,2,5
chr3	195508489	.	GCTGAGGAAGCGTCGGTGACAAGAAGAGGAGTGGCGTGACCTGTGGATA	G	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=25,32;MFRL=87,127;MMQ=47,31;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:4,3:2,5:3,5,4,4
chr3	195508499	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=88,67;MMQ=51,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.734:7:1,3:1,2:0|1:195508499_C_T:195508499:0,2,1,4
chr3	195508505	.	TGACAAGAAGAGGAGTGGCGTGACCTGTG	T	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=21,25;MFRL=154,67;MMQ=49,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.724:7:0,2:1,2:0|1:195508499_C_T:195508499:2,0,1,4
chr3	195508537	.	ACT	A	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=19,28;MFRL=154,67;MMQ=49,43;MPOS=-1073741840;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.690:6:0,1:1,1:0|1:195508499_C_T:195508499:2,0,1,3
chr3	195509429	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,37;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,9:0,14:0,0,12,14
chr3	195509955	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=31,23;MFRL=160,112;MMQ=42,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,34:0.798:50:9,17:6,11:0|1:195509955_A_C:195509955:13,3,18,16
chr3	195509964	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=160,107;MMQ=42,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,35:0.904:47:7,20:4,12:0|1:195509955_A_C:195509955:11,1,18,17
chr3	195510022	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=111,100;MMQ=48,28;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,41:0.520:78:24,17:11,16:20,17,28,13
chr3	195510030	.	C	G	.	.	DP=83;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=100,26;MMQ=46,27;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,4:0.060:82:41,1:28,2:48,30,2,2
chr3	195510156	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=85,79;MMQ=46,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.281:35:11,1:11,6:10,15,4,6
chr3	195510277	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=125,133;MMQ=33,37;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:195510277_TC_T:195510277:0,2,0,1
chr3	195510279	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=125,133;MMQ=33,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:195510277_TC_T:195510277:0,2,0,1
chr3	195510301	.	TCACC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	195510762	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=116,87;MMQ=42,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,13:0.697:18:2,8:1,4:0|1:195510762_G_A:195510762:3,2,11,2
chr3	195510773	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=105,90;MMQ=42,38;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.556:20:3,5:3,3:0|1:195510762_G_A:195510762:5,4,9,2
chr3	195510775	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=105,117;MMQ=42,38;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.537:19:5,1:4,4:0|1:195510762_G_A:195510762:5,4,8,2
chr3	195510821	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=98,144;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,7:0.111:70:35,5:23,2:30,33,5,2
chr3	195510827	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=105,79;MMQ=51,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,28:0.333:83:34,12:17,12:26,29,13,15
chr3	195511142	.	T	C	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,136;MMQ=60,34;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,21:0.154:137:51,10:51,8:69,47,5,16
chr3	195511590	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,110;MMQ=49,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:1,10:0,9:0,1,14,7
chr3	195511668	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=111,91;MMQ=51,55;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,26:0.379:68:27,19:13,4:27,15,16,10
chr3	195511686	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=106,120;MMQ=49,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,6:0.099:63:36,4:18,1:32,25,4,2
chr3	195511814	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=78,87;MMQ=40,48;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.445:41:11,8:9,10:10,13,12,6
chr3	195512245	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,5,12
chr3	195512343	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=104,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,13:0.261:50:13,7:19,4:0|1:195512343_G_A:195512343:21,16,9,4
chr3	195512373	.	G	GGAT	.	.	DP=61;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=41.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,13:0.237:57:19,7:20,5:0|1:195512343_G_A:195512343:26,18,9,4
chr3	195512455	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=110,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,15:0.243:64:25,13:21,2:27,22,12,3
chr3	195513102	.	A	G	.	.	DP=169;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=112,110;MMQ=60,50;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,53:0.346:154:61,34:34,18:53,48,26,27
chr3	195513173	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=112,123;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,4:0.064:75:31,3:29,1:0|1:195513173_G_A:195513173:30,41,0,4
chr3	195513180	.	C	G	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=115,127;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,3:0.053:73:29,2:33,1:0|1:195513173_G_A:195513173:31,39,0,3
chr3	195513194	.	C	CTTTCTACAAGAGACT	.	.	DP=72;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=119,126;MMQ=60,38;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,2:0.041:70:27,2:29,0:0|1:195513173_G_A:195513173:31,37,0,2
chr3	195513207	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=118,134;MMQ=60,46;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,17:0.287:60:19,7:21,9:17,26,6,11
chr3	195513318	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=112,97;MMQ=48,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,18:0.298:61:20,5:22,12:16,27,12,6
chr3	195513345	.	A	C	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=100,101;MMQ=50,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,12:0.156:81:30,6:36,6:30,39,4,8
chr3	195513461	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=92,67;MMQ=40,49;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.069:69:34,3:27,1:41,24,2,2
chr3	195513474	.	T	G	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=23,29;MFRL=98,79;MMQ=40,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.105:69:33,3:21,3:39,23,4,3
chr3	195515295	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=140,86;MMQ=46,52;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.233:10:3,1:5,1:4,4,0,2
chr3	195515449	.	A	G,T	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=24,20,23;MFRL=76,88,98;MMQ=60,40,43;MPOS=22,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.26,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:52,21,4:0.270,0.053:77:21,10,4:22,6,0:23,29,12,13
chr3	195515518	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=106,43;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.172:45:16,4:21,3:19,19,5,2
chr3	195515550	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,7:4,5:4,7,3,9
chr3	195516630	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=204.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,37:0,32:0,0,35,34
chr3	195516980	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=95,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,4:5,4:4,7,7,1
chr3	195517637	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:24,4:17,0:0|1:195517637_A_T:195517637:22,21,4,0
chr3	195517639	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:23,4:18,0:0|1:195517637_A_T:195517637:22,21,4,0
chr3	195518112	.	T	TGTCTCCTGCGTAACA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=155.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,11:0,0,21,16
chr3	195518460	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=558,166;MMQ=47,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:195518460_A_C:195518460:2,0,0,1
chr3	195518463	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=558,166;MMQ=47,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:195518460_A_C:195518460:2,0,0,1
chr3	195538718	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=125,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.559:23:8,3:2,8:5,5,4,9
chr3	195594151	.	CCT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=101,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr3	195596972	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=88,103;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:9,0:16,4:11,16,0,4
chr3	195597060	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=82,265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,2:2,0:7,1,1,1
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:3,0,5,2
chr3	195779155	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=121,138;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:2,3:0|1:195782176_CA_TG:195782176:3,4,0,6
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=110,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,2:2,3:0|1:195782176_CA_TG:195782176:2,4,0,5
chr3	195789353	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=25,26;MFRL=159,123;MMQ=40,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:2,1:16,1:19,0,2,0
chr3	195789358	.	CGTG	C	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=150,125;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:3,0:18,1:0|1:195789358_CGTG_C:195789358:21,0,3,0
chr3	195789359	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=26,28;MFRL=148,162;MMQ=41,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:2,1:16,2:18,0,3,0
chr3	195789363	.	CAT	C	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=153,125;MMQ=40,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.158:23:2,0:16,3:0|1:195789358_CGTG_C:195789358:20,0,3,0
chr3	195789383	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=25,30;MFRL=141,127;MMQ=46,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:3,2:21,1:24,0,3,0
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,33:0.653:50:4,14:13,18:10,7,19,14
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=192.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,25:0,39:0,0,26,39
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=94,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.526:21:3,3:6,8:7,3,5,6
chr3	195792288	.	CGGGGG	C,CG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=109,154,106;MMQ=59,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,11;RU=G;STR;TLOD=6.90,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.402,0.300:7:0,2,0:0,1,2:2,0,5,0
chr3	195792298	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=154,109;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,12,4
chr3	195800811	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:2,8:2,3:3,2,7,4
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr3	195925263	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=117,45;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:10,1:8,12,1,1
chr3	195935207	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=187,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr3	195935254	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:17,2,2,0
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	195937410	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=98,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:1,1,2,0
chr3	195937545	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=106,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,4:5,0:8,7,2,2
chr3	195937977	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=67,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:4,1,3,1
chr3	195938177	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=110,105;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,1,3
chr3	195953775	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr3	195954049	.	A	ATGTGTTACCTTGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	195955868	.	A	AGTCCTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	195956827	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,13:0,0,10,10
chr3	195959859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=93,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr3	195959924	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,14,6
chr3	195974181	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr3	196044894	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,4:0,0:2,1,3,1
chr3	196051097	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:11,5,2,0
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,0,9
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr3	196088809	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.603:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr3	196088846	.	C	CGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:196088846_C_CGG:196088846:0,2,0,1
chr3	196088849	.	A	AAGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:196088846_C_CGG:196088846:0,2,0,1
chr3	196089084	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=157,166;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:2,0:0|1:196089084_TG_T:196089084:3,0,2,0
chr3	196089094	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=157,166;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:196089084_TG_T:196089084:3,0,2,0
chr3	196089100	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=116,166;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:196089084_TG_T:196089084:2,1,2,0
chr3	196096271	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:6,6:5,2:6,5,4,4
chr3	196096462	.	A	AGGACGGACAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	196118621	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=105,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:1,2:5,0,3,1
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:2,2,5,1
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	196215451	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.549:22:7,7:1,5:4,6,7,5
chr3	196281023	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.526:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	196281208	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.917:34:1,13:1,19:2,0,13,19
chr3	196438729	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,0:7,3:15,6,2,1
chr3	196532148	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:7,2:9,4:15,1,6,0
chr3	196541252	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,2,2
chr3	196547446	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:1,6,1,5
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,10:0,0,15,9
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr3	196627356	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,12:0,5:0,0,9,8
chr3	196664333	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	196664478	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,2:8,3:5,12,1,4
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr3	196674252	.	G	GCTGGCTGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:196674252_G_GCTGGCTGAC:196674252:0,0,1,1
chr3	196674256	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=184,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:196674252_G_GCTGGCTGAC:196674252:0,1,1,1
chr3	196674417	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=89,145;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:4,3,2,0
chr3	196675476	.	G	GGCAGTTTACTTGCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	196737687	.	A	ATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:1,4,1,1
chr3	196746426	.	TG	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr3	196746433	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:7,0,2,0
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr3	196750044	.	C	CTACAGCGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	196754819	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	196778348	.	T	TGGGCAGGTTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=161,105;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:196778348_T_TGGGCAGGTTAC:196778348:1,0,0,1
chr3	196778351	.	A	AAGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=161,105;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196778348_T_TGGGCAGGTTAC:196778348:1,0,0,1
chr3	196778352	.	T	TCACCAGGGGCAGAAAGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=161,105;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196778348_T_TGGGCAGGTTAC:196778348:1,0,0,1
chr3	196803365	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:5,0,3,0
chr3	196817822	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,157;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:27,0:27,3:30,24,0,3
chr3	196831962	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=138,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr3	197239266	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	197273204	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,2:10,0:14,4,2,0
chr3	197404487	.	CTTTAA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197404494	.	C	CTGATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197404498	.	GG	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197404501	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197404505	.	T	TCTTGCCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197404506	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:197404487_CTTTAA_C:197404487:0,3,0,1
chr3	197409386	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=116,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.198:29:7,0:8,3:14,10,0,5
chr3	197422933	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:197422933_T_A:197422933:0,1,0,1
chr3	197422935	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:197422933_T_A:197422933:0,1,0,1
chr3	197432063	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,2,2
chr3	197444965	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=121,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,1:12,2:10,14,3,0
chr3	197445097	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=111.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,23,10
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,19,7
chr3	197500394	.	T	TTTTG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=120,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr3	197500413	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=174,162;MMQ=60,32;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.304:7:1,2:3,0:0,5,0,2
chr3	197518114	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=182.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,48:0.980:48:0,29:0,15:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,0,26,22
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG	.	.	DP=49;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=182.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,48:0.980:48:0,23:0,5:0|1:197544200_C_CGTGTGTGTGTGT:197544200:0,0,26,22
chr3	197544233	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197544233_A_G:197544233:0,0,0,1
chr3	197544246	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:197544233_A_G:197544233:0,0,0,1
chr3	197544249	.	A	ACACACCATAATT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:197544233_A_G:197544233:0,0,0,1
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,15,7
chr3	197574936	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr3	197581147	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	197581374	.	T	TTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,1:6,1:0|1:197581374_T_TTTC:197581374:4,12,0,2
chr3	197581376	.	T	TGTTTGTTGGCTGCATAAATG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:0|1:197581374_T_TTTC:197581374:4,12,0,2
chr3	197597250	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=124,196;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr3	197616568	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:0|1:197616568_TC_T:197616568:4,8,0,2
chr3	197616577	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=128,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:10,0:2,2:0|1:197616568_TC_T:197616568:4,8,0,2
chr3	197703078	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=18,28;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:197703078_A_T:197703078:0,2,0,1
chr3	197703083	.	A	AAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:197703078_A_T:197703078:0,2,0,1
chr3	197703084	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197703078_A_T:197703078:0,1,0,1
chr3	197703086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197703078_A_T:197703078:0,1,0,1
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCA	G,GGCAGCAGCAGCA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=109,88,128;MMQ=43,60,37;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,15;RU=GCA;STR;TLOD=32.80,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,9,3:0.476,0.258:15:2,5,1:1,4,2:1,2,6,6
chr4	53310	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,3:7,0:7,1,1,2
chr4	53428	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr4	53446	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.318:11:3,1:2,2:1,7,0,3
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	59469	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=117,107;MMQ=60,29;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.145:60:20,3:32,5:18,34,1,7
chr4	60031	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=92,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.176:43:19,4:17,3:24,12,5,2
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=52.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,7:0,0,8,9
chr4	155258	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=128,164;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0|1:155258_T_C:155258:5,2,0,2
chr4	155262	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=128,164;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:2,1:4,0:0|1:155258_T_C:155258:5,2,0,2
chr4	265978	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=93,330;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:2,4,1,1
chr4	289139	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,84;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	289226	.	CCTGGGTGTTTGGCTACTGTCTCATGTATCTTCACTTTGTAGGGCTCCTTTCTTTGCTCCAGATAGATGACCAGGT	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=106,112;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.079:39:8,0:9,3:18,17,1,3
chr4	289273	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:11,2:8,0:0|1:289273_C_T:289273:9,10,1,1
chr4	289278	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=100,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:11,2:7,0:0|1:289273_C_T:289273:9,9,1,1
chr4	289287	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=93,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,1:6,0:0|1:289273_C_T:289273:8,8,1,1
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	338197	.	T	TGA	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=27,26;MFRL=106,147;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:6,1:0|1:338197_T_TGA:338197:10,11,1,1
chr4	338200	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=108,147;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,1:8,0:0|1:338197_T_TGA:338197:10,12,1,1
chr4	338201	.	ATC	A	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=26,25;MFRL=110,135;MMQ=60,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,1:7,0:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,2,1
chr4	338205	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=110,68;MMQ=60,48;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,1:9,1:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,1,1
chr4	338246	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=133,128;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.226:20:11,1:5,3:0|1:338246_G_A:338246:9,7,1,3
chr4	338252	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=133,128;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,1:5,3:0|1:338246_G_A:338246:9,7,1,3
chr4	338258	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=133,121;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:0|1:338246_G_A:338246:9,7,1,2
chr4	338260	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=24,33;MFRL=133,121;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,0:4,3:0|1:338246_G_A:338246:9,7,1,2
chr4	338266	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=159,111;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,1:4,3:5,6,1,3
chr4	437675	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.170:25:9,3:11,0:12,9,2,2
chr4	438082	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=95,85902;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:11,5,2,0
chr4	533132	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:533132_G_T:533132:0,0,0,1
chr4	533133	.	A	AATAGGCATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:533132_G_T:533132:0,0,0,1
chr4	658556	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=178,129;MMQ=38,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr4	658582	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=151,132;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr4	658601	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=143,132;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,2:2,0:5,3,2,0
chr4	666397	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:666397_T_A:666397:3,1,0,1
chr4	666406	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:666397_T_A:666397:1,1,0,1
chr4	672931	.	C	CCCAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	680048	.	C	CTCAGCCTGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,65;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.358:10:1,3:5,0:0|1:680048_C_CTCAGCCTGAA:680048:4,3,2,1
chr4	680050	.	T	TTTTCTTTCATTCAGGTCAGTTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=97,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:5,0:0|1:680048_C_CTCAGCCTGAA:680048:3,3,2,1
chr4	728012	.	G	GCCTTCGTTCGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=113,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:1,2,1,1
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,12,1
chr4	755233	.	T	TGAAAATCTTGTCAGCTGTTTCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=106,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	755267	.	A	AGGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=106,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr4	871402	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:3,4,3,0
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	946290	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:946290_G_A:946290:0,2,0,1
chr4	946298	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:946290_G_A:946290:0,2,0,1
chr4	946300	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,19;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:946290_G_A:946290:0,2,0,1
chr4	952217	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,11;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:952217_A_C:952217:0,0,1,0
chr4	952227	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:952217_A_C:952217:0,0,1,0
chr4	952230	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:952217_A_C:952217:0,0,1,0
chr4	960380	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:960380_G_T:960380:0,0,0,1
chr4	960382	.	AG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:960380_G_T:960380:0,0,0,1
chr4	982571	.	G	GTAAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=95,88;MMQ=59,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:982571_G_GTAAGCCA:982571:0,1,1,0
chr4	982574	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=95,88;MMQ=59,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:982571_G_GTAAGCCA:982571:0,1,1,0
chr4	982577	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:982571_G_GTAAGCCA:982571:0,0,1,0
chr4	982578	.	G	GACCCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:982571_G_GTAAGCCA:982571:0,0,1,0
chr4	997502	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	1018791	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr4	1019076	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=73,28;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:5,3:20,1:0|1:1019076_T_A:1019076:9,20,3,1
chr4	1019078	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=73,28;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:7,2:21,1:0|1:1019076_T_A:1019076:9,20,3,1
chr4	1019083	.	C	CAA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=74,55;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:11,2:21,0:11,25,2,1
chr4	1067032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	1102224	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=109,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:2,7,0,2
chr4	1161471	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1161471_G_C:1161471:1,0,0,1
chr4	1161480	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1161471_G_C:1161471:0,0,0,1
chr4	1164378	.	AGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr4	1209840	.	G	GAGAGAAAGCACTAGATAAATA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:5,9,1,1
chr4	1244842	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	1246500	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:3,8:4,1:4,3,7,3
chr4	1321556	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1330759	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=78,66;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	1345647	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=117,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:3,4:2,1:3,2,2,4
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	1373848	.	CA	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	1374774	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	1374789	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	1388860	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,29;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1388860_C_T:1388860:0,1,1,0
chr4	1388883	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=112,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1388860_C_T:1388860:0,1,1,0
chr4	1657337	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1657337_GA_G:1657337:0,1,0,1
chr4	1657340	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1657337_GA_G:1657337:0,1,0,1
chr4	1657344	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1657337_GA_G:1657337:0,1,0,1
chr4	1725071	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,1:4,2:6,0,4,0
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	1725685	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=204,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr4	1732695	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,3,5
chr4	1732734	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:1,0:3,2:0,4,1,2
chr4	1733036	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,2,0
chr4	1737404	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	1741325	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1741534	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	1801205	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=89,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:1801205_C_T:1801205:0,2,0,1
chr4	1801212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=1014862,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:1801205_C_T:1801205:0,3,0,1
chr4	1807119	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:1807119_G_A:1807119:2,0,1,0
chr4	1807125	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:1807119_G_A:1807119:2,0,1,0
chr4	1808294	.	C	CCCCACACCCTGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr4	1818594	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr4	1818710	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	1818725	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=166,178;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1818725_T_G:1818725:0,1,0,1
chr4	1818732	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=166,178;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1818725_T_G:1818725:0,1,0,1
chr4	1818736	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=166,178;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1818725_T_G:1818725:0,1,0,1
chr4	1818740	.	AGGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=166,178;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1818725_T_G:1818725:0,1,0,1
chr4	1824016	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=106,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,2,2
chr4	1906110	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=112,135;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.382:14:2,0:5,5:4,5,0,5
chr4	1906167	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=73,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1906167_C_A:1906167:0,1,0,1
chr4	1906169	.	G	GCATTTACTCAGATGT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=112,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	1906181	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1906167_C_A:1906167:0,0,0,1
chr4	1906190	.	AAA	TTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1906167_C_A:1906167:0,0,0,1
chr4	1940317	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=121,18116638;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,0,2
chr4	1952977	.	G	GCGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1952977_G_GCGC:1952977:0,1,0,1
chr4	1952982	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1952977_G_GCGC:1952977:0,0,0,1
chr4	1955019	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=110,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:4,5,2,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr4	1962800	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=112,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:13,1:6,5:7,12,0,6
chr4	2065603	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=90,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,1,1
chr4	2074751	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr4	2173015	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	2178018	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:3,2,3,3
chr4	2209815	.	C	CATAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=AT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:2209815_C_CATAT:2209815:3,4,1,1
chr4	2209818	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:2209815_C_CATAT:2209815:3,4,1,1
chr4	2209819	.	C	CTTTGATG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:2209815_C_CATAT:2209815:3,4,1,1
chr4	2242593	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2322029	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:2322029_AG_CT:2322029:0,2,1,0
chr4	2322039	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:2322029_AG_CT:2322029:0,0,1,2
chr4	2322048	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:2322029_AG_CT:2322029:0,2,1,0
chr4	2339290	.	G	GCAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	2343150	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0|1:2513620_G_A:2513620:0,0,4,2
chr4	2513624	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:2513620_G_A:2513620:0,0,4,2
chr4	2514943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:2514943_G_A:2514943:0,1,0,1
chr4	2514949	.	T	TTCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2514943_G_A:2514943:0,1,0,1
chr4	2514953	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2514943_G_A:2514943:0,1,0,1
chr4	2664944	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=63,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr4	2674027	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=113,159;MMQ=60,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.172:33:14,0:14,5:0|1:2674027_C_T:2674027:10,18,0,5
chr4	2674034	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=113,159;MMQ=60,21;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:13,0:10,5:0|1:2674027_C_T:2674027:9,17,0,5
chr4	2701499	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=116,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:10,4:11,0:12,10,3,1
chr4	2717690	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	2746285	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	2746307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	2746322	.	CTC	AAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=54,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr4	2834145	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:0,3,2,1
chr4	2834215	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2834228	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2834228_C_T:2834228:0,0,0,1
chr4	2834231	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2834228_C_T:2834228:0,0,0,1
chr4	2834249	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2877924	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	2906453	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=93,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:2906453_T_G:2906453:1,3,3,1
chr4	2906475	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:5,2:2,0:1|0:2906453_T_G:2906453:5,3,1,1
chr4	2906477	.	T	TAATTTTACA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:5,2:2,0:1|0:2906453_T_G:2906453:5,3,1,1
chr4	2916698	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:3,0,0,1
chr4	2916762	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=110,103;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:2,1,2,6
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:1,1,1,2
chr4	2935251	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=132,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,3:1,4:2,1,5,2
chr4	2951804	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:1,7,6,4
chr4	2951872	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=127,62;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:0|1:2951872_G_T:2951872:4,8,1,1
chr4	2951878	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=127,62;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:2951872_G_T:2951872:4,8,1,1
chr4	2951880	.	GG	TC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=127,62;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:6,2:0|1:2951872_G_T:2951872:3,9,1,1
chr4	2951884	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=123,62;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:2951872_G_T:2951872:3,9,1,1
chr4	2955192	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=52,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr4	2965676	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:2965676_C_T:2965676:0,0,1,1
chr4	2965695	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:2965676_C_T:2965676:0,0,1,1
chr4	2990375	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3009599	.	ACA	GGG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=152,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:4,2:0,8,1,1
chr4	3009610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr4	3009623	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr4	3015469	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=92,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.307:7:3,1:2,0:1,4,0,2
chr4	3015484	.	A	AGTTACTGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr4	3015496	.	G	GAAAGAAAGAGAGAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=46,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:0,0:1,0:0,2,0,1
chr4	3024044	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr4	3029588	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	3109222	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr4	3109239	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr4	3109241	.	G	GTTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=189,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr4	3117936	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:7,5,2,0
chr4	3123166	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.245:6:0,1:5,0:0|1:3123166_T_C:3123166:2,3,0,1
chr4	3123169	.	T	TTCTCCTTTCTGA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,1:5,0:0|1:3123166_T_C:3123166:2,3,0,1
chr4	3123171	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,1:5,0:0|1:3123166_T_C:3123166:2,3,0,1
chr4	3123233	.	C	CGGGCACAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	3129265	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:6,3,3,0
chr4	3129383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	3132251	.	GCCTTTAAATTTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	3142441	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,1,1
chr4	3142443	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,1,1
chr4	3142445	.	TT	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,1,1
chr4	3142448	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,1,1
chr4	3142452	.	TT	GA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,0,1
chr4	3142456	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,23;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3142441_T_A:3142441:0,2,0,1
chr4	3176855	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3176855_A_C:3176855:0,1,0,1
chr4	3176856	.	T	TGTTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3176855_A_C:3176855:0,1,0,1
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,2,3
chr4	3188276	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,1,1
chr4	3214426	.	C	CTGCAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=114,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,3:2,0:2,3,2,1
chr4	3215919	.	T	TCTCCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	3216815	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=105,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr4	3235014	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=125,50;MMQ=60,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:2,2,1,2
chr4	3240155	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:3240155_C_A:3240155:0,0,1,0
chr4	3240159	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3240155_C_A:3240155:0,0,1,0
chr4	3240526	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	3240609	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:3240609_T_TC:3240609:2,0,0,1
chr4	3240611	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,21;MFRL=131,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3240609_T_TC:3240609:2,0,0,1
chr4	3255234	.	C	CACGTCCCCCCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=127,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr4	3255258	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr4	3265710	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:5,1:0,3:0,6,2,2
chr4	3318413	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr4	3319359	.	G	GAGCTCAGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	3427327	.	G	GCATGTGTGATGGCCTAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=83,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr4	3427348	.	G	GAGGAGAATGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	3446284	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3446284_G_C:3446284:0,0,1,0
chr4	3446292	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3446284_G_C:3446284:0,0,1,0
chr4	3446324	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	3447708	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3449663	.	C	CAGCCGCCTCCCAGGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr4	3451179	.	C	CATGTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=123,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr4	3451246	.	C	CCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	3475252	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	3487235	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=19,26;MFRL=55,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:0,1:0|1:3487235_A_G:3487235:0,2,2,0
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=22,32;MFRL=83,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,1:1,1:0|1:3487235_A_G:3487235:0,3,2,0
chr4	3487241	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=83,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,1:1,0:0|1:3487235_A_G:3487235:0,3,2,0
chr4	3487258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=92,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:2,1:2,1:0|1:3487235_A_G:3487235:1,3,2,1
chr4	3494898	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	3516448	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	3516742	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	3769815	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3769815_ATG_A:3769815:0,0,1,0
chr4	3769819	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3769815_ATG_A:3769815:0,0,1,0
chr4	3770309	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=118,74;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:7,3:2,10:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:9,0,13,1
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=118,74;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,14:0.600:23:7,4:2,10:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:9,0,13,1
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=118,61;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,17:0.643:26:7,4:2,11:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:9,0,13,4
chr4	4190595	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=101,129;MMQ=46,21;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:5,5,1,2
chr4	4190683	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=110,101;MMQ=60,27;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.381:16:5,3:5,3:3,7,2,4
chr4	4198948	.	GCGTTGC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,3:4,3:4,7,5,1
chr4	4198975	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=124,127;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:8,0:12,3:8,12,2,1
chr4	4199823	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=137,85;MMQ=54,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4199823_AT_A:4199823:0,1,0,1
chr4	4199825	.	CTAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=137,85;MMQ=54,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4199823_AT_A:4199823:0,1,0,1
chr4	4199832	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=137,85;MMQ=54,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4199823_AT_A:4199823:0,1,0,1
chr4	4214634	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=81,96;MMQ=52,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:6,7,0,3
chr4	4241953	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	4242038	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr4	4242163	.	TT	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=101,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:1,0:5,2:0|1:4242163_TT_AG:4242163:4,2,1,1
chr4	4242165	.	G	GAAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=101,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:1,0:4,2:0|1:4242163_TT_AG:4242163:4,2,1,1
chr4	4242167	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=88,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:4242163_TT_AG:4242163:3,2,1,1
chr4	4249414	.	AT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	4276445	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:0|1:4276445_G_T:4276445:6,12,1,1
chr4	4276455	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,2:0|1:4276445_G_T:4276445:5,12,1,1
chr4	4276456	.	G	GCGCCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=121,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:4276445_G_T:4276445:5,12,1,1
chr4	4276475	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:0,3,4,4
chr4	4304337	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr4	4422558	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr4	4864876	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,6:0,0,1,9
chr4	5018931	.	G	GCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5018931_G_GCA:5018931:0,2,0,1
chr4	5018932	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5018931_G_GCA:5018931:0,2,0,1
chr4	5053674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr4	5400067	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	5400070	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:5400070_A_ATT:5400070:0,0,0,1
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chr4	5564502	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	5567162	.	C	CCGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=187,191;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:5567162_C_CCGA:5567162:0,3,0,1
chr4	5567165	.	A	AAGGTGGATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=187,191;MMQ=52,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:5567162_C_CCGA:5567162:0,3,0,1
chr4	5567172	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=187,196;MMQ=52,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5567172_CA_TG:5567172:0,1,0,1
chr4	5567185	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=187,196;MMQ=52,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5567172_CA_TG:5567172:0,1,0,1
chr4	5577884	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
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chr4	5633682	.	C	CTGGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:5633678_GT_TA:5633678:2,1,1,1
chr4	5642378	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr4	5667427	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5667427_T_C:5667427:0,0,0,1
chr4	5667433	.	G	GCTGAAGTGCAGTGGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5667427_T_C:5667427:0,0,0,1
chr4	5687256	.	CG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5687256_CG_AA:5687256:0,0,0,1
chr4	5687263	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5687256_CG_AA:5687256:0,0,0,1
chr4	5691102	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:5691102_T_TG:5691102:0,2,1,1
chr4	5691103	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:5691102_T_TG:5691102:0,2,1,1
chr4	5691109	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:5691102_T_TG:5691102:0,2,0,1
chr4	5691112	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:5691102_T_TG:5691102:0,2,0,1
chr4	5721176	.	T	TTCACTAGATGGGACAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr4	5747106	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1,1,0,3
chr4	5747131	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	5749784	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:5749784_G_A:5749784:0,0,1,0
chr4	5749804	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:5749784_G_A:5749784:0,0,1,0
chr4	5750052	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:5750052_G_T:5750052:0,3,0,1
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chr4	5750058	.	AA	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=161,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:5750052_G_T:5750052:0,3,0,1
chr4	5754592	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,0:9,2:11,4,1,1
chr4	5795507	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=185,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5795507_G_C:5795507:0,1,0,1
chr4	5795512	.	C	CCAACAGTGTTTATTAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=185,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5795507_G_C:5795507:0,1,0,1
chr4	5795514	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=185,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5795507_G_C:5795507:0,1,0,1
chr4	5795517	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=185,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:5795507_G_C:5795507:0,1,0,1
chr4	5799010	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,0:0,7:0,0,1,6
chr4	5838587	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=186,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr4	5857850	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,3,2
chr4	5889887	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	5966939	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5966939_A_T:5966939:0,0,0,1
chr4	5966942	.	C	CCCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5966939_A_T:5966939:0,0,0,1
chr4	5969108	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5969108_C_T:5969108:0,0,1,0
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5969108_C_T:5969108:0,0,1,0
chr4	5969235	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5969252	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5975337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr4	5990177	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=110,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5990177_C_G:5990177:0,1,0,1
chr4	5990179	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,27;MFRL=110,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:5990177_C_G:5990177:0,1,0,1
chr4	6028031	.	G	GTGATCT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,1:4,1:0|1:6028031_G_GTGATCT:6028031:0,8,0,2
chr4	6028032	.	AGG	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=99,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,1:0|1:6028031_G_GTGATCT:6028031:0,8,0,2
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chr4	6062241	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr4	6288800	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:6288800_T_G:6288800:4,2,0,2
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chr4	6288805	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:6288800_T_G:6288800:4,2,0,2
chr4	6288807	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:6288800_T_G:6288800:4,2,0,2
chr4	6288809	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:6288800_T_G:6288800:4,2,0,2
chr4	6292909	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=66,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:6292909_C_T:6292909:1,2,1,1
chr4	6292915	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=66,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:6292909_C_T:6292909:1,2,1,1
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chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	6382748	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6382748_G_A:6382748:0,1,0,1
chr4	6382763	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6382748_G_A:6382748:0,1,0,1
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=86,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:6578487_A_G:6578487:0,1,0,4
chr4	6578488	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:6578487_A_G:6578487:0,4,0,1
chr4	6578489	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:6578487_A_G:6578487:0,4,0,1
chr4	6580283	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	6595058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr4	6602516	.	AG	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	6642641	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:4,7:2,6:2,4,8,5
chr4	6717926	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6717926_G_A:6717926:0,0,0,1
chr4	6717933	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6717926_G_A:6717926:0,0,0,1
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr4	6865957	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6865957_T_TGC:6865957:0,0,0,1
chr4	6865961	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6865957_T_TGC:6865957:0,0,0,1
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr4	6969160	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	6989003	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	7002780	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	7027080	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:7027080_C_T:7027080:0,1,0,2
chr4	7027084	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:7027080_C_T:7027080:0,1,0,2
chr4	7043264	.	CGA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=107,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,2:6,0:0|1:7043264_CGA_C:7043264:5,9,0,2
chr4	7043267	.	T	TCC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=107,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,2:6,0:0|1:7043264_CGA_C:7043264:5,9,0,2
chr4	7044114	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=109,44;MMQ=60,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:7044114_C_G:7044114:6,3,1,1
chr4	7044118	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=109,44;MMQ=60,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:2,2:0|1:7044114_C_G:7044114:6,3,1,1
chr4	7044124	.	T	TGTCCCACCCAAGGAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=113,44;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:7044114_C_G:7044114:3,3,1,1
chr4	7044357	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,2
chr4	7044380	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,2
chr4	7056281	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:3,1,1,2
chr4	7064212	.	G	GAGATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,173;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:7064212_G_GAGATTT:7064212:0,0,0,1
chr4	7064217	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:7064212_G_GAGATTT:7064212:0,0,0,2
chr4	7064258	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=173,141;MMQ=58,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7064258_G_A:7064258:0,1,0,1
chr4	7064261	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=173,141;MMQ=58,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:7064258_G_A:7064258:0,1,0,1
chr4	7064272	.	T	TTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7064258_G_A:7064258:0,0,0,1
chr4	7065929	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,69;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:8,10,2,1
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr4	7194835	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7434988_A_G:7434988:0,0,1,0
chr4	7435010	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7434988_A_G:7434988:0,0,1,0
chr4	7435540	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,0,2
chr4	7533383	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7533383_A_G:7533383:0,0,1,0
chr4	7533388	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7533383_A_G:7533383:0,0,1,0
chr4	7640249	.	C	CCCGGTCACTGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	7656048	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,3:3,0:3,1,3,1
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:7691193_G_C:7691193:0,0,2,2
chr4	7691200	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:7691193_G_C:7691193:1,2,1,0
chr4	7691224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=32,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7691193_G_C:7691193:2,2,1,0
chr4	7705198	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	7716932	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr4	7717012	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr4	7726847	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr4	7728658	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,1:3,7:1,3,7,1
chr4	7738730	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	7741851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:7741851_A_G:7741851:0,0,1,0
chr4	7741861	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7741851_A_G:7741851:0,0,1,0
chr4	7795653	.	AACATGAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	7840341	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:7,8,0,3
chr4	7845006	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,0:2,6:1,3,0,6
chr4	7870439	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr4	7985361	.	CTG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7985361_CTG_C:7985361:0,0,0,1
chr4	7985364	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7985361_CTG_C:7985361:0,0,0,1
chr4	7985367	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:7985361_CTG_C:7985361:0,0,0,1
chr4	8007051	.	AC	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:8007051_AC_GT:8007051:4,2,1,1
chr4	8007054	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=100,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:8007051_AC_GT:8007051:4,2,1,1
chr4	8009696	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8009696_G_A:8009696:1,0,1,0
chr4	8009705	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8009696_G_A:8009696:1,0,1,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	8031306	.	AAAAAACT	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=111,78;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr4	8031335	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=119,89;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.273:15:2,1:3,0:0|1:8031335_G_A:8031335:1,10,3,1
chr4	8031341	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=115,75;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:3,1:8,0:0|1:8031335_G_A:8031335:2,10,2,1
chr4	8034497	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,1,2
chr4	8046856	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:0,0:2,1:0|1:8046856_C_T:8046856:2,1,1,0
chr4	8046869	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:8046856_C_T:8046856:1,2,1,0
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=111,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,1:3,1:4,9,0,2
chr4	8207083	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,4:0,4:0,0,3,7
chr4	8207139	.	T	TTGGGAGGCCAAGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=114,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8207154_C_T:8207154:0,0,0,1
chr4	8207170	.	CT	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8207154_C_T:8207154:0,0,0,1
chr4	8207173	.	A	ATCCACCAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8207154_C_T:8207154:0,0,0,1
chr4	8207179	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,19;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:8207154_C_T:8207154:0,0,0,1
chr4	8214425	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=75,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	8217829	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1,0,4,1
chr4	8218795	.	A	AAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:8218795_A_AAG:8218795:2,0,0,1
chr4	8218798	.	C	CCCTGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8218795_A_AAG:8218795:2,0,0,1
chr4	8220105	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:2,6,3,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	8230280	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=68,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	8237311	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=250,82;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	8239402	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=135,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:8239402_G_C:8239402:4,3,1,1
chr4	8239406	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=140,38;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:8239402_G_C:8239402:4,2,1,1
chr4	8239410	.	GGG	TAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=140,38;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:8239402_G_C:8239402:4,2,1,1
chr4	8284084	.	TC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,773;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8284084_TC_CT:8284084:0,0,1,0
chr4	8284089	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,773;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8284084_TC_CT:8284084:0,0,1,0
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	8293974	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	8304097	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	8306028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	8398787	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=119,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:5,2,2,0
chr4	8415982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,2,1
chr4	8588950	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=92,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,3:0,1:0,1,2,3
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	8607928	.	C	CAAAGGGCATGAACTTCCCGAGGCCCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8609248	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	9784775	.	GTGCAGCCACTTCTGCTCCCGC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:9784775_GTGCAGCCACTTCTGCTCCCGC_G:9784775:1,2,1,1
chr4	9784798	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:9784775_GTGCAGCCACTTCTGCTCCCGC_G:9784775:1,2,1,1
chr4	9785134	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr4	9785265	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,127;MMQ=52,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,2,2
chr4	9889295	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=107,116;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:9,0:5,5:0|1:9889295_A_AT:9889295:5,9,0,5
chr4	9889298	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=107,116;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:9,0:4,4:0|1:9889295_A_AT:9889295:5,9,0,5
chr4	9892405	.	T	TCATCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	9909850	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=99,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,4:3,5:1,2,5,4
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,0:6,6:4,7,5,1
chr4	9982213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,0:9,4:6,7,1,3
chr4	9982285	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,0:2,3:1,3,2,1
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	10027445	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145378797;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	10080497	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=113,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr4	10086015	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	10099277	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	10446385	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,1:3,1:4,2,1,2
chr4	10502930	.	G	GTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:10502930_G_GTA:10502930:3,0,1,1
chr4	10502931	.	G	GCACTGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=154,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:2,0:1,2:0|1:10502930_G_GTA:10502930:3,0,1,1
chr4	10502937	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	10515007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	10527511	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,28713214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:0,2:8,0:5,3,0,2
chr4	10542058	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr4	10544032	.	G	GCCTGTGTTGATGACGTTCCCTGCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	10573509	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10573509_TA_T:10573509:0,0,0,1
chr4	10573512	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10573509_TA_T:10573509:0,0,0,1
chr4	10573516	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:10573509_TA_T:10573509:0,0,0,1
chr4	10669522	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=101,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,3,3
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	13579326	.	C	CCAACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13579326_C_CCAACA:13579326:0,1,0,1
chr4	13579327	.	T	TGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13579326_C_CCAACA:13579326:0,1,0,1
chr4	13579329	.	G	GAAACCCCGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:13579326_C_CCAACA:13579326:0,1,0,1
chr4	13581496	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr4	13582680	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=127,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:4,0:4,3:6,7,0,3
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	13589436	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:5,9,1,1
chr4	13589495	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	13601337	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	13603835	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13603835_G_A:13603835:0,0,0,1
chr4	13603837	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:13603835_G_A:13603835:0,0,0,1
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr4	13615380	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=196,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13615380_T_TA:13615380:0,1,0,1
chr4	13615382	.	T	TGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=196,257;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13615380_T_TA:13615380:0,1,0,1
chr4	13615385	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=196,257;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:13615380_T_TA:13615380:0,1,0,1
chr4	13617012	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,4:7,1:5,6,2,3
chr4	15005517	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:15005517_C_T:15005517:1,0,1,0
chr4	15005526	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:15005517_C_T:15005517:2,0,1,0
chr4	15341708	.	C	CATATCAGGGTTTATTTTTTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	15443888	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:4,3,3,0
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr4	15513147	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15530171	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=170,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	15539779	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:3,4,1,1
chr4	15542651	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15542651_T_TGC:15542651:0,3,0,1
chr4	15542654	.	TAG	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:15542651_T_TGC:15542651:0,4,0,1
chr4	15542670	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=25,32;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr4	15542672	.	T	A,G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=29,24,31;MFRL=194,126,213;MMQ=60,60,60;MPOS=4,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,0:1,1,1:0,4,0,2
chr4	15542682	.	G	GTCTATAATC	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=199,120;MMQ=60,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	15542685	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,25;MFRL=197,120;MMQ=60,23;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15542685_T_A:15542685:0,3,0,1
chr4	15542687	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=197,120;MMQ=60,23;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15542685_T_A:15542685:0,3,0,1
chr4	15542709	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	15542733	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	15562297	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15587886	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr4	15629409	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	15632228	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	15640319	.	T	TCCTCTTCCTCTTTC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr4	15689632	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,10:0,0,17,16
chr4	15691489	.	TGTA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTA;STR;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:12,3:8,3:10,12,4,2
chr4	15691846	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:15691846_T_G:15691846:12,2,0,2
chr4	15691849	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:15691846_T_G:15691846:12,2,0,2
chr4	15692058	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	15704774	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr4	15706466	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.685:7:1,4:0,0:2,0,4,1
chr4	15706502	.	G	GTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,1:0,0,3,4
chr4	15716961	.	A	ATGTCTATAGAGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	15938131	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=109,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,3:8,0:8,12,0,3
chr4	15938165	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=107,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:2,12,0,3
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15964825	.	A	ACTAGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	15972549	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	15981045	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:2,2,0,4
chr4	15982057	.	T	TTACAACAAGACTTCATCAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:3,10,0,2
chr4	15985984	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=101,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,3:1,4:1,0,4,3
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,0,0,1
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.895:7:0,0:0,1:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,0,6,1
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	16025030	.	A	ACTTCCAGCACCACCGTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,20;MFRL=85,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:16025030_A_ACTTCCAGCACCACCGTTTC:16025030:1,0,1,1
chr4	16025032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=85,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:16025030_A_ACTTCCAGCACCACCGTTTC:16025030:1,0,1,1
chr4	16025837	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	16026028	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	16026061	.	AA	CG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	16168246	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr4	16204266	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16204266_T_TAAA:16204266:0,1,0,1
chr4	16204267	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:16204266_T_TAAA:16204266:0,1,0,1
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr4	16510319	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr4	16513748	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=86,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,2,2
chr4	16590553	.	T	TCACAGGTTGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr4	17528576	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:17528576_G_A:17528576:1,3,1,0
chr4	17528585	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:17528576_G_A:17528576:0,3,1,0
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:3,4:4,4:2,5,1,7
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr4	17585327	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr4	17597229	.	ATAT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17597229_ATAT_A:17597229:0,1,0,1
chr4	17597235	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17597229_ATAT_A:17597229:0,1,0,1
chr4	17598840	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,7:0,8:1,1,10,5
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17634255_G_A:17634255:0,2,0,1
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17634255_G_A:17634255:0,2,0,1
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	17649494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:17649494_T_C:17649494:0,0,0,2
chr4	17649498	.	G	GGTGCAAGAACAGAGCACCA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,0,0,1
chr4	17649500	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,0,0,1
chr4	17649503	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,0,0,1
chr4	17649505	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,0,0,1
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,94;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,3:1,3:1,0,3,3
chr4	17666297	.	GA	AC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=17,25;MFRL=91,155;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:1,2:2,5,0,2
chr4	17666341	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=194,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	17689974	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	17694880	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr4	17694916	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:4,2,2,2
chr4	17694943	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,1,2
chr4	17706876	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17706876_G_A:17706876:0,0,0,1
chr4	17706878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17706876_G_A:17706876:0,0,0,1
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	17841465	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	17841727	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=103,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:9,0:15,2:0|1:17841727_G_A:17841727:11,13,1,1
chr4	17841734	.	T	TACTTCAAATAAGTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:17841727_G_A:17841727:11,5,1,1
chr4	17843921	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=117,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:5,2,3,1
chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.665:7:2,3:0,2:0,2,2,3
chr4	20258450	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20258450_C_T:20258450:0,0,0,1
chr4	20258451	.	TGA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20258450_C_T:20258450:0,0,0,1
chr4	20258454	.	TGACA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20258450_C_T:20258450:0,0,0,1
chr4	20259621	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,0,1,1
chr4	20259622	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,1:1,0:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,0,1,1
chr4	20482407	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=97,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:6,3,0,2
chr4	20490631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:20490631_A_G:20490631:0,4,0,1
chr4	20490639	.	TATTGTATCC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:20490631_A_G:20490631:0,3,0,1
chr4	20512232	.	ATA	CCT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20512232_ATA_CCT:20512232:0,1,0,1
chr4	20512239	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20512232_ATA_CCT:20512232:0,1,0,1
chr4	20512241	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20512232_ATA_CCT:20512232:0,1,0,1
chr4	20512243	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20512232_ATA_CCT:20512232:0,1,0,1
chr4	20512246	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=147,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:20512232_ATA_CCT:20512232:0,1,0,1
chr4	20512701	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	20533700	.	A	ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,3:7,6:3,6,5,5
chr4	20544286	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:20544286_C_A:20544286:0,1,0,2
chr4	20544289	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:20544286_C_A:20544286:0,1,0,2
chr4	20550805	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20550805_G_T:20550805:0,1,0,1
chr4	20550807	.	T	TTTTAGACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:20550805_G_T:20550805:0,1,0,1
chr4	20569099	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr4	20569254	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:0|1:20569254_A_G:20569254:0,3,2,5
chr4	20569259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:0|1:20569254_A_G:20569254:0,3,2,5
chr4	20569284	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	20597472	.	GAATAAGACCTAGTGTTC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=113,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.469:3:2,0:0,1:1,1,0,1
chr4	20619329	.	G	GGAAGCTTTTAGCAGATGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	20706067	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.242:17:3,1:5,2:7,6,3,1
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=98,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	20736420	.	C	CAAACAAACCAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr4	20736425	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	20751266	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=70,102;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:2,4,2,0
chr4	20751278	.	AG	GA,GG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31,30;MFRL=0,102,79;MMQ=60,50,60;MPOS=26,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.40,26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.214,0.714:11:0,2,8:0,0,1:0,0,7,4
chr4	20852291	.	C	CCCATGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	22394343	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=65,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:3,1:0,0:0|1:22394343_GA_G:22394343:1,2,0,1
chr4	22394345	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:2,2:0,0:0|1:22394345_A_C:22394345:0,2,1,1
chr4	22394348	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:2,1:0,0:0|1:22394345_A_C:22394345:0,2,1,1
chr4	22394350	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,18;MFRL=94,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:22394343_GA_G:22394343:0,2,0,1
chr4	22403113	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:22403113_T_TG:22403113:0,3,0,1
chr4	22403114	.	T	TGGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:22403113_T_TG:22403113:0,3,0,1
chr4	22403116	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:22403113_T_TG:22403113:0,3,0,1
chr4	22403119	.	A	ACCCAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=111,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:22403113_T_TG:22403113:0,3,0,1
chr4	22403123	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:22403113_T_TG:22403113:1,3,0,1
chr4	22414994	.	GGTATCTACATT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	22415451	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	22422768	.	A	AAACATATTTGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	22440099	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	22749383	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	22820576	.	GTCTGCTTTTGGAAAGGAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=113,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.511:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	23814707	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr4	23815721	.	A	AAAATTGGTTTGGATATTTGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,1,1
chr4	23816242	.	TAAAAAAA	T,TAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26,10;MFRL=59,137,130;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,10,15;RU=A;STR;TLOD=3.02,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.219,0.391:5:1,1,0:1,0,0:0,2,0,3
chr4	23816258	.	A	ATTAGCTGGGCAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	23825856	.	A	AAACCCACACTCACCCTCAGCCAGGTCCAGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,1,1
chr4	23830238	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,1:1,10:1,2,2,9
chr4	24521998	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24522000	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24522002	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24522003	.	T	TCTCC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24522005	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24522008	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24521998_G_A:24521998:0,0,0,1
chr4	24541990	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24541990_T_A:24541990:0,0,0,1
chr4	24541992	.	TT	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24541990_T_A:24541990:0,0,0,1
chr4	24541995	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24541990_T_A:24541990:0,0,0,1
chr4	24578376	.	G	GCATCATTAAAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	24801110	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	24801315	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	24802168	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=110,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	24802182	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:24802182_C_CT:24802182:0,3,0,1
chr4	24802185	.	A	ATTTCCCTGTCCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=131,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:24802182_C_CT:24802182:0,3,0,1
chr4	24802232	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24802232_C_CG:24802232:0,0,0,1
chr4	24802237	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24802232_C_CG:24802232:0,0,0,1
chr4	25005023	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr4	25005454	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,0,4
chr4	25153575	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:16,0:8,3:11,13,1,2
chr4	25160618	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:8,0:5,4:10,4,4,0
chr4	25160786	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:25160786_T_A:25160786:1,3,0,1
chr4	25160788	.	C	CAAGCAGCGTGGCAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:25160786_T_A:25160786:1,3,0,1
chr4	25262232	.	TTATATATATA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=119,118;MMQ=40,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=TA;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,0:1,1:1,2,0,1
chr4	25315637	.	C	CTTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	25334928	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=103,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,2,0
chr4	25363766	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=113,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr4	25385078	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25385078_A_T:25385078:0,1,0,1
chr4	25385080	.	T	TCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25385078_A_T:25385078:0,1,0,1
chr4	25392695	.	TA	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr4	25396094	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:25396094_A_C:25396094:0,1,0,1
chr4	25396096	.	T	TTGTAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25396094_A_C:25396094:0,1,0,1
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	25416063	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=102,97;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,0:7,3:9,9,0,3
chr4	25416074	.	CCCT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=112,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:5,2:7,0:0|1:25416074_CCCT_C:25416074:6,8,1,1
chr4	25416076	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=103,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,4:5,3:3,2,2,6
chr4	25416081	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:7,0:0|1:25416074_CCCT_C:25416074:7,8,1,1
chr4	25665996	.	C	CATTAGTTCTTATAGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	25665999	.	G	GCATTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=78,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:0,1:1,0:0|1:25665999_G_GCATTT:25665999:0,1,0,1
chr4	25666002	.	A	AAATCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=78,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:25665999_G_GCATTT:25665999:0,1,0,1
chr4	25666004	.	G	GCTTTTGTTTTAATC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=78,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:25665999_G_GCATTT:25665999:0,1,0,1
chr4	25678396	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,0:0,7:0,0,3,4
chr4	25750261	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	25766907	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:25766907_T_C:25766907:7,1,1,1
chr4	25766911	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:0|1:25766907_T_C:25766907:7,1,1,1
chr4	25766933	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=115,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:6,3,1,1
chr4	25792243	.	A	ATGCAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	25831823	.	C	CAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25831823_C_CAAAA:25831823:0,1,0,1
chr4	25831825	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25831823_C_CAAAA:25831823:0,1,0,1
chr4	25831842	.	C	CCATCACAGAGGTGGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	25835251	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25835251_A_T:25835251:0,1,0,1
chr4	25835253	.	GGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:25835251_A_T:25835251:0,1,0,1
chr4	25930071	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	26322478	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,2,0
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr4	26387959	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.954:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr4	26417068	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=64,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.622:10:1,3:3,1:2,2,2,4
chr4	26417136	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:1,0,6,7
chr4	26483657	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr4	26483868	.	T	TCCTTTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26483868_T_TCCTTTCTTC:26483868:0,0,0,1
chr4	26483872	.	T	TAGGACATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26483868_T_TCCTTTCTTC:26483868:0,0,0,1
chr4	26487460	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	26638830	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:14,0:6,3:8,12,1,2
chr4	26719740	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,5:2,5:4,0,5,5
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	27004734	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=133,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr4	27019304	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=112,114;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,4:17,0:18,12,4,0
chr4	27024575	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=92,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:27024575_A_T:27024575:0,2,0,1
chr4	27024577	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=92,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:27024575_A_T:27024575:0,2,0,1
chr4	27024581	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27024575_A_T:27024575:0,1,0,1
chr4	30725987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233770;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	30726870	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=116,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr4	31144301	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=99,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr4	36093593	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=133,50;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36093593_T_C:36093593:1,2,0,1
chr4	36093595	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=133,50;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36093593_T_C:36093593:1,2,0,1
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	36126393	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	36130099	.	T	TACACACAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=153,183;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=AC;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.343:7:3,0:1,0:0|1:36130099_T_TACACACAC:36130099:4,1,2,0
chr4	36130127	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=118,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.584:25:4,2:6,8:0|1:36130099_T_TACACACAC:36130099:8,3,5,9
chr4	36148837	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=115,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	36149037	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=162,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:36149037_C_T:36149037:0,2,0,1
chr4	36149039	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=162,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:36149037_C_T:36149037:0,2,0,1
chr4	36149342	.	G	GAGAATGCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:36149342_G_GAGAATGCC:36149342:3,3,1,1
chr4	36149344	.	T	TGCAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:0|1:36149342_G_GAGAATGCC:36149342:3,3,1,1
chr4	36149346	.	T	TTCAACTCTATA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=116,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:0|1:36149342_G_GAGAATGCC:36149342:3,2,1,1
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:3,1,5,3
chr4	36168706	.	CAAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	36211914	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	36216114	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:1,3,3,3
chr4	36317771	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=221,155;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36317771_A_C:36317771:1,0,1,0
chr4	36317781	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=221,155;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36317771_A_C:36317771:1,0,1,0
chr4	36318176	.	T	TACTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36318176_T_TACTA:36318176:0,1,0,1
chr4	36318179	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:36318176_T_TACTA:36318176:0,1,0,1
chr4	37246709	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr4	37358102	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37358102_G_C:37358102:0,1,0,1
chr4	37358104	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37358102_G_C:37358102:0,1,0,1
chr4	37432382	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:37432382_A_T:37432382:0,4,0,1
chr4	37432384	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:37432382_A_T:37432382:0,4,0,1
chr4	37432388	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=94,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:37432382_A_T:37432382:0,3,0,1
chr4	37440549	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:2,2,0,1
chr4	37448674	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=123,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,0,2
chr4	37591751	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:5,4:8,0:9,6,4,0
chr4	37592681	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	37636750	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37636750_T_G:37636750:0,1,0,1
chr4	37636752	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:37636750_T_G:37636750:0,1,0,1
chr4	37651155	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr4	37836302	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.365:28:11,3:7,7:7,11,4,6
chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=83,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr4	37841888	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:37841888_G_A:37841888:2,7,0,2
chr4	37841893	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:2,0:0|1:37841888_G_A:37841888:1,7,0,2
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	37857166	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	37903756	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,7,5
chr4	38046038	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:3,7,2,0
chr4	38119885	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	38134423	.	GTT	G,GT	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=31,30,32;MFRL=124,135,143;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=9.23,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,8,4:0.197,0.105:42:14,3,3:13,5,1:23,7,11,1
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=28,16;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,20:0.369:50:11,0:7,0:15,15,20,0
chr4	38134546	.	G	GAAC	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:6,2:15,2:0|1:38134546_G_GAAC:38134546:1,21,0,4
chr4	38134547	.	TGC	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:6,2:15,2:0|1:38134546_G_GAAC:38134546:1,21,0,4
chr4	38134551	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:6,2:15,2:0|1:38134546_G_GAAC:38134546:1,21,0,4
chr4	38698924	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:4,2:3,2:3,4,1,3
chr4	38774957	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:4,7,2,0
chr4	38829163	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,115;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,1:3,5:2,1,5,1
chr4	38879655	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	38879949	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr4	38880046	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,3,4
chr4	38916465	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	38924330	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr4	38924358	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:2,2,7,2
chr4	38924543	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,0:4,5:0,8,1,4
chr4	38930921	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:2,2:1,3:1,2,1,5
chr4	38933859	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,3:0,6:1,0,5,4
chr4	38934067	.	A	ACATG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38934067_A_ACATG:38934067:0,2,0,1
chr4	38934071	.	C	CATTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38934067_A_ACATG:38934067:0,2,0,1
chr4	38934074	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38934067_A_ACATG:38934067:0,2,0,1
chr4	38934075	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:38934067_A_ACATG:38934067:0,2,0,1
chr4	38934077	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:38934067_A_ACATG:38934067:0,2,0,1
chr4	38934081	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:38934067_A_ACATG:38934067:0,1,0,1
chr4	38934084	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:38934067_A_ACATG:38934067:0,1,0,1
chr4	38937316	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=168,173;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.326:7:1,0:3,2:0|1:38937316_C_CT:38937316:2,3,2,0
chr4	38937329	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=165,173;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:0,0:3,0:0|1:38937316_C_CT:38937316:2,4,2,0
chr4	38942609	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:12,3:8,10,3,0
chr4	38942697	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=19,34;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,1:0,3:0,1,0,4
chr4	38942727	.	CAGCAAATG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=132,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:2,1:0|1:38942727_CAGCAAATG_C:38942727:0,3,0,1
chr4	38942737	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=132,206;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38942727_CAGCAAATG_C:38942727:0,3,0,1
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	38944989	.	TGAAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:0,1,5,4
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=51,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:2,3,4,2
chr4	39184297	.	AAG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr4	39207118	.	ATTTACCATGTTGCCACTGATAGCTAATCTCCTTG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,41;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,0:1,2:7,2,1,1
chr4	39226738	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39226738_T_A:39226738:0,0,0,1
chr4	39226739	.	T	TAAAAGGTAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39226738_T_A:39226738:0,0,0,1
chr4	39241884	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=112,57;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:4,2,1,1
chr4	39255696	.	A	AGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	39304783	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	39306601	.	CC	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr4	39321969	.	CAAAA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.245:14:1,0:4,1:4,7,1,2
chr4	39343934	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0|1:39343934_C_T:39343934:5,1,2,0
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:39343934_C_T:39343934:0,0,7,3
chr4	39352910	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,0:0,0,3,1
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr4	39409014	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=160,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:5,2,4,0
chr4	39409416	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr4	39448542	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39458051	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=125,100;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.269:35:18,5:8,4:11,15,5,4
chr4	39459718	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:39459718_G_A:39459718:4,0,2,0
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1|0:39459718_G_A:39459718:3,0,4,0
chr4	39460672	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:2,3:2,2:4,0,3,2
chr4	39473039	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	39501722	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,31,32;MFRL=108,0,115;MMQ=39,60,60;MPOS=10,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=13.80,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,7,6:0.354,0.268:21:0,6,3:1,1,3:7,1,5,8
chr4	39501733	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=109,108;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:10,6:7,0:8,9,6,0
chr4	39779473	.	T	TTTGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39779473_T_TTTGGAGA:39779473:0,1,0,1
chr4	39779477	.	A	AAGTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39779473_T_TTTGGAGA:39779473:0,1,0,1
chr4	39846481	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:39846481_C_T:39846481:0,2,0,1
chr4	39846500	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,24;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39846481_C_T:39846481:0,1,0,1
chr4	39846502	.	A	ACAGCAAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39846481_C_T:39846481:0,1,0,1
chr4	39846520	.	C	CAGGAAAAATA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39870916	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39870916_T_C:39870916:0,0,1,0
chr4	39870919	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39870916_T_C:39870916:0,0,1,0
chr4	39900215	.	A	AGATAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	39902142	.	A	AGGTAAAACTCTTGGTCTGGGCTGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	39910172	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.762:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	39918635	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	40104855	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:0|1:40104855_G_T:40104855:0,3,0,1
chr4	40104863	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:40104855_G_T:40104855:0,4,0,1
chr4	40104867	.	A	AATGACAAAAGCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:40104855_G_T:40104855:0,4,0,1
chr4	40108734	.	T	TGTAAATTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	40123997	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=173,160;MMQ=54,53;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:0,1:0,6,0,2
chr4	40245033	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,276;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:12,9,1,1
chr4	40245990	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	40337607	.	G	GGTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=95,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr4	40428207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:40428207_C_T:40428207:0,2,0,1
chr4	40428215	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:40428207_C_T:40428207:0,2,0,1
chr4	40778146	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	40809014	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr4	40818024	.	AT	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	41015553	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=92,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,0:1,3:1,3,3,1
chr4	41015970	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,176;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,5:3,0:0|1:41015970_G_A:41015970:3,3,6,0
chr4	41015975	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=124,176;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,5:4,0:0|1:41015970_G_A:41015970:3,3,6,0
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	41640878	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,3:0,0:2,1,2,1
chr4	41641058	.	TTGAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=164,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41641058_TTGAA_T:41641058:0,1,1,0
chr4	41641066	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=164,240;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41641058_TTGAA_T:41641058:0,1,1,0
chr4	41641068	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=164,240;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41641058_TTGAA_T:41641058:0,1,1,0
chr4	41646651	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:1,3,5,3
chr4	41663621	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41663621_G_A:41663621:0,0,0,1
chr4	41663623	.	A	AACAATTAACAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41663621_G_A:41663621:0,0,0,1
chr4	41668659	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=133,1086;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,2:3,3,2,0
chr4	41673731	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	41682122	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:41682122_A_ATG:41682122:1,0,0,1
chr4	41682124	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41682122_A_ATG:41682122:1,0,0,1
chr4	41684546	.	G	GCTAATTTAGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	41983829	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=1096,458;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:41983829_G_GA:41983829:2,0,2,0
chr4	41983832	.	T	TCTGAAGATC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=1096,458;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:41983829_G_GA:41983829:2,0,2,0
chr4	41983835	.	T	TTCGTTCCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,25;MFRL=1096,424;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41983829_G_GA:41983829:2,0,1,0
chr4	41983838	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=1096,424;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:41983829_G_GA:41983829:2,0,1,0
chr4	41983840	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=1096,424;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:41983829_G_GA:41983829:2,0,1,0
chr4	41983842	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=130,424;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:41983829_G_GA:41983829:1,0,1,0
chr4	41984045	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr4	41984118	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr4	41985272	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27,31;MFRL=219,169,126;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.18,10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,6:0.249,0.587:9:0,0,4:1,1,2:0,1,2,6
chr4	41985448	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:1,7,1,2
chr4	41985478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	41986537	.	A	AGCTTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=105,146;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0|1:41986537_A_AGCTTC:41986537:1,2,0,1
chr4	41986538	.	A	AGCCTCCTGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=105,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0|1:41986537_A_AGCTTC:41986537:1,2,0,1
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=91,8329888;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=95,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:2,4,1,3
chr4	42025019	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:42025019_A_T:42025019:0,1,0,2
chr4	42025021	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:42025019_A_T:42025019:0,1,0,2
chr4	42025024	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:42025019_A_T:42025019:0,1,0,2
chr4	42025284	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr4	42037385	.	G	GTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.494:4:0,2:2,0:0|1:42037385_G_GTGT:42037385:0,2,1,1
chr4	42037388	.	G	GCTACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:0,2:2,0:0|1:42037385_G_GTGT:42037385:0,2,1,1
chr4	42051534	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42051534_G_A:42051534:0,0,0,1
chr4	42051540	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:42051534_G_A:42051534:0,0,0,1
chr4	42080417	.	T	TGCGACATGTTTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	42122044	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:4,3,2,2
chr4	42122405	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	42145554	.	C	CCGGGTTCAAGTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=116,42;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr4	42403242	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr4	42403499	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,20;MFRL=158,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,1,1,1
chr4	42403503	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,2,1,1
chr4	42403506	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,2,1,1
chr4	42403507	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,2,1,1
chr4	42403509	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,2,1,1
chr4	42403513	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=166,43;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:42403499_C_CCA:42403499:0,2,1,1
chr4	42524287	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:42524287_C_T:42524287:0,1,1,1
chr4	42524296	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=155,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:42524287_C_T:42524287:0,1,1,1
chr4	42524342	.	CAA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42524342_CAA_C:42524342:0,0,0,1
chr4	42524345	.	CACACCAAAGAT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:42524342_CAA_C:42524342:0,0,0,1
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	42571225	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.096:54:29,4:20,0:33,16,3,2
chr4	42571341	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,80;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr4	42592929	.	A	ATGGTAGAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=77,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:3,1,0,1
chr4	42596461	.	TAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr4	42602624	.	T	TTTATATTAGTAAAATTCTTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=98,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr4	42618021	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr4	42618138	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	42626659	.	GAA	G,GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23,18;MFRL=230,103,155;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=8.18,22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,11:0.238,0.612:17:1,2,3:1,0,2:2,0,5,10
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	42629038	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=116,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:5,1:7,4:7,5,4,1
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr4	42965248	.	CACTTGCTGGTTTT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	44449769	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=116,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr4	44651968	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=88,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.618:10:1,1:2,3:3,1,4,2
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	44684438	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0,7,1,1
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,7,0
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,7,0
chr4	44688540	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,5,7
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=88,117;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:0,4,1,7
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	44710008	.	TAAACGAGAAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44710008_TAAACGAGAAC_T:44710008:0,0,0,1
chr4	44710021	.	AAGCACCAAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44710008_TAAACGAGAAC_T:44710008:0,0,0,1
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=108,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,2:2,0,5,0
chr4	46042945	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	46086060	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:1,8:0,6:0,1,10,5
chr4	46125996	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46125996_T_A:46125996:0,1,0,1
chr4	46125997	.	C	CCACTACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46125996_T_A:46125996:0,1,0,1
chr4	46125999	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=109,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:46125996_T_A:46125996:0,1,0,1
chr4	46263900	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	46973270	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:3,0:2,6,2,3
chr4	46973306	.	AT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:46973306_AT_GG:46973306:0,3,0,1
chr4	46973311	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:46973306_AT_GG:46973306:0,3,0,1
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr4	47033788	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=106,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:5,4,0,2
chr4	47405406	.	A	AACAGCACGGTTAAACAAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr4	47428003	.	A	AATCTTAATGCTTATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:3,0:4,3:3,4,2,1
chr4	47455000	.	TG	CG,CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32,32;MFRL=0,149,88;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.47,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,2,1:0,0,0:0,0,3,0
chr4	47455010	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47455010_A_T:47455010:2,0,1,0
chr4	47455011	.	CGCAA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47455010_A_T:47455010:2,0,1,0
chr4	47455016	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47455010_A_T:47455010:2,0,1,0
chr4	47455022	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr4	47514545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr4	47514685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,107;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.736:9:0,3:2,4:1,1,3,4
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	47538871	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=134,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,1,1
chr4	47561141	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	47570772	.	CTAAAAAATGACAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=122,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	47571193	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,3,0,1
chr4	47571194	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,3,0,1
chr4	47571199	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,2,0,1
chr4	47571201	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,2,0,1
chr4	47571203	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,2,0,1
chr4	47571205	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47571193_T_C:47571193:0,2,0,1
chr4	47582387	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr4	47589299	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,809;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	47625811	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	47626034	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	47628545	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	47682174	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	47682182	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,144;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.282:9:1,0:5,2:6,1,1,1
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=141.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,21,22
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr4	47901353	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr4	47901486	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=131,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:3,0:0,1:0|1:47901486_G_C:47901486:1,2,1,0
chr4	47901487	.	TGG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=131,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:3,0:0,1:0|1:47901486_G_C:47901486:1,2,1,0
chr4	47901491	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=131,230;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:3,0:0,1:0|1:47901486_G_C:47901486:1,2,1,0
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr4	47939009	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=66,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr4	47939298	.	C	CTGTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47939298_C_CTGTT:47939298:0,1,0,1
chr4	47939299	.	A	AAAATTC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47939298_C_CTGTT:47939298:0,1,0,1
chr4	47939303	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47939298_C_CTGTT:47939298:0,1,0,1
chr4	47939305	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:47939298_C_CTGTT:47939298:0,1,0,1
chr4	47942985	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47942985_A_T:47942985:0,0,0,1
chr4	47942987	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47942985_A_T:47942985:0,0,0,1
chr4	47944160	.	TTCTCCCTAGCGGC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:3,7,0,3
chr4	47945405	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:3,10,1,1
chr4	47945407	.	T	TTCTTC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=114,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.241:10:4,0:4,2:0|1:47945407_T_TTCTTC:47945407:1,7,1,1
chr4	47945415	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:47945407_T_TTCTTC:47945407:0,8,1,1
chr4	47945455	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr4	48027327	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr4	48036863	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,2:0,3:0,0,5,2
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	48091925	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,101;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	48116403	.	C	CAAGGAGGGGGAGGAGGTGCAGGGAGGGTAGGATGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.483:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	48148435	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr4	48173540	.	G	GGAAATGGTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48173540_G_GGAAATGGTCA:48173540:0,2,0,1
chr4	48173542	.	A	AAAGTTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48173540_G_GGAAATGGTCA:48173540:0,2,0,1
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	48384994	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,34;MFRL=131,170;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,1,0,1
chr4	48385003	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=131,170;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,1,0,1
chr4	48385009	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,0,0,1
chr4	48385011	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,0,0,1
chr4	48385014	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,0,0,1
chr4	48385016	.	TAGGAA	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,0,0,1
chr4	48385023	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48384994_T_C:48384994:0,0,0,1
chr4	48496117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=280,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr4	48496332	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48496332_C_CT:48496332:0,0,0,1
chr4	48496335	.	T	TCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:48496332_C_CT:48496332:0,0,0,1
chr4	48502254	.	TTTAAGGATCTATTCGTATGTTTGGTAACAAAAACATTTAGTTGGCTACAAGAATATACCTGATGGCAGTAGCATTGTTGCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=224,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr4	48504903	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,26;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:0|1:48504903_A_AG:48504903:1,2,0,1
chr4	48504906	.	A	AAACAAAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,25;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:48504903_A_AG:48504903:1,2,0,1
chr4	48504910	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,24;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,1:1,0:0|1:48504903_A_AG:48504903:1,1,0,1
chr4	48504913	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,22;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48504903_A_AG:48504903:0,1,0,1
chr4	48504916	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=100,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48504903_A_AG:48504903:0,1,0,1
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	48523152	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=107,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:3,0:2,4:5,2,0,4
chr4	48525197	.	A	AAAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=127,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48525197_A_AAAAAAG:48525197:0,1,0,1
chr4	48525198	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=127,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:48525197_A_AAAAAAG:48525197:0,1,0,1
chr4	48529683	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.622:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	48530396	.	A	AGTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=81,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48530396_A_AGTTT:48530396:1,1,0,1
chr4	48530398	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=81,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48530396_A_AGTTT:48530396:1,1,0,1
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr4	48537603	.	T	TACACAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr4	48537633	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=82,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,3:1,3:0,1,5,2
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr4	48544232	.	CA	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr4	48559166	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48559166_G_GC:48559166:0,2,0,1
chr4	48559167	.	T	TATGTTCTCCGCCTCTTCACCATCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:48559166_G_GC:48559166:0,2,0,1
chr4	48566983	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=110,54;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:6,6,2,1
chr4	48567003	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=109,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:11,2:0|1:48567003_C_A:48567003:9,9,1,1
chr4	48567006	.	AT	TA	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=103,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:13,2:0|1:48567003_C_A:48567003:8,13,1,1
chr4	48567012	.	G	GCTGAAACTGGA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=99,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:5,0:15,2:0|1:48567003_C_A:48567003:7,13,1,1
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr4	48584771	.	A	ACTAGTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48584771_A_ACTAGTT:48584771:1,2,0,1
chr4	48584774	.	A	ATTCTTTTTCTTTCCGATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48584771_A_ACTAGTT:48584771:1,2,0,1
chr4	48596036	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.426:19:5,3:6,4:3,8,1,7
chr4	48597929	.	T	TTAAG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:6,4:17,0:0|1:48597929_T_TTAAG:48597929:9,14,2,2
chr4	48597933	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=118,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:6,2:17,0:0|1:48597929_T_TTAAG:48597929:9,14,2,2
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr4	48988450	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=169,81;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr4	48988477	.	G	GCTTTCTGTCTGGGAGTGCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	52777151	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr4	52862002	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=109,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:2,2,0,1
chr4	52863922	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:6,2,0,4
chr4	52863950	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=103,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:6,1,0,4
chr4	52890077	.	AAAGTC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	52894801	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,155;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,0:3,1:6,0,2,0
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,1,1
chr4	52896099	.	A	AACAGACATAGAGAACAGTGGAACACGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=1940,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.712:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr4	52935920	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=146,117;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:4,0,3,0
chr4	52936102	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52936102_AT_A:52936102:0,3,0,1
chr4	52936104	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:52936102_AT_A:52936102:0,3,0,1
chr4	52936107	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=51,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52936102_AT_A:52936102:0,2,0,1
chr4	52938165	.	TGGAGCTTGGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:3,1,1,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32,20;MFRL=139,164,122;MMQ=60,60,60;MPOS=22,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.447,0.281:8:1,3,2:1,1,0:0,2,0,6
chr4	53731673	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr4	53751819	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:53751819_G_A:53751819:1,2,1,0
chr4	53751822	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:53751819_G_A:53751819:1,2,1,0
chr4	54011424	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr4	54011576	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,190;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:1,1,3,4
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,18:0,0,12,22
chr4	54248418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:3,5:4,1,6,5
chr4	54280705	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=220,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr4	54319247	.	CAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:5,0:3,2:3,8,0,2
chr4	54325444	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=20281681,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.510:4:1,2:0,0:0,2,2,0
chr4	54327032	.	C	CTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:1,2,4,1
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=88,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,1,1
chr4	54344703	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,230;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:4,3:3,0:6,1,0,4
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr4	54852693	.	CTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=TTTTA;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr4	54852913	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=140,123;MMQ=51,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:54852913_A_C:54852913:0,4,0,1
chr4	54852915	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=140,123;MMQ=51,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:54852913_A_C:54852913:0,4,0,1
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	55144615	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:5,3,2,1
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	55524304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	55570048	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=135,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,2,0
chr4	55573252	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:55573252_C_T:55573252:11,2,1,1
chr4	55573256	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:55573252_C_T:55573252:11,2,1,1
chr4	55594075	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,1:2,2:6,5,1,2
chr4	55599159	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	55603037	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:55603037_C_A:55603037:0,4,0,1
chr4	55603039	.	T	TTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:55603037_C_A:55603037:0,3,0,1
chr4	55603043	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:55603037_C_A:55603037:0,3,0,1
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr4	55955025	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=130,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr4	55955191	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=118,129;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:55955191_C_T:55955191:1,3,0,1
chr4	55955205	.	T	TTTGGGAGGCCAAGGTGTGTGGATCACC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=118,129;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:55955191_C_T:55955191:0,2,0,1
chr4	55968008	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	55971131	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55971131_G_GC:55971131:1,0,0,1
chr4	55971134	.	A	ACCAGATTGCAGTTCTTGAACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55971131_G_GC:55971131:1,0,0,1
chr4	55991523	.	G	GGGGAGTGACATCAAATGTCCCCTAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=87,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=93,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr4	56290659	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,3:4,0:0|1:56290659_A_T:56290659:6,6,3,0
chr4	56290664	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=127,118;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:6,2:6,0:0|1:56290659_A_T:56290659:6,6,3,0
chr4	56309844	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:3,3,3,1
chr4	56319317	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:25,0:15,2:22,18,1,1
chr4	56319350	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=123,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,5:3,7:3,9,3,9
chr4	56336930	.	A	AAATCCTTTGTCATTTATCTCAAATTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:7,6,0,2
chr4	56336953	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr4	56435849	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr4	56448250	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:3,2,2,1
chr4	56458400	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	56471404	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:5,1,5,2
chr4	56471433	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,4,3
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:1,6,2,4
chr4	56744146	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:3,2:4,6,1,1
chr4	56835387	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=113,106;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:0|1:56835387_G_A:56835387:0,9,0,2
chr4	56835390	.	ACCAT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=116,106;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:2,1:0|1:56835387_G_A:56835387:0,10,0,2
chr4	56835400	.	CACATCAACA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=160,107;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:56835387_G_A:56835387:0,4,0,1
chr4	56846278	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,4:8,1:8,5,3,2
chr4	56877725	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr4	56878157	.	ATATTTATTTGTTTTGTAAAGATGTTATTTAGTGAAACAGAAAACATTCAAAGATACTTTATTTATTTATT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=147,90;MMQ=60,31;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,0:8,3:8,16,0,3
chr4	56885761	.	GTGAAGGATAGTTTTTTAATTTTTTTGAAGTGGAGGAAAGGTTAAGAGTA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.425:4:2,0:0,1:0,2,1,1
chr4	57176965	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	57176999	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57176999_A_C:57176999:0,1,0,1
chr4	57177000	.	T	TTTCTGTCCCCTCCCTCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:57176999_A_C:57176999:0,1,0,1
chr4	57180309	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=120,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,1:2,1:4,7,2,0
chr4	57180473	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.550:16:4,6:3,2:4,3,3,6
chr4	57180563	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=76,147;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr4	57180576	.	C	CGGAGTGGAGGGAGCGGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr4	57180616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr4	57180968	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:2,5,2,0
chr4	57182660	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=163,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,1:0,2,2,0
chr4	57182676	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=163,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	57204476	.	C	CTTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.553:7:3,1:0,3:3,0,3,1
chr4	57219523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,1,2
chr4	57220174	.	TAATAGATATTCAATATTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:3,1,1,0
chr4	57269591	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,23;MFRL=108,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr4	57269624	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=107,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:57269624_A_T:57269624:0,3,0,1
chr4	57269630	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57269624_A_T:57269624:0,2,0,1
chr4	57269633	.	G	GCAGTTATT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57269624_A_T:57269624:0,2,0,1
chr4	57269646	.	A	AAAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	57272937	.	T	TGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=106,237;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57272937_T_TGTC:57272937:0,1,0,1
chr4	57272940	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=106,237;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57272937_T_TGTC:57272937:0,1,0,1
chr4	57272941	.	C	CTACTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=106,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:57272937_T_TGTC:57272937:0,1,0,1
chr4	57318009	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=114,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:8,4:6,0:7,9,4,0
chr4	57344909	.	T	TATATAATTTTCTCTCGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	57349369	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=125,137;MMQ=52,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,0:18,3:20,12,0,3
chr4	57521972	.	GGCTCAGCC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	57523869	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr4	57547802	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr4	57547835	.	GT	CC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=127,32;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:57547835_GT_CC:57547835:3,5,1,1
chr4	57547838	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=127,32;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:57547835_GT_CC:57547835:3,5,1,1
chr4	57547840	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=127,32;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:57547835_GT_CC:57547835:3,5,1,1
chr4	57687788	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr4	57797414	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=118,198;MMQ=60,37;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:0,1:3,10:1,2,1,10
chr4	57830501	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,129;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr4	57843575	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,0:0,1:0|1:57843575_C_CAT:57843575:0,0,0,1
chr4	57843578	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:57843575_C_CAT:57843575:0,0,0,1
chr4	57845269	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr4	57871748	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=103,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.651:5:0,1:2,2:1,1,2,1
chr4	57872900	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,7960;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	57876955	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=94,104;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:5,3,5,2
chr4	57883175	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr4	57891056	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:6,2,2,0
chr4	57891239	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	57897570	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	57898495	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr4	62596460	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr4	62775554	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	62800554	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=68,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,3:0,1:1,1,2,2
chr4	62845388	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr4	62845461	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr4	62845490	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,6
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,5
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	65147341	.	T	TGGCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr4	65180522	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=76,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:2,5,2,0
chr4	65194307	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:65194307_A_C:65194307:3,8,1,1
chr4	65194310	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:65194307_A_C:65194307:3,8,1,1
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr4	65240822	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=110,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,1:2,2:6,2,2,1
chr4	65240967	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:1,5,2,9
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:4,1:7,9:5,6,6,4
chr4	66270243	.	A	AGAGCCTAACCATCTCTATCTCTCTCTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	66467419	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr4	66535281	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=116,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr4	66535284	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,3,1
chr4	66535301	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=94,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr4	68358653	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,138;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:18,0:9,3:16,11,0,3
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr4	68374597	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=105,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:11,3:5,1:8,8,3,1
chr4	68384008	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=124,111;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:4,6,1,4
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,5:4,3,2,3
chr4	68406626	.	TATTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=65,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:1,1,4,1
chr4	68447249	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,5:7,3:1,8,0,8
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr4	68490069	.	G	GTTGTATTTTTCCTTCTTAGCACTTACACTCACAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:0,1:1,0:0|1:68490069_G_GTTGTATTTTTCCTTCTTAGCACTTACACTCACAC:68490069:0,2,0,1
chr4	68490072	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:68490069_G_GTTGTATTTTTCCTTCTTAGCACTTACACTCACAC:68490069:0,1,0,1
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,1,2
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.658:12:2,5:0,3:3,1,6,2
chr4	68539539	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	68547232	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.179:23:7,2:11,2:11,8,2,2
chr4	68547267	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,114;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:8,4:20,0:17,11,4,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:7,1,6,0
chr4	68699049	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:2,2:4,0:0|1:68699049_C_CCA:68699049:3,3,1,1
chr4	68699051	.	AGG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=151,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.265:9:2,1:4,0:0|1:68699049_C_CCA:68699049:3,4,1,1
chr4	68700956	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
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chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr4	69095309	.	A	ATGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:69095309_A_ATGC:69095309:1,0,0,1
chr4	69095311	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69095309_A_ATGC:69095309:1,0,0,1
chr4	69095313	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69095309_A_ATGC:69095309:1,0,0,1
chr4	69095314	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:69095309_A_ATGC:69095309:1,0,0,1
chr4	69097138	.	G	GTGGCGTTCTCTGTATTTCCTGAATCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,131;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	69098244	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69098244_T_TC:69098244:0,1,0,1
chr4	69098247	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:69098244_T_TC:69098244:0,1,0,1
chr4	69102074	.	AG	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	69179887	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:14,1:17,5:14,18,4,2
chr4	69181942	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=99,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	69184121	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=146,151;MMQ=60,47;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr4	69184126	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:69184126_A_T:69184126:3,0,1,0
chr4	69184128	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:69184126_A_T:69184126:3,0,1,0
chr4	69184130	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:69184126_A_T:69184126:3,0,1,0
chr4	69184132	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:69184126_A_T:69184126:3,0,1,0
chr4	69184134	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:69184126_A_T:69184126:4,0,1,0
chr4	69184137	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:69184126_A_T:69184126:4,0,1,0
chr4	69203646	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	69215349	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	69332537	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	69337277	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=88,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:19,4:17,0:18,19,4,0
chr4	69337325	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=98,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:8,7:7,3:6,9,3,7
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:2,5:3,3:3,4,2,6
chr4	69342169	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=87,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:2,4,1,3
chr4	69343353	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,8,17
chr4	69344733	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,6:0,0,5,17
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,1:1,3:6,1,4,0
chr4	69362567	.	TGGG	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:69362567_TGGG_T:69362567:0,9,0,3
chr4	69362573	.	TGGAGGCCA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:69362567_TGGG_T:69362567:0,9,0,3
chr4	69416556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,146;MMQ=27,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr4	69434217	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	69519884	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,126;MMQ=27,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,2:4,6:6,4,3,5
chr4	69519941	.	C	CTTAGGGAGAGAGTCAAGAAAGAAGGTAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=131,51847;MMQ=40,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,1:7,8,0,2
chr4	69536084	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.486:37:8,10:11,8:8,11,10,8
chr4	69536359	.	T	TTAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=99,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr4	69536385	.	T	TAATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=99,92;MMQ=52,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	69681842	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,60;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:4,11,1,1
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,13:0,8:0,0,12,9
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,10,13
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	69973044	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,118;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr4	70146230	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,10,5
chr4	70346329	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=112,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:3,1,1,1
chr4	70346680	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,1,2
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr4	70346715	.	CC	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=172,160;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:70346715_CC_AG:70346715:0,3,0,1
chr4	70346720	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=172,160;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:70346715_CC_AG:70346715:0,3,0,1
chr4	70355380	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	70455021	.	A	ACCAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=176,329;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70455021_A_ACCAGG:70455021:1,0,1,0
chr4	70455022	.	T	TGAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=176,329;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70455021_A_ACCAGG:70455021:1,0,1,0
chr4	70455024	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=176,329;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70455021_A_ACCAGG:70455021:1,0,1,0
chr4	70455027	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=176,329;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:70455021_A_ACCAGG:70455021:1,0,1,0
chr4	70460328	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,152;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,7:2,3:1,4,7,3
chr4	70513139	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr4	70513175	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:1,2:10,0:0|1:70513175_G_A:70513175:4,7,1,1
chr4	70513183	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=111,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:0|1:70513175_G_A:70513175:3,6,1,1
chr4	70592976	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70592976_G_A:70592976:0,0,0,1
chr4	70592977	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70592976_G_A:70592976:0,0,0,1
chr4	70592980	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70592976_G_A:70592976:0,0,0,1
chr4	70592983	.	C	CTGCCCTCGTTTCAAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70592976_G_A:70592976:0,0,0,1
chr4	70723444	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	70805829	.	TCA	T,TCTCACA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,24,29;MFRL=148,129,162;MMQ=60,60,46;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.75,6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.318,0.320:6:0,0,2:2,1,0:0,2,0,4
chr4	70805831	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=162,140;MMQ=46,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.662:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	70805833	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=16,26;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:0,1:0,5,0,2
chr4	70807845	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:0,6,4,6
chr4	70810511	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=104,247;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr4	70811806	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	70826751	.	G	GCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:14,1:3,1:7,10,2,0
chr4	70866553	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=77,56;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.223:16:7,0:6,3:0|1:70866553_A_T:70866553:5,8,2,1
chr4	70866566	.	T	TTCTGGTATTCCCGTTA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=85,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:70866553_A_T:70866553:8,7,2,1
chr4	70896333	.	GGAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=127,125;MMQ=36,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr4	70896355	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	70899037	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,1,8
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	71027213	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=99,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:11,0,6,4
chr4	71062308	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:8,9:5,8:8,5,10,7
chr4	71062342	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.520:44:14,14:6,9:10,11,11,12
chr4	71066390	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=19,25;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:0,0:0|1:71066390_G_A:71066390:0,2,0,1
chr4	71066393	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,32;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:0,0:0|1:71066390_G_A:71066390:0,2,0,1
chr4	71066399	.	T	TTAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:71066390_G_A:71066390:0,1,0,1
chr4	71066403	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,0:0|1:71066390_G_A:71066390:0,1,0,1
chr4	71066406	.	G	GACAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:71066390_G_A:71066390:0,1,0,1
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	71113479	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.640:14:4,6:0,3:4,1,7,2
chr4	71115022	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=112,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:7,2,2,0
chr4	71115053	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=112,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:0,5:6,2:5,1,4,3
chr4	71115116	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:71115116_G_C:71115116:7,4,0,2
chr4	71115121	.	T	TCCCCCCTCCCACCCCCAAAAAAGAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=108,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:71115116_G_C:71115116:8,4,0,2
chr4	71115152	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:1,1,2,2
chr4	71201163	.	C	CCTTTTTAGCTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=98,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:71201163_C_CCTTTTTAGCTGT:71201163:3,1,0,2
chr4	71201166	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:71201163_C_CCTTTTTAGCTGT:71201163:3,1,0,1
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=130,128;MMQ=40,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,2,2
chr4	71227998	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,0,2
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,0,2
chr4	71232430	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.529:13:3,2:2,4:3,3,2,5
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,189;MMQ=57,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,2,1
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,133;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.343:24:6,3:10,5:9,7,3,5
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	71275145	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=108,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:11,7,0,2
chr4	71384579	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr4	71384621	.	C	CCACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=204,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr4	71388379	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	71388394	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr4	71398064	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	71467174	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:0|1:71467174_T_C:71467174:10,7,2,1
chr4	71467176	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=125,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,3:5,0:0|1:71467174_T_C:71467174:10,7,2,1
chr4	71468447	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:0|1:71468447_A_T:71468447:9,15,0,2
chr4	71468453	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:15,0:9,2:0|1:71468447_A_T:71468447:12,14,0,2
chr4	71472299	.	ATGCTG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71472299_ATGCTG_A:71472299:0,0,0,1
chr4	71472306	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71472299_ATGCTG_A:71472299:0,0,0,1
chr4	71495263	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=127,139;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,4:10,0:8,9,4,0
chr4	71500103	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:8,1,2,0
chr4	71500222	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,5:0.124:46:20,5:21,0:22,19,5,0
chr4	71523015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:71523015_G_A:71523015:0,4,0,2
chr4	71523020	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=126,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:0,1:0|1:71523015_G_A:71523015:0,4,0,2
chr4	71523022	.	AA	GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:71523015_G_A:71523015:0,3,0,2
chr4	71523025	.	A	ACTCTTCT,ATGATCACATTAGAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,25,25;MFRL=119,107,154;MMQ=60,60,60;MPOS=4,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.36,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:2,1,1:0,1,0:0,2,0,3
chr4	71523027	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:71523015_G_A:71523015:0,3,0,2
chr4	71691162	.	A	ACGGCAGCAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,3,9
chr4	71701890	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:17,6,0,3
chr4	71701962	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:0|1:71701962_C_T:71701962:9,11,0,2
chr4	71701965	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:0|1:71701962_C_T:71701962:9,11,0,2
chr4	71701967	.	T	TCCTCTTCCATTTTTGCAGGC	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:11,0:0|1:71701962_C_T:71701962:9,11,0,2
chr4	71859602	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=121,116;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:71859602_A_T:71859602:9,2,0,2
chr4	71859607	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=121,116;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:71859602_A_T:71859602:9,2,0,2
chr4	71891562	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=112,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,2:9,1:11,7,1,2
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr4	72121152	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr4	72263453	.	GCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72263453_GCTT_G:72263453:0,1,0,1
chr4	72263460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72263453_GCTT_G:72263453:0,1,0,1
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	72338589	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:2,2,1,2
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	72413281	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr4	72426011	.	GAAACA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=87,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:72426011_GAAACA_G:72426011:0,1,0,1
chr4	72426019	.	TGTGAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=87,100;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:72426011_GAAACA_G:72426011:0,1,0,1
chr4	72433696	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=222,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:72433696_C_CT:72433696:0,3,0,1
chr4	72433697	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=222,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:72433696_C_CT:72433696:0,3,0,1
chr4	72433699	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=222,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:72433696_C_CT:72433696:0,3,0,1
chr4	72433701	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=222,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:72433696_C_CT:72433696:0,3,0,1
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr4	72623713	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	72634975	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr4	72994649	.	T	TGTTCTCATTGGTTTCAAAGAACATCTTTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr4	73013523	.	GATTTAAAAAGAGCTAGTGTGATAATCCTAACTCTACTACGCATTATAT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	73154664	.	C	CCCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr4	73433234	.	G	GGAAAGAATATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	73433249	.	G	GGGGAGGGCCAGGAAGGAGGTTGAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,31;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.924:11:0,3:0,8:0,0,4,7
chr4	73434534	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr4	73434544	.	C	CTTAGGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	73930893	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.832:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	73933671	.	ATGTGTGTG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=TG;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.724:8:0,4:1,2:1,1,5,1
chr4	73942678	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,4:2,12:2,3,7,9
chr4	73963916	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:9,6,3,0
chr4	73968117	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:25,1:26,2:37,14,3,0
chr4	74005451	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74005451_G_T:74005451:0,1,0,1
chr4	74005452	.	C	CATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74005451_G_T:74005451:0,1,0,1
chr4	74010629	.	A	ACAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	74014809	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr4	74043282	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74043282_G_A:74043282:0,1,0,1
chr4	74043284	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=133,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74043282_G_A:74043282:0,1,0,1
chr4	74124071	.	TCCGCCTCCACCG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGCCTCCACCG;STR;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,0:3,4:3,5,1,3
chr4	74262998	.	T	TCCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74262998_T_TCCTTA:74262998:0,1,0,1
chr4	74263000	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=144,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74262998_T_TCCTTA:74262998:0,1,0,1
chr4	74285412	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,1:0|1:74285412_T_C:74285412:0,2,0,2
chr4	74285417	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74285412_T_C:74285412:0,3,0,1
chr4	74285421	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:74285412_T_C:74285412:0,3,0,1
chr4	74285940	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=104,57;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:12,7,1,1
chr4	74310844	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=100,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:10,4:0,3:4,6,3,4
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,8,13
chr4	74313260	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:3,7,2,3
chr4	74316532	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0|1:74316532_A_C:74316532:0,1,0,1
chr4	74316534	.	A	AAGGCCATCTCTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=103,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74316532_A_C:74316532:0,1,0,1
chr4	74351631	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:2,0:10,5:5,7,1,5
chr4	74364992	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20,34;MFRL=111,113,162;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.66,4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.243,0.267:13:1,1,0:5,2,2:2,5,0,6
chr4	74365948	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,0:3,2:1,5,0,3
chr4	74365968	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	74367706	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=149,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:3,1,3,0
chr4	74447678	.	T	TCTCTCTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.878:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=111,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0|1:74451073_A_G:74451073:2,2,0,3
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,0:0|1:74451073_A_G:74451073:0,3,0,3
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,3:8,2:4,8,2,3
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=23,31;MFRL=92,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:2,6,0,2
chr4	74453719	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=143,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:74453719_T_A:74453719:0,4,0,1
chr4	74453722	.	A	AGTAGAAAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:74453719_T_A:74453719:0,3,0,1
chr4	74453726	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:74453719_T_A:74453719:0,3,0,1
chr4	74464285	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24,22;MFRL=0,136,143;MMQ=60,60,60;MPOS=11,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=TG;STR;TLOD=3.19,6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.334,0.506:3:0,0,0:0,1,1:0,0,3,0
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.861:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	74486232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	74702790	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,3:4,0:5,6,2,1
chr4	74713812	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74713812_G_T:74713812:0,0,0,1
chr4	74713820	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=71,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74713812_G_T:74713812:1,0,0,1
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	74714073	.	A	AAGAGAGAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=AG;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:3,7,1,1
chr4	74714098	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,4,10
chr4	74735244	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,11:0,2:0,0,5,8
chr4	74864325	.	TC	CT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:74864325_TC_CT:74864325:4,3,1,1
chr4	74864328	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=145,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:2,0:0|1:74864325_TC_CT:74864325:4,3,1,1
chr4	74864333	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:2,2:1,0:0|1:74864325_TC_CT:74864325:2,2,1,1
chr4	74864334	.	C	CGGCTGCGGCGG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:3,2:1,0:0|1:74864325_TC_CT:74864325:2,2,1,1
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	75167567	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:2,4,0,2
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	75673345	.	C	CTTTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:75673345_C_CTTTT:75673345:0,4,0,1
chr4	75673348	.	T	TGTTATAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:75673345_C_CTTTT:75673345:0,3,0,1
chr4	75673350	.	C	CAGTGATG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:75673345_C_CTTTT:75673345:0,3,0,1
chr4	75673351	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:75673345_C_CTTTT:75673345:0,3,0,1
chr4	75681217	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:2,7,3,1
chr4	75695343	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=112,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:8,8,0,4
chr4	75938236	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:5,2,2,6
chr4	75938339	.	G	GAATGTTCACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	76416779	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=112,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:5,7:7,12:7,5,12,7
chr4	76419364	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=113,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,3:12,0:15,12,0,3
chr4	76446921	.	G	GATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=ATT;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:1,1:7,4:8,0,4,2
chr4	76447160	.	A	ATCTTTCTTTTAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	76532494	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr4	76571714	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	76572191	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:4,1,4,0
chr4	76573918	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=58,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:76573918_A_AC:76573918:1,1,0,1
chr4	76573922	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=58,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:76573918_A_AC:76573918:1,1,0,1
chr4	76580894	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr4	76715011	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,0:5,13,2,1
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr4	76721810	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:7,5:2,7:6,3,8,4
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.934:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76726528_T_C:76726528:0,0,0,1
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76726528_T_C:76726528:0,0,0,1
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.793:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	76731585	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:10,0:8,2:10,8,1,1
chr4	76734268	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=123,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,3:7,0:8,1,3,0
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.412:44:13,12:13,6:5,21,6,12
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,1
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,1
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	76805939	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=175,116;MMQ=56,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:76805939_G_GC:76805939:0,2,0,1
chr4	76805940	.	A	ACAGAATTGGTGTTAGAC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=175,116;MMQ=56,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:76805939_G_GC:76805939:0,2,0,1
chr4	76805960	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76805960_T_TG:76805960:0,0,0,1
chr4	76805962	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76805960_T_TG:76805960:0,0,0,1
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	76832383	.	TC	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	76840021	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=144,169;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:76840021_T_C:76840021:0,2,0,1
chr4	76840024	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=144,169;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:76840021_T_C:76840021:0,2,0,1
chr4	76840033	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=144,169;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:76840021_T_C:76840021:0,2,0,1
chr4	76841210	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr4	76878716	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=87,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:8,3:2,3:6,4,4,2
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr4	76878982	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:6,3,6,0
chr4	76882206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,3:8,0:7,6,3,0
chr4	76897191	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr4	76943235	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:3,1,6,1
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:2,3:4,5:1,5,1,7
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,1:0,4:0,4,1,4
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,2,5
chr4	76996957	.	CG	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr4	76997157	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.689:25:4,8:3,7:2,6,11,6
chr4	76997200	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=132,160;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.701:13:2,8:2,1:0|1:76997200_A_G:76997200:0,4,0,9
chr4	76997219	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=133,148;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.679:9:2,5:1,1:0|1:76997200_A_G:76997200:0,3,0,6
chr4	76997224	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=139,160;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0|1:76997200_A_G:76997200:0,2,0,5
chr4	76997226	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=139,160;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,4:0,1:0|1:76997200_A_G:76997200:0,2,0,5
chr4	77020236	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=205,135;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:77020236_CTT_C:77020236:0,3,0,1
chr4	77020239	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=205,135;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:77020236_CTT_C:77020236:0,3,0,1
chr4	77020242	.	CC	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=205,135;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:77020236_CTT_C:77020236:0,3,0,1
chr4	77020250	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,23;MFRL=205,135;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:77020236_CTT_C:77020236:0,3,0,1
chr4	77020252	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,24;MFRL=190,135;MMQ=35,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:77020236_CTT_C:77020236:0,2,0,1
chr4	77020265	.	GG	AC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=205,174;MMQ=40,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	77021576	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,23;MFRL=224,165;MMQ=50,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:77021576_G_A:77021576:0,2,0,1
chr4	77021579	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=25,26;MFRL=224,165;MMQ=50,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:77021576_G_A:77021576:0,2,0,1
chr4	77021581	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=224,165;MMQ=50,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:77021576_G_A:77021576:0,2,0,1
chr4	77021589	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77021591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77021593	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=30,24;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77021599	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77021603	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,22;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77021605	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,29;MFRL=251,197;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:77021589_T_G:77021589:0,1,0,1
chr4	77025840	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr4	77045915	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	77053834	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,73;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:6,1:1,1:2,5,1,1
chr4	77065476	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	77084472	.	A	AGAACTGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:4,2,1,1
chr4	77097784	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	77100807	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=120,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,3:2,3:5,2,3,3
chr4	77184898	.	G	GAAGATAGTCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=103,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:5,0:0,1:1,4,0,1
chr4	77189984	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0|1:77189984_T_C:77189984:0,4,0,2
chr4	77190009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77189984_T_C:77189984:0,3,0,1
chr4	77190012	.	A	AAACAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:77189984_T_C:77189984:0,3,0,1
chr4	77190016	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:77189984_T_C:77189984:0,2,0,1
chr4	77192688	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr4	77192714	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr4	77255356	.	T	TCCTCTTCTTGCTTTTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:77255356_T_TCCTCTTCTTGCTTTTC:77255356:0,2,0,1
chr4	77255359	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77255356_T_TCCTCTTCTTGCTTTTC:77255356:0,2,0,1
chr4	77255361	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:77255356_T_TCCTCTTCTTGCTTTTC:77255356:0,2,0,1
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=109,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr4	77283292	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=55,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,0:2,9:2,0,7,2
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr4	77317466	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,79;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:4,1,1,2
chr4	77317721	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=131,128;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:8,1:2,1:0|1:77317721_A_G:77317721:0,10,0,2
chr4	77317725	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,128;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:2,0:0|1:77317721_A_G:77317721:0,10,0,2
chr4	77631425	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:4,6:4,6:4,4,7,5
chr4	77660664	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:4,1:1,1:3,3,1,1
chr4	77660724	.	C	CCTTTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:0|1:77660724_C_CCTTTG:77660724:1,6,1,1
chr4	77660725	.	A	ACATAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:0|1:77660724_C_CCTTTG:77660724:1,6,1,1
chr4	77662361	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	77817328	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr4	77817661	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=78,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:3,0:2,2:2,3,2,0
chr4	77936247	.	A	ACCCCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=222,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77936247_A_ACCCCATT:77936247:0,1,0,1
chr4	77936248	.	G	GCTGACCAGTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=222,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:77936247_A_ACCCCATT:77936247:0,1,0,1
chr4	77949997	.	TGGTCCAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	77969825	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	77976617	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	78650306	.	T	TATTTTTGGGTATGGGGTTAGAGCAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:78650306_T_TATTTTTGGGTATGGGGTTAGAGCAGG:78650306:0,1,0,2
chr4	78650309	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:78650306_T_TATTTTTGGGTATGGGGTTAGAGCAGG:78650306:0,1,0,2
chr4	78669632	.	G	GAAATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	78694327	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,1:6,2:0,8,0,3
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.877:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	78808552	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=202,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	78830423	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=102,89;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,0:16,4:15,17,1,3
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,7:0,0:2,0,5,2
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=124,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,7:1,2:3,0,7,2
chr4	78987157	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=125,89;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:4,4:5,6:4,5,3,7
chr4	79173515	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	79186171	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr4	79186352	.	C	CCCACCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79186352_C_CCCACCA:79186352:0,2,0,1
chr4	79186355	.	A	ATCATTATCACAAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79186352_C_CCCACCA:79186352:0,2,0,1
chr4	79186357	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:79186352_C_CCCACCA:79186352:0,2,0,1
chr4	79186368	.	C	CATGACCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	79187994	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:6,0:0,2:3,3,2,0
chr4	79204208	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:79204208_TCA_T:79204208:0,2,0,1
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.774:2:0,1:0,1:1|0:79204208_TCA_T:79204208:0,0,0,2
chr4	79204211	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79204208_TCA_T:79204208:0,2,0,1
chr4	79254444	.	T	TTCCTGCATGTAGTTACATTTCTTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=124,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr4	79328727	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79328727_GT_G:79328727:0,0,1,0
chr4	79328730	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:79328727_GT_G:79328727:0,0,1,0
chr4	79334264	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=215,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:2,5:0,2:1,1,2,6
chr4	79343111	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,4:3,2:3,4,2,5
chr4	79350200	.	C	CTGTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=87,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TG;STR;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:4,3:1,3:4,1,4,2
chr4	79350346	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=122,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr4	79351505	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=100,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:2,1,2,1
chr4	79371474	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=183,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0,1,3,6
chr4	79372930	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:1,5:1,0,4,1
chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:79373254_T_C:79373254:0,0,3,0
chr4	79373276	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.404:10:1,3:5,0:1|0:79373254_T_C:79373254:6,0,4,0
chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	79387464	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr4	79391036	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	79391256	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,4,5
chr4	79391327	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=141,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	79393269	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	79393496	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr4	79403682	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=106,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,6:9,3:7,7,3,6
chr4	79403747	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=187,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr4	79410235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=113,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr4	79410247	.	G	GAGAAGAATCACTTTCCAAGCTCATTCAGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=203,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79410247_G_GAGAAGAATCACTTTCCAAGCTCATTCAGTT:79410247:0,2,0,1
chr4	79410250	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=203,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:79410247_G_GAGAAGAATCACTTTCCAAGCTCATTCAGTT:79410247:0,2,0,1
chr4	79420787	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	79420864	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr4	79420870	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.364:13:3,2:4,2:6,3,3,1
chr4	79428796	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:0,4,2,4
chr4	79430237	.	AA	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79430237_AA_TC:79430237:0,0,0,1
chr4	79430242	.	CT	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79430237_AA_TC:79430237:0,0,0,1
chr4	79432330	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=109,40;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:79432330_G_A:79432330:3,0,1,1
chr4	79432339	.	T	TGGATA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=104,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:79432330_G_A:79432330:4,0,1,1
chr4	79434650	.	GA	CC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=96,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,2:2,5,0,2
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr4	79460462	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=114,102;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:7,4,3,0
chr4	79460621	.	T	TCATACAACAACTCCATAGTGGCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:2,2,0,1
chr4	79461956	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=74,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:1,2,0,6
chr4	79512848	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79512848_A_G:79512848:0,1,0,1
chr4	79512849	.	A	ATTTTACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79512848_A_G:79512848:0,1,0,1
chr4	79516575	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:7,8,3,0
chr4	79522598	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=119,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,2,3
chr4	79525584	.	A	ATTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,1,0,1
chr4	79525590	.	CCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,1,0,1
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=113,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,2,0
chr4	79531202	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,3,2
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr4	79780921	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	79780932	.	TG	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	79782480	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=125,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,0:5,5:8,0,5,0
chr4	79792082	.	CCAG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAG;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:2,2:4,2:3,3,3,1
chr4	79793831	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:4,0:0|1:79793831_CA_TG:79793831:5,4,1,1
chr4	79793837	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=150,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:79793831_CA_TG:79793831:6,4,1,1
chr4	79793839	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=150,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:79793831_CA_TG:79793831:6,4,1,1
chr4	79793841	.	C	CCTTCAACTTCT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=150,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:2,2:8,0:0|1:79793831_CA_TG:79793831:6,4,1,1
chr4	79799992	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=118,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:10,0:4,3:7,7,2,1
chr4	80329098	.	TT	AC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:80329098_TT_AC:80329098:2,4,1,1
chr4	80329101	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:2,0:0|1:80329098_TT_AC:80329098:2,4,1,1
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	80905851	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	80905989	.	GC	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.210:22:14,3:4,1:9,9,0,4
chr4	80905990	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,18:0,6:0,0,9,15
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	80957195	.	GA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.228:21:0,1:4,0:4,12,0,5
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.577:19:2,5:5,6:6,2,7,4
chr4	80976362	.	GA	TT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=93,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:3,2:5,4,0,2
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr4	81121403	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=100,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:81121403_T_TCA:81121403:0,1,0,1
chr4	81121404	.	T	TAGTTTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=100,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:81121403_T_TCA:81121403:0,1,0,1
chr4	81124596	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,7:4,1:1,4,5,3
chr4	81884610	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=81,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.698:4:1,1:0,1:0,1,3,0
chr4	81952637	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=10,25;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.707:4:0,2:0,1:0,1,0,3
chr4	81967425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=110,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:9,3,1,2
chr4	81967587	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,0:1,3,1,1
chr4	82013619	.	AAAGGAAGG	A,AAAGGAAGGAAGG	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=24,20,22;MFRL=55,111,121;MMQ=50,60,47;MPOS=23,15;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=AAGG;STR;TLOD=13.56,13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,6:0.313,0.537:13:1,5,3:1,0,2:0,2,1,10
chr4	82025691	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	82058647	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.558:23:7,9:3,3:5,5,4,9
chr4	82064077	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.190:29:8,0:15,5:9,15,2,3
chr4	82074941	.	C	CACTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	82092835	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=110,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:4,2,2,0
chr4	82092870	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=156,84;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,0:3,7:3,2,4,3
chr4	82092967	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr4	82355209	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:82355209_T_C:82355209:0,1,0,1
chr4	82355211	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:82355209_T_C:82355209:0,1,0,1
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,24;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,3,1
chr4	83276430	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.887:16:0,7:1,7:1,0,14,1
chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,5:5,6:2,6,1,10
chr4	83372457	.	A	AATTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:83372457_A_AATTT:83372457:0,4,0,1
chr4	83372458	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:83372457_A_AATTT:83372457:0,4,0,1
chr4	83424089	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:2,2:3,1:4,1,3,1
chr4	83425860	.	C	CTAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:83425860_C_CTAA:83425860:0,0,0,1
chr4	83425862	.	T	TAGCTTTG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:83425860_C_CTAA:83425860:0,0,0,1
chr4	83425864	.	TAC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=193,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:83425860_C_CTAA:83425860:0,1,0,1
chr4	83425870	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=193,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83425860_C_CTAA:83425860:0,1,0,1
chr4	83425871	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=193,92;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83425860_C_CTAA:83425860:0,1,0,1
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	83626429	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=105,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:1,2:4,6:4,2,6,2
chr4	83626658	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr4	83748517	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr4	83748696	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:8,12,1,1
chr4	83748715	.	G	GGGTTTTTCTAATTTTAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:9,10,1,1
chr4	83778378	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=228,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	83778731	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83778731_C_T:83778731:0,1,1,0
chr4	83778733	.	ATAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:83778731_C_T:83778731:0,1,1,0
chr4	83778740	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	83791649	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	83838865	.	T	TAGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:83838865_T_TAGA:83838865:4,6,1,1
chr4	83838867	.	T	TTGTAATAGGCACCTTAAAGTTGTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:83838865_T_TAGA:83838865:4,6,1,1
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr4	83860760	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=108,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,2:15,1:22,7,2,1
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	83971219	.	CAGGAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83971219_CAGGAA_C:83971219:0,1,0,1
chr4	83971226	.	CAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,32;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83971219_CAGGAA_C:83971219:0,1,0,1
chr4	83971230	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:83971219_CAGGAA_C:83971219:0,0,0,1
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	83989571	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.603:10:4,1:0,3:2,2,5,1
chr4	83989583	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:7,3,2,0
chr4	83989659	.	A	AGACAGACCACAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:6,6,0,2
chr4	83996453	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=106,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:4,5,1,2
chr4	84015768	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:4,0,7,0
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr4	84231773	.	CAT	GGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,126;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:84231773_CAT_GGA:84231773:4,0,1,0
chr4	84231781	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.488:8:2,0:2,3:0|1:84231773_CAT_GGA:84231773:4,0,4,0
chr4	84232084	.	TGTATTTAAAAGCAAACATATAGCA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.526:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	84358305	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	84362443	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,9:3,3:4,4,8,4
chr4	84364751	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr4	84364770	.	AAAACAC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	84368253	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368253_T_C:84368253:0,0,0,1
chr4	84368256	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368253_T_C:84368253:0,0,0,1
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:4,4:5,3:2,8,2,5
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=76,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.759:9:0,3:2,4:1,1,1,6
chr4	84375194	.	AG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	84381035	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	84382058	.	CA	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.562:27:6,3:5,12:7,5,7,8
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:3,7,4,3
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr4	84515968	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:5,2,3,0
chr4	84518558	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:4,5:8,4:7,6,8,1
chr4	84519775	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29,20;MFRL=97,134,85;MMQ=60,60,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.06,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,6:0.263,0.361:16:1,1,3:4,3,3:5,1,7,3
chr4	84525973	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr4	85525331	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr4	85552882	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	85560000	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=90,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TA;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:0,1:3,0:2,1,2,1
chr4	85564391	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	85612737	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr4	85614167	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.215:26:18,0:1,5:5,16,0,5
chr4	85625692	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85625692_G_GAA:85625692:0,1,0,1
chr4	85625694	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85625692_G_GAA:85625692:0,1,0,1
chr4	85625697	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=230,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85625692_G_GAA:85625692:0,1,0,1
chr4	85634488	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	85636553	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=33295152,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:85636553_GA_G:85636553:1,1,1,1
chr4	85636556	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=33295152,65;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:85636553_GA_G:85636553:1,1,1,1
chr4	85636558	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=33295152,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:85636553_GA_G:85636553:1,1,1,1
chr4	85636562	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=33295152,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:85636553_GA_G:85636553:1,1,0,1
chr4	85647941	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	85654804	.	GAGTAAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGTAAC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	85657326	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=94,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:9,8,1,2
chr4	85660125	.	A	ACATTGTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=89,3016;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,488;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	85699873	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85699873_A_C:85699873:0,1,0,1
chr4	85699875	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:85699873_A_C:85699873:0,1,0,1
chr4	85704293	.	GAAACC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	85704313	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85704313_T_TTG:85704313:0,1,0,1
chr4	85704315	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=20,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85704313_T_TTG:85704313:0,1,0,1
chr4	85704317	.	A	AAGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:85704313_T_TTG:85704313:0,1,0,1
chr4	85704319	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85704313_T_TTG:85704313:0,0,0,1
chr4	85704322	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:85704313_T_TTG:85704313:0,0,0,1
chr4	85710824	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,5:0,10:0,0,11,8
chr4	85717864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=126,148;MMQ=60,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:5,0:9,3:6,8,0,4
chr4	85717885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=127,148;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:2,8,0,4
chr4	85730914	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	85741360	.	C	CAGATATA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:85741360_C_CAGATATA:85741360:0,4,1,1
chr4	85741362	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:85741360_C_CAGATATA:85741360:0,4,1,1
chr4	85741363	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:85741360_C_CAGATATA:85741360:0,4,0,1
chr4	85741368	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:85741360_C_CAGATATA:85741360:0,4,0,1
chr4	85762282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr4	86643155	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,2,3
chr4	86844948	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	86863166	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=106,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:0,2:2,2:1,1,3,1
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:1,6:3,4:1,3,7,3
chr4	86863516	.	T	TTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86863516_T_TTTA:86863516:0,0,0,1
chr4	86863518	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:86863516_T_TTTA:86863516:0,0,0,1
chr4	86915981	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=109,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:6,10,0,3
chr4	86916357	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=136,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,4:3,0:7,5,3,1
chr4	86988884	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:9,0:0,4:4,6,2,2
chr4	87019843	.	G	GGAGAAATATGGTAGTGAGTGGATGGAGAGCTTGAAGGGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,163;MMQ=60,36;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	87638368	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:87638368_G_GTT:87638368:0,0,0,1
chr4	87638370	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:87638368_G_GTT:87638368:0,0,0,1
chr4	87643538	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.228:15:7,1:5,2:6,6,1,2
chr4	87653953	.	A	ACTTAAAGCCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=134,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	87653958	.	T	TAAACGGCA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	87654006	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87654006_T_TC:87654006:0,1,0,1
chr4	87654009	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87654006_T_TC:87654006:0,1,0,1
chr4	87656066	.	G	GTTTGTTTTTTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0,7,0,2
chr4	87662692	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:87662692_T_G:87662692:2,0,1,0
chr4	87662694	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:87662692_T_G:87662692:2,0,1,0
chr4	87671710	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,5:8,0:7,3,5,0
chr4	87689089	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,71;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:10,2:9,9,1,1
chr4	87695741	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:87695741_G_T:87695741:1,2,0,1
chr4	87695748	.	A	AATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=905,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:87695741_G_T:87695741:1,0,0,1
chr4	87735593	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:4,0:6,2:6,4,0,2
chr4	87735763	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=115,125;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:87735763_G_T:87735763:1,5,0,2
chr4	87735768	.	C	CCCCCGCAGCTCCTGCACCCCACCATCCACCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=115,125;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:87735763_G_T:87735763:1,5,0,2
chr4	87809387	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr4	88005419	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=153,127;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr4	88035616	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:88035616_C_T:88035616:1,2,1,0
chr4	88035619	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:88035616_C_T:88035616:1,2,1,0
chr4	88048163	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr4	88048328	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	88048863	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:2,6,5,2
chr4	88052219	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr4	88053085	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	88055888	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88055888_G_GTTT:88055888:0,1,0,1
chr4	88055889	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88055888_G_GTTT:88055888:0,1,0,1
chr4	88056719	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.917:14:0,6:1,7:0,1,8,5
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	88056949	.	T	TGCTGTTGAGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	88085088	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:7,5,1,1
chr4	88099742	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=42,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,0:3,4:7,1,2,2
chr4	88106754	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,92;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:5,0:4,4:4,5,1,4
chr4	88116724	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,0:2,6:0,6,0,6
chr4	88226396	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:2,0,1,1
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr4	88231338	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.540:18:4,4:1,4:0|1:88231338_G_GA:88231338:5,3,7,3
chr4	88231339	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.540:18:3,5:2,4:0|1:88231338_G_GA:88231338:5,3,7,3
chr4	88231392	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=91,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.348:41:14,5:13,9:8,19,4,10
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	88258483	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,6:0,0,9,9
chr4	88261828	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	88293992	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.771:7:0,3:1,3:0,1,2,4
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	88295993	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr4	88312266	.	T	TTGAGATGGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:88312266_T_TTGAGATGGA:88312266:0,4,0,1
chr4	88312268	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=155,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:88312266_T_TTGAGATGGA:88312266:0,4,0,1
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	88356053	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=183,146;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.542:5:1,2:1,1:0|1:88356053_A_G:88356053:2,0,3,0
chr4	88356060	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.466:6:2,2:1,1:0|1:88356053_A_G:88356053:3,0,3,0
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	88379144	.	GA	TC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=130,87;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:1,0:3,2:0|1:88379144_GA_TC:88379144:1,3,0,2
chr4	88379153	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=130,87;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:88379144_GA_TC:88379144:0,3,0,2
chr4	88379160	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=130,87;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:88379144_GA_TC:88379144:0,3,0,2
chr4	88379162	.	C	CTTTGCACTGATGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=130,87;MMQ=60,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:88379144_GA_TC:88379144:0,3,0,1
chr4	88379166	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=122,87;MMQ=60,29;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:88379144_GA_TC:88379144:0,2,0,1
chr4	88394971	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	88400756	.	T	TGGATAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	88416223	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,13:0,0,5,17
chr4	88533441	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:88533441_T_C:88533441:0,0,5,0
chr4	88533445	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:88533441_T_C:88533441:0,0,5,0
chr4	88535305	.	ATCAAAAGATAATGGCAATGGCAGTGAC	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:6,1:9,0:0|1:88535305_ATCAAAAGATAATGGCAATGGCAGTGAC_A:88535305:10,6,3,0
chr4	88535348	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:0|1:88535305_ATCAAAAGATAATGGCAATGGCAGTGAC_A:88535305:6,2,3,0
chr4	88535832	.	A	ATAGCAGTGACAGCAGCAG	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,92;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAGCAGTGACAGCAGCAG;STR;TLOD=92.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.929:27:1,8:0,5:1,0,13,13
chr4	88536316	.	TAGC	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=99,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGC;STR;TLOD=101.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:0,10:1,0,17,8
chr4	88536362	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,9:0,19:0,0,18,11
chr4	88536692	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=29732417,99;MMQ=33,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.896:18:0,10:1,2:2,0,14,2
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	88580678	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=126,74;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.141:20:5,1:11,1:0|1:88580678_A_AT:88580678:4,14,0,2
chr4	88580681	.	A	AATGGAGTGGAATTGTGAGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=125,74;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:3,1:12,1:0|1:88580678_A_AT:88580678:3,14,0,2
chr4	88583341	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=92,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:88583341_T_A:88583341:1,3,1,0
chr4	88583344	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=92,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:88583341_T_A:88583341:1,3,1,0
chr4	88583387	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:88583387_CA_C:88583387:0,0,0,1
chr4	88583390	.	GGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:88583387_CA_C:88583387:0,1,0,1
chr4	88583397	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:88583387_CA_C:88583387:1,1,0,1
chr4	88584438	.	ACCAAGATGACAATGACTG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr4	88731997	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88731997_AA_GC:88731997:0,1,0,1
chr4	88731999	.	C	CTGGTGGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:88731997_AA_GC:88731997:0,1,0,1
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	88732531	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,6,6
chr4	88732692	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,20:0,0,15,20
chr4	88733118	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:88733118_C_A:88733118:1,2,0,1
chr4	88733119	.	G	GTAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:88733118_C_A:88733118:1,2,0,1
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr4	88973140	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:4,3,2,0
chr4	88986521	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:7,6:3,3:9,3,6,3
chr4	88987022	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=114,91;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:88987022_G_A:88987022:3,5,0,2
chr4	88987046	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=126,91;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:0|1:88987022_G_A:88987022:1,4,0,2
chr4	88989084	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:11,1,1,1
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chr4	88996867	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88996867_T_A:88996867:0,0,0,1
chr4	88996872	.	CTAATAAGTGAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88996867_T_A:88996867:0,0,0,1
chr4	88996889	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:88996867_T_A:88996867:0,0,0,1
chr4	89015803	.	C	CAATTTTCCAATATTTTTAAAACACTCTTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=141,46;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:3,3:9,0:0|1:89015803_C_CAATTTTCCAATATTTTTAAAACACTCTTT:89015803:5,7,2,1
chr4	89015805	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=141,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.231:15:3,1:8,0:0|1:89015803_C_CAATTTTCCAATATTTTTAAAACACTCTTT:89015803:5,7,2,1
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,3,11
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,2:2,0,5,0
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr4	89036023	.	AAGCCACATTTTAATT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=113,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:3,1,1,1
chr4	89060872	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	89381178	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:6,1,2,1
chr4	89383606	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89383606_A_T:89383606:0,1,0,1
chr4	89383607	.	T	TTCTTTCCCTTTCTTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89383606_A_T:89383606:0,1,0,1
chr4	89384802	.	T	TTCACAGGCCATCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:89384802_T_TTCACAGGCCATCTG:89384802:0,3,0,1
chr4	89384805	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:89384802_T_TTCACAGGCCATCTG:89384802:0,3,0,1
chr4	89400435	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=159,124;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:89400435_C_CA:89400435:1,0,2,0
chr4	89400457	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=102,124;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:0|1:89400435_C_CA:89400435:1,2,2,0
chr4	89400468	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=102,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:1,1:2,3,3,0
chr4	89414221	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=111,38;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:14,9,1,1
chr4	89414340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=122,127;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,0:5,5:0|1:89414340_C_T:89414340:2,9,0,5
chr4	89414345	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=124,127;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,0:5,5:0|1:89414340_C_T:89414340:2,8,0,5
chr4	89571150	.	G	GAATT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	89589293	.	C	CTTCAGCTACATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89589293_C_CTTCAGCTACATT:89589293:0,1,0,1
chr4	89589299	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89589293_C_CTTCAGCTACATT:89589293:0,1,0,1
chr4	89591324	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:7,8,0,2
chr4	89625646	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,3,0
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:1,2:2,3:3,1,3,2
chr4	89660208	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:11,6:13,0:13,11,5,1
chr4	89668106	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:5,6,0,2
chr4	89669079	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=132,190;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:89669079_C_T:89669079:0,4,0,1
chr4	89669081	.	C	CATCAGCTAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=157,110;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1|0:89669079_C_T:89669079:0,4,0,1
chr4	89669083	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=157,110;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:4,1:0,0:1|0:89669079_C_T:89669079:0,4,0,1
chr4	89669101	.	CAC	TGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=153,190;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89669079_C_T:89669079:0,1,0,1
chr4	89680148	.	GTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=102,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89680148_GTC_G:89680148:0,1,0,1
chr4	89680152	.	CAGCTGCTAATG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=102,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89680148_GTC_G:89680148:0,1,0,1
chr4	89702564	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	89711849	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0|1:89711849_T_C:89711849:1,2,1,1
chr4	89711854	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:89711849_T_C:89711849:1,2,1,1
chr4	89726073	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=100,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,2:4,2:10,0,2,3
chr4	89726283	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	89744242	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	90169067	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=136,134;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:0|1:90169067_C_T:90169067:1,8,0,4
chr4	90169069	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,134;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:0|1:90169067_C_T:90169067:1,8,0,4
chr4	90833281	.	T	TATCATTTTTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	90856112	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:0|1:90856112_T_C:90856112:6,8,1,1
chr4	90856116	.	A	AAGCATTAATGTACTGAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:0|1:90856112_T_C:90856112:6,8,1,1
chr4	91321314	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr4	91737018	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:6,0:0,2:1,5,1,2
chr4	93225785	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=88,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:6,1,3,3
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr4	94316763	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr4	94411978	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94411978_G_A:94411978:0,1,0,1
chr4	94411981	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:94411978_G_A:94411978:0,2,0,1
chr4	94411986	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:94411978_G_A:94411978:0,2,0,1
chr4	94436654	.	T	TAAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:94436654_T_TAAC:94436654:0,0,0,1
chr4	94436655	.	T	TGGAAAAAGTTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0|1:94436654_T_TAAC:94436654:0,0,0,1
chr4	94693644	.	A	AGCCCTACACACCCCCAGCCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr4	94750768	.	T	TGATGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=105,67;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr4	94750770	.	C	CCTCAACCTCCTGAGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=105,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:3,4,1,1
chr4	94751674	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,4,6
chr4	94751710	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr4	95147328	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:12,0:19,3:20,11,3,0
chr4	95170923	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=122,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr4	95170953	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr4	95185829	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,4:3,1:7,1,5,0
chr4	95194740	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=107,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,1:3,6:2,1,3,4
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,12,10
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:6,7,3,2
chr4	95506293	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=172,187;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,5:0,2:0,5,0,7
chr4	95506827	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,4:6,4:4,8,4,4
chr4	95508108	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=72,134;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,2:2,0:0|1:95508108_C_CT:95508108:2,4,2,0
chr4	95508128	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=85,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.243:29:7,4:11,2:0|1:95508108_C_CT:95508108:2,20,7,0
chr4	95508130	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=26,15;MFRL=85,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.256:29:5,0:15,1:2,20,7,0
chr4	95508281	.	CTT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.129:20:9,1:7,1:3,15,0,2
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	95578588	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,12,6
chr4	95585038	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	95585284	.	ATTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	96073956	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	96090629	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=686,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96090629_T_C:96090629:1,0,0,1
chr4	96090631	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=686,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96090629_T_C:96090629:1,0,0,1
chr4	96090635	.	T	TTTCAAAAATAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=686,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:96090629_T_C:96090629:1,0,0,1
chr4	96091250	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr4	96091524	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	96127869	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=82,86;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:1,2:4,3:3,3,2,3
chr4	96137259	.	GAAAAAGC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:0,0:0|1:96137259_GAAAAAGC_G:96137259:3,2,1,1
chr4	96137271	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=126,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:96137259_GAAAAAGC_G:96137259:3,1,1,1
chr4	96137274	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=126,40;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0|1:96137259_GAAAAAGC_G:96137259:3,1,1,1
chr4	96166057	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,105;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr4	96166373	.	A	ACACACTCTCTCCAATGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	96171681	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:2,5:6,4:2,6,3,6
chr4	96256673	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr4	96761648	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=103,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:5,3,0,2
chr4	99341156	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr4	99358083	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	99399748	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	99400026	.	CCCGCCGAACGACA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.711:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	99802300	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,19,16;MFRL=129,115,139;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.73,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,2:0.396,0.178:14:3,1,0:0,2,0:2,4,1,7
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	99823170	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr4	100009738	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=180,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:1,1,8,0
chr4	100045500	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,0:0,4:6,0,4,0
chr4	100045647	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,3:5,6:7,7,4,5
chr4	100047900	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	100062675	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:3,4:1,5:3,1,7,3
chr4	100065509	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	100126010	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	100130105	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr4	100131746	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	100134985	.	G	GTAGAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100134985_G_GTAGAAT:100134985:0,0,0,1
chr4	100134986	.	C	CTGCAAGAGGATATTTGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100134985_G_GTAGAAT:100134985:0,0,0,1
chr4	100134990	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100134985_G_GTAGAAT:100134985:0,0,0,1
chr4	100137292	.	ATTTTTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=48,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=23,16;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:0,1:0,4,1,0
chr4	100203773	.	C	CTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,113;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100203773_C_CTGT:100203773:0,1,0,1
chr4	100203775	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=188,113;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100203773_C_CTGT:100203773:0,1,0,1
chr4	100203777	.	A	AAGGATATTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=188,113;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100203773_C_CTGT:100203773:0,1,0,1
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,3:0,8:0|1:100205819_C_A:100205819:0,0,8,4
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0|1:100205819_C_A:100205819:0,0,6,4
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,42831;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:100212173_A_T:100212173:0,0,0,2
chr4	100212197	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,42831;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:100212173_A_T:100212173:0,0,0,2
chr4	100232053	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=150,15809;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:7,2:7,0:0|1:100232053_C_A:100232053:8,7,0,2
chr4	100232056	.	A	ATTTCTATGGGAGAGACAAAAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=148,15809;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:100232053_C_A:100232053:7,7,0,2
chr4	100239112	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,7270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	100261931	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100261931_C_A:100261931:0,0,0,1
chr4	100261933	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100261931_C_A:100261931:0,0,0,1
chr4	100264111	.	C	CCCTACTTATGCTTCACTTCAGTCTTTCTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,14589;MMQ=57,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:8,13,0,2
chr4	100264297	.	T	TAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100264297_T_TAAGTG:100264297:0,0,0,1
chr4	100264299	.	ATC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100264297_T_TAAGTG:100264297:0,0,0,1
chr4	100264303	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:100264297_T_TAAGTG:100264297:0,0,0,1
chr4	100265943	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr4	100265957	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,3:7,3:7,2,5,1
chr4	100434435	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=259,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:100434435_G_GTA:100434435:0,1,0,1
chr4	100434441	.	ACAACGC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=259,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:100434435_G_GTA:100434435:0,1,0,1
chr4	100445589	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	100475179	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=259,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	100496013	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,7725;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr4	100532253	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	100542465	.	A	AACCATCAAGGGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100542465_A_AACCATCAAGGGAC:100542465:0,2,0,1
chr4	100542469	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:100542465_A_AACCATCAAGGGAC:100542465:0,2,0,1
chr4	100542473	.	A	ACT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,22;MFRL=158,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:100542465_A_AACCATCAAGGGAC:100542465:0,2,0,1
chr4	100542482	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	100544051	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr4	100738035	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=110,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chr4	100756963	.	T	TTGTTTTGAGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=134,120;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.477:2:0,1:1,0:0|1:100756963_T_TTGTTTTGAGG:100756963:0,1,0,1
chr4	100756965	.	A	ACGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=134,120;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:100756963_T_TTGTTTTGAGG:100756963:0,1,0,1
chr4	100756967	.	C	CCTTCTATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=134,120;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100756963_T_TTGTTTTGAGG:100756963:0,1,0,1
chr4	100756971	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=134,120;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100756963_T_TTGTTTTGAGG:100756963:0,1,0,1
chr4	100784118	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=94,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:9,6:11,2:14,6,8,0
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,8:0.143:58:23,4:16,4:28,22,5,3
chr4	100784163	.	T	G	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=92,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,28:0.349:80:24,13:27,13:20,32,13,15
chr4	100806815	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:18,0:12,3:13,17,0,3
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr4	100827845	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100827845_T_A:100827845:0,0,0,1
chr4	100827848	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100827845_T_A:100827845:0,0,0,1
chr4	100870182	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:0,9,0,10
chr4	101108875	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:6,2:0|1:101108875_GT_G:101108875:2,7,1,2
chr4	101108877	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0|1:101108875_GT_G:101108875:2,7,1,2
chr4	101337150	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=99,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,5:1,1:1,1,6,0
chr4	101344183	.	T	TCTGG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=109,35;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:101344183_T_TCTGG:101344183:5,2,1,1
chr4	101344184	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=109,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:101344183_T_TCTGG:101344183:5,2,1,1
chr4	101344185	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=109,35;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:101344183_T_TCTGG:101344183:5,2,1,1
chr4	101368559	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr4	101396342	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:1,0:0,1:0|1:101396342_T_G:101396342:0,1,0,1
chr4	101396349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101396342_T_G:101396342:0,0,0,1
chr4	101396350	.	TGGACTGGCA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:101396342_T_G:101396342:0,0,0,1
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr4	102267807	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:102267807_CG_C:102267807:3,0,1,0
chr4	102267813	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:102267807_CG_C:102267807:3,0,1,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.880:6:0,3:0,3:1|0:102267807_CG_C:102267807:0,0,6,0
chr4	102783694	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,822100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:10,4,1,1
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	102942765	.	T	TTA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=113,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:3,5:1,3:0,4,2,7
chr4	103174491	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	103228545	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,1:6,2:9,2,3,0
chr4	103228628	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:6,5:11,0:9,8,5,0
chr4	103505784	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=116,669,118;MMQ=60,60,60;MPOS=12,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.86,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.339:6:2,0,1:0,2,1:2,0,3,1
chr4	103506060	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=164,221;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103506060_A_AC:103506060:0,3,0,1
chr4	103506062	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=164,221;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103506060_A_AC:103506060:0,3,0,1
chr4	103506069	.	GA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=164,221;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103506060_A_AC:103506060:0,3,0,1
chr4	103506077	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=164,221;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:103506060_A_AC:103506060:0,3,0,1
chr4	103514658	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,11,16
chr4	103514741	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=91,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,8:2,7:0,3,1,14
chr4	103518625	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr4	103527902	.	A	AAGAAACCTGGCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:103527902_A_AAGAAACCTGGCTC:103527902:0,1,0,1
chr4	103527904	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0|1:103527902_A_AAGAAACCTGGCTC:103527902:0,1,0,1
chr4	103528288	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=121,39;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,1:6,0:0|1:103528288_C_G:103528288:8,3,1,1
chr4	103528291	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=121,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:0|1:103528288_C_G:103528288:8,3,1,1
chr4	103531692	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	103534560	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr4	103534700	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:4,3:11,2:8,8,3,2
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr4	103555992	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr4	103556302	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	103610872	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,1:0,5:0,3,2,4
chr4	103720251	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:103720251_C_CCT:103720251:0,0,0,1
chr4	103720255	.	CA	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103720251_C_CCT:103720251:0,0,0,1
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,2:7,8:3,7,4,6
chr4	103747541	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:3,4:6,0,6,2
chr4	103789782	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:4,1,7,0
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:8,5:1,5:8,1,7,3
chr4	103790022	.	C	CTGTCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	103822404	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,138;MMQ=31,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:7,4,1,1
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=98,103;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:6,4,3,4
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:7,10,6,10
chr4	103911046	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=106,111;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:5,5,2,0
chr4	103911069	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	103979219	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:103979219_G_A:103979219:0,2,0,1
chr4	103979224	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:103979219_G_A:103979219:0,1,0,1
chr4	103988810	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	104004064	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:4,3,3,1
chr4	104027533	.	C	CGGTGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr4	104027534	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104027534_A_C:104027534:0,4,0,1
chr4	104027535	.	G	T,GACACACA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,21,31;MFRL=182,167,129;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,1,1:1,0,0:0,3,0,2
chr4	104027536	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104027534_A_C:104027534:0,4,0,1
chr4	104027548	.	A	AAAGATACAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	104053909	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:4,0:10,4:6,10,0,4
chr4	104054117	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TA;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	104054833	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr4	104065388	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,179;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	104082307	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=114,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:16,2:5,0:14,9,1,1
chr4	104097278	.	TAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:0,1:1,0:0|1:104097278_TAAAA_T:104097278:0,1,0,1
chr4	104097285	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:0,1:1,0:0|1:104097278_TAAAA_T:104097278:0,1,0,1
chr4	104097288	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.512:2:0,1:0,0:0|1:104097278_TAAAA_T:104097278:0,1,0,1
chr4	104117436	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=136,118;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.275:5:3,1:1,0:0|1:104117436_C_CA:104117436:0,4,0,1
chr4	104117441	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104117441_A_T:104117441:0,4,0,1
chr4	104117442	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=136,118;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104117436_C_CA:104117436:0,4,0,1
chr4	104117443	.	G	GACTCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104117441_A_T:104117441:0,4,0,1
chr4	104117444	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,22;MFRL=136,118;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:104117436_C_CA:104117436:0,4,0,1
chr4	104117451	.	A	AGACCTACAATCCATGAACTGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=57,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	104119452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:8,8,1,2
chr4	104510766	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	105412971	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105412971_G_A:105412971:0,0,0,1
chr4	105412990	.	G	GGCTGCTGCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105412971_G_A:105412971:0,0,0,1
chr4	105412994	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:105412971_G_A:105412971:0,0,0,1
chr4	106159644	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr4	106160542	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=143,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.264:12:5,0:4,3:6,3,2,1
chr4	106160771	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,67;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:106160771_G_GA:106160771:4,7,1,1
chr4	106160788	.	G	GTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,67;MMQ=60,25;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.180:14:6,0:4,2:0|1:106160771_G_GA:106160771:3,9,1,1
chr4	106163109	.	TTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:0,1,1,8
chr4	106307629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=101.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,8:0,0,21,3
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.884:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=106,108;MMQ=53,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr4	106359230	.	G	GGACAAAACACTACTAAAGAAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=143,106;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106359230_G_GGACAAAACACTACTAAAGAAAA:106359230:0,3,0,1
chr4	106359232	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=143,106;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:106359230_G_GGACAAAACACTACTAAAGAAAA:106359230:0,3,0,1
chr4	106359235	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=143,106;MMQ=60,53;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:106359230_G_GGACAAAACACTACTAAAGAAAA:106359230:0,3,0,1
chr4	106370502	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.087:66:28,4:33,1:15,46,0,5
chr4	106377990	.	T	TATCAAATAGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	106474096	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,4,11
chr4	106510470	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	106534691	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,0:2,6:0,3,0,6
chr4	106640447	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:106640447_C_A:106640447:1,0,0,1
chr4	106640450	.	G	GAAGAAATAACACAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:106640447_C_A:106640447:1,0,0,1
chr4	106819053	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:8,2:4,3:8,5,3,2
chr4	106859668	.	A	AGTGTTGCAATCCTAGTCTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	106863658	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=106,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:10,3:16,9,0,3
chr4	106880364	.	CT	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:106880364_CT_AA:106880364:0,0,0,1
chr4	106880367	.	C	CACAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:106880364_CT_AA:106880364:0,0,0,1
chr4	107092169	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	107115960	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=106,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,3:6,5:3,10,4,4
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=105,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	107156585	.	G	GCTCATAAAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:107156585_G_GCTCATAAAA:107156585:0,3,0,1
chr4	107156587	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:107156585_G_GCTCATAAAA:107156585:0,3,0,1
chr4	107156590	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=143,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:107156585_G_GCTCATAAAA:107156585:0,3,0,1
chr4	107156594	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:0|1:107156594_G_A:107156594:0,2,0,1
chr4	107156596	.	A	ATATTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:107156594_G_A:107156594:0,2,0,1
chr4	107157699	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=113,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr4	107168506	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	107171637	.	TAAATA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:3,3:3,5:1,5,2,6
chr4	107216286	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=149,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr4	107216371	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=149,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:1,2:1,3,2,0
chr4	107246136	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:6,4:10,6:10,6,5,5
chr4	107257975	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr4	108578174	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=123,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:12,0:14,4:7,19,0,4
chr4	108581168	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=121,63;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:3,3,0,2
chr4	108581179	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=110,63;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr4	108603314	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	108820870	.	CTTAGAAGAAATCAGGCAAACAGTTATTGATCACTTACCCTGTATTATACATTCTTCTAGACACTTCCCTATGTG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.348:8:2,1:2,2:0,5,2,1
chr4	108824642	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	108831779	.	T	TACACAGTGGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	108871324	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=136,636;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr4	108935770	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=277,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,2:0,2,3,3
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	108944821	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	108985388	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	108991974	.	A	ATAGTCACTAAATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr4	108991979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	108999300	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	108999366	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	108999501	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=129,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:108999501_T_C:108999501:10,6,0,2
chr4	108999507	.	C	CCCTGCCCCCACCTTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=137,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:108999501_T_C:108999501:9,6,0,2
chr4	108999546	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:5,0:5,7,1,1
chr4	109010207	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	109576843	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:1,4,1,4
chr4	109578572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr4	109669067	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	109670669	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:109670669_A_AC:109670669:0,2,0,1
chr4	109670670	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,30;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:109670669_A_AC:109670669:0,2,0,1
chr4	109670674	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=175,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:109670669_A_AC:109670669:0,2,0,1
chr4	109677715	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,20;MFRL=150,94;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:109677715_A_T:109677715:1,2,1,1
chr4	109677720	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,29;MFRL=137,94;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:109677715_A_T:109677715:0,2,0,1
chr4	109677724	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=137,94;MMQ=60,36;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:109677715_A_T:109677715:0,2,0,1
chr4	109677731	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,26;MFRL=137,94;MMQ=60,36;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:109677715_A_T:109677715:0,2,0,1
chr4	109677742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=150,94;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109677742_T_C:109677742:0,1,0,1
chr4	109677746	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=150,94;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109677742_T_C:109677742:0,1,0,1
chr4	109677751	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=150,94;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109677742_T_C:109677742:0,1,0,1
chr4	109681121	.	A	AAAT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:109681121_A_AAAT:109681121:0,4,0,1
chr4	109681123	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:109681121_A_AAAT:109681121:0,4,0,1
chr4	109681149	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,31;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109681149_AG_GT:109681149:0,1,0,1
chr4	109681154	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109681149_AG_GT:109681149:0,1,0,1
chr4	109681155	.	CAAACAAACA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109681149_AG_GT:109681149:0,1,0,1
chr4	109683943	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=109,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:4,8,3,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,4:0,15:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,5,14
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:109735133_T_C:109735133:0,0,2,12
chr4	109740566	.	CAACAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740566_CAACAA_C:109740566:0,1,0,1
chr4	109740572	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740566_CAACAA_C:109740566:0,1,0,1
chr4	109748227	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr4	109762918	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	109767438	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=172,265;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr4	109767453	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	109769844	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	109782004	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,2,2
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr4	109783565	.	TAAAACATGA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:3,1,1,0
chr4	109790319	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=110,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.425:48:9,10:16,10:3,25,9,11
chr4	109790346	.	C	CAATA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=108,172;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AATA;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr4	109790377	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=139,108;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0,7,0,6
chr4	109810988	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	109895432	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=117,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr4	110384830	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr4	110448386	.	AAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,160;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.351:4:1,1:1,0:0|1:110448386_AAAG_A:110448386:3,0,1,0
chr4	110448393	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=146,160;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.351:4:2,0:1,0:0|1:110448386_AAAG_A:110448386:3,0,1,0
chr4	110448678	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:110448678_C_T:110448678:0,0,0,1
chr4	110448683	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110448678_C_T:110448678:0,0,0,1
chr4	110454731	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=99,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,3:4,0:7,3,3,0
chr4	110580310	.	C	CCATCATAGAGTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=232,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	110581299	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=210,223;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,0,4
chr4	110581324	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=116,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.582:8:1,4:1,1:3,0,3,2
chr4	110581363	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=110,107;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:10,3:5,6:10,5,5,5
chr4	110603900	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:110603900_T_C:110603900:0,2,0,1
chr4	110603903	.	G	GTTGACACTCCAAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:110603900_T_C:110603900:0,2,0,1
chr4	110603906	.	AG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:110603900_T_C:110603900:0,2,0,1
chr4	110606344	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:110606344_C_T:110606344:0,0,1,0
chr4	110606367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:110606344_C_T:110606344:2,0,1,0
chr4	110606394	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	110618699	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=160,165;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr4	110618703	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=160,21009447;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.249:9:2,2:5,0:0|1:110618703_A_G:110618703:7,0,1,1
chr4	110618707	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=160,21009447;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.277:8:2,2:4,0:0|1:110618703_A_G:110618703:6,0,1,1
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,4,3
chr4	110619602	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110619602_C_T:110619602:0,0,0,1
chr4	110619610	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110619602_C_T:110619602:0,1,0,1
chr4	110619613	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:110619602_C_T:110619602:0,1,0,1
chr4	110624447	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:3,5,4,0
chr4	110638951	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110638951_T_C:110638951:0,0,0,1
chr4	110638953	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110638951_T_C:110638951:0,0,0,1
chr4	110638957	.	T	TGGATTTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:110638951_T_C:110638951:0,0,0,1
chr4	110670581	.	ATCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	110678819	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,2:7,2:7,5,3,1
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,7
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,3
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr4	110687943	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=85,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr4	110723157	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,103;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:8,0:19,2:10,17,0,2
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr4	110737582	.	TGGGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110737582_TGGGGG_T:110737582:0,1,0,1
chr4	110737593	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:110737582_TGGGGG_T:110737582:0,1,0,1
chr4	110743598	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr4	110743697	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr4	110786517	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=72,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr4	110790911	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:1,0,1,5
chr4	110864521	.	GG	AA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.131:21:12,2:5,0:0|1:110864521_GG_AA:110864521:11,8,0,2
chr4	110864526	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,21;MFRL=115,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,2:5,0:0|1:110864521_GG_AA:110864521:11,9,0,2
chr4	110902149	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr4	110929290	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=109,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr4	110980657	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=13,24;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:110980657_A_ACT:110980657:1,0,0,1
chr4	110980660	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:110980657_A_ACT:110980657:1,0,0,1
chr4	110980664	.	A	ATTGCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:110980657_A_ACT:110980657:2,0,0,1
chr4	110980665	.	A	ATGTGTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:110980657_A_ACT:110980657:2,0,0,1
chr4	110980667	.	T	TGGGAAGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:110980657_A_ACT:110980657:2,0,0,1
chr4	111397972	.	GCA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=150,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:111397972_GCA_G:111397972:3,0,1,1
chr4	111397978	.	C	CTCGGTCCTTCTGTCCACTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,55;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:0|1:111397972_GCA_G:111397972:3,0,1,1
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr4	111409671	.	CGTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=104,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GTTT;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,1:1,1:2,1,2,0
chr4	111412396	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:111412396_T_C:111412396:0,1,0,2
chr4	111412407	.	T	TCTTTCTTTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:111412396_T_C:111412396:0,1,0,2
chr4	111480943	.	AAATTT	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=167,170;MMQ=52,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	111480964	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=183,170;MMQ=46,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111480964_A_G:111480964:0,2,0,1
chr4	111480970	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=183,170;MMQ=46,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111480964_A_G:111480964:0,2,0,1
chr4	111480973	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=183,170;MMQ=46,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111480964_A_G:111480964:0,2,0,1
chr4	111480979	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=183,170;MMQ=46,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111480964_A_G:111480964:0,2,0,1
chr4	111480981	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=183,170;MMQ=46,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:111480964_A_G:111480964:0,2,0,1
chr4	111539780	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:3,4,0,2
chr4	111539928	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111539928_C_T:111539928:0,1,0,1
chr4	111539932	.	GA	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111539928_C_T:111539928:0,1,0,1
chr4	111539941	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:111539928_C_T:111539928:0,1,0,1
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr4	113176004	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=171.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,15:0,24:0,0,25,16
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,1,2
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,1,2
chr4	113187731	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr4	113199075	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr4	113299091	.	C	CTCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113299091_C_CTCT:113299091:0,0,0,1
chr4	113299093	.	GG	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113299091_C_CTCT:113299091:0,0,0,1
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	113346996	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	113347609	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:1,2:3,2:6,2,3,1
chr4	113350415	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	113359869	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=142,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:113359869_A_C:113359869:0,4,0,1
chr4	113359873	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=142,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:113359869_A_C:113359869:0,4,0,1
chr4	113359875	.	T	TTAAATTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:113359869_A_C:113359869:0,3,0,1
chr4	113359883	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	113362450	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr4	113362463	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=59,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr4	113460927	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,3,1
chr4	113460944	.	GAAGCACCCCAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,0,1
chr4	113509134	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	113530489	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.130:43:9,5:29,0:27,11,2,3
chr4	113530699	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:113530699_CA_TG:113530699:0,4,0,1
chr4	113530704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:113530699_CA_TG:113530699:0,4,0,1
chr4	113533796	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:4,5:7,3:3,8,0,8
chr4	113567405	.	CA	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=183,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113567405_CA_TC:113567405:2,0,1,0
chr4	113567416	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:113567405_CA_TC:113567405:3,0,1,0
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=105,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:1,4:4,2:4,1,3,3
chr4	113578326	.	TTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,21,27;MFRL=123,130,108;MMQ=60,60,60;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,16;RU=TG;STR;TLOD=10.20,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,3:0.232,0.334:12:3,4,2:1,1,1:4,0,6,2
chr4	113970965	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:8,1:14,7,2,0
chr4	114161710	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114161710_C_T:114161710:0,1,0,1
chr4	114161719	.	G	GAACTTTTTTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114161710_C_T:114161710:0,1,0,1
chr4	114163409	.	T	TGGAGGCTTTGTTCGTTTCTTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=117,63;MMQ=60,46;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr4	114179437	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr4	114179602	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=108,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:5,7,1,1
chr4	114179646	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:114179646_T_G:114179646:0,2,0,2
chr4	114179649	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:114179646_T_G:114179646:0,2,0,1
chr4	114204050	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114204050_C_T:114204050:0,0,0,1
chr4	114204057	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114204050_C_T:114204050:0,0,0,1
chr4	114204059	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114204050_C_T:114204050:0,0,0,1
chr4	114253259	.	T	TGACTACTTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=83,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.355:6:3,2:1,0:0|1:114253259_T_TGACTACTTG:114253259:3,1,1,1
chr4	114253262	.	C	CTTTTGAGTTTTTCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=83,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:114253259_T_TGACTACTTG:114253259:3,1,0,1
chr4	114256902	.	GCACTT	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114256910	.	GTTCATTATTAA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114256923	.	CGAGCGAATGAGT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114256938	.	GCTA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114256943	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114256947	.	CTGTTAGA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:114256902_GCACTT_G:114256902:0,0,1,0
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	114279454	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,4:4,0:6,7,4,0
chr4	114286429	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	114375697	.	A	ATTGCCGT,AAACTGGTGCCAAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20,24;MFRL=153,68,83;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.12,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.326,0.222:6:1,2,1:2,0,0:0,3,1,2
chr4	114375698	.	A	ATCCCAATCAGCT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.365:6:1,1:1,0:0,4,1,1
chr4	114386843	.	TA	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=153,219;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:114386843_TA_CG:114386843:0,4,0,1
chr4	114386846	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=158,219;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114386843_TA_CG:114386843:0,3,0,1
chr4	114386865	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=158,219;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	114386871	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=158,219;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	114458697	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114458697_T_TTTA:114458697:0,1,0,1
chr4	114458698	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114458697_T_TTTA:114458697:0,1,0,1
chr4	114582933	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.415:14:7,3:1,3:1,7,2,4
chr4	114823437	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	115544004	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:7,2:8,0:5,10,3,0
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	115597503	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115597503_A_C:115597503:0,1,0,1
chr4	115597509	.	TCTAACAGCTACTAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:115597503_A_C:115597503:0,1,0,1
chr4	115856443	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=133,44;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:5,3,0,2
chr4	118005343	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	118006162	.	A	ACAAACAACCCCATAAACAAATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:0,3:1,6:1,0,9,1
chr4	119036005	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:5,3:10,0:8,7,3,1
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	119174640	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32,33;MFRL=107,130,146;MMQ=48,60,60;MPOS=7,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=6.11,23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,11:0.237,0.586:18:0,2,6:2,1,5:2,1,14,1
chr4	119176850	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=95,107;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:4,6,0,2
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,12:0,0,26,5
chr4	119609182	.	CTTTTT	C,CTTTT,CTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,32,28,20;MFRL=0,148,84,70;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,28,31;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,12,16,18;RU=T;STR;TLOD=6.62,4.49,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,2:0.230,0.290,0.382:6:0,1,1,0:0,1,1,1:0,0,1,5
chr4	119609253	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=76,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:119609253_TG_CA:119609253:0,2,0,1
chr4	119609257	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=76,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:119609253_TG_CA:119609253:0,2,0,1
chr4	119615543	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:2,1:0|1:119615543_T_C:119615543:5,0,3,1
chr4	119615544	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.545:9:3,2:1,3:1|0:119615543_T_C:119615543:3,1,5,0
chr4	119625000	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	119666217	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:2,1:0,0:1,3,0,1
chr4	119673090	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=151,151;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr4	119736796	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=67,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:4,1:2,5,2,2
chr4	119944566	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.642:15:2,6:3,3:2,3,7,3
chr4	119948687	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119948687_A_T:119948687:0,0,0,1
chr4	119948691	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119948687_A_T:119948687:0,0,0,1
chr4	120057819	.	GT	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120057819_GT_AA:120057819:0,1,0,1
chr4	120057823	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:120057819_GT_AA:120057819:0,1,0,1
chr4	120057828	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:120057819_GT_AA:120057819:0,1,0,1
chr4	120072275	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	120085578	.	T	TGGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120085578_T_TGGTG:120085578:0,0,0,1
chr4	120085581	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120085578_T_TGGTG:120085578:0,0,0,1
chr4	120085585	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120085578_T_TGGTG:120085578:0,0,0,1
chr4	120107412	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120107412_T_A:120107412:0,0,0,1
chr4	120107414	.	TT	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:120107412_T_A:120107412:0,0,0,1
chr4	120161024	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,2:3,0:4,4,0,2
chr4	120161121	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr4	120192698	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,82;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:11,0:5,3:6,10,0,3
chr4	120194718	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr4	120194799	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=106,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:4,4,6,1
chr4	120214291	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:1,4,0,2
chr4	120241849	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr4	120422463	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=131,0;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:120422463_G_T:120422463:0,4,1,0
chr4	120422469	.	AC	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=131,0;MMQ=60,43;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:120422463_G_T:120422463:0,4,1,0
chr4	120422497	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	120422504	.	TGT	CAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	120423719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.558:14:2,4:3,1:0|1:120423719_C_T:120423719:2,4,4,4
chr4	120423729	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.557:14:2,3:3,3:0|1:120423719_C_T:120423719:1,5,4,4
chr4	120425777	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.352:21:7,4:6,3:4,10,1,6
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=106,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.527:6:1,1:1,1:2,1,0,3
chr4	120463669	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:0|1:120463669_G_A:120463669:3,9,1,2
chr4	120463674	.	C	CTTAACG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:6,1:0|1:120463669_G_A:120463669:3,7,1,2
chr4	120481431	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=108,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,6:6,3:7,4,5,4
chr4	120486402	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr4	120517708	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:120517708_A_G:120517708:4,5,1,1
chr4	120517713	.	T	TGACGTTGGCCTTGATCCCATCCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:4,2:0|1:120517708_A_G:120517708:4,5,1,1
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:2,2:1,5:3,0,6,1
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=105,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.554:36:6,10:9,9:9,7,14,6
chr4	121616222	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=80,602;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:3,2,0,2
chr4	121675879	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121675879_TG_T:121675879:0,0,0,1
chr4	121675881	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121675879_TG_T:121675879:0,0,0,1
chr4	121719580	.	CTA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:2,2,0,1
chr4	121720941	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	121720960	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	121737709	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:7,7,2,1
chr4	121738117	.	AA	CC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:121738117_AA_CC:121738117:1,3,0,2
chr4	121738122	.	CT	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:121738117_AA_CC:121738117:1,3,0,2
chr4	121739411	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	121774515	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr4	121828519	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr4	121957734	.	TG	CA,CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34,30;MFRL=0,242,131;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.03,51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,17:0.130,0.826:19:0,0,11:0,2,6:0,0,12,7
chr4	121958091	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr4	121967042	.	A	AACTAATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=91,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	122254234	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:0,0:2,2:0|1:122254234_T_A:122254234:2,3,1,1
chr4	122254236	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=137,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:0|1:122254234_T_A:122254234:2,3,1,1
chr4	122254242	.	CC	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=130,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:122254234_T_A:122254234:2,2,1,1
chr4	122254245	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=130,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:122254234_T_A:122254234:2,2,0,1
chr4	122257994	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=99,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,3:11,0:6,19,1,2
chr4	122258042	.	CATGAGAGTATGACTCAGTTGAGTAAAACACATCCATGCATAATTATCTAACCCTCAAGATTCCCT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.267:10:3,0:4,2:0,8,1,1
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	122590883	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.553:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	122722684	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:122722684_C_T:122722684:6,10,0,2
chr4	122722693	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,4:0.357:12:3,2:5,2:1|0:122722684_C_T:122722684:2,6,1,3
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr4	122740110	.	T	TGCAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122740110_T_TGCAGA:122740110:0,1,0,1
chr4	122740111	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122740110_T_TGCAGA:122740110:0,1,0,1
chr4	122740115	.	A	ATATAAGTTATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:122740110_T_TGCAGA:122740110:0,1,0,1
chr4	122743865	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122743865_TG_T:122743865:0,0,0,1
chr4	122743870	.	TT	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122743865_TG_T:122743865:0,0,0,1
chr4	122743874	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122743865_TG_T:122743865:0,0,0,1
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:122749436_G_T:122749436:1,2,0,3
chr4	122749456	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,1:1|0:122749436_G_T:122749436:1,3,0,1
chr4	122749459	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:122749436_G_T:122749436:1,3,0,1
chr4	122776811	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122776811_A_G:122776811:0,0,0,1
chr4	122776822	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122776811_A_G:122776811:0,0,0,1
chr4	122782813	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr4	122784545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	123094375	.	G	GAGATAGAGTCGCGCTCTGTAGCCCAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	123113352	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr4	123128329	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=128,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:8,7,0,2
chr4	123130886	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=191,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	123167823	.	T	TTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,0:2,1:3,1,2,0
chr4	123170926	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123170926_ACC_A:123170926:0,1,0,1
chr4	123170929	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123170926_ACC_A:123170926:0,1,0,1
chr4	123170933	.	TCAAC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123170926_ACC_A:123170926:0,1,0,1
chr4	123175493	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=91,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr4	123192712	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:16,5:21,0:20,17,5,0
chr4	123222417	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:3,0,2,0
chr4	123225908	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,0,2
chr4	123246971	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.301:11:3,0:4,3:7,1,2,1
chr4	123252713	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123252713_A_C:123252713:0,1,0,1
chr4	123252717	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123252713_A_C:123252713:0,1,0,1
chr4	123264485	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=151,1112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,1,2
chr4	123271218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,0:8,3:3,11,2,1
chr4	123276905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	123283163	.	AAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,0:2,2:2,0,3,0
chr4	123301471	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0|1:123301471_T_G:123301471:0,2,0,1
chr4	123301478	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123301471_T_G:123301471:0,2,0,1
chr4	123301480	.	A	ACTGGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:123301471_T_G:123301471:0,2,0,1
chr4	123377636	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:3,0:3,4:2,4,0,4
chr4	123662997	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:8,2,6,1
chr4	123663891	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:2,0:9,2:0|1:123663891_A_T:123663891:7,6,1,1
chr4	123663896	.	G	GCTATCTAAT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=115,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:123663891_A_T:123663891:4,7,1,1
chr4	123665005	.	CAAATAAACTGGAGCAGATTCCGAGAGTTTATGACGTTGTTACACCAAAGATTGAGGCGTGGCGCCGAGCATTGGATTTAGTATTGTTAGTACTTCAGACAGACAGTG	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.057:51:6,2:6,0:26,23,1,1
chr4	123665366	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=102,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.487:31:12,8:4,7:9,7,7,8
chr4	123666156	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	123797428	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr4	123818925	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,142;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,7,8
chr4	124323738	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,19:0,17:0,0,22,15
chr4	124323783	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,145;MMQ=60,43;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,1:4,9:2,8,0,10
chr4	124324233	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:3,3:7,3:4,6,4,3
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=118,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:2,3:5,4:2,5,5,2
chr4	125590689	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=168,66;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	125592065	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=23,23;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:4,4:4,2:0|1:125592065_C_A:125592065:4,4,4,2
chr4	125592079	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,2:3,0:0|1:125592065_C_A:125592065:7,6,1,1
chr4	125592081	.	G	GACATGTTGAT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,1:3,0:0|1:125592065_C_A:125592065:6,5,1,1
chr4	126238151	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=149,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:126238151_C_T:126238151:0,1,0,1
chr4	126238154	.	GGGAGCGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:126238151_C_T:126238151:0,2,0,1
chr4	126240649	.	AT	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=145,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:1,3,2,0
chr4	126241143	.	C	CTCACCATGTCCTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr4	126315196	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,1:1,0:0|1:126315196_T_TA:126315196:1,1,0,1
chr4	126315199	.	T	TAGTAAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:0,1:1,0:0|1:126315196_T_TA:126315196:1,1,0,1
chr4	126315203	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:126315196_T_TA:126315196:1,2,0,1
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	126390010	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	126390022	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,1795;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	126402634	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=53,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr4	126412769	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,4:4,0:8,6,4,0
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	128584566	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr4	128584580	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr4	128605611	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=115,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr4	128621144	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=102,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.409:18:5,3:3,3:8,2,4,4
chr4	128621272	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,1,3
chr4	128627021	.	TTC	GAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	128629632	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	128722493	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	128739387	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	128748447	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:13,2,1,1
chr4	128802446	.	G	GGCTGAGGGTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	128811476	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:0|1:128811476_A_G:128811476:1,6,0,2
chr4	128811478	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:128811476_A_G:128811476:1,6,0,2
chr4	128811480	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=165,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:2,1:0|1:128811476_A_G:128811476:1,6,0,2
chr4	128811485	.	TAC	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:128811476_A_G:128811476:1,4,0,2
chr4	128814425	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:0,3:2,1:3,0,3,1
chr4	128815133	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	128923001	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	128995989	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	129028446	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=120,65;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:0|1:129028446_C_T:129028446:10,9,1,1
chr4	129028459	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=140,65;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,1:0|1:129028446_C_T:129028446:7,8,1,1
chr4	129028467	.	A	AAGTGTGTGTGTCTTTTT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=149,65;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:129028446_C_T:129028446:6,6,1,1
chr4	129043204	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=100,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,1:7,6:7,3,3,4
chr4	129120708	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:4,2,6,4
chr4	129192414	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,126;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,2,0
chr4	129192649	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=112,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	129193752	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	129193756	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:129193756_AA_GC:129193756:0,2,0,1
chr4	129193759	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:129193756_AA_GC:129193756:0,2,0,1
chr4	129770068	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=113,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr4	129776983	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=103,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:3,2:0,6,1,5
chr4	129777013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=143,128;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr4	129777032	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,127;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0|1:129777032_GA_G:129777032:0,6,0,2
chr4	129777042	.	AT	TC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=158,127;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,1:0|1:129777032_GA_G:129777032:0,5,0,2
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=81,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr4	129812329	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0|1:129812329_T_A:129812329:0,2,0,1
chr4	129812330	.	T	TATGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:1,1:1,0:0|1:129812329_T_A:129812329:0,2,0,1
chr4	129812334	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:0,1:1,0:0|1:129812329_T_A:129812329:0,2,0,1
chr4	129880696	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=150,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr4	129880912	.	T	TTATTATTGCCTTCCTGCTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=116,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:5,0:2,8,1,1
chr4	129891559	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,0:6,3:5,7,2,1
chr4	129913412	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:129913412_G_A:129913412:0,1,0,1
chr4	129913415	.	T	TGTTGAAGGAAATATCCTAAGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:129913412_G_A:129913412:0,1,0,1
chr4	129924977	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=81,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:2,3:1,4:1,2,5,3
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	138442624	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr4	138449999	.	A	AGGCCTTCAGACTTCTATTTCAATGCATGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=113,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr4	138453307	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	139135761	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:16,0:8,3:9,15,0,3
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	139981918	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr4	139993286	.	A	ATTGCTGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	140189775	.	ATTAGT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140189775_ATTAGT_A:140189775:1,0,1,0
chr4	140189783	.	C	CAGATGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,32;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140189775_ATTAGT_A:140189775:1,0,1,0
chr4	140189787	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140189775_ATTAGT_A:140189775:1,0,1,0
chr4	140270772	.	C	CATAACTGCAAATTGCTCAGCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr4	140272466	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:1,4,0,5
chr4	140283102	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:0,3:1,5:1,0,3,5
chr4	140283142	.	T	TTACTAATAATAGTTACTCTGACTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=81,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr4	140305884	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=217,155;MMQ=52,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140305884_GG_AA:140305884:2,0,1,0
chr4	140305887	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=217,155;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140305884_GG_AA:140305884:2,0,1,0
chr4	140305890	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=217,155;MMQ=52,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140305884_GG_AA:140305884:2,0,1,0
chr4	140305897	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=217,155;MMQ=52,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140305884_GG_AA:140305884:2,0,1,0
chr4	140305899	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=217,155;MMQ=52,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:140305884_GG_AA:140305884:2,0,1,0
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,58;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	140454550	.	A	ATGACACAGATGGGAGACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.472:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	140587263	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=23,22;MFRL=106,73;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.326:31:9,4:10,5:0|1:140587263_C_T:140587263:5,16,5,5
chr4	140587269	.	T	TGTGCGCGCGC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=93,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.277:26:8,3:7,2:0|1:140587263_C_T:140587263:3,16,3,4
chr4	140599790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=111,72;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,0:11,3:6,11,2,1
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,7:0,0,11,7
chr4	140811265	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr4	141311960	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	141321425	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	141446767	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:1,4,1,5
chr4	141448595	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.216:32:9,3:14,4:12,13,5,2
chr4	141448779	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr4	141481219	.	A	ATTGTAACTGAAGTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:141481219_A_ATTGTAACTGAAGTT:141481219:0,2,0,1
chr4	141481225	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:141481219_A_ATTGTAACTGAAGTT:141481219:0,2,0,1
chr4	141481227	.	GA	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:141481219_A_ATTGTAACTGAAGTT:141481219:0,2,0,1
chr4	141549393	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	141555062	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	141560324	.	G	GTACTA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=99,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:1,3,1,1
chr4	141560335	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=74,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:141560335_TTC_T:141560335:1,2,0,1
chr4	141560338	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,24;MFRL=74,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:141560335_TTC_T:141560335:1,2,0,1
chr4	141598262	.	A	ACATTTTTCTTATGTGAATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=103,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:141598262_A_ACATTTTTCTTATGTGAATT:141598262:0,1,0,1
chr4	141598264	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=103,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141598262_A_ACATTTTTCTTATGTGAATT:141598262:0,1,0,1
chr4	141600736	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr4	141847110	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=108,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,1:4,1:4,2,1,2
chr4	141847279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:4,2,1,2
chr4	142651159	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr4	142949864	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr4	143003117	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.264:6:2,1:1,0:5,0,1,0
chr4	143003122	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.925:12:0,7:0,4:1,0,6,5
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=102,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,1,5
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	143029419	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	143033641	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=114,48;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:1,0,2,1
chr4	143044427	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:4,1,2,1
chr4	143045759	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:143045759_G_T:143045759:9,4,1,1
chr4	143045767	.	T	TCCAGGAAGTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:3,2:0|1:143045759_G_T:143045759:7,4,1,1
chr4	143066947	.	A	AGTTGTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.290:8:2,2:4,0:0|1:143066947_A_AGTTGTG:143066947:4,2,1,1
chr4	143066950	.	T	TTCGGAACTGCTAGCAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:143066947_A_AGTTGTG:143066947:4,2,1,1
chr4	143081811	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=343,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143081811_T_TTA:143081811:1,0,0,1
chr4	143081812	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=343,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143081811_T_TTA:143081811:1,0,0,1
chr4	143081814	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=343,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:143081811_T_TTA:143081811:1,0,0,1
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	143158979	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,5,1
chr4	143181740	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=80,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,8:7,3:0|1:143181740_A_C:143181740:0,10,2,9
chr4	143181748	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.666:16:2,7:3,3:0|1:143181740_A_C:143181740:0,5,2,9
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	143326312	.	AAGAG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AG;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:0,1:0,0:3,0,0,1
chr4	143350426	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.499:14:5,0:2,7:0|1:143350426_G_A:143350426:0,7,0,7
chr4	143350433	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.532:13:4,0:1,1:0|1:143350426_G_A:143350426:0,6,0,7
chr4	143350440	.	CT	GA,GT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,31,30;MFRL=153,105,119;MMQ=60,60,60;MPOS=8,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,0:1,0,1:0,4,0,2
chr4	143350454	.	GACCAGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:2,1:1,0:0|1:143350454_GACCAGAA_G:143350454:0,3,0,1
chr4	143350462	.	TGAATAAAGAC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:143350454_GACCAGAA_G:143350454:0,2,0,1
chr4	144107351	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:144107351_ATT_A:144107351:1,4,0,2
chr4	144107358	.	C	CACTCAGTTCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:144107351_ATT_A:144107351:1,3,0,2
chr4	144107362	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:144107351_ATT_A:144107351:1,3,0,1
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr4	144141615	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,1:13,3:6,13,1,3
chr4	144381679	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:144381679_T_TC:144381679:0,2,0,1
chr4	144381682	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:144381679_T_TC:144381679:0,2,0,1
chr4	144381712	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=201,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144381712_A_C:144381712:0,1,0,1
chr4	144381714	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=201,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:144381712_A_C:144381712:0,1,0,1
chr4	144442487	.	T	TCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:144442487_T_TCA:144442487:0,0,1,0
chr4	144442488	.	G	GCAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:144442487_T_TCA:144442487:0,0,1,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,3,3
chr4	144465096	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:5,12,0,2
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	144798074	.	A	AGCTCTCCCTAAGTTTTGTCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	144798093	.	T	TATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:144798093_T_TATA:144798093:0,1,0,1
chr4	144798098	.	TC	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:144798093_T_TATA:144798093:0,2,0,1
chr4	144801662	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,134;MMQ=60,48;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:11,2:14,3:0|1:144801662_C_G:144801662:10,15,0,5
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=112,120;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,2:14,0:0|1:144801662_C_G:144801662:10,16,0,2
chr4	144917499	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=134,151;MMQ=53,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,0:4,9:4,4,0,9
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=148,115;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.773:5:0,3:0,1:0,1,4,0
chr4	144918877	.	C	CATCATCCTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	144920638	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:145041011_AC_A:145041011:0,0,0,1
chr4	145041021	.	AT	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:145041011_AC_A:145041011:0,0,0,1
chr4	145041577	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,102;MMQ=52,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:4,1,2,1
chr4	145041686	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	145041707	.	CT	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,134;MMQ=60,37;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,3,0
chr4	145041750	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,3,1
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,4,1
chr4	145580701	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	145916505	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=200,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr4	146025712	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146025712_A_G:146025712:0,1,0,1
chr4	146025714	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146025712_A_G:146025712:0,1,0,1
chr4	146025718	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:146025712_A_G:146025712:0,1,0,1
chr4	146025721	.	A	AACAAAAGAACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=119,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:146025712_A_G:146025712:0,1,0,1
chr4	146031677	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=150,116;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:0|1:146031677_G_A:146031677:0,10,0,2
chr4	146031678	.	G	GTACA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=150,116;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:146031677_G_A:146031677:0,10,0,2
chr4	146031707	.	AACCT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:0|1:146031707_AACCT_A:146031707:0,3,0,1
chr4	146031712	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:146031707_AACCT_A:146031707:0,3,0,1
chr4	146033368	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.568:5:1,3:0,0:1,1,3,0
chr4	146042445	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:4,6:7,8:5,6,8,6
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.351:21:6,2:8,5:11,3,4,3
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,10:0,17:0,0,17,10
chr4	146048554	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr4	146058959	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=107,105;MMQ=52,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:7,0:6,3:7,6,2,1
chr4	146059841	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	146076632	.	TAA	T,TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,27,27;MFRL=126,193,87;MMQ=60,60,60;MPOS=13,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.08,13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,7:0.158,0.429:16:2,1,3:5,1,4:3,4,2,7
chr4	146080577	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr4	146086269	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,3:6,5:8,5,7,1
chr4	146463795	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=125,66;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.240:12:4,2:3,0:0|1:146463795_G_T:146463795:5,5,1,1
chr4	146463811	.	A	AGTTATCATCTGTTGTGGTTTCTCTTCTTCTTTTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=82,66;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:10,0:0|1:146463795_G_T:146463795:6,8,1,1
chr4	146467966	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=163,73;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,0:9,3:8,11,1,2
chr4	146572271	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr4	146617857	.	T	TCCAAGAGCATTTTAAGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=95,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.482:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	146650449	.	A	ATTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,160;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=24,28;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.786:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr4	146695865	.	G	GAACAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	146744684	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	146767125	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:4,0:8,3,1,1
chr4	146806762	.	CAGAGAGAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=AG;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.734:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	146813306	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146813306_C_CAG:146813306:1,0,1,0
chr4	146813307	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146813306_C_CAG:146813306:1,0,1,0
chr4	147104263	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	147108381	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr4	147110652	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	147215049	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	147438353	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=188,167;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	147438357	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=168,186;MMQ=45,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	147438362	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=187,147;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	147438380	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,15;MFRL=188,147;MMQ=60,30;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	148461037	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=94,65;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:3,5,1,1
chr4	148539086	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:7,4:0,5:6,2,7,2
chr4	148546018	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:5,8,1,1
chr4	148555486	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=124,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:0|1:148555486_T_A:148555486:6,5,1,1
chr4	148555495	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:0|1:148555486_T_A:148555486:5,9,1,1
chr4	148555674	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148555674_A_G:148555674:0,1,0,1
chr4	148555676	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148555674_A_G:148555674:0,1,0,1
chr4	148555679	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148555674_A_G:148555674:0,1,0,1
chr4	148555684	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148555674_A_G:148555674:0,1,0,1
chr4	148555685	.	C	CCCCAACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:148555674_A_G:148555674:0,1,0,1
chr4	148564160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=169,235;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	148564180	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=137,235;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	148564192	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=235,137;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	148604884	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.637:19:3,4:2,1:3,4,5,7
chr4	148604886	.	G	A,T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,25,20;MFRL=0,147,103;MMQ=60,60,60;MPOS=3,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.32,22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,15:0.348,0.614:22:0,3,4:0,2,4:0,0,8,14
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.926:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	148827697	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=108,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,9,5
chr4	148827973	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	148886159	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.190:27:9,3:13,2:13,9,4,1
chr4	148944467	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:1,5,7,3
chr4	148968047	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=111,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr4	148984415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=79,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:4,7,1,1
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	149356324	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:4,6,1,4
chr4	149357044	.	G	GTCAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:149357044_G_GTCAA:149357044:3,7,1,1
chr4	149357045	.	G	GATACCAC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:149357044_G_GTCAA:149357044:3,7,1,1
chr4	149357049	.	G	GATGC	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=137,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:149357044_G_GTCAA:149357044:2,7,1,1
chr4	149357051	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=148,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,1:6,0:0|1:149357044_G_GTCAA:149357044:2,6,1,1
chr4	151141978	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=121,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151141978_G_GT:151141978:0,1,0,1
chr4	151141979	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=121,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151141978_G_GT:151141978:0,1,0,1
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,0:0|1:151161470_A_G:151161470:0,0,5,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0|1:151161470_A_G:151161470:0,0,7,3
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0|1:151161470_A_G:151161470:0,0,8,3
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.886:14:0,4:1,8:0,1,0,13
chr4	151604954	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151604954_A_AC:151604954:0,1,0,1
chr4	151604955	.	A	AGAATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:151604954_A_AC:151604954:0,1,0,1
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.223:23:8,0:8,5:3,15,1,4
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr4	151772109	.	TAGCAAAGTAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:151772109_TAGCAAAGTAAA_T:151772109:0,3,0,1
chr4	151772123	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:151772109_TAGCAAAGTAAA_T:151772109:0,2,0,1
chr4	151773150	.	CA	TT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:4,2:6,0:0|1:151773150_CA_TT:151773150:8,3,0,2
chr4	151773153	.	A	ATTTTATTTATATTAAAGGTTTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:151773150_CA_TT:151773150:8,3,0,2
chr4	151821425	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,29;MFRL=84,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151821425_A_T:151821425:1,2,0,1
chr4	151821427	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,28;MFRL=84,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151821425_A_T:151821425:1,2,0,1
chr4	151821429	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,29;MFRL=84,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151821425_A_T:151821425:1,2,0,1
chr4	151821447	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,23;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151821447_A_AC:151821447:2,0,0,1
chr4	151821450	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,29;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151821447_A_AC:151821447:2,0,0,1
chr4	151821452	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151821447_A_AC:151821447:2,0,0,1
chr4	151821459	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr4	151830075	.	GG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	151850212	.	T	TGCTTGTTCTCCACACTGTAGGCAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=18,28;MFRL=125,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:2,2,0,1
chr4	151850246	.	A	ACTTCATGTCAAAACTTGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=142,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=118.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,7:0,12:0,0,22,5
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	152049310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,2:1,0:2,0,1,1
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	152064993	.	ATAAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:3,0,0,1
chr4	152069406	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=9,20;MFRL=174,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=AC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr4	152086844	.	G	GGGTTTCAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=57,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:152086844_G_GGGTTTCAGA:152086844:1,3,0,1
chr4	152086848	.	T	TCAGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=57,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:152086844_G_GGGTTTCAGA:152086844:1,3,0,1
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGGT;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	152203315	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=105,56;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,2:10,0:0|1:152203315_T_C:152203315:11,4,1,1
chr4	152203337	.	T	TGACATATGAAACAACCCTTCTCTCTGC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:0|1:152203315_T_C:152203315:5,8,1,1
chr4	152212486	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=102,105;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,1:5,7:3,5,2,6
chr4	152212662	.	T	TCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=227,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr4	152507998	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=93,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0|1:152507998_G_GCA:152507998:1,1,0,1
chr4	152508014	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=145,255;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:152507998_G_GCA:152507998:0,3,0,1
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,1:2,4:0,5,1,4
chr4	152571254	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=132,111;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:6,2:1,0:5,3,2,0
chr4	152571278	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,111;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:4,7,2,0
chr4	152571364	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:9,3:7,4,0,3
chr4	152571814	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,15;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571817	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=20,26;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571818	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571821	.	A	AATGG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,26;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571827	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571829	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152571814_A_AT:152571814:0,2,0,1
chr4	152571840	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	152583779	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr4	152583907	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=108,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.681:13:1,4:2,3:1,3,6,3
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr4	152629122	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,1,1
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=97,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:7,1:1,4:5,3,5,0
chr4	153245445	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=109,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,3:5,0:9,9,2,1
chr4	153252061	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr4	153268227	.	CA	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,2:3,1:1,4,3,1
chr4	153271281	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:9,0:23,5:16,16,0,5
chr4	153332607	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:14,0:7,2:0|1:153332607_C_T:153332607:12,10,1,1
chr4	153332625	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=116,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:12,0:7,1:0|1:153332607_C_T:153332607:13,9,1,1
chr4	153549728	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:2,3:3,0:0|1:153549728_AAAAAAAAAAAAAAAAAC_A:153549728:3,2,1,2
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,5:0.871:5:0,1:0,3:1|0:153549728_AAAAAAAAAAAAAAAAAC_A:153549728:0,0,2,3
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=77,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,7:3,4:2,4,2,9
chr4	153750918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	153793528	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr4	153831227	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:8,1,0,2
chr4	153864190	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr4	153889265	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=116,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:2,1,0,3
chr4	153889304	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:0,2,0,2
chr4	153895868	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:4,6,2,1
chr4	154191710	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=121,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	154197042	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:7,2,1,1
chr4	154249742	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,4:8,0:8,4,4,0
chr4	154276771	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:5,1,5,2
chr4	154502143	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:12,0:0,2:0,12,0,2
chr4	154502520	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:5,1,2,0
chr4	154513620	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,6:8,0:6,8,6,0
chr4	154513773	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154513773_GT_G:154513773:0,1,0,1
chr4	154513776	.	CT	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154513773_GT_G:154513773:0,1,0,1
chr4	154513781	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:154513773_GT_G:154513773:0,0,0,1
chr4	154523606	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154523606_G_GC:154523606:1,0,0,1
chr4	154523609	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=274,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:154523606_G_GC:154523606:1,1,0,1
chr4	154523611	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=274,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154523606_G_GC:154523606:1,1,0,1
chr4	154523613	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=274,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:154523606_G_GC:154523606:1,1,0,1
chr4	154543995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	154544103	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:4,4,0,2
chr4	154553833	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=99,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:6,2:8,4:9,5,4,2
chr4	154555325	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=118,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:5,2:8,1,2,0
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.397:10:4,4:2,0:4,2,1,3
chr4	154631634	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=91,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:4,2,1,6
chr4	154633734	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:4,4:1,2:1,4,2,4
chr4	154633790	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154633790_A_AAAG:154633790:0,1,0,1
chr4	154633791	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154633790_A_AAAG:154633790:0,1,0,1
chr4	154633793	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:154633790_A_AAAG:154633790:0,1,0,1
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,21671669;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	154669993	.	C	CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,12;RU=A;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:0|1:154669993_C_CAAAA:154669993:1,8,1,3
chr4	154670013	.	AAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1|0:154669993_C_CAAAA:154669993:0,2,0,2
chr4	154670024	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1|0:154669993_C_CAAAA:154669993:0,2,0,2
chr4	154670031	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,1:2,0:1|0:154669993_C_CAAAA:154669993:0,2,0,2
chr4	154707105	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr4	155181008	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,189;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AAAC;STR;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,2:0,9:0,0,9,2
chr4	155241619	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:12,6,2,0
chr4	155241830	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=61.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.896:16:0,8:0,7:0,1,13,2
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,6,8
chr4	155244486	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=90,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,1:1,2:2,2,3,2
chr4	155250915	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	155278359	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:6,4,2,0
chr4	155287317	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr4	155295162	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:155295162_A_T:155295162:1,2,0,1
chr4	155295164	.	A	ATTGTTGAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:155295162_A_T:155295162:1,2,0,1
chr4	155295169	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:1,1:3,0:0|1:155295162_A_T:155295162:1,3,0,1
chr4	155305670	.	C	CACCAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:155305670_C_CACCAAG:155305670:0,2,0,1
chr4	155305671	.	T	TTCCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=151,78;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:155305670_C_CACCAAG:155305670:0,2,0,1
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr4	155457781	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr4	155462148	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:4,1,5,0
chr4	155465701	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:2,9,0,2
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,6:0,3:3,0,8,1
chr4	155467186	.	CATATAATA	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=161,46;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:155467186_CATATAATA_C:155467186:3,4,1,1
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:1,3,1,1
chr4	155467195	.	GTTATAAAGAAATTTTAAAAAGAAAAAATGTGAACAGTGAAATATGCTTTTAAGATCTTTGTAAT	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=138,46;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.070:42:1,0:4,2:0|1:155467186_CATATAATA_C:155467186:25,14,2,1
chr4	155469959	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,0:2,2:3,1,1,2
chr4	155487758	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,3:2,0:0|1:155487758_T_G:155487758:3,5,3,0
chr4	155487760	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:0|1:155487758_T_G:155487758:3,5,3,0
chr4	155489736	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=229,198;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.492:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	155489745	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=229,198;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	155505837	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:155505837_A_T:155505837:3,6,0,2
chr4	155505841	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:6,2:0|1:155505837_A_T:155505837:3,7,0,2
chr4	155506969	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=156,302;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,1:3,2,2,0
chr4	155507085	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,2:2,0:3,1,2,0
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=109,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:3,1:1,4:3,1,5,0
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,422;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	155533544	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:8,0:11,5:9,10,0,5
chr4	155719919	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	155720678	.	C	CTGTCTCCAAGTGTTTTCTTTATTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:3,2,1,1
chr4	156135783	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=117,21809277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr4	156273840	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:156273840_C_G:156273840:0,4,0,1
chr4	156273842	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:156273840_C_G:156273840:0,4,0,1
chr4	156273844	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,26;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:156273840_C_G:156273840:0,4,0,1
chr4	156273869	.	T	C,TTTTTTCC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,33,14;MFRL=119,156,158;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,0:1,1,0:0,1,0,2
chr4	156273873	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156273873_T_C:156273873:0,2,0,1
chr4	156273875	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156273873_T_C:156273873:0,2,0,1
chr4	156273877	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=25,15;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0,2,0,1
chr4	156273879	.	T	C,TTCTTCTTCTTTA	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=0,28,28;MFRL=119,156,158;MMQ=60,60,60;MPOS=6,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr4	156273883	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:156273873_T_C:156273873:0,1,0,1
chr4	156274458	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=117,63;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,3:10,0:2,17,2,1
chr4	156276788	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr4	156276841	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr4	156283302	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	156283321	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=70,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:156283321_C_T:156283321:0,2,0,1
chr4	156283323	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=70,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156283321_C_T:156283321:0,2,0,1
chr4	156283330	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=70,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:156283321_C_T:156283321:0,2,0,1
chr4	156289900	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr4	156289917	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=93,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:6,5:2,1:5,3,3,3
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:4,5,4,1
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,1:0,0,3,2
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr4	156760140	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	156763430	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:5,3:2,0:0|1:156763430_G_A:156763430:5,3,2,1
chr4	156763432	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:4,1:3,0:0|1:156763430_G_A:156763430:5,3,2,1
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr4	156826268	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:12,0:9,15,4,0
chr4	156831362	.	A	AATGGAATGGAAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=101,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,2:3,0:4,6,1,1
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	156838568	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:3,4,6,2
chr4	156839462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:0|1:156847230_A_G:156847230:0,1,2,4
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:0|1:156847230_A_G:156847230:0,1,2,5
chr4	156847256	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	157732198	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,0:13,3:4,12,0,3
chr4	157891839	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	157999315	.	TT	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157999315_TT_CA:157999315:0,0,0,1
chr4	157999318	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157999315_TT_CA:157999315:0,0,0,1
chr4	158065038	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,9:0,0,14,12
chr4	158065127	.	CTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=114,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr4	158065136	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=133,109;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	158073881	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,0:2,2:5,3,2,0
chr4	158074078	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr4	158091755	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:158091755_A_AT:158091755:5,4,1,1
chr4	158091759	.	AG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=98,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:5,1:0|1:158091755_A_AT:158091755:5,4,1,1
chr4	158238830	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,24;MFRL=116,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,0:8,4:7,4,2,2
chr4	158255251	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	158255253	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	158255255	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	158255259	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	158255260	.	C	CTGAAATTTTAG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	158255262	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=140,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0|1:158255251_T_A:158255251:0,8,1,1
chr4	159076679	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	159091854	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=89,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:3,3,2,0
chr4	159136353	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,0:6,6:9,2,2,4
chr4	159520531	.	G	GCTTAGTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=74,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:159520531_G_GCTTAGTA:159520531:5,4,1,1
chr4	159520533	.	T	TTCCG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=74,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,1:0|1:159520531_G_GCTTAGTA:159520531:5,4,1,1
chr4	159554678	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr4	159601809	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=109,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:2,7,0,2
chr4	159611562	.	GGATGGTGCACCAAAGGTAAACCTTTTTAATAGTTACGTGCTTAATAAAGCGACAAACAACAGAAAGAACTGTGTGGGCATCAAAGTGAAACCCCATCTCTCCAAAAAAAGAAAACAAA	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.057:52:22,2:7,0:24,25,1,2
chr4	159627527	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:159627527_A_G:159627527:0,1,0,1
chr4	159627533	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159627527_A_G:159627527:0,1,0,1
chr4	159631703	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,26;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr4	159780775	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:13,0:13,6:0|1:159780775_C_T:159780775:16,13,0,6
chr4	159780778	.	TTTTATGTCAGCCGTTTGATGGAAGCTCTGGGAGAATTCAGGTAAAGTGGCAAAGTTTGGCAAATCCAACAGGAGATG	T	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=117,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,6:0.140:48:14,0:13,6:0|1:159780775_C_T:159780775:16,26,0,6
chr4	159780906	.	GC	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:159780906_GC_TA:159780906:0,1,0,1
chr4	159780913	.	A	AGCTGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,23;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:159780906_GC_TA:159780906:0,1,0,1
chr4	159791552	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=131,77;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:6,1:0|1:159791552_G_T:159791552:5,6,0,2
chr4	159791555	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=112,77;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:5,1:0|1:159791552_G_T:159791552:5,6,0,2
chr4	159791557	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=107,77;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:2,1:8,1:0|1:159791552_G_T:159791552:5,7,0,2
chr4	159894199	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	160189222	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,36;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr4	160225430	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,3,1
chr4	160253759	.	A	ACG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=87,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:160253759_A_ACG:160253759:4,8,1,1
chr4	160253760	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=87,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:0|1:160253759_A_ACG:160253759:4,8,1,1
chr4	160253762	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=102,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:2,0:0|1:160253759_A_ACG:160253759:5,8,1,1
chr4	160253767	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=102,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:160253759_A_ACG:160253759:5,8,1,1
chr4	160253769	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=102,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,1:3,0:0|1:160253759_A_ACG:160253759:5,8,1,1
chr4	160260349	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=115,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:3,6,3,0
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,1:1,7:1,2,4,4
chr4	162380457	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:162380457_G_C:162380457:1,1,0,1
chr4	162380461	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:162380457_G_C:162380457:1,1,0,1
chr4	162380565	.	A	AATTCCAAATATTGGGCTATTTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr4	162463668	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:5,2:0,7:3,2,4,5
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr4	164048319	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr4	164048342	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=151,158;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:164048342_T_C:164048342:0,4,0,1
chr4	164048351	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=151,158;MMQ=52,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:164048342_T_C:164048342:0,4,0,1
chr4	164087801	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.292:28:8,0:11,7:10,10,5,3
chr4	164247327	.	GACACAGTGATTGAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr4	164394308	.	A	ATGGAGCTGGGCAGCCGGCCTCAAGGGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	164394778	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:164394778_C_T:164394778:0,2,1,0
chr4	164394783	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:164394778_C_T:164394778:0,2,1,1
chr4	164394792	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:164394778_C_T:164394778:1,2,1,1
chr4	164507104	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.861:5:0,0:0,4:0,0,3,2
chr4	165981266	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=105,135;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:11,2,2,0
chr4	165981279	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=104,135;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:11,0:15,5,2,0
chr4	166009546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,152;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,4:2,0:3,0,0,4
chr4	166150086	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=101,128;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,4:13,1:5,19,0,5
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	166243082	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	166307575	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	166336316	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:2,3,3,0
chr4	166336382	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:2,4,3,5
chr4	166385770	.	T	TTTCTCTTTTTCTTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:166385770_T_TTTCTCTTTTTCTTCTTC:166385770:0,1,0,1
chr4	166385777	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:166385770_T_TTTCTCTTTTTCTTCTTC:166385770:0,1,0,1
chr4	166385779	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:166385770_T_TTTCTCTTTTTCTTCTTC:166385770:0,1,0,1
chr4	166946418	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr4	167012250	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.798:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	167012505	.	C	CTTGATGCTGCTCAATCTCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=131,104;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:167012505_C_CTTGATGCTGCTCAATCTCA:167012505:0,4,0,1
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,31;MFRL=104,131;MMQ=53,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	167012508	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=131,104;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:167012505_C_CTTGATGCTGCTCAATCTCA:167012505:0,4,0,1
chr4	167012511	.	A	ACTAAAGGCC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=131,104;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:167012505_C_CTTGATGCTGCTCAATCTCA:167012505:0,4,0,1
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	167020663	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=107,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:9,5:3,1:4,8,3,3
chr4	167833965	.	TC	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167833965_TC_CA:167833965:0,1,0,1
chr4	167833969	.	CTA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:167833965_TC_CA:167833965:0,1,0,1
chr4	167833971	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:167833965_TC_CA:167833965:0,0,0,1
chr4	167833973	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,28;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:167833965_TC_CA:167833965:0,1,0,1
chr4	167833975	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=21,24;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:167833965_TC_CA:167833965:0,1,0,1
chr4	167833979	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:167833965_TC_CA:167833965:0,0,0,1
chr4	167983848	.	A	ATGGGAAGAATGAGACTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=160,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	167983866	.	G	GAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167983866_G_GAA:167983866:0,0,0,1
chr4	167983869	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167983866_G_GAA:167983866:0,0,0,1
chr4	167983872	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:167983866_G_GAA:167983866:0,0,0,1
chr4	169049361	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr4	169060814	.	T	TAGTAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	169083757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=85,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:5,3,6,4
chr4	169105880	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,2,0,1
chr4	169105882	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,28;MFRL=198,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,2,0,1
chr4	169105886	.	TGAG	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,3,0,1
chr4	169105890	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,29;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,3,0,1
chr4	169105892	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,26;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,3,0,1
chr4	169105899	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:169105880_TG_T:169105880:0,3,0,1
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=78.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,17:0,5:0,0,18,5
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,3,5
chr4	169190129	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,19,30;MFRL=84,155,140;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.57,5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.338,0.379:8:1,1,1:1,0,1:0,2,1,5
chr4	169194583	.	TAATAGAGAGAGGTGA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.513:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:5,2,4,3
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr4	169299700	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169299700_T_G:169299700:0,0,0,1
chr4	169299702	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169299700_T_G:169299700:0,0,0,1
chr4	169300775	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=104,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	169305786	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=148,145;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr4	169312798	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=199,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:0,1:0,1:0,3,1,1
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	169317082	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=190,11767;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr4	169325282	.	T	TA,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=18,23,15;MFRL=131,126,162;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.72,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,3:0.509,0.303:11:1,3,0:0,1,1:0,2,1,8
chr4	169337982	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169337982_A_T:169337982:0,0,0,1
chr4	169337985	.	T	TTCTTACTTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169337982_A_T:169337982:0,0,0,1
chr4	169343736	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=126,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:7,2:0|1:169343736_A_G:169343736:8,7,0,2
chr4	169343741	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=127,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:0|1:169343736_A_G:169343736:8,8,0,2
chr4	169344727	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0|1:169344727_A_AT:169344727:1,2,6,0
chr4	169344731	.	A	AAGAAATTCTAAAAGTAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.691:11:0,3:3,3:0|1:169344727_A_AT:169344727:1,2,7,1
chr4	169348435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:2,4,3,1
chr4	169348551	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169348551_G_GTT:169348551:0,1,0,1
chr4	169348553	.	G	GCTTATTTATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169348551_G_GTT:169348551:0,1,0,1
chr4	169348556	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=179,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:169348551_G_GTT:169348551:0,1,0,1
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	169374533	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	169383169	.	T	TGATGTGCTTGTTTCTTTTTCTCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:3,2,1,1
chr4	169393595	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=91,117;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:10,6,5,4
chr4	169433167	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	169433270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr4	169433533	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,1:2,5,2,4
chr4	169611824	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:0|1:169611824_C_T:169611824:8,8,1,1
chr4	169611846	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=81,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:0|1:169611824_C_T:169611824:8,9,1,1
chr4	169630320	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=203,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:169630320_T_A:169630320:0,4,0,1
chr4	169630322	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=203,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:169630320_T_A:169630320:0,4,0,1
chr4	169630356	.	C	CTTTTTCTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=267,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	169812225	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,61;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,0:5,2:0|1:169812225_G_T:169812225:3,9,1,1
chr4	169812230	.	G	GTACCATGTTGTTTTCATTACTATA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=135,61;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:169812225_G_T:169812225:3,8,1,1
chr4	169812232	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=135,61;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,1:0|1:169812225_G_T:169812225:3,8,1,1
chr4	169812249	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:1,2,0,6
chr4	169815910	.	A	AACGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,4,2
chr4	169835212	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=90,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169835212_T_C:169835212:0,1,0,1
chr4	169835215	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=90,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169835212_T_C:169835212:0,1,0,1
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,6:0,0,10,4
chr4	169923363	.	CAAAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=165,0;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=A;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:2,0:1,2,0,2
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,7,6
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,3:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,7,6
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,1,6
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	170043343	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=95,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.616:32:7,9:5,10:8,4,14,6
chr4	170190135	.	T	TCCCAAAATTTATCTTAAAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=101,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:1,2:6,0:0|1:170190135_T_TCCCAAAATTTATCTTAAAA:170190135:6,3,1,1
chr4	170190139	.	GC	AA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:2,1:9,0:0|1:170190135_T_TCCCAAAATTTATCTTAAAA:170190135:7,5,1,1
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	170428352	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	170483260	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=137,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:0|1:170483260_T_A:170483260:13,5,1,1
chr4	170483265	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,2:7,0:0|1:170483260_T_A:170483260:12,6,1,1
chr4	170512009	.	AATTCAAGAATATTTAGGGATGAGAGGAACTAAATCCTTAAAAAGATATTTTAGGCTACAATTTCTTTTAACTTTGTAGGCACTGACATTAAATAGAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=111,271;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	170601449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr4	170638891	.	ACT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:2,2:6,0,2,0
chr4	170640993	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=99,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:0,0:4,13:2,2,13,0
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	170994520	.	GAGTCAGTCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170994520_GAGTCAGTCA_G:170994520:0,1,0,1
chr4	170994531	.	GATT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170994520_GAGTCAGTCA_G:170994520:0,1,0,1
chr4	170994537	.	AAATGTAAGTGCTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170994520_GAGTCAGTCA_G:170994520:0,1,0,1
chr4	172735782	.	GGCTTTAATTTTCCTGCCT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=112,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:172735782_GGCTTTAATTTTCCTGCCT_G:172735782:3,7,1,1
chr4	172735803	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=111,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:2,0:6,2:0|1:172735782_GGCTTTAATTTTCCTGCCT_G:172735782:3,5,1,1
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,6,15
chr4	173269638	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:1,0,1,1
chr4	173734680	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr4	173803914	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr4	173873126	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=194,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,0,3
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr4	173942526	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	174090004	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:2,4,2,2
chr4	174169582	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174169582_G_A:174169582:0,0,0,1
chr4	174169587	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174169582_G_A:174169582:0,0,0,1
chr4	174219223	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	174235092	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:174235092_A_T:174235092:0,1,2,0
chr4	174235094	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0|1:174235092_A_T:174235092:0,1,2,0
chr4	174235393	.	G	GTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	174239704	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:1,10,2,10
chr4	174253178	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.406:40:12,7:11,9:19,5,14,2
chr4	174253422	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=114,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,3:4,3:2,6,0,7
chr4	174253938	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,7:9,5:14,2,12,0
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	174312570	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=89,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,0:1,2:0|1:174312570_G_GT:174312570:2,2,1,1
chr4	174312574	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=89,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:174312570_G_GT:174312570:2,2,0,1
chr4	174312575	.	T	TTCTATTTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=89,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:174312570_G_GT:174312570:2,2,0,1
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	175158847	.	A	ACTCTCCACGCTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=181,1491;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr4	175225452	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr4	175252556	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175414277	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:175414277_A_T:175414277:0,0,1,0
chr4	175414287	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175414277_A_T:175414277:0,0,1,0
chr4	175429808	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr4	175443156	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr4	175443424	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175564860	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	175565245	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	175580191	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=95,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:5,3:10,6:8,7,6,3
chr4	175580211	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=95,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:7,12,2,0
chr4	175598533	.	CA	TA,TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28,31;MFRL=151,162,297;MMQ=60,60,40;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.07,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,1,1:0.200,0.200:7:5,0,0:0,1,1:0,5,0,2
chr4	175598536	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=157,297;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.222:7:3,0:1,1:0,6,0,1
chr4	175649873	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=17,26;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,0:0,1:0|1:175649873_G_A:175649873:0,5,0,1
chr4	175649877	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:175649873_G_A:175649873:0,4,0,1
chr4	175649880	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:175649873_G_A:175649873:0,4,0,1
chr4	175649882	.	A	ACCCCAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:175649873_G_A:175649873:0,4,0,1
chr4	176555975	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176555975_G_GTT:176555975:1,0,0,1
chr4	176555982	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176555975_G_GTT:176555975:1,0,0,1
chr4	176555984	.	A	ACTGACGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=168,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176555975_G_GTT:176555975:1,0,0,1
chr4	176556209	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,160;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr4	176561402	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:176561402_T_C:176561402:0,4,1,1
chr4	176561404	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=143,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:176561402_T_C:176561402:0,4,1,1
chr4	176561412	.	T	TAAATTAGTAGAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=135,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0|1:176561402_T_C:176561402:0,3,1,1
chr4	176622977	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176622977_T_G:176622977:0,0,0,1
chr4	176622978	.	T	TGTGTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176622977_T_G:176622977:0,0,0,1
chr4	176733450	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,0
chr4	176733452	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,0
chr4	177041245	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=120,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr4	177049854	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,3:1,7:3,0,6,5
chr4	177049880	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=111,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:1,4:5,9:3,3,4,9
chr4	177050057	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.730:9:1,3:1,3:0|1:177050057_G_A:177050057:0,2,0,7
chr4	177050062	.	CTATCAAATAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,3:1,2:0|1:177050057_G_A:177050057:0,2,0,6
chr4	177052925	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,1,5
chr4	177058580	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	177061176	.	C	CAAAAATAAAGCAATTTAACTACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	177061192	.	A	ACACTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	177071841	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr4	177093754	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,158;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:177093754_TG_CA:177093754:0,3,0,1
chr4	177093758	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=154,158;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:177093754_TG_CA:177093754:0,3,0,1
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=110,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,3,2
chr4	177114509	.	GT	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=202,113;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr4	177142776	.	CA	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:0,5:0,1,0,6
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chr4	177608775	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	178231219	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,5,2
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	178274750	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:2,0:2,6,1,2
chr4	178281754	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	178355662	.	A	ACACATGGAGCTGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,3:0,0,8,2
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	183267728	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr4	183522255	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:5,7,2,1
chr4	183601594	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr4	183650026	.	GAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr4	183652380	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:183652380_C_T:183652380:0,0,0,1
chr4	183652384	.	C	CAACATGGTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:183652380_C_T:183652380:0,0,0,1
chr4	183664522	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:6,4:9,9:8,8,4,9
chr4	183673226	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=89,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.490:13:2,1:2,5:2,5,2,4
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,2:0,7:0,0,2,8
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr4	183694772	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr4	183710196	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	183814167	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=152,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr4	183814169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr4	183815561	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=87,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	183815800	.	C	CCAGACTGGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr4	184175037	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:4,4,0,2
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr4	184190347	.	T	TCAAGAGAATAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=178,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr4	184192183	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	184192218	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:4,5:6,0:9,1,5,0
chr4	184201909	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=71,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,2,1
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	184207270	.	G	GTCCGGACACCCGTCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:184207270_G_GTCCGGACACCCGTCAA:184207270:0,1,0,1
chr4	184207273	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:184207270_G_GTCCGGACACCCGTCAA:184207270:0,1,0,1
chr4	184366071	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=123,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:7,0:6,4:6,8,2,2
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=219,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,1:7,4:7,1,3,2
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,7,18
chr4	184432102	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=128,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:7,3:7,0:1,13,1,2
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,1:2,3:5,0,3,1
chr4	184570712	.	T	TCCTTGTGCTTTTGGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=130,121;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	184570723	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	184577066	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=123,160;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,0,2
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	184584921	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184584921_T_C:184584921:0,0,1,0
chr4	184584926	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184584921_T_C:184584921:0,0,1,0
chr4	184585305	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184585305_T_TGC:184585305:0,0,0,1
chr4	184585308	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184585305_T_TGC:184585305:0,0,0,1
chr4	184585310	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184585305_T_TGC:184585305:0,0,0,1
chr4	184587658	.	G	GTACC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TACC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	184588309	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=88,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,9:10,2:7,11,3,8
chr4	184596446	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:1,7:6,3:0,7,1,9
chr4	184596483	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr4	184607970	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	184612553	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,6:2,5:1,1,7,4
chr4	184614641	.	GAGCCTCTGCACCC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:3,0,1,0
chr4	184615948	.	TATAAAATAAGC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAAATAAGC;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.508:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	184619017	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	184619051	.	TATAA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=116,201;MMQ=39,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr4	184619052	.	A	ATATATATATATATATGTATGGTATATATATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=143,99;MMQ=49,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:2,1:0,0:0|1:184619052_A_ATATATATATATATATGTATGGTATATATATG:184619052:0,2,0,1
chr4	184619057	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=158,99;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:184619052_A_ATATATATATATATATGTATGGTATATATATG:184619052:0,3,0,1
chr4	184626121	.	TTCTGCCACAGGACCTCAGCAATGGAGAATATCCCCATCATCACAACTGTCATCAC	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.066:44:8,0:17,2:19,23,1,1
chr4	184629794	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0|1:184932609_G_A:184932609:0,0,2,8
chr4	184932631	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0|1:184932609_G_A:184932609:0,5,0,5
chr4	185038270	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:185038270_A_T:185038270:0,0,0,1
chr4	185038274	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185038270_A_T:185038270:0,0,0,1
chr4	185074686	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	185319979	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,93;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	185329244	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,108;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,2:8,0:7,2,2,0
chr4	185340789	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:185340789_GGT_G:185340789:0,1,0,1
chr4	185340797	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:185340789_GGT_G:185340789:0,1,0,1
chr4	185350307	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:5,7:8,5:1,12,6,6
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=123,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:4,4:4,1,6,0
chr4	185578229	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	185578533	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:185578533_T_C:185578533:0,3,0,1
chr4	185578535	.	TT	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:185578533_T_C:185578533:0,3,0,1
chr4	185578539	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:185578533_T_C:185578533:0,3,0,1
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr4	185583119	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:185583119_G_A:185583119:0,4,0,1
chr4	185583121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=156,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:185583119_G_A:185583119:0,4,0,1
chr4	185612627	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,5:1,5:2,1,9,1
chr4	185623359	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr4	185623656	.	G	GTTGGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185623656_G_GTTGGT:185623656:0,0,0,1
chr4	185623659	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:185623656_G_GTTGGT:185623656:0,0,0,1
chr4	185634171	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=92,990;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.449:5:0,1:2,1:1,2,0,2
chr4	185652147	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	185652224	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr4	185686952	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=134,39;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:185686952_C_CAG:185686952:6,0,1,1
chr4	185686967	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:6,2:0|1:185686952_C_CAG:185686952:11,3,1,1
chr4	185686969	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:7,2:0|1:185686952_C_CAG:185686952:12,3,1,1
chr4	185686971	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:185686952_C_CAG:185686952:12,3,1,1
chr4	185686973	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=109,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:185686952_C_CAG:185686952:12,3,1,1
chr4	185687233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	185687687	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	185694877	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.283:15:4,2:6,2:6,5,4,0
chr4	185695113	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:0|1:185695113_G_T:185695113:1,3,0,3
chr4	185695117	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0|1:185695113_G_T:185695113:1,4,0,3
chr4	185697753	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr4	185701539	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	185724474	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:7,3,2,0
chr4	185940272	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:185940272_G_GT:185940272:1,3,0,1
chr4	185940273	.	G	GGCATGGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:185940272_G_GT:185940272:1,3,0,1
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	186085421	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186085421_T_TA:186085421:0,0,0,1
chr4	186085425	.	T	TTGCTCCAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186085421_T_TA:186085421:0,0,0,1
chr4	186085430	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186085421_T_TA:186085421:0,0,0,1
chr4	186085432	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186085421_T_TA:186085421:0,0,0,1
chr4	186097219	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr4	186097272	.	T	TTTTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTC;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0|1:186097272_T_TTTTTC:186097272:0,0,0,1
chr4	186097284	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186097272_T_TTTTTC:186097272:0,0,0,1
chr4	186188362	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186188362_C_A:186188362:0,1,0,1
chr4	186188363	.	C	CAACTACTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:186188362_C_A:186188362:0,1,0,1
chr4	186241918	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:5,1:6,9,0,2
chr4	186288449	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:1,0:3,1:0|1:186288449_T_G:186288449:1,4,0,2
chr4	186288457	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=115,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.294:5:2,0:0,1:0|1:186288449_T_G:186288449:1,3,0,1
chr4	186291913	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=92,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,3:10,0:9,8,3,0
chr4	186320666	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr4	186321067	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	186321447	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	186339584	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,12:0,0,13,11
chr4	186347055	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,6,18
chr4	186347073	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	186361862	.	C	CCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,78;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:186361862_C_CCAG:186361862:0,4,0,1
chr4	186361865	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=150,78;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:186361862_C_CCAG:186361862:0,4,0,1
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	186366809	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	186370676	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.775:18:3,5:1,9:3,1,9,5
chr4	186380295	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:3,3,2,3
chr4	186382318	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:3,6,0,2
chr4	186383730	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	186383748	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:186383748_A_AG:186383748:3,1,0,1
chr4	186383750	.	G	GGCATAGTGTAAGTTTCACTTTTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:186383748_A_AG:186383748:3,1,0,1
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	186425641	.	C	CTTA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:3,0:11,2:0|1:186425641_C_CTTA:186425641:9,5,1,1
chr4	186425642	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:3,0:10,2:0|1:186425641_C_CTTA:186425641:9,5,1,1
chr4	186425644	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:8,2:0|1:186425641_C_CTTA:186425641:9,5,1,1
chr4	186427735	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	186429769	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:3,13,1,1
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:186444698_A_C:186444698:0,0,0,2
chr4	186444704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:186444698_A_C:186444698:0,0,0,2
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	186508723	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,2:5,2:5,3,3,3
chr4	186532850	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	186551624	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	186560253	.	A	AGAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	186570521	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr4	186570855	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr4	186598295	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=102,206;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,3:8,0:5,7,3,0
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:4,0:3,2:0,7,0,3
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	187074833	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.948:36:0,15:1,20:0,1,18,17
chr4	187077206	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,6:0,13:0,0,8,11
chr4	187077272	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,0:8,6:6,8,2,4
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr4	187093018	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:5,2,3,1
chr4	187113172	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr4	187118613	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=147,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:187118613_C_A:187118613:4,0,1,1
chr4	187118615	.	GCCGC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=132,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:187118613_C_A:187118613:5,0,1,1
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr4	187129995	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:6,2:3,6:5,5,6,2
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,4:3,4:0,3,7,1
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,2:2,1,4,0
chr4	187172751	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:6,10,0,2
chr4	187175722	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=60,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,3,4
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	187178472	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=111,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:9,5:26,0:22,14,5,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	187525794	.	A	AGCGAAACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr4	187533029	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=178,167;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:4,1,4,0
chr4	187538406	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=118,90;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:187538406_A_AGT:187538406:0,1,0,1
chr4	187538407	.	A	AGGTTGGAAGATGAAATGACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=118,90;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:187538406_A_AGT:187538406:0,1,0,1
chr4	187538412	.	T	TTTTATTTTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=118,90;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:187538406_A_AGT:187538406:0,1,0,1
chr4	187541131	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=99,127;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,6:1,1:3,0,3,4
chr4	187542918	.	T	TGAAAGCAGGGAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:187542918_T_TGAAAGCAGGGAC:187542918:0,0,0,1
chr4	187542921	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0|1:187542918_T_TGAAAGCAGGGAC:187542918:0,0,0,1
chr4	187549396	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=120,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:5,6,0,2
chr4	187627792	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr4	187628174	.	GACTTTCACACGATAATTAGGTGGAATAAATGTAGGTGGGTTGTCATTAACATCTTCTAGTGAT	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.098:42:13,2:11,5:12,20,6,4
chr4	187628208	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=121,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:8,6,1,3
chr4	187629095	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:5,7,2,1
chr4	187629896	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	187630037	.	AT	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr4	187630394	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr4	188925176	.	T	TGAC	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:16,5:8,4:8,17,2,7
chr4	188925339	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=175,158;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	188925384	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=157,205;MMQ=58,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:188925384_AG_CA:188925384:0,2,0,1
chr4	188925392	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=194,205;MMQ=57,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:188925384_AG_CA:188925384:0,2,0,1
chr4	188925449	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,57;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:188925449_T_A:188925449:0,0,0,1
chr4	188925451	.	T	TAGCCGA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:188925449_T_A:188925449:0,0,0,1
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr4	190862083	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,3,0
chr4	190862182	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,4:9,5:7,10,6,3
chr4	190862242	.	TG	GT	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=120,84;MMQ=60,22;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.170:27:6,4:15,1:9,13,0,5
chr4	190862259	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=121,90;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:9,1:8,1:5,12,0,2
chr4	190862268	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=122,90;MMQ=60,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:6,1:5,12,0,2
chr4	190862287	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:2,6,1,4
chr4	190873254	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.349:12:3,2:5,2:6,2,2,2
chr4	190874147	.	AT	A	.	.	DP=51;ECNT=9;MBQ=27,29;MFRL=121,134;MMQ=49,23;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:24,3:14,2:24,18,5,0
chr4	190874157	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=9;MBQ=26,31;MFRL=121,133;MMQ=48,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.115:52:31,2:14,4:26,20,6,0
chr4	190874160	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=27,25;MFRL=122,123;MMQ=48,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.162:59:27,7:18,2:33,17,4,5
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=9;MBQ=31,24;MFRL=132,119;MMQ=48,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,26:0.363:73:23,19:21,7:32,15,15,11
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=9;MBQ=26,30;MFRL=122,132;MMQ=49,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,11:0.138:84:39,9:31,2:44,29,8,3
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=101;ECNT=9;MBQ=30,24;MFRL=117,112;MMQ=49,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,14:0.151:95:45,9:36,5:53,28,6,8
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=116;ECNT=9;MBQ=23,27;MFRL=112,141;MMQ=49,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:103,13:0.118:116:54,4:44,8:0|1:190874199_T_A:190874199:57,46,12,1
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=126;ECNT=9;MBQ=24,29;MFRL=112,135;MMQ=49,42;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,15:0.130:121:62,6:43,9:0|1:190874199_T_A:190874199:59,47,14,1
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=133;ECNT=9;MBQ=30,20;MFRL=107,107;MMQ=49,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,20:0.154:124:56,10:47,10:51,53,12,8
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=118,126;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,8:0.092:95:45,4:40,4:35,52,3,5
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=87;ECNT=4;MBQ=25,25,30;MFRL=121,133,125;MMQ=40,33,40;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.25,55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,8,22:0.104,0.270:84:30,2,14:24,6,8:17,37,5,25
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=127,161;MMQ=40,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:20,0:14,3:5,30,0,3
chr4	190874370	.	CAG	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,123;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,6:8,3:4,13,0,9
chr4	190876195	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=27,22;MFRL=108,106;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.326:26:7,4:9,4:14,4,5,3
chr4	190876204	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=29,28;MFRL=109,114;MMQ=60,48;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.336:35:11,4:8,8:15,8,12,0
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=109,113;MMQ=60,43;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=157.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,60:0.678:88:19,26:9,32:16,12,46,14
chr4	190876263	.	A	T	.	.	DP=111;ECNT=12;MBQ=25,24;MFRL=114,94;MMQ=46,42;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,7:0.067:107:48,1:46,5:64,36,3,4
chr4	190876268	.	A	G	.	.	DP=110;ECNT=12;MBQ=24,20;MFRL=109,115;MMQ=45,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,7:0.072:108:46,3:52,4:0|1:190876268_A_G:190876268:56,45,5,2
chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=110;ECNT=12;MBQ=24,20;MFRL=110,85;MMQ=45,42;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,7:0.072:107:48,0:48,7:57,43,3,4
chr4	190876272	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=12;MBQ=30,28;MFRL=109,109;MMQ=45,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,8:0.081:106:45,3:46,3:53,45,5,3
chr4	190876287	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=12;MBQ=20,23;MFRL=111,109;MMQ=41,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,6:0.074:93:41,2:37,4:0|1:190876268_A_G:190876268:40,47,3,3
chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=12;MBQ=31,20;MFRL=115,110;MMQ=40,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,8:0.124:70:30,2:31,6:0|1:190876301_C_A:190876301:21,41,5,3
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=12;MBQ=25,20;MFRL=114,110;MMQ=40,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,8:0.126:69:27,2:25,5:0|1:190876301_C_A:190876301:21,40,5,3
chr4	190876307	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=114,115;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,5:0.096:60:27,1:26,3:0|1:190876268_A_G:190876268:18,37,1,4
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=12;MBQ=25,29;MFRL=121,121;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:12,6:12,7:5,19,0,13
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=24,31;MFRL=135,120;MMQ=43,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,1:4,4:11,4,4,1
chr4	190878472	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=23,32;MFRL=120,135;MMQ=49,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,3:7,0:11,5,3,0
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=135,147;MMQ=43,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,1:2,3:8,3,2,2
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=136,111;MMQ=40,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:190878504_C_T:190878504:6,4,0,2
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=135,120;MMQ=43,33;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,3:4,3,2,3
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=135,111;MMQ=39,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:190878504_C_T:190878504:7,4,0,2
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=149,150;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:7,3:11,3:13,5,6,0
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=26,29;MFRL=145,74;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:15,0:20,3:29,7,2,1
chr4	190878596	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=11;MBQ=31,25;MFRL=143,184;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:16,1:28,1:0|1:190878596_G_A:190878596:37,7,1,1
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=30,25;MFRL=142,145;MMQ=40,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.325:46:10,6:21,8:27,4,11,4
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=143,114;MMQ=40,34;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.140:48:17,1:24,4:36,6,3,3
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=72;ECNT=11;MBQ=25,22;MFRL=134,71;MMQ=40,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.069:70:18,0:25,4:50,16,2,2
chr4	190878608	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=139,153;MMQ=40,40;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,3:0.073:52:20,2:28,1:0|1:190878596_G_A:190878596:41,8,2,1
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=88;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=116,126;MMQ=40,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,20:0.238:86:26,9:39,11:28,38,7,13
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=89;ECNT=11;MBQ=25,20;MFRL=120,115;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,24:0.277:88:23,12:40,12:24,40,7,17
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=11;MBQ=26,28;MFRL=118,115;MMQ=40,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.076:89:34,3:48,3:29,54,2,4
chr4	190878664	.	A	G	.	.	DP=89;ECNT=11;MBQ=24,32;MFRL=116,120;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.065:88:37,0:45,5:29,54,1,4
chr4	190878742	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=160,122;MMQ=33,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:6,0,9,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=127,115;MMQ=40,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:9,6:7,12:11,6,8,10
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=126,112;MMQ=50,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=67.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:14,6:6,12:0|1:190881992_T_C:190881992:12,8,4,15
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=125,112;MMQ=50,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:14,6:4,11:0|1:190881992_T_C:190881992:11,8,3,15
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=138,152;MMQ=50,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:16,3:24,2:31,11,2,3
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=11;MBQ=28,26;MFRL=136,155;MMQ=49,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:18,1:27,1:0|1:190882911_A_T:190882911:32,16,2,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=138,155;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:24,1:29,1:0|1:190882911_A_T:190882911:33,20,2,0
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=11;MBQ=31,27;MFRL=132,151;MMQ=50,37;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,7:0.128:60:24,2:29,5:30,23,6,1
chr4	190882959	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=11;MBQ=24,25;MFRL=116,114;MMQ=52,31;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.080:72:25,3:42,2:36,31,4,1
chr4	190882971	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=111,124;MMQ=52,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,8:0.126:69:25,4:34,2:0|1:190882971_T_C:190882971:27,34,5,3
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=11;MBQ=24,30;MFRL=110,133;MMQ=55,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,13:0.208:66:21,7:29,5:21,32,6,7
chr4	190882977	.	AAAG	A	.	.	DP=67;ECNT=11;MBQ=24,26;MFRL=110,133;MMQ=52,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.117:67:23,5:30,2:0|1:190882971_T_C:190882971:23,37,3,4
chr4	190882998	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=11;MBQ=25,30;MFRL=114,138;MMQ=52,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,5:0.097:59:22,2:29,3:25,29,1,4
chr4	190883007	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=128,133;MMQ=52,31;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.099:58:23,4:30,1:22,31,2,3
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=11;MBQ=23,25;MFRL=115,123;MMQ=60,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.121:51:20,4:21,2:24,21,0,6
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=140,79;MMQ=52,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.179:35:11,1:18,4:13,16,4,2
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=128,169;MMQ=52,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:11,0:16,2:13,15,0,2
chr4	190883154	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=148,81;MMQ=59,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:7,0:13,3:0,20,1,2
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,156;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:5,2:12,1:2,16,0,3
chr4	190884225	.	T	TTTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:5,3:12,4:13,4,5,3
chr4	190906080	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,98;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	190947306	.	C	CTGCCGTGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154950	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	156288	.	C	CAAACTCCCCCGAGCA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=127,85;MMQ=43,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	156310	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,26;MFRL=132,108;MMQ=43,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:156310_G_T:156310:0,4,0,1
chr5	156312	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=23,28;MFRL=132,108;MMQ=43,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:156310_G_T:156310:0,4,0,1
chr5	156336	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	156359	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:156359_C_CT:156359:0,1,0,1
chr5	156362	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,24;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156359_C_CT:156359:0,1,0,1
chr5	161985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=51,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:1,1,1,2
chr5	163205	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr5	163260	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr5	171569	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	173200	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr5	173231	.	AGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:173231_AGGG_A:173231:1,2,0,1
chr5	173237	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:173231_AGGG_A:173231:1,2,0,1
chr5	173258	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	174240	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	182070	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr5	224656	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=131,89;MMQ=49,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:5,9,1,4
chr5	224719	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=165,149;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:224719_C_T:224719:1,4,0,2
chr5	224723	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=165,149;MMQ=60,50;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,2:0|1:224719_C_T:224719:1,4,0,2
chr5	224734	.	C	CTGCAGCCTCCATCCA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.319:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,12,5
chr5	231111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr5	236617	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=143,678376;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:2,7,0,2
chr5	236650	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=113,1356675;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,1:10,2:4,10,0,3
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	254636	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=111,145;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr5	256392	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=179,139;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	256434	.	ACT	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=135,126;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:3,4:3,4,3,1
chr5	256472	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=110,119;MMQ=60,38;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.307:27:14,3:5,5:8,11,5,3
chr5	256514	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=102,132;MMQ=60,36;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:4,7,1,2
chr5	304310	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=140,165;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:304310_A_ACC:304310:0,1,0,1
chr5	304311	.	T	TCAGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=140,165;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:304310_A_ACC:304310:0,1,0,1
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr5	413591	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0|1:413591_G_A:413591:0,4,0,2
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:413591_G_A:413591:0,4,0,2
chr5	413639	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	427671	.	AAGGCCGTCGCCGCGGCTCCAGAGAAACTGGGAGTGGGGGATGGTTTCAGGATGATTCAAGCACATCGAATCACTCTGC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=162,76;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.301:9:0,2:0,0:5,0,2,2
chr5	428001	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.607:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr5	428206	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:428206_T_A:428206:0,4,0,1
chr5	428210	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:428206_T_A:428206:0,1,0,1
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.830:10:0,1:1,6:0,1,4,5
chr5	434361	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=60,57;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr5	457211	.	TGC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:457211_TGC_T:457211:0,1,0,1
chr5	457215	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:457211_TGC_T:457211:0,1,0,1
chr5	457219	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=122,118;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:457211_TGC_T:457211:0,1,0,1
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	475787	.	C	CAGAAGGAATTAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:7,1:3,1:4,6,1,1
chr5	476791	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:476791_C_CT:476791:0,0,0,1
chr5	476792	.	G	GGTCCCTCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:476791_C_CT:476791:0,0,0,1
chr5	477524	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=138,97;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:5,0:8,0:0|1:477524_G_T:477524:4,9,0,7
chr5	477526	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=138,97;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:5,0:8,7:0|1:477524_G_T:477524:4,9,0,7
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr5	481818	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:481818_T_TC:481818:0,0,0,1
chr5	481821	.	T	TGTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:481818_T_TC:481818:0,0,0,1
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=110,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,5:0,3:1,1,6,2
chr5	624664	.	A	AATCTTTAAGAGAATCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=93,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr5	633967	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=151,59;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr5	637882	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:4,2,2,0
chr5	639259	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr5	900704	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr5	907176	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,0,2
chr5	1034460	.	GTTTGC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1034460_GTTTGC_G:1034460:1,2,0,1
chr5	1034466	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,22;MFRL=99,76;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1034460_GTTTGC_G:1034460:1,2,0,1
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr5	1038250	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1038250_C_T:1038250:0,0,0,1
chr5	1038258	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1038250_C_T:1038250:0,0,0,1
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1065683	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1065683_A_C:1065683:0,0,0,2
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1065683_A_C:1065683:0,0,0,2
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr5	1078927	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	1081668	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=95,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,5:0,0:6,1,3,2
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:12,4:0,4:7,5,4,4
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,20;MFRL=94,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:0,1,1,1
chr5	1094461	.	C	CCCACTGAAAACGTCGGGTGATGGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1094461_C_CCCACTGAAAACGTCGGGTGATGGTT:1094461:0,0,0,1
chr5	1094466	.	TG	AA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1094461_C_CCCACTGAAAACGTCGGGTGATGGTT:1094461:0,0,0,1
chr5	1219583	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	1221529	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	1235790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:1,2,1,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	1244552	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0|1:1244552_C_T:1244552:0,1,0,1
chr5	1244553	.	G	GACCATCTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1244552_C_T:1244552:0,1,0,1
chr5	1244557	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,25;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1244552_C_T:1244552:0,1,0,1
chr5	1282731	.	AGCCAACCC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:1282731_AGCCAACCC_A:1282731:2,5,1,1
chr5	1282743	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:1282731_AGCCAACCC_A:1282731:1,5,1,1
chr5	1334507	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr5	1334592	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:1334592_GGC_G:1334592:0,0,0,1
chr5	1334597	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1334592_GGC_G:1334592:0,0,0,1
chr5	1401182	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=73,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1401182_C_T:1401182:1,1,0,1
chr5	1401195	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=73,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1401182_C_T:1401182:1,1,0,1
chr5	1401202	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=73,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:1401182_C_T:1401182:1,1,0,1
chr5	1401208	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,25;MFRL=58,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:1401182_C_T:1401182:1,1,0,1
chr5	1401210	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=58,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:1401182_C_T:1401182:1,1,0,1
chr5	1401213	.	C	CCAGACAACCACTGA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:1401182_C_T:1401182:1,0,0,1
chr5	1409881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=110,679073;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:5,1,0,2
chr5	1416142	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1416320	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=196,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1416320_C_T:1416320:0,1,0,1
chr5	1416324	.	G	GAGGACCTGTTCAAATCAACACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:1416320_C_T:1416320:0,1,0,1
chr5	1443402	.	TT	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1443402_TT_AA:1443402:0,0,0,1
chr5	1443406	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1443402_TT_AA:1443402:0,0,0,1
chr5	1470900	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=56,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,2:2,0,2,3
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr5	1481135	.	CAGGGCCTGCACCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=103,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	1483426	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1882660	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1882660_G_C:1882660:0,0,1,0
chr5	1882669	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1882660_G_C:1882660:0,1,1,0
chr5	2748742	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr5	5232398	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	5239768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=124,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:4,0,1,1
chr5	5262766	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=108,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=76,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr5	5460911	.	T	TCTTTATGCTGCCAGAATTCACATGTTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=96,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr5	5460955	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:5460955_A_T:5460955:2,1,0,1
chr5	5460959	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=124,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:5460955_A_T:5460955:2,1,0,1
chr5	5462352	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=182,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr5	5462378	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=193,75;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:5462378_GC_G:5462378:1,1,0,1
chr5	5462382	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=182,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:5462378_GC_G:5462378:1,2,0,1
chr5	5463515	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	5463543	.	C	CTTCCAACA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=202,106;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5463543_C_CTTCCAACA:5463543:0,1,0,1
chr5	5463545	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=202,106;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5463543_C_CTTCCAACA:5463543:0,1,0,1
chr5	5463547	.	T	TTGAATAGGAGTGGTGAGAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=202,106;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:5463543_C_CTTCCAACA:5463543:0,1,0,1
chr5	5464839	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=76,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr5	5469074	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,0:5,4:5,7,4,0
chr5	5476223	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,0:1,3:1,5,0,3
chr5	5489524	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5489524_G_A:5489524:0,0,0,1
chr5	5489526	.	A	ACAGAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5489524_G_A:5489524:0,0,0,1
chr5	5489530	.	TTC	AAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:5489524_G_A:5489524:0,0,0,1
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	6377293	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,2:3,1:4,5,1,2
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr5	6604205	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr5	6609936	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:15,0:18,10,3,0
chr5	6610085	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:6610085_C_T:6610085:0,4,0,1
chr5	6610108	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6610085_C_T:6610085:0,2,0,1
chr5	6610114	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,32;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6610085_C_T:6610085:0,1,0,1
chr5	6610115	.	T	TAGCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6610085_C_T:6610085:0,1,0,1
chr5	6610116	.	GATAC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:6610085_C_T:6610085:0,1,0,1
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	6620434	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:0|1:6620434_T_TC:6620434:1,5,1,1
chr5	6620436	.	A	ATAAAATCCATCCAGAGCCACCT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:0|1:6620434_T_TC:6620434:1,5,1,1
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	6623431	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:6623431_G_GC:6623431:0,1,0,1
chr5	6623432	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,25;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:6623431_G_GC:6623431:0,1,0,1
chr5	6737571	.	A	G,C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33,30;MFRL=0,150,239;MMQ=60,60,60;MPOS=25,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,1,0:0,1,1:0,0,3,0
chr5	6737576	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=239,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0|1:6737576_G_A:6737576:1,0,3,0
chr5	6737577	.	T	TGAAAGACCTTTGGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=126,239;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:1,1:1|0:6737576_G_A:6737576:3,0,1,0
chr5	6739791	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr5	6743990	.	A	AATTGGGCCAGTTTCAATAATAATACCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	6744021	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6744021_C_CA:6744021:0,0,0,1
chr5	6744023	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6744021_C_CA:6744021:0,0,0,1
chr5	6744026	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6744021_C_CA:6744021:0,0,0,1
chr5	6746404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=121,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chr5	6748518	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	6748659	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,7:0,0,9,9
chr5	6754762	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	7691014	.	C	CATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	7706833	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:3,1,4,1
chr5	7709479	.	G	GGCAGGGGATCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	7713020	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	7713039	.	TAAAGCTTATTGC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1,1,0,1
chr5	7743742	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,21;MFRL=107,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,4:3,4:1,2,5,3
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=89,2599863;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr5	7817117	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,0:6,3:1,7,0,3
chr5	7820622	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr5	7820774	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=47,42557731;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr5	7835616	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	7866135	.	TTGAGG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr5	7868030	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,10,12
chr5	7883486	.	G	GGAGATTGGATCTTGTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	7885782	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0|1:7885782_A_AT:7885782:3,0,2,0
chr5	7885794	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=184,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,3:0.571:5:0,1:1,2:1|0:7885782_A_AT:7885782:2,0,3,0
chr5	7889241	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr5	7891584	.	GGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=107,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:2,12,0,2
chr5	7897414	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:0|1:7897414_T_C:7897414:1,7,1,1
chr5	7897416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:7897414_T_C:7897414:1,7,1,1
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	9190628	.	C	CCTTCTAGGGGGAGGTTGGGGAGGGCCTGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0|1:9190628_C_CCTTCTAGGGGGAGGTTGGGGAGGGCCTGG:9190628:0,2,0,1
chr5	9190630	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=114,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:9190628_C_CCTTCTAGGGGGAGGTTGGGGAGGGCCTGG:9190628:0,1,0,1
chr5	9225088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	10250372	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,11,8
chr5	10256161	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,1
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,1
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,1
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	10286501	.	TTCA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCA;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:1,2:3,2,1,1
chr5	10387078	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=115,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,3:8,0:6,8,2,1
chr5	10387230	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=107,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,0,2
chr5	10394868	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=114,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:16,0:16,3:26,6,3,0
chr5	10415585	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=143,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:2,2:8,0:9,2,1,1
chr5	10415605	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=143,35;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:11,0:8,5,1,1
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	10761009	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	10761182	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,0:0,13:0|1:10761182_A_G:10761182:0,0,7,7
chr5	10761201	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=93,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.371:6:0,0:4,2:0|1:10761182_A_G:10761182:2,2,0,2
chr5	10981994	.	A	ACTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	11111239	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11111243	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11111246	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11111248	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11111249	.	CAT	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11111255	.	T	TAATGCCATC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11111239_T_C:11111239:0,0,0,1
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:1,2,2,3
chr5	11199761	.	C	CCAAAGTGCTGGGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	11346732	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11346732_A_T:11346732:0,0,0,1
chr5	11346734	.	AT	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11346732_A_T:11346732:0,0,0,1
chr5	11346737	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:11346732_A_T:11346732:0,0,0,1
chr5	11564995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr5	13701525	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:7,2:9,3:0|1:13701525_T_C:13701525:3,13,2,3
chr5	13701536	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=122,95;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:7,2:7,2:0|1:13701525_T_C:13701525:3,11,2,3
chr5	13701541	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=112,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,0:6,4:5,10,0,4
chr5	13701571	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:2,1:2,0:0|1:13701571_A_G:13701571:1,3,0,1
chr5	13701572	.	A	ACG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,23;MFRL=123,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:13701571_A_G:13701571:1,3,0,1
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=114,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr5	13737597	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13737597_T_TC:13737597:0,0,0,1
chr5	13737600	.	A	ACTTCTGTCTCCTATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13737597_T_TC:13737597:0,0,0,1
chr5	13737603	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13737597_T_TC:13737597:0,0,0,1
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=76,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,2,3
chr5	13776719	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=91,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr5	13792237	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:6,1,0,2
chr5	13809063	.	CG	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	13814682	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.650:6:0,3:1,1:1,1,3,1
chr5	13815049	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	13820656	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=87,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr5	13824278	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	13824410	.	C	CTACAGTTTTTTTGGTGACGACTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,2:0,0:3,3,1,1
chr5	13829608	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,5,1
chr5	13839695	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	13842042	.	A	ATTTCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=128,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,0,1
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=180,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	13845178	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13845178_GGA_G:13845178:0,0,0,1
chr5	13845186	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13845178_GGA_G:13845178:0,0,0,1
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	13862600	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	13862616	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr5	13871925	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	13891000	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr5	13917393	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13917393_A_C:13917393:1,2,0,1
chr5	13917398	.	A	AAAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13917393_A_C:13917393:1,2,0,1
chr5	13917402	.	A	AAATAGTATTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13917393_A_C:13917393:1,1,0,1
chr5	14297395	.	C	CAGCTTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=229,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	14367148	.	AAT	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,4,1,1
chr5	14367153	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=30,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,4,1,1
chr5	14367155	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,4,1,1
chr5	14367159	.	AT	CC,AGT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=24,27,20;MFRL=159,119,54;MMQ=60,60,60;MPOS=2,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.222,0.333:6:2,1,0:1,0,2:0,3,1,2
chr5	14367161	.	G	GTTAT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=29,20;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,4,1,1
chr5	14367163	.	C	CAATCGTATGTGAGGG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=159,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,1:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,4,1,1
chr5	14367166	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=178,54;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14367148_AAT_A:14367148:0,2,0,1
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr5	14398902	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	14461469	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	14476968	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=53,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	14498139	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:14498139_G_T:14498139:4,2,0,2
chr5	14498143	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:14498139_G_T:14498139:4,2,0,2
chr5	14502863	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:14502863_A_AT:14502863:0,0,0,1
chr5	14502864	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:14502863_A_AT:14502863:0,0,0,1
chr5	14508022	.	A	ATATGTGATTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	14601442	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:5,0:11,3,3,0
chr5	14607351	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,13;MFRL=140,144;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:14607351_G_C:14607351:3,0,1,0
chr5	14607357	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=140,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:14607351_G_C:14607351:3,0,1,0
chr5	14607360	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=140,144;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:14607351_G_C:14607351:3,0,1,0
chr5	14607365	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,16;MFRL=140,144;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:14607351_G_C:14607351:3,0,1,0
chr5	14607367	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,15;MFRL=140,144;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:14607351_G_C:14607351:3,0,1,0
chr5	14607370	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=149,144;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:14607351_G_C:14607351:2,1,1,0
chr5	14607375	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=154,144;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:14607351_G_C:14607351:1,2,1,0
chr5	14673696	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=81,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,3:0,0:4,0,2,1
chr5	14693069	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=52,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:14693069_C_CTT:14693069:1,2,0,1
chr5	14693070	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=52,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:14693069_C_CTT:14693069:1,1,0,1
chr5	14693071	.	A	ATTGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,24;MFRL=52,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:14693069_C_CTT:14693069:1,1,0,1
chr5	14693075	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=52,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr5	14741921	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.388:6:0,2:2,0:3,1,1,1
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr5	16177807	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr5	16666736	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr5	16670905	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr5	16670951	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=170,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr5	16673765	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16673765_A_C:16673765:1,0,1,0
chr5	16673770	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16673765_A_C:16673765:1,0,1,0
chr5	16699747	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16699748	.	GCATGTA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16699756	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16699759	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16699761	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16699762	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=193,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16699747_A_C:16699747:1,0,0,1
chr5	16704889	.	T	TGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:4,0:1,4:4,1,1,3
chr5	16758380	.	T	TATTCCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16758380_T_TATTCCAC:16758380:0,1,0,1
chr5	16758382	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16758380_T_TATTCCAC:16758380:0,1,0,1
chr5	16762320	.	GAAAATCA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr5	16762813	.	C	CAGCACGGTGGCTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=129,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	16762839	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16762839_A_G:16762839:0,0,0,1
chr5	16762848	.	A	ACACTGCTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16762839_A_G:16762839:0,0,0,1
chr5	16762850	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16762839_A_G:16762839:0,0,0,1
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=131,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,1:4,8:2,3,5,4
chr5	16764575	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16764575_C_T:16764575:0,0,0,1
chr5	16764579	.	T	TTTACAGA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16764575_C_T:16764575:0,0,0,1
chr5	16764583	.	G	GGAAATGAAGGAAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16764575_C_T:16764575:0,0,0,1
chr5	16764586	.	A	AGAGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16764575_C_T:16764575:0,0,0,1
chr5	16764589	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:16764575_C_T:16764575:0,0,0,1
chr5	16769262	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:16769262_CGA_C:16769262:2,1,0,1
chr5	16769266	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:16769262_CGA_C:16769262:2,1,0,1
chr5	16769273	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	17276053	.	CCT	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CT;STR;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.620:14:2,4:1,4:1,4,2,7
chr5	17276078	.	CTA	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=108,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.179:15:7,0:5,2:0|1:17276078_CTA_C:17276078:4,9,0,2
chr5	17276090	.	CTATCT	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,0;MFRL=120,95;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:5,0:0|1:17276078_CTA_C:17276078:2,6,0,2
chr5	17276149	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:5,3:14,0:2,18,4,0
chr5	17276848	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr5	19591449	.	G	GTAGAAAGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	21751762	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21751762_A_T:21751762:0,0,1,0
chr5	21751764	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21751762_A_T:21751762:0,0,1,0
chr5	21751766	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:21751762_A_T:21751762:0,0,1,0
chr5	21752056	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr5	21760858	.	T	TTTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21760858_T_TTTAC:21760858:0,1,0,1
chr5	21760862	.	TGAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21760858_T_TTTAC:21760858:0,1,0,1
chr5	21760867	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21760858_T_TTTAC:21760858:0,1,0,1
chr5	21802542	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21802542_C_CTG:21802542:0,1,0,1
chr5	21802543	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21802542_C_CTG:21802542:0,1,0,1
chr5	21802546	.	T	TTCATTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:21802542_C_CTG:21802542:0,1,0,1
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,10:0,0:0,0,0,10
chr5	23518143	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23518143_T_TA:23518143:0,0,0,1
chr5	23518145	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:23518143_T_TA:23518143:0,0,0,1
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	24488155	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,588;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:5,3,0,2
chr5	24509947	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr5	24535401	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24535401_T_G:24535401:0,0,0,1
chr5	24535404	.	A	ACCCCAGAGATGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24535401_T_G:24535401:0,0,0,1
chr5	24537820	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:24537820_T_G:24537820:0,0,0,1
chr5	24537824	.	AAGGTGCAGGATGCTG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24537820_T_G:24537820:0,0,0,1
chr5	24593595	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	26885747	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=55,502;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26885747_G_A:26885747:0,2,1,0
chr5	26885749	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=55,502;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:26885747_G_A:26885747:0,2,1,0
chr5	26890036	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=149,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:1,4,2,1
chr5	31267629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:3,1,0,2
chr5	31267856	.	A	AGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	31297403	.	TGTTGTCCAAGTCACTGCGACGGATGCAGATGATCCAACATATGGGAACAGTGCTAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.289:11:0,0:2,2:5,2,1,3
chr5	31297528	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr5	31305405	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=141,47;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:3,1,3,0
chr5	31305577	.	C	CTCAGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	31323510	.	C	CAGCTGGCAGCCAACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	31401447	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,23;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr5	31411052	.	T	TTGCTTTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=103,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	31451825	.	A	ACAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=135,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	31483753	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:2,0:1,1:0|1:31483753_GA_G:31483753:3,0,1,0
chr5	31483765	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=76,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,0:1,1:0|1:31483753_GA_G:31483753:3,0,1,0
chr5	31486540	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	31508970	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31508970_A_G:31508970:0,0,0,1
chr5	31508973	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31508970_A_G:31508970:0,0,0,1
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,4,3
chr5	31526756	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,39;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:1,1,2,0
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr5	31538692	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:2,3:1,2:1,2,2,3
chr5	31541142	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.748:18:3,9:1,4:3,1,9,5
chr5	31551581	.	A	AAGAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:0|1:31551581_A_AAGAC:31551581:2,2,0,1
chr5	31551583	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:2,0:1,1:0|1:31551581_A_AAGAC:31551581:2,2,0,1
chr5	31551607	.	T	TCTATGTCAGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	31983819	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:1,7,0,9
chr5	31995878	.	C	CCCTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	32058053	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=91,120;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,0:12,4:0|1:32058053_T_A:32058053:9,11,0,4
chr5	32058056	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=91,120;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:7,0:9,3:0|1:32058053_T_A:32058053:9,11,0,4
chr5	32069857	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:1,4,2,5
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:1,3,2,5
chr5	32087374	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=64,75;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr5	32088645	.	A	ACACACTTGCTCCTTTCATGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=136,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr5	32089721	.	GC	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=188,778;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32089721_GC_TG:32089721:2,0,1,0
chr5	32089726	.	G	GACACATCGAGGAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=188,778;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:32089721_GC_TG:32089721:2,0,1,0
chr5	32090843	.	C	CCATTAGAGTTGTG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr5	32090845	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr5	32101400	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	32135599	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	32249028	.	C	CACATCTACAACCATCTGAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.482:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	32263298	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.259:9:3,2:2,0:0|1:32263298_A_AC:32263298:3,4,1,1
chr5	32263302	.	G	GAAAAATGAGAAGTACCAGCACAACAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.238:10:3,2:5,0:0|1:32263298_A_AC:32263298:4,4,1,1
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=83.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,19:0,0,17,11
chr5	32390622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32390622_G_A:32390622:0,1,0,1
chr5	32390626	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32390622_G_A:32390622:0,1,0,1
chr5	32390637	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32390622_G_A:32390622:0,1,0,1
chr5	32591824	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.317:13:6,2:2,0:1,8,4,0
chr5	32591827	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:6,1:2,0:1,8,4,0
chr5	32738886	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	32780991	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32780991_C_G:32780991:0,1,0,1
chr5	32780994	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32780991_C_G:32780991:0,1,0,1
chr5	32780998	.	C	CTCCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32780991_C_G:32780991:0,1,0,1
chr5	32786465	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.399:11:5,4:2,0:2,5,3,1
chr5	33441124	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	33461457	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33461457_G_C:33461457:0,3,0,1
chr5	33461460	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33461457_G_C:33461457:0,3,0,1
chr5	33461462	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33461457_G_C:33461457:0,3,0,1
chr5	33462034	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr5	33527350	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=72,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,1:5,1:10,6,1,1
chr5	33527411	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=83,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:3,3:1,4,0,3
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:1,0:4,3:4,2,3,1
chr5	33588822	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	33595996	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	33630916	.	C	CCATGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=115,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:33637891_C_A:33637891:0,0,0,2
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:33637891_C_A:33637891:0,0,0,3
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	33648842	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,5,4
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	33649902	.	C	CTAGAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr5	33937590	.	G	GCACAGCCTCATGC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=106,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,1:5,4,1,1
chr5	33938003	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33938003_C_CAT:33938003:1,0,0,1
chr5	33938004	.	G	GTTCCAGCTGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=8,30;MFRL=124,83;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:33938003_C_CAT:33938003:1,0,0,1
chr5	33947271	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr5	33954685	.	A	AGAATACGTTACATAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.854:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	33989355	.	A	AAAATTACTAGAGCATGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	33989518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr5	33989553	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:33989553_G_C:33989553:2,2,1,1
chr5	33989555	.	C	CTCTCGCTCTCTCCCTCGCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:33989553_G_C:33989553:2,2,1,1
chr5	34006104	.	A	AATTGAAACCTGTGGTTAGGCATGAGCAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	34008100	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr5	34008130	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	34020919	.	T	TCCCCCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:34020919_T_TCCCCCC:34020919:0,0,0,1
chr5	34020924	.	T	TCCCCATCTCTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34020919_T_TCCCCCC:34020919:0,0,0,1
chr5	34687911	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr5	34688210	.	CGACAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=62,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:0,4:1,0,7,1
chr5	34807928	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,4,8
chr5	34811078	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr5	34818976	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr5	34821825	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr5	34913701	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=139,77;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.170:19:4,0:12,2:4,12,0,3
chr5	34925328	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,17;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,0:0,2:2,0,4,1
chr5	34941328	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:1,1:3,4,0,2
chr5	34941387	.	C	CCCGAGTAGCTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	34945797	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:2,2:0,0:3,1,3,0
chr5	34949786	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=113,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,0:10,3:4,10,1,2
chr5	34954588	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	34998778	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	35014297	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=133,110;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:35014297_A_G:35014297:0,4,0,1
chr5	35014305	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=146,119;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:3,0:2,1:0|1:35014305_T_C:35014305:0,5,0,1
chr5	35014316	.	TA	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=147,110;MMQ=52,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:35014297_A_G:35014297:0,4,0,1
chr5	35014317	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=147,119;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:35014305_T_C:35014305:0,3,0,1
chr5	35026683	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	35032769	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr5	35033023	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	35033706	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	35033748	.	A	AGGATGTAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	35036997	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	35048056	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	35089820	.	T	TTAAGCAAGGAGCAACAATCAGTTGCAAATA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	35628724	.	TGTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:35628724_TGTTC_T:35628724:0,4,0,1
chr5	35628730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:35628724_TGTTC_T:35628724:0,4,0,1
chr5	35628733	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,30;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:35628724_TGTTC_T:35628724:0,4,0,1
chr5	35628736	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:35628724_TGTTC_T:35628724:0,4,0,1
chr5	35628739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:35628724_TGTTC_T:35628724:0,3,0,1
chr5	35649421	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,3:1,0:1,0,1,2
chr5	35654698	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=116,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,2,0
chr5	35705964	.	T	TTTGTGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=196,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35705964_T_TTTGTGCCTC:35705964:0,1,0,1
chr5	35705965	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=196,244;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35705964_T_TTTGTGCCTC:35705964:0,1,0,1
chr5	35709184	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,7,12
chr5	35712900	.	C	CTGCCCATCTTCT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:0|1:35712900_C_CTGCCCATCTTCT:35712900:5,4,1,1
chr5	35712902	.	A	AGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=114,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:2,2:7,0:0|1:35712900_C_CTGCCCATCTTCT:35712900:5,4,1,1
chr5	35713007	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	35740341	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:35740341_C_G:35740341:0,1,0,1
chr5	35740342	.	AAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35740341_C_G:35740341:0,1,0,1
chr5	35740347	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35740341_C_G:35740341:0,1,0,1
chr5	35740352	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=128,74;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:35740341_C_G:35740341:0,1,0,1
chr5	35753715	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	35753877	.	G	GAGTTCAGGCAGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	35771830	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=94,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:8,15,1,1
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	35793347	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=127,120;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:12,0:3,2:8,7,0,2
chr5	35795738	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	35806960	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:5,1,1,1
chr5	35857176	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=136,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr5	35857207	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	35861152	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,4:2,0:1,3,1,3
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,4:6,1:4,4,4,1
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,50675533;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	35921214	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=127,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35921214_C_T:35921214:1,0,1,0
chr5	35921220	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=127,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:35921214_C_T:35921214:1,0,1,0
chr5	35954615	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	35955682	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	35956026	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	35957202	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr5	35991428	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35991428_A_C:35991428:0,0,0,1
chr5	35991431	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35991428_A_C:35991428:0,0,0,1
chr5	36117958	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:3,10,1,1
chr5	36166654	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=93,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr5	36201273	.	AA	GG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=95,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:36201273_AA_GG:36201273:4,6,1,1
chr5	36201278	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=95,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:36201273_AA_GG:36201273:4,6,1,1
chr5	36201282	.	T	TATGAGTCAACGC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=105,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:36201273_AA_GG:36201273:2,6,1,1
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	36212001	.	G	GCTGTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:0,2:4,0:0|1:36212001_G_GCTGTT:36212001:1,3,1,1
chr5	36212004	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,2:4,0:0|1:36212001_G_GCTGTT:36212001:2,3,1,1
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=100,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.734:12:1,4:1,5:1,2,3,6
chr5	36225681	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:3,0:4,6,0,3
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,7,18
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr5	36270053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,0:5,3:10,6,0,3
chr5	36271404	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:17,0:20,2:0|1:36271404_A_C:36271404:16,21,1,1
chr5	36271413	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:15,2:0|1:36271404_A_C:36271404:15,18,1,1
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,2:0|1:36301362_T_A:36301362:1,0,5,2
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=127,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,2:0|1:36301362_T_A:36301362:1,0,5,2
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,6:2,1:1,1,4,3
chr5	36680745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=134,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:6,1:2,1:0,8,1,2
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	36686404	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	36984706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	36984875	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:16,2:14,3:14,17,0,5
chr5	37016192	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:37016192_G_C:37016192:9,8,2,0
chr5	37016194	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,2:11,0:0|1:37016192_G_C:37016192:9,8,2,0
chr5	37027576	.	GT	G,GTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31,14;MFRL=146,123,117;MMQ=60,60,60;MPOS=28,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.19,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,4:0.198,0.236:17:3,1,1:4,2,0:2,7,0,8
chr5	37036449	.	GTA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,4:4,2:8,3,4,2
chr5	37051861	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:11,4:7,0:13,5,5,0
chr5	37107824	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=128,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:9,0:14,2:0|1:37107824_C_T:37107824:13,11,1,1
chr5	37107830	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=126,35;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:11,0:16,2:0|1:37107824_C_T:37107824:15,12,1,1
chr5	37120386	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:37120386_A_C:37120386:2,4,0,2
chr5	37120389	.	T	TTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:37120386_A_C:37120386:2,4,0,2
chr5	37120390	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0|1:37120386_A_C:37120386:2,4,0,2
chr5	37121933	.	TCA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37121933_TCA_T:37121933:1,2,0,1
chr5	37121937	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=112,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:37121933_TCA_T:37121933:1,2,0,1
chr5	37179585	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:1,10,0,2
chr5	37198865	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=113,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.090:40:22,3:15,0:20,17,1,2
chr5	37199010	.	GAAAATTTAGAATGTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr5	37224915	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	37243227	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.204:42:18,0:16,8:14,20,1,7
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr5	37299754	.	A	AGATATGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:37299754_A_AGATATGTGTG:37299754:0,1,0,1
chr5	37299756	.	A	ACAAAATAAAGGCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.493:2:0,1:1,0:1|0:37299754_A_AGATATGTGTG:37299754:0,1,0,1
chr5	37299758	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=110,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:37299754_A_AGATATGTGTG:37299754:0,1,0,1
chr5	37314364	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:14,2:15,0:0|1:37314364_G_A:37314364:15,14,1,1
chr5	37314376	.	T	TAAAAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,1:11,0:0|1:37314364_G_A:37314364:13,10,1,1
chr5	37314377	.	T	TAACAC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=124,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:0|1:37314364_G_A:37314364:13,10,1,1
chr5	37326053	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.284:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr5	37326057	.	ATCCC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37326057_ATCCC_A:37326057:2,1,0,1
chr5	37326062	.	AAATGTTTC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=20,26;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37326057_ATCCC_A:37326057:2,1,0,1
chr5	37326083	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37326083_A_T:37326083:1,1,0,1
chr5	37326084	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:37326083_A_T:37326083:1,1,0,1
chr5	37326086	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=120,115;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:37326083_A_T:37326083:1,1,0,1
chr5	37328627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=186,187;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	37342838	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr5	37342840	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=181,139;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr5	37349160	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	37358343	.	GTCTGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37358343_GTCTGA_G:37358343:1,0,0,1
chr5	37358350	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37358343_GTCTGA_G:37358343:1,0,0,1
chr5	37371105	.	C	CATAAA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0|1:37371105_C_CATAAA:37371105:0,3,0,1
chr5	37371111	.	A	AAC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,23;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37371105_C_CATAAA:37371105:0,3,0,1
chr5	37371115	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:37371105_C_CATAAA:37371105:0,3,0,1
chr5	37371128	.	G	GTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37371128_G_GTCCCC:37371128:0,1,0,1
chr5	37371129	.	AAACAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,26;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37371128_G_GTCCCC:37371128:0,1,0,1
chr5	37371140	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:37371128_G_GTCCCC:37371128:0,2,0,1
chr5	37371147	.	GAAGTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37371128_G_GTCCCC:37371128:0,1,0,1
chr5	37392289	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,152;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:0,1:1,3:1,1,5,3
chr5	37701240	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=69,104;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:2,1,0,3
chr5	37701255	.	T	TCTGCAAGCTAGAAGGAACCCTGGAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=69,104;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.378:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	37727243	.	C	CTTTCTTTCTTTCTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:37727243_C_CTTTCTTTCTTTCTCTCT:37727243:0,0,0,2
chr5	37727246	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:37727243_C_CTTTCTTTCTTTCTCTCT:37727243:0,0,0,2
chr5	38258786	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.338:9:4,0:0,0:2,4,3,0
chr5	38350584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=116,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:4,5,1,1
chr5	38352476	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,5:0,0,4,6
chr5	38352512	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=190,124;MMQ=53,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	38407273	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	38409242	.	TTAC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=90,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.345:4:3,0:0,1:0|1:38409242_TTAC_T:38409242:1,2,0,1
chr5	38409249	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:38409242_TTAC_T:38409242:0,0,0,1
chr5	38425008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr5	38448506	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,77;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,0:1,3:0,8,1,2
chr5	38484875	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=105,207;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,0:17,3:21,14,0,3
chr5	38485834	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	38496727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38496727_C_T:38496727:0,1,0,1
chr5	38496736	.	A	AATAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38496727_C_T:38496727:0,1,0,1
chr5	38496739	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38496727_C_T:38496727:0,1,0,1
chr5	38527228	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr5	38528951	.	GACAC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.746:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	38885353	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	38923166	.	ACG	CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=140,174;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:38923166_ACG_CTT:38923166:4,0,1,0
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:38923166_ACG_CTT:38923166:1,0,3,0
chr5	38925344	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=130,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:13,3:6,0:7,12,2,1
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	38932494	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr5	38942563	.	T	TG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,0:11,2:0|1:38942563_T_TG:38942563:0,14,0,2
chr5	38942575	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:7,2:0|1:38942563_T_TG:38942563:0,13,0,2
chr5	38942578	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:6,2:0|1:38942563_T_TG:38942563:0,12,0,2
chr5	38943136	.	G	GTCATCACCCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38943136_G_GTCATCACCCCAA:38943136:0,2,0,1
chr5	38943141	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38943136_G_GTCATCACCCCAA:38943136:0,2,0,1
chr5	38943156	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	38945919	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	38950468	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,24;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:4,6,1,1
chr5	38950776	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,10,14
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=638,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,7:0,10:0,2,5,15
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr5	38959018	.	ACTT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.530:2:1,0:0,1:0|1:38959018_ACTT_A:38959018:0,1,0,1
chr5	38959023	.	A	ATAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38959018_ACTT_A:38959018:0,0,0,1
chr5	38959033	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38959018_ACTT_A:38959018:0,0,0,1
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr5	38962789	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	38967169	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	38971912	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=119,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:7,4:4,3:5,6,3,4
chr5	39108309	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=119,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,5:1,3:4,3,3,5
chr5	39108322	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,9,10
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	39127960	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:39127960_G_C:39127960:0,1,0,3
chr5	39127961	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,27;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:0,0:0|1:39127960_G_C:39127960:0,2,0,1
chr5	39127963	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=123,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39127960_G_C:39127960:0,2,0,1
chr5	39134295	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:4,2,3,0
chr5	39201991	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:10,3:16,0:12,14,4,0
chr5	39311555	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39311555_A_T:39311555:1,0,0,1
chr5	39311556	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39311555_A_T:39311555:1,0,0,1
chr5	39341785	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=161,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr5	39375082	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,14,7
chr5	39377418	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,2,14
chr5	39390121	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	39393580	.	T	TTGAACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39393580_T_TTGAACA:39393580:0,0,0,1
chr5	39393584	.	AA	GG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39393580_T_TTGAACA:39393580:0,0,0,1
chr5	39394493	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=112,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	40681614	.	C	CAGTTTGTATCCAAAAATGATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,17;MFRL=138,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,1:2,0:2,5,1,1
chr5	40691893	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=134,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.597:23:3,6:6,7:4,5,7,7
chr5	40692430	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40692430_CA_C:40692430:0,1,0,1
chr5	40692435	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40692430_CA_C:40692430:0,1,0,1
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	40728591	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:40728591_A_G:40728591:1,2,0,1
chr5	40728594	.	GA	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:40728591_A_G:40728591:1,2,0,1
chr5	40747190	.	CA	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=176,120;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:40747190_CA_TC:40747190:0,4,0,1
chr5	40747195	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=176,120;MMQ=50,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:40747190_CA_TC:40747190:0,4,0,1
chr5	40747199	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=162,120;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40747190_CA_TC:40747190:0,3,0,1
chr5	40747216	.	GA	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	40852451	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr5	40853483	.	T	TAACAAGGAAAAGGTTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	40854612	.	GCA	TAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40854612_GCA_TAT:40854612:0,1,0,1
chr5	40854624	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40854612_GCA_TAT:40854612:0,1,0,1
chr5	40854626	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=120,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40854612_GCA_TAT:40854612:0,1,0,1
chr5	40928574	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	40928792	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr5	40950157	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr5	40972769	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr5	40980102	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	40981691	.	G	GCCACTCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40981691_G_GCCACTCCT:40981691:0,1,0,1
chr5	40981692	.	G	GGGTTCTCATCCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40981691_G_GCCACTCCT:40981691:0,1,0,1
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=107,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,0:0,2:1,2,2,1
chr5	40999981	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	41008687	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:8,1,0,2
chr5	41009282	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=284,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	41012615	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	41018600	.	T	TGCTGTTTATTTTACTGTATTTTTTGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	41019073	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:41019073_T_C:41019073:3,3,1,1
chr5	41019076	.	A	ATCTTT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:41019073_T_C:41019073:3,3,1,1
chr5	41019077	.	G	GCCCTGGAGTTCCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:41019073_T_C:41019073:4,3,1,1
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	41033112	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr5	41038971	.	T	TCAGGTAATGCCCG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	41042284	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	41052777	.	A	ATTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,5;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41052777_A_ATTT:41052777:0,0,0,1
chr5	41052780	.	A	ACAGCCTCTAGTTTTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41052777_A_ATTT:41052777:0,0,0,1
chr5	41054862	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:41054862_C_T:41054862:6,4,1,1
chr5	41054867	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,2:0|1:41054862_C_T:41054862:6,4,1,1
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,2:1,3:1,1,1,4
chr5	41069698	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	41069734	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr5	41070793	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	41149284	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	41176634	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,2:7,0:7,4,1,1
chr5	41176824	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=189,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr5	41313618	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	41313733	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,100;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:3,3,2,0
chr5	41313854	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=105,67;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:41313854_C_T:41313854:6,5,1,1
chr5	41313861	.	G	GCCCGTTCTCAATGAGCTGTTGGGTA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=105,67;MMQ=60,45;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:41313854_C_T:41313854:3,4,1,1
chr5	41313886	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=114,64;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,2:1,0:0|1:41313886_C_G:41313886:1,5,1,1
chr5	41313889	.	A	ATGG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=114,64;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0|1:41313886_C_G:41313886:1,5,1,1
chr5	41313891	.	A	ACG	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,24;MFRL=114,64;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,1:1,0:0|1:41313886_C_G:41313886:1,5,1,1
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,11:0,3:0,0,8,6
chr5	41382597	.	G	GGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	41731887	.	A	ATGGAATCG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,1:10,1:3,10,0,2
chr5	41807535	.	T	TCCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=174,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:41807535_T_TCCCC:41807535:0,2,1,1
chr5	41807537	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:41807535_T_TCCCC:41807535:0,2,1,1
chr5	41842746	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=115,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,3,2
chr5	41850103	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=109,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:8,3:1,0:4,5,2,1
chr5	41850369	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	41909830	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.301:19:6,1:4,2:9,5,3,2
chr5	41917377	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=137,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:7,5,2,1
chr5	41927423	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	42713472	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=102,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	42719344	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,3:0,2,4,5
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=113,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:1,2,0,5
chr5	42779690	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,7:2,7:2,4,3,11
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	43122341	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43122341_C_T:43122341:0,2,0,1
chr5	43122352	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43122341_C_T:43122341:0,1,0,1
chr5	43122357	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:43122341_C_T:43122341:0,1,0,1
chr5	43161317	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	43173576	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=118,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	43245870	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,72;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr5	43297339	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43297339_GC_TT:43297339:0,2,0,1
chr5	43297341	.	A	ATATATTAGTTAGCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:43297339_GC_TT:43297339:0,2,0,1
chr5	43297344	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43297339_GC_TT:43297339:0,2,0,1
chr5	43297346	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:43297339_GC_TT:43297339:0,2,0,1
chr5	43297348	.	AAGGACCTTCC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,22;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:43297339_GC_TT:43297339:0,2,0,1
chr5	43298280	.	T	TCCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	43453874	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=121,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:6,8,1,1
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr5	43509155	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=96,115;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43509155_T_C:43509155:1,0,1,0
chr5	43509156	.	ATGGT	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=96,115;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43509155_T_C:43509155:1,0,1,0
chr5	43509162	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=96,115;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43509155_T_C:43509155:1,0,1,0
chr5	43509163	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=96,115;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43509155_T_C:43509155:1,0,1,0
chr5	43509166	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:2,1:0|1:43509155_T_C:43509155:2,0,3,0
chr5	43509168	.	CTGT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,25;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0|1:43509155_T_C:43509155:2,0,3,0
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	43527646	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	43533994	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43533994_T_TCC:43533994:0,3,0,1
chr5	43533995	.	A	AGGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43533994_T_TCC:43533994:0,3,0,1
chr5	43534001	.	A	ATTATGGAGCAAAGAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	43534013	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	43537075	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:9,3:6,15,1,2
chr5	43547856	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.318:26:12,3:6,5:9,9,4,4
chr5	43548030	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:1,0:4,2:0|1:43548030_T_TG:43548030:1,5,0,2
chr5	43548034	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:43548030_T_TG:43548030:1,5,0,2
chr5	43548037	.	A	AGAACGTCACCAACTGT	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=26,27;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:43548030_T_TG:43548030:1,6,0,2
chr5	43548060	.	C	CAGTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:43548060_C_CAGTTT:43548060:0,2,1,1
chr5	43548062	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:43548060_C_CAGTTT:43548060:0,2,1,1
chr5	43548067	.	AC	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=183,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43548060_C_CAGTTT:43548060:0,2,0,1
chr5	43619101	.	ATTAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAT;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr5	43645663	.	TTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TA;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	43659294	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:5,0:0|1:43659294_A_C:43659294:6,2,1,1
chr5	43659295	.	T	TCGAACTCC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:43659294_A_C:43659294:6,2,1,1
chr5	43677772	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	44388482	.	G	GAATCAACCCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:44388482_G_GAATCAACCCA:44388482:3,4,1,1
chr5	44388483	.	G	GCAAACCCAGATTAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=125,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:44388482_G_GAATCAACCCA:44388482:3,4,1,1
chr5	44815041	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:7,8,1,1
chr5	45396542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	45396884	.	A	ATGTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	50055456	.	C	CTT,CTTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,19,29;MFRL=0,109,127;MMQ=60,60,50;MPOS=22,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,18,20;RU=T;STR;TLOD=5.81,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.526,0.388:5:0,1,0:0,0,2:0,0,2,3
chr5	50056085	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr5	50056181	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=107,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.060:48:23,2:23,0:22,24,2,0
chr5	50057782	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:3,3:1,3,0,6
chr5	50122645	.	GT	G,GTT	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=15,20,20;MFRL=119,107,102;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=14.76,7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,9,5:0.342,0.235:24:2,4,3:1,3,0:2,8,4,10
chr5	50122661	.	C	CGAATTGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,2:5,0:6,17,0,2
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	52161500	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:1,3:2,1:3,0,3,1
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	52193442	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	52235582	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	52243361	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	52285312	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.595:25:7,9:3,6:2,8,8,7
chr5	52322721	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	52351377	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,4,3
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr5	52351876	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:5,6:13,3:8,10,4,6
chr5	52353959	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr5	52365923	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.623:10:2,3:1,3:2,2,4,2
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:4,3:0,5,0,6
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:52367706_T_C:52367706:0,0,1,0
chr5	52367715	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=108,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:52367706_T_C:52367706:1,0,2,0
chr5	52368366	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr5	52368472	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=98,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:1,5,5,6
chr5	52369002	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,5:0,0:4,0,4,1
chr5	52369086	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=116,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:8,6:4,4:6,6,5,5
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,1:5,4:7,2,4,1
chr5	52382748	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr5	52394436	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.138:41:12,0:23,5:24,12,2,3
chr5	52397420	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	52398114	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	52404277	.	T	TTAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=61,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0|1:52404277_T_TTAC:52404277:2,0,5,0
chr5	52404287	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0|1:52404277_T_TTAC:52404277:4,0,5,0
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,5:0,4:3,0,6,3
chr5	52404525	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr5	52776657	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr5	52780862	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:14,2:7,0:0|1:52780862_G_A:52780862:11,10,1,1
chr5	52780864	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,2:6,0:0|1:52780862_G_A:52780862:11,10,1,1
chr5	52781517	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:20,3:12,0:14,18,3,0
chr5	52781902	.	CAAAAA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=85,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.220:17:3,1:8,0:9,5,1,2
chr5	52954468	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=93,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:0,5:5,4:2,3,0,9
chr5	52954555	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	52979097	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr5	53450542	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	53467682	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,4:8,0:10,5,4,0
chr5	53814394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	53815722	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr5	53816286	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53816286_G_GA:53816286:1,3,0,1
chr5	53816289	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:53816286_G_GA:53816286:1,3,0,1
chr5	53839212	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=123,60;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:10,2:0|1:53839212_A_G:53839212:8,13,0,2
chr5	53839219	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=124,60;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:53839212_A_G:53839212:10,12,0,2
chr5	54403737	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=143,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,3:5,0:2,7,2,1
chr5	54403836	.	C	CTTAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54403836_C_CTTAA:54403836:0,0,0,1
chr5	54403837	.	C	CAAGCATTATCTGTTTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:54403836_C_CTTAA:54403836:0,0,0,1
chr5	54410120	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.943:16:0,10:0,5:0,0,5,11
chr5	54415826	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54415826_T_TG:54415826:0,1,0,1
chr5	54415828	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54415826_T_TG:54415826:0,1,0,1
chr5	54415831	.	T	TCTACAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:54415826_T_TG:54415826:0,1,0,1
chr5	54424540	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	54528435	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528435_G_T:54528435:0,0,0,1
chr5	54528439	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528435_G_T:54528435:0,0,0,1
chr5	54528444	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54528435_G_T:54528435:0,0,0,1
chr5	54529085	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=89,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54529085_G_A:54529085:1,1,0,1
chr5	54529087	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=89,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:54529085_G_A:54529085:1,1,0,1
chr5	54529111	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	54586250	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	54586265	.	T	TGCTTGCTTAATTGTCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	54654453	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:4,3:1,0:4,2,3,0
chr5	54662559	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:11,7,2,0
chr5	54674304	.	GTTTGGTAAAGGTATGTCATTGTTTCTTCATAAAATACTTGAATAATTCAATATTTAAACATATT	G	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:17,0:21,4:14,32,2,2
chr5	54674321	.	CATTGTTTCTTCATAAAATACTTGAATAATTCAATATTTAAACATATTTTTGTTAAAGATTCTAATTT	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.084:32:12,0:11,2:6,24,1,1
chr5	54674332	.	CATAAAATACTTGAATAATTCAATATTTAAACATATTTTTGTTAAAGATTCTAATTTATTTTTTATTCTG	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.134:26:8,3:7,1:1,19,4,2
chr5	54675077	.	T	TGGGGACTATAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,2:0,0,5,4
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr5	54710072	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=110,67;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.401:17:4,3:5,4:2,8,2,5
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.837:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	54721681	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=110,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,5:6,0:7,5,5,0
chr5	54721957	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.487:2:0,0:1,1:0|1:54721957_C_A:54721957:0,1,0,1
chr5	54721959	.	A	ACACCACTGGAGCGATGTGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54721957_C_A:54721957:0,1,0,1
chr5	54737681	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:0|1:54737681_C_CT:54737681:7,8,1,1
chr5	54737682	.	C	CTATGAAA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:54737681_C_CT:54737681:7,8,1,1
chr5	54737684	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:54737681_C_CT:54737681:7,8,1,1
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	54763986	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=120,90;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54763986_G_C:54763986:0,1,0,1
chr5	54763992	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=120,90;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:54763986_G_C:54763986:0,1,0,1
chr5	54941810	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	54944945	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr5	54948586	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.820:9:0,2:1,4:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,1,1,7
chr5	54948598	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,2:1,2:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,1,0,7
chr5	54948613	.	A	ACCTGAAGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,4,0,1
chr5	54948618	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,18;MFRL=127,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,2,0,2
chr5	54960673	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,5,13
chr5	54960687	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,2,9
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr5	54993752	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,1,1
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr5	55059727	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55059727_A_C:55059727:0,0,1,0
chr5	55059729	.	G	GGTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:55059727_A_C:55059727:0,0,1,0
chr5	55082572	.	C	CCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55082572_C_CCAGGG:55082572:0,1,0,1
chr5	55082574	.	TTTGA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:55082572_C_CCAGGG:55082572:0,1,0,1
chr5	55082575	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:55082572_C_CCAGGG:55082572:0,0,0,1
chr5	55082582	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,1:0,0:1|0:55082572_C_CCAGGG:55082572:0,0,0,1
chr5	55178976	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,4:1,2:3,4,3,3
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,6,6
chr5	55192281	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=100,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,6:0.159:42:17,0:19,6:15,21,0,6
chr5	55196023	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	55206444	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr5	55248078	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:5,1:9,1:8,7,1,1
chr5	55250660	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,1:0,3,1,1
chr5	55252984	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=77,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.487:17:1,1:3,6:3,6,6,2
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr5	55398366	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,3:9,0:9,11,0,3
chr5	55412347	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	55412471	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:5,6:10,3:6,9,4,5
chr5	55422681	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=77,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	55455565	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr5	56167790	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,85;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:8,2,4,0
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.839:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	56181951	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:1,0:2,2:0,3,0,4
chr5	56181963	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.465:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	56181969	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:56181969_A_G:56181969:0,1,0,1
chr5	56181973	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56181969_A_G:56181969:0,0,0,1
chr5	56181982	.	GT	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:56205643_A_G:56205643:0,0,0,9
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:56205643_A_G:56205643:0,0,0,7
chr5	56209833	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:56209833_G_GA:56209833:2,4,1,1
chr5	56209834	.	G	GACTGATCACCACACA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=112,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:56209833_G_GA:56209833:2,4,1,1
chr5	56209841	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:56209841_A_G:56209841:1,3,1,1
chr5	56209843	.	A	ATTTTTCAC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=128,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:56209841_A_G:56209841:1,3,1,1
chr5	56209876	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	56219181	.	T	TCTTC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:56219181_T_TCTTC:56219181:2,4,1,1
chr5	56219184	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=115,58;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:56219181_T_TCTTC:56219181:2,5,1,1
chr5	56219185	.	A	ATCTCCCAATAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=129,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0|1:56219181_T_TCTTC:56219181:2,4,1,1
chr5	56224714	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	56510096	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:0,6,0,2
chr5	56526603	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=97,128;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:8,5:8,6:7,9,4,7
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=96,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.530:17:3,3:4,6:2,6,1,8
chr5	56527155	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:56527155_T_TA:56527155:2,10,0,2
chr5	56527158	.	T	TTCAAGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:56527155_T_TA:56527155:2,10,0,2
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	56545475	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:0,3,4,0
chr5	56546749	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr5	56778003	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=107,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=102,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	57755843	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr5	57790924	.	T	TAAGTGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,0,0,1
chr5	57790927	.	TC	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,0,0,1
chr5	57792549	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:2,2,4,3
chr5	57792855	.	T	TTAGCAGTCAGGCCACTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=95,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:7,2:14,0:12,9,0,2
chr5	57793001	.	T	TAGTAGTACCATGTGAGTCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	58270457	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	58271526	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=121,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:6,6,4,0
chr5	58271696	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,954;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr5	58272116	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr5	58272139	.	GAC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=101,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:8,1:5,3:7,6,3,1
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,5,3
chr5	58286737	.	GAAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,35;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.339:4:0,0:0,1:0,3,0,1
chr5	58286762	.	A	ACAG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58286762_A_ACAG:58286762:0,3,0,1
chr5	58286763	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:58286762_A_ACAG:58286762:0,3,0,1
chr5	58286765	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:58286762_A_ACAG:58286762:0,4,0,1
chr5	58286770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:58286762_A_ACAG:58286762:0,4,0,1
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	58489384	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr5	59188933	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	59189213	.	GGGC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr5	59189312	.	GG	AA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=110,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:1,0:3,2,0,1
chr5	59893643	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=97,58;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,0:14,3:12,15,0,3
chr5	60060147	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=111,27;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:5,10,1,1
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	60170518	.	A	AAGAAAT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=23,26;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,0:3,2:0|1:60170518_A_AAGAAAT:60170518:0,6,0,2
chr5	60170526	.	AT	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=104,133;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:5,2:0|1:60170518_A_AAGAAAT:60170518:0,6,0,2
chr5	60170531	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=104,133;MMQ=48,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:60170518_A_AAGAAAT:60170518:0,4,0,2
chr5	60186974	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	60217999	.	T	TAGGTAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAAACCCAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=161,151;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,1:3,0:1,4,0,1
chr5	60241090	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=117,95;MMQ=46,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,2:14,0:16,11,1,1
chr5	60790037	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,4:1,0:3,3,2,2
chr5	60821821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr5	60821845	.	TT	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60821845_TT_CA:60821845:0,2,0,1
chr5	60821852	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60821845_TT_CA:60821845:0,2,0,1
chr5	60821856	.	T	TCCTTCCTTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60821845_TT_CA:60821845:0,2,0,1
chr5	60999867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=128,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:60999867_T_C:60999867:0,2,0,1
chr5	60999868	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=128,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:60999867_T_C:60999867:0,2,0,1
chr5	60999872	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=128,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:60999867_T_C:60999867:0,2,0,1
chr5	60999892	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60999892_T_C:60999892:0,0,0,1
chr5	60999900	.	G	GCTACTTTCTTTGGTCAAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:60999892_T_C:60999892:0,0,0,1
chr5	61643816	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr5	61657228	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:4,3,1,3
chr5	61657377	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=162,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,9:5,1:2,7,3,7
chr5	61661206	.	G	GTTTCGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.365:6:3,2:1,0:0|1:61661206_G_GTTTCGT:61661206:1,3,1,1
chr5	61661211	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:61661206_G_GTTTCGT:61661206:1,3,0,1
chr5	61661216	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=164,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:61661206_G_GTTTCGT:61661206:0,2,0,1
chr5	61661217	.	A	ATGTTTTCTTGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=164,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:0,0:0|1:61661206_G_GTTTCGT:61661206:0,2,0,1
chr5	61669490	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=164,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:3,0,4,2
chr5	61669503	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:3,1,4,3
chr5	61686647	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,138;MMQ=52,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	61699465	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:2,4:3,1:2,3,4,1
chr5	61745737	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,6:0,0,9,9
chr5	61747811	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,23;MFRL=148,143;MMQ=60,56;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,1:0,6,0,2
chr5	61747834	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=159,139;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	61747851	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=165,145;MMQ=54,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61747851_C_T:61747851:0,4,0,1
chr5	61747854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=165,145;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61747851_C_T:61747851:0,4,0,1
chr5	61747856	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=165,145;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:61747851_C_T:61747851:0,4,0,1
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	61781396	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=137,128;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61781396_G_A:61781396:0,4,0,1
chr5	61781403	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=137,128;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61781396_G_A:61781396:0,4,0,1
chr5	61781404	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=137,128;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:61781396_G_A:61781396:0,4,0,1
chr5	61781405	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	61781408	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=136,140;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	61800748	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	61874642	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,17;MFRL=87,0;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:0,0:0|1:61874642_T_G:61874642:0,2,1,0
chr5	61874647	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,17;MFRL=87,0;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:61874642_T_G:61874642:0,2,1,0
chr5	61874650	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=87,0;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:61874642_T_G:61874642:0,2,1,0
chr5	61874671	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,13;MFRL=0,0;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:61874642_T_G:61874642:0,0,1,0
chr5	62072524	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr5	62073031	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,69;MMQ=59,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,1:9,2:11,2,1,2
chr5	62073118	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	63510420	.	A	AATGTTCATGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=237,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	63905068	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.951:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr5	64070617	.	A	AAATTATGAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr5	64084746	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=60,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.503:12:1,3:4,3:4,2,5,1
chr5	64096170	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,5:2,1:1,6,2,4
chr5	64314146	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=188,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,0:0,2:0|1:64314146_T_A:64314146:0,5,1,1
chr5	64314148	.	A	ACCTAGGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=188,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:64314146_T_A:64314146:0,5,1,1
chr5	64314150	.	A	ATACCAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:3,0:1,2:0|1:64314146_T_A:64314146:0,4,1,1
chr5	64447767	.	TGC	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:64447767_TGC_T:64447767:4,1,1,1
chr5	64447771	.	C	CCCATAATTATAT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=101,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:64447767_TGC_T:64447767:4,1,1,1
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,3,1
chr5	64756186	.	G	GTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	64769450	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=24,21;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.125:45:20,5:20,0:23,17,5,0
chr5	64817458	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=164,177;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64817458_AT_GC:64817458:0,2,0,1
chr5	64817462	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=164,177;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64817458_AT_GC:64817458:0,2,0,1
chr5	64817465	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=164,177;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64817458_AT_GC:64817458:0,2,0,1
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:7,2,3,2
chr5	64838726	.	A	AAAACAAAAAACAACAAACAAAAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=247,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.475:2:1,0:0,1:0|1:64838726_A_AAAACAAAAAACAACAAACAAAAAAC:64838726:0,1,0,1
chr5	64838730	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,21;MFRL=247,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64838726_A_AAAACAAAAAACAACAAACAAAAAAC:64838726:0,1,0,1
chr5	64838734	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=247,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64838726_A_AAAACAAAAAACAACAAACAAAAAAC:64838726:0,1,0,1
chr5	64847514	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=117,85;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,4:8,0:1,17,0,4
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr5	64863484	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:5,1:2,1:0,7,0,4
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	64880982	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0|1:64880982_T_G:64880982:0,1,0,1
chr5	64880984	.	A	ATAAAACAGATATATAAAAAAATGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=21,25;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64880982_T_G:64880982:0,1,0,1
chr5	64882016	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,0,2
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	64914107	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:64914107_G_T:64914107:0,2,0,1
chr5	64914130	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=269,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64914107_G_T:64914107:0,1,0,1
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:4,2,2,1
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr5	64931761	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,0:10,2:9,3,1,1
chr5	64933457	.	C	CA	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=123,117;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.381:45:3,3:14,8:15,13,9,8
chr5	64933473	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,97;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.108:61:14,4:25,1:24,29,4,4
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	64948243	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,131;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr5	64951512	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=110,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.503:24:5,9:7,3:7,5,5,7
chr5	64960311	.	A	ATCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TC;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:5,1,2,0
chr5	65008909	.	T	TGTCTAGGAAGCAGCCATGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,5:0,0,13,3
chr5	65083937	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:65083937_CCT_C:65083937:3,0,1,1
chr5	65083940	.	T	TCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=144,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:65083937_CCT_C:65083937:3,0,1,1
chr5	65083948	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=144,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:0|1:65083937_CCT_C:65083937:4,1,1,1
chr5	65083950	.	T	TAGCGGTGCGTGTG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=144,40;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,0:2,2:0|1:65083937_CCT_C:65083937:4,1,1,1
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr5	65342119	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,30653;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	65350280	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=137,495;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:7,0:7,6:9,6,6,0
chr5	65372793	.	C	CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,15418;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:8,0:15,2:10,13,0,2
chr5	65460785	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:65460785_A_G:65460785:0,0,0,1
chr5	65460799	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:65460785_A_G:65460785:0,1,1,0
chr5	65460814	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:65460785_A_G:65460785:0,1,1,0
chr5	65466666	.	C	G	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.090:75:31,0:37,6:32,37,6,0
chr5	65466667	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=118,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.050:76:33,1:40,2:38,35,0,3
chr5	66088217	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=161,998;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr5	66195701	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=120,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:3,7:6,5:8,1,9,3
chr5	66255027	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.314:10:5,2:2,0:7,0,3,0
chr5	66259675	.	C	CTAGAAGCAGCCCTGAGAAGCAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr5	66282428	.	TTA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr5	66300721	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:7,1,4,0
chr5	66386001	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:7,0:10,3:10,7,3,0
chr5	66386166	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:66386166_T_TCA:66386166:0,1,0,1
chr5	66386170	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66386170_CCT_C:66386170:0,1,0,1
chr5	66386172	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.733:2:0,1:0,1:0|1:66386166_T_TCA:66386166:0,0,0,2
chr5	66386174	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66386170_CCT_C:66386170:0,1,0,1
chr5	66391521	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,0:5,4:0|1:66391521_T_G:66391521:0,5,0,4
chr5	66391525	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,0:5,4:0|1:66391521_T_G:66391521:0,5,0,4
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr5	66432581	.	T	TCGGGATAGAAGAGTTACATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	66460613	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr5	66479348	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,310;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:7,6,2,0
chr5	66479482	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr5	66481594	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	67522851	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=121,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:1,3:6,8:4,3,4,7
chr5	67584525	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,10;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:4,0:3,0:9,1,3,0
chr5	67587994	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	68390120	.	CCGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	68396764	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=110,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,0:3,1,0,2
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,1,5
chr5	68467240	.	A	AGTACCAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=176,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:1,4,1,1
chr5	68470308	.	AGTCTG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=146,169;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68470308_AGTCTG_A:68470308:0,2,0,1
chr5	68470319	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=146,169;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68470308_AGTCTG_A:68470308:0,2,0,1
chr5	68470328	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=146,169;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:68470308_AGTCTG_A:68470308:0,2,0,1
chr5	68470333	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=157,169;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:68470308_AGTCTG_A:68470308:0,1,0,1
chr5	68473456	.	TAACTTGTA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:6,0:2,8,1,1
chr5	68490601	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,93;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,0:4,2:0,11,1,1
chr5	68504276	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0|1:68504276_T_TC:68504276:0,4,0,2
chr5	68504281	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=123,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:68504276_T_TC:68504276:0,4,0,1
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr5	68565086	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=112,187;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.154:43:14,0:23,6:13,24,0,6
chr5	68565098	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:4,17,0,3
chr5	68602688	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:13,0:11,11,2,0
chr5	68648142	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:68648142_G_C:68648142:0,1,0,1
chr5	68648143	.	A	AAACTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=15,26;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:68648142_G_C:68648142:0,1,0,1
chr5	68648148	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:68648142_G_C:68648142:0,0,0,2
chr5	68648153	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=12,24;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:68648142_G_C:68648142:0,1,0,1
chr5	68648154	.	A	C,ATTTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,19,21;MFRL=0,168,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,0,1:0,0,0,2
chr5	68648157	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:68648142_G_C:68648142:0,1,0,1
chr5	68667263	.	TCCCCCC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=135,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,9;RU=C;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.421:8:0,1:0,2:0|1:68667263_TCCCCCC_T:68667263:4,1,1,2
chr5	68667273	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.389:11:1,4:6,0:1|0:68667263_TCCCCCC_T:68667263:1,6,4,0
chr5	68680841	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:68680841_CA_TG:68680841:0,3,0,1
chr5	68680847	.	CGC	TAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68680841_CA_TG:68680841:0,3,0,1
chr5	68692375	.	T	TAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:0,0:1,1:0,3,0,2
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.934:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr5	68716402	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68716402_T_TG:68716402:0,1,0,1
chr5	68716405	.	T	TACTTCAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68716402_T_TG:68716402:0,1,0,1
chr5	68716409	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68716402_T_TG:68716402:0,1,0,1
chr5	68716411	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:68716402_T_TG:68716402:0,1,0,1
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr5	68862362	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=131,117;MMQ=32,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,5:1,0:4,0,4,1
chr5	68862363	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=118,118;MMQ=45,21;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:1,1:7,1,2,0
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=136,117;MMQ=44,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:2,5:0,2:2,0,7,2
chr5	70351263	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,164;MMQ=25,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr5	70398830	.	GA	AT	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=97,153;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.054:54:33,0:16,2:22,30,0,2
chr5	70398901	.	TAATATA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70398901_TAATATA_T:70398901:0,0,0,1
chr5	70398908	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70398901_TAATATA_T:70398901:0,0,0,1
chr5	70751818	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,17:0,0,10,12
chr5	70760050	.	CAGT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,45;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:70760050_CAGT_C:70760050:0,4,1,1
chr5	70760054	.	G	GACA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,45;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:0,2:0|1:70760050_CAGT_C:70760050:0,4,1,1
chr5	70760056	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,20;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:70760050_CAGT_C:70760050:0,1,1,1
chr5	70760061	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:70760050_CAGT_C:70760050:0,0,1,1
chr5	70763088	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	70763240	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,0:3,3:6,5,0,3
chr5	70786726	.	G	GAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	70787049	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=137,125;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:2,0:1,1:0|1:70787049_TG_CA:70787049:1,2,0,1
chr5	70787053	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=147,125;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.322:5:2,0:1,1:0|1:70787049_TG_CA:70787049:1,3,0,1
chr5	70787057	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,125;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:70787049_TG_CA:70787049:1,2,0,1
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr5	70806457	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,5,13
chr5	70806649	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	70809269	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.669:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,14,10
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,57;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr5	70840233	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,17,8
chr5	70840433	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	70888931	.	T	TGCCAGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=187,146;MMQ=40,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:70888931_T_TGCCAGGGGG:70888931:0,3,0,1
chr5	70888933	.	G	GTGGTCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,146;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:70888931_T_TGCCAGGGGG:70888931:0,3,0,1
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr5	70948618	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=172,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,1,3
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr5	71015358	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71015358_C_A:71015358:0,0,0,1
chr5	71015360	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71015358_C_A:71015358:0,0,0,1
chr5	71015364	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71015358_C_A:71015358:0,0,0,1
chr5	71015365	.	C	CACGCACGCACGCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71015358_C_A:71015358:0,0,0,1
chr5	71403555	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403557	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403559	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403561	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403565	.	A	ACCTGGGGCC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403567	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71403568	.	C	CCCAT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71403555_G_C:71403555:0,0,0,1
chr5	71482380	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	71492223	.	A	AGTGTCACTCGCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	71492959	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=106,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr5	71495781	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:3,0:0,1:0|1:71495781_C_T:71495781:1,2,0,1
chr5	71495788	.	A	ATCTCCCTTCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:71495781_C_T:71495781:1,2,0,1
chr5	71496231	.	A	AACCCACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=257,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71496231_A_AACCCACC:71496231:0,1,0,1
chr5	71496236	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=257,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71496231_A_AACCCACC:71496231:0,1,0,1
chr5	71496237	.	T	TCCTGAGGTCAAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=257,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:71496231_A_AACCCACC:71496231:0,1,0,1
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	71533945	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:5,9,2,0
chr5	71591428	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=121,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:8,0:15,5:4,19,0,5
chr5	71631528	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	71654084	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=132,623;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	72112647	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	72112680	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	72157835	.	A	AGTAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=183,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72157835_A_AGTAAT:72157835:0,1,0,1
chr5	72157836	.	C	CTCACTTAAAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72157835_A_AGTAAT:72157835:0,1,0,1
chr5	72182857	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	72185591	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.279:22:3,2:9,3:12,4,5,1
chr5	72187746	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=823,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:72187746_A_T:72187746:0,2,0,1
chr5	72187747	.	ATCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=823,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:72187746_A_T:72187746:0,2,0,1
chr5	72192419	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:5,13,0,2
chr5	72192434	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=144,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:2,15,0,2
chr5	72192454	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=163,105;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:0,13,0,2
chr5	72199552	.	G	GTGTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.321:7:3,2:1,0:0|1:72199552_G_GTGTT:72199552:3,2,1,1
chr5	72199555	.	A	ATTTTGGATAGTATCTAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.321:7:4,2:1,0:0|1:72199552_G_GTGTT:72199552:3,2,1,1
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	72201291	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72201291_G_A:72201291:0,1,0,1
chr5	72201292	.	G	GCAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:72201291_G_A:72201291:0,1,0,1
chr5	72347188	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=119,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,3:11,0:11,6,2,1
chr5	72424224	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=109,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:9,5,1,1
chr5	72798502	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	72866584	.	GTTTGTTTAAAATCAGTTGCTCTTTGTAATTTATCAGTGTGCATTTGAATTGCATATCTAAGTC	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=125,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.256:6:2,0:3,1:0,5,0,1
chr5	72866620	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:72866620_G_C:72866620:0,0,0,1
chr5	72866624	.	G	GCTGTTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:72866620_G_C:72866620:0,0,0,1
chr5	72866628	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:72866620_G_C:72866620:0,0,0,1
chr5	73048702	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,2:10,0:9,7,0,2
chr5	73072504	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:2,4,0,6
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=116,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	73091149	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr5	73153389	.	TACAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AC;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	73153545	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,3:10,0:7,9,0,3
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,0:2,4:2,5,1,3
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	73188152	.	C	CTCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=262,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	73189073	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:5,5,1,1
chr5	73197172	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr5	73197200	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	73930969	.	C	CTCATGTTTCTCACATTTCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73930969_C_CTCATGTTTCTCACATTTCA:73930969:0,2,0,1
chr5	73930973	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=169,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:73930969_C_CTCATGTTTCTCACATTTCA:73930969:0,2,0,1
chr5	73930989	.	C	CAACAG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=199,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73930989_C_CAACAG:73930989:1,1,0,1
chr5	73930990	.	T	TGTAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=199,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73930989_C_CAACAG:73930989:1,1,0,1
chr5	73930991	.	C	CAGGAA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=199,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73930989_C_CAACAG:73930989:1,1,0,1
chr5	73930994	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,23;MFRL=199,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:73930989_C_CAACAG:73930989:1,1,0,1
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr5	74009521	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=135,147;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:9,0:0,1:0,9,0,2
chr5	74011541	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=94,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.211:18:3,1:7,1:5,10,1,2
chr5	74011607	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,23;MFRL=137,143;MMQ=58,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74011607_A_C:74011607:0,2,0,1
chr5	74011611	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=137,143;MMQ=58,47;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74011607_A_C:74011607:0,2,0,1
chr5	74011615	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	74037303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=119,254;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:7,2:8,0,2,0
chr5	74072339	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,3:9,0:11,0,3,0
chr5	74101192	.	C	CCATCTTTCTTTTTTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.758:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	74325110	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=97,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr5	74640068	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:9,4:19,0:15,13,2,2
chr5	74646236	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:4,13,0,2
chr5	74646878	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,6,1
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:2,2,2,5
chr5	74655726	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr5	74656175	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=107,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,3:0,4:2,2,2,5
chr5	74680437	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:4,1:2,3:2,4,4,0
chr5	74698750	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:3,2,1,3
chr5	74842760	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=142,160;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:74842760_A_G:74842760:7,0,2,0
chr5	74842768	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=127,146;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,3:4,0:0|1:74842760_A_G:74842760:8,0,3,0
chr5	74842772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=127,134;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0|1:74842760_A_G:74842760:8,0,2,0
chr5	74872811	.	C	CTAGGAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:74872811_C_CTAGGAAG:74872811:0,0,0,2
chr5	74872813	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:74872811_C_CTAGGAAG:74872811:0,0,0,2
chr5	74880595	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=137,173;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:11,5:5,0:7,10,5,0
chr5	74973530	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	74986361	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=113,316;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:3,11,1,1
chr5	75008347	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75008347_AT_A:75008347:0,0,0,1
chr5	75008352	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75008347_AT_A:75008347:0,0,0,1
chr5	75427518	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr5	75427935	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:2,2,4,3
chr5	75594656	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:2,7,1,1
chr5	75597302	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr5	75757322	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	75884734	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:8,4,3,2
chr5	75884904	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=155,167;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:75884904_C_T:75884904:0,4,0,1
chr5	75884909	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=158,161;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0,2,0,2
chr5	75884913	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=156,167;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:75884904_C_T:75884904:0,3,0,1
chr5	75884914	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=160,154;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	75886168	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	75888788	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:2,4,3,5
chr5	75902191	.	T	TCCTTCTGATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=172,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:75902191_T_TCCTTCTGATGC:75902191:0,1,0,1
chr5	75902194	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=172,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75902191_T_TCCTTCTGATGC:75902191:0,1,0,1
chr5	75923141	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	75923393	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:1,1:3,2:0,4,0,4
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr5	75927635	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=100,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:3,2,3,1
chr5	75927789	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=102,135;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,0,2
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr5	75936750	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=95,53;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:6,5,0,2
chr5	75936764	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=95,53;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:5,6,0,2
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	75960818	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,5,0
chr5	75960825	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,7,0
chr5	75964462	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr5	75964702	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	75967510	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr5	75967719	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:10,4,1,1
chr5	75997063	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:75997063_A_G:75997063:0,6,0,4
chr5	75997069	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:4,1:2,2:0|1:75997063_A_G:75997063:0,6,0,4
chr5	76129053	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,5,4
chr5	76173727	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	76259350	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	76326742	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=93,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr5	76332587	.	C	CGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,2:5,0:0|1:76332587_C_CGG:76332587:2,10,1,1
chr5	76332594	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:4,0:0|1:76332587_C_CGG:76332587:1,9,1,1
chr5	76355362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=113,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr5	76607930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.624:9:3,3:0,1:1,2,2,4
chr5	76621612	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	76708940	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=116,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,4:7,0:13,4,3,1
chr5	76708977	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=107,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:12,4:14,0:15,13,3,1
chr5	76708987	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=99,60;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:9,5:11,3:11,9,3,5
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0|1:76747087_T_C:76747087:0,0,10,4
chr5	76747097	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,4:5,0:0|1:76747087_T_C:76747087:12,4,3,1
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,4:0,0,12,1
chr5	76760657	.	G	GA,GAA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33,17;MFRL=0,142,132;MMQ=60,60,60;MPOS=16,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=51.68,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,20,3:0.815,0.150:23:0,6,0:0,11,0:0,0,3,20
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.427:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr5	76785406	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=16,29;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:0,2:0,1:0|1:76785406_GA_G:76785406:0,3,1,3
chr5	76785408	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0|1:76785406_GA_G:76785406:0,3,1,3
chr5	76787919	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	77311447	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=240,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.571:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	77409744	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=104,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:4,0:15,4:4,17,0,4
chr5	77523337	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:9,2:2,0:6,6,0,2
chr5	77536799	.	TATATA	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:9,2:0|1:77536799_TATATA_T:77536799:5,15,1,1
chr5	77536806	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:0|1:77536799_TATATA_T:77536799:3,15,1,1
chr5	77536813	.	T	TGCTG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:77536799_TATATA_T:77536799:2,14,1,1
chr5	77536816	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=123,54;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,0:9,2:0|1:77536799_TATATA_T:77536799:2,14,1,1
chr5	77717681	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=104,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.249:46:18,5:17,6:13,22,4,7
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=87.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,7,21
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr5	78076124	.	GTGAACCCAGGTTGGGATAACAAATGAGACAAGAGTCGTGAGAAAAGGCCTGAGGTCCAACTTCCAAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:0,1:0,0:2,1,1,0
chr5	78135276	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=124,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,2:4,1:3,4,0,3
chr5	78251347	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=167,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:0,3:0,2,1,2
chr5	78265092	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=66,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:78265092_C_T:78265092:0,2,0,3
chr5	78265096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=66,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,1:0|1:78265092_C_T:78265092:0,2,0,3
chr5	78280974	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	78324208	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	78324482	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=100,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr5	78326797	.	CC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr5	78328702	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=73,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78328702_C_T:78328702:0,2,0,1
chr5	78328726	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=89,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:78328702_C_T:78328702:0,2,0,1
chr5	78340448	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	78373482	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=133,1010;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78373482_T_C:78373482:0,1,1,0
chr5	78373484	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=133,1010;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78373482_T_C:78373482:0,1,1,0
chr5	78373491	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=133,1010;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78373482_T_C:78373482:0,1,1,0
chr5	78373492	.	T	TTCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=133,1010;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:78373482_T_C:78373482:0,1,1,0
chr5	78375318	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:78375318_C_A:78375318:1,3,0,1
chr5	78375320	.	T	TGGAAGTAAAAACG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:78375318_C_A:78375318:1,3,0,1
chr5	78411822	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=120,3139559;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr5	78416973	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,1:2,1:2,1,2,0
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	78573790	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:2,5,6,0
chr5	78586906	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78586906_A_G:78586906:0,0,1,0
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:78586906_A_G:78586906:0,0,1,0
chr5	78608354	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,19,21;MFRL=186,118,103;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.43,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.341,0.506:8:0,0,1:0,1,2:0,1,1,6
chr5	78610439	.	TCCAACACCACCACCTCCCCCACCTCCTCCCCCTCCC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=124,37;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.221:20:4,0:6,3:3,13,4,0
chr5	78808703	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	78915992	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	78964924	.	C	CAGGTATCAGAGTGTTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78964924_C_CAGGTATCAGAGTGTTA:78964924:0,0,0,1
chr5	78964928	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78964924_C_CAGGTATCAGAGTGTTA:78964924:0,0,0,1
chr5	78964931	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78964924_C_CAGGTATCAGAGTGTTA:78964924:0,0,0,1
chr5	78964934	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:78964924_C_CAGGTATCAGAGTGTTA:78964924:0,0,0,1
chr5	78981171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:1,2,0,4
chr5	79057813	.	G	GAAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	79086903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,25;MFRL=65,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr5	79086920	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:79086920_GC_G:79086920:0,3,1,1
chr5	79086922	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:79086920_GC_G:79086920:0,3,1,1
chr5	79095483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=61,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0,2,0,2
chr5	79284375	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,0:5,2:10,4,0,2
chr5	79285991	.	T	TAAAGGC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=110,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:21,2:18,2:20,19,0,4
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	79351852	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr5	79355471	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	79366080	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	79366249	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr5	79366886	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=109,143;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,2:7,2:10,8,4,0
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	79368048	.	TAGA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:5,0,6,0
chr5	79369213	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	79369227	.	G	GATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	79378447	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.655:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr5	79442084	.	TCAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79442084_TCAA_T:79442084:0,1,0,1
chr5	79442088	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79442084_TCAA_T:79442084:0,1,0,1
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	79617143	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:3,1:4,5,2,0
chr5	79617413	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,0:3,3:6,2,2,1
chr5	79734297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr5	79744202	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr5	79770678	.	G	GCTGTGAGGAGTAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	79855309	.	C	CCTCAGCTTGCAAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=51,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr5	79855912	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79855912_C_T:79855912:0,1,0,1
chr5	79855920	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79855912_C_T:79855912:0,1,0,1
chr5	79855923	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79855912_C_T:79855912:0,1,0,1
chr5	79855927	.	T	TAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=102,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:79855912_C_T:79855912:0,1,0,1
chr5	79933884	.	A	ACTGCATCTTAGTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr5	79945140	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,4:1,2:6,0,6,0
chr5	79952426	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	79968137	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=100,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,0:12,4:12,13,0,4
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	80021193	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	80021445	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr5	80088564	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=124,82;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,0:8,3:15,10,3,0
chr5	80160596	.	AAATG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	80256786	.	CCCGCGCCACCCAGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	80382640	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=105,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr5	80382848	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	80409526	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,2:4,5:6,1,3,4
chr5	80504342	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:80504342_T_A:80504342:0,2,0,1
chr5	80504345	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=127,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:80504342_T_A:80504342:0,2,0,1
chr5	80521686	.	GG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=220,52952222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80521686_GG_CC:80521686:0,1,1,0
chr5	80521691	.	C	CTTCTCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=220,52952222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:80521686_GG_CC:80521686:0,1,1,0
chr5	80547156	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=132,144;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	80547176	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=159,144;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	80552777	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,2:4,0:4,12,2,0
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:3,1,4,0
chr5	80640922	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	80655709	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:3,3,5,1
chr5	80724572	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	80733270	.	TCCTGAG	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=97,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:17,0:16,2:17,20,1,1
chr5	80733284	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=97,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:16,0:17,3:16,17,0,3
chr5	80769686	.	C	CATATGTAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=178,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:80769686_C_CATATGTAAA:80769686:0,1,0,1
chr5	80769688	.	A	AAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=178,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:80769686_C_CATATGTAAA:80769686:0,1,0,1
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:7,3,5,1
chr5	80785147	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:11,0:11,6:11,11,0,6
chr5	81283559	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=125,154;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:0|1:81283559_G_T:81283559:0,10,0,2
chr5	81283562	.	T	TTC	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=132,154;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,1:0|1:81283559_G_T:81283559:0,10,0,2
chr5	81283563	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=132,154;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,1:0|1:81283559_G_T:81283559:0,10,0,2
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,14,1
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	81574013	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.644:3:0,1:1,1:0|1:81574013_T_TG:81574013:1,0,2,0
chr5	81574019	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=8,11;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.636:3:0,0:0,0:0|1:81574013_T_TG:81574013:1,0,2,0
chr5	81574023	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=14,12;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.636:3:0,0:0,0:0|1:81574013_T_TG:81574013:1,0,2,0
chr5	82360783	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=114,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:13,7:7,5:12,8,8,4
chr5	82360944	.	GAA	GA,G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,18,18;MFRL=130,22965502,150;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,10;RU=A;STR;TLOD=3.14,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.206,0.174:12:1,0,0:2,0,0:1,7,0,4
chr5	82786296	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=201,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:82786296_G_GAA:82786296:0,2,1,1
chr5	82786297	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=201,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:82786296_G_GAA:82786296:0,2,1,1
chr5	82816235	.	CAAGA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr5	82817839	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=143,106;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:7,9,0,3
chr5	82834058	.	AGAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:2,0,1,0
chr5	82834663	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,0:0,3:3,0,1,2
chr5	82875800	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=108,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:4,2,2,1
chr5	83259189	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=65,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	83356243	.	G	GGTATGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=100,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,1,1
chr5	83433032	.	CACACAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:83433032_CACACAT_C:83433032:2,1,1,0
chr5	83433045	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=162,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:83433032_CACACAT_C:83433032:2,2,1,0
chr5	83433159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr5	83433187	.	A	AAAGTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:83433187_A_AAAGTTTT:83433187:0,3,0,1
chr5	83433190	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:83433187_A_AAAGTTTT:83433187:0,3,0,1
chr5	83525797	.	A	AGGGGAAGAATCTAACTGGCAGGAGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.446:2:0,1:1,0:0|1:83525797_A_AGGGGAAGAATCTAACTGGCAGGAGG:83525797:0,1,0,1
chr5	83525799	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.446:2:0,1:1,0:0|1:83525797_A_AGGGGAAGAATCTAACTGGCAGGAGG:83525797:0,1,0,1
chr5	83680146	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=147,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:1,1,1,1
chr5	86667856	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	86679495	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.471:11:2,3:4,2:4,2,4,1
chr5	86679676	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	86685143	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=150,147;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:9,0,2,0
chr5	86685157	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,147;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:9,2,2,0
chr5	87493557	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=97,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:10,0:12,12,1,1
chr5	87498902	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=149,156;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	87502325	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,3:0,0,9,10
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=229,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	87524307	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=124,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:4,9,1,1
chr5	88027766	.	T	TGTAAAAAAGGAAATATCTTCGTATAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	88047737	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,3:9,0:16,4,3,0
chr5	88119683	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,159;MMQ=57,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,0:0,4:0,4,0,4
chr5	89705390	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,2:0,0,5,2
chr5	89769647	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr5	89781543	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:89781543_A_T:89781543:1,8,1,1
chr5	89781544	.	T	TTTGGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=127,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:89781543_A_T:89781543:1,8,1,1
chr5	89814604	.	G	GTGACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	89918582	.	C	CGG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=158,170;MMQ=50,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:89918582_C_CGG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918584	.	G	GAGTCTTGC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=170,139;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.357:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	89918588	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,27;MFRL=158,170;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:89918582_C_CGG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=266,155;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:89918598_C_T:89918598:0,3,0,1
chr5	89918602	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=266,168;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr5	89918604	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,24;MFRL=225,180;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	89918618	.	TG	GA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,30;MFRL=266,155;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:89918598_C_T:89918598:0,3,0,1
chr5	89923662	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:89923662_GT_G:89923662:0,1,0,2
chr5	89923665	.	GGACACAACAATGAACTGTTAGAATA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:89923662_GT_G:89923662:1,1,0,2
chr5	89924976	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	89925410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	89931159	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	89938434	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:6,4:0,0:4,2,3,1
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr5	89940489	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:4,1:7,3,3,0
chr5	89940771	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	89969819	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	89979380	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	89981854	.	T	TGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=79,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:3,2,2,1
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	89993045	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89993045_T_C:89993045:0,1,0,1
chr5	89993051	.	C	CCGTTTTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:89993045_T_C:89993045:0,1,0,1
chr5	90001988	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	90016129	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=258,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,7:1,5:1,0,4,8
chr5	90021292	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:6,0,4,1
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr5	90021564	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90021564_A_T:90021564:0,0,0,1
chr5	90021565	.	G	GTTGATTTTCTCTATTTTTTTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90021564_A_T:90021564:0,0,0,1
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=31819007,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,104;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,2:4,1:6,0,3,0
chr5	90052531	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	90059344	.	T	TCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90059344_T_TCCA:90059344:0,0,0,1
chr5	90059346	.	C	CTGTTAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90059344_T_TCCA:90059344:0,0,0,1
chr5	90059348	.	T	TGATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:90059344_T_TCCA:90059344:0,0,0,1
chr5	90074646	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	90107089	.	GGAGCACAGATTGTGGAGGA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=105,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,2:3,0:3,4,1,1
chr5	90107108	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr5	90119324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr5	90261372	.	CG	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=183,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.583:12:3,5:2,2:4,1,5,2
chr5	90446118	.	C	CTCTCTCTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.317:8:4,2:1,0:0,6,0,2
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	90674408	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr5	93076976	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr5	93386617	.	T	TCTGAGTAACCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	93388777	.	T	TATAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=ATAG;STR;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,1:0,0,5,0
chr5	93722036	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:4,5:2,5:1,5,6,4
chr5	93722050	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:5,5,1,4
chr5	93731842	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,90;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr5	93775905	.	T	TCAGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=143,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	93812816	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=99,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:7,2:9,5:11,6,4,4
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=116,105;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.373:32:9,3:10,7:0|1:93905243_T_C:93905243:11,9,3,9
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=115,101;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.250:33:12,2:12,5:0|1:93905243_T_C:93905243:12,13,1,7
chr5	93905265	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=115,103;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:11,2:12,2:0|1:93905243_T_C:93905243:11,14,0,5
chr5	93905269	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=115,100;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:12,1:13,2:0|1:93905243_T_C:93905243:11,14,0,4
chr5	93905271	.	GT	CC	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=115,103;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:12,2:0|1:93905243_T_C:93905243:11,14,0,3
chr5	93966539	.	GCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93966539_GCCC_G:93966539:0,1,0,1
chr5	93966543	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:93966539_GCCC_G:93966539:0,1,0,1
chr5	93998112	.	G	GTTA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=96,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:0,4,1,6
chr5	94006023	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:0,1,1,7
chr5	94022479	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:0,0:0,5,1,3
chr5	94050447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:4,2,2,1
chr5	94050609	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:94050609_AG_A:94050609:0,2,0,2
chr5	94050611	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94050609_AG_A:94050609:0,3,0,1
chr5	94050613	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94050609_AG_A:94050609:0,3,0,1
chr5	94134864	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94134864_G_T:94134864:0,1,0,1
chr5	94134866	.	A	ACAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:94134864_G_T:94134864:0,1,0,1
chr5	94206641	.	T	TGGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=75,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr5	94207134	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,0:4,7:1,10,0,7
chr5	94224681	.	A	ACGTAAAATATTTTAACAACAAAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	94230578	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:0,2:2,0:0|1:94230578_T_G:94230578:1,2,1,1
chr5	94230582	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=82,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.497:4:1,1:1,0:0|1:94230578_T_G:94230578:1,1,1,1
chr5	94248596	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:4,0:5,2:0|1:94248596_C_T:94248596:4,6,2,1
chr5	94248598	.	T	TCTCTCTCTCTC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=119,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0|1:94248596_C_T:94248596:4,6,2,1
chr5	94259796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=143,95;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:5,0:9,2:1,13,1,2
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,157058;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr5	94749969	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	94764288	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:4,4,1,2
chr5	94772540	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr5	94805654	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=18,32;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94805654_CA_C:94805654:0,1,0,1
chr5	94805657	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=14,27;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94805654_CA_C:94805654:0,1,0,1
chr5	94805661	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=14,34;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:94805654_CA_C:94805654:0,1,0,1
chr5	94805715	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	94834331	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22,20;MFRL=0,139,177;MMQ=60,60,48;MPOS=32,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.09,12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,5:0.298,0.618:7:0,2,1:0,0,2:0,0,0,7
chr5	94845231	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr5	94852180	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:5,4,2,0
chr5	94860368	.	T	TAAAATCAACTTGACAGTTCTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=90,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	94864864	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=104,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:94864864_G_A:94864864:0,3,0,1
chr5	94864869	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=104,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:94864864_G_A:94864864:0,2,0,1
chr5	94927426	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr5	95018398	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr5	95018407	.	C	CTCTGAGTGATT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr5	95119537	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,1:4,1:3,8,2,0
chr5	95224700	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.433:7:1,1:1,2:4,0,3,0
chr5	95236833	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr5	95236866	.	ACTG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	95278679	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.447:38:12,11:9,5:12,9,14,3
chr5	95414786	.	T	TTAAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=98,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:3,2:3,7:6,0,7,2
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr5	95746737	.	G	GATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:95746737_G_GATT:95746737:0,1,0,1
chr5	95746739	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:95746737_G_GATT:95746737:0,1,0,1
chr5	95761432	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=89,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	95765095	.	T	TAAAGTGGGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95765095_T_TAAAGTGGGAC:95765095:0,1,0,1
chr5	95765099	.	T	TGCCCTAAATGTAGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:95765095_T_TAAAGTGGGAC:95765095:0,1,0,1
chr5	96066632	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	96079330	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=74,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:1,1,2,0
chr5	96086405	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:96086405_A_C:96086405:3,4,1,1
chr5	96086406	.	TTTGAG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:1,0:0|1:96086405_A_C:96086405:3,4,1,1
chr5	96093389	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=122,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:7,3:1,8:4,5,7,5
chr5	96093391	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=108,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.385:14:3,3:4,2:3,6,3,2
chr5	96103110	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=130,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,2:7,3:8,1,2,3
chr5	96103799	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	96116112	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:4,0:5,0,1,1
chr5	96116940	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:0,6,0,7
chr5	96127883	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:4,9,2,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	96232142	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,35:0.926:37:0,17:2,18:1,1,16,19
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,2,9
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr5	96244563	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96244563_C_T:96244563:0,0,1,0
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:96244563_C_T:96244563:0,0,2,0
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	96253332	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.145:18:11,0:4,2:4,12,0,2
chr5	96253339	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:96253339_G_A:96253339:2,14,0,2
chr5	96253348	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:96253339_G_A:96253339:0,12,0,2
chr5	96253406	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,167;MMQ=46,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr5	96339102	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0|1:96339273_T_G:96339273:0,0,3,3
chr5	96339275	.	AGC	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=26,20;MFRL=80,44;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.503:4:2,2:0,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,1,1,1
chr5	96339279	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,20;MFRL=80,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,1,1,1
chr5	96339281	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,20;MFRL=159,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,0,1,1
chr5	96339285	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,20;MFRL=155,44;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,1,1,1
chr5	96339287	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=155,44;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,1,1,1
chr5	96339290	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,16;MFRL=155,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:96339273_T_G:96339273:1,1,1,1
chr5	96339296	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:96339273_T_G:96339273:0,1,1,1
chr5	96341750	.	T	TTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,23;MFRL=119,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:0,2:1,0,7,0
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23,23;MFRL=116,132,113;MMQ=60,60,60;MPOS=5,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.23,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,4:0.433,0.362:11:1,2,1:1,3,3:1,1,8,1
chr5	96358093	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:96358093_C_T:96358093:5,7,1,1
chr5	96358097	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=137,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:96358093_C_T:96358093:5,7,1,1
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr5	96443248	.	T	TATTACGAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	96509054	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr5	96518792	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr5	98106504	.	T	TATGGCCTAGGTCTTCTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=87,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	98115361	.	TCTGCCGTTGACGGCTTTGACTCTGAGTTTTGCAAGGCCTTGCGTGCCTATGCTGGCTGCACCCAGCGAACTTCAAAAGC	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.093:43:10,6:8,1:13,19,6,5
chr5	98128781	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=151,26833608;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:98128781_T_A:98128781:1,1,0,1
chr5	98128785	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=151,26833608;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:98128781_T_A:98128781:1,1,0,1
chr5	98192164	.	AAGG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,6:3,5:4,6,2,9
chr5	98194781	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,4:5,2:1,6,0,6
chr5	98210868	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=110,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:2,3:7,6:3,6,3,6
chr5	98221383	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:0,9:5,1:1,4,2,8
chr5	98229104	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,5:3,5:5,2,7,3
chr5	101574877	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:101574877_C_T:101574877:2,0,1,0
chr5	101574885	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:101574877_C_T:101574877:2,0,1,0
chr5	101574897	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=114,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.488:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,5:3,1:3,5,4,2
chr5	101595831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:2,3,1,2
chr5	101606507	.	G	GTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101606507_G_GTCTTC:101606507:0,1,0,1
chr5	101606509	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101606507_G_GTCTTC:101606507:0,1,0,1
chr5	101627027	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=115,60;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	101631860	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=109,60;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:2,6,0,2
chr5	101724445	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=92,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:7,3:9,6,3,0
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,5,1
chr5	101735367	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,20;MFRL=107,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:6,0:6,2:0|1:101735367_C_T:101735367:6,7,1,1
chr5	101735373	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=100,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:101735367_C_T:101735367:6,6,1,1
chr5	101755748	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,97;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:1,8,0,2
chr5	101813467	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:2,4:6,0:6,3,4,0
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr5	102472405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=135,6;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:4,1,4,0
chr5	102490670	.	T	TGTGCACTGTTGGTGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:5,0:2,5,1,1
chr5	102494351	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,15;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:102494351_C_T:102494351:0,3,0,1
chr5	102494361	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:102494351_C_T:102494351:0,3,0,1
chr5	102494375	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	102504097	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	102537200	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:3,3,3,4
chr5	102611654	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:16,0:6,3:6,17,0,3
chr5	102614327	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.495:22:5,9:5,1:7,4,6,5
chr5	102894484	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	102895209	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	102895241	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=248,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	106723481	.	A	AAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:106723481_A_AAT:106723481:2,5,1,1
chr5	106723485	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=129,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:106723481_A_AAT:106723481:2,5,1,1
chr5	106723496	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=142,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:106723481_A_AAT:106723481:1,6,1,1
chr5	106723501	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:106723481_A_AAT:106723481:1,7,1,1
chr5	108168451	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.468:5:2,1:1,1:1,2,2,0
chr5	108382742	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,6:1,1:1,0,7,0
chr5	108516399	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:8,2,3,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=108,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.887:15:1,4:0,9:0,1,4,10
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=105.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,13,12
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr5	108714681	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=110,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.274:14:2,0:8,3:4,6,2,2
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr5	109103308	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,0:4,2:3,6,1,1
chr5	109153074	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=105,156;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,0:7,7:9,9,0,7
chr5	109200782	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=115,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:6,3:15,0:7,14,3,0
chr5	109202725	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:3,6,2,6
chr5	109849698	.	T	TTGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	109954325	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=197,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:109954325_G_GA:109954325:0,1,0,1
chr5	109954328	.	T	TCTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=197,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109954325_G_GA:109954325:0,1,0,1
chr5	109954330	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=197,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109954325_G_GA:109954325:0,1,0,1
chr5	109963670	.	ATTTTCT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109963670_ATTTTCT_A:109963670:0,0,0,1
chr5	109963677	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109963670_ATTTTCT_A:109963670:0,0,0,1
chr5	110092480	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.320:10:3,2:4,1:1,6,2,1
chr5	110092502	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr5	110407284	.	T	TGGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	110409410	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:110409410_T_G:110409410:0,4,0,1
chr5	110409419	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=118,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:110409410_T_G:110409410:0,3,0,1
chr5	110409440	.	G	GTTTTGGCTTGCCTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.670:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:1,10,1,2
chr5	110438181	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr5	110439776	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	110440498	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=117,76;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:6,4,1,2
chr5	110448753	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:110448753_T_A:110448753:0,0,3,0
chr5	110448755	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:110448753_T_A:110448753:0,0,3,0
chr5	110448757	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:110448753_T_A:110448753:0,0,3,0
chr5	110448759	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:110448753_T_A:110448753:0,0,2,0
chr5	110459520	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,382;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,3:1,0:4,2,3,0
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	110710699	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr5	110819753	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=158,59;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,2,3
chr5	111091550	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=128,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	111091577	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=177,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111091577_G_A:111091577:0,1,0,1
chr5	111091583	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=177,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111091577_G_A:111091577:0,1,0,1
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,1,12
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,1,12
chr5	111505885	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	111506149	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:111506149_C_T:111506149:0,2,0,1
chr5	111506156	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111506149_C_T:111506149:0,1,0,1
chr5	111506157	.	ATCTTGTC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111506149_C_T:111506149:0,1,0,1
chr5	111506168	.	AA	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=119,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111506149_C_T:111506149:0,1,0,1
chr5	111506673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:111506673_G_A:111506673:4,5,1,1
chr5	111506677	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:111506673_G_A:111506673:4,5,1,1
chr5	111506680	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:111506673_G_A:111506673:3,3,1,1
chr5	111506684	.	C	CAGTGCAAAACACACAA	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=97,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:0|1:111506673_G_A:111506673:3,3,1,1
chr5	111506744	.	T	TGCCCTAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	111545670	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr5	112176555	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:5,5,1,1
chr5	112178492	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:1,2,1,5
chr5	112197132	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.523:19:4,5:5,4:0|1:112197132_G_A:112197132:1,8,6,4
chr5	112197140	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:0|1:112197132_G_A:112197132:1,8,5,4
chr5	112198128	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,109;MMQ=50,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,4:2,0:2,2,3,1
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:3,2,6,0
chr5	112222694	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr5	112222787	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,6:3,1:4,3,2,5
chr5	112237982	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=181,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr5	112238003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=145,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,1,0
chr5	112238039	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:2,1:1,2,2,1
chr5	112256814	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=63.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	112419933	.	T	TATTCAAAAGTTGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	112420937	.	GA	AG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=115,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,1:10,1:9,10,1,1
chr5	112439941	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=117,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,5:7,0:7,6,3,3
chr5	112720648	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,1,1
chr5	112770492	.	C	CCCCAGGAGAATCACTTGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.666:1:0,0:0,1:0|1:112770492_C_CCCCAGGAGAATCACTTGAA:112770492:0,0,0,1
chr5	112770502	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112770492_C_CCCCAGGAGAATCACTTGAA:112770492:0,0,0,1
chr5	112823998	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr5	112824166	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	112849801	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	112851109	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	112860939	.	TAGA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112860939_TAGA_T:112860939:0,0,0,1
chr5	112860946	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112860939_TAGA_T:112860939:0,0,0,1
chr5	112868693	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=94,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:2,2:6,7:3,5,5,5
chr5	112884594	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:1,1,5,4
chr5	112884728	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=115,131;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,6:3,2:1,10,1,7
chr5	112884775	.	A	AGCAAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	112889065	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr5	112889608	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:4,2:4,4,3,2
chr5	112889821	.	CCTCTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	112899250	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	112899702	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.605:16:3,8:3,0:2,4,5,5
chr5	112903600	.	CAAATAATGAAATTA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,2:1,0:0|1:112903600_CAAATAATGAAATTA_C:112903600:0,5,0,2
chr5	112903620	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:112903600_CAAATAATGAAATTA_C:112903600:0,4,0,2
chr5	112917278	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,4:9,4:5,8,4,4
chr5	112919941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	114466685	.	G	GTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,17973000;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114466685_G_GTA:114466685:0,0,1,0
chr5	114466687	.	AA	TT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,17973000;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114466685_G_GTA:114466685:0,0,1,0
chr5	114515765	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=92,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,0:5,4:5,4,2,2
chr5	114515805	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:114515805_T_C:114515805:0,2,0,1
chr5	114515808	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:114515808_G_GC:114515808:0,1,0,2
chr5	114515809	.	T	TCTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:114515808_G_GC:114515808:0,1,0,2
chr5	114515810	.	T	TTTCC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:114515805_T_C:114515805:0,2,0,1
chr5	114515812	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:114515808_G_GC:114515808:0,1,0,2
chr5	114557762	.	G	GAGTTTCCTAATTCTAGTGAACAGGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	114879053	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:5,10,1,1
chr5	114879077	.	T	TGTTAGGAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:9,7,1,1
chr5	115167564	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=153,404;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:1,0:3,1:0,4,0,2
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=128,140;MMQ=60,55;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,5:6,5:7,6,6,4
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=149,160;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	115336444	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr5	115341611	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,3:0,0,3,12
chr5	115341638	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr5	115351089	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:115351089_G_A:115351089:1,2,0,1
chr5	115351094	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:115351089_G_A:115351089:1,2,0,1
chr5	115351096	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:115351089_G_A:115351089:1,2,0,1
chr5	115351100	.	C	CTCCTGGGCTTAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=116,74;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:115351089_G_A:115351089:1,2,0,1
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	115420897	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=204,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=122,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,7:5,7:7,1,10,4
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	115469773	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,1:3,4:4,5,3,2
chr5	115628116	.	AC	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=179,143;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:115628116_AC_GA:115628116:1,0,1,0
chr5	115628136	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,15;MFRL=127,143;MMQ=60,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,0:0|1:115628116_AC_GA:115628116:5,0,1,0
chr5	115628140	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=127,161;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:3,0,2,0
chr5	115783373	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=111,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr5	115808892	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=65,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,0:0,0:0|1:115808892_G_T:115808892:0,2,0,1
chr5	115808895	.	C	CTAGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=65,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:115808892_G_T:115808892:0,2,0,1
chr5	115811403	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115811403_T_G:115811403:0,1,0,1
chr5	115811405	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115811403_T_G:115811403:0,1,0,1
chr5	115814496	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	115822489	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:3,9:8,6:5,6,9,6
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	115837950	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:13,0:11,5:12,12,0,5
chr5	118500981	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,24,19;MFRL=75,120,152;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.19,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.349,0.328:7:1,1,1:0,2,0:1,1,2,3
chr5	118506603	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr5	118506685	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:4,1:5,7:4,5,4,4
chr5	118506796	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,1:0|1:118506796_C_T:118506796:2,1,1,0
chr5	118506802	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,1:0|1:118506796_C_T:118506796:2,1,1,0
chr5	118506805	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr5	118513132	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:11,2:14,0:12,13,2,0
chr5	118513246	.	C	CTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr5	118525426	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.210:44:26,8:9,0:24,11,9,0
chr5	118532034	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	118533723	.	AT	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118533723_AT_CC:118533723:0,2,0,1
chr5	118533727	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118533723_AT_CC:118533723:0,2,0,1
chr5	118533743	.	G	GTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	118576096	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.554:5:1,1:0,2:2,0,2,1
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr5	118691909	.	G	GACCCGGGCTCCGCTTATCCAGCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=123,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.543:7:1,3:0,1:0|1:118809533_CCA_C:118809533:3,0,4,0
chr5	118809543	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.270:9:6,2:1,0:1|0:118809533_CCA_C:118809533:7,0,2,0
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,7,21
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,2,5
chr5	118861707	.	AAGGC	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:0|1:118861707_AAGGC_A:118861707:2,6,1,1
chr5	118861713	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=48,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,7:0.728:9:2,3:0,4:1|0:118861707_AAGGC_A:118861707:1,1,2,5
chr5	118861717	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:118861707_AAGGC_A:118861707:2,5,1,1
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr5	118965623	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=212,124;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118965623_A_G:118965623:0,1,0,1
chr5	118965625	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=212,124;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118965623_A_G:118965623:0,1,0,1
chr5	121188573	.	CAGTTATTTTCCCAGGCTCG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121188573_CAGTTATTTTCCCAGGCTCG_C:121188573:0,0,0,1
chr5	121188597	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:121188573_CAGTTATTTTCCCAGGCTCG_C:121188573:0,0,0,1
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr5	121330402	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:9,9:14,4:8,15,1,12
chr5	121488187	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	121739646	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,157;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr5	121761310	.	G	GTTGAGTAGAGGGAGGGTACTTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	121786512	.	T	TTTTTGTTATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121786512_T_TTTTTGTTATA:121786512:0,1,0,1
chr5	121786514	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121786512_T_TTTTTGTTATA:121786512:0,1,0,1
chr5	121786516	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:121786512_T_TTTTTGTTATA:121786512:0,1,0,1
chr5	122131123	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.685:10:2,2:0,5:1,2,0,7
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:0,3,2,6
chr5	122153014	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:4,4,0,3
chr5	122161958	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:122161958_A_G:122161958:0,4,0,1
chr5	122161961	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:122161958_A_G:122161958:0,4,0,1
chr5	122163401	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr5	122281651	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=150,241;MMQ=60,60;MPOS=-26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,6:1,9:1,0,16,0
chr5	122281919	.	C	CTTGGTTGTTGAATAAACCACATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr5	122335773	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122335773_G_T:122335773:0,0,0,1
chr5	122335774	.	C	CAAACAAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122335773_G_T:122335773:0,0,0,1
chr5	122335776	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:122335773_G_T:122335773:0,0,0,1
chr5	122337747	.	GC	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:122337747_GC_CA:122337747:0,2,0,1
chr5	122337753	.	CATAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:122337747_GC_CA:122337747:0,2,0,1
chr5	122359502	.	A	AACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=113,99;MMQ=59,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=AC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.579:4:2,1:0,0:1,1,1,1
chr5	122495107	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	122509197	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=125,119;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:2,2,4,3
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	122682260	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=133,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr5	122682425	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	122700371	.	G	GGAGGCTGGAGAGACAAAAGAAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0|1:122700371_G_GGAGGCTGGAGAGACAAAAGAAC:122700371:0,1,0,1
chr5	122700374	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:122700371_G_GGAGGCTGGAGAGACAAAAGAAC:122700371:0,1,0,1
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:4,1,7,1
chr5	122714173	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,132;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr5	122722370	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,10;MFRL=60,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.563:10:2,1:1,1:3,1,5,1
chr5	122725761	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:1,3:8,6:2,7,4,5
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:1,2:4,0,4,3
chr5	122728913	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr5	122729230	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	123973701	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr5	123983636	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.156:28:11,2:12,2:12,12,2,2
chr5	123984395	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=97,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,0:13,6:14,13,0,6
chr5	123985443	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr5	123985464	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	124079745	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=105,104;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:9,2:10,0:12,8,2,0
chr5	125696080	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,106;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,0:13,3:14,10,0,3
chr5	125696140	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr5	125696220	.	C	CATAACACAAGTAAAATTCTAAACAAAATAATTAATCAACAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.306:6:2,0:1,0:0,5,0,1
chr5	125696225	.	T	TCAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	125805295	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=138,61;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:7,0,1,1
chr5	125805316	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=131,112;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:8,4,2,0
chr5	125805322	.	C	CCATT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=127,120;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,0:10,6,2,0
chr5	125805534	.	C	CATGTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:125805534_C_CATGTG:125805534:0,0,0,1
chr5	125805536	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:125805534_C_CATGTG:125805534:0,0,0,1
chr5	125805540	.	AC	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:125805534_C_CATGTG:125805534:0,1,0,1
chr5	125805544	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125805534_C_CATGTG:125805534:0,1,0,1
chr5	125820286	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,134;MMQ=60,43;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr5	125880589	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,5,1
chr5	125896918	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	125898834	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr5	125904118	.	C	CGCCACCATGCCCAGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr5	125915685	.	TTTAATTG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTAATTG;STR;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.401:23:3,6:8,3:10,4,2,7
chr5	125915876	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=151,234;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:5,0:0,2:0|1:125915876_C_T:125915876:0,5,0,2
chr5	125915879	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=151,234;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.311:7:5,0:0,2:0|1:125915876_C_T:125915876:0,5,0,2
chr5	125915897	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=139,218;MMQ=50,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr5	125929000	.	A	AACACAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=AC;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.770:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr5	125929836	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=134,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,1,2
chr5	125944214	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:125944214_A_C:125944214:0,1,0,1
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=128,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:125944214_A_C:125944214:0,1,0,1
chr5	125967404	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=96,91;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,3:6,1:6,4,3,1
chr5	125968389	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125968389_A_C:125968389:0,1,0,1
chr5	125968391	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:125968389_A_C:125968389:0,1,0,1
chr5	125968393	.	C	CCAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:125968389_A_C:125968389:0,1,0,1
chr5	125971699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr5	126141368	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=97,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:3,11,0,2
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	126161629	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=89,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:3,3:9,1:10,2,2,2
chr5	126168442	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=103,66;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:21,3:12,0:20,14,3,0
chr5	126168563	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr5	126168589	.	A	AACAGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	126171999	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr5	126250812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,27;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.686:7:1,0:0,4:0,2,1,4
chr5	126666962	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=86,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr5	126674941	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr5	126705780	.	C	CCCTCCCCAGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126705780_C_CCCTCCCCAGCTA:126705780:0,0,0,1
chr5	126705786	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126705780_C_CCCTCCCCAGCTA:126705780:0,0,0,1
chr5	126746249	.	C	CTTCTGTCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126746249_C_CTTCTGTCTG:126746249:0,0,0,1
chr5	126746250	.	A	AGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126746249_C_CTTCTGTCTG:126746249:0,0,0,1
chr5	126746252	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:126746249_C_CTTCTGTCTG:126746249:0,0,0,1
chr5	126758502	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr5	126770380	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,46;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:3,3,0,3
chr5	126781082	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=139,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr5	126781464	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126781464_G_C:126781464:0,0,0,1
chr5	126781467	.	G	GCATAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:126781464_G_C:126781464:0,0,0,1
chr5	126994141	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=94,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:3,4:1,8:1,3,5,7
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr5	127450433	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0|1:127450433_A_T:127450433:0,7,0,3
chr5	127450437	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:0|1:127450433_A_T:127450433:0,7,0,3
chr5	127450460	.	A	ATTCGTTGGTATTTACACTTTTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	127483341	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=115,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:0|1:127483341_C_T:127483341:11,9,1,1
chr5	127483356	.	G	GTATCTGGGACAGGATAAAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=122,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,0:5,2:0|1:127483341_C_T:127483341:9,9,1,1
chr5	127484588	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr5	127493904	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=149,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr5	127609633	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=120,131;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,2:3,5:1,2,3,5
chr5	127613766	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127613766_A_T:127613766:0,1,0,1
chr5	127613774	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127613766_A_T:127613766:0,1,0,1
chr5	127613778	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:127613766_A_T:127613766:0,1,0,1
chr5	127616014	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=140,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr5	127625030	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.344:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	127625042	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:127625042_G_GAA:127625042:0,2,0,1
chr5	127625044	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0|1:127625042_G_GAA:127625042:0,2,0,1
chr5	127636485	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=80,5788158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:5,0,0,2
chr5	127636578	.	G	GGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,85;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:5,2:1,0:2,4,1,1
chr5	127641391	.	C	CAAACCAACAACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=119,335;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.477:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr5	127645181	.	G	GCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	127668718	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr5	127670795	.	TTGTGTGTGCATGTGGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:2,1:0,0:3,1,1,0
chr5	127697354	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:127697354_T_A:127697354:2,0,0,1
chr5	127697359	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:127697354_T_A:127697354:2,0,0,1
chr5	127702218	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,173;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:127702218_A_G:127702218:0,0,1,0
chr5	127702220	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,173;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:127702218_A_G:127702218:0,0,1,0
chr5	127702224	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127702218_A_G:127702218:0,0,1,0
chr5	127872226	.	C	CCCCCTTTGCCAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=147,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:1,3,1,1
chr5	128301824	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=82,122;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:5,4,3,0
chr5	128301885	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=90,124;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,1:1,5:2,5,2,4
chr5	128326164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,0,2
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	128362830	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:4,1,1,1
chr5	128365238	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	128440920	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,278;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:3,0:5,3,0,2
chr5	128957860	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,4:5,0,2,2
chr5	128957884	.	TTGCCAGGTCAAAGGCCAGTAACTGCTTGCTACAAACAAATCCGCAGAGTGTCAATTCTGTGATGGTTCCCTCCAAGC	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=104,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.098:29:0,0:7,2:15,12,1,1
chr5	128958093	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,4,0,1
chr5	128958096	.	T	TTAA	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=30,28;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,4,0,1
chr5	128958097	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,4,0,1
chr5	128958099	.	T	TAAAA	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=29,27;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,5;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,4,0,1
chr5	128958101	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,4,0,1
chr5	128958103	.	A	ATAT	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=27,24;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,3,0,1
chr5	128958105	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=25,24;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,3,0,1
chr5	128958108	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,3,0,1
chr5	128958111	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=23,26;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:128958093_G_GA:128958093:0,3,0,1
chr5	128958129	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128958129_TGG_T:128958129:0,0,0,1
chr5	128958133	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:128958129_TGG_T:128958129:0,0,0,1
chr5	129015452	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,467;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	129072979	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:129072979_G_A:129072979:1,2,0,1
chr5	129072980	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:129072979_G_A:129072979:1,2,0,1
chr5	129241424	.	CAGCACG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	129520200	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr5	130495172	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=110,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:7,9,1,1
chr5	130517911	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=120,59;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.160:33:14,0:14,4:16,12,5,0
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	130815363	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,1:2,1:5,5,0,2
chr5	130831198	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:4,0:1,2:4,1,2,0
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr5	130939025	.	TA	T,TAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,28,25;MFRL=124,164,168;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.00,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,4:0.142,0.184:24:7,0,1:10,3,3:3,14,1,6
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,5:0,0,15,4
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,6:0,14:0,0,4,17
chr5	131006425	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	131008035	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,66;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:6,6,1,1
chr5	131042263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	131066725	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,4,10
chr5	131298466	.	TGCAGACCCCACCCCGATTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	131302259	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr5	131309069	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=196,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr5	131312238	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	131322643	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:131322643_T_C:131322643:0,9,0,2
chr5	131322649	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.256:10:2,0:6,2:0|1:131322643_T_C:131322643:0,8,0,2
chr5	131322666	.	CCACACACTCACA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	131323721	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:5,1:7,2,0,2
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	131396342	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=111,42;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	131534461	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:131534461_G_C:131534461:0,0,1,0
chr5	131534468	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131534461_G_C:131534461:0,0,1,0
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	131534742	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:131534742_C_CT:131534742:1,2,0,1
chr5	131534743	.	C	CCCTGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:131534742_C_CT:131534742:1,2,0,1
chr5	131546199	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr5	131554376	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=122,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:131554376_T_A:131554376:0,4,0,1
chr5	131554383	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:131554376_T_A:131554376:0,3,0,1
chr5	131554385	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,24;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:131554376_T_A:131554376:0,3,0,1
chr5	131554387	.	A	ATATGC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,22;MFRL=107,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:131554376_T_A:131554376:0,3,0,1
chr5	131554407	.	TAG	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131554407_TAG_T:131554407:0,1,0,1
chr5	131554410	.	G	GTA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131554407_TAG_T:131554407:0,1,0,1
chr5	131554412	.	ATG	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=26,26;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:131554407_TAG_T:131554407:0,1,0,1
chr5	131554430	.	ATAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,21;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131554430_ATAAT_A:131554430:0,1,0,1
chr5	131554437	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,28;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131554430_ATAAT_A:131554430:0,1,0,1
chr5	131602166	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr5	131607777	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:5,4:10,0:9,7,4,0
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,4,5
chr5	131649416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=128,47;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	131660119	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr5	131663062	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,12:0,0,7,14
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr5	131730011	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=84,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr5	131878662	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=90,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:131878662_G_C:131878662:2,1,1,1
chr5	131878669	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,26;MFRL=118,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:131878662_G_C:131878662:2,2,0,1
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr5	131927111	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=129,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:5,10,0,3
chr5	131995353	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:131995353_T_A:131995353:3,0,0,1
chr5	131995355	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131995353_T_A:131995353:3,0,0,1
chr5	131995356	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131995353_T_A:131995353:3,0,0,1
chr5	131995358	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:131995353_T_A:131995353:3,0,0,1
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	132018288	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	132036489	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	132038199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	132039132	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,12,4
chr5	132044505	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	132044726	.	TGAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr5	132046789	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr5	132056268	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=127,163;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:6,3:12,0:12,6,3,0
chr5	132088711	.	T	TC,TAACTCCAGACTGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,27,28;MFRL=117,121,123;MMQ=60,60,60;MPOS=3,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.12,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.336,0.327:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr5	132096419	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132096419_G_A:132096419:0,0,1,0
chr5	132096428	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,16;MFRL=140,145;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:132096419_G_A:132096419:1,0,1,0
chr5	132099634	.	T	TTTAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:132099634_T_TTTAA:132099634:0,2,0,1
chr5	132099635	.	G	GCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:132099634_T_TTTAA:132099634:0,2,0,1
chr5	132099637	.	G	GAGCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:132099634_T_TTTAA:132099634:0,2,0,1
chr5	132150938	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:132150938_T_A:132150938:0,0,1,1
chr5	132150948	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:132150938_T_A:132150938:0,0,1,1
chr5	132151398	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=99,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.189:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr5	132159067	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=127,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr5	132200117	.	T	TGTTCCCAATAGCCAAGTTAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:2,2,0,1
chr5	132200142	.	A	AACCTCAAATCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=83,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:132200142_A_AACCTCAAATCCC:132200142:0,2,0,1
chr5	132200143	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=83,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:132200142_A_AACCTCAAATCCC:132200142:0,2,0,1
chr5	132200146	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=83,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,0:0,1:0|1:132200142_A_AACCTCAAATCCC:132200142:0,2,0,1
chr5	132234702	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=12,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,3,0
chr5	132234780	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=119,143;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:15,6:17,0:18,14,6,0
chr5	132238183	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,146;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,0:8,5:13,9,0,5
chr5	132240151	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=117,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,2:1,4:2,3,0,6
chr5	132267850	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=61.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,18:0.625:28:5,10:5,8:0|1:132267850_A_AT:132267850:5,5,7,11
chr5	132267859	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.607:29:6,10:5,7:0|1:132267850_A_AT:132267850:5,6,7,11
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr5	132403057	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.536:9:4,2:0,3:4,0,5,0
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	132409074	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=42,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,1,3
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	132425415	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=18,18;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:0,1:0,0:0,1,0,3
chr5	132425465	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,30;MFRL=160,107;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:132425465_AA_GG:132425465:0,3,0,1
chr5	132425469	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=160,107;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:132425465_AA_GG:132425465:0,3,0,1
chr5	132425471	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=160,107;MMQ=60,46;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:132425465_AA_GG:132425465:0,3,0,1
chr5	132425487	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	132427128	.	C	CCATGTTCAGGCCATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132427128_C_CCATGTTCAGGCCATTT:132427128:0,1,0,1
chr5	132427130	.	A	AAACAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:132427128_C_CCATGTTCAGGCCATTT:132427128:0,1,0,1
chr5	132428498	.	GTTTTTTTT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=95,124;MMQ=60,41;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=32,24;RU=T;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.313:12:3,0:3,0:4,5,0,3
chr5	132437613	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=62,147;MMQ=50,59;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:0,3:1,1,0,3
chr5	132437647	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,147;MMQ=40,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:132437647_C_T:132437647:0,3,0,1
chr5	132437649	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=150,147;MMQ=40,59;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:132437647_C_T:132437647:0,3,0,1
chr5	132553138	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	132556657	.	G	GAGCTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132556657_G_GAGCTC:132556657:0,0,0,1
chr5	132556659	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132556657_G_GAGCTC:132556657:0,0,0,1
chr5	132561509	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132561509_G_A:132561509:0,2,0,1
chr5	132561519	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:132561509_G_A:132561509:0,2,0,1
chr5	132569260	.	GCCT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr5	133295243	.	A	ATAATAATAATAAT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=109,71;MMQ=55,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:133295243_A_ATAATAATAATAAT:133295243:9,11,0,2
chr5	133295244	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=109,71;MMQ=55,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:6,0:12,1:0|1:133295243_A_ATAATAATAATAAT:133295243:9,11,0,2
chr5	133309641	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=121,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	133311725	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=102,122;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr5	133311762	.	C	CAAGTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:133311762_C_CAAGTT:133311762:0,1,0,1
chr5	133311765	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133311762_C_CAAGTT:133311762:0,1,0,1
chr5	133311768	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:133311762_C_CAAGTT:133311762:0,1,0,1
chr5	133316325	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=114,161;MMQ=34,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	133328135	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0,4,0,1
chr5	133473697	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=114,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.404:15:1,4:8,1:8,1,5,1
chr5	133477802	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr5	133477925	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:133477925_G_T:133477925:1,3,1,1
chr5	133477927	.	A	ATTGTCTTTTCACTCACAGGTTGCGGTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=124,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:0|1:133477925_G_T:133477925:1,3,1,1
chr5	133477939	.	C	CAAGGACCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	133478341	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr5	133478359	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,3,3
chr5	133481467	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,3:2,3:1,3,3,3
chr5	133496649	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:5,4,3,2
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=177,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	133537519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:3,3,2,1
chr5	133644493	.	T	TGTCTCAGCCTGAAATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=218,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	133647977	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=123,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:8,3:12,0:10,10,2,1
chr5	133655067	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:5,3:4,6,5,4
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,6:1,3:2,2,3,6
chr5	133686146	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0,5,1,1
chr5	133880124	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr5	133887676	.	CTGGCCTGTGGGGCAGACTG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=94,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:2,0,1,0
chr5	133887780	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=102,118;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:5,3,3,5
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=94,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:0,1:4,2:2,2,1,3
chr5	133914633	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:133914633_C_A:133914633:4,1,1,1
chr5	133914635	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=111,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:133914633_C_A:133914633:4,1,1,1
chr5	133945288	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=99,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,2:2,6:6,4,6,2
chr5	133948331	.	T	TAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=40,52;RU=A;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.896:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr5	134011834	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=115,114;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.259:19:7,0:3,2:4,10,0,5
chr5	134029470	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr5	134032922	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=101,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:10,0:16,2:18,8,0,2
chr5	134079758	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=76,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:134079758_T_G:134079758:1,1,0,1
chr5	134079760	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=76,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:134079758_T_G:134079758:1,1,0,1
chr5	134079834	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	134106761	.	CTCTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,145;MMQ=60,52;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCTT;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:4,1:1,1:0,5,0,3
chr5	134109602	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:0,5,0,5
chr5	134164284	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr5	134164495	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:134164495_T_TA:134164495:0,2,0,1
chr5	134164497	.	T	TATTTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,28;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:134164495_T_TA:134164495:0,2,0,1
chr5	134164507	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:134164495_T_TA:134164495:0,1,0,1
chr5	134192151	.	T	TCTGTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=188,171;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:134192151_T_TCTGTAA:134192151:0,1,0,1
chr5	134192153	.	A	AGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=188,171;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:134192151_T_TCTGTAA:134192151:0,1,0,1
chr5	134223593	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=94,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:3,5,1,2
chr5	134343661	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=61,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr5	134343682	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=82,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:6,1,0,3
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	134345047	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=97,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr5	134364838	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=84,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr5	134688798	.	T	TCAGAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	134705185	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=99,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:13,11,1,2
chr5	134705676	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr5	134782414	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=104,99;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,5:5,1:2,7,1,5
chr5	134782450	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=103,99;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,1,3
chr5	134870913	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr5	134907552	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:8,2:3,7:4,8,3,6
chr5	134910220	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=121,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,1:5,0:0|1:134910220_C_A:134910220:7,7,1,1
chr5	134910229	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=121,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:134910220_C_A:134910220:6,8,1,1
chr5	135186075	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	135186146	.	C	CAGAGCTGTGCCTGTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr5	135223619	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=156,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	135223713	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=155,101;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,5:3,4,2,6
chr5	135272373	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:3,4:3,4:3,3,5,3
chr5	135273066	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=301,242;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:135273066_A_G:135273066:0,1,1,0
chr5	135273071	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=301,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:135273066_A_G:135273066:0,1,1,0
chr5	135273075	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=301,242;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135273066_A_G:135273066:0,1,1,0
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=109,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.244:18:6,3:8,1:8,6,3,1
chr5	135290512	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=128,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.171:15:3,0:10,2:0|1:135290512_G_C:135290512:2,11,1,1
chr5	135290520	.	C	CACAAAATCATTGAAGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=117,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:2,0:9,2:0|1:135290512_G_C:135290512:2,10,1,1
chr5	135396452	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:5,3:0,1:5,0,2,2
chr5	135396468	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=171,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:5,1,3,4
chr5	135396669	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:2,4,1,5
chr5	135398279	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=126,85;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,1,2
chr5	135398474	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135398474_C_T:135398474:0,1,0,1
chr5	135398480	.	G	GATCACAGTTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:135398474_C_T:135398474:0,1,0,1
chr5	135489688	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=114,139;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:8,3:0|1:135489688_A_C:135489688:7,13,0,3
chr5	135489691	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=115,139;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:9,0:9,3:0|1:135489688_A_C:135489688:7,14,0,3
chr5	135496895	.	TATA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	135498944	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,1:0,4:6,0,3,2
chr5	135508381	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:0,1:3,2:1,3,1,2
chr5	135510033	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:2,4:2,0:2,3,4,0
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,5:0,0,8,10
chr5	135561058	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr5	135692260	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	135692943	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	136320758	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr5	136328367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	136403551	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:136403551_T_A:136403551:0,0,0,1
chr5	136403554	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:136403551_T_A:136403551:0,0,0,1
chr5	136403558	.	A	AAAGCCTTCCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:136403551_T_A:136403551:0,0,0,1
chr5	136448234	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:136448234_C_G:136448234:3,5,1,1
chr5	136448236	.	T	TGCAG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=113,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:136448234_C_G:136448234:3,5,1,1
chr5	136448288	.	T	TCATTGAGTTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:136448288_T_TCATTGAGTTG:136448288:0,1,0,1
chr5	136448291	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=141,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136448288_T_TCATTGAGTTG:136448288:0,1,0,1
chr5	136602766	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=124,93;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:9,13,0,3
chr5	136975547	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=0,84;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:6,3,0,2
chr5	136994017	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:136994017_T_TA:136994017:2,1,0,1
chr5	136994018	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=94,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:136994017_T_TA:136994017:2,1,0,1
chr5	136994051	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136994051_TG_T:136994051:0,0,0,1
chr5	136994056	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136994051_TG_T:136994051:0,0,0,1
chr5	136997743	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.342:12:4,3:4,0:3,5,3,1
chr5	136997802	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,28;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	136997805	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136997805_G_GC:136997805:0,1,0,1
chr5	136997808	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136997805_G_GC:136997805:0,1,0,1
chr5	136997810	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:136997805_G_GC:136997805:0,1,0,1
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=119,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,6,1
chr5	137206750	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137206750_G_A:137206750:0,1,0,1
chr5	137206752	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137206750_G_A:137206750:0,1,0,1
chr5	137225316	.	C	CACGTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	137235527	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,189;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	137241856	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	137277801	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137277801_T_A:137277801:0,1,0,1
chr5	137277806	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:137277801_T_A:137277801:0,3,0,1
chr5	137277807	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:137277801_T_A:137277801:0,3,0,1
chr5	137281708	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr5	137289221	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:137289221_T_A:137289221:0,2,0,1
chr5	137289223	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:137289221_T_A:137289221:0,2,0,1
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,17,13
chr5	137298253	.	G	GGTAAGAGAGACTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr5	137342589	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	137347387	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=160,115;MMQ=49,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,2:6,1:8,0,3,0
chr5	137347398	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=145,157;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:11,0,2,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr5	137347407	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=26,17;MFRL=142,108;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,0:11,0,1,1
chr5	137354851	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr5	137420368	.	G	GTACAAACGCACAAATATAGGCATGCATTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	137423639	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137423639_T_TG:137423639:0,0,0,1
chr5	137423645	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137423639_T_TG:137423639:0,0,0,1
chr5	137423649	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137423639_T_TG:137423639:0,0,0,1
chr5	137423652	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137423639_T_TG:137423639:0,0,0,1
chr5	137424806	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:137424806_C_T:137424806:1,3,0,1
chr5	137424810	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:137424806_C_T:137424806:1,3,0,1
chr5	137426625	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=107,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:4,0:3,7,3,0
chr5	137454433	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=146,120;MMQ=52,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:0|1:137454433_A_G:137454433:7,0,2,0
chr5	137454451	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.222:11:4,2:5,0:0|1:137454433_A_G:137454433:9,0,2,0
chr5	137474325	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr5	137488221	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=128,62;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:0|1:137488221_C_T:137488221:7,7,1,1
chr5	137488234	.	A	ATATTCACACCAAAAGAAGGGAAAGAACTGGAG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=113,62;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:137488221_C_T:137488221:9,8,1,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr5	137499903	.	T	TCCTGTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137499903_T_TCCTGTAC:137499903:0,1,0,1
chr5	137499910	.	C	CCTGGTTTCCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137499903_T_TCCTGTAC:137499903:0,1,0,1
chr5	137499912	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137499903_T_TCCTGTAC:137499903:0,1,0,1
chr5	137503843	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137503843_T_A:137503843:0,0,0,1
chr5	137503845	.	G	GCAGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137503843_T_A:137503843:0,0,0,1
chr5	137503847	.	T	TTAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137503843_T_A:137503843:0,0,0,1
chr5	137503848	.	C	CATTTTCTCTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137503843_T_A:137503843:0,0,0,1
chr5	137506434	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	137506931	.	CAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr5	137507736	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=115,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:6,6,2,0
chr5	137513369	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=107,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:1,2:1,2:3,0,0,4
chr5	137518776	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,2,0
chr5	137519864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0|1:137519864_G_A:137519864:1,2,0,2
chr5	137519871	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137519864_G_A:137519864:1,0,0,1
chr5	137521717	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,97;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:11,4:7,11:7,11,8,7
chr5	137527269	.	T	TATGTGTCCTTTTTTC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	137527294	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:137527294_A_AAAT:137527294:0,0,0,1
chr5	137527295	.	G	GCATTTGAGGGATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:137527294_A_AAAT:137527294:0,0,0,1
chr5	137527683	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=141,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	137527714	.	C	CTATTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:137527714_C_CTATTA:137527714:0,3,0,1
chr5	137527719	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:137527714_C_CTATTA:137527714:0,3,0,1
chr5	137537724	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=151,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,0:1,3:6,0,3,0
chr5	137589876	.	CTTTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:3,1:7,6,0,2
chr5	137593655	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=70,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:137593655_C_G:137593655:0,4,0,1
chr5	137593657	.	C	CTTTTGAGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=70,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:137593655_C_G:137593655:0,4,0,1
chr5	137593667	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	137595371	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137595371_AG_CA:137595371:0,1,0,1
chr5	137595375	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137595371_AG_CA:137595371:0,1,0,1
chr5	137595378	.	G	GCAAAGATTGCTGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137595371_AG_CA:137595371:0,1,0,1
chr5	137610128	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	137621802	.	T	TCCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:137621802_T_TCCCA:137621802:2,2,0,1
chr5	137621804	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=67,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:137621802_T_TCCCA:137621802:2,2,0,1
chr5	137625290	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	137626528	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=149,136;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr5	137627732	.	T	TGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=121,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:3,4,1,1
chr5	137708303	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=103,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:4,0:1,3:5,2,3,0
chr5	137708434	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=107,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,3:4,9:3,5,4,8
chr5	137727169	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=195,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	137754658	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,5:2,3:2,1,6,2
chr5	137754695	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,5:1,4:4,1,7,2
chr5	137760048	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,3:2,1,2,1
chr5	137760083	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	137762570	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=204,181;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:137762570_G_A:137762570:2,0,1,0
chr5	137762579	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=204,181;MMQ=50,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,1:1,0:0|1:137762570_G_A:137762570:2,0,1,0
chr5	137766066	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=100,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:7,7:8,5:8,7,5,7
chr5	137780218	.	G	GCCCCAGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,0,1
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=79,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:4,1,8,1
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:1,4:0,1:2,0,4,1
chr5	137847092	.	T	TACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=AC;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr5	137849173	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr5	137878515	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:5,1:9,4,2,0
chr5	137893005	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=114,148;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:11,1,2,0
chr5	137893011	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=129,139;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:5,0:14,1,2,0
chr5	137902610	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr5	137902912	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=250,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:1,3,3,0
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:1,4:6,1:7,0,3,2
chr5	137906904	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:137906904_C_CT:137906904:0,3,0,1
chr5	137906908	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=168,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:137906904_C_CT:137906904:0,2,0,1
chr5	138147789	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr5	138260320	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=91,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:4,2:5,8,2,1
chr5	138260326	.	A	AGT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:138260326_A_AGT:138260326:6,8,1,1
chr5	138260329	.	G	GGCAGGCCACCCC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:10,0:3,2:0|1:138260326_A_AGT:138260326:6,8,1,1
chr5	138456942	.	G	C,A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30,24;MFRL=142,142,170;MMQ=60,60,60;MPOS=4,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr5	138456944	.	T	C,TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27,25;MFRL=142,142,170;MMQ=60,60,60;MPOS=2,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr5	138456948	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.796:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr5	138643569	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:4,3:4,6,2,1
chr5	138655286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:138655286_C_T:138655286:0,4,0,1
chr5	138655291	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:3,0:1,1:0|1:138655286_C_T:138655286:0,4,0,1
chr5	138707908	.	T	TGGC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.291:8:3,2:3,0:0|1:138707908_T_TGGC:138707908:3,3,1,1
chr5	138707909	.	T	TTGGATTTGTAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=101,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0|1:138707908_T_TGGC:138707908:3,3,1,1
chr5	138714448	.	TGCCGTCCTCTGGGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	138715753	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=107,95;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:5,7,2,0
chr5	138715826	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138715826_AAG_A:138715826:0,1,0,1
chr5	138715830	.	A	AGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,24;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:138715826_AAG_A:138715826:0,1,0,1
chr5	138717770	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138717770_G_T:138717770:0,0,0,1
chr5	138717772	.	A	AACAGTTTTTCCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138717770_G_T:138717770:0,0,0,1
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,4,2
chr5	138728483	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:138728483_A_G:138728483:0,0,1,1
chr5	138728492	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,29;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:1,0:0,1:0|1:138728483_A_G:138728483:0,1,1,1
chr5	138730720	.	C	CCGGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:0,0:0|1:138730720_C_CCGGA:138730720:2,9,1,1
chr5	138730722	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=118,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:11,2:0,0:0|1:138730720_C_CCGGA:138730720:2,9,1,1
chr5	138732579	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,0:3,6:6,2,4,2
chr5	138758546	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=27,30;MFRL=154,168;MMQ=49,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,0:1,2:0,2,0,3
chr5	138758583	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=146,161;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:138758583_G_A:138758583:0,3,0,1
chr5	138758585	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=161,146;MMQ=40,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr5	138758586	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=160,161;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:138758583_G_A:138758583:0,2,0,1
chr5	138758588	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,24;MFRL=154,160;MMQ=40,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr5	138758592	.	TCG	ATA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,26;MFRL=146,161;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:138758583_G_A:138758583:0,3,0,1
chr5	138758602	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=161,146;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138758602_G_A:138758602:0,1,0,1
chr5	138758605	.	AG	GT	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,33;MFRL=146,161;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:138758583_G_A:138758583:0,1,0,1
chr5	138758606	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:138758602_G_A:138758602:0,0,0,1
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:1,3:5,3:0,7,2,4
chr5	138856078	.	T	TCTTTTTTATGTGGCTGTGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	139060399	.	G	GAGATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139060399_G_GAGATA:139060399:0,2,0,1
chr5	139060401	.	G	GCAGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139060399_G_GAGATA:139060399:0,2,0,1
chr5	139201638	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=165,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139201638_A_T:139201638:0,1,0,1
chr5	139201640	.	G	GGTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=165,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139201638_A_T:139201638:0,1,0,1
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr5	139217404	.	G	GTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr5	139219594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	139232005	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=77,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:4,9:7,2:8,4,4,7
chr5	139235338	.	C	CTGGTGTCCAGCAGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=71,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr5	139239583	.	A	AGAGTGTGGATTGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:139239583_A_AGAGTGTGGATTGT:139239583:0,2,0,1
chr5	139239588	.	C	CCACTAAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:139239583_A_AGAGTGTGGATTGT:139239583:0,2,0,1
chr5	139239619	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,22;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139239619_C_A:139239619:0,1,0,1
chr5	139239620	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139239619_C_A:139239619:0,1,0,1
chr5	139239623	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139239619_C_A:139239619:0,1,0,1
chr5	139245239	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:0|1:139245239_G_C:139245239:0,3,0,1
chr5	139245249	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139245239_G_C:139245239:0,2,0,1
chr5	139245250	.	C	CAGAAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139245239_G_C:139245239:0,2,0,1
chr5	139245252	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:139245239_G_C:139245239:0,2,0,1
chr5	139494773	.	TAC	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,1:6,1:8,7,1,1
chr5	139494846	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=27,22,26,26;MFRL=120,92,117,91;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,13,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.41,24.53,15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:29,4,17,14:0.059,0.248,0.217:64:8,2,5,9:19,2,9,3:14,15,19,16
chr5	139494865	.	G	T	.	.	DP=113;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=104,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,5:0.032:111:50,0:43,0:46,60,5,0
chr5	139497997	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:0|1:139497997_T_G:139497997:7,18,0,2
chr5	139498001	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,2:9,0:0|1:139497997_T_G:139497997:8,18,0,2
chr5	139498004	.	T	TGTTTG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=115,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:0|1:139497997_T_G:139497997:8,15,0,2
chr5	139500469	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=146,128;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:7,3,3,0
chr5	139501709	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:14,0:5,4:11,9,4,0
chr5	139508463	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139508463_TT_CA:139508463:0,1,0,1
chr5	139508466	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139508463_TT_CA:139508463:0,1,0,1
chr5	139625683	.	A	AGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,24;MFRL=89,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	139714274	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=122,110;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:7,0:12,9,1,1
chr5	139725743	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139725743_G_T:139725743:0,0,0,1
chr5	139725745	.	C	CCTGAGAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139725743_G_T:139725743:0,0,0,1
chr5	139740653	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=136,273;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	139741823	.	G	GCCGAGGCGGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139741823_G_GCCGAGGCGGGT:139741823:0,1,0,1
chr5	139741826	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,26;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139741823_G_GCCGAGGCGGGT:139741823:0,1,0,1
chr5	139741828	.	G	GCCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139741823_G_GCCGAGGCGGGT:139741823:0,1,0,1
chr5	139741832	.	GGTC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=162,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:139741823_G_GCCGAGGCGGGT:139741823:0,1,0,1
chr5	139743787	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr5	139744270	.	CTGCA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139744270_CTGCA_C:139744270:0,0,0,1
chr5	139744278	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:139744270_CTGCA_C:139744270:0,0,0,1
chr5	139745508	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=101,71;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:7,7,1,1
chr5	139747541	.	G	GATCTTATAGTCTGAGTTGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	139747544	.	C	CGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0|1:139747544_C_CGA:139747544:0,1,0,1
chr5	139747548	.	GC	TA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139747544_C_CGA:139747544:0,0,0,1
chr5	139781727	.	AGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr5	139815862	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=118,113;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:11,0:13,4:7,18,0,4
chr5	139862313	.	A	ATAGCAGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139862313_A_ATAGCAGAAAG:139862313:0,1,0,1
chr5	139862315	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139862313_A_ATAGCAGAAAG:139862313:0,1,0,1
chr5	139884461	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:8,3:17,0:0|1:139884461_T_A:139884461:13,13,3,0
chr5	139884465	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:8,3:18,0:0|1:139884461_T_A:139884461:13,13,3,0
chr5	139889705	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:0|1:139889705_G_A:139889705:7,6,2,1
chr5	139889713	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=105,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,3:5,0:0|1:139889705_G_A:139889705:8,4,2,1
chr5	139889865	.	C	CTAGTTGTCTTCCAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139889865_C_CTAGTTGTCTTCCAG:139889865:0,0,0,1
chr5	139889867	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:139889865_C_CTAGTTGTCTTCCAG:139889865:0,0,0,1
chr5	139907713	.	C	CTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139907713_C_CTAT:139907713:0,1,0,1
chr5	139907729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=158,166;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:139907713_C_CTAT:139907713:1,1,0,1
chr5	139914960	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=129,124;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,0:5,5:6,6,0,5
chr5	139917595	.	TTGGTAATAACAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr5	139928390	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	139931628	.	A	AGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=96,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:5,5:3,2:0|1:139931628_A_AGT:139931628:4,4,4,4
chr5	139931629	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=96,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:0|1:139931628_A_AGT:139931628:4,4,4,4
chr5	139936898	.	A	AGGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139936898_A_AGGT:139936898:0,1,0,1
chr5	139936899	.	C	CCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=130,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:139936898_A_AGGT:139936898:0,1,0,1
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	139937146	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,6:0,5:0,0,9,3
chr5	139948153	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=96,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:7,4,0,3
chr5	140021858	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr5	140022436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,3,2
chr5	140023818	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr5	140027625	.	GTGTGTATGTA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=137,108;MMQ=51,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.760:7:2,4:0,1:0|1:140027625_GTGTGTATGTA_G:140027625:0,2,0,5
chr5	140027647	.	C	CAGAGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=188,105;MMQ=60,40;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:140027625_GTGTGTATGTA_G:140027625:0,2,0,2
chr5	140027649	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=188,105;MMQ=60,40;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:140027625_GTGTGTATGTA_G:140027625:0,2,0,2
chr5	140034389	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:1,6,0,2
chr5	140035326	.	TTGGCATGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0,2,1,0
chr5	140039877	.	CTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,19;MFRL=117,207;MMQ=51,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.418:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr5	140048267	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=105,73;MMQ=50,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.292:28:11,1:9,6:6,14,6,2
chr5	140053903	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:5,9,2,0
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=88,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr5	140057649	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140057649_AG_A:140057649:0,1,0,1
chr5	140057654	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:140057649_AG_A:140057649:0,1,0,1
chr5	140062782	.	C	CCACCTCAGCCTCCCAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr5	140070581	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:0,0:2,1:0|1:140070581_C_T:140070581:0,2,0,1
chr5	140070585	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140070581_C_T:140070581:0,1,0,1
chr5	140070590	.	T	TCTACTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140070581_C_T:140070581:0,1,0,1
chr5	140073321	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:140073321_TGA_T:140073321:0,4,0,1
chr5	140073324	.	C	CCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:140073321_TGA_T:140073321:0,4,0,1
chr5	140073883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:3,5:6,4:5,4,2,8
chr5	140076172	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=108,2114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,0:14,2:0|1:140076172_C_T:140076172:14,22,2,0
chr5	140076190	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=99,2114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:17,0:14,2:0|1:140076172_C_T:140076172:13,21,2,0
chr5	140076992	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	140081525	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr5	140166243	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=98,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.349:30:7,10:10,0:9,11,10,0
chr5	140174865	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=111,116;MMQ=60,58;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,2:9,2:6,5,1,3
chr5	140182819	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=137,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:6,2,1,2
chr5	140187048	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,190;MMQ=52,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	140188601	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=118,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,0:2,0:0|1:140188601_A_C:140188601:1,1,1,1
chr5	140188611	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=74,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:140188601_A_C:140188601:1,2,1,1
chr5	140188914	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=135,68;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:3,3:5,4,1,2
chr5	140188962	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=130,68;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:7,5,1,1
chr5	140203687	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=21,25;MFRL=109,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:8,7,2,0
chr5	140209878	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:3,7,1,1
chr5	140229214	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:2,1,1,1
chr5	140229585	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,59;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:2,4,1,2
chr5	140230483	.	TTCTAGCA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,2:5,0:0|1:140230483_TTCTAGCA_T:140230483:8,10,0,2
chr5	140230495	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:0|1:140230483_TTCTAGCA_T:140230483:9,10,0,2
chr5	140230582	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,368;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:3,0:14,3:8,9,3,0
chr5	140231916	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:0,18,0,2
chr5	140231945	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,3:2,0:0,6,0,3
chr5	140232470	.	AT	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=96,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.139:30:11,2:13,3:12,13,2,3
chr5	140232589	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140232589_G_A:140232589:0,0,0,1
chr5	140232591	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:140232589_G_A:140232589:0,0,0,1
chr5	140237387	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=84,99;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:3,3:3,2:4,3,2,3
chr5	140251161	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=120,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,2:2,0:2,7,0,2
chr5	140264245	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.324:22:10,6:5,0:6,9,6,1
chr5	140306510	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:140306510_G_C:140306510:9,12,1,1
chr5	140306516	.	T	TCTCTACTGTGTTCCATTGGTC	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=24,20;MFRL=112,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,0:14,2:0|1:140306510_G_C:140306510:9,11,1,1
chr5	140306559	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:140306559_G_A:140306559:2,8,1,1
chr5	140306562	.	G	GCT	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:140306559_G_A:140306559:2,8,1,1
chr5	140306563	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=102,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:140306559_G_A:140306559:2,8,1,1
chr5	140306565	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=101,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,0:6,2:0|1:140306559_G_A:140306559:2,7,1,1
chr5	140306576	.	C	CAGGTCGT	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=101,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr5	140308427	.	C	CCTCAGGTGATCTGCCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,1,1
chr5	140347173	.	A	ACACCACCATGCCTGGTTACTTGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr5	140389447	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=105,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:8,1:13,7,1,2
chr5	140432194	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=144,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:140432194_GAA_G:140432194:4,0,0,2
chr5	140432197	.	A	ATTGTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=144,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:140432194_GAA_G:140432194:4,0,0,2
chr5	140432199	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=144,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:140432194_GAA_G:140432194:4,0,0,2
chr5	140433155	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=101,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr5	140474652	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:0|1:140474652_A_C:140474652:3,3,1,1
chr5	140474655	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=121,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:140474652_A_C:140474652:3,3,1,1
chr5	140475198	.	C	CG,CATTCCTGGGTGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25,31;MFRL=101,96,181;MMQ=60,60,60;MPOS=4,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr5	140475199	.	T	TTTTGCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=102,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	140475250	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	140480746	.	T	TCCCAGGTGAGCATCTGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,16;MFRL=153,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr5	140502652	.	AAT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:140502652_AAT_A:140502652:2,2,1,1
chr5	140502655	.	G	GGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=145,65;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:140502652_AAT_A:140502652:2,2,1,1
chr5	140517061	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	140517090	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,77;MMQ=55,58;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	140531175	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,33;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr5	140531700	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	140554691	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=144,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,1:4,7:5,6,6,2
chr5	140555163	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.341:24:11,2:4,5:9,7,5,3
chr5	140555510	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:16,4:13,1:15,16,4,1
chr5	140558575	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:7,5,1,2
chr5	140562073	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	140563395	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:140563395_C_T:140563395:2,1,1,1
chr5	140563399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,0:2,1:0|1:140563395_C_T:140563395:2,1,1,1
chr5	140564268	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=192,142;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140564268_C_T:140564268:1,0,0,1
chr5	140564288	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=192,142;MMQ=47,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140564268_C_T:140564268:1,0,0,1
chr5	140564912	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=102,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:7,8:5,6:10,3,8,6
chr5	140564982	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,19;MFRL=136,164;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.438:9:1,1:2,0:0,5,0,4
chr5	140565019	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=165,170;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr5	140565025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=170,170;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,0:0,4,0,2
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	140572668	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,196;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,2,2
chr5	140574473	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:4,1:2,4,2,0
chr5	140575211	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr5	140588558	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=107,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:3,1:6,4,1,2
chr5	140590642	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:3,8,0,5
chr5	140593745	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=160,173;MMQ=34,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0|1:140593745_CC_TT:140593745:0,2,0,2
chr5	140593750	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=160,173;MMQ=34,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:140593745_CC_TT:140593745:0,2,0,2
chr5	140594415	.	C	CGAAGACTTAGATGTAGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:140594415_C_CGAAGACTTAGATGTAGG:140594415:1,5,1,1
chr5	140594418	.	TG	AA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:140594415_C_CGAAGACTTAGATGTAGG:140594415:1,5,1,1
chr5	140595022	.	GATGTCAATGACAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:1,4,1,1
chr5	140598053	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=82,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140598053_T_C:140598053:0,2,0,1
chr5	140598067	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140598053_T_C:140598053:0,1,0,1
chr5	140598131	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140598131_A_C:140598131:0,0,0,1
chr5	140598136	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140598131_A_C:140598131:0,0,0,1
chr5	140598138	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140598131_A_C:140598131:0,0,0,1
chr5	140625806	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:2,2,0,1
chr5	140627578	.	T	TGTGGCTATTGTAAGTGAGACTGCA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=126,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:5,2:7,4,1,1
chr5	140627605	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=105,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.635:11:1,3:3,4:1,3,5,2
chr5	140710877	.	ACCTCATC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	140711215	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=106,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,2:7,0:7,3,2,0
chr5	140720294	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=123,145;MMQ=49,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:140720294_T_A:140720294:1,1,1,0
chr5	140720303	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=131,145;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140720294_T_A:140720294:1,0,1,0
chr5	140724189	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:2,3,0,1
chr5	140731910	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=137,98;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0|1:140731910_A_T:140731910:0,1,0,1
chr5	140731911	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=139,98;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:140731910_A_T:140731910:0,2,0,1
chr5	140731914	.	C	CACAGCGCTGAGACTCCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=139,98;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:140731910_A_T:140731910:0,2,0,1
chr5	140732284	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=105,42;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:2,5,1,1
chr5	140732294	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,34;MFRL=99,180;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr5	140732313	.	TAACCAGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=162,180;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:140732313_TAACCAGGC_T:140732313:0,3,0,1
chr5	140732324	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=162,180;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:140732313_TAACCAGGC_T:140732313:0,3,0,1
chr5	140735213	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140735213_G_T:140735213:1,0,0,1
chr5	140735217	.	A	AATTCTGGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=103,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140735213_G_T:140735213:1,0,0,1
chr5	140735719	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=96,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	140735743	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=115,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:140735743_G_A:140735743:0,2,0,2
chr5	140735752	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=145,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:140735743_G_A:140735743:0,1,0,2
chr5	140736116	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,134;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:3,1,0,3
chr5	140740452	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:6,2,3,0
chr5	140740997	.	T	TCTTCCAGTCAGCAAGCTCAGATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:140740997_T_TCTTCCAGTCAGCAAGCTCAGATG:140740997:2,2,1,1
chr5	140741003	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=159,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:140740997_T_TCTTCCAGTCAGCAAGCTCAGATG:140740997:1,2,1,1
chr5	140743853	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=188,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr5	140744918	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:1,2,1,0
chr5	140744924	.	A	G,AGAGAAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,26,26;MFRL=89,115,119;MMQ=60,60,60;MPOS=31,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.19,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.249,0.292:4:2,1,1:0,0,0:1,1,1,1
chr5	140745186	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,10699770;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	140750044	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,10:0,1:0,0,6,5
chr5	140752222	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=102,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:14,6,1,2
chr5	140762875	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:4,7,0,2
chr5	140763419	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,22;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:1,8,3,1
chr5	140767477	.	G	GTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,75;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	140769155	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr5	140769293	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140769293_C_T:140769293:0,0,0,1
chr5	140769303	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140769293_C_T:140769293:0,0,0,1
chr5	140779638	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:140779638_G_A:140779638:2,0,1,0
chr5	140779643	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:140779638_G_A:140779638:2,0,1,0
chr5	140785025	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140785025_T_A:140785025:0,1,0,1
chr5	140785027	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140785025_T_A:140785025:0,1,0,1
chr5	140797425	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=152,119;MMQ=34,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr5	140800934	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=99,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:4,6,2,0
chr5	140856426	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	140856658	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=117,518;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,0:4,3:6,1,3,0
chr5	140857202	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140857202_G_T:140857202:0,2,0,1
chr5	140857205	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:140857202_G_T:140857202:0,2,0,1
chr5	140864749	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:9,0:1,3:5,5,0,3
chr5	140866646	.	GCTGA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr5	140896624	.	T	TTTTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=93,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140896624_T_TTTTTTTG:140896624:2,1,0,1
chr5	140896627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=93,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:140896624_T_TTTTTTTG:140896624:2,1,0,1
chr5	140914087	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=203,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr5	140914094	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,22;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:140914094_T_A:140914094:0,3,0,1
chr5	140914095	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:140914094_T_A:140914094:0,3,0,1
chr5	140915654	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=135,136;MMQ=60,43;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:3,0:0,11,0,2
chr5	140915726	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,26;MFRL=205,168;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,1,0,1
chr5	140915729	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=205,168;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,1,0,1
chr5	140915735	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,0,0,1
chr5	140915739	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,0,0,1
chr5	140915742	.	A	ATG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,24;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,0,0,1
chr5	140915749	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,22;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140915726_G_A:140915726:0,0,0,1
chr5	140953563	.	TGGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=117,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GGA;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr5	141007822	.	A	ACTCTTCTGGTTCATTATAAGCTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	141007831	.	G	GGGACTACAGGCGCCCGCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=203,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	141009527	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:141009527_T_TA:141009527:4,1,1,1
chr5	141009528	.	C	CACCCACATA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=120,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:141009527_T_TA:141009527:4,1,1,1
chr5	141009789	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=244,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141009789_C_CCT:141009789:0,1,0,1
chr5	141009790	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=244,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141009789_C_CCT:141009789:0,1,0,1
chr5	141009792	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=244,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141009789_C_CCT:141009789:0,1,0,1
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,14:0,0,15,6
chr5	141018023	.	T	TGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141018023_T_TGC:141018023:0,0,0,1
chr5	141018028	.	A	AGCC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141018023_T_TGC:141018023:0,0,0,1
chr5	141018030	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141018023_T_TGC:141018023:0,0,0,1
chr5	141018033	.	T	TGGC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141018023_T_TGC:141018023:0,0,0,1
chr5	141018035	.	T	TGGAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141018023_T_TGC:141018023:0,0,0,1
chr5	141019273	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141019273_A_AC:141019273:0,0,0,1
chr5	141019278	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141019273_A_AC:141019273:0,0,0,1
chr5	141019280	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:141019273_A_AC:141019273:0,0,0,1
chr5	141052529	.	T	TGCCTTGAGCGACGAGGATCCTGAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	141304877	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=164,104;MMQ=46,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr5	141304889	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=146,52;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0|1:141304889_T_G:141304889:4,0,1,1
chr5	141304892	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=146,52;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0|1:141304889_T_G:141304889:4,0,1,1
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,137;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CTG;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr5	141334921	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=76,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	141336584	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=234,121;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:4,1,4,0
chr5	141337126	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:3,5,4,5
chr5	141353069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141353069_T_C:141353069:4,0,1,0
chr5	141353074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141353069_T_C:141353069:4,0,1,0
chr5	141353076	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141353069_T_C:141353069:4,0,1,0
chr5	141353377	.	TC	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=92,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:141353377_TC_GT:141353377:0,2,0,1
chr5	141353381	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=92,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:141353377_TC_GT:141353377:0,2,0,1
chr5	141353384	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141353377_TC_GT:141353377:0,1,0,1
chr5	141353386	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:141353377_TC_GT:141353377:0,1,0,1
chr5	141358423	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141358423_CT_C:141358423:0,1,0,1
chr5	141358427	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:141358423_CT_C:141358423:0,1,0,1
chr5	141358430	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:141358423_CT_C:141358423:0,0,0,1
chr5	141358434	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:141358423_CT_C:141358423:0,0,0,1
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=87,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.839:14:0,5:1,7:1,1,0,12
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.272:22:5,1:11,5:0,16,1,5
chr5	141511537	.	A	AAATTAGCTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:7,0:15,2:1,21,0,2
chr5	141515487	.	A	AATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	141520013	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,120;MMQ=51,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:141520013_C_CAA:141520013:1,0,1,0
chr5	141520034	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=150,120;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:141520013_C_CAA:141520013:3,0,1,0
chr5	141524078	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:11,0,3,0
chr5	141699392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=134,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr5	141975067	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr5	142288318	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	142288527	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=89,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr5	142301123	.	GG	TT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,69;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:5,4,1,2
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	142393779	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	142393790	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142393790_G_GT:142393790:0,1,0,1
chr5	142393794	.	CC	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142393790_G_GT:142393790:0,1,0,1
chr5	142393798	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142393790_G_GT:142393790:0,1,0,1
chr5	142416741	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,3,3
chr5	142545710	.	GA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	142545750	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	142586694	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:5,2,3,0
chr5	142587097	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,17;MFRL=155,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,0:2,1:1,3,1,1
chr5	142587114	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=150,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	142587115	.	C	CAAGCACCCAAATG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr5	142593572	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=119,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,0:1,2:1,6,2,0
chr5	142662359	.	GAGAT	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:142662359_GAGAT_G:142662359:0,4,0,1
chr5	142662364	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=178,200;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:142662364_A_G:142662364:0,4,0,1
chr5	142662366	.	ATAGG	A,AATCTAGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,24,24;MFRL=140,215,200;MMQ=60,60,40;MPOS=4,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,1,1:0,0,0:0,3,0,2
chr5	142662367	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=140,226;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:142662359_GAGAT_G:142662359:0,3,0,1
chr5	142662368	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,27;MFRL=140,200;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:142662364_A_G:142662364:0,3,0,1
chr5	142662371	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=178,200;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:142662364_A_G:142662364:0,4,0,1
chr5	142779151	.	A	AGTTGTCATCTCCAGATCC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=203,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	142780062	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:4,4,0,2
chr5	143853425	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,42;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:6,12,1,2
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	145175945	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=145,130;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:2,4:4,0:6,1,0,4
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr5	145199681	.	TTTTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	145246085	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=109,81;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:6,2,5,2
chr5	145246122	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=112,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:12,0:5,4:9,8,1,3
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=175,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr5	145439565	.	A	ACACCAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=102,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:145439565_A_ACACCAT:145439565:3,4,1,1
chr5	145439568	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=102,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,0:0|1:145439565_A_ACACCAT:145439565:3,4,1,1
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:145508457_T_C:145508457:0,1,1,1
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=185,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:145508457_T_C:145508457:0,1,1,1
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:3,1:0,0:1,2,1,0
chr5	145508727	.	A	AGAAAGTGCGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:4,1,4,4
chr5	145512378	.	AAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:145512378_AAG_A:145512378:1,0,1,0
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=125,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,1:1,0:0|1:145512378_AAG_A:145512378:1,0,1,0
chr5	145522674	.	T	TTATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TA;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=123,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:4,7:11,3:4,12,6,4
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:3,3,4,1
chr5	145557046	.	AATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=0,0;MMQ=54,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.553:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	145557302	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=167,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=108,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr5	145608465	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:8,1,2,0
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=126,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,1:3,1:3,5,1,1
chr5	145647288	.	G	GTTGGA	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.092:41:20,0:15,3:0|1:145647288_G_GTTGGA:145647288:16,22,0,3
chr5	145647290	.	T	TGCAGTGGCG	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:21,0:15,3:0|1:145647288_G_GTTGGA:145647288:16,23,0,3
chr5	145647292	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=103,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:22,0:16,3:0|1:145647288_G_GTTGGA:145647288:16,23,0,3
chr5	145647319	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=102,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:9,3:4,14,1,2
chr5	145836662	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,1:0,5:3,0,5,1
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:11,8:2,7:8,5,5,10
chr5	145850328	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,4:8,3:4,11,3,4
chr5	145851163	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.706:19:2,10:3,1:3,3,2,11
chr5	145851230	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,155;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr5	145859763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr5	145888687	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr5	145894738	.	GAAC	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145894738_GAAC_G:145894738:1,1,0,1
chr5	145894743	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145894738_GAAC_G:145894738:1,1,0,1
chr5	145894745	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:145894738_GAAC_G:145894738:1,1,0,1
chr5	146080745	.	A	AGAAAAGTATATCTATTATCTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	146257555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr5	146435163	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	146619206	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=130,79;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,1,2
chr5	146657838	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	146773628	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=122,63;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,4:8,0:9,9,3,1
chr5	146778672	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=102,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:3,5,2,0
chr5	146778683	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=117,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,2,0
chr5	146780465	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	146780480	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:146780480_G_T:146780480:0,0,0,1
chr5	146780483	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:146780480_G_T:146780480:0,0,0,1
chr5	146971253	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,8,10
chr5	146981383	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=116,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:12,0:13,2:0|1:146981383_G_A:146981383:7,18,1,1
chr5	146981389	.	GA	TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=114,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:15,2:0|1:146981383_G_A:146981383:9,19,1,1
chr5	147012368	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=137,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:147012368_T_A:147012368:0,3,0,1
chr5	147012370	.	AGCAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:147012368_T_A:147012368:0,4,0,1
chr5	147012378	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:147012368_T_A:147012368:0,3,0,1
chr5	147019114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	147019335	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=134,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr5	147020178	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	147020443	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	147040757	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=120,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:5,2:4,0:4,5,1,2
chr5	147204261	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=105,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,1:2,4:1,4,4,1
chr5	147260941	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	147281324	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.127:30:13,0:13,3:5,22,0,3
chr5	147286056	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,88;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:2,10,2,1
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0|1:147444989_G_A:147444989:0,0,2,4
chr5	147445023	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:147444989_G_A:147444989:0,0,0,5
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0,0,12,6
chr5	147450028	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=114,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.438:23:8,4:5,6:3,10,4,6
chr5	147450040	.	C	CTTTCTTT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:0|1:147450040_C_CTTTCTTT:147450040:1,14,0,2
chr5	147450042	.	AA	TT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=126,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:7,0:0|1:147450040_C_CTTTCTTT:147450040:1,14,0,2
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr5	147468971	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	147469018	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:4,2,4,0
chr5	147470679	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=91,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,30:0.600:50:15,13:4,17:16,4,18,12
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=94,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:7,5:1,5:4,4,5,5
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=94,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=127,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:7,1,4,2
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,4:3,2:6,2,4,2
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,2:2,2:4,3,1,4
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:5,0,3,2
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=113,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:3,7:8,6:3,8,5,8
chr5	147481085	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	147484465	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.695:5:0,3:0,1:1,0,3,1
chr5	147486774	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:1,4,0,4
chr5	147486818	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr5	147488367	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=113,101;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.642:29:5,9:5,8:6,4,10,9
chr5	147491502	.	A	AGTGAGGGCTGAAAAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=40,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr5	147493871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	147494105	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr5	147498098	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=195,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=86,56;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	147505116	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.781:21:2,7:2,9:0,4,12,5
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:4,3,2,2
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=75,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:1,1,4,1
chr5	147516470	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=105,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:3,3,0,2
chr5	147549420	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=126,999;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,4:2,0:0,3,0,5
chr5	147554889	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	147555048	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:147555048_CA_C:147555048:0,2,0,1
chr5	147555053	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:147555048_CA_C:147555048:0,2,0,1
chr5	147692003	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,118;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr5	147693826	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr5	147695283	.	C	CTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCA;STR;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	147778689	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:0|1:147778689_C_T:147778689:4,11,1,2
chr5	147778696	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:0|1:147778689_C_T:147778689:3,12,1,2
chr5	147781732	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,1,1
chr5	147784449	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:147784449_T_TC:147784449:0,1,0,1
chr5	147784451	.	T	TCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:147784449_T_TC:147784449:0,1,0,1
chr5	147785802	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:6,4:0,2:5,3,5,1
chr5	147788798	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:5,6,4,7
chr5	147793666	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	147803557	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,3348;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,1,1
chr5	147807062	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:2,3,0,2
chr5	147819366	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:1,7,0,5
chr5	147856232	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,5:1,2:5,1,6,1
chr5	147856257	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=122,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.457:13:5,3:2,3:4,3,3,3
chr5	147856392	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:147856392_A_G:147856392:1,3,0,1
chr5	147856399	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:147856392_A_G:147856392:1,3,0,1
chr5	147889623	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:3,6:0,1:2,1,2,6
chr5	147928225	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	148206473	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,9,17
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	148208053	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:14,0:10,3:9,16,0,3
chr5	148407772	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:148407772_A_AG:148407772:0,0,0,1
chr5	148407774	.	A	AGCTCTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148407772_A_AG:148407772:0,0,0,1
chr5	148407775	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148407772_A_AG:148407772:0,0,0,1
chr5	148407779	.	C	CCAGCCTGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:148407772_A_AG:148407772:0,0,0,1
chr5	148424124	.	GAT	ACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:2,0:5,4,1,1
chr5	148431720	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=133,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:4,5,1,1
chr5	148442043	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148442043_T_A:148442043:0,0,0,1
chr5	148442050	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148442043_T_A:148442043:0,0,0,1
chr5	148442054	.	CT	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148442043_T_A:148442043:0,0,0,1
chr5	148442059	.	A	ATGCAAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:148442043_T_A:148442043:0,0,0,1
chr5	148562981	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr5	148590423	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,1,10
chr5	148618749	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:0|1:148618749_C_T:148618749:8,1,4,1
chr5	148618752	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:0|1:148618749_C_T:148618749:8,1,4,1
chr5	148620224	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:3,1,2,1
chr5	148620406	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148620406_C_CA:148620406:0,0,0,1
chr5	148620407	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148620406_C_CA:148620406:0,0,0,1
chr5	148620410	.	C	CTTCTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148620406_C_CA:148620406:0,0,0,1
chr5	148620413	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:148620406_C_CA:148620406:0,0,0,1
chr5	148622081	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=107,71017790;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr5	148624440	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=153,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,2:4,2,0,4
chr5	148625972	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=107,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr5	148627503	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr5	148630034	.	C	CATTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=111,50;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:1,1,1,1
chr5	148681930	.	CTCTCCCT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,53;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr5	148681947	.	C	CTGTAGCGTCTTCTGCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=107,53;MMQ=60,50;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:148681947_C_CTGTAGCGTCTTCTGCT:148681947:3,1,1,1
chr5	148681954	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=107,53;MMQ=60,39;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:148681947_C_CTGTAGCGTCTTCTGCT:148681947:3,1,0,1
chr5	148686952	.	GTGACGCCTGCAGATAATGACTC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:3,1,0,1
chr5	148725199	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,11:0,0,8,15
chr5	148725225	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=59.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,4:0,12:0,0,3,15
chr5	148729263	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=131,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,5:5,8:7,3,6,7
chr5	148737780	.	G	GATTTGGTCCTGCAGAAGCACAAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	148747164	.	G	GAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	148808619	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.495:6:2,0:1,0:0|1:148808619_T_G:148808619:3,0,0,3
chr5	148808621	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.495:6:2,0:1,0:0|1:148808619_T_G:148808619:3,0,0,3
chr5	148876488	.	AAATAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	148886523	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr5	148999881	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,5:0,1:1,0,5,2
chr5	149000039	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=118,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,6:2,7:2,3,4,9
chr5	149001283	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:2,5,5,3
chr5	149001318	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:149001318_T_A:149001318:10,4,0,2
chr5	149001319	.	GTGGC	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=116,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:8,0:0|1:149001318_T_A:149001318:12,4,0,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	149006879	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	149200216	.	TCTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149200216_TCTC_T:149200216:0,0,0,1
chr5	149200223	.	AAAATCCCGGCTCTG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149200216_TCTC_T:149200216:0,0,0,1
chr5	149212243	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,5:3,4:5,2,3,6
chr5	149215971	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=33,20;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,1:0,2,1,1
chr5	149215978	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,30;MFRL=85,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:149215978_C_T:149215978:1,2,0,1
chr5	149215981	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,32;MFRL=85,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:149215978_C_T:149215978:1,2,0,1
chr5	149215984	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=20,28;MFRL=85,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:149215978_C_T:149215978:1,2,0,1
chr5	149215989	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:149215978_C_T:149215978:0,2,0,1
chr5	149215991	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=24,30;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:149215978_C_T:149215978:0,2,0,1
chr5	149216003	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149216003_GT_G:149216003:0,0,0,1
chr5	149216007	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149216003_GT_G:149216003:0,0,0,1
chr5	149216024	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	149247443	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=196,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	149276373	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=93,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	149301157	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,5:7,0:15,1,5,0
chr5	149301335	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr5	149324135	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:10,5:6,0:6,10,5,0
chr5	149360503	.	A	AAAAGAACCAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr5	149374879	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,3,2
chr5	149375163	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=111,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:149375163_G_T:149375163:13,9,1,1
chr5	149375168	.	G	GGGACTGAAAAAATGAGACCAT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:10,2:0|1:149375163_G_T:149375163:14,8,1,1
chr5	149375170	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=104,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:10,1:0|1:149375163_G_T:149375163:14,8,1,1
chr5	149391994	.	T	TTAGAGATGGGGTCTCACTGCATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	149416486	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,0:14,3:10,16,1,2
chr5	149417044	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=129,147;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.319:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr5	149421618	.	G	GAACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149421618_G_GAACC:149421618:0,0,0,1
chr5	149421620	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:149421618_G_GAACC:149421618:0,0,0,1
chr5	149421622	.	G	GGACGAGCGTAATGCCTGACTCCTTCCAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149421618_G_GAACC:149421618:0,0,0,1
chr5	149427360	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:149427360_A_AGG:149427360:0,3,0,1
chr5	149427362	.	T	TGTCTTACCCAGGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:149427360_A_AGG:149427360:0,3,0,1
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149429798	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	149430107	.	TT	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,151;MMQ=53,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	149431729	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:149431729_G_C:149431729:1,3,0,1
chr5	149431732	.	G	GCCGTCTTGCACAGGGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=137,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:149431729_G_C:149431729:1,3,0,1
chr5	149433596	.	TG	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	149435759	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr5	149437257	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149437257_C_T:149437257:0,0,0,1
chr5	149437260	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149437257_C_T:149437257:0,0,0,1
chr5	149456771	.	CT	AA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr5	149460483	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:18,0:5,2:10,13,1,1
chr5	149497107	.	GCACA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=CA;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:4,5,5,6
chr5	149497450	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:149497450_T_C:149497450:1,4,1,1
chr5	149497452	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:149497450_T_C:149497450:1,4,1,1
chr5	149497454	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,2:0|1:149497450_T_C:149497450:1,4,1,1
chr5	149497458	.	C	CAGCATGAGAG	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=138,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:149497450_T_C:149497450:1,4,1,1
chr5	149499538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,29;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	149509591	.	G	GCCATCTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	149515074	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr5	149580584	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr5	149582069	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:0,1,2,0
chr5	149582335	.	A	AAGAG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149582338	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149582339	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149582343	.	G	GTGGCTTTGCC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149582344	.	A	AACCC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,24;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149582346	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149582335_A_AAGAG:149582335:0,0,0,1
chr5	149583175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=63,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	149584197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=119,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr5	149584483	.	C	CCAGCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=100,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149602189	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149602363	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	149602835	.	A	AGGTGTAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149602835_A_AGGTGTAT:149602835:0,1,0,1
chr5	149602837	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149602835_A_AGGTGTAT:149602835:0,1,0,1
chr5	149602838	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149602835_A_AGGTGTAT:149602835:0,1,0,1
chr5	149602840	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149602835_A_AGGTGTAT:149602835:0,1,0,1
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:2,2,1,4
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr5	149669117	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:2,2:0|1:149669117_C_T:149669117:5,4,1,1
chr5	149669126	.	C	CCAG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:2,2:0|1:149669117_C_T:149669117:4,6,1,1
chr5	149669127	.	T	TACC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:2,2:0|1:149669117_C_T:149669117:4,6,1,1
chr5	149669129	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=101,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,1:0|1:149669117_C_T:149669117:4,6,1,1
chr5	149677202	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr5	149755292	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:3,3,1,1
chr5	149758654	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=206,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	149758969	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=104,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.187:19:6,0:9,3:2,14,1,2
chr5	149759096	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr5	149759110	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr5	149763305	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=118,68;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:0,1:6,4:2,4,2,3
chr5	149771691	.	G	GTTCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	149772237	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	149772932	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr5	149778539	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:149778539_G_T:149778539:6,3,1,1
chr5	149778541	.	AAAAGCTG	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:5,0:4,2:0|1:149778539_G_T:149778539:13,6,1,1
chr5	149778552	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:149778539_G_T:149778539:13,6,1,1
chr5	149782796	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:2,3:3,6,2,1
chr5	149784776	.	A	AAGTCTTTGCTATAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	149792412	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149823785	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	149824000	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149824000_T_G:149824000:0,0,0,1
chr5	149824003	.	G	GGCAGGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149824000_T_G:149824000:0,0,0,1
chr5	149826477	.	CTCGG	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.139:19:11,2:4,0:0|1:149826477_CTCGG_C:149826477:8,9,1,1
chr5	149826485	.	GC	AA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,2:3,0:0|1:149826477_CTCGG_C:149826477:7,8,1,1
chr5	149826489	.	T	TGAA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:149826477_CTCGG_C:149826477:6,7,1,1
chr5	149826490	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:0|1:149826477_CTCGG_C:149826477:6,7,1,1
chr5	149826572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr5	149827098	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=102,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:3,6:6,8:5,4,9,5
chr5	149919868	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	149921313	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=191,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:149921313_CA_AG:149921313:0,3,0,1
chr5	149921317	.	CCCGGATAATT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=186,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:149921313_CA_AG:149921313:0,4,0,1
chr5	149931222	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	149931421	.	A	ACGGAACGGAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	150029362	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr5	150031148	.	CCTGGGCTGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=80,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CTGGG;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	150072705	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=115,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150072705_A_C:150072705:1,0,0,1
chr5	150072707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:150072705_A_C:150072705:3,0,0,1
chr5	150072710	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:150072705_A_C:150072705:3,0,0,1
chr5	150072854	.	TCTGG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=86,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:5,2:1,5,1,1
chr5	150076545	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:150076545_C_CG:150076545:0,4,0,1
chr5	150076546	.	C	G,CGTCATTTCAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30,27;MFRL=133,180,122;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.36,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:1,2,0:1,0,1:0,2,0,3
chr5	150076549	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:150076545_C_CG:150076545:0,4,0,1
chr5	150090958	.	A	AGAGAATCCATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:150090958_A_AGAGAATCCATT:150090958:0,0,0,1
chr5	150090961	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150090958_A_AGAGAATCCATT:150090958:0,0,0,1
chr5	150097883	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,3,1
chr5	150098032	.	TTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150098032_TTA_T:150098032:0,1,0,1
chr5	150098037	.	C	CTCTCTCTCTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150098032_TTA_T:150098032:0,1,0,1
chr5	150113130	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	150135900	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr5	150227620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=101,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.492:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr5	150227652	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:150227652_G_T:150227652:8,5,1,1
chr5	150227655	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:0|1:150227652_G_T:150227652:8,5,1,1
chr5	150275220	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:4,4,0,4
chr5	150276098	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:4,2,2,0
chr5	150276613	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150277979	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,78;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:12,3,2,0
chr5	150278179	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	150282672	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:3,0:12,6,0,3
chr5	150282674	.	A	AT,ATT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,27,24;MFRL=126,100,102;MMQ=60,60,60;MPOS=8,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=T;STR;TLOD=9.37,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,9,3:0.476,0.167:18:5,7,3:1,2,0:5,1,5,7
chr5	150282784	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	150404944	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:1,6,2,2
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr5	150410219	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=64,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,4,1
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	150415098	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=94,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr5	150440020	.	TGTGGCTGAGAGCA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=180,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.625:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr5	150481133	.	GGC	TTT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:0|1:150481133_GGC_TTT:150481133:2,11,1,1
chr5	150481137	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:0|1:150481133_GGC_TTT:150481133:2,11,1,1
chr5	150481139	.	C	CTTT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=108,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:5,0:0|1:150481133_GGC_TTT:150481133:2,11,1,1
chr5	150481150	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=117,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:1,8,0,2
chr5	150481162	.	GGCT	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr5	150497504	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	150498981	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=53,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr5	150501881	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	150503784	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=62,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,2,1
chr5	150506086	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,11,5
chr5	150506114	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,34;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:0,0:3,1:1,3,0,1
chr5	150506120	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=139,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150506120_C_T:150506120:0,1,0,1
chr5	150506127	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150506120_C_T:150506120:0,0,0,1
chr5	150506128	.	CACA	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150506120_C_T:150506120:0,0,0,1
chr5	150506135	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150506120_C_T:150506120:0,0,0,1
chr5	150506138	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	150518240	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:4,2:15,1:8,11,0,3
chr5	150519670	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,1,2
chr5	150563241	.	C	CTCCTCTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150563241_C_CTCCTCTGA:150563241:0,1,0,1
chr5	150563244	.	C	CTCCATTCCTACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150563241_C_CTCCTCTGA:150563241:0,1,0,1
chr5	150564973	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:1,2,2,0
chr5	150565761	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150565761_AG_A:150565761:0,1,0,1
chr5	150565769	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=106,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:150565761_AG_A:150565761:0,1,0,1
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	150603444	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=109,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:5,1,2,3
chr5	150639224	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	150647040	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr5	150647083	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:150647083_G_A:150647083:1,1,0,1
chr5	150647085	.	C	CTTTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150647083_G_A:150647083:1,1,0,1
chr5	150657284	.	A	ACATACCAAGCCCTCTATGAGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:150660769_A_G:150660769:0,0,3,5
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:150660769_A_G:150660769:0,0,1,4
chr5	150663561	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,4:0,8:0|1:150663561_T_A:150663561:0,0,11,4
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:150663561_T_A:150663561:0,0,11,4
chr5	150664343	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	150696447	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,4,9
chr5	150705056	.	A	ATATATATATACCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=159,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	150705064	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150705064_G_T:150705064:0,1,0,1
chr5	150705067	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150705064_G_T:150705064:0,1,0,1
chr5	150712898	.	A	ACATGAACAAGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=107,1936;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.288:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr5	150846864	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:0|1:150846864_AG_A:150846864:1,0,0,2
chr5	150846866	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.601:3:0,0:0,1:0|1:150846864_AG_A:150846864:1,0,0,2
chr5	150847505	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:4,1:1,5:0|1:150847505_T_C:150847505:1,4,1,5
chr5	150847509	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0|1:150847505_T_C:150847505:1,4,1,4
chr5	150853193	.	CTTTTGCTTTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTGCTTTG;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr5	150853394	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,1:2,0:0|1:150853394_G_A:150853394:2,1,0,1
chr5	150853402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:150853394_G_A:150853394:2,2,0,1
chr5	150853412	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1|0:150853394_G_A:150853394:0,1,1,1
chr5	150856107	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,1,1
chr5	150856327	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=107,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:2,8,1,1
chr5	150867849	.	TG	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=79,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	150887165	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:150887165_T_G:150887165:0,3,0,1
chr5	150887167	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=126,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:150887165_T_G:150887165:0,3,0,1
chr5	150887227	.	CCCTCTTA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150887227_CCCTCTTA_C:150887227:0,0,0,1
chr5	150887237	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150887227_CCCTCTTA_C:150887227:0,0,0,1
chr5	150901671	.	G	GCCCTTGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:150901671_G_GCCCTTGGC:150901671:1,2,0,1
chr5	150901674	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:150901671_G_GCCCTTGGC:150901671:1,2,0,1
chr5	150901675	.	C	CTCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,1:0,0:0|1:150901671_G_GCCCTTGGC:150901671:1,2,0,1
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	150923405	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,4:0,1:0,0,3,3
chr5	150925966	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,710;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0,5,1,1
chr5	151046137	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151046137_C_G:151046137:0,1,0,1
chr5	151046138	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151046137_C_G:151046137:0,1,0,1
chr5	151046139	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151046137_C_G:151046137:0,1,0,1
chr5	151166218	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=130,61;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,1:5,0:0|1:151166218_C_T:151166218:7,6,1,1
chr5	151166226	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=131,61;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:151166218_C_T:151166218:9,7,1,1
chr5	151166229	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=131,61;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,2:5,0:0|1:151166218_C_T:151166218:9,7,1,1
chr5	151169827	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=156,34798921;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:3,0:9,0,0,2
chr5	151175139	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:3,7,7,6
chr5	151175202	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	151178968	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151178968_GGT_G:151178968:0,3,0,1
chr5	151178974	.	GT	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151178968_GGT_G:151178968:0,3,0,1
chr5	151236039	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=218,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	151239290	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	151239306	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	151239641	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:151239641_CT_AA:151239641:0,0,0,1
chr5	151239644	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:151239641_CT_AA:151239641:0,0,0,1
chr5	151239645	.	T	TAGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:151239641_CT_AA:151239641:0,0,0,1
chr5	151239648	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:151239641_CT_AA:151239641:0,0,0,1
chr5	151775169	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=61,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr5	151784690	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=0,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr5	153029797	.	GGGTAGCCAGGGGAGGTAGGTGCCTGATGGGAGTGGGTGGTGCCCACAAATCCTGACTGTCTGTCATTTCTCTTCTACTCATCTGAACTTTAGGCTTATCCGTCCTGCAGAAAGTCCTGGATACAGCTGCTGAGAAGAACTGGCAGGTGACAGCAGTCAACATTTTGACAACCACAGAGGAGGGATACCGGATGCTCTTTCAGGACCTGGAGAAGAAAAAGGAGCGGCTGGT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=120,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:1,2:0,0:16,9,1,1
chr5	153029852	.	ACTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	153029960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=74,130;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,0,2
chr5	153030102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,3:3,0:0,5,1,2
chr5	153035525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	153065746	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	153078681	.	T	TAACCTAATATTGAAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	153085695	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=126,120;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr5	153085698	.	T	TGTTTTTTGAGAC,TGTTTGTTTTTTGAGAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28,29;MFRL=131,120,120;MMQ=60,47,40;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,1,1:0.182,0.182:8:2,1,1:1,0,0:0,6,0,2
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:3,2,2,2
chr5	153382462	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=81,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,0:5,4:7,5,3,1
chr5	153432450	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:3,2:0,2:3,0,3,1
chr5	153432733	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:3,7,0,2
chr5	153674536	.	TTGTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=196,165;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=TG;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:0,1:0,2,0,1
chr5	153677587	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=147,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:2,0:5,2:5,2,1,2
chr5	153726791	.	A	ATCCTTGGAGGTGGTGTAGCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	153789183	.	C	CTTCCTGTGTGGTCTGGTCCCAACCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=93,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:3,2:3,0:4,2,1,1
chr5	153795375	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=124,184;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.313:23:5,6:10,0:5,11,7,0
chr5	153795539	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153795539_TA_T:153795539:0,1,0,1
chr5	153795542	.	GGCAAT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:153795539_TA_T:153795539:0,1,0,1
chr5	153795552	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153795539_TA_T:153795539:0,0,0,1
chr5	153795554	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153795539_TA_T:153795539:0,0,0,1
chr5	153857512	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153857512_C_T:153857512:0,0,0,1
chr5	153857516	.	GGGTGC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:153857512_C_T:153857512:0,0,0,1
chr5	154135684	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=13,12;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:154135684_A_C:154135684:4,0,1,0
chr5	154135688	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=18,16;MFRL=143,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:154135684_A_C:154135684:4,0,1,0
chr5	154170349	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr5	154172202	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=122,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.161:16:9,2:5,0:0|1:154172202_G_T:154172202:7,7,0,2
chr5	154172203	.	C	CTCCATTCTTTTCCTCCCCTGATT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=122,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:9,2:4,0:0|1:154172202_G_T:154172202:7,7,0,2
chr5	154174808	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=137,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:1,0:5,2:4,2,2,0
chr5	154179357	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:2,3,2,2
chr5	154183957	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154183961	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154210339	.	C	CAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:4,2,4,2
chr5	154217616	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr5	154243039	.	C	CATGATCTTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,137;MMQ=60,57;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	154254757	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254757_G_A:154254757:1,0,1,0
chr5	154254765	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=25,31;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254757_G_A:154254757:1,0,1,0
chr5	154254776	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254776_CA_C:154254776:1,0,1,0
chr5	154254778	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254776_CA_C:154254776:1,0,1,0
chr5	154254781	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254776_CA_C:154254776:1,0,1,0
chr5	154254785	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,33;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254776_CA_C:154254776:1,0,1,0
chr5	154254789	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=150,209;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154254776_CA_C:154254776:1,0,1,0
chr5	154267818	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=98,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:8,4:4,0:6,7,4,0
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	154280916	.	CTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=120,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,2:5,0:6,4,1,1
chr5	154282235	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=83,97;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0|1:154282235_T_C:154282235:2,2,3,3
chr5	154282243	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=83,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,3:1,4:0|1:154282235_T_C:154282235:2,2,3,4
chr5	154282278	.	C	CCAACACGCAGCCTCTAAAAGCTTTATAGTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=104,89;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	154291494	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:154291494_C_T:154291494:0,3,0,1
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:154291494_C_T:154291494:0,1,0,3
chr5	154291517	.	G	GATTGTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=63,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:154291494_C_T:154291494:0,2,0,1
chr5	154291519	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154291494_C_T:154291494:0,1,0,1
chr5	154292592	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.247:6:1,0:4,1:0|1:154292592_CT_C:154292592:1,4,0,1
chr5	154292594	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=111,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.251:6:0,0:1,1:0|1:154292592_CT_C:154292592:1,4,0,1
chr5	154297637	.	A	ATCAAAAGAAGTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154304205	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154307187	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154307187_C_CA:154307187:0,0,0,1
chr5	154307188	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154307187_C_CA:154307187:0,0,0,1
chr5	154307192	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154307187_C_CA:154307187:0,0,0,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	154311908	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	154320596	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:2,1,5,0
chr5	154336832	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr5	154393343	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=181,1157;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154393343_G_T:154393343:1,0,1,0
chr5	154393347	.	G	GACTCCAATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=181,1157;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154393343_G_T:154393343:1,0,1,0
chr5	154393348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=181,1157;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154393343_G_T:154393343:1,0,1,0
chr5	154393549	.	G	GCCCTTA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=103,65;MMQ=60,52;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.140:25:15,0:7,3:0|1:154393549_G_GCCCTTA:154393549:8,14,2,1
chr5	154393550	.	G	GACCAGGAGAGAGGAGACTC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=103,65;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.139:25:15,0:7,0:0|1:154393549_G_GCCCTTA:154393549:8,14,2,1
chr5	154395158	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=119,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:3,5:9,4:10,2,8,1
chr5	155935512	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	156074573	.	G	GTAACTTGTTTGTCGTAATCTTTTTGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:3,4,1,1
chr5	156349300	.	CAATAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.692:1:0,1:0,0:0|1:156349300_CAATAG_C:156349300:0,0,0,1
chr5	156349306	.	CACCTTACAA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156349300_CAATAG_C:156349300:0,0,0,1
chr5	156390046	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=114,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,3:3,0:2,1,3,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=21,31;MFRL=127,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	156390307	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156390307_T_C:156390307:0,1,0,1
chr5	156390315	.	TTTGCC	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156390307_T_C:156390307:0,1,0,1
chr5	156390320	.	C	CAAAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:156390320_C_CAAAG:156390320:0,0,0,1
chr5	156390321	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156390320_C_CAAAG:156390320:0,1,0,1
chr5	156390323	.	A	AATAATGCTACCTGTGT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=26,25;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156390320_C_CAAAG:156390320:0,1,0,1
chr5	156390324	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=23,33;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:156390307_T_C:156390307:0,1,0,1
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=8,31;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.845:8:0,4:0,3:1,0,4,3
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.292:26:6,3:7,4:4,15,2,5
chr5	156482626	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156482626_A_C:156482626:0,0,0,1
chr5	156482629	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156482626_A_C:156482626:0,0,0,1
chr5	156516063	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=155,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr5	156525920	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=100,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	156589750	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=114,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,1,1
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr5	156645039	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	156659492	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.371:5:2,1:1,1:0|1:156659492_CA_TG:156659492:0,3,0,2
chr5	156659500	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:156659492_CA_TG:156659492:0,3,0,1
chr5	156659511	.	G	GGACCTGAGAGATTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0|1:156659511_G_GGACCTGAGAGATTGA:156659511:0,1,0,1
chr5	156659514	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156659511_G_GGACCTGAGAGATTGA:156659511:0,1,0,1
chr5	156659515	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156659511_G_GGACCTGAGAGATTGA:156659511:0,1,0,1
chr5	156670823	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=123,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	156712428	.	G	GAGTTAAAATGCATTGAGGCCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:5,0:4,4,1,1
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=13325518,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:0,7:1,5:1,0,5,7
chr5	156738830	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	156753307	.	A	ACTTCCTTTTGGCCACCGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=95,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:156753307_A_ACTTCCTTTTGGCCACCGC:156753307:0,2,0,1
chr5	156753309	.	T	TAAAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=95,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:156753307_A_ACTTCCTTTTGGCCACCGC:156753307:0,2,0,1
chr5	156753333	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	156753352	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	156787259	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr5	156788420	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156788420_A_C:156788420:0,1,1,0
chr5	156788424	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156788420_A_C:156788420:0,1,1,0
chr5	156887133	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=90,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:3,2:2,1,2,1
chr5	156895721	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=100,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:5,4,1,1
chr5	156898690	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,2:7,4:8,6,3,3
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,1,8
chr5	156916002	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=141,147;MMQ=47,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:9,0,2,0
chr5	156916022	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,122;MMQ=60,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:2,2:10,0:11,1,2,0
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=118,101;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:3,3:9,5:7,5,5,5
chr5	156918716	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=105,153;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:11,4,2,0
chr5	156936258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,1,1
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	156936576	.	A	AAGAGGATGGGGCTGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:3,0,5,1
chr5	156957784	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=113,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:0,4:9,3:6,3,4,3
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0|1:157075943_TAC_T:157075943:0,1,0,3
chr5	157075970	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=146,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.428:5:2,2:1,0:1|0:157075943_TAC_T:157075943:0,3,0,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=95,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr5	157158414	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,3,0
chr5	157158439	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=167,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,6:2,3:1,1,8,1
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=125,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,1:3,3:3,1,3,1
chr5	157166399	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:5,2,1,1
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,30;MFRL=75,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr5	157181070	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=122,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:4,7,2,1
chr5	157214789	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr5	157230787	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=81,90;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:13,0:16,5:3,26,0,5
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,546;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	158522577	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1,2,2,0
chr5	158523374	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=115,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr5	158523522	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,1,2
chr5	158526579	.	A	ATTTCCCTAAAAGTCCCTTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=0,114;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr5	158588633	.	GAAAAAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34,32;MFRL=0,164,137;MMQ=60,60,60;MPOS=21,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.20,19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,11:0.188,0.754:13:0,2,4:0,0,7:0,0,2,11
chr5	158589858	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.652:18:3,6:3,6:4,2,10,2
chr5	158600921	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr5	158603873	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,139;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:15,3:22,0:14,23,3,0
chr5	158608880	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,2:4,3:11,0,5,0
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,8:1,2:2,4,6,4
chr5	158705370	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=116,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:1,7,0,9
chr5	158743846	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=73,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:2,4:0,2:1,1,4,2
chr5	158753627	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:5,0,1,1
chr5	159343840	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr5	159463869	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159463869_CA_TG:159463869:0,0,0,1
chr5	159463872	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159463869_CA_TG:159463869:0,0,0,1
chr5	159463873	.	GTTTCTCTCCA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159463869_CA_TG:159463869:0,0,0,1
chr5	159463890	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159463869_CA_TG:159463869:0,0,0,1
chr5	159476479	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=103,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,1,1
chr5	159478089	.	GTTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.524:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr5	159520910	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:9,6,2,1
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	159659273	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,12:0,0,11,18
chr5	159661723	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,4,0
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,4,0
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,3,6
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,0:0,8:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,3,7
chr5	159686459	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=119,79;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr5	159707772	.	G	GGTTTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	159821677	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.234:18:11,3:3,0:8,6,4,0
chr5	159830420	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=115,68;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:5,5:11,0:6,10,4,1
chr5	159831625	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159831625_TGG_T:159831625:0,0,0,1
chr5	159831629	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159831625_TGG_T:159831625:0,0,0,1
chr5	159831640	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159831625_TGG_T:159831625:0,0,0,1
chr5	159831657	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159831625_TGG_T:159831625:0,0,0,1
chr5	159831660	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159831625_TGG_T:159831625:0,0,0,1
chr5	159834486	.	T	TCATTTTCTTGGTAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=131,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr5	159834618	.	A	ACTCTAGCCTGGGTGACAAAGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=113,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:159834618_A_ACTCTAGCCTGGGTGACAAAGC:159834618:1,4,1,1
chr5	159834621	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=113,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,1:0|1:159834618_A_ACTCTAGCCTGGGTGACAAAGC:159834618:1,4,1,1
chr5	159839530	.	T	TAAAAA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=106,108;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,19;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:2,1:1,4,3,1
chr5	159839545	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,22;MFRL=107,126;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:3,1:2,1:1,5,0,2
chr5	159839561	.	A	AGC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,18;MFRL=139,53;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:3,1:2,0:0|1:159839561_A_AGC:159839561:0,6,1,1
chr5	159839562	.	A	ACAAAAAT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=139,53;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:4,1:2,0:0|1:159839561_A_AGC:159839561:0,6,1,1
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	159840700	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	159841439	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:3,4:12,0:11,4,4,0
chr5	159841492	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:1,2:2,1:0,5,0,3
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr5	160063369	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:160063369_T_A:160063369:0,2,0,1
chr5	160063372	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:160063369_T_A:160063369:0,2,0,1
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	160097464	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=123,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr5	160097496	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr5	160753563	.	TTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160753563_TTGG_T:160753563:0,1,0,1
chr5	160753568	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,24;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160753563_TTGG_T:160753563:0,1,0,1
chr5	160753570	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160753563_TTGG_T:160753563:0,1,0,1
chr5	160753572	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160753563_TTGG_T:160753563:0,1,0,1
chr5	160753574	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,29;MFRL=177,111;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160753563_TTGG_T:160753563:0,1,0,1
chr5	160761908	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=106,1124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:2,3,1,1
chr5	160972143	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160972143_C_T:160972143:1,0,0,1
chr5	160972146	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=14,25;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:160972143_C_T:160972143:1,0,0,1
chr5	161178716	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=124,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr5	161495146	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:1,2,0,1
chr5	161495164	.	G	GGTTCTCTTATGAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	161528175	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	162887650	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=105,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:2,4:8,4:7,3,4,4
chr5	162896899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=126,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162896899_C_T:162896899:0,3,0,1
chr5	162896901	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=126,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162896899_C_T:162896899:0,3,0,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:1,5,1,5
chr5	166712130	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:166712130_T_C:166712130:0,3,0,1
chr5	166712131	.	GATGGCTGCTTT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:166712130_T_C:166712130:0,3,0,1
chr5	166712147	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:166712130_T_C:166712130:0,2,0,1
chr5	167303040	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=88,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:167303040_G_A:167303040:2,7,0,2
chr5	167303042	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=87,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:167303040_G_A:167303040:3,7,0,2
chr5	167303043	.	G	GAACCAGAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=87,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:167303040_G_A:167303040:3,7,0,2
chr5	167517505	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	167589617	.	T	TGCTGGGGGAGAGTCACCAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=94,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:0|1:167589617_T_TGCTGGGGGAGAGTCACCAG:167589617:4,6,1,1
chr5	167589623	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=115,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:167589617_T_TGCTGGGGGAGAGTCACCAG:167589617:4,7,1,1
chr5	167617501	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,587;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	167631334	.	C	CCAACAGGCTCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=105,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:167631334_C_CCAACAGGCTCTT:167631334:1,0,1,1
chr5	167631341	.	GC	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=100,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:167631334_C_CCAACAGGCTCTT:167631334:2,0,0,1
chr5	167638882	.	TT	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	167671797	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=151,123;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:167671797_CA_TG:167671797:0,4,0,1
chr5	167671802	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0|1:167671797_CA_TG:167671797:0,2,0,3
chr5	167671805	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:167671797_CA_TG:167671797:0,4,0,1
chr5	167671809	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=157,123;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:167671797_CA_TG:167671797:0,3,0,1
chr5	167674235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:167674235_C_T:167674235:2,0,1,1
chr5	167674239	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:167674235_C_T:167674235:2,0,1,1
chr5	167849193	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167849193_GT_AG:167849193:0,0,0,1
chr5	167849197	.	TC	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=228,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:167849193_GT_AG:167849193:0,1,0,1
chr5	167851168	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	167858492	.	T	TTTGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	167881021	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=120,116;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:7,3:12,6,3,0
chr5	167882381	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=163,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:2,1:10,1:8,5,0,2
chr5	167891668	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:3,0,5,0
chr5	167895054	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167895054_A_C:167895054:0,1,0,1
chr5	167895061	.	G	GGAACATCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=210,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:167895054_A_C:167895054:0,3,0,1
chr5	167895065	.	A	ATTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=210,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:167895054_A_C:167895054:0,3,0,1
chr5	167895067	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=210,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:167895054_A_C:167895054:0,3,0,1
chr5	167913603	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=108,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	167919884	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=117,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,1:9,2:5,12,0,3
chr5	167919888	.	T	TTTTTTTTCCC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=117,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,1:8,2:5,12,0,3
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:0,5,0,5
chr5	167929035	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=147,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:5,5:9,4:6,8,3,7
chr5	167945141	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,29;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,2,0,1
chr5	167945146	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,2,0,1
chr5	167945152	.	AA	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,2,0,1
chr5	167945155	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,2,0,1
chr5	167945157	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,1,0,1
chr5	167945160	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=137,102;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167945141_TAC_T:167945141:0,1,0,1
chr5	167988533	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:167988533_T_A:167988533:0,2,0,1
chr5	167988537	.	A	ACAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167988533_T_A:167988533:0,1,0,1
chr5	167988539	.	ATAAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167988533_T_A:167988533:0,1,0,1
chr5	168110999	.	G	GCCTCCCCAGTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:168110999_G_GCCTCCCCAGTA:168110999:2,4,1,1
chr5	168111004	.	TC	GG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:168110999_G_GCCTCCCCAGTA:168110999:2,4,1,1
chr5	168123506	.	GAGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168123506_GAGGA_G:168123506:0,1,0,1
chr5	168123508	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	168123513	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168123506_GAGGA_G:168123506:0,1,0,1
chr5	168123517	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=21,22;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168123506_GAGGA_G:168123506:0,1,0,1
chr5	168135182	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0|1:168135182_G_GT:168135182:0,1,0,1
chr5	168135183	.	G	GTGTGATGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:168135182_G_GT:168135182:0,1,0,1
chr5	168137980	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=110,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:6,11,0,2
chr5	168139303	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=107,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:7,2,2,0
chr5	168179922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=98169919,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr5	168180168	.	CGGTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168180168_CGGTG_C:168180168:0,1,0,1
chr5	168180173	.	G	GTAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:168180168_CGGTG_C:168180168:0,1,0,1
chr5	168222578	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:0|1:168222578_A_T:168222578:3,4,1,1
chr5	168222579	.	G	GTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:0|1:168222578_A_T:168222578:3,4,1,1
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:6,3,4,1
chr5	168233444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,4:9,0:8,4,4,0
chr5	168233474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=81,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,2:5,3:9,3,2,3
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	168250350	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	168620435	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr5	168690710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=129,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:2,1:0|1:168690710_C_T:168690710:1,1,0,1
chr5	168690723	.	C	CTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=129,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168690710_C_T:168690710:0,1,0,1
chr5	169028481	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr5	169096207	.	T	TAAAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,1:1,1:2,1,2,1
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	169098265	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	169122803	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:1,5,1,2
chr5	169129422	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=116,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,3:3,1:4,8,1,3
chr5	169129483	.	G	GAGCTGCGACAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	169138909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.651:9:0,1:2,4:0,3,3,3
chr5	169141505	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=106,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:2,4,0,3
chr5	169143383	.	GG	AG,TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26,27;MFRL=0,195,219;MMQ=60,60,60;MPOS=15,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr5	169143392	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	169291493	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=127,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169291493_GT_G:169291493:0,1,0,1
chr5	169291497	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=127,199;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169291493_GT_G:169291493:0,1,0,1
chr5	169308493	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=113,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr5	169423208	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169423208_G_A:169423208:0,1,0,1
chr5	169423211	.	C	CTATGGGAGCTCACCTTTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:169423208_G_A:169423208:0,1,0,1
chr5	169423229	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	169423272	.	C	CATTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=222,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169423272_C_CATTT:169423272:0,1,0,1
chr5	169423273	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=222,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169423272_C_CATTT:169423272:0,1,0,1
chr5	169423276	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=222,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169423272_C_CATTT:169423272:0,1,0,1
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:169454831_G_A:169454831:1,0,5,0
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:169454831_G_A:169454831:1,0,5,0
chr5	169454941	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=104,177;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,3:7,2:8,4,2,3
chr5	169468929	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	169469175	.	C	CTCCCAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=42,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:169469175_C_CTCCCAA:169469175:1,1,0,1
chr5	169469177	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=42,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:169469175_C_CTCCCAA:169469175:1,1,0,1
chr5	169469180	.	GA	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169469175_C_CTCCCAA:169469175:1,0,0,1
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	169477429	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=71,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:2,1,1,1
chr5	169482453	.	G	GGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:169482453_G_GGCTA:169482453:0,0,0,1
chr5	169482456	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169482453_G_GGCTA:169482453:0,0,0,1
chr5	169483655	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=137,135;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr5	169483679	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=115,135;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:9,4,2,0
chr5	169483840	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:169483840_A_T:169483840:0,3,0,1
chr5	169483842	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169483840_A_T:169483840:0,3,0,1
chr5	169483870	.	A	ATAAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,24;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169483870_A_ATAAG:169483870:0,1,0,1
chr5	169483872	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:169483870_A_ATAAG:169483870:0,1,0,1
chr5	169484766	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=239,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169484766_G_GT:169484766:0,1,0,1
chr5	169484772	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=239,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169484766_G_GT:169484766:0,1,0,1
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr5	169496072	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,2:0,0:1,0,1,1
chr5	169504627	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	169504743	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr5	169509045	.	G	GTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169509045_G_GTCT:169509045:0,1,0,1
chr5	169509047	.	A	AAACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169509045_G_GTCT:169509045:0,1,0,1
chr5	169509049	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169509045_G_GTCT:169509045:0,1,0,1
chr5	169509929	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	169535161	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,0:2,2:4,2,2,0
chr5	169535522	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=57,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,5:1,1,6,5
chr5	169683638	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	169685204	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:4,3,1,4
chr5	169685785	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=105,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:6,1,4,0
chr5	169697805	.	C	CTTGGCTGGTTTGGCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=117,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:8,2:10,0:6,12,1,1
chr5	169931623	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,2:4,1:5,0,2,1
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr5	170162870	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=70,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr5	170215778	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=113,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	170215780	.	GTCCA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:170215780_GTCCA_G:170215780:0,4,0,1
chr5	170215788	.	A	ACT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:170215780_GTCCA_G:170215780:0,4,0,1
chr5	170221379	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,18;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.526:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr5	170221411	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170221411_TG_CT:170221411:0,1,0,1
chr5	170221414	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170221411_TG_CT:170221411:0,1,0,1
chr5	170239259	.	T	TTATTTTATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170239259_T_TTATTTTATC:170239259:0,1,0,1
chr5	170239262	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170239259_T_TTATTTTATC:170239259:0,1,0,1
chr5	170239266	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170239259_T_TTATTTTATC:170239259:0,1,0,1
chr5	170323223	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:7,5:7,9:6,8,10,4
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	170692937	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170692937_C_A:170692937:0,1,0,1
chr5	170692940	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170692937_C_A:170692937:0,1,0,1
chr5	170692941	.	C	CATT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:170692937_C_A:170692937:0,1,0,1
chr5	170725928	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=72,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:170725928_G_T:170725928:1,2,0,1
chr5	170725930	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=72,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:170725928_G_T:170725928:1,2,0,1
chr5	170725934	.	G	GCCAACCCCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:170725928_G_T:170725928:0,2,0,1
chr5	170725937	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=115,91;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170725928_G_T:170725928:0,1,0,1
chr5	170815125	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,0:1,4:0,3,0,4
chr5	170818897	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:0|1:170818897_A_G:170818897:0,8,0,2
chr5	170818906	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0|1:170818897_A_G:170818897:0,7,0,2
chr5	170819887	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:10,2:3,5:9,4,2,5
chr5	170820024	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:1,5,0,3
chr5	170827115	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=93,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:0|1:170827115_C_A:170827115:5,3,3,0
chr5	170827118	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=93,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:0|1:170827115_C_A:170827115:5,3,3,0
chr5	170832243	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr5	170837513	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr5	170863331	.	GGCCTCAGAGACCTCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	170883734	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	170883844	.	C	CTTAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	171297808	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:171297808_T_C:171297808:6,13,1,1
chr5	171297812	.	T	TCACACCCACCCCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=115,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,2:0|1:171297808_T_C:171297808:6,13,1,1
chr5	171299804	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=118,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,1,1
chr5	171305167	.	A	ATTTGTCTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:171305167_A_ATTTGTCTCT:171305167:0,1,0,1
chr5	171305168	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171305167_A_ATTTGTCTCT:171305167:0,1,0,1
chr5	171305172	.	TAC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=120,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171305167_A_ATTTGTCTCT:171305167:0,1,0,1
chr5	171482859	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171482859_AC_A:171482859:0,1,0,1
chr5	171482863	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:171482859_AC_A:171482859:0,1,0,1
chr5	171517426	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=59,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr5	171517443	.	A	ATC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171517443_A_ATC:171517443:0,0,0,1
chr5	171517444	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171517443_A_ATC:171517443:0,0,0,1
chr5	171517449	.	G	GGGGGTGGTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171517443_A_ATC:171517443:0,0,0,1
chr5	171532851	.	CTTTCACA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	171638806	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=142,101;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:7,0:8,3,2,0
chr5	171661357	.	G	GTACGTCCCTTTATCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:2,2,1,1
chr5	171774363	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr5	171774399	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,1,2
chr5	171800895	.	G	GTGTCCTGACAAGATGCCACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:171800895_G_GTGTCCTGACAAGATGCCACA:171800895:1,1,0,1
chr5	171800898	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:171800895_G_GTGTCCTGACAAGATGCCACA:171800895:1,1,0,1
chr5	172261414	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:172261414_A_C:172261414:1,1,1,0
chr5	172261417	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,12;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:172261414_A_C:172261414:1,1,1,0
chr5	172261431	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,18;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:172261414_A_C:172261414:0,2,1,0
chr5	172261449	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,11;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,0:0|1:172261414_A_C:172261414:0,3,1,0
chr5	172261462	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	172261489	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	172315872	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:172315872_G_A:172315872:0,0,1,4
chr5	172315879	.	G	GTTAGGGTGACATTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:172315872_G_A:172315872:1,3,0,1
chr5	172324128	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	172336789	.	C	CCCAACGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:172336789_C_CCCAACGCA:172336789:1,2,0,1
chr5	172336790	.	T	TTACAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:172336789_C_CCCAACGCA:172336789:1,2,0,1
chr5	172342029	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=59,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr5	172342059	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:2,3,3,3
chr5	172351160	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr5	172395664	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,23,7
chr5	172421760	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=65,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:2,1:0,1:2,3,0,2
chr5	172513557	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:0|1:172513557_C_T:172513557:6,9,1,1
chr5	172513576	.	A	AGTGTGGTC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:172513557_C_T:172513557:4,11,1,1
chr5	172517781	.	GT	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.204:13:7,2:3,0:5,6,0,2
chr5	172535553	.	AGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	172560793	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,0,4
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	172578549	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	172578787	.	A	AATAATAGTCAAGTTTTCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	172662014	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=113,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,1:1,1:0|1:172662014_G_A:172662014:5,4,2,0
chr5	172662024	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:0|1:172662014_G_A:172662014:4,6,2,0
chr5	172745269	.	A	AAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=AG;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr5	172755273	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	173036509	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:173036509_C_CAT:173036509:0,0,0,1
chr5	173036511	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:173036509_C_CAT:173036509:0,0,0,1
chr5	173036513	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:173036509_C_CAT:173036509:0,0,0,1
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:9,7:3,9:8,5,10,6
chr5	173359600	.	A	AGAAGGGACCAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173359600_A_AGAAGGGACCAAG:173359600:0,1,0,1
chr5	173359601	.	T	TATTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173359600_A_AGAAGGGACCAAG:173359600:0,1,0,1
chr5	174152006	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:2,1,1,3
chr5	174156168	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	174869536	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:174869536_G_A:174869536:7,4,1,1
chr5	174869537	.	C	CCA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:174869536_G_A:174869536:7,4,1,1
chr5	174869538	.	TGG	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:0|1:174869536_G_A:174869536:7,4,1,1
chr5	174869543	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=110,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:174869536_G_A:174869536:6,4,1,1
chr5	174870073	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:4,0:0,1:4,0,0,1
chr5	174870466	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=117,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr5	174919080	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:8,3:4,0:8,5,3,0
chr5	174939093	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr5	174949548	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:174949548_G_C:174949548:0,0,0,1
chr5	174949550	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:174949548_G_C:174949548:0,0,0,1
chr5	175112607	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175112607_G_T:175112607:0,0,0,1
chr5	175112612	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175112607_G_T:175112607:0,0,0,1
chr5	175523746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=132,822398;MMQ=57,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:3,3,2,0
chr5	175523828	.	GCGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=174,131;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:175523828_GCGT_G:175523828:0,1,0,1
chr5	175523835	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=174,131;MMQ=27,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:175523828_GCGT_G:175523828:0,1,0,1
chr5	175524503	.	T	TGAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=139,132;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:175524503_T_TGAC:175524503:0,3,0,1
chr5	175524505	.	A	ACCCATCACCTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=139,132;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:175524503_T_TGAC:175524503:0,3,0,1
chr5	175528589	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=110,85;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:14,9,1,1
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,162;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr5	175717825	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175717825_C_T:175717825:0,0,1,0
chr5	175717827	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175717825_C_T:175717825:0,0,1,0
chr5	175717833	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=90,110;MMQ=40,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:175717825_C_T:175717825:1,0,2,0
chr5	175774682	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=97,111;MMQ=60,24;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:4,5,4,0
chr5	175774923	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:7,9,1,2
chr5	175823609	.	G	GTTGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	175915861	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr5	175921150	.	AGTT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,2:8,6:7,9,4,4
chr5	175933707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:6,4:6,5:7,6,6,3
chr5	175992481	.	TCCCTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:175992481_TCCCTC_T:175992481:0,0,0,1
chr5	175992489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175992481_TCCCTC_T:175992481:0,0,0,1
chr5	175995857	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.777:7:0,1:1,5:0,1,3,3
chr5	175998370	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,32;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:175998370_G_C:175998370:0,2,0,1
chr5	175998377	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:175998370_G_C:175998370:0,2,0,1
chr5	175998378	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:175998370_G_C:175998370:0,2,0,1
chr5	175998380	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:175998370_G_C:175998370:0,2,0,1
chr5	176002542	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=98,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:2,3,1,2
chr5	176002707	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:4,0,2,4
chr5	176003070	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=113,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:176003070_G_T:176003070:5,5,1,1
chr5	176003073	.	T	TGCGCGGCCCCCCTCTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:176003070_G_T:176003070:5,6,1,1
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr5	176004866	.	A	AGT	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=27,27;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.494:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	176004878	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:176004878_T_A:176004878:1,3,0,1
chr5	176004879	.	GTATGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:176004878_T_A:176004878:1,3,0,1
chr5	176004887	.	G	C,GTTTACTATATATAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,33,30;MFRL=162,131,156;MMQ=60,60,60;MPOS=6,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:1,1,0:1,2,0,2
chr5	176004891	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,29;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176004878_T_A:176004878:1,1,0,1
chr5	176004897	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,21;MFRL=213,131;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176004878_T_A:176004878:1,0,0,1
chr5	176004968	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,2:4,3:4,0,5,0
chr5	176008641	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,1,0,1
chr5	176008644	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,1,0,1
chr5	176008646	.	G	GTAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,1,0,1
chr5	176008648	.	TTGAG	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,1,0,1
chr5	176008654	.	C	CGTTA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=113,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,1,0,1
chr5	176008659	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,0,0,1
chr5	176008667	.	TC	GA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:176008641_C_CT:176008641:0,0,0,1
chr5	176013841	.	CGG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=145,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:6,2:0|1:176013841_CGG_C:176013841:5,5,1,1
chr5	176013846	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=145,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:6,2:0|1:176013841_CGG_C:176013841:5,5,1,1
chr5	176017549	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr5	176025938	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr5	176053336	.	GGTGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,190;MMQ=49,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=GT;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	176074752	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,6,14
chr5	176301085	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,24;MFRL=82,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:176301085_G_A:176301085:2,2,0,1
chr5	176301094	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,22;MFRL=82,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:176301085_G_A:176301085:2,2,0,1
chr5	176301106	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:176301106_T_C:176301106:0,1,1,1
chr5	176301108	.	CATT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:176301106_T_C:176301106:0,1,1,1
chr5	176301113	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0|1:176301106_T_C:176301106:0,0,1,1
chr5	176305400	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:176305400_G_GT:176305400:2,3,1,1
chr5	176305401	.	G	GTCAGGTGAGCCCAAGCT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:176305400_G_GT:176305400:2,3,1,1
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr5	176305497	.	TGGA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=102,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:2,3,0,1
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr5	176308198	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:176308198_G_C:176308198:1,1,0,1
chr5	176308200	.	C	CTCTGTGGATTGGAGTTAGGAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,34;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:176308198_G_C:176308198:1,1,0,1
chr5	176308202	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:176308198_G_C:176308198:1,1,0,1
chr5	176308902	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=77,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	176310871	.	C	CCCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:4,2:1,0:0|1:176310871_C_CCCT:176310871:3,3,1,1
chr5	176310873	.	G	GGCCAACACCCTGTCTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:4,2:1,0:0|1:176310871_C_CCCT:176310871:3,3,1,1
chr5	176315360	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0|1:176315360_C_CT:176315360:2,3,1,1
chr5	176315361	.	C	CAAAGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:2,2:3,0:0|1:176315360_C_CT:176315360:2,3,1,1
chr5	176315363	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=141,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:176315360_C_CT:176315360:2,3,1,1
chr5	176317596	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176317596_C_T:176317596:2,0,1,0
chr5	176317609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176317596_C_T:176317596:2,0,1,0
chr5	176318306	.	G	GAGTCTGGCCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176318306_G_GAGTCTGGCCA:176318306:0,0,0,1
chr5	176318308	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176318306_G_GAGTCTGGCCA:176318306:0,0,0,1
chr5	176333126	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	176383102	.	ATGGTG	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=144,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:176383102_ATGGTG_A:176383102:0,2,0,1
chr5	176383109	.	GTCACTCACAAAGCCACAGGTAATCACAGAT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=168,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:176383102_ATGGTG_A:176383102:0,3,0,1
chr5	176383144	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=211,98;MMQ=60,60;MPOS=-17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:176383102_ATGGTG_A:176383102:0,1,0,1
chr5	176383148	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,24;MFRL=211,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:176383102_ATGGTG_A:176383102:0,1,0,1
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr5	176516631	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=101,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:2,7,2,3
chr5	176520283	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,1:0|1:176520283_G_C:176520283:0,4,2,0
chr5	176520287	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0|1:176520283_G_C:176520283:0,4,2,0
chr5	176520819	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=149,107;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:176520819_CA_TG:176520819:0,3,0,1
chr5	176520825	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=149,107;MMQ=60,21;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:176520819_CA_TG:176520819:0,3,0,1
chr5	176520834	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,27;MFRL=165,107;MMQ=60,21;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:176520819_CA_TG:176520819:0,2,0,1
chr5	176520844	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=153,132;MMQ=41,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:176520819_CA_TG:176520819:0,2,0,1
chr5	176520847	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=198,120;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:176520819_CA_TG:176520819:0,1,0,2
chr5	176520852	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=153,132;MMQ=41,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1|0:176520819_CA_TG:176520819:0,2,0,1
chr5	176520854	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,32;MFRL=132,107;MMQ=60,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176520819_CA_TG:176520819:0,1,0,1
chr5	176520858	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,25;MFRL=107,132;MMQ=21,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:176520819_CA_TG:176520819:0,1,0,1
chr5	176522528	.	C	CAAAATAGAATGGCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:4,5,1,1
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,7,5
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr5	176524414	.	C	CAACTGACGGTGTGAGCTGTCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=55,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	176638986	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:4,0:6,5,1,2
chr5	176639105	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,4:5,7:6,2,6,5
chr5	176639243	.	C	CAATATTAGTCTTTTTCTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	176684233	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=14,21;MFRL=173,204;MMQ=39,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:176684233_T_C:176684233:0,1,0,1
chr5	176684240	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=173,204;MMQ=39,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176684233_T_C:176684233:0,1,0,1
chr5	176684249	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=173,204;MMQ=39,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176684233_T_C:176684233:0,1,0,1
chr5	176687260	.	A	AGGCTGGTCTCTTAACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	176709577	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,61;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:1,7,0,2
chr5	176719198	.	TCCATCATACTCA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176719198_TCCATCATACTCA_T:176719198:0,2,0,1
chr5	176719212	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176719198_TCCATCATACTCA_T:176719198:0,2,0,1
chr5	176721263	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=128,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr5	176729726	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=19,13;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:1,0:0|1:176729726_G_T:176729726:2,3,0,2
chr5	176729736	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.547:7:1,1:2,3:0|1:176729726_G_T:176729726:0,3,0,4
chr5	176730131	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,2:2,1:0|1:176730131_A_C:176730131:2,5,3,0
chr5	176730133	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,0:2,0:0|1:176730131_A_C:176730131:2,6,3,0
chr5	176730139	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=116,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,1:0|1:176730131_A_C:176730131:4,5,2,0
chr5	176730143	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=110,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:5,1:0|1:176730131_A_C:176730131:6,6,2,0
chr5	176730145	.	CGTGCCTGG	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=116,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:5,0:0|1:176730131_A_C:176730131:8,7,2,0
chr5	176731617	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr5	176733341	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:2,1:1,1:3,1,3,0
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	176734657	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,1:2,3:1,1,0,4
chr5	176761341	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	176764875	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	176792912	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,9:1,4:3,0,9,4
chr5	176813433	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,51;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,1,1
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=140,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.577:8:2,3:1,1:3,0,4,1
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176831980_T_C:176831980:0,0,1,0
chr5	176831989	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:176831980_T_C:176831980:0,0,1,0
chr5	176832680	.	G	GTATGGGAATGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,313;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:2,1,0,1
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	176859848	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,6,7
chr5	176860950	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:3,4,1,1
chr5	176868695	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr5	176885029	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.412:7:1,0:3,0:2,2,3,0
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	176894354	.	G	GACCCTCACTGAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=107,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,1,1
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr5	176895980	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:176895980_G_T:176895980:2,4,1,1
chr5	176895982	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:176895980_G_T:176895980:2,6,1,1
chr5	176895984	.	G	GCAGGAAGTAGGATTGAAGCAT	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=129,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:2,2:0|1:176895980_G_T:176895980:2,6,1,1
chr5	176896016	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr5	176917810	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:6,1,2,0
chr5	176917897	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=104,120;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,3:7,2:7,9,2,3
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr5	176932095	.	G	GGGAGGGGACAGGGCATGGGAATGCGGTGCTCTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=81,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:2,2,1,1
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176939597	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=85,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr5	176943334	.	C	CTGA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=107,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:4,0:11,2:0|1:176943334_C_CTGA:176943334:10,5,1,1
chr5	176943336	.	T	TCCTTCAGGCACGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=107,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:2,0:10,2:0|1:176943334_C_CTGA:176943334:10,5,1,1
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,1603436;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	176958366	.	G	GAACTGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=178,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:176958366_G_GAACTGA:176958366:1,2,1,1
chr5	176958369	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:176958366_G_GAACTGA:176958366:1,2,1,1
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr5	177019416	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,2:4,0:4,16,1,1
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,3,12
chr5	177020602	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,3:1,1:2,2,3,1
chr5	177021215	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=31,24;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,2:16,0:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,2,0
chr5	177021218	.	T	TAA	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=25,23;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:12,2:15,0:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,3,1
chr5	177021219	.	T	TACCC	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=25,21;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:12,0:16,1:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,3,1
chr5	177021221	.	CAG	C	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:16,2:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,1,1
chr5	177021224	.	CTA	C	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:15,2:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,1,1
chr5	177021228	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=26,25;MFRL=133,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:15,2:0|1:177021215_G_T:177021215:16,11,1,1
chr5	177021229	.	AGTG	A	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=28,24;MFRL=134,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:15,2:0|1:177021215_G_T:177021215:17,11,1,1
chr5	177021236	.	CAG	C	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,0:14,2:0|1:177021215_G_T:177021215:13,13,1,1
chr5	177021240	.	TGGTGGA	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=28,28;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:0|1:177021215_G_T:177021215:12,13,1,1
chr5	177021250	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=27,28;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:177021215_G_T:177021215:11,12,1,1
chr5	177021252	.	TGGA	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=27,29;MFRL=135,48;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:0|1:177021215_G_T:177021215:11,12,1,1
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	177034433	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	177165987	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=143,144;MMQ=40,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,134;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr5	177166270	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:177166270_G_T:177166270:0,0,0,1
chr5	177166272	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:177166270_G_T:177166270:0,0,0,1
chr5	177423002	.	TCCACAC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177423002_TCCACAC_T:177423002:0,0,0,1
chr5	177423010	.	TGTTCCCTCCCCTTCTCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177423002_TCCACAC_T:177423002:0,0,0,1
chr5	177466284	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=164,171;MMQ=27,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr5	177546598	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=96,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,2,2
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,10,6
chr5	177633100	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:177633100_G_GA:177633100:0,2,0,1
chr5	177633102	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:177633100_G_GA:177633100:0,2,0,1
chr5	177633104	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=133,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:177633100_G_GA:177633100:0,2,0,1
chr5	177634295	.	GGGGTT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:177634295_GGGGTT_G:177634295:0,0,0,1
chr5	177634304	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:177634295_GGGGTT_G:177634295:0,0,0,1
chr5	177638953	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:15,0:8,2:0|1:177638953_C_T:177638953:9,15,1,1
chr5	177638959	.	T	TCCCC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:177638953_C_T:177638953:9,13,1,1
chr5	177638963	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=136,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:7,2:0|1:177638953_C_T:177638953:9,14,1,1
chr5	177649990	.	T	TACCTTTATC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177649990_T_TACCTTTATC:177649990:0,1,0,1
chr5	177649993	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177649990_T_TACCTTTATC:177649990:0,1,0,1
chr5	177649997	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177649990_T_TACCTTTATC:177649990:0,1,0,1
chr5	177649999	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177649990_T_TACCTTTATC:177649990:0,1,0,1
chr5	177650001	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=101,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177649990_T_TACCTTTATC:177649990:0,1,0,1
chr5	177656900	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=117,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,3,1
chr5	177658625	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.836:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chr5	177658878	.	ATGGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	177665750	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:4,9,1,1
chr5	177666079	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,19;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,0:0|1:177666079_T_TG:177666079:2,0,1,0
chr5	177666083	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=13,13;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:0,0:0|1:177666079_T_TG:177666079:2,0,1,0
chr5	177666091	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	177666095	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177666079_T_TG:177666079:0,0,1,0
chr5	177669473	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0|1:177669473_T_C:177669473:0,1,0,1
chr5	177669479	.	A	ACTGGAAT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669473_T_C:177669473:0,1,0,1
chr5	177669482	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669473_T_C:177669473:0,1,0,1
chr5	177669484	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669473_T_C:177669473:0,1,0,1
chr5	177669486	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669473_T_C:177669473:0,1,0,1
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=124,77;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:1,4,4,3
chr5	177675235	.	C	CCATTTG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:177675235_C_CCATTTG:177675235:4,8,1,1
chr5	177675240	.	T	TCCATTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:5,0:0|1:177675235_C_CCATTTG:177675235:5,7,1,1
chr5	177675241	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=117,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:7,0:0|1:177675235_C_CCATTTG:177675235:5,7,1,1
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=77,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	177684022	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	177684574	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=82,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=114,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,2:3,2:2,2,1,3
chr5	177697440	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177697440_CT_C:177697440:0,1,0,1
chr5	177697444	.	TC	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177697440_CT_C:177697440:0,1,0,1
chr5	177697447	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:177697440_CT_C:177697440:0,1,0,1
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,4,7
chr5	177715643	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=135,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:177715643_G_A:177715643:0,4,0,1
chr5	177715648	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:177715643_G_A:177715643:0,3,0,1
chr5	177715660	.	A	ACCCTGATTGAGCTCTAAGTGTTGCCATAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:0,1:1,0:0|1:177715660_A_ACCCTGATTGAGCTCTAAGTGTTGCCATAT:177715660:0,2,0,1
chr5	177715663	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177715660_A_ACCCTGATTGAGCTCTAAGTGTTGCCATAT:177715660:0,1,0,1
chr5	178030959	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=111,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	178139442	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=123,84;MMQ=52,49;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:10,2:5,1:5,10,1,2
chr5	178140090	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,2:3,5:4,2,1,6
chr5	178293406	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=137,138;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr5	178310444	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=93,172;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0|1:178310444_G_A:178310444:4,1,0,2
chr5	178310446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:178310444_G_A:178310444:0,0,4,3
chr5	178311157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=127,138;MMQ=60,50;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,0:3,1:0|1:178311157_T_C:178311157:7,4,1,1
chr5	178311160	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=127,138;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:178311157_T_C:178311157:7,4,1,1
chr5	178358274	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr5	178358857	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=126,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:6,2:0,1:2,4,1,2
chr5	178359554	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=110,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr5	178391996	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178391996_G_T:178391996:1,0,0,1
chr5	178391998	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178391996_G_T:178391996:1,0,0,1
chr5	178392002	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:178391996_G_T:178391996:1,0,0,1
chr5	178392007	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=15,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:178391996_G_T:178391996:2,0,0,1
chr5	178392009	.	G	GGAGAGAAACCTTTT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:178391996_G_T:178391996:2,0,0,1
chr5	178413508	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178413816	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	178413947	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,3:0,1,0,5
chr5	178416209	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,27;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:178416209_C_A:178416209:0,1,0,2
chr5	178416212	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=108,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:178416209_C_A:178416209:0,1,0,2
chr5	178416216	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,26;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:178416209_C_A:178416209:0,2,0,2
chr5	178416221	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:178416209_C_A:178416209:0,2,0,1
chr5	178416223	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:178416209_C_A:178416209:0,2,0,1
chr5	178416228	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:178416209_C_A:178416209:0,2,0,1
chr5	178416230	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,30;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:178416209_C_A:178416209:0,2,0,1
chr5	178460151	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=116,46;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:0|1:178460151_C_T:178460151:13,7,1,1
chr5	178460170	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=26,20;MFRL=117,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,0:11,2:0|1:178460151_C_T:178460151:15,14,1,1
chr5	178460173	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:178460151_C_T:178460151:15,13,1,1
chr5	178460176	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=124,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:178460151_C_T:178460151:14,13,1,1
chr5	178460179	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:11,2:0|1:178460151_C_T:178460151:14,13,1,1
chr5	178460182	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=25,20;MFRL=121,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:178460151_C_T:178460151:14,13,1,1
chr5	178460439	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,3:4,1:3,7,2,2
chr5	178505589	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=173,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:1,0:0|1:178505589_C_G:178505589:2,1,1,0
chr5	178505591	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=173,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,1:2,0:0|1:178505589_C_G:178505589:2,1,1,0
chr5	178540941	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=119,90;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,4:10,0:7,11,4,0
chr5	178540975	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=119,104;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:2,7:8,6:2,8,5,9
chr5	178557142	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	178559993	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178559993_C_T:178559993:0,0,0,1
chr5	178560001	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178559993_C_T:178559993:0,0,0,1
chr5	178565001	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178567061	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:178567061_C_CT:178567061:1,2,0,1
chr5	178567063	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=111,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:0|1:178567061_C_CT:178567061:1,2,0,1
chr5	178567067	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:178567061_C_CT:178567061:0,2,0,1
chr5	178567082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr5	178581797	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	178634706	.	CAGG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178634706_CAGG_C:178634706:0,3,0,1
chr5	178634712	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178634706_CAGG_C:178634706:0,3,0,1
chr5	178634715	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178634706_CAGG_C:178634706:0,3,0,1
chr5	178770759	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	178989473	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=62,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:2,3:0,5:1,1,3,7
chr5	179016664	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:2,5,1,2
chr5	179020715	.	T	TCGTGGGTGTCCTTTTCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179020715_T_TCGTGGGTGTCCTTTTCCAG:179020715:0,1,0,1
chr5	179020717	.	A	AACTTCATTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179020715_T_TCGTGGGTGTCCTTTTCCAG:179020715:0,1,0,1
chr5	179021853	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:2,9,0,3
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chr5	179029052	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179029048_T_C:179029048:0,0,0,1
chr5	179036522	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr5	179036546	.	C	CCCCCTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179036544_C_CGTGCCAGT:179036544:0,0,0,1
chr5	179041785	.	GAAAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.469:7:1,1:3,1:3,1,2,1
chr5	179043041	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=933,124;MMQ=27,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:0,7:5,3:0|1:179043041_C_G:179043041:5,0,9,1
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0|1:179043041_C_G:179043041:0,0,13,9
chr5	179045142	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=105,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.409:37:8,9:14,6:12,10,9,6
chr5	179048205	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:0,4:6,4:5,1,7,1
chr5	179050188	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,1,5
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr5	179069912	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,101;MMQ=52,51;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:5,5:6,2:6,5,4,4
chr5	179069949	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=94,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:10,0:14,6:11,13,6,0
chr5	179071866	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=99,139;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,4:6,4:7,7,4,4
chr5	179136137	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:179136137_CA_TG:179136137:0,3,0,2
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,5:0.854:5:0,2:0,2:1|0:179136137_CA_TG:179136137:0,0,0,5
chr5	179136155	.	ATCCTAGC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	179137161	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:179137161_C_T:179137161:0,0,0,1
chr5	179137165	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:179137161_C_T:179137161:0,0,0,1
chr5	179146876	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,4:0,0:0,3,0,4
chr5	179153793	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=111,65;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.145:32:15,0:12,4:0|1:179153793_C_T:179153793:12,16,1,3
chr5	179153797	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=86,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,8:0.272:31:11,5:12,3:1|0:179153793_C_T:179153793:9,14,3,5
chr5	179193598	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.428:16:5,2:4,3:4,5,2,5
chr5	179200834	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	179227154	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,5,2
chr5	179259933	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	179260600	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,2:2,0:6,3,1,1
chr5	179260789	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr5	179267949	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,0,6
chr5	179271272	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,35;MFRL=120,138;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:179271272_G_GA:179271272:1,2,0,1
chr5	179271280	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=120,138;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:179271272_G_GA:179271272:1,2,0,1
chr5	179271285	.	GCTCACT	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=159,120;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	179271290	.	CT	TG	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=179,138;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:179271272_G_GA:179271272:0,1,0,1
chr5	179271313	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,25;MFRL=138,179;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179271313_G_A:179271313:0,1,0,1
chr5	179271318	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179271313_G_A:179271313:0,0,0,1
chr5	179271320	.	A	ATACG	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179271313_G_A:179271313:0,0,0,1
chr5	179271326	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,22;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179271313_G_A:179271313:0,0,0,1
chr5	179271328	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179271313_G_A:179271313:0,0,0,1
chr5	179275075	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr5	179275087	.	T	TGAAATGA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:179275087_T_TGAAATGA:179275087:1,8,0,2
chr5	179275089	.	A	ACTTACCTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=132,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:3,2:0|1:179275087_T_TGAAATGA:179275087:1,8,0,2
chr5	179275092	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=128,103;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:0|1:179275087_T_TGAAATGA:179275087:1,7,0,2
chr5	179280556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	179292446	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179292446_C_A:179292446:0,0,0,1
chr5	179292448	.	GGC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179292446_C_A:179292446:0,0,0,1
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chr5	179294574	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0|1:179294574_A_ATC:179294574:0,2,0,1
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chr5	179734312	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,2:1,0:1,5,0,3
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chr5	179765413	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	179765467	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=167,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,0:0,7:0,1,5,2
chr5	179765621	.	G	GGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179765621_G_GGAA:179765621:0,1,0,1
chr5	179765623	.	T	TATCAGGCTGGACATGGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179765621_G_GGAA:179765621:0,1,0,1
chr5	179780292	.	CCTCCGTGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCCGTGGG;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.688:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179956197	.	CAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,137,141;MMQ=60,53,40;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,18;RU=A;STR;TLOD=3.29,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.624:5:0,0,0:0,1,4:0,0,5,0
chr5	179977097	.	C	CCACCTCCCAAACCTCCTGGCCAACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	179992846	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:8,2:0|1:179992846_G_A:179992846:6,6,1,1
chr5	179992851	.	T	TCTTCCTTTTGTC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:3,0:8,2:0|1:179992846_G_A:179992846:6,6,1,1
chr5	179994306	.	G	GCATTCTCTCAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr5	179994836	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=94,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,3:14,0:14,7,3,0
chr5	180030478	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180030478_T_G:180030478:0,1,0,1
chr5	180030480	.	G	GGTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:180030478_T_G:180030478:0,1,0,1
chr5	180036982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=125,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:3,4,2,0
chr5	180038336	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	180039580	.	C	CCG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=56,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:180039580_C_CCG:180039580:4,3,1,1
chr5	180039581	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=56,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:180039580_C_CCG:180039580:4,3,1,1
chr5	180039583	.	C	CCCCT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=56,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:180039580_C_CCG:180039580:4,3,1,1
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,2,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,3,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=65,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:0,1:2,3:1,2,2,3
chr5	180045700	.	G	GGGTTACCCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	180046344	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	180046358	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	180046375	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180047746	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=122,138;MMQ=60,58;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:2,7,0,2
chr5	180047801	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:180047801_C_T:180047801:0,0,0,1
chr5	180047815	.	C	CCCCTG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180047801_C_T:180047801:0,0,0,1
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,2,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,2,0
chr5	180056192	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	180057053	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=107,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	180166276	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr5	180277514	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:14,0:17,11,3,0
chr5	180277992	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:7,5,1,2
chr5	180278393	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:5,6,2,1
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=57,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,6:2,2:4,0,5,4
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=124,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,1:5,3:4,2,2,2
chr5	180338439	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,1,2
chr5	180424498	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=111,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180424498_G_C:180424498:2,2,0,1
chr5	180424501	.	A	ATCACCTGAGGTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=111,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:180424498_G_C:180424498:2,2,0,1
chr5	180429718	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr5	180429743	.	G	GAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=111,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:4,2:0|1:180429743_G_GAT:180429743:1,5,0,2
chr5	180429747	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=111,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:5,2:0|1:180429743_G_GAT:180429743:1,5,0,2
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=123,86;MMQ=58,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,4,1
chr5	180472498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,2,0
chr5	180472513	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,2,1
chr5	180477449	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180480316	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr5	180482563	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,28;MFRL=154,170;MMQ=40,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:180482563_A_T:180482563:0,2,0,1
chr5	180482570	.	C	CCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=154,170;MMQ=40,36;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:180482563_A_T:180482563:0,2,0,1
chr5	180482573	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=154,170;MMQ=40,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:180482563_A_T:180482563:0,2,0,1
chr5	180482580	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=154,170;MMQ=40,36;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:180482563_A_T:180482563:0,2,0,1
chr5	180482583	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=159,161;MMQ=38,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	180482585	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=147,166;MMQ=40,38;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	180582286	.	T	TTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr5	180582291	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr5	180582980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=233,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr5	180626905	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=144,83444803;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:0|1:180626905_C_T:180626905:2,5,2,0
chr5	180626927	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.246:10:6,1:1,1:1|0:180626905_C_T:180626905:5,3,1,1
chr5	180662046	.	G	GAAATAATCATTTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180663941	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.231:21:9,2:7,1:12,4,2,3
chr5	180664126	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=131,90;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,0:5,4:2,9,0,4
chr5	180666619	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:180666619_C_T:180666619:0,1,0,1
chr5	180666620	.	T	TGAGCAGGCAGTGAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:180666619_C_T:180666619:0,1,0,1
chr5	180666640	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	180668426	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180668426_CA_C:180668426:0,0,1,0
chr5	180668444	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:180668426_CA_C:180668426:2,0,1,0
chr6	312023	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,26;MFRL=115,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:2,7,3,6
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=116,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:2,5,1,6
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=129,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:335251_T_C:335251:0,2,0,1
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=129,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:335251_T_C:335251:0,2,0,1
chr6	335271	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:335271_T_G:335271:0,0,0,1
chr6	335272	.	T	TGGCAGCTACA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:335271_T_G:335271:0,0,0,1
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr6	349016	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:2,0:0,3:0,2,2,2
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=206,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr6	397255	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=132,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:397255_A_G:397255:3,8,1,1
chr6	397263	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=134,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:397255_A_G:397255:3,7,1,1
chr6	397265	.	C	CCCACAGAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0|1:397255_A_G:397255:3,6,1,1
chr6	398771	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:2,1,4,0
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	407673	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:407673_C_CT:407673:0,3,0,1
chr6	407677	.	CT	TG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:407673_C_CT:407673:0,3,0,1
chr6	407684	.	GC	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:407673_C_CT:407673:0,3,0,1
chr6	407687	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,24;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:407673_C_CT:407673:0,3,0,1
chr6	407692	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:407673_C_CT:407673:0,3,0,1
chr6	489090	.	T	TTGAGCCCAGGAGTTTGAGATTAGCCTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=122,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr6	549364	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	553967	.	T	TGTTTTCCATATAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr6	576902	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,11,5
chr6	656143	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr6	1315019	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,1,3,2
chr6	1315021	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,1,3,2
chr6	1315060	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	2624374	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	2678630	.	G	GTTCTTCTCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:2678630_G_GTTCTTCTCT:2678630:2,3,1,1
chr6	2678631	.	A	ATTCCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:2678630_G_GTTCTTCTCT:2678630:2,3,1,1
chr6	2678632	.	G	GTGAATTCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=122,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,1:0|1:2678630_G_GTTCTTCTCT:2678630:2,3,1,1
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:1,2,4,2
chr6	2689217	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	2749506	.	TCC	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:1,0:4,0:0|1:2749506_TCC_T:2749506:1,4,1,1
chr6	2749509	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:2749506_TCC_T:2749506:1,4,1,1
chr6	2749511	.	CCTCTTCACTTTTAACAT	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=126,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0|1:2749506_TCC_T:2749506:1,4,1,1
chr6	2749540	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,50;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr6	2766465	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	2779460	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:2779460_C_T:2779460:8,4,1,1
chr6	2779470	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=99,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:5,2:0|1:2779460_C_T:2779460:8,7,1,1
chr6	2836266	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr6	2838046	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr6	2838102	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr6	2838248	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr6	2948649	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=118,59;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:7,9,1,1
chr6	2948662	.	G	GGGCAAGGCAGACTTCTC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=124,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:5,10,1,1
chr6	2949387	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr6	3006807	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=101,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,22:0.302:74:27,8:20,11:36,16,13,9
chr6	3006821	.	C	CT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=112,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.130:36:19,2:11,2:15,16,2,3
chr6	3010390	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr6	3010459	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,9,2
chr6	3017283	.	C	CAAATAGAATTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3017283_C_CAAATAGAATTTA:3017283:0,4,0,1
chr6	3017285	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3017283_C_CAAATAGAATTTA:3017283:0,4,0,1
chr6	3019654	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	3083595	.	CACTGTG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3083595_CACTGTG_C:3083595:0,0,0,1
chr6	3083603	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3083595_CACTGTG_C:3083595:0,0,0,1
chr6	3083606	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3083595_CACTGTG_C:3083595:0,0,0,1
chr6	3083610	.	TAATAGGTGCCCAGTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3083595_CACTGTG_C:3083595:0,0,0,1
chr6	3127596	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=96,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:8,6,0,2
chr6	3129464	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3129464_GCA_G:3129464:0,1,0,1
chr6	3129467	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=160,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3129464_GCA_G:3129464:0,1,0,1
chr6	3154871	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,79;MMQ=60,49;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	3157760	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	3264092	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=99,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:3264092_C_T:3264092:0,1,1,0
chr6	3264096	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1|0:3264092_C_T:3264092:1,0,0,1
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:3264092_C_T:3264092:0,0,1,1
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	3273618	.	T	TCTCCTTCTACCTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:3273618_T_TCTCCTTCTACCTC:3273618:1,2,1,1
chr6	3273619	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:0|1:3273618_T_TCTCCTTCTACCTC:3273618:1,2,1,1
chr6	3273622	.	C	CATTCCTGAAACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=151,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3273618_T_TCTCCTTCTACCTC:3273618:1,2,0,1
chr6	3287265	.	C	CACACCTGGCTAATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr6	3287313	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:7,3,0,2
chr6	3983301	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	3983925	.	G	GCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=90,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:1,7,3,1
chr6	4031998	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=154.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,18:0,28:0,0,22,24
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	4041038	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=104,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,1:6,1:13,6,2,0
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,29;MFRL=251,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:4052167_C_A:4052167:0,0,9,1
chr6	4052172	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.278:11:7,0:1,3:0|1:4052167_C_A:4052167:6,2,3,0
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr6	4057428	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,571;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,2,2
chr6	4060624	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=134,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,2:6,1:11,1,2,1
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,6,5
chr6	4116351	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,35195934;MMQ=56,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	4128127	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,0:0,0:0|1:4128127_G_C:4128127:0,0,0,1
chr6	4128128	.	A	ATTCCCTTCCATTCAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:4128127_G_C:4128127:0,0,0,1
chr6	4892180	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=106,98;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:8,2:4,7,0,2
chr6	4892257	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=75,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0|1:4892257_T_A:4892257:3,1,0,2
chr6	4892259	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=75,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0|1:4892257_T_A:4892257:3,1,0,2
chr6	4892260	.	TTGC	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=75,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGC;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0|1:4892257_T_A:4892257:3,1,0,2
chr6	4892265	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=75,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:0,2:0|1:4892257_T_A:4892257:3,1,0,2
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	4937728	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.410:5:0,1:2,1:0|1:4937728_C_CA:4937728:1,2,2,0
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.494:12:1,2:3,3:0|1:4937728_C_CA:4937728:3,3,5,1
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0|1:4937728_C_CA:4937728:3,2,4,1
chr6	4995566	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	4996684	.	A	ACCTAGCACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=111,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:4996684_A_ACCTAGCACC:4996684:0,3,0,1
chr6	4996687	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=111,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:4996684_A_ACCTAGCACC:4996684:0,3,0,1
chr6	4996691	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=138,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:4996684_A_ACCTAGCACC:4996684:0,2,0,1
chr6	5000721	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	5000779	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=108,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,4:4,2:3,5,1,5
chr6	5109592	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr6	5404958	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=77,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,5:2,3:1,1,0,8
chr6	5431960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr6	5832142	.	G	GTAATCCCAGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	6152211	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:3,3,1,2
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr6	6197635	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:6197635_A_G:6197635:0,2,0,1
chr6	6197639	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:6197635_A_G:6197635:0,2,0,1
chr6	6197646	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6197635_A_G:6197635:0,1,0,1
chr6	6222260	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	6321128	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=101,115;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,1,5
chr6	6321208	.	C	CCTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6321208_C_CCTAT:6321208:0,1,0,1
chr6	6321210	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:6321208_C_CCTAT:6321208:0,1,0,1
chr6	6588881	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	6625152	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr6	6649974	.	A	AAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGG;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	6650014	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0|1:6650014_A_G:6650014:0,0,0,1
chr6	6650018	.	ATTAAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6650014_A_G:6650014:0,0,0,1
chr6	7226850	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,1,1
chr6	7226864	.	G	GGACTCAAGTGATCCTCCTCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:3,5,1,1
chr6	7231694	.	C	CAGAAATGGACTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=113,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:4,5,1,1
chr6	7232158	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=103,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr6	7240717	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:9,5,4,0
chr6	7246944	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:4,3,1,1
chr6	7247526	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7247526_T_A:7247526:0,0,0,1
chr6	7247528	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7247526_T_A:7247526:0,0,0,1
chr6	7248888	.	A	AATCATGGGTGGCTGCTAAGTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=106,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr6	7290273	.	ATGG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7290273_ATGG_A:7290273:0,0,0,1
chr6	7290279	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7290273_ATGG_A:7290273:0,0,0,1
chr6	7290281	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7290273_ATGG_A:7290273:0,0,0,1
chr6	7330194	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	7334152	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,160;MMQ=50,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=85,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,4:0,7:2,0,8,4
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,4,0
chr6	7378684	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,389;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr6	7386000	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=96,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr6	7387462	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	7390369	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.806:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	7393452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:7,4,4,4
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr6	7397081	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	7403239	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	7413094	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.209:21:10,2:5,2:14,3,4,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	7564139	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
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